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Chr3	22403581	0	T	C	0;0;0;0;0;0;7;4;0	0;0;22;26;0;0;0;0;0	11	114.47	C	pseudogene:TAIR10(AT3G60610)	pseudogenic_transcript:TAIR10(AT3G60610.1)	pseudogenic_exon:TAIR10(id=356782)
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Chr1	17663256	0	C	T	0;0;4;1;0;0;0;0;0	0;0;0;0;0;0;21;20;0	5	61.3696	T	pseudogene:TAIR10(AT1G47930)	pseudogenic_transcript:TAIR10(AT1G47930.1)	pseudogenic_exon:TAIR10(id=85214)
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Chr3	22403753	0	G	A	1;3;0;0;0;0;0;0;0	0;0;0;0;22;16;0;0;0	4	50.4895	A	pseudogene:TAIR10(AT3G60610)	pseudogenic_transcript:TAIR10(AT3G60610.1)	pseudogenic_exon:TAIR10(id=356782)
Chr5	3284476	0	T	C	0;0;0;1;0;0;1;3;0	0;0;31;25;0;0;0;0;0	5	50.1858	C	CDS:TAIR10(id=474766)	gene:TAIR10(AT5G10450)	mRNA:TAIR10(AT5G10450.1)	mRNA:TAIR10(AT5G10450.2)	mRNA:TAIR10(AT5G10450.3)	mRNA:TAIR10(AT5G10450.4)	protein:TAIR10(AT5G10450.1)	protein:TAIR10(AT5G10450.2)	protein:TAIR10(AT5G10450.4)	exon:TAIR10(id=474756)	exon:TAIR10(id=474768)	three_prime_UTR:TAIR10(id=474755)
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Chr5	3255808	0	T	C	0;0;0;0;0;0;0;4;0	0;0;20;16;0;0;0;0;0	4	49.609	C	exon:TAIR10(id=474588)	CDS:TAIR10(id=474586)	gene:TAIR10(AT5G10350)	mRNA:TAIR10(AT5G10350.1)	mRNA:TAIR10(AT5G10350.2)	mRNA:TAIR10(AT5G10350.3)	protein:TAIR10(AT5G10350.1)	protein:TAIR10(AT5G10350.2)	protein:TAIR10(AT5G10350.3)
Chr1	23657187	0	A	G	0;0;0;0;4;0;0;0;0	15;18;0;0;0;0;0;0;0	4	48.1984	G	pseudogene:TAIR10(AT1G63760)	pseudogenic_transcript:TAIR10(AT1G63760.1)	pseudogenic_exon:TAIR10(id=118199)
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Chr2	14777714	0	T	C	0;0;1;0;0;0;4;0;0	0;0;23;26;0;0;0;0;0	5	48.0106	C	exon:TAIR10(id=218759)	CDS:TAIR10(id=218758)	gene:TAIR10(AT2G35060)	mRNA:TAIR10(AT2G35060.1)	mRNA:TAIR10(AT2G35060.2)	protein:TAIR10(AT2G35060.1)	protein:TAIR10(AT2G35060.2)
ChrM	26550	0	G	A	0;4;0;0;0;1;0;0;0	0;0;0;0;14;29;0;0;0	5	45.9013	A	gene:TAIR10(ATMG00090)	mRNA:TAIR10(ATMG00090.1)	protein:TAIR10(ATMG00090.1)	exon:TAIR10(id=589512)	CDS:TAIR10(id=589511)
Chr4	6025041	0	T	C	0;0;0;0;0;0;2;1;0	0;0;33;20;0;0;0;0;0	3	44.4279	C	gene:TAIR10(AT4G09520)	mRNA:TAIR10(AT4G09520.1)	protein:TAIR10(AT4G09520.1)	exon:TAIR10(id=380466)	CDS:TAIR10(id=380464)
Chr1	20451655	0	C	T	0;0;1;2;0;0;0;0;0	0;0;0;0;0;0;26;27;0	3	44.4279	T	five_prime_UTR:TAIR10(id=101575)	five_prime_UTR:TAIR10(id=101583)	gene:TAIR10(AT1G54830)	mRNA:TAIR10(AT1G54830.1)	mRNA:TAIR10(AT1G54830.2)	mRNA:TAIR10(AT1G54830.3)	exon:TAIR10(id=101574)	exon:TAIR10(id=101582)
ChrM	28670	0	G	A	1;3;0;0;0;0;0;0;0	0;0;0;0;9;17;0;0;0	4	44.3783	A	exon:TAIR10(id=589510)	CDS:TAIR10(id=589509)	gene:TAIR10(ATMG00090)	mRNA:TAIR10(ATMG00090.1)	protein:TAIR10(ATMG00090.1)
Chr3	19539626	0	T	C	0;0;0;1;0;0;4;0;0	0;0;19;19;0;0;0;0;0	5	43.9238	C	exon:TAIR10(id=338626)	CDS:TAIR10(id=338624)	gene:TAIR10(AT3G52720)	mRNA:TAIR10(AT3G52720.1)	mRNA:TAIR10(AT3G52720.2)	protein:TAIR10(AT3G52720.1)	protein:TAIR10(AT3G52720.2)
Chr2	12032304	0	A	G	0;0;0;0;2;1;0;0;0	27;23;0;0;0;0;0;0;0	3	43.697	G	exon:TAIR10(id=202418)	CDS:TAIR10(id=202419)	gene:TAIR10(AT2G28210)	mRNA:TAIR10(AT2G28210.1)	protein:TAIR10(AT2G28210.1)
Chr1	5762967	0	T	C	0;0;0;0;0;0;3;0;0	0;0;22;28;0;0;0;0;0	3	43.697	C	gene:TAIR10(AT1G16840)	mRNA:TAIR10(AT1G16840.1)	mRNA:TAIR10(AT1G16840.2)	mRNA:TAIR10(AT1G16840.3)	mRNA:TAIR10(AT1G16840.4)	exon:TAIR10(id=39500)	three_prime_UTR:TAIR10(id=39499)
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Chr5	8967721	0	A	G	0;0;0;0;3;0;0;0;0	21;28;0;0;0;0;0;0;0	3	43.4439	G	exon:TAIR10(id=508591)	five_prime_UTR:TAIR10(id=508592)	gene:TAIR10(AT5G25760)	mRNA:TAIR10(AT5G25760.1)	mRNA:TAIR10(AT5G25760.2)
Chr3	21859528	0	T	C	0;0;0;0;0;0;1;2;0	0;0;28;21;0;0;0;0;0	3	43.4439	C	gene:TAIR10(AT3G59120)	mRNA:TAIR10(AT3G59120.1)	protein:TAIR10(AT3G59120.1)	exon:TAIR10(id=353092)	CDS:TAIR10(id=353091)
Chr1	20983904	0	T	C	0;0;0;0;0;0;0;3;0	0;0;29;17;0;0;0;0;0	3	42.6538	C	protein:TAIR10(AT1G56100.2)	exon:TAIR10(id=105013)	CDS:TAIR10(id=105012)	CDS:TAIR10(id=105025)	gene:TAIR10(AT1G56100)	mRNA:TAIR10(AT1G56100.1)	mRNA:TAIR10(AT1G56100.2)	mRNA:TAIR10(AT1G56100.3)	protein:TAIR10(AT1G56100.1)	exon:TAIR10(id=105026)	exon:TAIR10(id=105034)	five_prime_UTR:TAIR10(id=105032)
Chr4	1416193	0	A	G	0;0;0;0;2;1;0;0;0	18;26;0;0;0;0;0;0;0	3	42.0992	G	CDS:TAIR10(id=371405)	gene:TAIR10(AT4G03210)	mRNA:TAIR10(AT4G03210.1)	mRNA:TAIR10(AT4G03210.2)	protein:TAIR10(AT4G03210.1)	protein:TAIR10(AT4G03210.2)	exon:TAIR10(id=371403)
ChrM	189101	0	G	A	0;3;0;0;0;0;0;0;0	0;0;0;0;27;16;0;0;0	3	41.8127	A	gene:TAIR10(ATMG00650)	mRNA:TAIR10(ATMG00650.1)	protein:TAIR10(ATMG00650.1)	exon:TAIR10(id=589810)	CDS:TAIR10(id=589809)
Chr5	7956116	0	C	T	0;0;0;3;0;0;0;0;0	0;0;0;0;0;0;17;26;0	3	41.8127	T	gene:TAIR10(AT5G23600)	mRNA:TAIR10(AT5G23600.1)	protein:TAIR10(AT5G23600.1)	exon:TAIR10(id=503715)	CDS:TAIR10(id=503716)
Chr1	8505693	0	T	C	0;0;0;0;0;0;1;2;0	0;0;24;19;0;0;0;0;0	3	41.8127	C	three_prime_UTR:TAIR10(id=55396)	gene:TAIR10(AT1G24040)	mRNA:TAIR10(AT1G24040.1)	mRNA:TAIR10(AT1G24040.2)	exon:TAIR10(id=55397)
ChrM	41931	0	G	A	1;2;0;0;0;0;0;0;0	0;0;0;0;22;20;0;0;0	3	41.5198	A	gene:TAIR10(ATMG00160)	mRNA:TAIR10(ATMG00160.1)	protein:TAIR10(ATMG00160.1)	exon:TAIR10(id=589545)	CDS:TAIR10(id=589544)
Chr3	6853171	0	T	C	0;0;0;0;0;0;0;3;0	0;0;20;22;0;0;0;0;0	3	41.5198	C	exon:TAIR10(id=294678)	CDS:TAIR10(id=294677)	gene:TAIR10(AT3G19720)	mRNA:TAIR10(AT3G19720.1)	mRNA:TAIR10(AT3G19720.2)	mRNA:TAIR10(AT3G19720.3)	protein:TAIR10(AT3G19720.1)	protein:TAIR10(AT3G19720.2)	protein:TAIR10(AT3G19720.3)
Chr1	12637509	0	C	T	0;0;1;2;0;0;0;0;0	0;0;0;0;0;0;22;20;0	3	41.5198	T	gene:TAIR10(AT1G34540)	mRNA:TAIR10(AT1G34540.1)	protein:TAIR10(AT1G34540.1)	exon:TAIR10(id=75780)	CDS:TAIR10(id=75781)
Chr3	10078066	0	A	G	0;0;0;0;3;0;0;0;0	16;25;0;0;0;0;0;0;0	3	41.2202	G	three_prime_UTR:TAIR10(id=310378)	gene:TAIR10(AT3G27280)	mRNA:TAIR10(AT3G27280.1)	mRNA:TAIR10(AT3G27280.2)	exon:TAIR10(id=310376)
Chr1	3984512	0	A	G	0;0;0;0;0;3;0;0;0	23;18;0;0;0;0;0;0;0	3	41.2202	G	exon:TAIR10(id=27968)	CDS:TAIR10(id=27969)	gene:TAIR10(AT1G11790)	mRNA:TAIR10(AT1G11790.1)	mRNA:TAIR10(AT1G11790.2)	protein:TAIR10(AT1G11790.1)	protein:TAIR10(AT1G11790.2)
Chr1	3460306	0	C	T	0;0;3;0;0;0;0;0;0	0;0;0;0;0;0;16;24;0	3	40.9135	T	gene:TAIR10(AT1G10490)	mRNA:TAIR10(AT1G10490.1)	exon:TAIR10(id=24561)	three_prime_UTR:TAIR10(id=24563)
Chr1	2380102	0	A	G	0;0;0;0;3;0;0;0;0	16;24;0;0;0;0;0;0;0	3	40.9135	G	gene:TAIR10(AT1G07700)	mRNA:TAIR10(AT1G07700.1)	mRNA:TAIR10(AT1G07700.2)	mRNA:TAIR10(AT1G07700.3)	exon:TAIR10(id=16464)	exon:TAIR10(id=16474)	five_prime_UTR:TAIR10(id=16465)	five_prime_UTR:TAIR10(id=16475)
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Chr1	7879633	0	T	C	0;0;0;0;0;0;3;0;0	0;0;25;14;0;0;0;0;0	3	40.5994	C	exon:TAIR10(id=51757)	CDS:TAIR10(id=51755)	gene:TAIR10(AT1G22300)	mRNA:TAIR10(AT1G22300.1)	mRNA:TAIR10(AT1G22300.2)	mRNA:TAIR10(AT1G22300.3)	protein:TAIR10(AT1G22300.1)	protein:TAIR10(AT1G22300.2)	protein:TAIR10(AT1G22300.3)
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Chr4	16977795	0	T	C	0;0;1;0;0;0;0;3;0	0;0;18;18;0;0;0;0;0	4	33.927	C	gene:TAIR10(AT4G35830)	mRNA:TAIR10(AT4G35830.1)	mRNA:TAIR10(AT4G35830.2)	protein:TAIR10(AT4G35830.1)	exon:TAIR10(id=443736)	five_prime_UTR:TAIR10(id=443735)
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Chr4	74973	0	T	C	0;0;1;0;0;0;2;0;0	0;0;29;24;0;0;0;0;0	3	27.104	C	gene:TAIR10(AT4G00180)	mRNA:TAIR10(AT4G00180.1)	mRNA:TAIR10(AT4G00180.2)	protein:TAIR10(AT4G00180.1)	exon:TAIR10(id=363869)	five_prime_UTR:TAIR10(id=363867)
Chr1	28941062	0	A	G	1;0;0;0;2;0;0;0;0	23;23;0;0;0;0;0;0;0	3	25.9329	G	gene:TAIR10(AT1G77000)	mRNA:TAIR10(AT1G77000.1)	mRNA:TAIR10(AT1G77000.2)	protein:TAIR10(AT1G77000.1)	protein:TAIR10(AT1G77000.2)	exon:TAIR10(id=147115)	exon:TAIR10(id=147129)	CDS:TAIR10(id=147117)	CDS:TAIR10(id=147131)
Chr3	19516075	0	T	C	0;0;1;0;0;0;0;2;0	0;0;21;24;0;0;0;0;0	3	25.7519	C	exon:TAIR10(id=338439)	exon:TAIR10(id=338476)	CDS:TAIR10(id=338438)	CDS:TAIR10(id=338474)	gene:TAIR10(AT3G52640)	mRNA:TAIR10(AT3G52640.1)	mRNA:TAIR10(AT3G52640.2)	mRNA:TAIR10(AT3G52640.3)	protein:TAIR10(AT3G52640.1)	protein:TAIR10(AT3G52640.2)	protein:TAIR10(AT3G52640.3)
Chr5	2331224	0	C	T	0;0;0;2;0;0;1;0;0	0;0;0;0;0;0;19;19;0	3	24.3669	T	gene:TAIR10(AT5G07370)	mRNA:TAIR10(AT5G07370.1)	mRNA:TAIR10(AT5G07370.2)	mRNA:TAIR10(AT5G07370.3)	mRNA:TAIR10(AT5G07370.4)	exon:TAIR10(id=467877)	five_prime_UTR:TAIR10(id=467878)
Chr5	2331225	0	A	G	1;0;0;0;0;2;0;0;0	18;19;0;0;0;0;0;0;0	3	24.1497	G	gene:TAIR10(AT5G07370)	mRNA:TAIR10(AT5G07370.1)	mRNA:TAIR10(AT5G07370.2)	mRNA:TAIR10(AT5G07370.3)	mRNA:TAIR10(AT5G07370.4)	exon:TAIR10(id=467877)	five_prime_UTR:TAIR10(id=467878)
ChrM	188413	0	G	A	1;1;0;0;0;1;0;0;0	0;0;0;0;24;12;0;0;0	3	23.927	A	gene:TAIR10(ATMG00640)	mRNA:TAIR10(ATMG00640.1)	protein:TAIR10(ATMG00640.1)	exon:TAIR10(id=589805)	CDS:TAIR10(id=589804)
Chr2	5977916	0	T	C	0;0;1;0;0;0;2;0;0	0;0;20;15;0;0;0;0;0	3	23.6983	C	exon:TAIR10(id=173324)	CDS:TAIR10(id=173322)	gene:TAIR10(AT2G14170)	mRNA:TAIR10(AT2G14170.1)	mRNA:TAIR10(AT2G14170.2)	mRNA:TAIR10(AT2G14170.3)	protein:TAIR10(AT2G14170.1)	protein:TAIR10(AT2G14170.2)	protein:TAIR10(AT2G14170.3)
Chr1	8505785	0	T	C	0;0;0;1;0;0;1;1;0	0;0;18;17;0;0;0;0;0	3	23.6983	C	three_prime_UTR:TAIR10(id=55396)	gene:TAIR10(AT1G24040)	mRNA:TAIR10(AT1G24040.1)	mRNA:TAIR10(AT1G24040.2)	exon:TAIR10(id=55397)
Chr3	19914819	0	G	A	0;2;0;0;1;0;0;0;0	0;0;0;0;16;17;0;0;0	3	23.2222	A	exon:TAIR10(id=340911)	five_prime_UTR:TAIR10(id=340909)	gene:TAIR10(AT3G53740)	mRNA:TAIR10(AT3G53740.1)	mRNA:TAIR10(AT3G53740.2)	mRNA:TAIR10(AT3G53740.3)	mRNA:TAIR10(AT3G53740.4)
Chr1	24692917	0	A	G	1;0;0;0;2;0;0;0;0	14;19;0;0;0;0;0;0;0	3	23.2222	G	gene:TAIR10(AT1G66250)	mRNA:TAIR10(AT1G66250.1)	exon:TAIR10(id=123807)	five_prime_UTR:TAIR10(id=123808)
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ChrM	141335	0	G	A	2;2;0;0;0;0;0;0;0	0;0;0;0;0;4;0;0;0	4	15.4407	A	gene:TAIR10(ATMG00513)	mRNA:TAIR10(ATMG00513.1)	protein:TAIR10(ATMG00513.1)	exon:TAIR10(id=589725)	CDS:TAIR10(id=589724)
Chr3	21075099	0	C	T	0;0;0;1;0;0;1;1;0	0;0;0;0;0;0;14;28;0	3	11.7609	T	exon:TAIR10(id=348212)	CDS:TAIR10(id=348213)	gene:TAIR10(AT3G56930)	mRNA:TAIR10(AT3G56930.1)	mRNA:TAIR10(AT3G56930.2)	protein:TAIR10(AT3G56930.1)	protein:TAIR10(AT3G56930.2)	exon:TAIR10(id=348196)	CDS:TAIR10(id=348197)
Chr1	27747888	0	G	A	1;0;0;0;1;1;0;0;0	0;0;0;0;21;18;0;0;0	3	11.4613	A	gene:TAIR10(AT1G73805)	mRNA:TAIR10(AT1G73805.1)	protein:TAIR10(AT1G73805.1)	exon:TAIR10(id=140623)	CDS:TAIR10(id=140622)
Chr5	25301735	0	T	C	0;0;2;0;0;0;1;0;0	0;0;19;19;0;0;0;0;0	3	11.3566	C	exon:TAIR10(id=577837)	CDS:TAIR10(id=577836)	protein:TAIR10(AT5G63080.1)	gene:TAIR10(AT5G63080)	mRNA:TAIR10(AT5G63080.1)