CHR	BP	REF	ALT	TS	MAF	MAF_allele	Prop_missing_genotypes	Prop_missing_alleles	Allfreq_ref	Allfreq_alt	Genofreq_ref	Genofreq_het	Genofreq_alt	Allcount_ref	Allcount_alt	Genocount_ref	Genocount_het	Genocount_alt
Y	30900	T	C	Y	0.5	ALT	0.9	0.9	0.5	0.5	0	1	0	2	2	0	2	0
Y	33942	C	A	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	40749	A	G	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	41132	G	A	Y	0.5	ALT	0.9	0.9	0.5	0.5	0.5	0	0.5	2	2	1	0	1
Y	41198	G	A	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	53690	T	C	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	55140	C	T	Y	0	REF	0.95	0.95	0	1	0	0	1	0	2	0	0	1
Y	55294	A	T	N	0.333333333333333	REF	0.85	0.85	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0.666666666666667	2	4	1	0	2
Y	55301	T	C	Y	0.333333333333333	REF	0.85	0.85	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0.666666666666667	2	4	1	0	2
Y	56377	G	A	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	56587	A	G	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	69987	A	G	Y	0.25	ALT	0.9	0.9	0.75	0.25	0.5	0.5	0	3	1	1	1	0
Y	81211	G	T	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	81222	C	G	N	0.25	REF	0.9	0.9	0.25	0.75	0	0.5	0.5	1	3	0	1	1
Y	81316	C	T	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	102628	G	A	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	115732	A	T	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	116670	T	C	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	119287	A	G	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	119289	T	A	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	122019	T	C	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	122071	A	T	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	122077	G	A	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	261037	G	C	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	261054	T	G	N	0.25	REF	0.9	0.9	0.25	0.75	0	0.5	0.5	1	3	0	1	1
Y	261059	G	T	N	0.25	REF	0.9	0.9	0.25	0.75	0	0.5	0.5	1	3	0	1	1
Y	261095	C	A	N	0.25	REF	0.9	0.9	0.25	0.75	0	0.5	0.5	1	3	0	1	1
Y	266444	A	G	Y	0.5	ALT	0.9	0.9	0.5	0.5	0.5	0	0.5	2	2	1	0	1
Y	266496	G	A	Y	0.375	ALT	0.8	0.8	0.625	0.375	0.25	0.75	0	5	3	1	3	0
Y	266535	T	G	N	0.333333333333333	ALT	0.85	0.85	0.666666666666667	0.333333333333333	0.333333333333333	0.666666666666667	0	4	2	1	2	0
Y	266622	G	A	Y	0.166666666666667	ALT	0.85	0.85	0.833333333333333	0.166666666666667	0.666666666666667	0.333333333333333	0	5	1	2	1	0
Y	266637	A	T	N	0.416666666666667	ALT	0.7	0.7	0.583333333333333	0.416666666666667	0.166666666666667	0.833333333333333	0	7	5	1	5	0
Y	267579	T	C	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	267608	C	T	Y	0.5	ALT	0.9	0.9	0.5	0.5	0	1	0	2	2	0	2	0
Y	267661	T	C	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	267688	T	C	Y	0.166666666666667	REF	0.85	0.85	0.166666666666667	0.833333333333333	0	0.333333333333333	0.666666666666667	1	5	0	1	2
Y	267754	C	T	Y	0.166666666666667	ALT	0.7	0.7	0.833333333333333	0.166666666666667	0.666666666666667	0.333333333333333	0	10	2	4	2	0
Y	267758	C	T	Y	0.25	ALT	0.8	0.8	0.75	0.25	0.5	0.5	0	6	2	2	2	0
Y	267771	C	G	N	0.125	ALT	0.8	0.8	0.875	0.125	0.75	0.25	0	7	1	3	1	0
Y	267839	G	A	Y	0.1	REF	0.75	0.75	0.1	0.9	0	0.2	0.8	1	9	0	1	4
Y	268124	T	C	Y	0.25	ALT	0.9	0.9	0.75	0.25	0.5	0.5	0	3	1	1	1	0
Y	281897	C	T	Y	0	REF	0.95	0.95	0	1	0	0	1	0	2	0	0	1
Y	282859	T	G	N	0.25	ALT	0.9	0.9	0.75	0.25	0.5	0.5	0	3	1	1	1	0
Y	282882	G	T	N	0.25	REF	0.9	0.9	0.25	0.75	0	0.5	0.5	1	3	0	1	1
Y	289988	C	T	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	313252	T	C	Y	0.25	ALT	0.9	0.9	0.75	0.25	0.5	0.5	0	3	1	1	1	0
Y	321014	A	G	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	326755	G	A	Y	0.25	REF	0.9	0.9	0.25	0.75	0	0.5	0.5	1	3	0	1	1
Y	326842	G	A	Y	0	REF	0.95	0.95	0	1	0	0	1	0	2	0	0	1
Y	386363	C	T	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	414847	A	T	N	0	REF	0.9	0.9	0	1	0	0	1	0	4	0	0	2
Y	416872	G	A	Y	0.25	ALT	0.9	0.9	0.75	0.25	0.5	0.5	0	3	1	1	1	0
Y	416892	A	G	Y	0.25	ALT	0.9	0.9	0.75	0.25	0.5	0.5	0	3	1	1	1	0
Y	456486	A	G	Y	0	REF	0.95	0.95	0	1	0	0	1	0	2	0	0	1
Y	456646	C	G	N	0	REF	0.95	0.95	0	1	0	0	1	0	2	0	0	1
Y	456650	G	T	N	0	REF	0.95	0.95	0	1	0	0	1	0	2	0	0	1
Y	476299	G	A	Y	0.25	ALT	0.9	0.9	0.75	0.25	0.5	0.5	0	3	1	1	1	0
Y	508698	A	G	Y	0.375	ALT	0.8	0.8	0.625	0.375	0.25	0.75	0	5	3	1	3	0
Y	529406	A	G	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	529448	G	A	Y	0.5	ALT	0.9	0.9	0.5	0.5	0	1	0	2	2	0	2	0
Y	529478	C	G	N	0.5	ALT	0.9	0.9	0.5	0.5	0	1	0	2	2	0	2	0
Y	531272	A	T	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	536265	C	A	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	536293	A	G	Y	0.125	REF	0.8	0.8	0.125	0.875	0	0.25	0.75	1	7	0	1	3
Y	536306	C	A	N	0.125	REF	0.8	0.8	0.125	0.875	0	0.25	0.75	1	7	0	1	3
Y	536363	C	G	N	0.166666666666667	REF	0.85	0.85	0.166666666666667	0.833333333333333	0	0.333333333333333	0.666666666666667	1	5	0	1	2
Y	548042	T	C	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	548044	C	T	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	548084	C	T	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	548118	C	T	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	548937	A	G	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	612743	T	C	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	613429	T	A	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	613454	G	A	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	613984	T	C	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	689935	C	T	Y	0.25	ALT	0.9	0.9	0.75	0.25	0.5	0.5	0	3	1	1	1	0
Y	713969	C	A	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	714241	T	C	Y	0	REF	0.95	0.95	0	1	0	0	1	0	2	0	0	1
Y	714257	G	C	N	0	REF	0.95	0.95	0	1	0	0	1	0	2	0	0	1
Y	714307	T	C	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	714439	C	T	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	714509	A	G	Y	0.375	ALT	0.8	0.8	0.625	0.375	0.25	0.75	0	5	3	1	3	0
Y	714557	G	C	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	714709	G	A	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	715701	T	C	Y	0.5	ALT	0.9	0.9	0.5	0.5	0	1	0	2	2	0	2	0
Y	715729	A	C	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	739377	C	G	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	739607	G	A	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	739608	A	T	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	755061	T	C	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	755103	T	G	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	761766	C	T	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	761801	G	A	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	975439	G	A	Y	0.25	ALT	0.9	0.9	0.75	0.25	0.5	0.5	0	3	1	1	1	0
Y	976791	T	C	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	980549	T	G	N	0	REF	0.95	0.95	0	1	0	0	1	0	2	0	0	1
Y	982971	A	C	N	0.25	ALT	0.9	0.9	0.75	0.25	0.5	0.5	0	3	1	1	1	0
Y	991138	T	C	Y	0.25	ALT	0.9	0.9	0.75	0.25	0.5	0.5	0	3	1	1	1	0
Y	991500	C	A	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	991516	C	T	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	991552	T	G	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1018964	C	A	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1026662	G	T	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1026672	G	A	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1041125	T	C	Y	0.25	REF	0.9	0.9	0.25	0.75	0	0.5	0.5	1	3	0	1	1
Y	1041154	A	G	Y	0.25	REF	0.8	0.8	0.25	0.75	0	0.5	0.5	2	6	0	2	2
Y	1041258	A	G	Y	0.5	ALT	0.8	0.8	0.5	0.5	0	1	0	4	4	0	4	0
Y	1041336	G	A	Y	0.166666666666667	ALT	0.85	0.85	0.833333333333333	0.166666666666667	0.666666666666667	0.333333333333333	0	5	1	2	1	0
Y	1041351	A	G	Y	0.5	ALT	0.8	0.8	0.5	0.5	0	1	0	4	4	0	4	0
Y	1041352	C	T	Y	0.375	REF	0.8	0.8	0.375	0.625	0	0.75	0.25	3	5	0	3	1
Y	1041456	A	T	N	0.25	ALT	0.9	0.9	0.75	0.25	0.5	0.5	0	3	1	1	1	0
Y	1051368	T	A	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1057488	C	T	Y	0	REF	0.95	0.95	0	1	0	0	1	0	2	0	0	1
Y	1075503	G	A	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1075653	C	T	Y	0	REF	0.95	0.95	0	1	0	0	1	0	2	0	0	1
Y	1075672	G	T	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1082388	A	C	N	0.25	ALT	0.9	0.9	0.75	0.25	0.5	0.5	0	3	1	1	1	0
Y	1082630	A	C	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1101429	T	C	Y	0	REF	0.95	0.95	0	1	0	0	1	0	2	0	0	1
Y	1113070	G	C	N	0	REF	0.95	0.95	0	1	0	0	1	0	2	0	0	1
Y	1139267	A	G	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1155268	A	G	Y	0	REF	0.95	0.95	0	1	0	0	1	0	2	0	0	1
Y	1156298	G	T	N	0.375	ALT	0.8	0.8	0.625	0.375	0.25	0.75	0	5	3	1	3	0
Y	1156431	C	T	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1159863	A	T	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1160084	T	C	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1163155	A	G	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1172623	C	A	N	0.375	ALT	0.8	0.8	0.625	0.375	0.25	0.75	0	5	3	1	3	0
Y	1172695	C	T	Y	0.4	ALT	0.75	0.75	0.6	0.4	0.2	0.8	0	6	4	1	4	0
Y	1173429	T	A	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1173467	T	C	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1173589	G	A	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1191864	G	T	N	0	REF	0.95	0.95	0	1	0	0	1	0	2	0	0	1
Y	1193289	G	A	Y	0.333333333333333	ALT	0.85	0.85	0.666666666666667	0.333333333333333	0.333333333333333	0.666666666666667	0	4	2	1	2	0
Y	1195040	T	C	Y	0.5	ALT	0.9	0.9	0.5	0.5	0.5	0	0.5	2	2	1	0	1
Y	1202429	C	T	Y	0.25	REF	0.9	0.9	0.25	0.75	0	0.5	0.5	1	3	0	1	1
Y	1202580	C	A	N	0.416666666666667	REF	0.7	0.7	0.416666666666667	0.583333333333333	0	0.833333333333333	0.166666666666667	5	7	0	5	1
Y	1202605	T	A	N	0.333333333333333	REF	0.85	0.85	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0.666666666666667	0.333333333333333	2	4	0	2	1
Y	1202607	G	A	Y	0.166666666666667	REF	0.85	0.85	0.166666666666667	0.833333333333333	0	0.333333333333333	0.666666666666667	1	5	0	1	2
Y	1202619	T	G	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1208132	A	G	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1208135	A	G	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1208144	C	A	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1219057	T	G	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1219061	G	T	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1219074	G	T	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1219105	A	G	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1219255	A	G	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1231234	C	A	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1246931	T	C	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1246949	G	A	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1264811	C	T	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1264858	A	C	N	0.25	REF	0.9	0.9	0.25	0.75	0	0.5	0.5	1	3	0	1	1
Y	1264866	A	T	N	0.25	REF	0.9	0.9	0.25	0.75	0	0.5	0.5	1	3	0	1	1
Y	1264872	A	G	Y	0.25	REF	0.9	0.9	0.25	0.75	0	0.5	0.5	1	3	0	1	1
Y	1264884	T	G	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1282834	T	C	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1283065	C	G	N	0	REF	0.95	0.95	0	1	0	0	1	0	2	0	0	1
Y	1297675	A	C	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1300831	T	A	N	0.25	ALT	0.9	0.9	0.75	0.25	0.5	0.5	0	3	1	1	1	0
Y	1301698	C	T	Y	0	REF	0.95	0.95	0	1	0	0	1	0	2	0	0	1
Y	1312783	A	T	N	0	REF	0.95	0.95	0	1	0	0	1	0	2	0	0	1
Y	1312797	C	T	Y	0	REF	0.95	0.95	0	1	0	0	1	0	2	0	0	1
Y	1312808	T	C	Y	0	REF	0.95	0.95	0	1	0	0	1	0	2	0	0	1
Y	1330562	C	T	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1334333	A	G	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1334338	A	G	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1334426	A	G	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1334429	G	C	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1334466	C	T	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1353350	T	C	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1398225	G	A	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1417717	T	A	N	0.5	ALT	0.9	0.9	0.5	0.5	0	1	0	2	2	0	2	0
Y	1417718	T	C	Y	0.5	ALT	0.9	0.9	0.5	0.5	0	1	0	2	2	0	2	0
Y	1420633	G	A	Y	0	REF	0.95	0.95	0	1	0	0	1	0	2	0	0	1
Y	1453127	G	C	N	0.125	REF	0.8	0.8	0.125	0.875	0	0.25	0.75	1	7	0	1	3
Y	1453148	C	T	Y	0.1	REF	0.75	0.75	0.1	0.9	0	0.2	0.8	1	9	0	1	4
Y	1453245	T	C	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1453311	G	T	N	0.5	ALT	0.9	0.9	0.5	0.5	0.5	0	0.5	2	2	1	0	1
Y	1460301	A	C	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1465656	G	T	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1465928	T	C	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1465982	T	C	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1466244	A	G	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1479314	G	C	N	0	REF	0.95	0.95	0	1	0	0	1	0	2	0	0	1
Y	1508600	A	G	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1508612	G	A	Y	0.5	ALT	0.9	0.9	0.5	0.5	0	1	0	2	2	0	2	0
Y	1508647	C	T	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1508806	T	C	Y	0	REF	0.95	0.95	0	1	0	0	1	0	2	0	0	1
Y	1508815	G	T	N	0	REF	0.95	0.95	0	1	0	0	1	0	2	0	0	1
Y	1508916	C	T	Y	0.125	REF	0.8	0.8	0.125	0.875	0	0.25	0.75	1	7	0	1	3
Y	1536443	A	T	N	0.375	ALT	0.8	0.8	0.625	0.375	0.25	0.75	0	5	3	1	3	0
Y	1537110	G	A	Y	0.166666666666667	REF	0.85	0.85	0.166666666666667	0.833333333333333	0	0.333333333333333	0.666666666666667	1	5	0	1	2
Y	1537123	G	A	Y	0.3	ALT	0.75	0.75	0.7	0.3	0.4	0.6	0	7	3	2	3	0
Y	1537223	T	G	N	0.333333333333333	ALT	0.85	0.85	0.666666666666667	0.333333333333333	0.333333333333333	0.666666666666667	0	4	2	1	2	0
Y	1537251	C	T	Y	0.25	ALT	0.9	0.9	0.75	0.25	0.5	0.5	0	3	1	1	1	0
Y	1537287	G	T	N	0	REF	0.95	0.95	0	1	0	0	1	0	2	0	0	1
Y	1586536	A	T	N	0.5	ALT	0.9	0.9	0.5	0.5	0	1	0	2	2	0	2	0
Y	1586738	G	A	Y	0.5	ALT	0.9	0.9	0.5	0.5	0	1	0	2	2	0	2	0
Y	1586783	G	T	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1586785	C	T	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1586806	T	C	Y	0.333333333333333	ALT	0.85	0.85	0.666666666666667	0.333333333333333	0.333333333333333	0.666666666666667	0	4	2	1	2	0
Y	1586807	G	T	N	0.333333333333333	ALT	0.85	0.85	0.666666666666667	0.333333333333333	0.333333333333333	0.666666666666667	0	4	2	1	2	0
Y	1616219	T	C	Y	0	REF	0.95	0.95	0	1	0	0	1	0	2	0	0	1
Y	1616231	A	C	N	0	REF	0.95	0.95	0	1	0	0	1	0	2	0	0	1
Y	1616238	T	A	N	0	REF	0.95	0.95	0	1	0	0	1	0	2	0	0	1
Y	1616894	A	G	Y	0.25	ALT	0.9	0.9	0.75	0.25	0.5	0.5	0	3	1	1	1	0
Y	1619824	G	T	N	0.5	ALT	0.9	0.9	0.5	0.5	0	1	0	2	2	0	2	0
Y	1619839	A	G	Y	0.5	ALT	0.85	0.85	0.5	0.5	0	1	0	3	3	0	3	0
Y	1619993	A	G	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1626342	C	T	Y	0.25	ALT	0.9	0.9	0.75	0.25	0.5	0.5	0	3	1	1	1	0
Y	1626344	C	T	Y	0.25	ALT	0.9	0.9	0.75	0.25	0.5	0.5	0	3	1	1	1	0
Y	1640377	G	A	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1640401	C	G	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1647660	C	G	N	0.5	ALT	0.85	0.85	0.5	0.5	0	1	0	3	3	0	3	0
Y	1664048	T	C	Y	0	REF	0.95	0.95	0	1	0	0	1	0	2	0	0	1
Y	1664710	C	T	Y	0.25	ALT	0.9	0.9	0.75	0.25	0.5	0.5	0	3	1	1	1	0
Y	1664717	C	G	N	0.25	ALT	0.9	0.9	0.75	0.25	0.5	0.5	0	3	1	1	1	0
Y	1666726	G	A	Y	0.166666666666667	REF	0.85	0.85	0.166666666666667	0.833333333333333	0	0.333333333333333	0.666666666666667	1	5	0	1	2
Y	1666753	G	T	N	0.166666666666667	REF	0.7	0.7	0.166666666666667	0.833333333333333	0	0.333333333333333	0.666666666666667	2	10	0	2	4
Y	1666820	A	G	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1666999	T	C	Y	0.25	REF	0.9	0.9	0.25	0.75	0	0.5	0.5	1	3	0	1	1
Y	1667442	A	C	N	0	REF	0.95	0.95	0	1	0	0	1	0	2	0	0	1
Y	1667451	C	T	Y	0	REF	0.95	0.95	0	1	0	0	1	0	2	0	0	1
Y	1742233	A	G	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1753635	C	T	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1762357	C	T	Y	0.25	ALT	0.9	0.9	0.75	0.25	0.5	0.5	0	3	1	1	1	0
Y	1779754	G	A	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1779765	G	A	Y	0.5	ALT	0.9	0.9	0.5	0.5	0	1	0	2	2	0	2	0
Y	1779791	G	A	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1780329	G	A	Y	0	REF	0.95	0.95	0	1	0	0	1	0	2	0	0	1
Y	1785627	G	C	N	0.25	REF	0.9	0.9	0.25	0.75	0	0.5	0.5	1	3	0	1	1
Y	1814994	C	T	Y	0	REF	0.95	0.95	0	1	0	0	1	0	2	0	0	1
Y	1825416	G	A	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1841848	G	C	N	0.25	REF	0.9	0.9	0.25	0.75	0	0.5	0.5	1	3	0	1	1
Y	1845446	T	G	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1845459	G	A	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1847307	T	C	Y	0.25	REF	0.8	0.8	0.25	0.75	0	0.5	0.5	2	6	0	2	2
Y	1847365	C	T	Y	0.5	ALT	0.9	0.9	0.5	0.5	0	1	0	2	2	0	2	0
Y	1847473	A	T	N	0.25	ALT	0.9	0.9	0.75	0.25	0.5	0.5	0	3	1	1	1	0
Y	1847608	C	T	Y	0	REF	0.9	0.9	0	1	0	0	1	0	4	0	0	2
Y	1847623	C	T	Y	0	REF	0.95	0.95	0	1	0	0	1	0	2	0	0	1
Y	1847631	T	C	Y	0.5	ALT	0.85	0.85	0.5	0.5	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	3	3	1	1	1
Y	1969072	T	C	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1969078	A	C	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1985136	C	T	Y	0.25	ALT	0.9	0.9	0.75	0.25	0.5	0.5	0	3	1	1	1	0
Y	1986714	C	A	N	0	REF	0.95	0.95	0	1	0	0	1	0	2	0	0	1
Y	1986717	C	T	Y	0	REF	0.95	0.95	0	1	0	0	1	0	2	0	0	1
Y	1988707	C	T	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1988711	T	C	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1994779	A	T	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1994805	T	G	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	1996493	G	A	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	2004351	A	T	N	0.5	ALT	0.8	0.8	0.5	0.5	0	1	0	4	4	0	4	0
Y	2004487	G	A	Y	0	REF	0.9	0.9	0	1	0	0	1	0	4	0	0	2
Y	2004559	T	A	N	0.1	ALT	0.75	0.75	0.9	0.1	0.8	0.2	0	9	1	4	1	0
Y	2004657	A	G	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	2005680	A	T	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	2005707	A	T	N	0.375	ALT	0.8	0.8	0.625	0.375	0.25	0.75	0	5	3	1	3	0
Y	2005714	A	G	Y	0.4	ALT	0.75	0.75	0.6	0.4	0.2	0.8	0	6	4	1	4	0
Y	2005905	T	C	Y	0	REF	0.95	0.95	0	1	0	0	1	0	2	0	0	1
Y	2005909	G	C	N	0	REF	0.95	0.95	0	1	0	0	1	0	2	0	0	1
Y	2005943	C	A	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	2014442	C	T	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	2148526	C	T	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	2180929	A	T	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	2180943	T	G	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	2190601	C	A	N	0	REF	0.95	0.95	0	1	0	0	1	0	2	0	0	1
Y	2394365	A	G	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	2394409	T	G	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	2395103	T	A	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	2396559	G	C	N	0	REF	0.95	0.95	0	1	0	0	1	0	2	0	0	1
Y	2397107	T	C	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	2434987	G	T	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	2443306	G	A	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	2510414	T	C	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	2510417	G	A	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	2510816	A	G	Y	0	REF	0.95	0.95	0	1	0	0	1	0	2	0	0	1
Y	2511159	A	C	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	2512727	C	G	N	0.333333333333333	ALT	0.85	0.85	0.666666666666667	0.333333333333333	0.333333333333333	0.666666666666667	0	4	2	1	2	0
Y	2512734	G	A	Y	0.25	ALT	0.9	0.9	0.75	0.25	0.5	0.5	0	3	1	1	1	0
Y	2515498	C	A	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	2575364	C	T	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	2575407	C	T	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	2575416	T	C	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	2575523	G	A	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	2576068	T	C	Y	0.166666666666667	REF	0.85	0.85	0.166666666666667	0.833333333333333	0	0.333333333333333	0.666666666666667	1	5	0	1	2
Y	2576071	C	T	Y	0.166666666666667	REF	0.85	0.85	0.166666666666667	0.833333333333333	0	0.333333333333333	0.666666666666667	1	5	0	1	2
Y	2595491	T	C	Y	0	REF	0.95	0.95	0	1	0	0	1	0	2	0	0	1
Y	2617065	T	C	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	2619300	G	C	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	2628597	G	A	Y	0.375	REF	0.6	0.6	0.375	0.625	0	0.75	0.25	6	10	0	6	2
Y	2629048	A	T	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	2629053	G	A	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	2629106	A	C	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	2629224	T	C	Y	0.5	ALT	0.9	0.9	0.5	0.5	0	1	0	2	2	0	2	0
Y	2629379	G	C	N	0.5	ALT	0.9	0.9	0.5	0.5	0	1	0	2	2	0	2	0
Y	2629384	C	A	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	2630626	G	A	Y	0.1875	ALT	0.6	0.6	0.8125	0.1875	0.625	0.375	0	13	3	5	3	0
Y	2632981	G	T	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	2633072	C	T	Y	0.125	REF	0.8	0.8	0.125	0.875	0	0.25	0.75	1	7	0	1	3
Y	2633082	C	A	N	0.125	REF	0.8	0.8	0.125	0.875	0	0.25	0.75	1	7	0	1	3
Y	2633089	A	C	N	0.125	REF	0.8	0.8	0.125	0.875	0	0.25	0.75	1	7	0	1	3
Y	2633101	T	A	N	0.125	REF	0.8	0.8	0.125	0.875	0	0.25	0.75	1	7	0	1	3
Y	2633105	G	A	Y	0.125	REF	0.8	0.8	0.125	0.875	0	0.25	0.75	1	7	0	1	3
Y	2634224	A	G	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	2635360	T	C	Y	0.5	ALT	0.9	0.9	0.5	0.5	0.5	0	0.5	2	2	1	0	1
Y	2635372	A	T	N	0.25	ALT	0.9	0.9	0.75	0.25	0.5	0.5	0	3	1	1	1	0
Y	2635441	G	A	Y	0.5	ALT	0.9	0.9	0.5	0.5	0.5	0	0.5	2	2	1	0	1
Y	2635461	T	C	Y	0.125	ALT	0.6	0.6	0.875	0.125	0.875	0	0.125	14	2	7	0	1
Y	2636657	C	A	N	0.25	REF	0.9	0.9	0.25	0.75	0	0.5	0.5	1	3	0	1	1
Y	2638871	T	C	Y	0.25	ALT	0.9	0.9	0.75	0.25	0.5	0.5	0	3	1	1	1	0
Y	2638872	G	A	Y	0.25	ALT	0.9	0.9	0.75	0.25	0.5	0.5	0	3	1	1	1	0
Y	2639099	G	A	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	2644610	G	T	N	0	REF	0.95	0.95	0	1	0	0	1	0	2	0	0	1
Y	2654997	T	C	Y	0.375	ALT	0.8	0.8	0.625	0.375	0.25	0.75	0	5	3	1	3	0
Y	2655589	G	T	N	0	REF	0.9	0.9	0	1	0	0	1	0	4	0	0	2
Y	2664135	T	C	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	2664222	G	A	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	2664384	G	C	N	0.25	ALT	0.9	0.9	0.75	0.25	0.5	0.5	0	3	1	1	1	0
Y	2676694	G	A	Y	0.333333333333333	ALT	0.85	0.85	0.666666666666667	0.333333333333333	0.333333333333333	0.666666666666667	0	4	2	1	2	0
Y	2676713	T	G	N	0.5	ALT	0.9	0.9	0.5	0.5	0.5	0	0.5	2	2	1	0	1
Y	2676900	A	C	N	0	REF	0.95	0.95	0	1	0	0	1	0	2	0	0	1
Y	2681319	C	A	N	0	REF	0.95	0.95	0	1	0	0	1	0	2	0	0	1
Y	2764700	A	C	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	2765793	C	T	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	2765873	G	A	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	2765882	C	G	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	2765910	T	A	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	2765963	A	G	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	2765970	C	A	N	0	REF	0.95	0.95	0	1	0	0	1	0	2	0	0	1
Y	2765979	T	A	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	2765992	T	G	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	2765997	G	T	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	2766041	G	T	N	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	2766048	C	T	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	2766066	A	G	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	2766476	A	T	N	0	REF	0.95	0.95	0	1	0	0	1	0	2	0	0	1
Y	2849549	A	G	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	2857873	C	T	Y	0.5	ALT	0.95	0.95	0.5	0.5	0	1	0	1	1	0	1	0
Y	2874002	C	T	Y	0	REF	0.95	0.95	0	1	0	0	1	0	2	0	0	1