CHR BP REF ALT NEW TS MAF MAF_allele Prop_missing_genotypes Prop_missing_alleles Allfreq_ref Allfreq_alt Genofreq_ref Genofreq_het Genofreq_alt Allcount_ref Allcount_alt Genocount_ref Genocount_het Genocount_alt X 4970402 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 4972830 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 4974143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 4976065 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 4984698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 4990476 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 4991128 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 4993763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 4994490 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 4994888 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 4995139 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 4995810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 4996137 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 4996245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 4997490 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 4998167 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 4999214 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 4999317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 4999650 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 4999679 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5000099 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5000100 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5002982 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5003354 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5003386 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5004459 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5004532 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 5004676 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5004711 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5006438 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5006473 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5006911 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5007798 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5008084 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5008495 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5009136 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 5009200 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5009300 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5009487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5010214 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5010908 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5010939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5011314 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5011617 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5012240 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5012299 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5012516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5012952 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5013234 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5013455 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5013469 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5013473 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5013860 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5014028 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5014435 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5015077 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5015100 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5015372 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5015505 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5015733 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5016270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5016682 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5016778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5016900 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5017368 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5017761 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5017909 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5018022 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5018038 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5018099 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5018534 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5018671 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5019201 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5019342 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5019812 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5020257 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5020317 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5021507 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5022835 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5023052 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 5023113 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 5023785 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 5023835 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5024027 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5024741 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5024917 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5024966 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 5025816 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5026106 T C Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 5027061 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5028061 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5028074 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5028137 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5028446 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5028447 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5028594 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5028694 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5029278 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5030145 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5031467 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 X 5031767 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 5031950 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5032938 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5035626 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5039308 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5040669 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 5041336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5046849 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5047861 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5048602 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5051962 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5053509 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5054745 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5059332 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5060382 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 5062621 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5063834 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5065091 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5065473 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5065987 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 5069640 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5070385 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 5070524 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5072537 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5072948 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5074240 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5074563 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5075072 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5075762 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5076150 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5077607 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5077932 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 5079122 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5079267 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 5079526 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5080366 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5081805 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5081865 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5082421 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5082505 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5083351 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5083639 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5084840 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5084852 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5085101 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5085354 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5085622 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 5085751 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5085896 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5085976 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5095312 A C N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 X 5105304 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5105563 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5105679 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5105957 T G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 5110322 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5110868 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 5110943 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5111151 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5111223 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5111480 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5111582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5112134 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5112393 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5112493 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5112725 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 5112963 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5113010 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5113315 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5113393 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5113550 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5113668 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 5113892 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5114081 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5114849 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 5115654 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5115655 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5115678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5115679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5116430 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5116695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5117195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5118347 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5118858 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5119433 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5119460 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5119605 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5119724 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5120885 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 5121135 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5121248 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 5122070 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5122603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5122778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5122780 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 5124099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5124368 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5124538 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 5134747 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5135373 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5135536 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5136166 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5137912 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5147057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5148788 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5149119 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5149125 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5150828 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5151065 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5151199 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5152229 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 5152711 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5152767 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5152964 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5153235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5153326 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5153426 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5153447 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5153493 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5153662 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5154901 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5154966 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5155029 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5155822 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5156195 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5156850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5157171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5157461 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5157575 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5157638 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5157693 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5157879 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5158453 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5158490 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5158493 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 X 5158717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5158736 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5158870 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5159365 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5159735 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 5159902 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 5159986 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5160392 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 5160826 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5162132 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5162477 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5165551 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 5165840 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 5165841 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 5167046 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5167827 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5167904 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5168104 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5168964 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5169052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5170276 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5170443 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5171050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5171131 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5172834 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 5172918 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5174093 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5174614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5175298 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5176151 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5177582 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 5178654 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5179673 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 5180188 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5180708 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5181129 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5181178 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 X 5181626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5182037 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5182586 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 5182588 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 5182895 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5183799 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 X 5183913 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5184438 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5185351 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 5185535 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5186022 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5186269 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5187701 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5187940 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 X 5188250 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 X 5191763 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 X 5192273 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5192342 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5192945 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5206756 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5208350 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5208351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5208492 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5209544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5228935 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5234437 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5234444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5235072 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5235649 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 X 5236038 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 X 5237525 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 5237829 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5238116 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5239975 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5240168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5240741 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 5240904 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5241595 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5250304 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5260440 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5260756 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 X 5261702 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5262347 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5264281 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5265282 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5272674 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5275148 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5278564 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5280638 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5281296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5283411 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5283580 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5283903 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5283959 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5284109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5285104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5286066 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5287346 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5289859 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5290547 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5290758 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5291949 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5292355 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5294782 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 5295883 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5297728 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5298108 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5298608 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 5299076 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5299565 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5300802 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5304807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5304993 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5305128 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5305975 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 X 5306172 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5307985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5308813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5309687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5310097 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5314234 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5314973 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5316760 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5316866 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5317776 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 5317859 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5318060 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5319237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5319960 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 5320104 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 5320347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5320874 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5321919 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5322167 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5322456 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 X 5323277 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 5323299 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5323314 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5323798 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 5325197 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5326105 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5326526 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5328082 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5333241 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5333688 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5334086 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5334594 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5335029 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 5335847 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5337286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5339098 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5339132 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5340447 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5342198 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5344847 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5348634 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5348977 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 5350015 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5350416 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5351279 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5351787 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5351901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5353238 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 5354764 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5355242 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5355405 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5356773 G A Y Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 X 5367977 A C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 5368275 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5368319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5368495 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5368924 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5372670 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 5382515 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5382787 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5384165 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5387164 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5388132 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5388805 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5389179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5389394 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5389707 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 X 5389732 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5391631 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5392797 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5392856 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5395680 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5396100 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5396131 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5396475 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5396713 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5396951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5397239 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5397607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5399979 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5399999 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5400609 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 5401761 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5402237 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5403065 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5407604 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5409941 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5410009 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5410713 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5412152 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5412245 G T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 X 5412502 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 5413873 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5414168 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5414523 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 5415564 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5415611 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5416054 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5417545 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5418009 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 5418282 T A N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 X 5419103 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 5420057 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 5420083 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 5420185 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5421260 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5421293 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5421337 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5421582 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5421791 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5422302 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5422659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5422984 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 5423413 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5423807 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 X 5423825 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 X 5423847 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 X 5424143 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 X 5424623 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5424658 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5424915 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5426371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5427735 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 X 5427745 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5428066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5430183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5430365 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5430414 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5431178 G C Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 X 5435051 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5435220 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5442515 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5449865 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 5449956 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5450336 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 5450489 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5450970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5451053 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 X 5451458 G T Y N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 X 5452341 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5452450 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5454242 C T Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 X 5454606 C T Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 X 5454629 A G Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 X 5458232 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5459178 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 5460802 G T N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 X 5460806 T C N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 X 5461055 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 X 5461624 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 X 5463398 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 X 5463657 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5463703 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 X 5464224 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5464363 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5464868 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5464906 G T Y N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 X 5466716 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 5470266 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 X 5470410 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5470523 T G Y N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 X 5470855 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 5471341 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5471399 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5471403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5471755 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5472012 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5476892 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5477331 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5482818 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5482984 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5483918 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5491343 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5492757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5493158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5501478 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5502451 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5502511 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5502808 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 5503047 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5504328 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 5504873 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5507633 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5509388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5511579 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5512645 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5512719 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 X 5516122 A G N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 X 5516265 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5520724 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 5521103 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5521857 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5524543 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5525608 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5525831 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 5526363 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5528239 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5528297 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5528615 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5528777 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5529899 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5531989 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5535304 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5544699 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 5545492 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5545815 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5547615 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5547750 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5548042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5548490 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 5548576 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5550327 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5551235 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 5551492 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5554038 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5554736 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5555865 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5556305 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 5557325 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5558096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5559700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5561623 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5562607 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5563743 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 5565351 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5575976 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5582588 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5586837 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5587456 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 5589614 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5592620 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5596210 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 5596248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5597345 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5598888 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 5599064 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5599359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5600633 C G N N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 X 5605157 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5605567 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5606502 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5611714 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5612768 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5616132 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5618724 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5618735 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5620070 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5620855 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5626009 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5626093 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 5628110 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 5629841 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5633978 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5636503 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5638511 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5639263 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5643178 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5643927 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 5648174 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5648850 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5649138 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 5649268 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5649809 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5651460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5651472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5653689 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 5654523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5654560 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5657626 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5659022 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5659045 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5659074 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5660563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5661946 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5667454 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5667495 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5667919 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5668097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5668359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5672463 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5672464 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5673078 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5673580 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5673603 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5674231 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 5677926 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5681484 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 5683742 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5686073 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5688002 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5688904 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5688935 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5691246 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5692558 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5696230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5696324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5696950 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5699619 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 5703761 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5707641 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5710672 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 5712822 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5716517 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5717348 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5720339 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5720369 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5722584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5722713 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5722771 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5724342 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5727444 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5727978 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5729599 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5730438 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 5733800 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5733801 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5733811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5734521 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5740948 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5747521 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5748397 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5748431 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5748481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5759589 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5765213 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5769035 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 5769125 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 5775097 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5776290 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 5779302 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5780365 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5782017 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 5785042 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5785334 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5787471 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5791080 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5794531 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5797418 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5797580 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5799796 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5801016 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5801962 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5804703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5806608 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5807333 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5808052 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5808053 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5808153 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5808870 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5809838 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5810593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5812618 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5812675 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5814379 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5814850 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5815240 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5818487 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5818898 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 5819075 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5819761 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 5819856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5819902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5822883 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5822993 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5824577 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5826001 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5827235 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5828881 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5829107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5830042 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5833278 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 5833558 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5834740 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 5836995 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5838106 G C Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 5839315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5840042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5843225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5844435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5845171 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5847544 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5847694 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5848063 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5848622 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5849907 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5850666 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5850776 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5851420 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5851613 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5851653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5851715 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5851801 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5852989 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5853870 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5855561 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5855631 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5855758 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5856279 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5857103 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5857444 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5857620 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5857623 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5858131 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5860055 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5860348 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5863547 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5863620 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5863971 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5864028 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5865332 G T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 5866498 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5868670 C T Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 5871200 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5872542 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5873199 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5873223 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5873580 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5874535 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5875316 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5876676 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5877618 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5878649 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5879844 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5881600 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5881827 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5882137 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 5885713 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5886382 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5886863 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5887587 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5889135 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5889264 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5890682 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5892495 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5893752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5896051 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5897353 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5898417 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5899273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5899680 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5899872 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5900244 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5902063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5903946 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5904541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5904693 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5904834 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5905051 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5905300 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5905383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5906729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5906863 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5906966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5907628 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5908004 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5908325 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5908582 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5908607 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5908705 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5908725 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5910745 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 5911988 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5912186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5912320 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5912431 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5912473 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5913400 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5913536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5913667 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5913782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5913900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5914505 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5914506 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5914762 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 5916235 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5916306 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5916442 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5916684 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5916790 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 5916860 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 5917149 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 5917211 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 5917212 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 5917600 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5917655 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5917811 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5917982 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 5918019 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5918119 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 5918416 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 5918426 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 5918559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5918758 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5918760 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5918807 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5918956 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5919197 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5919393 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 5919843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5919940 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 5919949 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 5919950 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 5920598 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5923226 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 5926944 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 5927454 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5927780 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5928817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5929173 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5929245 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5929335 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5930394 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5934046 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5936739 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5936740 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5938036 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5938238 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5941005 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5941290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5941510 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5941937 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5941953 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5941967 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5942255 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5942279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5942358 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5942362 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5943601 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5944545 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5945111 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5945226 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5945327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5945542 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5945604 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 5946472 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5946617 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5946820 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5946963 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5948240 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5949649 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5950373 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5950374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5951857 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5957732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5964741 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5965271 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5968451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5973322 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 5976411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5979109 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5979110 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 5982524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5983739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5986110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5986896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5987150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5991023 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5992519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5992945 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5993829 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5994242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5995739 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 5999235 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 5999587 C T N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 5999654 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 6006341 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6008522 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 6009986 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6017374 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 6018567 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6019389 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6021614 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6024685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6028079 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6030804 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6036113 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 6041033 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6043643 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 6045461 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6048968 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6049033 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6049337 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6055537 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6058808 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6059109 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6063715 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6064897 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6065124 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6068395 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 6068849 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 6069098 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6073232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6073505 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6082840 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6085370 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6086472 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6087994 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 6091820 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6098945 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6099129 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6101023 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6101322 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 6102735 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6103351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6104590 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6105277 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6105555 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6107134 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6108526 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6110224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6113836 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6115798 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6119300 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6120670 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 6123097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6125331 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6125795 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6125957 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6127272 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 6131175 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 6131661 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6135362 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 6137686 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6137885 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6150742 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6151390 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6154025 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 6154391 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6154795 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6158150 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6158882 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6163716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6164010 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6168397 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6169522 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6171964 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6173431 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 6175676 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6176172 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6184119 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6184959 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6186558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6186836 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6188423 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 6194812 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 6195382 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6195905 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6195931 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6195948 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6196393 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 6197724 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 X 6200022 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6200211 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6203151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6209140 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6209169 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6210662 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6212617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6213527 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 6213653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6213781 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6215708 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 6216492 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 6217111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6217732 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6217745 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6217935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6218773 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6218930 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 6219662 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6220676 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 6222173 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 6222754 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 6223447 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6225472 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6226216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6226633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6227091 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6227870 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 6227916 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6230017 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6230530 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6230808 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6233957 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6234016 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6234324 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6238481 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 6238590 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6239158 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6239259 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6239362 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6240534 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6242226 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6246105 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6249539 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6250043 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6251150 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6251757 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6252913 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6253967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6254580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6256672 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6256845 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6257295 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6257299 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6257561 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 6259308 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6260382 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6261704 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6262237 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6264178 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 6264685 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6267279 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6267550 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6270954 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 6273963 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6274126 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 6276371 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 6280685 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6281850 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6281903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6282074 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6284437 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6287523 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6287719 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6295602 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6300272 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6302451 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6303390 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6307158 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6308824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6311741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6312437 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6312819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6313286 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6313367 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 6313537 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6313653 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6318926 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6322981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6326154 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6326788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6328578 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6328656 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6329005 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6329166 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6329441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6329653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6330186 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6331374 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6341728 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6342505 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 6343036 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 6344406 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6345466 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 6347776 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6348443 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6350227 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 6350935 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6352801 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 6353345 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6355618 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6355620 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6357577 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6410142 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 6413851 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6414626 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6415732 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6416063 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 X 6422382 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6426758 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6428160 C G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 6432234 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6432724 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6433074 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 6433940 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6435143 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6437053 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6437208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6438662 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 X 6439826 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 6439974 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6440546 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 6441715 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6441819 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6444371 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6444726 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6446482 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6449448 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 6450142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6453207 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 X 6454525 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6455600 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6455609 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6458557 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6460610 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 X 6460613 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6461655 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 6462789 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6463096 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 6463395 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6465692 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 6466326 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6468841 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 6470102 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 6470714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6471418 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6472439 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6474066 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6474324 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6475022 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6475908 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 6477064 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6479504 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6480641 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 6480884 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6481081 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6481166 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6481175 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 6482814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6484714 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6485002 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6485751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6485870 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6486563 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 6486913 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6487382 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6487615 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 6487905 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6487999 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6488006 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6488228 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6488479 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 X 6488480 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 X 6488887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6490872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6490909 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6491647 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6494400 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 6494710 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 6498131 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 6498527 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6501044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6501156 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6503576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6504605 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6506495 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6507505 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6507891 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6509972 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 6510540 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 6512130 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6513873 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6515771 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6518487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6518704 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6521601 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6521999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6523603 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6524615 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6528308 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6529625 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 6532272 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6534822 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 6536170 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6537045 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6544921 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6556441 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 6556995 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6559968 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 6563617 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6565662 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6569941 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6571567 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6575422 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6584826 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6589708 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6590116 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6593586 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 6593858 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6596917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6602094 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6606948 C G N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 6613661 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6614970 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 6618208 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 6625165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6629715 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6631093 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6631281 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6632641 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6636363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6637009 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6637328 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6637825 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 6640621 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6640710 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6643624 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6643883 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6644294 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6649384 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6649604 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6651009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6652632 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6652804 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6657622 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 6658016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6659041 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6660352 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 6662073 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6662679 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6665169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6669978 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6671126 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6672025 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6672339 G C N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 X 6675897 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6676527 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6676947 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 X 6677857 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6679528 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6680924 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6681805 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6684827 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6685216 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6690199 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6693824 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6694580 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6695264 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6695332 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6695460 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6695543 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6700561 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 6703738 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6703828 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6705864 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6705865 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6707136 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6707294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6707314 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6707384 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6707406 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6707689 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6708378 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6710773 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6710871 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6712826 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6712919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6713072 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6713080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6715889 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6715910 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6716100 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6722903 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6724337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6724387 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6724585 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6725003 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 6726338 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6727207 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6727933 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6729693 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 6731849 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6734722 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6737194 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6741547 T G N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 X 6741550 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 X 6741641 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6742332 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6742372 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6742783 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6746487 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6747128 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6749559 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6751571 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6751611 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 6754091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6755286 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6756241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6757428 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6757814 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6758423 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6759030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6759492 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6760587 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6760847 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 6761062 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6761996 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 6762272 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 6764213 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6765074 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6765853 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6767618 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6768330 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 X 6768482 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 X 6768853 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 6768980 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 6770113 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 6770918 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6775859 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 X 6776324 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6776545 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6776652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6778314 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6779532 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6779539 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6782861 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6783000 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6784382 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6786146 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6787034 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 X 6787072 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 X 6787825 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 6788073 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6788248 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 X 6788270 C A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 X 6788296 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 X 6789208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6789321 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6789329 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6789365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6789369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6789385 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6791027 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 X 6791419 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 X 6791460 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6791792 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 X 6792078 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6792561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6792893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6793267 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 6795145 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 6795551 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 6796709 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 X 6796934 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 X 6796969 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6797433 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6798540 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 6802859 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 6803506 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 6804368 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6805946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6814214 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6814538 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6815166 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6815191 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6816247 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6820486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6821302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6825269 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6825776 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6826961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6827195 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6827211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6827748 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6828135 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6828781 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6831315 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6834376 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 X 6834391 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 X 6834579 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 X 6834726 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 X 6834780 A C N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 X 6834842 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 X 6835176 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6835225 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6835423 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 X 6835693 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 X 6835826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6835852 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 X 6835913 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6835964 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 X 6836055 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 X 6836078 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 X 6836084 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6836247 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6836278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6836417 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 X 6836543 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 6836859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6837361 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 X 6837363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6837930 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 6837966 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 6837994 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 6838509 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6841424 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 X 6844185 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6852092 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6855682 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6858552 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 6859249 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6860748 A T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 X 6860783 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6861218 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 6863806 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6863813 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6864257 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6865323 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6866026 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6866253 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6867600 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 X 6867884 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6868205 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6869259 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6870504 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6870772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6871347 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 6872476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6872523 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6875335 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6879301 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6879470 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6879571 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 6879582 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 6879586 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 6879660 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6879789 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6879862 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 X 6879869 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6880151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6880269 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6880319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6880330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6883034 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6884740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6886176 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 6889764 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 6891962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6892132 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6892133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6892220 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 6892735 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6893525 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 6893706 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6893987 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6895713 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6896369 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6897037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6899226 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6905235 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6905236 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6905935 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6905952 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6907538 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6908258 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 X 6908463 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6912002 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 X 6912585 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6912586 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 X 6913889 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6916622 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6917003 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6917107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6917434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6918308 C T N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 X 6927936 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 6929046 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 6930969 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6934374 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6934873 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 X 6953650 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6953651 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6959013 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 X 6977392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6981327 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6983626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6984537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 6985757 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 6986060 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6986475 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 6989010 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6991788 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6993434 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6996264 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 6996571 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6996990 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 6998311 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 6998568 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7001429 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7003837 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 7003920 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7005175 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7005332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7005663 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7006934 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7007272 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7007389 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7009046 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7014614 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7017077 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7017439 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7017574 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7017582 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7017682 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7018022 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 7018030 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 7018276 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 7019012 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7019940 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7020431 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7021615 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7021849 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7022003 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7022054 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7022302 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7023005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7023101 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7023271 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7023710 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7024956 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 7025107 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7025356 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 X 7025363 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 7025835 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7026047 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 7031444 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7033362 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7035173 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7038453 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 7038549 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 7039253 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7041196 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7042440 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7044487 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7045670 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7046006 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7046042 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7046742 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7048842 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7048950 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7049590 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7051383 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 7051483 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7056377 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 7060306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7060464 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7062486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7063071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7063887 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7064528 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7064856 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7065056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7067461 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 7067672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7068420 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7069264 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7071444 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7073379 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7074050 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7075020 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 7075025 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 7075033 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 7075648 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7076650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7076724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7079430 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7080081 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 7080587 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7081685 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7082003 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7082807 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7087465 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7088561 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7088727 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7090788 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7095727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7096162 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7096356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7098595 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7099744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7099748 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7101529 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7101865 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7102592 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7104250 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7105952 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7106213 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7106262 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7106529 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7106606 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7107094 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7109450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7109995 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7110020 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7111474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7111954 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7112431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7113168 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7113184 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7113236 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7119458 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 7119844 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7121391 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7122858 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 7122958 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 7124180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7124669 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7124782 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7125295 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7125424 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7125754 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7127008 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 7127063 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 7127245 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7127271 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7127352 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 7127510 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7127532 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7127657 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7127662 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 7127672 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7128399 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7130920 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7131261 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 7134758 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7136148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7137287 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 7147139 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7148907 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7152516 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7153471 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7155225 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7157560 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7157613 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7157707 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7160283 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7160690 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7161772 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7166877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7168643 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7168826 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7168832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7168946 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7172356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7174297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7174428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7174542 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7176170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7176246 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7176457 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7178232 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7179608 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7185182 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7185208 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7194594 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7195377 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7196471 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7196508 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7207679 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7208470 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7209012 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7212619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7214067 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 7216417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7219070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7221549 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7228271 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7229985 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7234978 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7235869 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7235870 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7235922 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7236292 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 7237981 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7238285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7240028 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 7240101 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7240109 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7240969 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7242913 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7243984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7246244 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7246968 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 7249694 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7250131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7251527 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7253389 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7253538 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7254052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7254130 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7254288 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7256354 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7257344 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7258962 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 7260000 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 7260624 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7260650 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7264953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7268513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7270729 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7271344 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7271550 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7273574 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 7278779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7283761 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7286115 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7287875 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7290661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7292166 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 7292769 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7293587 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7294246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7294812 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7299160 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7300037 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7301732 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7302777 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7305454 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7307099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7311256 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7311597 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7311790 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7314892 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7314893 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7318978 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7319633 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7319884 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7322040 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7322276 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7323317 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 7325019 G A Y Y 0.5 ALT 0.95 0.95 0.5 0.5 0 1 0 1 1 0 1 0 X 7326007 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7326012 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 7326328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7326920 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7328400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7331857 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7333115 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 7333631 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7334115 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 7335523 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7340630 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7344143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7345199 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7347099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7348638 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7349542 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7352503 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7352590 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7352719 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7352789 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7352858 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7353260 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7353372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7353596 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7354207 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7354815 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7356108 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 7356330 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7356474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7356504 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7357376 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7360178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7367401 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7369653 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7375653 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 7375988 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7377721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7379500 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7380986 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7381030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7381509 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7383719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7384925 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7386156 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 7386491 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7386492 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7388083 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 7388469 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7388569 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7389366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7391630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7399410 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7402244 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7404003 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 7407182 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7407719 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 7407729 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 7412070 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7416753 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 7417603 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7420207 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7421097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7421351 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7421531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7422317 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7422930 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7428562 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7428919 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7432995 T A N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 7435795 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7438375 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7440161 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7440923 T A N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 7441827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7443569 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7450538 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7452482 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7453842 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7455647 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7460113 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7464419 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7466357 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7475271 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7475308 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7476278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7476287 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7476381 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7477994 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7478418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7478565 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 7478892 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 7479259 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7479362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7479492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7479501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7479715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7481294 T G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 X 7482430 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 7483043 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7483061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7484488 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7485321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7487706 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7488235 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7488301 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7490081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7492316 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7492335 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 7492419 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 7494784 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 7495350 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7495979 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7503617 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7504177 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 7504775 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7508618 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7515206 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 7515799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7518352 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7524355 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7527197 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7527468 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7528848 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7529428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7532701 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7533729 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7533980 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7534254 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 7535053 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7536952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7539887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7540262 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7543304 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7543578 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7543589 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7543590 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7548015 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7549342 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7551243 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 7551623 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7552657 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7553527 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 7557132 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7557307 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 7558098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7558472 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 7558511 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 7560711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7561426 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7561789 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7562135 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7562832 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 7563146 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7563391 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7564275 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7564485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7565390 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 7566982 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 7567007 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 7567072 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 7567428 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7569388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7570836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7572695 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 7574910 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7575381 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7575613 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 7576092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7576762 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7576893 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7577620 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7578945 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 7579258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7580925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7582613 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7582719 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7583158 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7585740 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7586249 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7586254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7586306 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7587212 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7587565 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7588581 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 7591527 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 7592501 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7592734 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7592735 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7593015 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 7593277 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 7594178 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7595549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7596685 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7597439 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7598076 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7598919 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7600655 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7600891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7601710 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7602979 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7603020 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7603570 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7605926 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 7608018 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7610047 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 7610251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7611403 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7613028 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7613170 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7614495 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7615036 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7617568 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7618503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7620814 A T Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 7620824 C A Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 7621117 C G Y N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 7622056 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 7622216 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7626455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7627694 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7633552 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7635914 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7636425 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7636894 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7639130 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7642683 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7642816 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7650368 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 7654390 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7655864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7658326 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 7659223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7659554 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 7659595 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7663547 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7664361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7664548 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7666368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7666643 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7669290 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7669431 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7674371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7677675 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7679141 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7684202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7687048 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7687566 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7688129 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7688233 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7693676 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7694403 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7694935 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7696896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7699472 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7699614 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7702143 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7703920 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7705411 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7705835 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7709705 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 7712787 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 7712919 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 7713545 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 7713928 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7715875 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7717954 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7720277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7722651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7722652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7723005 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7729291 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7731323 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7733937 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 7736471 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7738995 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7739056 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7739058 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7740659 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 7741665 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7746035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7747580 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7747965 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7748477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7750893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7751440 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7751460 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7751475 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7751778 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7752821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7758825 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7759771 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 7760251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7760512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7760605 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7760661 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7760933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7761316 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7761436 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7761891 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7762668 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7762729 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7763767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7764606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7764619 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7764624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7766146 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 7768679 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7771722 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7772765 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7776934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7779008 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7781109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7784314 A C N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 X 7791302 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7791849 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7794902 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 7796449 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 7798402 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7801444 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7801689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7801918 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7802011 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7803319 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7803409 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7803618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7804313 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7804433 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7804567 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7804736 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7804848 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7804908 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7804932 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7804956 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7805010 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7806361 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7806667 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7807753 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 7807948 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 7810099 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 7810134 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7816654 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7817809 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7819346 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7820740 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 7821026 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 7821498 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7823665 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7824840 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7825396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7825460 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7826321 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7827399 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7827996 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7835486 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7837733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7839063 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7839081 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7839116 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7839145 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7839318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7840086 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7840402 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7841793 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7841993 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7842009 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 X 7845676 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 7846752 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7852014 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7854363 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7857344 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7860447 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7861606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7863201 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7863810 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7866004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7866064 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7866071 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7866705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7867722 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7867994 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7868662 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7869331 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 7870548 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7872091 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 7872838 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 7878233 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7881714 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7882124 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 7883731 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7884655 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7884941 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7885058 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7886994 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 X 7887683 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7888051 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 7888052 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7890067 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7890677 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 7892229 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7893101 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 7893270 T G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 7894696 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 7897005 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7899957 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7900032 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7901724 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7903675 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7905751 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7906869 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7907550 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7910703 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7911678 G C Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 7911776 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 7911812 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 7915216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7916620 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7916759 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7916761 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7920036 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7921194 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7925577 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7928780 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 7930219 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7930741 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 7930775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7932251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 7934488 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7941066 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 7952388 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 7953859 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 8002428 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8002618 T C Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 X 8002926 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 8012964 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8013579 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8013989 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8039358 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8040314 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8040454 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8041611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8048482 T A Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 8048772 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 8053340 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8053590 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8054537 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8087686 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8089380 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8089732 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8090018 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8090864 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8091896 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 8093703 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8101545 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8102309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8103544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8103882 T A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 8104849 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8105437 G T Y N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 8108479 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 8110977 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 8113917 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8115295 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 8115970 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8117861 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8122393 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8122776 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8125531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8126981 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8136297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8139497 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8142147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8157235 T C Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 X 8160342 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8161914 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8161918 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8164157 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8167965 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8172569 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8173776 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8174618 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8176446 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8181110 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8181156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8181157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8182241 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8182282 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8182483 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8183550 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8186966 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8195197 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8195950 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8197267 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8197286 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8198956 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 8200716 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8202074 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8202318 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8204171 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8204263 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8205289 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8208805 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8209425 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8210044 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 X 8210423 A T Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 8214866 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8215766 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8217662 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8218779 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8220607 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8221439 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8221927 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 X 8223727 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8224223 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8224677 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8224867 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8225009 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8225095 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8225675 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8225993 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8226291 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8226750 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8226755 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8226913 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 8229774 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8230705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8232173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8239842 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8240811 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8245975 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 8246496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8250611 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8250670 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8253794 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8254252 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 8255542 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8255757 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8257324 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8258362 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8258466 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 X 8260907 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8268161 G A Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 8281288 T C N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 8281679 A C Y N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 8284120 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 8297165 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 8297188 T G Y N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 8298835 T C Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 8301430 C T N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 8301522 A G Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 8302195 C G Y N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 8302594 T G N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 8304864 G T Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 8305183 T A Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 8308678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8310345 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8316678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8325260 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8325488 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8340346 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 8340379 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8340787 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8341613 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8347785 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 8347801 C G Y N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 X 8348768 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 8355172 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8355909 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8356118 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8356530 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8357383 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8357988 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8358109 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8358161 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8358924 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8361477 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8362033 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8363550 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8364233 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8364844 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8366299 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8367096 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8367790 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8371641 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 8380526 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8402946 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8405587 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8405769 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8405988 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8406244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8406394 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8408047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8408793 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8410124 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 8410412 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 8411252 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8411999 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 8413053 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8413054 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8414508 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8419600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8420981 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8420990 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 8422888 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8424215 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8425424 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8425618 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 8427949 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8429153 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8430108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8432208 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8433255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8433814 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8433879 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8433880 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8434529 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 8434676 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8436172 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8436615 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 8436654 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 8441359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8441606 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8444285 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8445070 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8450852 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 8451018 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8451108 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 8455827 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8456863 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8458105 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 8459117 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8459531 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8462092 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8462913 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8462914 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8463237 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8463244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8463249 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8464867 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8464977 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8467628 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8473689 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8473918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8477531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8477666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8478507 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8478603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8480072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8481089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8482468 A T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 X 8484096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8486639 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8488311 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8489576 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8491256 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 8491437 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8492910 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8493646 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8494163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8494346 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8496144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8500031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8506480 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8512406 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8513356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8518851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8520228 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8528033 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8528163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8531002 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8532884 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 8534018 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 X 8534090 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8536094 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 X 8572459 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 8582248 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8584046 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8590279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8594865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8598942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8600545 C T N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 X 8655704 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8657927 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8658374 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8658779 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8659471 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 8664467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8668677 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8669904 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8671716 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8673821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8674856 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 8676912 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8680441 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8680442 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8680616 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8683651 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8684453 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8691041 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8691249 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 8691664 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 8695358 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 8696282 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8696606 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8697045 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8697728 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8698308 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8698608 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 X 8700512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8700883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8701235 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 8701661 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8702849 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 8703359 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 8704032 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8705721 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8706079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8706380 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8709168 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8709169 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8710609 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8710702 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8710861 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8713739 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 8714839 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8716031 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8717981 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8718246 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8718913 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8719185 T A Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 X 8719692 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8720399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8720698 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8722240 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 8723789 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8723893 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8725122 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8725199 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8725639 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8726268 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8726269 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8727195 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8727332 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 X 8727333 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 X 8728104 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8729420 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 8729694 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8729698 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8730302 G A N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 8730649 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8730805 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8732841 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8733032 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 8733643 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8733808 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8735575 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8735576 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8735650 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8735811 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8735816 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 8735817 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8735866 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8735882 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8735890 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8735901 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8736105 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 8736109 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 8736275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8736393 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 8736444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8736454 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8736456 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8736606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8736771 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8736897 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8736986 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 8737095 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8737351 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8738612 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8739249 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8739529 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8739556 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 8741155 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8741633 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 8741716 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8741817 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8742393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8742877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8743011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8743085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8743215 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 8743611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8744021 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 8744242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8744255 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8744281 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8744285 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8744331 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 8744421 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8744438 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 8744638 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 8744946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8747450 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8748114 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8749582 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 X 8749893 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 X 8752430 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 8753988 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 X 8754136 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 X 8754200 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 X 8754382 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8754690 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 X 8755231 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 8756118 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 8756921 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 X 8757137 T G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 X 8758723 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8758818 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8758866 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8758889 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8761074 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8761663 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8761989 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8762198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8762268 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8762292 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 X 8762641 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 X 8762786 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 X 8763146 T C N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 0.153846153846154 0.153846153846154 20 6 9 2 2 X 8763948 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 X 8764208 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 X 8764513 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8765408 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 X 8765435 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 X 8766277 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 X 8766810 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 X 8766992 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 X 8767068 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 X 8767157 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 X 8767695 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 8767974 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8768221 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 X 8768435 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8768594 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 X 8768669 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 X 8769136 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8769411 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8769510 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 X 8769842 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 X 8769904 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 X 8770521 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 8770783 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 X 8770811 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 X 8770858 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 X 8770947 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8771112 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 X 8771246 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 X 8771268 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 X 8771470 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 X 8771554 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 X 8771632 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 X 8771741 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 X 8771764 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 X 8771861 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 X 8772010 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 X 8772145 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 X 8772187 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 X 8772289 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 X 8772309 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 X 8772388 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 X 8772480 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 X 8772580 C T N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 X 8772594 C A N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 X 8772614 A C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 X 8772645 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 X 8772682 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 X 8772910 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 X 8772969 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 X 8772973 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 X 8772988 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 X 8772997 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 X 8773020 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 X 8773106 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8774280 C G N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 X 8775166 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 8775168 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 8775419 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 8775559 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 8775668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8775872 C G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 X 8776169 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8776218 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8776329 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8776402 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8776516 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 X 8778718 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8780565 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8781218 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8781648 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8784414 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8786227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8786428 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 X 8786518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8786530 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8786562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8786621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8786633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8787424 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8787425 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8787435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8787910 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8788147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8789087 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8790364 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8790487 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8790497 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8790607 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8791525 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8792847 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8793546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8793703 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8795003 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8795687 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8795992 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8803052 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 8805547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8807764 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 8810075 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8812849 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8813035 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8814027 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 X 8816990 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8817077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8817152 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8817725 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8817795 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8817985 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8818401 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8819797 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 8819812 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8820375 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8820672 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8820848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8821477 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 8823319 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 8823538 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8825278 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8828138 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8828604 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8829134 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8829139 A T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 X 8829149 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 X 8829623 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 8829661 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 8830053 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8830095 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 X 8830304 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8830371 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 X 8830507 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 X 8830629 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 X 8830642 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 X 8830676 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 X 8830722 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 X 8830731 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 X 8830836 C G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 X 8831057 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 X 8831600 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 8832624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8833493 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8833796 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8834531 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 8837167 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 8838612 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8839486 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 8841366 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8841533 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8845929 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8846616 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 8849444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8849599 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 8854257 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 8855745 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 8857340 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 8857342 G A N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 X 8857910 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8858193 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8858315 T A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 X 8858728 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 X 8859472 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8867160 T G Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 8868680 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 8869186 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 8869198 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 8869207 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 8869542 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 8870499 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 X 8870725 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 8870942 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 8874957 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8875118 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8875889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8877209 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 8879134 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 8880485 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 8882806 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8883294 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8883359 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 8883437 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 8884813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8887694 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 8889845 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 X 8890713 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 8891120 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8894748 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 8894934 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 8897483 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 8897823 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 8898321 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 X 8900337 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8900695 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8900719 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8901303 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8901645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8902012 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8903139 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 8906015 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8908044 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8917465 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8918362 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8920685 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 8929022 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8929042 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8931571 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 X 8934009 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8935651 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 8935996 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8937013 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 8937265 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 8949153 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 8950817 A G Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 X 8950818 T C Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 X 8953761 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8954604 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8954973 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8956294 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8958334 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 8958727 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8958728 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8974235 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 8977541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8978607 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8978815 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 8978817 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8978878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8980447 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8980730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8980747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8984055 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8984702 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8984858 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8985275 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8987318 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8987847 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8988053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8989314 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8990495 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8990829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8991149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8991863 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 8993111 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 8993513 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 8994031 G T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 9000096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9000502 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 9000552 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9001154 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9001952 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9001972 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9002516 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9002597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9003092 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9003274 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9003610 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9003935 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9011633 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 9012192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9012241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9012686 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9013271 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9013842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9017869 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9018328 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 9018906 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9021224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9022187 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9022372 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9025521 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9027150 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9027627 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9028604 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 9029170 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9029241 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9030138 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 9030229 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 9030518 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9031104 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9031268 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 9031424 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9031440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9032450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9032769 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 9034335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9034967 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9036480 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9038166 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9038890 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9038980 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9040732 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9041039 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9043722 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9044474 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 X 9045238 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9045455 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9046433 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9047647 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9047686 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9048046 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9049138 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9049621 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9049636 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 9049730 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9050162 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9050195 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 X 9050196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9051283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9051465 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9052029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9052068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9052281 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9052291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9052337 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9052635 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 X 9053697 G T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9054516 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9054670 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 9056476 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 9057430 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 X 9057860 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9058803 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 9058842 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 9058884 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 9059090 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 9059175 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 9059231 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 9059447 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 9060040 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 9061213 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9063894 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 9064195 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9064263 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 9064301 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 9064949 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 9064983 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 9065143 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9065144 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 9065665 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 9065667 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 X 9066307 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 9066979 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 9067144 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9067456 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 9067970 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 9068046 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9068047 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9068075 G C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 X 9068077 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 9068127 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 9068254 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9068373 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 X 9068723 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9069478 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 9070868 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9070871 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9070999 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9071402 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 9071448 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 9071757 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 9072233 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9072280 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 9072382 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 X 9072467 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 X 9072525 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9072567 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9072689 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9072951 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 9073025 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 9073082 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9073239 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9073282 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9073344 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 9073378 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 9073503 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 9074191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9074834 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9074887 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9075446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9075605 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9076329 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 X 9076737 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9076865 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 9086743 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 9086887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9087041 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9087352 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 9087444 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 9087864 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9088200 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9088635 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9088685 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9088860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9089344 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9089440 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9089652 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9091708 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9091844 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9093665 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 9093742 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 9097896 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9103348 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 9106356 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9106392 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9107566 A G Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 9107977 C A Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 9108075 C T Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 9112606 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9112638 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 9114180 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9116384 C G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 9117753 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9120601 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9121272 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 9121319 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9122703 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 9123546 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 9126018 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9127479 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9127504 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9128298 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9128449 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9128487 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9129480 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9132301 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9132312 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9133251 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9137106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9137156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9137845 G A Y Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 4 4 1 2 1 X 9138121 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 9140461 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 9142078 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 9142083 C A N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 X 9148434 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 9149680 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9149681 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9149766 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9152259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9153676 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9153703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9154585 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9154625 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9155421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9155705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9159863 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 X 9160004 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 9160516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9161045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9162222 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9162238 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 X 9162477 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9163286 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9164832 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9166158 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9166452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9166508 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9166751 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9174298 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9174391 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9174737 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9175086 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9177417 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 X 9179856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9181655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9181707 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 X 9181859 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 X 9184058 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 X 9184163 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9184217 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 X 9184249 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9184644 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 9185883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9186037 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9186303 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9186402 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9187206 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 9188832 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9189095 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 9189121 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 9189267 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 9189832 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9189890 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9193090 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9193573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9193596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9193785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9194174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9194185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9194713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9195541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9196703 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9197574 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9197656 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9197875 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 X 9198267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9198523 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9198935 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9199279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9199360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9199583 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 X 9199584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9199615 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 X 9199638 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 X 9199683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9199868 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 X 9199877 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 X 9199905 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 X 9199910 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 X 9200009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9200074 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 X 9200079 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9200081 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9209293 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 X 9209300 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 X 9209348 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 X 9209374 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 X 9209385 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 X 9209442 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9209465 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9209757 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9209791 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9209820 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9209834 C A N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 X 9209835 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 9209963 T C N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 X 9209978 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 X 9210645 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9210754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9210834 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9210843 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9210852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9210934 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9211017 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9211107 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9211277 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9211306 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9211324 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9212042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9212231 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9212608 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 9213004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9213387 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 X 9213443 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9213450 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9213621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9213812 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9214119 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9214127 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9216020 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 X 9216072 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9216176 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 X 9216234 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9216770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9216798 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9217004 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 X 9217061 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9217628 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 9218409 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9218477 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 X 9223548 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9230798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9231775 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 X 9236210 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9236996 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 X 9242290 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9245231 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 9245551 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 9246901 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9247577 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 X 9248571 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9248709 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9248928 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9250237 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9257137 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9263362 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9264030 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 X 9264699 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9267382 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 9267483 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9267536 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9267920 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9268473 A G N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 X 9268571 C T N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 X 9268789 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 X 9268794 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 X 9268855 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 X 9269072 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9269165 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9269400 G C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 X 9269430 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 X 9269494 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9269544 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 X 9269548 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 X 9270970 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 X 9271015 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 X 9271064 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 X 9271127 C A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 X 9271219 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 X 9271323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9271400 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 X 9271401 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 X 9271439 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 X 9271599 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 X 9271641 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 X 9271880 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 X 9271898 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 X 9271964 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 X 9271982 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 X 9272027 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 X 9272108 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 X 9272200 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 X 9272236 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9272245 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 X 9272328 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9272655 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 X 9273076 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9273181 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 X 9273421 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 X 9273956 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 X 9273963 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 X 9274083 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 9274140 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 9274323 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9274447 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 9274488 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 X 9274649 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 X 9274803 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 X 9274990 T A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 X 9275023 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9275124 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 X 9275208 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9275395 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 X 9275408 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 X 9275443 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 X 9275482 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 X 9275620 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9275662 T A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 X 9275698 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9276173 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 9276302 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9276313 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9276361 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9276376 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9276383 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9276421 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9276499 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 9276546 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 9276757 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9276917 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9277425 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9277577 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9277930 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9278286 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 X 9278590 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9278616 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9279223 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9279633 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 X 9279637 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9279777 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9279883 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9279979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9280465 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 9280606 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9280725 T C Y Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 X 9281039 C T Y Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 X 9281167 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9281403 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 X 9281823 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9282598 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 X 9285662 A G Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 X 9286674 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 X 9286836 A T Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 X 9286880 A G Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 X 9288002 T G Y N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 X 9290932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9291183 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 X 9291369 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9291507 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 X 9291548 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 X 9291653 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9292402 C G N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 X 9292422 G T N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 X 9292472 A C N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 X 9292474 C T Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 X 9292631 C A N N 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 12 12 3 6 3 X 9292801 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 10 8 2 6 1 X 9292809 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 9293118 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 X 9293153 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 X 9293187 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 X 9293468 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 X 9293473 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 X 9293847 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9293860 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9294121 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9294207 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9294290 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9294837 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 X 9302927 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9303393 G T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 X 9303785 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9305613 C T Y Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 X 9305644 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9305688 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9305878 C T Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 X 9306525 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9306589 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9306764 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9306784 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 X 9306988 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 X 9307027 C A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 X 9307172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9307777 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9307894 C T N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 X 9308056 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 2 4 0 2 1 X 9308175 T C Y Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.272727272727273 0.454545454545455 0.272727272727273 11 11 3 5 3 X 9308218 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 X 9309013 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 X 9309066 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 X 9309734 A G N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 X 9309752 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 9309769 C T Y Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.25 0.416666666666667 0.333333333333333 11 13 3 5 4 X 9309785 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 9309792 C T N Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.272727272727273 0.545454545454545 0.181818181818182 12 10 3 6 2 X 9310131 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9310200 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 X 9310365 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 X 9310447 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9310590 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 X 9310594 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 X 9310611 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 X 9310628 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 X 9311339 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9314454 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9327320 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9327582 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9328403 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9330709 G A N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 X 9331051 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9331188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9331360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9332171 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9332811 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9333372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9335194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9335631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9338547 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9338635 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9338898 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9339443 A C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 9341626 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9342808 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9343459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9343557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9343608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9344005 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9344127 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9346654 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 9348499 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9349792 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9350013 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9350156 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9350186 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 9353534 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9353753 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9353791 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9353836 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9354476 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9355061 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 9355360 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 9355644 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 9355665 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9355751 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9355883 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9355970 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9356102 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9356217 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 9356492 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9356944 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9356949 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9359310 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9362806 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 X 9363048 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9363155 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9364774 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9365121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9366004 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9366633 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9368267 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9368298 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9368308 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9368373 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9368438 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9368443 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9368578 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9368953 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9368971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9369202 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9369285 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9369460 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9371060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9371499 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9371682 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9372607 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9373030 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 9373408 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9374363 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9374522 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9375378 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9375990 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9376092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9376093 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9376191 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9376381 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9376451 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9376469 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9376542 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9376633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9376832 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9376953 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9376960 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9377006 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9377012 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9377199 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9377306 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9377359 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9377492 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 9377617 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9377823 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9377842 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9377911 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9378092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9378108 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9378250 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9378266 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9378277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9378283 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9378306 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9378440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9378684 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9379899 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9379929 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9380030 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9380283 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9380974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9381262 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9381310 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9381770 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9382065 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9382179 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9382489 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 9382492 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9382495 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 9382907 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9383524 A C N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 9383532 C A Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 9383650 G T Y N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 9383656 G T Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 9383672 A C Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 9384142 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 9384862 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9385119 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9385190 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9385200 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9385319 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9385512 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9385611 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9385612 C G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 X 9385929 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9386362 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9386572 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 X 9386771 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 X 9386912 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9386950 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 9388171 T A N N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 X 9388297 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9388881 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9389184 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 X 9389306 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 9389902 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 9390073 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 9393132 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9394452 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 9394453 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 9395233 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9395884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9395968 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9396172 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9396334 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9396579 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9396590 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9396668 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9396698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9396863 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9396934 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9397755 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 9397765 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9397960 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9398731 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9398809 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 X 9398858 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9399391 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9399586 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 X 9399857 T G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 9399909 G T Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 9400133 T G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 9400280 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9403927 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9404031 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9404102 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9404103 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9404124 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9404386 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9404602 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9404882 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9405019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9405023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9405899 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9406697 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9406816 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9408206 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9408849 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9409139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9409180 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9409429 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9409550 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9410200 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9410414 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9410911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9410932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9411010 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9411030 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9411749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9412776 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9412871 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 9412997 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 9413196 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 9413525 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 X 9413609 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9413790 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9414389 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9414580 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9414620 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9414913 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9416641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9416982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9417328 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9417433 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 9417844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9418175 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9418343 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9418344 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9418414 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9419523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9419796 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9420460 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9420821 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9421034 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9421354 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9421396 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9421917 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9422679 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9423812 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9423901 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9425403 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9425832 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9426068 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9426284 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9426285 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9426358 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9426398 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9426470 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9426599 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9426670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9427127 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9427176 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9427483 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9427597 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9427969 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9427970 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9428085 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9428419 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9428714 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9428932 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9429020 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9429051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9429474 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9429502 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9429509 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9430379 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 9430765 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9430777 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9430779 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9430957 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9431218 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 9431219 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 9431396 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 9431530 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 9431648 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9431793 G C Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 9431829 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9431961 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9431995 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9432048 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9432854 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9432959 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9434241 C A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 X 9434803 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 9435575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9435845 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9437027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9437991 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 9438138 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9438238 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9438648 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 9440437 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 X 9440577 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9440613 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 X 9441154 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 X 9441391 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 9442231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9443247 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 9444105 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9444394 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 9444715 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9445991 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 9449245 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9452262 T C N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 9453460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9454640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9454665 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9460175 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9461375 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 9461381 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 9462739 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9474275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9475885 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9477913 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9482999 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 9483336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9483579 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9484009 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9485914 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 X 9486011 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9486254 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9486422 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9487199 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9487327 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9487540 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9488097 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9488198 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 9488329 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9489500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9489502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9489864 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9493151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9493334 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9493833 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 9493952 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9494367 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9494646 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9496031 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9503572 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9505644 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9506498 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9507915 G A Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 X 9508259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9508669 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9509594 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9510319 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9511512 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9511716 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 9511738 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 9512007 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 9512185 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9512681 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9512780 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 X 9512982 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9512988 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9513927 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 9514020 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 9514183 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 X 9514363 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9514394 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9514714 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 X 9515430 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 9515658 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9515713 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 9515763 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 9515869 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 9515914 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 9515942 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 9516185 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9516230 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9516349 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 9516358 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9516429 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9516454 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 9516485 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 9516562 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 X 9516563 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 X 9516650 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 9516659 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 X 9516676 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 X 9516722 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9517146 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 X 9517467 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9518041 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9519138 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 X 9519347 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 9519568 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9519625 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 9519911 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 9520115 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9520530 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9521494 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9522340 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9524461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9525334 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9525578 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9526092 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 9526208 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 9528181 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9528913 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9528925 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9529245 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 9529657 G T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 9532532 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 9537135 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9538143 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9542446 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9542559 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9542611 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9542773 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 9543084 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9543116 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9550515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9550529 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9551047 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9551787 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9554290 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9554835 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9554863 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9555230 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9556267 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 9556635 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9557634 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9559127 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 9561963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9564023 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9565156 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9566075 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9566171 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9566638 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9567208 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9569453 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9569626 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9573580 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9574173 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9574249 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9574934 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9575396 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9575404 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 X 9576387 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9578390 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9578991 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9580093 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 9580140 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 9580352 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9581089 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 9581131 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9581230 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9581352 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 X 9582303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9582413 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 X 9582771 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 9582875 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 9583339 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9583450 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 X 9583662 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 9584111 C A N N 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 X 9584712 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 9584858 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 9584941 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 9584962 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9585543 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9585603 T A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 X 9585693 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 X 9586785 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9586857 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 9587445 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9588466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9588566 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9588627 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9589242 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9589269 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9590419 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9590615 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 9591368 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 X 9598893 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 9601425 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9602326 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 9602339 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9603183 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 9603714 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9604817 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9605657 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9605787 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9608108 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9608679 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9613598 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9614008 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9614653 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9615090 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9616186 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9616187 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9617212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9621912 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9626222 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9627506 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 X 9627855 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9631165 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9631535 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9632292 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9632371 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9632384 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9632414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9632464 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9632467 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9632478 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9632501 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9632564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9632798 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9632991 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9633182 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9633446 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 9633585 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 9633639 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 9633922 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9633975 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9634021 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9634037 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9634055 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9634141 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9634157 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9634174 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9634210 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9634223 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9634301 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9634800 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9634883 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9634947 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9635079 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9635119 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9635279 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9635286 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 9635289 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9635297 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9635388 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 X 9635411 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 X 9635548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9635943 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9637153 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9638876 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.7 0 0.3 28 12 14 0 6 X 9639694 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9640909 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9641760 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9648180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9648181 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9649056 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9649714 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 9650348 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9650572 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9650772 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9650788 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9651369 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9651399 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9651547 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9651550 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9651826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9651982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9652103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9652204 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9652267 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 9652400 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9652496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9652503 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9652581 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9652645 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9652733 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9652787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9652792 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9652999 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9653353 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9654030 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 9654253 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9654423 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9654627 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9654763 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9656158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9656185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9656217 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9656497 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9657153 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9657463 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9657483 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9657592 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9657614 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9657793 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9658018 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 9658328 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9658378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9659011 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9661335 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9661554 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9661563 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9661666 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 9662003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9663321 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9664859 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 9665453 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9665484 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9666451 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9667299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9667469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9667606 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9670208 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9670963 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9671027 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 9677261 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9677637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9678768 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9681435 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9682320 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9682664 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9683524 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 9683630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9683691 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9683753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9683754 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9683759 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 9683776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9684767 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9685065 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 9685246 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9685497 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9685707 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9692172 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9694350 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9695654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9697973 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9702532 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9704673 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9705316 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9705553 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9705711 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9706044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9706272 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9706777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9706974 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9707595 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9708463 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 9708493 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9708683 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9709925 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9711839 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 9712713 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9713822 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9714396 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9718457 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9720239 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9720390 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 9720495 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9720966 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 9722615 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9723242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9723280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9723473 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9723568 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9723581 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9724332 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 9729156 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9730598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9732090 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 9735609 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9736629 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9741389 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9741731 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9742374 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9743039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9744296 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9745251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9747769 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9747818 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9748058 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9748069 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9755718 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9758929 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9761164 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9761996 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9762204 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9762476 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9763036 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9764037 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9764468 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9765772 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9768307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9770138 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9770212 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9770292 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9770864 G T N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 9771195 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9771586 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9772960 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9773565 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 9773652 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9773814 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9773815 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9774060 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9774409 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 9774688 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9774962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9776508 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9776640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9776658 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9777004 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9777026 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9777112 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9777195 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9777256 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9777642 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9779032 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9779427 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9779490 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9779766 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9779917 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9779987 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9781016 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9781579 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9781606 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9781709 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 9781826 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 9781999 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 9782092 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 9782150 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9782219 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 9782469 T C N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 9782517 T G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 9782874 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9783093 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9785201 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9785400 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9786347 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9787635 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9787641 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9787642 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9787729 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9787843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9787905 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9787980 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9787992 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9788239 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9788261 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9788288 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9788448 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9788638 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9788639 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 9788725 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9788776 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9788866 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9789042 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9789232 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9789328 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9789968 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 9790006 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9790076 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 9790115 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 9790179 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9793316 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9793580 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9796037 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9796604 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9799998 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9802134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9803703 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9805608 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 9806547 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9807237 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9807406 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 9811216 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9811766 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9812834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9813846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9814083 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9818761 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9819938 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9820807 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9821006 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9821765 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9824914 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9826767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9827459 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9828159 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9828818 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9828951 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9829207 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9829685 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9832866 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 9833704 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9833765 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9834700 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9836201 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9836491 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9837145 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 9837228 G T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 9837576 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9839273 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9840230 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9844510 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9847596 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9848019 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9848180 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9848775 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9851686 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9851994 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9854696 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9854779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9856971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9857040 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9858289 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9859364 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9861932 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9863102 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9863430 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9863599 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9864157 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9864357 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9864651 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9865180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9865452 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9865577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9866819 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 9867635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9867651 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9869686 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9870755 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9871459 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 9871912 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 9872676 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 X 9873245 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9874337 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9874730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9876890 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9879091 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9879783 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9881696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9884007 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9884943 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9889340 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9893110 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9893212 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9893655 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9893841 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9894679 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9895496 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9896370 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 9896601 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9897291 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9897940 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 9898177 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9898253 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 9898371 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9900293 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9900364 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9901511 A G Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 X 9902032 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9902952 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9902965 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9903840 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9903863 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9903997 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9904095 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 9904126 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9904147 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 9904298 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9904774 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9905965 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9906040 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 X 9906689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9906697 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9907708 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9907781 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9907815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9908048 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9908236 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9908251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9908267 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 X 9908271 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 X 9908304 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9908341 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 X 9908420 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9908667 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9909194 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9909205 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9909219 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9909865 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9909909 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9910059 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9910066 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9910536 C T Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 9910564 A C Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 9910882 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 9911169 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9912278 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 9912293 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9912303 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 9912304 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 9912363 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9912423 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 X 9912781 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 X 9912866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9912926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9912942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9912956 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 X 9912957 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 X 9913013 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9913019 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 X 9913032 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 X 9913077 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 X 9913097 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9913127 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 X 9913146 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 X 9913158 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 X 9913160 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9913207 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9913785 A T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 X 9913820 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9913887 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 9914078 C G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 X 9914098 A G N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 X 9914106 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 9914137 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 9914219 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 9914337 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9914346 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9914396 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 X 9914442 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 X 9914768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9915214 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9917114 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9918102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9919426 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 X 9920182 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9923590 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 X 9923817 A G N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 X 9923821 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 9923882 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 X 9924156 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9924399 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9924590 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9924684 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 X 9924704 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9924793 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 X 9924833 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9924923 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9924940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9925132 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9926098 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9926432 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9926503 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9926570 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 9926700 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 9926995 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9927015 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9927367 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 X 9927560 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 9927905 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9928238 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 X 9928451 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 X 9928627 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 X 9928747 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 X 9930023 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 9931456 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9932291 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9936135 A C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 9941387 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9945434 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 9948120 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9950816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9953818 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9954278 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 X 9959882 A T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 X 9960007 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9961101 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 X 9961313 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9961455 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9961851 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9963001 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 X 9963282 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 X 9963357 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9964285 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9964297 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9964541 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 9966206 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9966803 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9967407 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9967706 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 X 9971281 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 9973091 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 9974950 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9975035 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9975647 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9976213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9978842 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9979317 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 9979526 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 9986806 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9987783 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9988253 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9988528 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9988841 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9988942 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9989730 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9989832 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9989857 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9989925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9989999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9990068 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9990580 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9990737 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9990949 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9991026 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9991335 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9993154 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9994025 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9994399 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9994445 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9994526 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9994938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 9994961 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 X 9995135 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9995311 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 X 9995368 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 X 9995374 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 X 9995457 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 9996255 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 9996772 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9996792 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 9998232 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 9998843 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 X 10000041 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10002973 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10003304 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10004967 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 10006316 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10006568 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10006916 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10007276 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10007699 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 10007997 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 10010805 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10010967 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10010997 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10011093 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 10017698 T G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 10017906 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 10018217 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 10019078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10019287 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 10019426 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 10021155 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10026843 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10027210 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10027330 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 10029582 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10033243 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10034905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10035571 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10036108 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10036526 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10037185 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10041967 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10043654 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10045972 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 10047243 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 10048019 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10049806 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10052788 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10056116 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10057856 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 10058780 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 X 10059338 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10063412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10064887 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10068488 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 10069552 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10074137 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10074876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10075088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10078015 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10079460 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 10080879 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10081871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10084031 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10084743 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10084985 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10085045 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10085350 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 X 10085512 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 X 10085632 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 X 10085859 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10086629 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10086977 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10087013 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10087550 G A Y Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 5 7 2 1 3 X 10087551 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 10087690 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 10087760 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 10087829 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 X 10088086 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10088285 T C Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 X 10088692 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 X 10089196 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 X 10089626 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 X 10089644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10089769 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10090078 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 X 10090087 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 X 10090221 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10090222 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 X 10090530 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 10090797 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 10091998 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10093102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10093580 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10093815 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10094750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10094800 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 X 10094819 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 X 10094938 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10095260 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10095700 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 10095920 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10096600 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10096679 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10096843 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 X 10096860 G A N Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.8 0 0.2 8 2 4 0 1 X 10096880 A G N Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.75 0 0.25 6 2 3 0 1 X 10096899 A C N N 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.8 0 0.2 8 2 4 0 1 X 10096908 A G N Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.8 0 0.2 8 2 4 0 1 X 10096918 G A N Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.8 0 0.2 8 2 4 0 1 X 10096947 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 X 10096981 A G N Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.8 0 0.2 8 2 4 0 1 X 10096999 A C N N 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.8 0 0.2 8 2 4 0 1 X 10097003 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 X 10099040 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10100643 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 10100645 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 10100912 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10101010 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 X 10101018 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 10109228 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 10111226 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10113917 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10114186 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10116273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10116476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10118653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10121743 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 10122601 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10122768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10124187 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10124198 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10124360 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10133008 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10133825 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10134189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10139297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10144664 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10145167 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10146342 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10148425 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10150404 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10151102 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10155419 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 10155886 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10156150 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10156151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10164526 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10165397 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10168884 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10179396 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10181061 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10182498 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 10182757 T C N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 X 10182825 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 10182887 G A N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 10182986 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 X 10183286 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10183511 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10183811 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10183992 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 10184234 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 X 10184270 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 X 10184415 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 X 10184416 G T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 X 10184444 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 X 10184681 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10184792 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 10184804 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10184927 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 10185051 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 X 10185310 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 X 10185372 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10185438 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10185483 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 10185583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10185782 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10185785 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10185871 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10185879 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10186703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10188575 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10193026 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 X 10193408 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10193578 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 10193975 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10196971 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10197811 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10198234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10200893 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 10202304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10202715 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10203681 C T Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 X 10207775 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10208878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10209014 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10212077 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 10212175 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 10212803 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 10213400 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10213808 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10213972 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10214310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10220326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10221479 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 10221873 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 10221919 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 10222234 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 10223009 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10226130 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 10227381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10227417 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10227931 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 X 10228861 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10228932 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10228970 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10229031 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.4375 0.125 0.4375 16 16 7 2 7 X 10229114 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.388888888888889 0.166666666666667 0.444444444444444 17 19 7 3 8 X 10229134 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 X 10229296 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 X 10229551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10229702 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 X 10229720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10230767 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 X 10231092 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10231210 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10232393 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10232431 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10232447 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10233255 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10234246 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10234370 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10234491 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10234712 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 10234713 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 10234725 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 X 10235706 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10235828 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10235996 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10237439 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10240108 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 10241413 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10244633 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10245526 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10245602 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10245632 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10247793 C A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 10250887 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.368421052631579 0.0526315789473684 0.578947368421053 15 23 7 1 11 X 10251055 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10253799 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10254361 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 10254977 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10255908 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 10256289 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10256441 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 10258577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10259891 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10260426 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10260469 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10260667 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 10260728 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5625 0.125 0.3125 20 12 9 2 5 X 10261338 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10262388 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10265855 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10266143 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10266299 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 X 10266555 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10266691 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.411764705882353 0.176470588235294 0.411764705882353 17 17 7 3 7 X 10267021 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 10269831 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10273357 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10273358 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10274678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10275988 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 X 10277231 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10277628 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10280707 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 10282486 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10284774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10285107 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 X 10285444 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.277777777777778 0.111111111111111 0.611111111111111 12 24 5 2 11 X 10285472 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.333333333333333 0.111111111111111 0.555555555555556 14 22 6 2 10 X 10285659 A T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 X 10285975 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10285979 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 X 10286041 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 X 10286111 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 X 10286372 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 10286506 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 X 10287811 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10288541 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10288553 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10288555 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 X 10288769 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 10288813 T A N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 X 10288851 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 10288926 A C N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 X 10288960 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 X 10289118 A T N N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 X 10289502 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 10290039 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 10290508 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10291712 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10299397 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 10299527 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 10301519 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10303905 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 10303914 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 10303918 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 10303921 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 10305478 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10307731 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10308533 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 10309091 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10311489 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10314095 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10317848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10320670 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10321709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10327102 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 10327577 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 10330026 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10342363 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10344977 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 10348807 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 X 10349096 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10350660 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10354459 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10357004 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 10359866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10360284 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10360606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10360776 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10360994 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10362034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10362790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10363770 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10363794 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10366348 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10366739 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10367279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10367493 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10367891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10369163 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10371718 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10375511 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10376866 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10379729 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10380022 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10380416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10383081 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10386573 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10389533 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 10393289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10394555 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10396976 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10399115 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10399439 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10400604 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10400833 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10402167 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10403770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10404783 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10408572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10408749 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 X 10409128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10410141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10410945 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 10411052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10412722 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 X 10412814 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 X 10412829 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 X 10413025 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 X 10413184 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10413398 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10413665 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10413730 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.210526315789474 29 9 14 1 4 X 10413820 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10413862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10414081 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10414083 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10414315 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10414365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10414393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10414551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10414561 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10414567 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10414579 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10414616 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10414629 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10415061 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 10415098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10415110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10415163 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10415183 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10415191 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10415230 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10415701 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10415952 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.8 0.0666666666666667 0.133333333333333 25 5 12 1 2 X 10416284 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10416426 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 10416626 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 10416827 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 10417094 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10417371 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 X 10417868 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10419411 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10419593 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 10420154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10420171 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10420664 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10423372 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10424191 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10425807 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10432976 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10433560 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 10434416 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10435448 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10435537 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10435896 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10437038 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10437184 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10440251 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 10441785 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10442550 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10442580 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10444602 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10445031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10446055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10446719 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10447578 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10447639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10447915 A T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 10448817 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10449596 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10449733 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10450097 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10450372 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10450725 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10450753 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 10452218 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 X 10452263 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10452771 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10452886 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 X 10453046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10453294 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 X 10453402 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10453731 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10453791 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10455154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10455904 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 10460284 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10462464 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10463857 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 10464160 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10467679 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 10467730 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 10468423 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10469984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10470044 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10472400 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10472868 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 10473202 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10473606 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 X 10473629 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 X 10473670 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 X 10473675 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 X 10474038 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 X 10475157 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10475275 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10476674 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 10476784 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 X 10476896 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 10480460 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 10484534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10485149 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10485940 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10486488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10486497 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10486511 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10486633 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10487964 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10488286 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10489614 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10490890 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10492226 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 10492335 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 X 10496133 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10496514 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10497605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10499709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10499790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10500562 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 10504166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10506972 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 10507201 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 10509665 C G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 X 10510005 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 10511494 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10511938 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10512988 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 10512989 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 10517976 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10519326 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 10520075 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 10521453 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10524176 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10524680 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10533962 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10533986 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 X 10534942 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10534949 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10537895 T C N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 X 10538468 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10539010 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10539485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10539625 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10549961 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10553464 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10555582 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10556803 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 X 10558488 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10562688 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10562756 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10565369 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10565390 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10566248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10566249 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10566292 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10566356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10566649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10567520 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 X 10567557 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10567903 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10568172 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10568521 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10569230 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 10569487 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10569734 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 X 10571505 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10571726 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10571832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10572814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10575163 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10577712 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10577772 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 10578338 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 10579508 G C N N 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 9 11 2 5 3 X 10579658 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 10579794 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10580245 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 10580354 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 10580408 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 10580440 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 10580463 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 10580486 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10580530 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 X 10580781 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 10580909 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 X 10580919 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10581003 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10581035 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 X 10581048 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10581064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10581120 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10581140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10581219 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 X 10581259 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 X 10581279 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 X 10581371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10581373 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 X 10581465 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 10581505 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10581531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10581561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10581788 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 10581794 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10581891 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10582004 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10582073 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 10582167 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 10582440 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 10582453 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 10582590 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 10582608 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 10582615 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 10582625 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 10582946 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 10582974 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 10582989 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 10583041 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 10583046 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 10583090 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10583473 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10583476 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10583487 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10583634 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10583638 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10583740 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 10583797 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 10583935 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 10584544 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10585284 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 10585516 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10585787 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10591505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10594851 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10594983 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 10595231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10598389 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 10601150 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10601161 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10601875 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10606335 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 10607241 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 10607358 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 10609322 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10609463 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10609486 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10614844 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10615171 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10615465 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10621176 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10621869 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10623533 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10628444 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10628999 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10630207 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10631035 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10634520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10637689 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 10637749 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 10642324 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10643131 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10644600 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 10644601 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 10645020 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10645248 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10645581 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10646788 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 10647832 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 10648572 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10649493 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10650137 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10650785 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10653963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10659798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10660496 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10661464 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10661860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10664951 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10665100 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 10666567 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10666591 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10667765 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10667989 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10670827 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10671120 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 10673086 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10673748 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10674295 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10675600 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 10676942 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10677607 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 10677864 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10680965 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 10680985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10684963 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10688821 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10690709 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10691400 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10692058 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10693427 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10693659 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10694719 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10695361 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 10696032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10696156 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10696517 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 10697488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10699494 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 10700313 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 10700480 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 10701118 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10702843 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10704670 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10704680 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10704758 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10707591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10709090 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10709920 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10713356 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10717815 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 X 10718121 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10719182 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10721241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10728972 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10729061 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10729189 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 10730714 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10735345 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 10739183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10740166 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10740867 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10740883 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10741029 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10741030 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10741046 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10742207 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10743694 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10746144 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10748078 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10749172 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10749344 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10750288 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 X 10750955 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10751223 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10751901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10755783 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10756845 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10759580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10760150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10760352 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10761600 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10762174 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10762459 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10763519 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10764255 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10764916 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10765475 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10765529 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10767333 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10767977 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10768214 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 10768284 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10770007 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 10770410 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10771084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10773862 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 10774256 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10774820 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 X 10774840 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 X 10774864 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 X 10775210 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 X 10775247 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 X 10777050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10778179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10778436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10779428 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10785361 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 10787880 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10788400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10789651 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10789653 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 X 10790439 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10791154 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10791181 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10791200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10791306 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10791309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10792614 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10792670 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10792761 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10792802 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10792804 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10793604 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10793708 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10793802 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10793993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10794032 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10794442 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 10794532 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10794775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10794806 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 X 10795457 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 X 10795504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10795544 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10795598 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 X 10795832 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 X 10795965 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 X 10796190 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 10797306 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10797337 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 X 10797431 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 X 10797539 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10797584 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 X 10797612 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 X 10797660 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 X 10797753 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 X 10797856 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10798201 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 X 10798251 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10798267 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 X 10798355 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 X 10798498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10798503 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10798812 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 X 10799224 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10799745 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10799893 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10800050 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10801339 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10802680 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10803210 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10803925 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10804007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10805677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10805683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10807494 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10807682 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10807951 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10809526 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10812721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10814412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10816837 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10817595 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10818717 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10819749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10821381 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10821928 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10823304 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10825188 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10826636 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10829944 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10830664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10830800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10834633 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10836618 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10837794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10840122 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 10842045 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10842873 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10843062 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10843956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10844695 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 X 10845205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10845382 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 X 10845629 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10845970 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10846012 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10846676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10847734 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10847933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10848007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10848715 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10848716 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10850831 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10850853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10851239 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10852733 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10852837 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10853744 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10857092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10857806 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10860391 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 10862601 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10865418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10870230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10871029 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 X 10871300 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 X 10871468 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 X 10871780 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 X 10871788 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 X 10871988 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10872154 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 X 10872312 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10873871 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 X 10874225 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 10875231 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10904991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10905008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10905110 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10905215 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10908316 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10909554 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 X 10911305 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10911386 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10911802 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 X 10912084 A T Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 X 10912108 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10912504 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10912635 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10912754 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10912768 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 X 10912771 T A Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 X 10912781 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 X 10912825 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 X 10912842 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 X 10912855 G C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 X 10913009 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 X 10913099 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10913138 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 X 10913144 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 X 10913173 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10913476 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10913491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10913549 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10913813 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10914366 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 X 10914403 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 X 10914546 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 X 10914640 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 X 10914664 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 X 10914667 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 X 10914687 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 X 10914732 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 X 10914832 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10914948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10915404 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10915487 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 X 10915515 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10915922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10916626 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10917106 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10917459 G T N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 X 10917602 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10917684 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 10918154 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 10919122 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10919200 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 X 10919249 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 X 10919364 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 X 10919485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10921548 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10921804 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10923655 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10924073 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10924253 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10924491 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10924548 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10924567 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10925023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10925228 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10925368 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10925380 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10925900 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10927444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10929039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10929114 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10929161 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10929183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10929364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10929381 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10929445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10929514 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10929588 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10929597 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10929930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10930412 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10930499 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10932699 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 X 10932865 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 X 10932977 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10933964 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10934025 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10934038 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10934189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10934246 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10934312 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10934684 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 X 10936167 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10936221 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10937441 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10937463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10938235 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 X 10939443 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10940611 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10942771 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10944027 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 X 10944227 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 10949180 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 10950424 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10952383 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 10952647 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10952705 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10952823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10953389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10953503 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10954316 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 10954551 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10955194 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 X 10955292 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 10955670 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10955896 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10957148 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 10957260 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10958284 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 10958295 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 10958365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10958419 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 10958425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10959373 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 X 10959615 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 10959749 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 10959798 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10959948 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 10960024 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10960088 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 10960162 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10960591 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 10960852 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 10960927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10960934 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 10961111 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 10961220 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 10961488 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 10961884 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 10962624 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 10963108 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 10964073 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10964996 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10965177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10966659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10966901 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 10968152 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 10968332 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10971991 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 X 10972468 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10973274 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 10973734 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10974022 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10974058 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 10974390 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10974405 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 10974458 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10975043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10975818 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10975851 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10977770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10979056 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10980038 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 10983125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10983947 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10986139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10986429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10989264 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10989272 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10990025 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10991271 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10992265 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 10992849 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10994043 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 10994124 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 10995792 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10995828 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 10997100 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 10997712 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 10998631 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 10998767 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 10998868 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 X 11001584 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11003744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11005746 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 11006113 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 11007502 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 11011732 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 11011785 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11012536 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11012716 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 11013452 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 11013537 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 11014030 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 11014478 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11015615 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 11015873 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11020168 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 X 11020828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11025798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11026603 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 11027962 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11028604 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11030644 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 X 11032645 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11033394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11037031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11037888 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11037956 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 X 11038832 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11039681 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11041067 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 11042201 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11044497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11044498 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11045147 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11045209 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 11046379 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11046458 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 11046690 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 11047220 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11047227 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11048100 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 11048261 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11050697 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11051355 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11052785 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11053317 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11056933 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11057417 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 11058201 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11058340 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11059021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11059421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11059557 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11060697 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11060731 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 11061051 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 11061606 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 11061992 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 11062052 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11062082 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 11064962 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11066528 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 11067521 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11070073 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11070104 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11072825 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11075957 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11076985 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11078542 G T Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 11079369 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11080254 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 11081527 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 11084534 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11086294 C T Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 X 11087060 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 11087292 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 X 11091044 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 11091417 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 11091925 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 11093740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11094703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11094755 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 11095202 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 11095243 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11096442 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11096772 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11097410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11098574 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 11100442 G T Y N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 X 11102695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11103134 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11103550 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 11104736 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11104797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11104883 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11105239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11105449 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11105611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11106374 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 11107810 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11108066 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 11108654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11108822 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11109178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11109718 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 11110041 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11110320 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 11110780 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11112623 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 11113288 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 11116265 G T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 X 11117178 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 X 11117222 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11118465 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11119151 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11119501 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 11122065 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 11122480 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 11125862 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11127733 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 11128255 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11128804 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11129199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11130137 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 X 11130757 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11133399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11136178 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11140909 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 X 11143462 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11146316 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 11147576 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 X 11147961 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 X 11152172 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11154515 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11154849 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11157352 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11158624 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11159997 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 X 11160321 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 11163987 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11164218 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11165169 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11165332 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11165477 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 X 11166846 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11168106 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11169126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11170844 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11171077 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 11172814 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 11173136 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11173948 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 X 11174118 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11175877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11177152 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11180108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11181887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11182246 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11182308 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11183064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11184227 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11190394 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11191653 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11192062 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11197406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11198488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11200686 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11201472 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 11202434 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11202879 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11203321 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11205202 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 11208937 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11209830 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11214021 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 11214460 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11218165 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11220830 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 X 11221368 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11223962 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11224944 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 11226645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11226730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11227863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11231720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11234050 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11234635 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11235676 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11236101 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11237737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11238103 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11243783 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 11244671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11245342 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11245747 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11246058 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 X 11247291 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11247577 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11250127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11252939 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11253139 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 11257469 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 11259002 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 X 11259028 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 X 11259100 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11259153 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 X 11259245 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11259266 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11259303 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11259345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11259510 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 X 11259529 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 X 11259587 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11259658 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11259926 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 X 11260165 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11260904 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 X 11260911 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 X 11261124 C A N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.133333333333333 0.733333333333333 0.133333333333333 15 15 2 11 2 X 11261188 A G N Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 10 10 2 6 2 X 11261201 A G N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 X 11261246 G T N N 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 2 4 1 0 2 X 11261642 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 X 11261839 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 X 11261899 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11261904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11261945 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 X 11262043 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 X 11262061 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 X 11263361 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11264413 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 11265690 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11265692 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11267007 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11268013 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11268093 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11270059 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 X 11271326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11273092 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11273750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11274249 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11277954 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11282435 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11282514 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11283215 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11284080 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 11285644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11286030 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11286386 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11287419 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11287696 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11288888 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11292529 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11292933 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11293287 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11293290 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11294861 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11295995 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11296298 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11296825 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11300057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11300303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11302090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11302284 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11303022 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11304640 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 X 11306303 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11306377 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11306392 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11306666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11309498 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11310705 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11312902 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11317147 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11318604 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11319442 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 X 11319553 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 X 11320324 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 X 11320438 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 11320464 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 X 11320469 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 X 11320497 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 X 11320546 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 X 11320770 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 X 11320891 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11320896 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 X 11321082 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11321111 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 X 11321193 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 X 11321195 C G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 X 11321262 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 X 11321353 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 11321375 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 11321446 A T N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.133333333333333 0 0.866666666666667 4 26 2 0 13 X 11321912 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11321954 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11321956 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11322057 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11322063 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11322065 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 11322074 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11322135 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11322403 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 11322538 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11323512 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 X 11323592 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11323641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11323685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11324210 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 X 11324225 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 X 11324235 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 X 11324236 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 X 11326412 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11326938 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11327487 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11328112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11328113 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11328413 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11328419 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11330230 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11331072 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11331296 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11332402 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11333051 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11333266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11334639 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11335060 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11339265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11340071 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11340198 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11341907 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 11341951 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 11341963 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 11342005 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 11342052 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 11342068 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 11342074 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 11342252 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 11342304 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11342322 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 11342380 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 11342559 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 11342564 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 11342603 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 11342678 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 11342722 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 11342737 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 11342766 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 11342768 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 11342830 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 11342861 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 11343839 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11344577 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11344930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11347365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11347852 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11349692 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11351996 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11354877 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 11355282 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 X 11356625 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 X 11357026 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11359197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11360472 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11362787 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 11363415 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11364282 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11365586 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 X 11366550 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 X 11367082 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11367277 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11367831 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11368647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11369540 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 11369679 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 11370106 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11370262 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11370782 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11372849 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11373440 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11373449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11373506 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11373586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11376529 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 X 11378170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11379134 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11380289 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11381646 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11381699 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11381866 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11382713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11385567 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 11387920 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11389475 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 11390754 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11397261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11399437 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 11399917 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11400915 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11403548 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 11403806 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 11404554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11405518 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 X 11405560 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 X 11405902 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11407039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11408327 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11410020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11410418 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11410553 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11410554 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11411067 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11411164 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 11413712 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11414113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11415939 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11418468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11418954 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11419974 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 11421048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11421145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11421460 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11422225 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11422377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11423002 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11423214 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11424628 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11425263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11425659 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 11426881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11428091 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11429289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11430217 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11430758 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 11431615 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11432753 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11433572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11433739 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11434291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11445939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11446311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11446452 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11446937 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11447179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11449858 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11450208 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11450218 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11450920 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11455099 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11455183 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 11455927 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11456952 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11458048 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11458311 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11458950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11460352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11460497 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11460983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11461081 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11462732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11464483 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11464487 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 11465265 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 11465696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11471519 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11471900 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11473124 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11473908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11476763 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11478889 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11482255 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11482944 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11482968 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11483655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11485619 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11486213 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11486672 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11487214 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11487321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11487431 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11487563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11487631 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11488902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11492854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11495267 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11495309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11498237 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11498375 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11498427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11499942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11501065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11505273 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11506340 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11508426 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11508794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11509280 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11513101 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11514508 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11515807 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11517508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11519035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11519176 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11519440 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 11520483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11520793 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11524554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11525685 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 11526009 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 11526519 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11526572 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 11528291 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11531611 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11531816 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11532785 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 11533948 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11534366 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 11534462 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11534464 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11534584 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11534834 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11535106 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11535318 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 11536066 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11537179 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 11538167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11540403 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11541220 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 X 11541221 C G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 X 11544127 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 11544314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11545602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11550264 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11550776 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11553078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11554425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11556205 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11557068 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11557322 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11559211 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 11559369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11560767 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 11561332 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11562954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11563132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11563620 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11565164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11566957 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 11567210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11567239 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 11567272 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11567289 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 11567290 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 11567360 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 X 11569647 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 11570086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11570602 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11572253 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11573894 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 11575653 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11579168 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11581622 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11584543 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 11586656 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11592773 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11593830 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11595357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11598878 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11601943 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11603085 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11606333 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11606701 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11608181 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11609561 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11611843 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11611932 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 X 11612339 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11612678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11615295 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11616881 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11620539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11620949 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 X 11621586 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11622703 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11622949 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11623244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11623505 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11623540 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11624506 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11628742 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11629837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11630506 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 11641437 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11642370 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11643305 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11643349 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11646195 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11647163 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11649272 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11649414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11652222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11652592 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11659003 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11661091 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 11661119 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11665761 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 11671560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11671616 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11671972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11672195 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11672351 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11673361 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11675398 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 11675488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11676492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11680306 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11680328 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11681473 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11684450 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11686000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11686538 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11687809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11687984 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11688182 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11688197 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11688216 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11689272 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11689375 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11689453 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 11692370 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11692727 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11692728 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11692811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11694307 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 X 11696364 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11696574 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11696712 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11698333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11698653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11701422 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11703106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11704682 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11704839 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11708194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11709079 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11716410 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 11717076 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11717223 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11720420 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11721800 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 11723495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11724201 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11724202 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11724487 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 X 11724949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11727373 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 11728577 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11731211 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11731338 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11731511 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11738034 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11742099 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11744725 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11746884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11749071 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11749984 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 11750401 C G N N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 X 11750404 C G N N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 X 11753848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11754101 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11756685 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11759154 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11759156 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 11763475 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11767498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11769867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11770139 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11770179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11771983 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11772742 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11773996 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 11774619 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11775559 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 X 11776933 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11778356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11779032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11779819 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11780977 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11783238 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 X 11783438 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11783463 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11783555 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11783560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11784735 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11785747 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11787216 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 X 11789193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11789817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11791277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11792272 C T Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 X 11792362 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11792491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11793460 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 11793755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11794485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11794847 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11795181 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11795454 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11795840 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11796072 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11796893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11796913 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11799428 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11799758 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11801572 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11801853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11801971 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11802761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11802957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11803964 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11804640 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 11804856 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 11804905 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 11804909 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 11805934 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 11805935 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 X 11805995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11806103 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 X 11806183 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 X 11806207 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11808207 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11815877 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 11818506 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11821374 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11824143 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 11826089 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11827593 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11829025 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11829615 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11829650 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11829818 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11829828 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11829871 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11829882 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 11829930 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11830241 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 11830551 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11832550 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11833071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11835409 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11835434 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11836530 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 11836717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11836734 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11837807 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11839291 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 X 11839488 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 X 11839843 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 11839854 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11839931 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11840170 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11841132 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11841353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11842379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11842677 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 X 11842680 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 X 11842874 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11843053 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 X 11844140 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 X 11844151 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 X 11844362 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 X 11844467 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11844812 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 11844859 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11845173 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 X 11845507 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11845511 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11845999 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 11847656 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 11847670 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 11848290 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11848455 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 11849201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11849489 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11849937 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 11852354 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 X 11853546 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11855660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11855970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11857328 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11857451 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11857650 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 X 11858476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11862448 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 11863797 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11866705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11867942 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11868487 G T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 X 11868718 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 X 11868733 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11869207 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11869895 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11873217 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 11873829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11874198 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11875891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11875900 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11879660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11879726 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.333333333333333 0.0555555555555556 0.611111111111111 13 23 6 1 11 X 11880140 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 11880926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11884157 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11884826 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11885327 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 X 11890123 T G N N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.538461538461538 0.153846153846154 0.307692307692308 16 10 7 2 4 X 11890131 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 11890674 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11891703 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11894190 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11895344 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11903515 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11904883 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11907585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11910240 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 X 11911117 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 X 11912670 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 11913187 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11914683 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 11914685 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 11916751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11917378 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11919779 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11919852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11920589 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11921037 C T N Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.75 0 0.25 6 2 3 0 1 X 11921102 T C N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 X 11921107 C T N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 X 11921168 T G N N 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 6 14 1 4 5 X 11921501 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 11921532 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11921543 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 X 11921739 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 11922969 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11924637 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11925119 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11925901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11927804 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 X 11928253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11928423 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11929410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11930658 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11930688 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11930844 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11932113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11934630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11936786 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11940887 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11941548 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 11945443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11946015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11951971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11953684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11954639 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11961244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11964895 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11964984 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11966409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11970166 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11971148 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11971336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11975146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11976720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11977477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11977479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11978300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11979571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11979685 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11981545 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11983176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11983347 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11983838 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11984012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11984446 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11985037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11986960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11987032 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11987689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11988247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11988790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11989163 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11990962 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 11991535 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11993774 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11993994 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11994573 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11994926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 11996846 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 11999443 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12000539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12002427 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12002604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12002821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12005478 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12010986 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12011348 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12012021 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12012386 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 12014476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12014928 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12015528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12016349 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 12017830 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12017990 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 12018024 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 12018129 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12019174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12019274 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 X 12019281 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 12019890 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 X 12023548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12023814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12025249 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12027697 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12030653 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12031767 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12033100 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 X 12034376 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12034527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12035256 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12035284 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12035352 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 X 12036040 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 12036141 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 12036232 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 12036343 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 12036416 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12036555 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 12036566 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 12036967 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12037555 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 X 12037839 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 X 12037963 A G Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 X 12038012 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 X 12038021 A C Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 X 12038365 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12038428 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 X 12038671 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 X 12038712 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 X 12039152 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 12039404 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12039427 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 X 12039528 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 12039529 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 12039568 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12040416 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12040417 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12041576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12043922 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12046487 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 X 12049301 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 12052022 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12053246 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12053899 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12055440 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 12055555 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 12058178 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 12058878 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 12060110 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 12061214 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12063886 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 X 12064631 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12066835 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12067342 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12067544 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12067937 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12068071 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 X 12068903 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12069760 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 X 12072440 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12073974 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12076528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12076640 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12076651 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12076712 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 X 12077057 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12077062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12077112 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12078204 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12080110 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 12081151 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12081719 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12081838 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.210526315789474 29 9 14 1 4 X 12082235 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12082476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12083268 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12083546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12084643 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12084865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12085220 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12086070 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 12086268 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12086756 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 X 12086907 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12088528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12090223 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 12093294 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12096840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12097948 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12097969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12100331 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12100974 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 X 12107045 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12108406 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12108668 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12108815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12111900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12111933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12112365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12112636 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 X 12114895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12114986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12118371 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12118461 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12119397 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12119694 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12120156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12120455 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12121283 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12125513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12129948 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12130801 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12130991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12132731 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 12132787 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 12135415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12137041 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12139490 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12140629 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12142046 G T N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 X 12142541 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 12142968 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 X 12145657 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12145784 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12147465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12148655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12149389 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12150280 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 X 12151086 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 12151255 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12152315 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12153768 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12153790 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 X 12154587 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12154817 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12156196 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 X 12156644 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 X 12156932 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.222222222222222 0.0555555555555556 0.722222222222222 9 27 4 1 13 X 12156983 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 X 12157019 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.210526315789474 0.0526315789473684 0.736842105263158 9 29 4 1 14 X 12157039 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.222222222222222 0.0555555555555556 0.722222222222222 9 27 4 1 13 X 12157176 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.210526315789474 0.0526315789473684 0.736842105263158 9 29 4 1 14 X 12157177 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.210526315789474 0.0526315789473684 0.736842105263158 9 29 4 1 14 X 12157268 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12157353 G C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.176470588235294 0.0588235294117647 0.764705882352941 7 27 3 1 13 X 12157503 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.222222222222222 0 0.777777777777778 8 28 4 0 14 X 12157550 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.266666666666667 0 0.733333333333333 8 22 4 0 11 X 12157577 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 X 12157618 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12157620 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 X 12157692 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 X 12157814 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 X 12158421 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 X 12158428 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 X 12158478 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12158586 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.176470588235294 0.0588235294117647 0.764705882352941 7 27 3 1 13 X 12158595 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12158621 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 X 12158829 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 X 12159267 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.263157894736842 0 0.736842105263158 10 28 5 0 14 X 12159630 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 X 12159658 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 X 12159810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12160273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12160391 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12160447 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 X 12163725 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12163934 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12164807 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12166413 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12166907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12168640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12169112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12170182 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12170774 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12170938 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12172164 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12175436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12176232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12177338 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12177798 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12184092 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 X 12185831 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 X 12187064 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12187086 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12187094 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12187199 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12187215 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12189054 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12189081 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12189242 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12189810 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12195839 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 X 12196760 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 12199458 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12200665 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12201050 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12201442 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 X 12202552 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12202887 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12203883 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.210526315789474 0.0526315789473684 0.736842105263158 9 29 4 1 14 X 12204624 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12207308 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 X 12207826 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12209075 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12211264 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12213530 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 12214762 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12220179 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12222050 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12222162 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12223072 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.294117647058824 0.0588235294117647 0.647058823529412 11 23 5 1 11 X 12228335 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 12229334 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12230700 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 12239234 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12240763 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12243896 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12245769 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 12246369 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12248681 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12249340 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12249514 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12250883 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12251977 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12252105 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12253331 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12260823 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 12266999 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12282373 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12282493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12282705 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.388888888888889 0.166666666666667 0.444444444444444 17 19 7 3 8 X 12283056 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12284397 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 12286017 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 X 12286063 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 12287228 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 X 12287607 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 12287630 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 12287732 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 12287944 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12288014 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12288475 A C N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.5 0.214285714285714 0.285714285714286 17 11 7 3 4 X 12288873 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12289320 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12289336 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12289382 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12291034 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 12291150 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 12291465 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 X 12296287 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 12296648 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12297997 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 12299021 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12300851 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12302689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12302758 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12303807 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 12307124 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12308197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12311650 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12318783 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12319340 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12320517 A T Y N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.466666666666667 0.2 0.333333333333333 17 13 7 3 5 X 12320518 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 12320985 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12321817 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 12321833 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12321893 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 12321992 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 12322009 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 12330099 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12332767 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12333292 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12334485 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12334899 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12339423 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12341813 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 12348003 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12350054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12352128 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12352452 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 X 12354848 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12374450 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 X 12374983 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 12375896 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12376073 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12378854 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12381174 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12383206 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12384603 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12384691 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 12389103 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12389277 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 X 12389776 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 12389992 A G Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 12391635 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 12391715 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 12392393 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12395124 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 12396249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12396298 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12396470 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12396519 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 X 12396523 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 X 12396532 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 X 12398578 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 12400755 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 X 12408842 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12409384 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12409387 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12409443 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12409452 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12409453 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12412828 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12413671 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12414144 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12418985 C A N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 X 12419402 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 12423053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12424418 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12424479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12424509 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12424564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12424789 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12426916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12426938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12426990 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12428433 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 X 12428621 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 X 12428717 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 12428738 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 12428746 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 12428960 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12429682 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12430051 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12430566 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 12430697 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12430970 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12431514 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12431747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12432563 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12433706 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12434301 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12435358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12435763 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 12437096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12437490 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12438811 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 X 12439015 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12439355 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12439820 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 X 12439976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12441051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12442536 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 12442878 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12444499 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12446582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12446763 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12447017 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12447047 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 X 12447972 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 X 12450551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12452608 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12453802 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12453915 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12455518 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 X 12457280 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12459378 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12463472 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12464241 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12464926 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12465140 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12465180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12466856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12467326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12470243 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12471880 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 12472741 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 12474028 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12474200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12474677 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12475027 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12475065 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12475568 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 12475586 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 12475611 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 12475620 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 12475648 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12475705 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12476102 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12476318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12476347 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12476386 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12476414 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12476468 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12476475 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12476625 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12477021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12477240 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12477276 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12477837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12477870 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12479176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12479816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12480426 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12487084 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12488994 G A Y Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.25 0 0.75 4 12 2 0 6 X 12490103 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12491206 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12493089 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12493141 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12493846 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12497633 C T Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 12497803 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 12500292 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12501454 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12502737 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12503022 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12503917 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12509126 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12509192 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12509261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12509297 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12509406 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12509413 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12509435 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12509506 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 X 12509813 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12510119 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12510569 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12510704 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12510713 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12510769 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12511049 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12511100 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12511162 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12511335 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12511365 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12511777 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12512009 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 12512357 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12512389 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12512465 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12512484 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12513233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12513370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12516178 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 12517154 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 12518784 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12519257 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12519327 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12519401 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12519416 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 12522479 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12524488 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12524491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12524499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12524602 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12524729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12526225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12526870 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12527011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12529196 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12530173 T G Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 X 12549355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12553273 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12553599 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 12555046 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12557137 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12559770 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12559771 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12560633 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12560688 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12560965 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 12560980 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 12561059 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 12564815 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 X 12571784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12573411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12575199 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12579010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12579502 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12586413 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12591869 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12593187 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12594271 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12598254 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 12599998 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 12604907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12607282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12609492 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12610214 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 12610322 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12612563 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 12612658 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12613729 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12614860 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12616958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12617417 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 12617839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12619442 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12619885 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 12620056 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 12620318 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12620450 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12620844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12621759 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12622129 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12622423 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 12622778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12622832 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 12623831 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12624910 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12626392 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12627711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12627969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12628991 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12629366 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 X 12630291 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12630637 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12631373 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12631458 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12631653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12632064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12632687 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12634083 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12634329 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12634746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12635476 T A N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 X 12635803 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12635844 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12635891 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12636056 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12636077 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12636250 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12637033 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 12637105 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12637409 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12638230 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 12638241 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 12638276 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12638404 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12638649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12638657 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 X 12638712 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 X 12639688 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12640925 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 12647116 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12652551 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 12653710 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 12655074 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 X 12655272 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12655434 G T N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 8 20 0 8 6 X 12655848 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12657607 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12657957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12658655 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12659579 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 12660339 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12660858 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 X 12661218 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12661369 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12661373 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12661393 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12662750 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 12663896 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12665756 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 12666211 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 12666511 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 12666691 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12670774 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12671358 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12672199 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 12672497 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 12673309 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12674886 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12676059 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12676307 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 12676313 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 12676452 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 12676526 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 12677081 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12677648 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 12677797 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 12678881 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12679127 G C N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.3125 0.1875 0.5 13 19 5 3 8 X 12679763 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 12679923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12680387 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12680704 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 12681680 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12681786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12681980 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12682841 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12683269 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12684626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12685554 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12686337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12686595 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12687054 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 12687665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12687807 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12688424 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12689717 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12690400 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12690443 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12690585 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 X 12692404 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 12693346 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12694077 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12694860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12699474 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 12707206 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12709235 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12710006 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 12710359 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 12711059 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 12711185 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 12711235 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 12711722 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 12712003 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 X 12712159 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12726926 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12728063 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12728456 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12728973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12729112 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12729531 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12729968 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12731918 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12732495 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12735259 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12736365 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 12737042 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 12737138 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 12738110 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12739770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12740112 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 12740463 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 12742208 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12775912 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12775913 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 12776156 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 12776349 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 12777211 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12777219 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12779257 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 12779364 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 X 12779373 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 X 12779387 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 X 12779409 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 X 12779410 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 X 12779578 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 X 12781116 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12781277 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 X 12781397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12781443 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 X 12781836 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12781938 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12782515 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 12784313 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 X 12784579 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12785896 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12787335 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12790050 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 12792427 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12792834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12792935 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12794659 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 12798410 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 12798431 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12801769 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 12802247 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 12802382 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 12804281 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12804640 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12807827 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12808052 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12808185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12814447 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 12816391 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12816479 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12819787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12821505 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12821998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12823435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12823860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12824379 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 12825174 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12825177 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12825824 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 12827416 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12828460 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 12828461 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 12828472 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 12829034 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12829565 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12830015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12831869 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 X 12832254 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 X 12832345 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12832422 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12832454 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 12832851 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12832861 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12832877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12832958 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12833085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12845543 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 X 12849518 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 X 12850435 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12855063 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 12855519 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 12857098 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 12857843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12861162 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12862498 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12863623 A T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.294117647058824 0.117647058823529 0.588235294117647 12 22 5 2 10 X 12863881 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 12867176 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 12867258 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12868412 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12873594 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12873819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12875302 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 X 12876146 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 12877994 C T Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 12880329 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12880401 C T Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 12881039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12881716 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 12883028 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12883106 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12887534 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12889265 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 12889523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12901333 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12902153 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12905102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12907025 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12907241 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 X 12909484 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 X 12909715 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 X 12909940 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 12910152 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 12910154 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 12910277 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 X 12910289 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 X 12910479 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 X 12911280 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 X 12911624 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 12911740 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 X 12911846 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 X 12911853 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 X 12912401 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 X 12912602 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 12912879 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 12913526 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12913641 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 X 12913760 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12915819 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 12916023 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 X 12916072 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 X 12916150 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 X 12916222 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 X 12916807 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12918320 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 X 12918403 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 X 12918424 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 X 12918429 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 X 12918919 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 12919000 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 X 12919026 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 X 12919050 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 X 12919068 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 X 12919152 A T N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 X 12919202 C A N N 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 12 12 4 4 4 X 12920750 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 X 12922522 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12922591 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12924121 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12924191 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 12925239 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12925857 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12927335 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12927666 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12927820 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12928811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12928828 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 X 12928852 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 X 12929460 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 X 12930179 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 X 12930758 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 12931288 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 X 12931428 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12932770 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 12933128 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 X 12933271 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 X 12933361 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 X 12933503 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 X 12933611 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 X 12933640 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 X 12933800 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 X 12933814 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 X 12933846 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 X 12933903 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 X 12933944 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 X 12934132 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 X 12934213 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 X 12934234 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 X 12935259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12935390 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 X 12935420 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 X 12935426 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 X 12935436 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 X 12935516 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 12935573 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12935591 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 X 12935875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12935992 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 X 12936064 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 X 12936442 A C N N 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 5 15 2 1 7 X 12936606 G A N Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 5 11 2 1 5 X 12936694 G C N N 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.363636363636364 0.0909090909090909 0.545454545454545 9 13 4 1 6 X 12936757 T C N Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.363636363636364 0.0909090909090909 0.545454545454545 9 13 4 1 6 X 12937262 C T N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 X 12937281 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 X 12937289 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 X 12937295 G A N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 X 12937324 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 X 12937328 A G N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 X 12937348 T C N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 5 15 2 1 7 X 12937376 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 12937412 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 X 12937628 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 12938075 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 12938311 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 12938315 C G N N 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.636363636363636 0.0909090909090909 0.272727272727273 15 7 7 1 3 X 12938317 A C Y N 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.636363636363636 0.0909090909090909 0.272727272727273 15 7 7 1 3 X 12938324 G A N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.181818181818182 17 5 8 1 2 X 12938755 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12938832 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12939435 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 12939789 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 12939884 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 X 12940229 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 X 12940658 G C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 X 12940695 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 X 12941001 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 12942189 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12942833 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 12942985 C G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 X 12943058 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12943124 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 X 12943162 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 X 12943229 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 12943232 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 12943259 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 12943420 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 12943423 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 12943564 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 X 12943590 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 X 12943686 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 12943717 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 12943861 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 12944016 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 12944178 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 12944286 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12945573 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 12945816 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 12948558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12948701 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 12948976 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 12949775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12950828 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12952787 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12954269 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 12954911 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 X 12955353 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 X 12957300 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12957959 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12959702 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12960360 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 12961522 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12961554 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 X 12961977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12962068 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12964198 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12964221 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 X 12966370 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 12967251 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 X 12971210 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12971657 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 12972116 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 12973400 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12973954 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12974404 G A N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 X 12975688 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 12975745 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 12979180 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 X 12979275 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 X 12979280 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 X 12979377 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 X 12979401 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 X 12980264 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12984362 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12984923 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 X 12986141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12986536 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12987026 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 X 12988085 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12988129 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12990355 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12990515 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12990696 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 X 12990885 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12991254 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 12991635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12992634 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 12992656 T G N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 X 12993437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12993598 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 12994412 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 12994508 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 12995228 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12995704 G C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 X 12996018 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 X 12996610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12999375 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12999387 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12999556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 12999774 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 X 13001307 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13001548 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13003857 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13005368 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13006904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13007132 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13007934 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 13008911 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 X 13010147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13010205 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13012097 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13012747 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13012831 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13013897 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13013898 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13015096 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13016512 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13020407 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13023132 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 X 13025943 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13029802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13030404 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 X 13031475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13031476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13032724 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13033802 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13037067 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 13037138 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 13040568 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13042845 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13043716 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13048726 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 13048987 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13049011 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13049497 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13049862 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13050580 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 13050627 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 X 13050891 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 X 13051454 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 X 13051458 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 X 13051463 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 X 13051702 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13051727 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13052641 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13053697 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13054450 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 X 13054535 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 X 13054551 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 X 13054877 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13055479 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13055550 A C Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 X 13055729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13055791 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 X 13056030 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 X 13056053 G C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 X 13056079 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13056201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13056267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13056473 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 X 13056843 G T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 X 13057647 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13057856 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 13057921 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 X 13058300 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 X 13059104 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13059461 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13065817 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13066543 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13066629 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13067100 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13070447 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13070868 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13071413 T A Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 X 13077457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13077799 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13081296 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13081495 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13081496 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13082736 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 13084448 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 13086905 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13088563 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13092196 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13092875 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 X 13093856 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13094402 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13094451 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 X 13095009 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 X 13095189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13096244 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13096968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13098745 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13101633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13105567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13105688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13105703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13105983 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 13105995 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13106525 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 13109538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13109591 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13109776 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 X 13110367 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13112919 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13114317 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 X 13119728 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 X 13125736 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13127294 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 13133456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13134526 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13137983 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13139485 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13139567 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 X 13139936 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 X 13140170 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 13140176 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 13140397 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13140692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13143335 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13144985 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 13145431 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13147978 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13148132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13152075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13154446 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13154941 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 13155473 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 13156094 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13156761 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13157155 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 13159478 A C N N 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.142857142857143 0.714285714285714 0.142857142857143 7 7 1 5 1 X 13159992 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13161094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13164133 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13164429 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13164800 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 13164902 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13167033 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13169693 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13169799 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13170132 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 13180645 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 13181406 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 13189033 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 13189084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13189086 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13189348 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13198422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13203644 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13207114 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 13207146 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 13208845 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13209884 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13212170 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13212346 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 13213806 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13213987 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13214174 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13224213 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13225519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13228519 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 13229180 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 13232051 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13234483 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13235452 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 13236299 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13238429 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13238497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13239860 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13240663 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13240778 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 13242072 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 13242994 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13244083 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 13244208 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 13245079 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13245247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13245955 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 13247086 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 X 13247272 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13247282 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13249880 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13250407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13251176 T A N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 13252259 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13253068 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13253629 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13255301 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 13256604 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 13256818 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13258642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13259225 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13259943 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 13261923 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13265343 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13271236 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 13274792 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13275450 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 13277809 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 13278179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13284224 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 13285409 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 13288772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13289020 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13289076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13289604 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13299488 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13303191 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13303910 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 13304400 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13306269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13306637 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13306892 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13307044 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 13308721 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13313325 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13315880 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13317753 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 X 13317982 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13318113 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13318815 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 13321347 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 13321695 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13322986 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13323159 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 13324165 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13324810 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13324814 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 X 13328315 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13329537 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13329615 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13331912 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13341134 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13345618 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13350165 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13351803 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13360864 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 13361010 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 13361015 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 13361545 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13361603 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 13365275 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13365459 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13367417 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13368814 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 13370196 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13370231 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 13370409 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 13371677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13377698 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 13378914 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13379166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13379459 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13381937 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13382786 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13391187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13392679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13393414 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13397012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13398662 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13398737 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13400049 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13402080 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 13402479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13402751 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13402851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13404853 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 13408414 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13408651 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13408696 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13414955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13417486 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13423628 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 13424658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13426427 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13427833 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13428480 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 13428538 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13428564 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13429303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13432285 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 13432297 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 13432394 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 13436503 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13437315 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13439979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13441668 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13441850 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13441865 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13443998 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 13444005 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13445263 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13445976 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13445990 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13447776 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13453188 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13453314 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13454008 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13455174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13457707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13457828 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13459537 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13460363 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13460528 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13461744 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13462343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13462780 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13463123 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13463126 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13463145 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13463327 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 X 13463648 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 13463958 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 13465454 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13467379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13468240 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13468833 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13468940 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13469182 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13469557 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13470709 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13470814 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13470826 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13471510 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 13472409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13475130 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13475701 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 X 13476107 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13476796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13477580 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13478515 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 13478581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13478974 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13479017 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13479268 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13479626 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13480671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13481625 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13481779 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 13487042 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 13490120 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13490560 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 13491445 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13492631 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 13492787 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13494355 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13494665 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13495241 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13496837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13499997 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13500918 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 13501229 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13501475 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 13502592 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 13503065 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 13504057 A C N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 X 13504851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13505842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13506050 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13506387 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13506708 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13506988 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13507653 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13509130 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13509536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13509575 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 13512320 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13512452 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 X 13516269 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13517722 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13518293 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 13519774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13521625 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13526609 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 13526850 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13526889 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13534540 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13534794 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13535138 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13535596 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13535949 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13536049 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 13536728 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 X 13537074 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13538225 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13538245 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13538643 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 13539982 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 13540387 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13540815 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13540939 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13541082 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13551880 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 X 13551961 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13554914 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 13555049 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 13561729 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13562613 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13563514 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 13565760 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13567130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13568705 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13568874 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 X 13568904 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 X 13568934 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 X 13568940 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 13569018 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 X 13569405 G T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 X 13569487 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13569670 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 13571420 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13573475 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13573563 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13573951 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13575321 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13576052 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13576192 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13576823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13579689 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 13580652 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13586875 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 13587385 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 13587832 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 13588168 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 13589975 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13590374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13591950 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13593799 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 13594448 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 13594788 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 X 13594911 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13600449 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 13601909 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13602903 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 13603845 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13606233 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13606405 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13608380 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13609342 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13609640 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13611367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13613284 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13614987 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13615326 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13615759 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13616668 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 13621016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13625068 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13628381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13631510 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 X 13637581 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13639402 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13640461 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13641643 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13646096 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 13647011 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 13647332 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 13647871 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 13648549 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 13648609 C T Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 13650008 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 13650369 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 13651298 C G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 13651578 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 13652019 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 13653166 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 13653878 C G Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 13654759 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 13654958 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 13655306 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 13659542 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13660481 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 13663077 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13669350 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13670498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13676797 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13677173 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13678196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13679294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13683245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13683866 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13685417 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13685443 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13685628 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 13686233 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13687405 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 13687527 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13688324 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13689399 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13692285 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13692881 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13693186 A C Y N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 X 13693268 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13694104 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 13694985 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13695358 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13697974 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13702196 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13702913 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13707462 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13707593 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13707604 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13707605 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13713949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13714464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13715123 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13717611 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13720544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13727750 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13735785 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 13736037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13736389 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13737578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13738435 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 13739503 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 13746302 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 13747191 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 13747633 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13749200 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13749240 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 13749241 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 13749638 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13750080 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 13750154 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13752178 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13754094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13755140 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 13756769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13766846 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13767761 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 13777953 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13778194 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 13779390 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13779522 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13779673 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 13784086 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13788753 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13799653 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13805884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13809220 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 13813747 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13815712 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13817351 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 13818127 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 13821763 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 13824004 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 13832736 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13834820 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13834961 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13835109 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13838916 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13841892 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13849575 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13850356 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13860426 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13861407 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 13863968 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13867538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13867539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13867734 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13870737 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13872239 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13875301 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13877047 A C N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 X 13877823 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13879338 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13883828 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13884464 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13891377 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 13894710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13899871 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13900107 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13904578 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13906249 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13908676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13910544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13910659 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13910788 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13913194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13917971 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13919659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13920616 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13920744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13920932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13924361 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13926666 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13927492 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 13929088 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13929742 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13930216 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13932943 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 13938453 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 13938720 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13939360 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 X 13941248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13941904 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13942498 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 13944189 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13945383 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13949770 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13949919 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13950063 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13950220 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13950332 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13950343 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13950909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13952066 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13954295 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13954926 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13958393 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13959101 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13960728 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13961034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13961368 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13962789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13962801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13963015 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13963984 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13966553 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13966862 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 13969718 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 13969861 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13971086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13972592 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 13972623 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 13973259 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13975452 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13975904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13976425 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 13977493 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13978260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13978606 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 13978933 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 13983845 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 13983921 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13984172 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13984411 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13985910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13986051 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13986061 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13986255 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13986694 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13986911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13986942 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13987248 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13987304 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13987399 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 13994791 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13995191 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 13995662 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13996941 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13998218 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 13998321 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 13999039 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 13999402 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14001263 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14002572 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 14004605 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14005738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14005866 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14009177 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14009954 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14010049 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14012837 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14013804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14014548 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14019921 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14021150 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14023631 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 14024419 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 14024980 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14025764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14026162 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14026915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14029692 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14030098 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14035538 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14035799 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14036615 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14036683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14038760 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14042864 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 14043548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14044083 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14045358 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14045559 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14046414 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14047843 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14049911 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14050627 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14053187 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14054364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14056028 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14057839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14069121 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 14073548 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14077446 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 14080196 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14083755 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14085805 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14086056 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14089930 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14090881 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14091206 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14091229 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14091426 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14091427 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14108171 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14108295 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14109960 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14112327 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14113292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14115396 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14116771 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 14116935 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 X 14116972 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14123734 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14124969 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14130704 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 14131269 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14135752 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14143683 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 14144453 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14144682 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14144907 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14146197 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14157109 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14169088 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14170604 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14170749 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14171061 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14171288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14172913 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14173018 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14173037 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14174813 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14177029 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 14178827 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 14179274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14183427 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 14183580 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14187296 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14192875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14200855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14203340 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14203420 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14208661 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14208836 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14209979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14210192 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14218106 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14218770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14218938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14219277 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14220985 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 14221169 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14222917 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14226071 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 14226394 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14226791 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14227650 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14230230 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14230677 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14231676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14234315 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14237361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14246854 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14248054 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14251285 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14254033 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 14257227 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14259886 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14259903 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14262538 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14262540 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14262710 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14262821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14262862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14262867 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14262871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14262895 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14262968 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14263058 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14263069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14263077 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14263093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14263146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14263232 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14263276 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14263326 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14263428 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 14263433 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14263436 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14263527 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14263541 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14263543 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14263661 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14263712 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14263729 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14263746 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14263785 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14263802 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14263807 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14263967 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14263975 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14263976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14264056 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 14264125 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 14264449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14267536 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14268642 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14268672 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14269721 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14278347 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14278858 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14278962 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 X 14279180 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14281994 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14282038 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14282139 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14285005 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14285685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14286607 A C Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 14286685 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14286748 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14287550 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14287740 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14288692 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14288893 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14289068 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 14289848 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14290986 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14291417 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14292697 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14294574 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14294907 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 14295587 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 14296564 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14298024 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14299617 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14299639 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14300039 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14300378 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14304164 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 X 14306427 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14311863 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14314430 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 14314438 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 14314466 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14315736 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14316012 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14318349 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14319219 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14319698 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14320328 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 14322441 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14323238 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14324530 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14325982 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14326254 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14338010 C G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 14339218 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 14339436 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 14341692 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14341923 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14342172 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14343305 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 14343881 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14344845 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14344930 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14345095 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14346650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14347014 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14347761 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14353527 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14353578 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14354326 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14355061 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14355995 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 14358970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14359177 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14365276 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14366293 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14367966 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14368270 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14371230 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 14371523 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 14372113 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14372114 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14373904 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14373926 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 14374224 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14376030 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14376079 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 14376259 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14380033 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14380562 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14381003 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14382804 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14383547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14384028 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14385277 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 14385611 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14385615 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 X 14385628 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14385698 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14386355 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14387019 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14387487 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14395676 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14396551 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 14400163 A C Y N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 14404189 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 14406357 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14406971 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14408893 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14409325 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14409941 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14410572 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 14410660 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14413141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14413247 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14414354 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14415287 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14416196 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14416833 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14416834 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14420701 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14420749 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14420904 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 14424171 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14424401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14427240 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14427286 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14427559 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14427591 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14428152 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14428236 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14428434 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14428531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14428672 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14429265 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14429511 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14429799 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14430093 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14431083 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14432322 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14433441 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 14433671 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 X 14433672 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 X 14433894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14434319 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 X 14434879 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14435601 G A Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 14436672 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 X 14438460 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 14440663 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14442493 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14442751 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14442864 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14443482 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14445810 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14445882 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 14446038 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 14446332 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14446505 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 X 14447784 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14448493 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 14448494 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14452014 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14452190 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14453084 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14453653 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14460622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14461399 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 X 14461429 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 14462053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14463335 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14464135 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 14464136 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 14464343 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14465377 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14465622 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14466940 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14467880 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14467891 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14467893 G C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14469801 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14470255 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 14470473 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14471107 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14472912 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14473921 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14474073 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14474494 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14475148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14475814 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14476270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14478038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14478449 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 14479500 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 14480273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14481608 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14483050 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14483194 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14483541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14484390 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 14485488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14489519 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14489818 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14490046 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 14490559 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14491307 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 14491622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14492204 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14493798 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14493980 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14496419 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14496512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14497183 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14498230 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14498672 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14499162 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14500449 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14500503 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14501064 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14505961 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 X 14506506 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14507131 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14507700 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14507983 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14508256 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14509113 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 14511053 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14511249 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14511597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14512440 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14516034 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14516977 G A Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 14517444 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 14517510 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 14518610 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14518670 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14519478 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14519939 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14520221 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14523426 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14524396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14526387 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14527522 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14528040 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14529303 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14529642 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 14529869 C T Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 X 14530358 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14530424 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14530802 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14531403 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14531805 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14532153 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 14532253 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14532380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14532619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14534208 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14534361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14534580 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14535370 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14535660 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14535846 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 14536843 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14538488 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14538629 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 14538750 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14546879 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14547328 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14547937 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 14548102 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14551464 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 14552049 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 14554518 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 14555389 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 X 14555737 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14555738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14556128 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14556197 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 X 14556772 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14558001 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 14558545 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14560373 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14560793 A G N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 14561121 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14561772 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 X 14561822 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 X 14561903 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 X 14562236 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14562314 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14562932 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 14562949 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 14564026 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14565056 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 14565099 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14565774 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 14565911 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14566317 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14566468 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 X 14566757 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 14567644 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14568877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14569182 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14570686 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 14571488 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14572115 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14573271 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 14573761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14575706 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 X 14575781 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14575814 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 X 14576808 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14577636 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14578617 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 X 14578712 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14579185 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 14579361 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14580833 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14580965 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14582302 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 14582578 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14582594 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 X 14582893 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14583208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14583460 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14583605 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14583671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14583964 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14584112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14587941 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14588914 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14588946 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14590345 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14590643 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 14591015 C T Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 14591092 G C N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 14593110 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14593126 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14594011 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14595066 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 14595889 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14596596 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 14596738 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 14596775 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 X 14596894 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 14599038 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14603308 C G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 14603931 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 14604589 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 14606321 T G Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 X 14607169 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14607232 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14607532 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14608243 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14608373 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14608469 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14609751 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14609991 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14610063 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14611928 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14612654 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14616625 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14618031 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14618104 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14618279 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14619348 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14619414 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14619706 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14620708 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14620719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14620748 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14621520 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 14621663 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14621693 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14621694 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14622133 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14622848 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14623530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14624130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14625213 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14626407 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 14626408 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 14627118 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 14627998 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14628106 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14628254 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14628294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14628409 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14628453 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14628648 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14628819 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 14628929 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14631005 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14631541 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14632848 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 14634641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14636274 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14636457 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 14637275 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14637461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14641480 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14641963 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14642173 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14642803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14643055 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14647716 T G Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 14650945 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14656295 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14659496 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14661051 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14661424 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14661446 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14662099 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14662282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14662498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14662514 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14662542 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 14662568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14662898 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14663650 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 X 14663696 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14663701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14664033 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14664103 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14665636 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 14665848 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14666464 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14666562 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14667610 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14667656 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14668151 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 14668323 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14669147 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14669202 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14669529 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14670143 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14670433 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14670451 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14670984 G A Y Y 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 X 14671264 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 14671361 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 14671605 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 14671801 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 14673989 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 X 14674060 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14674079 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14674490 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14674888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14675143 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14675297 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14675449 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14676558 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14676573 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14676708 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14676898 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 14676934 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 14677530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14678431 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14678516 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14678541 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14682240 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 14682457 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 14682565 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 14682868 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 14683283 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 14683302 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 X 14683680 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 14683701 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14683736 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 14683766 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 X 14683768 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 X 14683912 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 X 14683992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14684215 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 X 14684273 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14684311 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 X 14684625 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 X 14684754 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 14684817 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14684870 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 X 14685006 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 14685032 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 14685038 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14685297 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14685515 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 14685533 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 14685619 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 14685727 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 X 14685772 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 X 14685836 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 X 14685893 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 14685980 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 X 14686238 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 14686291 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 14686309 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 14686561 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 X 14686698 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 X 14686717 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 X 14686859 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14686889 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 X 14687087 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 X 14687147 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 X 14687814 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 14688264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14688275 C T Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 14688310 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14688314 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 14688315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14688595 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 X 14688758 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14689217 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 X 14689356 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 14689365 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 X 14689408 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 X 14689487 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14689695 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 X 14689852 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 X 14689875 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 X 14690013 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14690202 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14690272 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 X 14690297 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 X 14690337 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14690687 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 X 14690746 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 14690785 G A N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 X 14690844 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14690878 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14691099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14691120 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14691140 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14691176 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14691177 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14691185 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14691201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14691326 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14691661 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14691680 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14691687 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14691866 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14691920 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14691997 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 14692152 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 14692196 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 14692203 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14692321 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14692325 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14692441 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14692467 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14692801 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14692861 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14692932 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14692938 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14692977 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14693105 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14693141 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14693163 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14693320 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14693412 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14693414 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14693472 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 14693474 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 14693516 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 14693618 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 X 14693783 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 14693823 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 14694895 A G Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 14695217 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14695423 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 14695495 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14696871 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14696874 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14696910 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 14697004 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14697081 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14697184 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14697280 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14697282 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14697292 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 14697313 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14697324 C A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 14697329 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 14697941 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14697945 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14697959 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14698078 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14698112 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14698187 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 X 14698188 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14698262 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14698338 C A Y N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 X 14698377 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14698392 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14698397 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14698418 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14698451 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14698479 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14698481 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14698485 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14698494 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14698604 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14698634 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 14698796 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14698859 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14698914 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 14698921 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 14698945 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 14699044 C T Y Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 X 14699204 A T N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 14699575 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 14700271 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14700605 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14700625 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14700645 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14700748 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14700798 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 14700814 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 14700930 G A Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 14700941 G C Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 14703744 G A Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 X 14704164 T G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 14704200 T G Y N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 X 14704452 G A Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 14704454 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 14704473 T C Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 X 14704975 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 14705128 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14705173 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14705199 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14705211 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14705264 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14705292 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14705306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14705707 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14705837 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14705899 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14705918 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14705945 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14705995 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14706000 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14706046 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14706314 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 14706623 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 14706665 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14706758 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14706776 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14706860 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14706927 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14706935 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14706981 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14707126 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14707152 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14707183 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 14707651 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14707838 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14707875 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14707971 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14708153 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14708154 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14708185 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14708332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14708402 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14708546 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14708710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14708720 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14708740 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14708744 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14709060 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14709104 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14709106 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14709107 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 14709149 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14709450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14709487 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14709543 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 14709586 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14709920 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14709988 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14710027 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14710053 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14710093 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14710222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14710226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14710277 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14710620 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 14710729 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14710740 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14710923 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14711152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14711204 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14711348 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14711546 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 14711951 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 14712023 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14712036 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14712142 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14712173 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14712250 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14712315 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14712351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14712369 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14712401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14712421 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14712632 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14712934 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 14712978 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 14713003 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14713296 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14713333 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14713355 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14713369 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14713399 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14713433 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14713576 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14713685 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14713784 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14714085 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14714328 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14714398 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 14714687 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14714692 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14714736 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 14714772 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14714855 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14714982 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14715253 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14715374 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14715523 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14715713 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14715715 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 X 14715900 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14716281 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14716295 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14717387 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14718723 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 X 14719603 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14719890 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14719891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14719893 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14720109 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 14722082 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 14722802 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14724141 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 X 14724313 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14724678 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14725409 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14725455 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14725782 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14728769 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14731798 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14734819 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14735375 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14735465 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14735496 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14736615 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 14736666 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14736965 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14738447 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14738493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14739270 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14739753 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14740564 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14742058 T G N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 14743458 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 14743933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14744030 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14746374 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14748150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14748320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14749138 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14751606 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14752424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14753059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14755009 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 14755131 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14755973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14762352 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14762518 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14762718 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14764043 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14764563 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14764576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14764942 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14765223 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 14765261 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14765373 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14765594 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 14765656 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 14769243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14770746 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14771354 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14771790 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 14772423 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14772445 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14772661 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14773156 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14774333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14774706 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14774879 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 14775529 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14775706 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14776266 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14779660 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14779786 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14779828 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14779866 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14780976 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14781544 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 14782332 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14782347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14784151 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14784401 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14784431 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14784501 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14785417 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14786026 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14786129 A C Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 14787036 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14787098 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14787799 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14787841 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14787938 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14788635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14788991 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14791992 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14792063 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14795594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14796652 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14797082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14797457 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14800007 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14801153 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 14803227 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14804291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14807760 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14808709 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14809328 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 14809517 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14810582 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 14810725 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14810787 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14811158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14811886 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 14811939 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 14813803 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14815349 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14816807 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14816900 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14816902 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 14817256 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14817990 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14818877 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14820620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14821393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14822179 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14823847 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14824355 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14824420 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14828163 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 X 14828519 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14828838 T A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 14831307 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14831831 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14834622 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14846555 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14859976 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14862495 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 14863354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14871861 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 14876395 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 14877476 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14878354 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14891652 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 14897294 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14903265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14903516 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14905059 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14912082 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14918058 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14921032 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14925044 T A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 X 14930034 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14938236 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14940630 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14941648 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14942356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14946944 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14952739 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14955301 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14960040 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 X 14960265 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14963645 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14964054 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14965220 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14967336 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 X 14967377 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14967495 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14967848 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 14967849 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 14980599 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14980721 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14981125 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 14983514 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 14984015 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14984430 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14986453 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 14986647 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14987822 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14988503 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14990079 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14990132 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14990522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14990565 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14993970 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 14994168 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 14995486 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14998010 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 14999896 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 14999936 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 X 15001900 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15005577 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15005708 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 15005749 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 15006266 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15008019 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15009369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15011319 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15012677 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15012702 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15013391 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15013553 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15014088 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15014832 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15016192 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15016977 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15017131 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15017803 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15018355 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15018719 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15019238 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15020767 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15020784 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15020791 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15020866 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 15021257 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15021281 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15022290 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15023255 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15023338 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15027622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15027701 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15028167 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 X 15028340 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15029193 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15031125 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15031301 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15031881 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 15032154 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 15032655 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15033000 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15034519 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15034893 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15037585 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15038128 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15039167 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 15043358 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15044388 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15045085 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 15045816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15045873 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15046643 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15047745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15047825 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15049047 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15060437 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15061424 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15061498 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15062005 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 15062337 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 15063062 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15063624 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 15070769 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15071208 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15072191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15072422 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15073488 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15073850 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15074450 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15075201 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15075414 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15077079 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15077175 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15077197 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15077562 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15078135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15078393 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15081451 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15083545 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15085477 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15086633 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15087073 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15087764 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15087943 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 15088231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15089768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15091043 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15091258 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15091777 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15091907 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 15091942 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 15092149 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 15092160 C A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 15092325 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 15093331 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15095208 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15095437 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15096688 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 15096695 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 15096988 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 15097426 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15099137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15100079 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15101462 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 15101654 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15102191 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15102222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15103629 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15104351 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 15104836 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15104849 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15106294 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15106312 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15107648 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15107883 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15108689 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 15108734 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 15109766 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15110966 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15111065 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15111346 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15112104 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15113790 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15114594 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15114689 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15116111 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 15116320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15116759 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15116781 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15117304 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15117379 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15118728 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15119974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15120572 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15120959 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 15121648 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15121976 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 15123188 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15124258 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 15124298 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 15124678 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15124733 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15124920 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15125322 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15126141 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15127542 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15127846 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15129764 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15130101 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15130223 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15130224 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15130412 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15130522 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 15130877 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15132348 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 15132657 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15133461 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 15135484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15136219 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15137731 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15137881 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15137907 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15139145 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15139158 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15139981 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15140252 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15141171 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15144161 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 15144391 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15146066 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 15147275 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15147983 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15148335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15148969 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15149335 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15149464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15150662 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15151020 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15151205 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15151639 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15151979 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15153621 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15154748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15155025 A C N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 X 15155284 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 15155588 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 15157645 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15158064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15160165 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15160455 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 15162150 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15163553 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 15171739 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15171804 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15171830 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15174783 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 15175056 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15175268 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15176229 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15177252 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 15178701 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15179946 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15180607 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15180975 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15181416 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15182588 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15183505 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15183677 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15184312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15184903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15187926 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15188016 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15192206 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15193300 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15193347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15194346 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15196056 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15196777 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 15200465 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15200505 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15200787 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15201635 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15202142 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15202342 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15203187 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15203936 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 15207110 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15207265 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15207391 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15208674 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15212677 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15213059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15213936 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15214163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15214552 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15214778 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15216720 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15218303 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15219184 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15222611 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 15225453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15225521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15225560 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15225805 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15228098 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 15229378 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15230241 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15231159 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15231334 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 15231487 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15232039 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15232222 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15233035 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15237058 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 15237764 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15238004 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15238346 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15238400 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15238449 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15238676 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15239177 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 15239262 C T Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 15239512 A T Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 15240123 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 X 15240715 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15241188 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 15242020 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 15252640 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15252699 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15253138 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15257118 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15277308 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15277742 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15281106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15281594 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 15283241 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15283557 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15284503 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15286187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15288203 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15288697 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15289755 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15291784 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15293822 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15294884 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15296424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15299988 T A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 X 15300791 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15306852 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15313435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15314175 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 15316626 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15317001 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15324507 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15340172 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15341411 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15343941 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15344023 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15344308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15344337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15345666 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 15346291 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15346402 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15347447 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 15348499 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15349570 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15352396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15352864 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15352898 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 15353912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15354116 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15354117 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15355365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15356209 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15356236 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15356752 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15356908 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15357115 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15357154 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15358312 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15359809 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15360573 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15363197 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15363261 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 15363946 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 15364950 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15374677 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15374936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15375629 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15381980 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15381993 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15385063 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15388908 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15389229 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15389446 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15391585 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15395267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15395811 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15395831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15397403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15397863 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15401608 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15402319 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15402438 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15402908 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15407173 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15407600 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15407791 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 15409571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15411855 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15413718 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15414491 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15414658 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15415628 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 15417998 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15421390 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15421945 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15423449 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15423529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15423997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15425722 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15427825 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 15428762 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 15429107 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15429563 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15429572 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15430089 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 15431114 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15431255 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 15432842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15434406 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15435757 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15436135 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15436801 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15438611 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15440329 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15440348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15441996 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 15447431 G T Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 15447658 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15448043 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15450625 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15450752 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15451245 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15452435 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15453469 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 15453476 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 15456299 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15458880 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15459646 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15459882 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15459921 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15459930 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15460928 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15462535 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15462715 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15462825 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 15466499 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15466516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15467036 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15469978 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15470233 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 15472288 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15472641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15473103 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15473755 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15473852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15474988 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 15475983 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15476258 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15479397 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15479574 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15489931 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15492148 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15497985 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15509478 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15509567 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15534233 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15558205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15558531 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15562824 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15570250 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 15572142 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15577409 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15580450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15585586 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15587320 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 15604753 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 15610973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15612163 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15622411 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15623611 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15624340 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15625209 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15625993 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15626415 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15632091 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15632515 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 15633346 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15635181 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15635287 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15635473 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 15635862 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 15637452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15639298 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 15640077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15640960 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15643929 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15646406 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15648439 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15649096 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15649640 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 15651448 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15651736 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15652645 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15664895 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15666472 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15669114 A C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 15672404 T G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 15674848 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15677965 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15679822 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15679937 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15680902 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 15681799 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15683284 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 15683671 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15697776 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15697855 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15704893 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 15709221 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15709650 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15710991 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15720141 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15720990 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 15722138 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 15723264 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15726122 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 15728046 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15728540 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15728755 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15730502 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 15731314 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 15734558 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15734588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15735144 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15739851 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15744462 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15744883 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15745087 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15745823 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15746073 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15746158 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15746481 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15747608 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15747864 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15748736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15750708 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15751607 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15752048 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15752726 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15752805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15756110 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15757928 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15758614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15760585 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15761893 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15770403 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15772163 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15773193 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 15773309 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 15776049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15776100 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15777239 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15779226 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15781109 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15782553 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15783890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15785727 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15797719 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15798319 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15806193 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15807709 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15809428 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15809430 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15810596 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15815039 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15822807 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15826440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15826549 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15826887 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 15827470 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15827510 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15828200 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15828252 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15828831 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15830876 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15831764 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15831767 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15835262 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15835481 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15835632 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15836163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15836167 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15837824 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15838001 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15838769 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 15838840 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15838922 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15839202 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 15839555 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15839858 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15841451 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15842322 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15842679 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15842711 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15842855 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15844822 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15845486 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15845683 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15847309 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15848077 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15849408 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15850839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15850926 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15851259 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15851336 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15851503 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15851863 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15852019 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15852154 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15852225 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15852614 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15852875 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15853620 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15854113 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15854846 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15855002 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15856057 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 15856216 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15856760 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15857765 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 15858478 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15860128 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 15862530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15863815 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15863918 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15864010 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15864571 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 15865459 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15867001 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15867884 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15868463 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15868714 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15868852 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15870296 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 15876590 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15877663 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15878124 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15878909 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15879005 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15879133 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15879220 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15879543 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 15881991 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 15882013 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 15882949 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15889669 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15890057 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15890208 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15890762 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15892094 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 15892192 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 15892198 A C N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 X 15892951 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15893251 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15893739 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 15895000 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 15897707 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15898025 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15900255 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15901407 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15901458 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15902666 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15902990 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15904361 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15904505 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15905455 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15907530 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 15908230 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15909178 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15909947 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15910342 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15911336 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 15911661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15912820 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15925046 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 15926288 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15926687 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15927053 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15928234 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15930338 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15932993 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15933224 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15934235 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15936945 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15937137 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15941488 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15944497 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15944995 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 15945531 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15947606 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15949263 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15952275 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15954590 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 15954696 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15954893 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15960148 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15963047 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15965414 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15969583 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15970273 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15970867 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15970933 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15971865 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 15972303 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15972498 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15980822 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15981330 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15982116 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15982227 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15983805 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15984604 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15984695 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15985101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15986302 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 15986688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15987109 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15987757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15990928 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15991268 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 15992589 C G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 15992769 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15993022 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15993311 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15993482 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15993564 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15993879 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15994096 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15994161 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15994556 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 15994736 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15994978 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 15995158 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15995511 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15995519 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15996257 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15996288 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15996486 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15996562 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15996726 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15996948 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15997499 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 15997506 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15997592 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 15997763 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 15998965 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 15999058 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15999074 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15999352 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15999734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15999786 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 15999953 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16000611 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 16000771 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 16001189 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16001258 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16001569 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16001594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16001675 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16001930 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16001966 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16002175 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 16002265 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 16002742 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16004689 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 16004726 T A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 16004812 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16004842 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16004994 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16005163 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16005338 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 16005378 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16005559 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16005931 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16005946 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16006304 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16006380 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 16006554 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 16006974 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16007381 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16007382 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16007472 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16007547 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16007629 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16007817 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16008133 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16008152 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16008270 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16008630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16008672 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16008680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16009041 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16009824 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16010207 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16010243 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16010383 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16010603 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16010679 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16010702 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16010707 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16010805 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16010920 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16011457 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16011485 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16011490 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16011782 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16012398 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16012776 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16012858 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16013025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16013031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16013119 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16013146 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16013297 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16013320 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16013385 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16014094 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16014220 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16014264 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16014281 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16014589 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16014679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16014712 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16016039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16016090 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16016411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16016451 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 16016468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16016522 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 16016536 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 16016680 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16016818 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16016864 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16017016 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16024466 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16024479 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16024493 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16024742 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16024815 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16024929 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 16025314 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16025407 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16025679 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 16025710 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 16025728 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 16025795 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 16026354 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16027282 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16028114 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16028533 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16028585 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16028703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16028725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16029047 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16029049 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16029245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16029417 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16029451 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16030043 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16030044 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16030490 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16031189 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16031425 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16031749 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 16031922 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 16032167 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16032989 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 16033009 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16033011 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16033119 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16033121 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16033339 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16033722 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16034070 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16034156 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16034191 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16034224 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16034325 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16034599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16034605 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16035045 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16035128 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16035198 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16035277 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 16036101 T A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 16037027 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16037126 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16037247 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16037338 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16037350 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16037465 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16037501 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16037617 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16038212 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16038370 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16038425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16038660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16038712 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16038774 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16038936 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16038953 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16039095 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16039112 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16039707 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16039720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16039802 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16040470 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16041194 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 16041225 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 16041947 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16042150 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16042167 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16042291 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16042377 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16042422 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16042516 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16042858 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16042863 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 16042886 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 16043091 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16043385 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16043566 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 16044129 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16044419 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16044716 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16044717 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16044722 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16044833 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 16045191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16045194 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16045351 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16045373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16045489 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16045689 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16045717 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16046022 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16047305 A C N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 16047335 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 16047416 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16047568 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16047612 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16047727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16047850 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16048128 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 16048273 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 16048284 T G N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 X 16054628 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16054689 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16054737 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16054811 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16054904 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16054917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16054983 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16055167 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16055172 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 16055547 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 16055708 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16055768 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16055911 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16055970 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16056120 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16056620 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16056648 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16057102 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16057107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16057832 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16058217 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16060216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16061500 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16062857 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16064570 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16066016 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 X 16066140 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16074002 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16074773 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16077806 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 X 16078262 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16080302 A C N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 X 16081091 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16081301 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16081561 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16081679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16082272 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16082891 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 16082985 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 16083153 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 16088199 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 16091000 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16091802 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16092459 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16093344 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16094412 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 16096405 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16097170 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16097278 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16099086 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16101912 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16102649 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16105266 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16109665 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16110111 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16110597 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16112314 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16113184 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16113353 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16113581 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16113646 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16114724 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16116667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16121437 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 16123997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16124132 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16124922 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16126549 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 16127073 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16127673 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 X 16128425 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 16131549 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16131807 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16131937 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16133848 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16134371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16134779 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16136765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16140774 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16142380 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16142514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16143366 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16144074 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16145683 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 16145997 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16146607 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16146813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16149374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16149788 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16150152 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16151830 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16152288 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16152890 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16152901 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16153002 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16153117 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16153459 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16154042 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16158549 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16159133 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16161269 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16163330 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16163561 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16164028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16165259 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16165628 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16165772 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16166736 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16175149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16175555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16177901 G T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 X 16178449 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16179309 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16179353 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16179448 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16179859 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 16182126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16183549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16189481 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16189575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16189689 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16190444 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 16191027 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16193634 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 16197249 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16197807 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16199110 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16201149 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16201462 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 16204040 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16204387 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16210654 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16212713 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16218436 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16223073 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16227356 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 16234165 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16235180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16241389 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16250245 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16254351 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16257222 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 16259645 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16261072 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16261662 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16265864 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16271958 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16277129 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16278528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16279582 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16279763 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16280168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16280311 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16280399 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16280952 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 16281435 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16282903 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16282964 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16283178 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16283938 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16284270 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16284346 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16285103 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16287434 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 X 16287567 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16287848 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16288259 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16288520 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 16290122 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16291164 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16293152 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16293187 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16293803 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 X 16294795 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16294988 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 X 16295049 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16295074 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16295186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16295276 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16295501 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16296556 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16298175 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16299303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16300305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16306927 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 X 16306985 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 X 16307257 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 X 16307371 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 X 16307898 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16308221 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16310724 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 16310956 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16311381 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 X 16311634 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16312207 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16314061 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 X 16314853 A G N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 X 16315961 T G Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 X 16315987 T G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 X 16315992 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 X 16317851 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16318025 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16318968 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 16324963 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16328103 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16328155 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16331977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16334496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16334777 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16341350 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16346320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16346855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16347467 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 16348654 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16352037 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16353793 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16353968 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16354526 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16357082 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16361375 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16361548 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16361638 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16361653 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16361822 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16361863 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16362622 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 16366706 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16367051 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16370991 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16371830 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 16381803 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16383522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16388532 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16388905 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16395288 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16408410 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16410210 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 16412289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16413222 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16413334 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16414779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16414780 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16416879 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16417145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16417607 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16422712 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16426832 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16432625 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16435698 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16436781 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16437794 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16439022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16440584 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16440897 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16441070 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16442203 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16442593 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16453582 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16454596 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16454873 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16456778 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16457275 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 16458162 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 16460887 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16461223 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16461773 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16462545 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16462760 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16462927 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16466705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16466864 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16468301 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16470252 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 16470638 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16471295 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16471950 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16473974 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16474722 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 16476767 G T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 X 16477449 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16477840 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16478793 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16481760 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16482036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16491717 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16492423 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 X 16495599 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16496043 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16496125 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 X 16496371 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16497219 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 16498965 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16499138 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 X 16499308 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16499339 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 X 16499526 C T N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 X 16499666 A T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 X 16499709 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 X 16499895 T A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 X 16499993 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 X 16500021 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 X 16500062 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 X 16500080 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.8 0.0666666666666667 0.133333333333333 25 5 12 1 2 X 16500151 T A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 X 16500198 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16500465 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16500497 G C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 X 16500592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16500659 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16501680 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 X 16503168 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16503564 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16507337 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16509061 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16512225 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16512488 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 16513244 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16519755 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16522856 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16523145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16524432 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16524677 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16525826 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16526636 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16529500 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16529942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16530498 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 X 16532073 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16533107 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16533961 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16534135 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16535187 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 16535658 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16536712 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16537456 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16540580 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16541271 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 X 16542362 T G N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 X 16544952 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16545645 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 X 16545781 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 X 16546053 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 X 16546094 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16546132 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 X 16546153 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 X 16546332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16547047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16547272 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 X 16547315 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 X 16548299 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16548622 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16549053 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 X 16549671 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16550289 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16550529 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 16550612 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16550841 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16551048 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16551987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16552025 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16552109 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16552166 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16552179 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16552390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16552649 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16554100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16554147 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16554239 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16554527 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16554851 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16554884 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16555057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16555904 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16556090 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16557741 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16557868 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 X 16558179 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16558491 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 16559238 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16559725 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16559918 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16560379 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16560412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16561229 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16561436 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16561536 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16561562 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16562683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16562711 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 16563038 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 X 16563292 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16563931 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 16563934 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 X 16564198 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16564315 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 16564410 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16564462 T A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 X 16564498 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16564506 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 X 16564567 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 16564740 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16566389 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16568107 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16570820 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 16571059 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 16571687 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16573545 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16575073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16575115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16575136 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16576715 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16576821 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16578954 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16579703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16582289 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16584343 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 X 16586941 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16587899 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16589532 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16590095 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16594071 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16594340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16595091 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 X 16595596 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16599124 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16599188 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16599212 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16600630 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 16602566 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 16604045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16604748 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16605518 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 X 16605945 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16608388 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16608509 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16612363 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16616096 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16616948 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16616997 C G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16616999 T G Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 16618956 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16620246 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16620315 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16623763 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16624556 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 X 16625754 T A Y N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 X 16633875 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16634826 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16634954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16635367 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16637392 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16637814 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 16638870 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16639890 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16640059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16642333 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16642876 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.647058823529412 0.117647058823529 0.235294117647059 24 10 11 2 4 X 16643720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16644574 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16645696 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16646355 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16646372 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16647315 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 X 16647458 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16648170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16648673 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 16648787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16654059 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 16654499 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 16658737 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 X 16658898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16658926 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 X 16659006 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 X 16659029 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 X 16659826 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 X 16659949 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 X 16660227 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 16660352 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 X 16660524 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 X 16664187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16664527 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16667224 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16669247 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16672593 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16676415 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16676580 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16676631 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16687666 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 16691900 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 16693089 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16699250 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 X 16710220 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16711775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16713035 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16713192 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16717253 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16721544 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16722931 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 16723276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16723550 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16726507 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 16727359 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16729141 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16729867 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 16731220 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16731989 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 16733940 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 16736806 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16737617 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16742597 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16745933 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16746206 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16750014 G C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 X 16750119 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 16750369 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16752256 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16754636 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16762348 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16762832 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 X 16763115 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16763489 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16765197 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 16765467 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16765691 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 X 16765822 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 X 16766301 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16766377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16766453 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 16767109 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16767384 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16767533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16767648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16767797 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16767851 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16767953 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16768332 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16768414 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16770114 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16770547 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 16770986 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16771412 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16771571 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16771685 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16771703 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 16771828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16771838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16771851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16772148 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16772589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16772661 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16772876 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16774688 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 X 16776346 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16778562 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 X 16780755 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16782422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16783672 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16785311 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 X 16786335 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16787168 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16788235 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16788643 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16788655 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 X 16791867 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16794967 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16799982 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 16804283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16805318 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16806935 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16810106 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16811902 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16812288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16821472 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16821717 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16827971 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16829010 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16829774 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16829780 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16830941 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16831183 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16833272 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16834137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16834287 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16836004 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16844293 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 16844399 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 16844422 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 16844540 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 16845729 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16846096 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16851462 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16853547 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 X 16856292 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16856293 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16856911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16858078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16861020 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16861060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16861805 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16867141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16867272 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16871338 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 16871696 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16872525 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16875211 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16875865 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 16877967 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16878402 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16878708 T C Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 X 16878963 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16879778 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16880497 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16880728 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 16880768 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16881777 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16882173 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16882742 T C Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 X 16883588 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16884909 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16885549 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16898192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16898411 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 X 16898420 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 X 16898487 G T Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 X 16898782 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 X 16899239 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 X 16899284 G C N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 X 16899358 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 X 16899414 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 X 16899453 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 X 16899791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16900134 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16900666 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16900906 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 X 16900960 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 X 16901450 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 X 16901935 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 X 16902008 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 X 16902142 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 X 16902274 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 16902596 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 16902841 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 16903232 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 X 16903359 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 X 16903454 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 X 16903617 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 X 16903803 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 X 16904221 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16908690 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16909075 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 X 16909411 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16910694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16910947 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 X 16911576 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16912504 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 16914130 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16916414 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16917806 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16917808 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16917814 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16918782 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16919666 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16920731 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16923555 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16926573 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16927213 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16927973 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16928079 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16928543 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 X 16930211 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16930967 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 X 16933089 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16933146 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16933334 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 16933642 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16937493 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16939225 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16941139 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16942159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16943299 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 X 16943318 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 X 16943362 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 X 16943428 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 X 16943475 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16943553 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16943559 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 X 16943971 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 X 16945532 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16946225 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16948251 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16948940 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16949216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16949632 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16950297 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16950982 A G Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 X 16951207 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 X 16951485 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16951652 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16951750 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16952120 C A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 16952549 G A Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 X 16956017 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16959235 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 X 16965224 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 16966502 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16966684 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16967709 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16970549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16970959 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16974374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16977322 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16977678 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16978322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 16985117 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 16985799 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 16990332 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16990959 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16991272 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16991500 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 16995253 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 16995396 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 16995760 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 16996343 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 16996436 C G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 17004670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17005031 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 X 17007352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17008106 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17009125 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17010484 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17010874 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17010948 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17011043 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17011101 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 X 17011153 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17011156 C G N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 X 17011196 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 X 17011258 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 17011344 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17011526 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17011632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17011653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17011654 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17011722 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17011749 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17011868 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17012281 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17012743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17012868 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 X 17013152 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17013228 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 X 17013767 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 X 17013830 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17013880 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 X 17013947 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 X 17014558 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 X 17014861 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17014935 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 X 17018994 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17019536 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17021615 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17028567 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17029722 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17031801 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17034319 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17034826 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17036282 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17036315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17036423 C A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 X 17037018 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 X 17037973 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17039314 C A Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 X 17039986 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17040411 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 17041088 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 X 17041149 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 X 17041721 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 X 17042663 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17046891 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17047005 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17048196 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17048781 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17050706 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17051500 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17052258 G C N N 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 12 12 4 4 4 X 17054701 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 X 17056404 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 X 17057217 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17057402 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 X 17057479 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17058511 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17058573 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17060766 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17060849 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 17061187 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 17061557 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 17065286 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17066186 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17066788 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17070623 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17070983 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 17089581 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17094303 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17101648 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17102262 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17102527 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 17102741 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 17103391 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17108315 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17108914 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 X 17112162 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17114044 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 17114419 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17115670 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17116025 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17116332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17116811 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17117009 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17117959 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 X 17121945 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17123794 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 17124543 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17125556 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17125827 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17125941 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17126344 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17126576 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 17126952 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17131039 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17132059 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17133596 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17134071 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17135691 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17135972 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17136031 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17137001 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17137126 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 17139183 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17139235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17140602 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17141539 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 17143627 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17146421 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17146440 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17146540 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17153003 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17155610 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17156624 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17158944 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17170630 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17172031 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17172587 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17177441 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17179734 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 17185328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17187684 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17188381 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17188551 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17188870 T G N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 X 17190871 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17191158 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 X 17191195 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17193580 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17197992 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17207337 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17207521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17208293 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17209506 T G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 X 17209670 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 X 17209798 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 X 17209799 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17209834 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17209889 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 X 17210207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17210511 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17210558 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17210887 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 17211283 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17211809 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17212343 C T Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 X 17213058 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17213063 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 X 17213180 T A Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 X 17213194 T A Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 X 17213579 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17213984 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 X 17214388 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17214743 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17214835 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17215142 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17216739 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17217054 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17217367 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17217668 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17232627 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17232810 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17235161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17236879 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17239066 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17239316 A G Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 X 17240721 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 17242387 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17243790 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 17245345 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17247733 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 17248914 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 17250588 A G Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 17250590 C A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 17250591 A T Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 17250598 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17250602 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17252559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17253600 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 17254165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17254283 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17255508 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17256240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17258790 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17262434 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17263087 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17263172 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17263290 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 17266434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17267661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17272409 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17275534 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17276020 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17276171 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17279419 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17279451 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17281095 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17282928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17283088 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17283306 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17286106 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17286878 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 17289887 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17290607 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17290900 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 17290921 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17292588 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 17300466 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 X 17303375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17303894 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17304679 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17306569 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17306573 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17306574 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17307095 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17307693 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 17310645 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17311669 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17311678 T A N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.533333333333333 0.2 0.266666666666667 19 11 8 3 4 X 17314201 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17315249 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 17315426 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 17317373 G C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 X 17317804 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 X 17317842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17317964 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 X 17318179 T G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 X 17318235 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 X 17318754 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 X 17319229 A C N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 X 17319539 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 X 17319655 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 X 17319795 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 17320154 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17320491 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17321261 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 17321435 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 17321957 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 17324445 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 17325274 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17325678 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17329177 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17332002 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17333303 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17335680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17336821 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 17338513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17340561 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17341560 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17342317 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17343878 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17344279 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 17345204 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17346565 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17348935 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 X 17349422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17349869 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 X 17349954 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 X 17350000 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 X 17350001 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 X 17350879 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 X 17350904 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 X 17350909 G T N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 X 17351111 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 X 17351902 G C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 X 17352127 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 X 17353142 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 X 17353256 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 X 17353301 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 X 17353972 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 X 17354293 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17354402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17354666 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 X 17354698 C A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.176470588235294 27 7 13 1 3 X 17354707 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 X 17354750 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 X 17355466 G C Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 X 17355752 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 X 17355761 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 X 17355802 G T Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 X 17355832 G T Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 X 17355876 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 X 17355986 A T Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 X 17356212 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 17356230 T G Y N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 X 17356413 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 17357265 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17357537 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 X 17357540 T A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 X 17357746 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17357886 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 X 17357899 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 X 17357983 T C Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 X 17358265 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 X 17358275 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17358303 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 X 17365834 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.8 0.0666666666666667 0.133333333333333 25 5 12 1 2 X 17365868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17365942 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 X 17366095 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17366112 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 X 17366127 C T Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 X 17366322 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 X 17366349 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 X 17366400 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 X 17366713 G T Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 X 17366716 A G Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 X 17366932 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17366943 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 X 17366947 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 X 17367051 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17367055 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17367114 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 X 17367596 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 X 17367603 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17367656 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 X 17373859 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17373930 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17374545 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17374692 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17375316 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17375550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17378269 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17379538 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 X 17380077 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 17380091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17380655 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17381016 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 X 17381701 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17382413 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17382936 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17383271 A G Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 X 17383895 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 17386499 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 17386690 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17386985 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17387529 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17388707 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17390023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17393235 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17394027 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17394937 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17395022 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17395059 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17395504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17396143 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17396650 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17396945 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17399201 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17399432 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 17399466 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17399528 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17400638 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17400784 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17401401 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 17402337 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17402889 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17403523 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17403552 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17403816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17403845 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17404746 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17406491 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 X 17408205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17410753 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17412300 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17412563 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17413130 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17413311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17418494 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17419699 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17421669 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17425218 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17426863 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17427083 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 17434816 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17435450 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17439301 C A N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 X 17439448 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17439555 A G N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 X 17439732 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 17440408 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17440482 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17440530 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 X 17440996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17443666 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17444314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17444394 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17444530 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 X 17444632 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17444663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17445101 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 X 17445161 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17445745 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 X 17445807 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17447516 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 X 17449278 C T Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 X 17449300 T C Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 X 17449317 A G Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 X 17450812 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17468092 T G N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.333333333333333 0.0666666666666667 0.6 11 19 5 1 9 X 17468381 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 17468594 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 17468737 C T N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.285714285714286 0.0714285714285714 0.642857142857143 9 19 4 1 9 X 17469365 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 17469784 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 17469825 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 17470423 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 17470478 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 17470803 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 17471274 G A Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 17471353 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 17471835 G C N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.3125 0.0625 0.625 11 21 5 1 10 X 17472435 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 17472657 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 17472695 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 17472750 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 17473021 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 17473652 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 17473837 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 17474702 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 17474703 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 17475326 C G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 17475353 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 17475674 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 17475735 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 17475843 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 17475968 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 17476430 T A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 17477218 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 17477437 C T N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.4 0 0.6 12 18 6 0 9 X 17477537 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 17481534 G A Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 17482762 C A Y N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.230769230769231 0.0769230769230769 0.692307692307692 7 19 3 1 9 X 17483256 A T Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 17483384 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 17484488 G C Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 X 17484739 G A Y Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.307692307692308 0.0769230769230769 0.615384615384615 9 17 4 1 8 X 17484804 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 17484806 C T Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 17484995 A G Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 X 17495530 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 X 17495762 G A Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 X 17495883 A G Y Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 X 17496936 T C N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 X 17499127 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 17499559 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 17499673 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 X 17499989 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 X 17500029 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 X 17500128 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17500221 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17500243 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17500244 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 X 17500302 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17500654 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17500895 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17501068 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17501083 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17501106 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17501175 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17501338 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 X 17501686 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 17502168 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17502514 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 17502907 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17503049 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17503242 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 X 17503283 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17503460 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 X 17503677 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 17503748 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17504749 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 X 17504768 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 X 17504925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17505020 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 X 17505049 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17505598 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17505878 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 X 17505924 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17505925 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17506108 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 X 17506262 G T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 X 17506296 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17507968 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 X 17508424 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17508619 T C N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 X 17508669 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17508672 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17508688 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 X 17508926 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17509156 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17509179 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 X 17510242 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 17510322 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 17510348 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17510482 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17512614 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17512672 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17512704 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17512877 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17512991 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17513000 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17513566 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17513579 C A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 X 17513618 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.1875 0.125 0.6875 8 24 3 2 11 X 17513670 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 X 17513689 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 X 17513755 G A N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.461538461538462 0.153846153846154 0.384615384615385 14 12 6 2 5 X 17514208 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 X 17514214 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 X 17514815 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 X 17515200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17515617 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 X 17515652 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 X 17515718 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 X 17516408 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17516806 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17518110 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17518171 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17518924 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 X 17519661 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17519942 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 17520396 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17520728 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 17522528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17522688 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17523022 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 X 17523612 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17524433 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17524444 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17524531 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17524738 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17524811 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 X 17524868 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 X 17525187 T A Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 X 17525320 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 X 17525423 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 17525807 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17525887 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 X 17527911 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17528049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17529204 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 X 17530025 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17530151 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17530451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17532882 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17535541 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17537292 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 X 17537837 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 X 17537849 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 X 17537977 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17538656 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17538842 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 X 17539338 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17539489 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 X 17539562 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17539989 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 17540027 A G N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 X 17540086 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 X 17540348 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 17541275 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 17541477 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 17541666 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17542198 C A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 X 17542220 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17542617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17542831 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 X 17542886 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17542912 A T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 X 17543393 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17543476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17543606 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 X 17544638 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 X 17545742 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 X 17545855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17546375 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 X 17546469 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17546670 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 X 17546735 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 X 17547239 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17547463 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 X 17548530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17548587 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17548733 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17548804 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17549188 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 X 17549221 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17549755 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 X 17549931 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17550103 A G Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 X 17550187 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17550344 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 X 17550568 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17550581 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 X 17550610 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 X 17550687 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17550790 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 X 17550880 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17551057 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 X 17551370 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17551419 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17551759 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17552052 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 X 17552081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17552302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17558988 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17561375 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17564529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17565414 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17567498 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17567532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17567870 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17570680 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 17570740 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 17571077 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17571116 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17571198 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 X 17572325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17575711 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 X 17576812 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17576893 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17577549 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17579020 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17580738 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17581795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17581824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17586384 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17587120 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17591002 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17591536 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17591574 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17592497 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17592881 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17597024 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17597839 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17598959 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17599929 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 17600604 T A Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 17604141 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 17609353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17609707 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17610222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17611663 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 X 17612548 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 X 17612616 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17613897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17614609 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17614871 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17614922 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17616598 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17623030 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17623804 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17623810 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17625560 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17626371 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17626880 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17627041 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 17628303 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17629191 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17629534 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17629896 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 X 17633868 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17634304 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17634936 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17635310 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17635452 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17635462 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17636118 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17636601 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17637146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17638239 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17639354 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17639730 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17640307 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 17640977 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17641767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17642033 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 X 17642294 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17643943 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17645201 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 17646166 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 X 17646587 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 17647078 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 17648097 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 17648197 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 17650114 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 17651608 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17651721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17652897 G T Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 17653045 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17653976 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 17654613 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17656582 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 X 17656697 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17656783 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 17656898 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17657559 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17659602 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 17659746 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17660132 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 17660137 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 17660371 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 17660523 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17661236 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17663543 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17665321 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17667490 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17667631 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 X 17668626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17669586 A T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 17669675 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17669693 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17669808 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 X 17670644 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17671496 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17672012 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 X 17672233 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17672280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17672751 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17673648 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17673665 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17674242 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17674564 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 X 17674744 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17674800 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 X 17675118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17675373 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17675860 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17675915 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17676068 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17676266 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17676312 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17676351 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17676500 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17676569 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17676609 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17676658 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17676844 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17676855 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17676911 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17676923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17677097 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17677214 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 17677550 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17677689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17677707 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17677821 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17677868 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17678188 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17678580 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 X 17678637 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 X 17678805 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 X 17678841 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 X 17678862 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17678929 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 X 17678957 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 X 17679012 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 X 17679999 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 17680854 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 X 17680911 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17680968 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 X 17681036 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17681068 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17681695 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 X 17681702 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 X 17683955 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17686252 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 17687166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17688580 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17688749 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17692428 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17693043 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17694567 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17694568 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17694789 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17697313 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17697822 C T Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 X 17697863 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17698207 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17706123 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17706900 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 17707222 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 17707935 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 17708260 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17709775 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17711199 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17711717 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17711992 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 17713213 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17714313 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17717126 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17717911 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17718039 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17718718 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17720686 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17721424 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17721533 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17722065 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17722102 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17722111 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17727257 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17727384 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17729376 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17732556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17733003 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17733394 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17735403 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 17735740 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17736676 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 17738966 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17739421 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17741514 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17745201 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17746519 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17746837 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 17754217 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17758722 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17761639 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17764070 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17764446 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17766298 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17766380 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17766526 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17768285 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17771662 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17772739 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17774296 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 17775577 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 17777873 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17778255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17782846 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17783803 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17785902 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17786442 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17792605 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 17795129 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17797503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17801061 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17802253 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17804571 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17804842 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17805126 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17805321 G C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 X 17807514 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17808918 C G N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 17816858 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17817632 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17817906 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17818036 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17818996 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 17825248 C G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 17829211 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17831078 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 17832902 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 17832913 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 17835759 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17838086 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17840114 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 17841328 G A N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 X 17844646 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17850844 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17853958 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17855480 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 17859526 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 17863867 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 17878865 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 X 17879555 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17879625 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17888216 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17888374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17888575 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17888836 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17890801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17893589 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 17893602 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 17893929 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17894252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17896450 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17896894 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17897172 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17899059 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 17901571 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17901607 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17902197 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17903069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17903553 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 17905070 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17907313 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 17910834 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 17911803 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17912221 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 17912225 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 17920093 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 17920270 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 17920454 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 17924499 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 X 17926285 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17928015 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17930816 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 X 17935670 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17936966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17937621 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17937622 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17945234 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17949376 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17950325 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17950373 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17954225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17956025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17956155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17956172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17957640 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17959543 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 17960215 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 17961379 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17961837 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17961951 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17961958 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17962802 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17965419 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17965781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17966332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17966630 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17967253 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17967355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17969228 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17969645 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17971204 C A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 X 17973039 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17973055 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 17973056 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17973070 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17973095 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17973787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17974140 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17974834 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17975107 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17978111 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 17981022 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17981699 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17984192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17984721 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17987107 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 17988174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17989965 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17991770 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17992163 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17992223 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17992422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17992740 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17993409 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17995651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17998106 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17998377 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17998418 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17998671 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17998681 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17998826 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17998843 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17998956 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17998983 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17999021 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17999225 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17999338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17999390 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17999513 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17999614 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17999624 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 17999727 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17999813 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 17999876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 17999910 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18000024 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18000052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18000174 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18000247 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18000251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18000890 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18001414 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18002838 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18002842 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18003702 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 18005926 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18008285 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18010390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18012038 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 X 18012367 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 X 18013298 G A N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 X 18013356 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 18014786 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 X 18014797 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 X 18014846 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 X 18015132 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18015495 T C N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.230769230769231 0.153846153846154 0.615384615384615 8 18 3 2 8 X 18015917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18016002 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 X 18016119 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 X 18016243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18016299 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 X 18016326 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 X 18016339 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 X 18016390 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 X 18016441 T G N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 X 18016443 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 X 18016644 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 X 18016790 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 X 18016833 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 X 18016893 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 X 18017004 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 X 18017142 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 X 18017190 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18017227 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 X 18017359 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18017535 G A N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.416666666666667 0.25 0.333333333333333 13 11 5 3 4 X 18017575 T G N N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.384615384615385 0.307692307692308 0.307692307692308 14 12 5 4 4 X 18017976 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 X 18018081 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 X 18018625 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 18018636 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 18018683 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18018685 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18018891 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 X 18018919 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 X 18018945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18019299 A T N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 X 18019324 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 X 18019476 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 X 18020309 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18020623 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18021162 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18021872 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18021995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18023097 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 18023504 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18024352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18025044 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18025079 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 X 18025210 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 X 18025291 G C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 X 18025325 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 X 18026010 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 X 18026049 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 X 18026181 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 X 18026575 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18026727 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 X 18026846 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18026882 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 X 18027070 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18027727 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 X 18027742 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 X 18027803 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18028454 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 X 18028535 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18028626 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18028785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18028949 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 X 18029084 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18029085 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18029144 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18029283 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 X 18029364 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18029434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18029731 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 18029978 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18030051 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18030099 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18030255 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18030332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18030621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18030779 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18031376 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18031682 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18032489 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18032800 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 X 18032866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18033065 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18033217 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18034345 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 X 18034537 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18034834 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18034961 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18034963 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18035146 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18036277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18036934 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 18042445 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 18043705 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18044823 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18047046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18047717 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18047768 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18048144 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 18048661 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18049039 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18049506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18050612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18051214 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18051951 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18052384 T A Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 18052494 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 18053014 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18053320 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 X 18053543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18054066 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18055403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18057617 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18058340 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 18058787 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 18058857 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18058997 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18061812 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18062453 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 18065060 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18066399 T A N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 18068060 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18068986 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 18073013 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 18075578 A G Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 18077408 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18077730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18077909 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18078563 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18078591 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18080256 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18080565 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 X 18081948 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 18091395 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18094565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18094677 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18094870 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18094910 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18098355 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18100075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18100484 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18104207 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18106576 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18106745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18108591 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 18108979 C T Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 X 18109359 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 18110905 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 X 18111263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18111900 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 X 18111994 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 X 18112043 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18112111 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18112351 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18123216 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18124770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18125220 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 18125517 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 18126750 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 18130058 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 18130441 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18139634 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18140584 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18142161 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18142675 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18144364 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 18145217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18145807 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 18146249 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18147214 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18148818 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18150147 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18150403 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18150444 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18151584 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 18152006 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 18152222 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18154657 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18155559 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18155691 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 X 18156092 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18156491 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 X 18156958 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18157179 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18157309 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18157364 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 X 18157467 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 X 18157569 T G N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 X 18157572 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18157659 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.470588235294118 0.176470588235294 0.352941176470588 19 15 8 3 6 X 18158062 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18158231 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18158354 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18159012 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 X 18159279 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 X 18159421 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 X 18159446 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18159680 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18159835 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18160171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18160395 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18160788 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18160789 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 18160823 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18167836 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18169462 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18169486 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18170487 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 18170667 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 18172647 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 X 18173290 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 18173543 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18174598 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18175745 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18177251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18177271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18178239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18178702 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18179246 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18179356 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18180055 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18181719 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18183126 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18191902 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18198839 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18201275 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18209478 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 18209676 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 18213761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18214252 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 18214767 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18215019 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 18215381 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18215453 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18215824 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18216195 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18217629 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18218078 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18218469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18218729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18218978 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18220249 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18220756 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18220809 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18220841 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18221904 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18222227 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18223596 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18228613 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18228666 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18229838 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18229956 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18231208 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18232299 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18233850 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18235060 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18236880 C T N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.428571428571429 0.0714285714285714 0.5 13 15 6 1 7 X 18236886 G C N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.4375 0.125 0.4375 16 16 7 2 7 X 18238099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18238778 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18240444 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18241251 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18241548 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 18242179 G C N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 18246584 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18246685 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18246781 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18247870 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18251189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18252418 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18252431 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18252862 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 18252965 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18255504 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 18257202 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18259813 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18259838 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18265256 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 X 18268668 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18269004 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18269963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18272455 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 18272709 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 18272810 G C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 18276024 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18278326 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18278377 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 X 18279251 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18281383 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18281741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18282177 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18284830 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 18285889 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 18286474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18286875 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 X 18286948 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18287097 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18287713 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 X 18290311 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18292486 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18292546 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 X 18300725 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18300819 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.45 0.1 0.45 20 20 9 2 9 X 18302263 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18305606 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18305661 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 18305970 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 18309755 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18311179 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18311654 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18313947 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18314660 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18315664 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18315868 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18316685 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18318847 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18320353 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 18321218 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18321863 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 X 18322180 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18322553 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18322815 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18323031 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18329107 T G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 18331144 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18331261 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18331262 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18335161 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 18335201 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 18337075 A C N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.411764705882353 0.117647058823529 0.470588235294118 16 18 7 2 8 X 18337369 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18339947 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18340686 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18340729 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18342771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18344100 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18348441 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 18348488 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18350942 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 X 18355321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18358528 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18358534 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18359583 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18359682 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18360269 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18361774 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 18362806 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 18363133 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 18363855 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 18368070 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 18369727 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18371362 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18384067 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18384509 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18384787 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18384864 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18387861 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18388020 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18389101 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18389548 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18391096 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18391399 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18391932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18392316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18392363 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18393552 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18397167 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18397408 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18398775 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 18399297 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 X 18399909 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 X 18400679 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18401451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18403117 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18403185 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 X 18404736 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18405707 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18406337 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18406364 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18406440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18406698 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18407158 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18409039 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18409617 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18410088 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18411813 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 18412063 C G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 18412947 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 18414591 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 X 18416542 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 18417200 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18417316 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18418682 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18421734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18421922 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18427679 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18430347 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 X 18431534 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18434808 C T Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 18434814 A C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 18434816 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 18435344 A C Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 18435726 T C Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 18437022 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18440187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18441037 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18443485 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18444097 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 X 18447497 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18447778 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18449414 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 18449536 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18450358 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18450685 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18451114 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18451183 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18452387 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18453622 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 18456110 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18457744 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 18461436 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 18462743 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18464780 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18465282 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 18465567 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18465930 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18466827 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18466894 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 18467516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18471118 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18472509 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18472679 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18473533 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18474687 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18474824 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18482270 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 18484956 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18484994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18487120 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18492356 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18492799 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18493038 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 X 18498682 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18501849 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18502304 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 18502931 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 X 18503057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18503208 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18503455 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18504509 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18505627 C T N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 18 6 8 2 2 X 18505684 A G N Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 15 5 7 1 2 X 18505849 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 18505985 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18506662 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 X 18506871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18507506 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 X 18507616 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18507948 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 X 18508722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18508924 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18511409 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18511633 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 18516917 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18517850 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18521211 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 18522308 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18522773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18524843 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18525990 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18526625 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18527243 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18527417 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18529488 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18530451 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 X 18530621 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18530721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18530991 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18532408 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18532517 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18535056 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 18536033 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 18536256 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 18539772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18542584 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 18543596 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18544191 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 18544612 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18547918 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 X 18551684 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 18552501 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18552749 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18556321 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18557156 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18557383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18557790 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 18558034 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18561784 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18563182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18564355 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 18565170 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 18566139 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18566788 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 X 18567272 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 18567293 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 18567766 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18569602 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18569794 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18570367 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 18570483 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 18572038 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18572200 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 18572696 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18572951 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.8 0.0666666666666667 0.133333333333333 25 5 12 1 2 X 18574395 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18574558 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18575365 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18575822 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18577092 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18578313 G A N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 X 18578433 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18579792 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18581376 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18582086 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18582143 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18582897 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18584042 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18584431 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18584589 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18584727 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18584805 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18585092 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18585741 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18586189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18586864 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18587419 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 18587560 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 18588017 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 18588070 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 18589003 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18589226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18589989 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18591504 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 X 18591519 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 X 18592047 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18592076 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 18593023 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18593540 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18593554 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 X 18596151 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18596772 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18597480 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18598714 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18599061 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18599815 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 18599861 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 18600472 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 18601525 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18601853 T C Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 X 18603147 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18603955 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 18604694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18605399 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18605459 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18606046 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 18606244 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18606328 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18609516 C A Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 18610699 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 18611032 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 18611651 G A Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 18611822 G A Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 18613103 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 18613554 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18613985 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18614765 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 18615258 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 18617819 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18619152 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 18619722 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18620145 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 18621811 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18623640 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18623949 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18623966 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18624323 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18624427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18625943 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18627170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18628407 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18628470 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18629935 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18631079 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 X 18631119 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18631458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18633691 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18634402 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18634629 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18635367 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18635539 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18636537 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 18636759 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18637698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18637755 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18638112 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 18639109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18639425 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18644186 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18645938 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 18646657 G A N Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.6 0 0.4 6 4 3 0 2 X 18647222 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 18649464 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18649863 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18650063 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 18650416 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18652231 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18653431 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18654825 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18655349 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18657519 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 18658695 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 18658943 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18659551 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18659709 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 18660403 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18661388 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18661981 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18662497 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 X 18663685 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 18664823 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18666511 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18666535 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 18667057 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18667794 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18670304 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18671099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18671241 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 18671420 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18671450 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18671471 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 18672317 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18674242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18674244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18674818 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18675445 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18675875 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 18676611 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18677962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18679255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18679530 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18679994 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 18680009 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18682109 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18684368 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18686172 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18686514 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18688223 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18691245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18692073 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18692267 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18692959 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18693133 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18693198 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18694149 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18695323 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 18697446 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18697658 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18699558 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18706514 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 18707298 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18707738 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 18707753 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18708438 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 18708806 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 18709678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18710841 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 18710969 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 18711439 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18712426 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18714824 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18717841 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 18720192 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18720973 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 X 18720995 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 X 18722192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18724979 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18727005 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18728370 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18731697 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 X 18734256 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18734648 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18735513 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18736559 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 18736838 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18737739 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18738831 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18739250 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 18741034 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18741471 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 X 18750162 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18750816 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18757023 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 X 18758859 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18759423 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18760208 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18761357 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18762531 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18762557 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18762918 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 18762919 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 18777085 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18778041 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 18778934 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18780305 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 18784795 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18787652 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18788089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18789070 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18789114 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18792328 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 18792684 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 18792931 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18793731 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18796302 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18796498 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18796719 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18798122 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18798501 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18799324 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18799509 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 18799839 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18800153 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18800608 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 X 18800681 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.133333333333333 26 4 13 0 2 X 18800898 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 X 18800899 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 X 18800908 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 X 18800972 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 X 18801057 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 X 18801081 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 X 18802149 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18805338 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18806167 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18811429 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18812085 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18812793 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18814325 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18815209 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 18815357 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18817309 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18818424 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 18818426 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 18818530 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 18818845 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18819507 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 18820095 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18820364 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 18820752 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 18823258 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.176470588235294 0 0.823529411764706 6 28 3 0 14 X 18823316 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 6 30 3 0 15 X 18823629 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 18825068 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18826348 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 18826421 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 18827300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18827665 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18827784 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18828028 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18829105 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18829851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18830204 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18831110 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18832220 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 18832895 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18833091 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18833631 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18833702 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18834981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18835485 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18835929 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18836780 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18837258 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 18837748 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 X 18839428 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 X 18840485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18840605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18842300 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18842697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18843914 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18844835 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 18845217 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 18845316 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 18848735 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 18848814 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18848872 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18849137 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 X 18849378 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 18854163 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18854219 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18855222 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18855784 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.176470588235294 27 7 13 1 3 X 18855852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18856315 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18856481 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18859021 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18862287 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18862485 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18862577 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18862607 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18862710 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18862783 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18862861 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18862869 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18862999 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 X 18863004 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18863123 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 18863259 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 18863270 T A N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 18863652 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18863710 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18864100 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18864117 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18864309 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18864360 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18864492 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18864749 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18864890 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18864995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18865115 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18865145 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18865535 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18865614 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18865640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18865641 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18865794 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18865888 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 18865957 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 18865961 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 18865965 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 18866175 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 18866299 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18866387 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18866407 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18866702 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18866731 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18866756 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18866767 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18866788 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18866797 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18866857 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18866929 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18866951 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18867101 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18867120 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18867201 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18867257 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18867355 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18867363 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18867736 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 18867795 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 18867838 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18867896 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18867954 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18868027 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18868080 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18868096 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18868142 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18868187 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 18868324 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18868543 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 18868636 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18868725 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18868729 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18868833 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18868926 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 18869258 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18869411 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 18869426 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18869510 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18869871 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18869911 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18870092 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18870189 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18870199 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18870445 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18870485 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18870525 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18870562 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18870640 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18870794 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18870834 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18870941 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 18870942 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 18870956 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 18871043 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 18871137 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18871384 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 18871432 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 18871437 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 X 18871571 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 18871635 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18871788 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 18871800 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18871844 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18871868 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18873333 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 18873905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18873993 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 X 18874154 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 X 18874961 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 18875204 G A N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 X 18875593 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18877167 A G N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.230769230769231 19 7 9 1 3 X 18877370 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18877391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18879166 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18879180 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 X 18880454 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 X 18881050 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 X 18881237 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 X 18882952 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18884161 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 18885886 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18887685 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18888045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18891138 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18892111 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18892947 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18892948 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18896255 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 18897234 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18898440 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18899213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18899635 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18899913 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18899922 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18900139 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18900207 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 18900804 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18903529 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18905039 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18905147 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18907098 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 X 18907158 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18908648 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18909396 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 18910980 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18914071 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18914595 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18914739 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18915391 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18916756 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18916764 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18917396 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18918706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18919109 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 X 18921689 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18923668 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18923945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18924160 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18929138 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0 0.764705882352941 0.235294117647059 13 21 0 13 4 X 18929673 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18930741 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 18930838 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18930874 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18930972 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 X 18930976 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18931016 C A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 X 18931024 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18931841 C A Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 X 18931995 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 18933581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18934101 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18934232 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18934373 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18934697 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 18934930 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18936340 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18937335 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18937731 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18939760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18941195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18942656 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 18946312 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 18951154 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18951248 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18952900 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18953118 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18954729 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 X 18954756 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18958320 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18959338 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 X 18959437 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18959566 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18962724 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 18969416 C T Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 X 18971028 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18977406 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 X 18981125 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 18981782 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 18985279 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 18986351 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 18986541 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 18987233 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 18989792 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 18993553 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 19001764 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 19003052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19007225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19007897 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 X 19008116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19010709 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19011326 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19020219 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19024506 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19026596 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19027288 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19027611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19028567 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19031539 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 19035235 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19036745 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19041235 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19044248 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 X 19045676 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19046115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19047077 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19051905 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 19054846 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19055399 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19056851 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19057011 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19057166 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19060462 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19060796 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19061788 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19062459 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19062722 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19064319 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19065809 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 19067225 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19067947 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19070640 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19073145 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 19075511 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 19078681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19089785 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19091651 T G Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 19092541 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 X 19093242 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19093477 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 19093531 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19094462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19102675 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19104543 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19106537 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 19108548 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19109618 T C N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 19109866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19111019 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19112364 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19112998 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19113571 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19114481 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19117572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19118977 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19120481 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 19120669 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 X 19121540 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 19122340 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 19122892 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19123809 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19124207 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 X 19129065 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19130840 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19132180 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19134141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19135528 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19135833 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19135837 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 19142737 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19143372 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 19143949 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19144066 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19144309 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 X 19145246 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 19147501 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19148185 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 19151616 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19152427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19153866 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19156151 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19156275 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19156378 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 X 19156404 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19156736 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19156914 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 X 19157096 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 19157391 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 X 19157409 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 X 19157498 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19158148 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 X 19158499 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 X 19159261 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 X 19161085 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 X 19161118 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 X 19161138 A G Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 X 19161210 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19161370 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 X 19161417 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19161770 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 X 19162952 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 X 19163234 T G Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 X 19163633 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 X 19163646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19163671 G A Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 X 19163830 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 X 19164350 C A N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 X 19164360 A T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 X 19164625 G A Y Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 X 19164657 C T Y Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.307692307692308 0.461538461538462 0.230769230769231 14 12 4 6 3 X 19164678 A T Y N 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.272727272727273 0.454545454545455 0.272727272727273 11 11 3 5 3 X 19164700 G C N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 X 19164855 A T N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 X 19165011 G A Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 X 19165163 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19165244 G T Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 X 19165491 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 X 19165543 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19166305 A T Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 X 19166375 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 X 19166546 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 X 19166561 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 X 19166613 C A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 X 19166823 G T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 X 19167223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19167287 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 X 19167298 C G Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 X 19167372 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 X 19167546 C T Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 X 19168112 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 X 19168190 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 X 19168329 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19168556 C G Y N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 X 19168863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19168996 T A Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 X 19169019 G A Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 X 19169083 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19169343 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 19169555 G C Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 X 19169709 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 X 19169754 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19169823 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19169917 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 X 19169991 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19170082 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19170316 G T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 X 19170635 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 X 19170962 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19171047 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19171184 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 X 19171544 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 X 19173124 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19174167 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 X 19175103 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19176211 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19177447 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19178138 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19178597 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 19179141 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19179518 G C Y N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 X 19179906 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 19179926 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 19180961 C T Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 X 19182725 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 19184208 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 19185291 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19186421 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19186456 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 19186931 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 19187231 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 19187516 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19187715 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19190238 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19190544 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19191392 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19192648 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19192745 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19193553 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19193628 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 19194530 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19194833 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 X 19195018 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 19195242 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19195695 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19195838 G A Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 X 19197014 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19201664 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19206875 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19206944 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19207475 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 19207596 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 19209675 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 X 19210511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19211231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19212090 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 19213331 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19215829 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19216283 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19216329 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19221055 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19221097 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19222719 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19222971 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19224272 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19224691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19225071 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19227111 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19246186 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19246245 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19247641 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19249371 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19252061 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 19252314 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 19253649 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19254679 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19255021 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19257671 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19258550 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19258814 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19261398 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 19263182 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19263772 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 19264609 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19264666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19266070 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 19266634 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19266985 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19269011 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19270550 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19275194 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19278322 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19280346 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19281585 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19282185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19282912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19283814 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19285384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19286131 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19286435 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19287160 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 19287362 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 19287730 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19288420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19288681 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19289298 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19290674 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 19292497 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 19293675 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19294032 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19294238 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19294469 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19295874 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19296290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19297477 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19297757 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19298188 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19299577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19300095 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19302454 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19302524 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19304413 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19304827 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19306257 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 X 19307713 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19307922 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 X 19309455 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19310507 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19311213 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19312768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19313966 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19315618 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19315723 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19315782 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19316561 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19321716 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19322606 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19324590 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 19324885 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 19326803 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 19326846 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19329199 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19333160 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19336627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19336808 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19337233 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19337651 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19337903 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19338127 G C N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 19340459 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 19342336 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19342559 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19342810 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19343670 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19345472 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19348564 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19348760 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19349472 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 19351240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19351367 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19351494 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19352627 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19353771 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 19353949 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19354896 C T Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 19355108 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 19361730 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19362107 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 19362900 C A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 19363786 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19364091 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 19364944 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19365612 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 19366304 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19366714 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19369647 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19370160 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19371581 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19372228 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19379191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19381260 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 19381805 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19382178 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 19388731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19389396 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19389432 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 X 19389935 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19389963 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19389975 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19390056 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 X 19390061 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19390123 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19390263 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 X 19390688 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19393088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19394622 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 19395338 G A Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 X 19395569 A T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 X 19396014 T C Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 X 19396140 A G Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 X 19396246 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19397134 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19397207 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19397250 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 X 19397435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19397475 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19397536 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 19397712 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 19397716 C T N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 19397776 T A Y N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 19397824 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 19397887 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 19397928 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 X 19398149 A G Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 X 19398180 T G N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 X 19398186 A T N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 X 19398410 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19398717 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19398925 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 X 19398928 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19399186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19399376 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19399755 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19400627 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19403974 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19415410 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19415499 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19416008 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 19419720 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19421489 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19421730 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19421734 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19421735 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19421802 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19421926 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19422607 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19422613 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19422962 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19423051 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19423198 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19423280 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19423465 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19423570 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19424777 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19424883 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19425366 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19426332 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19426344 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19426375 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19426560 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 X 19426575 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 X 19426610 A C N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 X 19426611 T A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 X 19426622 A G Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 X 19426650 A C Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 X 19426701 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19426710 G T N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 X 19426736 C T N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 X 19426767 G C N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 X 19426775 G C N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 X 19426792 A G Y Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 X 19426893 A G Y Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 X 19426946 G A Y Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 X 19426999 A C Y N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 X 19427010 G A Y Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 X 19427140 T G N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 X 19427331 T A N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 X 19427460 A G Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 X 19427536 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 X 19427599 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 X 19427620 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19427621 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19427628 A G Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 X 19427689 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19428088 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 X 19428264 T G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 X 19428534 T G Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 X 19428537 A T Y N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 X 19428627 C T N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.285714285714286 0.5 0.214285714285714 15 13 4 7 3 X 19428682 G A Y Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.285714285714286 0.5 0.214285714285714 15 13 4 7 3 X 19428862 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 4 8 0 4 2 X 19428882 T G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 19429017 A G N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 X 19429024 C T N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 X 19429281 T C Y Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 X 19429308 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19429324 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19429369 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 X 19429450 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19429474 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19429521 A G Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 X 19429821 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 X 19429839 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 X 19429847 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 X 19429911 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 X 19430102 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 X 19430111 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 X 19430415 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19430769 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19431275 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19432069 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19432126 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 19432222 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 X 19432677 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 X 19432951 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 X 19433076 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 X 19433232 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 X 19433501 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 X 19433630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19434675 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 X 19434824 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19436345 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19436350 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19436931 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 X 19443283 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 19443338 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 19443458 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 X 19443670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19443740 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 X 19443829 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19445450 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 X 19445523 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 X 19445978 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 X 19446333 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19446377 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19446549 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 X 19446550 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 X 19446565 T A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 X 19446593 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19446680 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 X 19446685 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 X 19446735 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 X 19446842 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19446984 T G N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 X 19447023 G A N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 X 19447029 T C N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 X 19447183 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 X 19447285 A T Y N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 X 19447324 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 X 19447389 A G Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 X 19447438 G C Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 X 19447566 C G Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 X 19447738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19447780 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19447829 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 X 19447833 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 X 19447838 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 X 19447862 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 X 19447983 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 X 19448003 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 X 19448532 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 X 19449082 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19449170 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19449176 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19449214 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19449367 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 X 19450133 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19450440 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19450847 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19451027 C T Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 X 19451476 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19451934 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19454594 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19457183 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19457343 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19460079 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 19460194 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 19461777 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19461804 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19462288 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19462682 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19463249 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19463501 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19464863 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19466275 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19467362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19467483 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19468154 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 19468157 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 19468416 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19468482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19468639 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19468696 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19468763 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19468886 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19468906 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19469402 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19469416 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19469465 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 X 19469587 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19469609 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19469638 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19469663 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19469923 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19470003 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 X 19470058 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19470081 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19470347 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19470441 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19470555 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 X 19470792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19470798 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19470833 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 X 19470840 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 X 19470864 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 19470865 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 19471134 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19471404 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19471485 A G N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 X 19471502 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 19471511 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 19471534 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 19471574 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19471629 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 X 19471833 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 19473096 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19473117 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19473505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19473683 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 X 19473805 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 X 19474043 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19475381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19475644 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 X 19475662 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 X 19475900 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19475921 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 19475940 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19476830 G C Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 X 19477836 C G N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 X 19478279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19479715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19479824 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19480100 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.263157894736842 0.0526315789473684 0.684210526315789 11 27 5 1 13 X 19480323 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.235294117647059 0.117647058823529 0.647058823529412 10 24 4 2 11 X 19482289 T A N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.25 0.0625 0.6875 9 23 4 1 11 X 19483892 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19484834 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19487482 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19487532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19488838 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19491836 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19492404 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 19494146 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19494928 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19496899 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19502890 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 19506038 G A Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 19506086 T G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 19506354 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19506573 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19507402 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19507889 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19509302 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19512672 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19513206 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 19513377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19513754 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.176470588235294 27 7 13 1 3 X 19514036 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19514142 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19516311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19519589 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19520037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19522790 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19523130 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19527265 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 19533550 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19534638 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19534991 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19537302 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19538361 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19538559 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19538722 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19539591 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.277777777777778 0.0555555555555556 0.666666666666667 11 25 5 1 12 X 19545333 G A Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 19545450 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19545936 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19546578 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19547013 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 19547991 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19552811 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19554996 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19557570 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19557571 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19560528 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19562340 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19563367 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19563502 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19565139 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19566108 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19569961 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 19570800 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19571265 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19571960 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19579012 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 19583519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19585052 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19585506 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19586008 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19588108 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19595903 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19596098 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 X 19596258 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.315789473684211 0.0526315789473684 0.631578947368421 13 25 6 1 12 X 19599249 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19607876 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.3 0.05 0.65 13 27 6 1 13 X 19608192 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 19608581 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19609048 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19609892 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19610067 A T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 19618439 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19618917 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 19618970 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 19620130 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19620447 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.3 0.05 0.65 13 27 6 1 13 X 19620502 T C Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.277777777777778 0.0555555555555556 0.666666666666667 11 25 5 1 12 X 19621467 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.277777777777778 0.0555555555555556 0.666666666666667 11 25 5 1 12 X 19621578 C T Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.315789473684211 0.0526315789473684 0.631578947368421 13 25 6 1 12 X 19624120 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19624501 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.3 0.05 0.65 13 27 6 1 13 X 19624839 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19625159 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19625877 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19625899 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19626427 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19626465 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19626537 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 19626573 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19626817 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19626840 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.315789473684211 0.0526315789473684 0.631578947368421 13 25 6 1 12 X 19626841 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19627090 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.65 0.05 0.3 27 13 13 1 6 X 19627454 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19629840 C T Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.642857142857143 0.0714285714285714 0.285714285714286 19 9 9 1 4 X 19630427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19630450 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.176470588235294 27 7 13 1 3 X 19630582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19632682 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 19633114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19633177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19634573 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.333333333333333 23 13 11 1 6 X 19636113 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 19637660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19638450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19640575 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19640580 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19640645 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19640927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19640985 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19641208 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.65 0.05 0.3 27 13 13 1 6 X 19641223 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19641668 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19642473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19642665 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.222222222222222 0.0555555555555556 0.722222222222222 9 27 4 1 13 X 19642801 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19642947 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19643028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19643656 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.263157894736842 27 11 13 1 5 X 19643718 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19644998 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 19645369 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19647655 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19647793 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19648613 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19649116 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19650004 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 X 19650334 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19650926 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 X 19651353 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 X 19653266 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 X 19653475 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.157894736842105 0 0.842105263157895 6 32 3 0 16 X 19653689 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19653809 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19654587 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19654855 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19654930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19654952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19655255 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19656368 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 19656793 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19657254 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 X 19659084 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19659841 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19660039 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19661002 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19661448 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19662171 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19662194 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19663166 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19663866 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.157894736842105 0 0.842105263157895 6 32 3 0 16 X 19663872 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 6 30 3 0 15 X 19663875 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.157894736842105 0 0.842105263157895 6 32 3 0 16 X 19666173 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19666327 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19667310 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19667468 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.3 0.05 0.65 13 27 6 1 13 X 19667528 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.277777777777778 0.0555555555555556 0.666666666666667 11 25 5 1 12 X 19667656 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 X 19667676 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.277777777777778 0.0555555555555556 0.666666666666667 11 25 5 1 12 X 19667684 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.277777777777778 0.0555555555555556 0.666666666666667 11 25 5 1 12 X 19667763 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.263157894736842 0.0526315789473684 0.684210526315789 11 27 5 1 13 X 19668027 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 X 19668077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19668178 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19668678 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 X 19668739 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19669436 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19669828 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19669845 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19669946 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19670026 C A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 X 19670394 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19670701 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19672073 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 19672492 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19672582 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19675336 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19675722 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19675729 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19677339 C T Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.555555555555556 0.111111111111111 0.333333333333333 22 14 10 2 6 X 19677420 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 X 19678195 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 X 19678249 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19678318 A G Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.647058823529412 0.117647058823529 0.235294117647059 24 10 11 2 4 X 19678325 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.611111111111111 0.111111111111111 0.277777777777778 24 12 11 2 5 X 19678348 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 X 19679426 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19679733 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19679734 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19679779 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19679968 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 X 19679987 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19680238 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19680442 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19680552 C A Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.647058823529412 0.117647058823529 0.235294117647059 24 10 11 2 4 X 19680555 A C N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.647058823529412 0.117647058823529 0.235294117647059 24 10 11 2 4 X 19680768 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19680878 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 X 19680882 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19680952 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 X 19680989 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.611111111111111 0.111111111111111 0.277777777777778 24 12 11 2 5 X 19681121 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19681175 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 X 19681217 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19681285 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 26 14 12 2 6 X 19681290 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.578947368421053 0.105263157894737 0.315789473684211 24 14 11 2 6 X 19681307 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 19681308 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 X 19681436 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19681577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19681586 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19681834 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.625 0.0625 0.3125 21 11 10 1 5 X 19681837 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.625 0.0625 0.3125 21 11 10 1 5 X 19681849 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.625 0.0625 0.3125 21 11 10 1 5 X 19681857 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.625 0.0625 0.3125 21 11 10 1 5 X 19681935 C T N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.6 0.0666666666666667 0.333333333333333 19 11 9 1 5 X 19682020 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5625 0.125 0.3125 20 12 9 2 5 X 19682097 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.611111111111111 0.111111111111111 0.277777777777778 24 12 11 2 5 X 19682108 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 X 19682109 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.611111111111111 0.111111111111111 0.277777777777778 24 12 11 2 5 X 19682144 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.555555555555556 0.111111111111111 0.333333333333333 22 14 10 2 6 X 19682202 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.611111111111111 0.111111111111111 0.277777777777778 24 12 11 2 5 X 19682326 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 26 14 12 2 6 X 19682377 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.578947368421053 0.105263157894737 0.315789473684211 24 14 11 2 6 X 19682396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19682456 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 26 14 12 2 6 X 19682464 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.578947368421053 0.105263157894737 0.315789473684211 24 14 11 2 6 X 19682560 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 X 19683508 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 19683560 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19683742 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19683934 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19684105 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19684125 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19684207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19684287 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19684309 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19684314 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19685187 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19685218 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19685562 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19685613 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19685619 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19685839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19685992 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 19686008 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19686050 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 19686809 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 19687470 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19687575 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 19687941 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19687984 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19688026 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19688374 G C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19688379 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 19688560 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19688572 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19688600 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19688692 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 X 19688693 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 X 19688694 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19688860 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19688986 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19689027 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 19689082 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19689161 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19689196 C A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 19689410 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19689457 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19689832 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19689858 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19689973 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19690184 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 19690778 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 19691022 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 19691180 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 19691287 A G Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 X 19691399 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19691568 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19691606 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19691675 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19691807 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 19691846 G C Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 19691954 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 19691981 A G Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 19692194 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19692214 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.611111111111111 0.111111111111111 0.277777777777778 24 12 11 2 5 X 19692278 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19692375 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 19693036 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19693079 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19693091 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19693385 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 19693408 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 19693415 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 19693422 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.6 0.133333333333333 0.266666666666667 20 10 9 2 4 X 19693477 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 19693568 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19693722 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19693875 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19694023 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19694069 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19694197 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19694240 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19694335 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 X 19694653 T C N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.0769230769230769 0.769230769230769 0.153846153846154 12 14 1 10 2 X 19694705 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19695085 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19695435 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19695710 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19695802 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19695916 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19696004 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19696007 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19696080 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19696098 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19696101 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19696142 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19696261 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19696275 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 X 19696304 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19696422 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19696812 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19696929 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19696942 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19697037 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19697159 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19697180 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19697445 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19697463 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19697497 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19697609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19697625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19697754 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 X 19697828 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19698274 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 19698275 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 19698443 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 19698454 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 19698541 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 19698639 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 19698718 C A Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.647058823529412 0.117647058823529 0.235294117647059 24 10 11 2 4 X 19698739 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.625 0.125 0.25 22 10 10 2 4 X 19698785 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19698919 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19698930 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19699037 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19699133 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19699174 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19699220 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19699404 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19699434 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19699516 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19699600 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 X 19699659 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 19699662 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 19700089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19700229 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 X 19700372 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 X 19700567 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 X 19700681 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19700899 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19701152 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19701203 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19703911 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19705077 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19706484 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 X 19707240 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19707573 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19709110 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 X 19709621 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 X 19709712 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 X 19709749 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 X 19710181 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 X 19710183 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19710198 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 X 19710320 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19710376 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 X 19710499 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 X 19710521 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 X 19710608 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 X 19710668 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 X 19713322 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19715550 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 X 19715793 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19716223 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19716811 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 X 19717137 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19717231 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19717673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19722258 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19722658 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19722700 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19723353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19723541 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 X 19723563 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19723826 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 X 19723868 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 X 19723876 A G N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 X 19723929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19723997 G T N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 X 19724172 T A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 X 19724249 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19724250 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19724335 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19724843 A T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 X 19724893 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19724984 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19725007 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 X 19725142 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 19725149 G T Y N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 X 19725150 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 19725209 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 19725290 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 19725444 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19725859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19725972 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 X 19726556 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 X 19727053 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 19729390 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19730247 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19730256 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19731199 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19731391 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19734726 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 X 19734953 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19734965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19736132 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19737162 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19737265 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19737419 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19737639 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19737767 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19740142 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19748623 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19749247 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19749469 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19749743 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 X 19750905 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 X 19751005 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19751069 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 X 19752259 C G Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 X 19752457 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 19752765 G A Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 19753594 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19754299 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19754705 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19754838 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19755258 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19756215 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19756269 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19756282 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19756462 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19758187 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19760730 G C Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 19761834 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 19763137 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 X 19763709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19764797 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 X 19764952 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19766244 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 19766719 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 X 19767779 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19768859 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19769177 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19769681 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19771453 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 19771737 C A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.235294117647059 0.117647058823529 0.647058823529412 10 24 4 2 11 X 19773031 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 19775593 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 19775594 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 19775690 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 19776241 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19777372 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19777823 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 19778353 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19778743 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19778965 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19779228 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 19779613 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 X 19779668 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19779828 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19780333 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19783290 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19783777 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19784947 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 X 19784954 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 X 19784963 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19786521 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19786651 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 X 19788684 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19788722 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 X 19789031 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19789552 G A Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 19789618 G C Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 19793535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19794122 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 X 19794123 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19795586 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19799775 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19801113 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19801627 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19801987 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19804846 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19808735 T A Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.526315789473684 0.105263157894737 0.368421052631579 22 16 10 2 7 X 19809031 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 0.105263157894737 0.421052631578947 20 18 9 2 8 X 19809352 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19809944 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19810526 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19811179 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 X 19816481 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19817575 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19819122 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19820065 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19822076 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19822786 A T Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 0.105263157894737 0.421052631578947 20 18 9 2 8 X 19823501 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19824803 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19827186 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19828444 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19828523 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19828524 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19830334 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19830474 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19831566 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19833390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19834226 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19835085 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19835784 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19838133 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 19845635 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19846481 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.35 0.1 0.55 16 24 7 2 11 X 19846483 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.35 0.1 0.55 16 24 7 2 11 X 19846517 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.368421052631579 0.105263157894737 0.526315789473684 16 22 7 2 10 X 19846660 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19848376 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19850041 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19850673 C T Y Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.636363636363636 0.181818181818182 0.181818181818182 16 6 7 2 2 X 19852597 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19859244 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19859510 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19859712 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19862225 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 19870228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19872595 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 X 19873182 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19874953 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19875941 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19876362 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19876368 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19876521 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 19876529 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 19882679 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19884885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19885486 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19887154 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19889737 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19892748 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19892897 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19894071 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19895589 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 19895607 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 19895829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19895909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19903457 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19903548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19903616 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.35 0.1 0.55 16 24 7 2 11 X 19903646 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.35 0.1 0.55 16 24 7 2 11 X 19903656 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19903767 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19903917 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.55 0.1 0.35 24 16 11 2 7 X 19904041 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19904481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19906390 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19906548 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19908231 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19908800 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19908912 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19910207 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19915110 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19916878 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19917452 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19919437 A G N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 19920973 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19921022 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19922584 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 X 19925128 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19925674 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19925737 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19925953 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19927101 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19927169 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19927503 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19928975 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19929229 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19930622 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19931762 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19932324 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19932698 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19933729 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19936272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19936640 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19937838 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19940923 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19942792 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19947933 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19949948 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19950457 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 X 19953421 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19953551 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 19955417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19956449 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 19956839 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19957023 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19959153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19959990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19962057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19962066 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19962313 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 X 19962775 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19963117 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19964523 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19965073 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19965373 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19968226 G A N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 19970440 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19977222 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 19978667 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19979356 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19982056 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19982948 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19983182 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 19985805 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 19992871 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 X 19993187 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 X 19993278 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 X 19993410 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 19993764 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 19994121 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 19995381 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19995460 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19995534 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 19996195 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 X 19997098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19998242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 19999117 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20004141 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20006224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20009485 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20015194 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 20015265 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20016477 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20017458 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20023819 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 20027804 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20028006 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20034323 T G Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 X 20035688 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20035979 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20037071 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20037499 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20039461 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20042288 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 20042417 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 20043468 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20043919 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 20043960 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20044519 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20045779 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20046212 G T Y N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 X 20053908 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 20069905 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 20071008 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 20073206 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20075230 G A Y Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 13 7 5 3 2 X 20077987 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20078082 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20081284 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20091313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20091615 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20094672 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20096141 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 X 20096398 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 20097166 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20100588 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20100603 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20101313 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 X 20101759 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20103458 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 20117382 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20119656 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20125718 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 20130249 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20131310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20131460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20131791 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20132022 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20134494 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20135921 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20139382 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20139631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20148531 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20149970 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20151819 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20161760 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 20163479 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 X 20164384 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20168644 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 20185643 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20185756 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 20188851 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 20205361 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20207132 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20208361 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20214707 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 X 20214873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20217407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20224246 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20228533 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20239164 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20240659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20241031 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20242475 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20245363 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20248210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20248357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20248662 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20248797 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20249135 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20251288 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20251326 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20251738 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20251796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20251889 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 X 20252282 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20252356 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20252411 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20252423 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 20252492 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20259872 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20259944 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20268503 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 20268783 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20269913 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20270386 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20274991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20278510 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20278575 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20279309 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20279330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20282619 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 X 20286176 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20288021 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 X 20294515 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20298187 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20298388 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20298487 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20300297 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20300503 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 X 20300535 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20301153 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 X 20301167 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 X 20301250 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 X 20301381 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 X 20301382 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 X 20301407 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 X 20301438 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 X 20301494 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 X 20301632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20301690 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 20301881 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 20302010 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 20302044 G A N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 X 20302060 C G N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 X 20302114 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 X 20302133 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 X 20302188 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 X 20302301 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 20302315 A G N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.133333333333333 0.733333333333333 0.133333333333333 15 15 2 11 2 X 20302350 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 20302774 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 X 20302782 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 X 20302792 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 X 20302794 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 X 20302869 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 X 20303038 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 X 20303317 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 X 20303356 A G N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 X 20303626 T C N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 X 20303674 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 20303686 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 4 2 1 2 0 X 20303857 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 20305588 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20306711 C G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 20306838 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 20308211 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20309225 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 X 20309335 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 20309336 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 20309345 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 20309347 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 20309457 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 X 20309796 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 X 20310337 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20310778 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 20310814 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20310855 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20310862 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20310884 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20310896 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20311163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20311284 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20311954 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20312054 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20312390 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20312489 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20312804 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20312811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20312870 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20313128 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 20313183 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 20313401 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20313593 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20313678 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20313733 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20314097 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20314275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20314700 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20314717 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20315461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20315886 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20316278 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20317341 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20317558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20318215 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20318965 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20318991 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20319048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20319213 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20319849 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20320010 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20320404 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20320475 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20320496 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20320743 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20320835 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20320875 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20320916 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20320923 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20320959 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 20320968 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 20321037 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 20321219 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20321369 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20321563 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 20321575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20321599 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20321632 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20321713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20322082 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20322137 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 20322993 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20327750 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20327806 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20329735 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20332515 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 20334631 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20335912 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20338059 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20338531 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20346221 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20346264 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20347147 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20347151 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20348439 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20348749 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20349049 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20349094 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20349184 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20350466 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20350529 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20356420 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 20356494 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20356514 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20357404 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20357424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20357428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20358509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20358579 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20358588 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20358637 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 20359038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20359102 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20359106 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20359139 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20359163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20359172 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20359202 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20359617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20359827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20359853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20359896 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20359908 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20359909 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20360043 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20360547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20361840 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 20361858 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20361864 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20361969 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20362073 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20362221 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20362318 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20362345 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20362466 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20362538 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20362691 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 20362739 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 20362866 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 20362895 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 20362953 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20363203 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20363503 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 20363600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20363638 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20363655 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20363684 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20363697 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20363706 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20363848 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20363896 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20364030 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20364353 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 20364355 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20364379 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 20364380 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 20364383 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 20364450 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20364454 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20364486 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20364609 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 20364639 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20364685 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20364768 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20364769 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20364912 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 20365613 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20365790 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20365879 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20366049 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20366223 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20366381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20366397 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20366398 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 20366599 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20366816 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20367288 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20368472 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 20371302 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20371857 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20371872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20373540 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20373555 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20373834 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20377467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20377717 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20379616 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20379912 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20380526 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20382969 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20385054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20385190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20385574 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20386043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20388272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20388860 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20388928 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 20389635 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20389724 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 X 20390903 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20392219 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 20392476 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20393404 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20393569 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 20393798 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 X 20393824 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20393891 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 X 20393896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20394025 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20394109 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 X 20394691 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 X 20394692 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20394980 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 X 20395425 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 X 20395479 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 X 20395650 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20395685 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20395793 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 X 20395940 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 X 20396133 C G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 X 20396439 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20396706 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20396903 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 X 20396976 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 X 20398613 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20398641 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 20398827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20398938 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 X 20399821 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20400025 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 20400904 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 X 20400912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20402278 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20402319 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20402751 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 20402838 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 X 20403228 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20403316 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20403947 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 20403999 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 20404020 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 20404222 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 20405244 T G Y N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 X 20405427 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 X 20405902 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20406564 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 X 20407153 T G N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 X 20408253 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20408968 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20409258 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20411057 C T Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 20411366 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 20411726 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20412533 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20413882 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20415023 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20415048 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20415112 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20415204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20415413 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20415974 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20416712 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20416742 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 X 20416755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20416900 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 20417156 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20417180 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20417817 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20417920 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20417974 C G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 20418229 T C Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 X 20418323 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 X 20419254 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 20419598 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 X 20420146 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 20420861 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 20421206 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 X 20421363 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 X 20421513 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20421689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20421798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20421814 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 X 20422073 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20422512 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 X 20423122 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20423612 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20424089 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20424798 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20430245 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20431496 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20431638 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20432480 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 20433218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20433649 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 20434312 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20436082 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 20439038 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 20439795 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20440572 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20441202 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20441527 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 X 20442187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20450779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20450988 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20451187 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20452544 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20452558 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20452577 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20455969 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20456345 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 X 20456401 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 X 20456561 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 X 20457598 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 20457785 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 X 20459197 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 X 20459615 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 X 20459652 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 20459655 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20459854 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20461139 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 20461315 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20461441 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20464691 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 X 20464877 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20465590 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 20465635 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20465655 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20469663 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 20469737 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 X 20472791 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 X 20472905 C T Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 X 20472919 T C Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 X 20472974 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 X 20473575 G A N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 X 20474372 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20474746 T C N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 X 20474967 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 20475071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20475863 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 20475901 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 20475913 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 20476371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20477625 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20481816 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20483700 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20483979 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20485533 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 X 20486412 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20489898 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 X 20490099 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 X 20490220 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20490414 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 X 20490473 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 X 20490510 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20490844 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20491862 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20494803 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20496881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20502966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20509104 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20509316 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20509713 C T Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 X 20509721 C T Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 X 20510030 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 X 20510270 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20510504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20511620 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20513052 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20515662 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20516158 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20516430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20522536 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20522551 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20522896 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20524274 T G Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 X 20524305 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 X 20524788 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20525180 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20537584 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20539594 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20539786 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20539837 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20540194 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20540769 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20540779 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 20541581 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 20541632 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 20541879 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 X 20542154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20542210 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20542412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20542695 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20542741 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20542769 G C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 20543340 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20544093 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 20544175 G A Y Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 X 20544614 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20545326 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 20545715 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 20546974 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 20547192 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 20547301 T G Y N 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 X 20547932 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 20548260 T G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 20548343 G T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 20548482 G T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 20548662 C T N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 X 20548786 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 20548991 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 20549093 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 X 20549115 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 X 20549783 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 X 20550645 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 X 20551160 T A N N 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 X 20551521 A G Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 20552098 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 20552643 T C Y Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.285714285714286 0.142857142857143 0.571428571428571 5 9 2 1 4 X 20552649 A G Y Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 5 11 2 1 5 X 20552658 G A Y Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 5 11 2 1 5 X 20552662 A C Y N 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 5 11 2 1 5 X 20552672 G A N Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 5 11 2 1 5 X 20554238 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 5 13 2 1 6 X 20554385 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 20554593 G A N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 X 20554594 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 20554815 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 20554887 T G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 20555271 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 X 20555409 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 20555539 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 20555607 T C N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 X 20555746 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 X 20555921 G C N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 X 20556516 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 X 20556579 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 20557212 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 20557539 G A N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 X 20557752 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20558958 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20559199 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 20559349 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20559383 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 20560027 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 20560553 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 20561489 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 X 20561536 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 20561615 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 20561675 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 20561743 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 X 20562099 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 20562126 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 X 20562209 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 20562509 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 20562934 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 20562988 C A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 X 20563225 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20563521 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20563884 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 20564292 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20565134 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20565426 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20566901 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20569658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20570033 A G Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 X 20570633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20570894 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20573194 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20574037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20574272 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20575106 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20576256 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 20581893 C T N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 20583641 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 20592539 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20593240 A G Y Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 X 20594950 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 20596863 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20599009 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20602285 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 X 20603857 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20604655 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 X 20604819 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 20606378 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20606890 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20607090 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20607120 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 20614668 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20617798 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20620190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20622901 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 X 20622972 T A N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.529411764705882 0.176470588235294 0.294117647058824 21 13 9 3 5 X 20625123 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20625268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20633052 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20638669 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20639059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20643726 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20655825 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20658299 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 20665753 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20667031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20667304 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20667676 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 X 20667761 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20668248 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 X 20669343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20669372 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 X 20669797 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20670390 A C Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 X 20670577 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20670590 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20670653 C A Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 20671677 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20671752 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 X 20671773 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 X 20672166 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 20672423 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20672562 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20672563 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20672682 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20672696 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20672840 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 X 20672971 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.277777777777778 0.111111111111111 0.611111111111111 12 24 5 2 11 X 20673066 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 X 20673079 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.277777777777778 0.111111111111111 0.611111111111111 12 24 5 2 11 X 20673110 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 X 20673261 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 X 20673523 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 X 20673567 T G N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.266666666666667 0.133333333333333 0.6 10 20 4 2 9 X 20673568 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 10 22 4 2 10 X 20673598 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 X 20673623 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 X 20673985 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 X 20674066 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.277777777777778 0.111111111111111 0.611111111111111 12 24 5 2 11 X 20674161 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.235294117647059 0.117647058823529 0.647058823529412 10 24 4 2 11 X 20674165 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.235294117647059 0.117647058823529 0.647058823529412 10 24 4 2 11 X 20674183 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.1875 0.125 0.6875 8 24 3 2 11 X 20674251 C A N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.2 0.133333333333333 0.666666666666667 8 22 3 2 10 X 20674257 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 X 20674273 T C N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.285714285714286 0.142857142857143 0.571428571428571 10 18 4 2 8 X 20674287 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 X 20674521 C G N N 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.3 0.1 0.6 7 13 3 1 6 X 20674673 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20674694 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20674700 C G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 X 20674734 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 X 20674758 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 X 20674916 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20674975 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 X 20674983 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 X 20675061 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 X 20675181 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 X 20675732 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 X 20675798 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.277777777777778 0.0555555555555556 0.666666666666667 11 25 5 1 12 X 20676012 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20676152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20676191 C A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.294117647058824 0.117647058823529 0.588235294117647 12 22 5 2 10 X 20676418 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.277777777777778 25 11 12 1 5 X 20676425 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.611111111111111 0.111111111111111 0.277777777777778 24 12 11 2 5 X 20676498 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 X 20676602 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.647058823529412 0.117647058823529 0.235294117647059 24 10 11 2 4 X 20676760 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20676816 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 X 20676854 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 X 20677212 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 X 20678001 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20678266 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 X 20685316 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20689873 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20689913 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20690681 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20691236 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20691372 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20691801 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20692346 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20692761 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 20694476 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20695019 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20695706 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20696598 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20697380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20697718 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 20697820 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20700129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20702781 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20703399 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20704315 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 X 20707444 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20707745 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20712556 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20713426 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20713667 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 20716139 A T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 20717002 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 X 20719790 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20721142 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 20722199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20722239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20723919 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 20725204 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20727379 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20727681 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20727995 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 20730323 G C Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 20735891 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20736955 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20737973 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20738788 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 20739229 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20739752 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20740642 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20740844 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20741535 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20742984 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 X 20742987 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20743899 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20747409 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20754900 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20754986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20756775 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20758154 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20759146 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20761286 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20761849 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20762131 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20762735 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20762756 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20766851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20769058 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 20769096 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20771689 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20772463 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20772783 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20773685 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20775843 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20776642 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20776763 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20777035 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20779340 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20779502 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20780870 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20782028 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20782898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20783804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20784041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20787402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20787656 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 X 20787756 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20788232 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 X 20791571 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20792075 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20792117 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20792416 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20792422 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20795965 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20796052 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20796146 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20796963 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20797389 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20798427 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20798650 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 X 20798984 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20799585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20800532 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20801622 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20803642 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20804740 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20809250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20826819 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20828262 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20830014 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20830540 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20841562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20844369 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20845607 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20852228 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20853146 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 20853783 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20853975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20854437 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20856375 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20859704 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 20860617 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 20860926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20860997 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20861590 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 20862232 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20862676 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 X 20863021 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20863050 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 X 20863164 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 X 20863344 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20863370 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20863426 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20863518 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20863889 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 X 20863913 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 X 20864152 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 X 20864870 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 X 20864875 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 X 20864913 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 X 20864929 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 X 20865130 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 X 20865162 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 X 20865196 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20865398 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 X 20865461 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 X 20865510 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 X 20865536 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 X 20865716 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20865730 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 X 20865779 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20865826 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20865882 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20865936 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 X 20866082 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 X 20866121 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 X 20866191 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 X 20866202 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 X 20866405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20866471 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 X 20866637 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20867663 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20868094 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 X 20869389 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 20870946 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20871565 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 X 20871586 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 X 20871724 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20872215 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 X 20872241 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 X 20872537 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20872771 T C N Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.545454545454545 0.272727272727273 0.181818181818182 15 7 6 3 2 X 20872785 T A N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 X 20872786 C T N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 X 20872812 C T N Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.636363636363636 0.181818181818182 0.181818181818182 16 6 7 2 2 X 20872843 C A N N 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 6 6 2 2 2 X 20873628 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20873664 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 X 20873711 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 X 20874252 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 X 20874324 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 X 20874481 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 20875355 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 X 20876246 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20876684 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 X 20876999 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 X 20878287 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 X 20878417 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20879346 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20880780 G C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 X 20881024 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 X 20882465 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20882497 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 20882511 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 20883950 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20884169 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 X 20884200 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 X 20884276 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20884303 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 X 20884322 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 X 20884366 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 X 20884385 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 X 20884482 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 X 20884497 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 X 20884546 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 X 20884710 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 X 20885107 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 X 20885274 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 X 20885407 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 X 20885473 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20885713 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 X 20885717 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 X 20885760 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 X 20886031 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 X 20886268 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20886562 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 X 20886657 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 X 20886872 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20887034 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 X 20887163 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20887368 C G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 X 20887396 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 X 20887419 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 X 20887581 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 20887601 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 20887837 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0 0.823529411764706 0.176470588235294 14 20 0 14 3 X 20887950 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 X 20887959 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 X 20887964 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 X 20888012 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 X 20888061 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 X 20888119 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 X 20888148 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20888167 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20888265 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 X 20888662 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 X 20888689 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 X 20888702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20888732 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20888772 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 X 20888955 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 X 20888958 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 X 20888959 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 X 20888973 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 X 20889062 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 X 20889152 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 X 20889186 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 X 20889187 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 X 20889194 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 X 20889213 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 X 20889336 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 X 20889351 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 X 20889412 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 X 20889427 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 X 20889428 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 X 20889558 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 X 20889745 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 X 20889779 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20889784 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 X 20889863 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 20889913 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 X 20889915 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 X 20889947 T G N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 X 20889975 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 20892424 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20892746 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20892961 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 X 20892988 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 X 20892992 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 X 20893733 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20895773 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20896207 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20896298 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20896310 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20896445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20896567 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20896708 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20896733 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20896752 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20896794 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20896801 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20896830 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20896900 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20896903 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20896912 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20896982 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 20897359 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 20897944 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 20898065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20898210 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20898339 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20898465 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20898502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20898537 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20898552 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20898557 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20898612 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20898732 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20898787 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20898828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20898838 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20898842 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20898950 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20899017 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20899662 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 20899779 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 X 20899930 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20900210 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20900212 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20900215 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20900251 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20900389 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20901351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20901383 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20901757 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20901947 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 20902510 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 X 20902547 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20902665 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20902748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20902828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20902900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20902928 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20903064 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20903074 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 20903125 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20903181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20903253 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20903410 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 20903829 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20904017 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20904949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20905061 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20905067 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20905287 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20905346 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 20905404 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20905793 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 20905912 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20905937 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20906030 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20906036 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20906189 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 20906248 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 20906302 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20906487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20906934 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20906939 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20906943 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20906944 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20907015 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 20907023 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 20907111 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20907464 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 20907560 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20907578 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20907634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20907747 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20907755 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20907941 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20908017 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20908252 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 20909027 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 X 20910833 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20911265 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20911630 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 20912178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20913106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20913113 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20913126 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20913549 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20914125 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20914198 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 X 20915137 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 20915526 C A N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 X 20917200 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 X 20917202 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 X 20917297 C T Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 X 20917343 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 X 20917364 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 X 20917417 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 X 20917459 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 X 20917632 T A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 X 20917687 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 X 20917694 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 X 20917778 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 X 20917783 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20917861 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 X 20917920 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 X 20918163 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20918397 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20918854 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20919000 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20919054 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20919168 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 X 20919182 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20919206 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20919235 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20919397 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20919398 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20919533 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20919607 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20919610 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 20919614 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 20919673 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20919769 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20919981 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 20920143 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20920215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20920288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20920404 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 20920680 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 20920693 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20920747 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20920833 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 20920953 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 20920961 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 20921201 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 20921596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20921718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20924005 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20924608 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 20924706 A T N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 20925840 T C Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 20926666 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 20928013 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20928700 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 20928991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20931342 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 20931631 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20931632 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20931714 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 X 20934111 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 20934195 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20934282 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 X 20934905 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 20936690 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 X 20936763 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 X 20937026 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 X 20937350 T C N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 X 20938934 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20939046 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 X 20939049 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 X 20939079 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20939511 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 X 20940000 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 X 20940384 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.75 0.0625 0.1875 25 7 12 1 3 X 20940485 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20941017 T A N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 X 20941356 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20941596 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 X 20941887 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20942098 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20942192 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 X 20942302 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 X 20942303 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 X 20942399 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 X 20942429 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 X 20942695 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 X 20942980 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 X 20943348 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20943353 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 X 20944120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20947318 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.8 0.0666666666666667 0.133333333333333 25 5 12 1 2 X 20953639 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 20953763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20953863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20955183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20961721 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 20963186 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20963746 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20971076 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 X 20971658 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 20974839 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 20976616 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 20978105 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20987717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20988316 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 20992582 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20992936 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 20993099 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 20995027 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20995380 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 20996581 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 20997046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21000973 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21001551 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21001569 T G Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 X 21001654 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21001842 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21001857 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 X 21001899 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 X 21001938 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21001985 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 X 21002195 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21002273 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 X 21002601 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21002603 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21002681 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 X 21002720 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 X 21002759 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 X 21002776 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 X 21003238 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21003320 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 X 21003455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21003871 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21004518 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21004583 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21005088 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 21006242 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21006284 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21006515 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21007043 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 21007049 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21007896 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21008209 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 X 21008490 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 X 21008637 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 X 21008706 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 21008820 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 X 21008864 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 X 21008882 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 X 21009080 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21009149 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 X 21011824 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 21012041 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21012164 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 X 21012255 T C Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 X 21013592 T G Y N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 X 21013615 A G Y Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 X 21013678 C T Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 X 21013940 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 21014136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21014140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21014213 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 X 21014215 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21014402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21014409 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21014579 T G Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 21014657 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 21014825 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21014879 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 21015412 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21018921 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21026974 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21027753 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21030951 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21041355 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21041921 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21042269 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 21050387 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 21050802 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21052397 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 21054768 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21056557 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21056874 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21057777 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 X 21058521 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 21059111 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 21060298 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21062459 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21066481 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21066664 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21068823 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 X 21069161 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21070182 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21071531 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21071824 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21072040 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21072164 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 X 21072379 A C N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 X 21072527 A G Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 X 21072649 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 X 21072656 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 X 21072669 C A Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 X 21072694 A C Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 X 21072736 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 X 21072754 A T Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 X 21072756 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 X 21072759 T C Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 X 21072766 A G Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 X 21072834 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 X 21072914 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 X 21072944 T C Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 X 21073108 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21073455 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21074221 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21075230 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21075280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21076174 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21076255 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21077799 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 21082935 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21087377 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21087716 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21092651 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21096503 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21096970 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21097017 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21097725 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21097763 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21097775 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21098408 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21098416 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21098839 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 X 21099312 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 21099344 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 21099799 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21099842 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21100460 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21103234 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21103405 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21103758 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 21107565 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21107649 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21109383 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21113346 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21113375 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21113478 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 21114142 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 21114470 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21117990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21118760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21118819 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21119184 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 X 21120073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21124586 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 21127477 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21127694 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21130345 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21130705 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21134617 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21135312 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 X 21135348 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 X 21138427 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21138767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21146561 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21149320 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21149788 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21154619 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 X 21155019 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 X 21156040 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 X 21157423 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 X 21158826 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21158834 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 X 21159249 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 X 21159346 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 X 21159749 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 X 21160040 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21160753 T C N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 12 12 4 4 4 X 21161247 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21161924 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 X 21162687 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21163176 C A N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 X 21163464 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21166970 T C N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 X 21168729 T G N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 X 21168901 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21173489 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21176029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21176182 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21179124 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21179751 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 21179915 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 21185370 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21187312 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21187653 G A N Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 10 6 4 2 2 X 21188356 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 21188491 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 21188561 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21191761 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 21193953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21195855 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 21204999 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 21205634 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21207738 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21208537 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21209386 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21209505 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21209552 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21211396 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21212289 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21212309 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21220666 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21221490 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21222859 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21225736 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21225737 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21225922 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21227878 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 21230040 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21230791 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21232094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21235773 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 21236665 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21237085 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21237890 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21238222 T G N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 X 21238327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21238377 C G N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 X 21240250 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 21240455 G A Y Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 9 15 3 3 6 X 21240558 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21241408 A G Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 X 21241438 T A Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 X 21241651 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 X 21241722 A T Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 X 21241807 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 X 21242095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21242136 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 X 21242444 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 X 21242838 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 X 21242846 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21242903 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 X 21245547 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21245864 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 21245894 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21246464 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 X 21246847 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21246968 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21251359 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21252620 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21252821 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21253763 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 X 21253802 G T Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 X 21254113 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21256616 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 21256966 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 21260265 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21260569 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 21262144 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21310819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21316949 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 21317183 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21317225 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21317921 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21322083 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21322459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21324458 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21329595 G C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21341673 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21342887 G T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 X 21344336 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21350818 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 21353295 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21354637 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 X 21354801 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 X 21354806 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 X 21354876 G C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 X 21354884 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 X 21356828 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21357561 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21359372 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21359571 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21361778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21362848 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21363300 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 X 21364718 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 X 21364831 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 X 21364882 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 X 21364901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21364914 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 X 21365374 T G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 X 21365694 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 X 21365698 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 X 21365748 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 X 21366070 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 21366103 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 21366271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21366291 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21366710 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 X 21366813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21366923 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 X 21366956 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 X 21367205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21367308 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21367371 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 X 21367372 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 X 21367988 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 X 21368121 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21368633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21368820 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 X 21369603 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21369860 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21370104 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 X 21370538 A C N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 X 21371025 G T N N 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 4 10 0 4 3 X 21371378 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 X 21372461 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 X 21372724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21373104 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21373107 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21373611 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21382985 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 X 21385241 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21386219 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21386442 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21390175 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21390318 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21394762 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21396167 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21397717 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21399610 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21399708 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21403538 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21406602 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21408242 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 21410156 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21410497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21410702 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 X 21413478 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 21413604 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21414195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21419058 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21421784 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21432599 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21432629 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21432660 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21434074 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21434221 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21435533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21436639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21436738 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21437751 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21438066 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21439569 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 21441635 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21441748 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21449003 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 21449004 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21449476 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 21449506 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 21452476 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21454094 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21454657 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21458209 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21458238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21459842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21460984 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21461669 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21462162 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21462587 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21464863 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21465460 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 21465681 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21465684 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21465693 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 21467245 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21475503 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21475809 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21475918 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21475919 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21482984 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21485928 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 21488135 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21495724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21497650 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21500536 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21501598 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 21503260 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21506563 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21509183 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21511341 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21512901 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21518885 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21522523 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21529281 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 21535082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21540187 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21540468 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21540501 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21547389 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21548728 T G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 21551041 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21551989 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21552066 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21552281 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21557156 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21560254 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21561391 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21569630 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21570688 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21570905 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21577063 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 21579393 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21579684 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21580969 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 21581197 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21582682 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 21585862 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21586870 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21597556 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21597864 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21598186 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21609334 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21609335 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 21626715 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 21631540 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21631863 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21634190 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21634619 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21634964 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21636586 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21639483 C A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 X 21642954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21643228 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21649717 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 21654066 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 21656036 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21660238 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 21660407 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 21662658 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21668724 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21668922 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 21670791 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 X 21670829 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21670990 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21671101 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21671161 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21671790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21672141 G C Y N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 X 21672360 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21676260 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21676618 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21677513 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21678791 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 21680216 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 X 21680493 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 21680974 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21681306 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21682205 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21683250 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 21683761 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21684270 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21686354 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21686376 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21686761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21686762 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21689001 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21694402 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 21697866 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21698390 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 21698637 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 21699214 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21700360 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 21700974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21702224 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 21702425 T G N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 21705514 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21714017 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21714584 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21715844 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21716094 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21719028 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21720724 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21723098 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21728482 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21729200 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21730064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21748813 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21750175 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21751371 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21752430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21754558 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21755363 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 21756053 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 21756536 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 21758095 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21758193 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21758770 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21761782 T C N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 X 21761994 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21762702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21763600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21763999 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21764305 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21764354 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21764908 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21765327 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21765817 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21765866 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21766036 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 21766262 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21766598 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21766663 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21766721 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21766884 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21767206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21768028 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21768182 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 21768824 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21769064 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21769908 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21769916 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21772038 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21773031 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21774775 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21774992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21775088 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21776724 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21776862 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21778167 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21779869 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21781919 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21782536 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21782722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21782782 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21783219 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21784877 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21787323 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21787765 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21789405 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 21789532 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21789536 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 21790036 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21790075 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21790912 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21791066 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21791612 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21792081 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 21794192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21795045 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21795377 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21798280 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21801377 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21804975 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21812022 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 21813013 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21814413 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 X 21818040 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21818061 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21818165 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21818223 G A N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 X 21818955 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21818973 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21820779 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 21824764 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21828525 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 21829645 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21832418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21832419 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21833540 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 21836783 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21837705 A C N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 21839516 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 21842155 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21843239 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 21843907 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 21845966 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21846533 G A N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 X 21847076 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21847678 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21849521 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21849880 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21853027 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 21856583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21860034 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21864996 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21865085 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21869229 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21870100 T G N N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 X 21874760 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21875326 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21875722 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21877471 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21881359 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21891796 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21893041 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21895556 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21895862 C T Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 X 21896994 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21898591 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21899222 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21899506 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21899910 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21900006 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21900195 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21900480 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21900906 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21902472 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 X 21902474 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21902905 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21904020 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21905574 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21905605 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21906268 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21907222 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21907441 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21908191 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21908429 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21909217 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 21909433 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21909439 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21909738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21909854 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21910043 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21910443 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21910645 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21910673 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21910714 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21910856 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21911247 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 21912122 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21912241 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21914661 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21921682 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21923004 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21923119 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21923389 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21925653 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 21927000 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21928764 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21931059 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21931069 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21931099 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21933955 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21934875 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21935482 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21935532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21936627 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21938942 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21939006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 21939939 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21940727 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21942790 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 21945409 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 21950377 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 X 21953391 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 21959963 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 22010794 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22028513 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 22028765 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 22034614 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22036702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22053483 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22054634 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22054915 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22062589 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22067750 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22068742 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22068915 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22069207 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 22069953 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22072399 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22072512 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22073021 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22074526 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22087249 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22088559 C G Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 X 22096912 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22097225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22097427 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22097725 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22097932 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22102561 T C Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 X 22104209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22104983 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 22112101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22112446 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 22113932 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22115375 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22118846 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 22120894 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22122678 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 22122719 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 22123726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22124002 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22128603 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22130847 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22132422 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22132725 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22133506 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22133605 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22148745 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 22148820 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 22158268 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22158706 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22158995 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 22159282 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22160131 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22160133 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22160461 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 X 22160750 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 X 22160783 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 X 22160801 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 X 22160809 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 X 22160824 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 X 22160865 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 X 22160896 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 X 22160987 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 X 22161056 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 X 22162071 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 X 22162441 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 X 22166980 G T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 X 22167262 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22169402 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 22171120 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22171167 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 X 22172897 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 22173312 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 22174931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22176107 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 X 22176986 A T N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 22177591 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22178538 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 22178718 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 22179282 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 X 22179368 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22179861 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22181357 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 22182625 C A Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 22183383 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22183624 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22183690 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22185038 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 X 22185265 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22185638 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22186035 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22186359 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22189109 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22195538 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22196040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22196602 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22197055 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22198362 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 22198699 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 22199442 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22199942 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22200340 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22200762 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 22201855 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22202722 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22204594 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22205055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22208826 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22208903 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 X 22208920 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 X 22208948 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 X 22208966 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 X 22209080 G T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 X 22209500 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22209524 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22209736 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22209855 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 22210340 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22210575 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 22210744 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22211097 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 22211187 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 22212223 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22212275 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22212356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22212394 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22213055 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22213290 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 22213292 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22213596 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 22213659 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22213820 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 22214027 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22214742 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22215643 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22216297 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22216409 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 X 22216461 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 X 22217905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22219343 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22219865 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 X 22219903 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 22228080 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22228498 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 22228781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22230745 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 X 22230995 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 X 22231826 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 22232543 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22232757 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22233738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22235397 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22235776 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22236501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22237991 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22238887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22240635 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22242912 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22244671 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22245872 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 X 22247026 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 X 22248372 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 22248483 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 22248948 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22249611 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22249779 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22251855 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 X 22252200 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 22254401 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 22257098 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22257572 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22257850 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 22257865 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 22258277 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 22261086 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22261180 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 22262844 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22264101 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22264102 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 X 22265906 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 22266501 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22266984 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22268624 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22269202 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 22269283 C A Y N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 X 22270260 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22273179 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22274252 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 22274355 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 22275657 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22277063 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22277661 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22277875 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 22278547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22280948 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22281450 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22282456 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22283912 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22285448 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22286013 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22286103 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22286521 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 22287240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22287475 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22288127 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 X 22289028 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 22289499 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22291075 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22291130 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 22291727 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22292513 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22293343 T A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 22294922 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22298066 C G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 X 22300459 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22302129 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22302681 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 X 22303223 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 22303698 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 X 22304060 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22304225 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 X 22304254 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 X 22304366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22304985 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22305002 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22305169 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22306504 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 22309759 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22312291 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22313901 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22314841 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22315571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22315906 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22315941 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 22316039 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22316197 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22316830 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 X 22317387 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22319760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22320156 G T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 X 22320264 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22320295 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 22321924 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 X 22321946 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22322166 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22322565 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 X 22322941 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22322981 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22324385 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22324834 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22325388 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22326019 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 22326400 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22326441 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 22326490 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22326597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22329764 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22333178 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22333854 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22334045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22335500 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22337330 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 22339959 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 X 22340008 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 22340280 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 22341988 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 X 22342371 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22342670 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22346268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22346315 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22346676 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22346781 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22347207 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22347486 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22347628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22347980 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 22350766 T G Y N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 22351388 G T Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 22351574 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 X 22352789 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 22352963 C G Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 22353070 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 22353144 T A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 22355441 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 22356591 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22356890 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 22357557 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22357572 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22359423 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 22361670 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22363793 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22363810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22365552 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22365659 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22366232 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22366259 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 22366465 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22366502 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22366746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22366767 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 22367016 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22367060 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22367214 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 22367541 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22367931 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 22368077 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22368392 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22368419 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22368669 A C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 X 22368678 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 22368732 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 22369463 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 22369502 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 22369504 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 22369628 G A N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 X 22369961 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 22369963 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 X 22370169 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22370473 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22370588 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 X 22370602 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22370616 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 X 22370860 G T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 X 22370878 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 22370921 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 22371186 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 22371208 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 22371214 G A N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 X 22371228 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 22371350 T A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 X 22371422 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22371729 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 X 22371835 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 22371957 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22372274 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 22372448 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 X 22372586 A C Y N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 X 22372588 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 X 22372666 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 22373004 A C Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 22373061 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22373360 A G N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 X 22373398 C A N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 22373500 G C N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 22374798 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 22375393 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 22375401 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 22375515 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 22375572 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 X 22375719 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 22375861 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22376121 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 22376512 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 22376576 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 22376868 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 22376932 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 22377192 C T Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 22377394 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 22377789 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 22378104 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 22378119 T C Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 X 22378601 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 22379013 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 X 22379032 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 X 22379046 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 X 22379049 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 X 22379317 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22379319 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 X 22379321 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 X 22379469 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 X 22379562 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 X 22379572 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22379607 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22379646 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 X 22379682 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 X 22380151 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22380460 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 22380506 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 X 22380617 A C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 X 22380722 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 22380753 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 22380788 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 22380820 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 X 22380831 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 X 22380878 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 X 22380968 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 X 22380974 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22380977 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22381016 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 X 22381169 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 X 22381333 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22381351 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22381419 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22381481 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22381488 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22381539 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 X 22381549 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 X 22381581 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 X 22381741 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22381770 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22381799 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22382083 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 22382093 G C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 X 22382183 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 22382238 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22382717 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22383000 C G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 X 22383041 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22383268 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 22383452 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 22383580 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22383663 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 22383769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22383997 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22384236 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22384243 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 22384260 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22384358 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 22384485 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22384486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22384507 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22384535 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22384618 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22384897 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 X 22384982 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22385113 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22385118 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22385303 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22385506 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22385569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22385578 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22385612 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22385740 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22386254 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 X 22386305 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22386465 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 X 22387007 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22387069 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22387300 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22388029 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22388108 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 22388760 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22390971 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22391179 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22391269 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22392169 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22392534 G T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 22395357 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22396550 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22396945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22398117 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 22398153 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 22398155 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 22398953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22399644 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 22400058 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 22400123 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22400883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22401059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22401565 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22402074 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22403973 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 22403982 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 22405040 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22406405 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22406430 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22406475 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22406681 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22406705 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22406777 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22407141 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 22407211 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22407262 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22407411 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22407464 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 22407951 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22407985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22408052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22408195 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22408264 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22408296 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22408539 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22409004 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22409086 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22409188 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22409296 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22409644 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22410488 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 22410661 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 22410673 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 22410851 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 22411498 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22411829 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22412575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22413920 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 22415281 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 X 22415353 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22416072 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22417507 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 22418035 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22418345 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 X 22421663 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22423069 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22423180 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22423429 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22423970 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 22424834 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 22425205 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 22426833 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22427662 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 22428108 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 22430580 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22432131 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22434885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22434924 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22435179 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22436233 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22436353 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22440316 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22441515 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22441618 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22445935 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22446823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22448371 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22449611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22462421 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22462988 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22464021 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 22467515 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22467909 G C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22468519 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22468539 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22471329 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22475982 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22477490 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 X 22478793 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22480048 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22481006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22482823 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 22482966 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22483176 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22483371 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22485411 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22486217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22487166 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22488187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22488778 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22491155 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22491186 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22491807 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 22492606 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 22493505 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22495540 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 22495634 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22495685 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22495760 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22498788 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22499260 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22499502 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22500076 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22500422 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 X 22501409 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22501417 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22501697 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22504103 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22505764 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22505766 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22507702 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22507816 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22509085 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 22509378 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 22509502 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22511328 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 X 22512367 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22512626 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22513805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22514023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22515892 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 22516777 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22517321 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22518625 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 X 22519579 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 22519855 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22519996 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22520368 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22520638 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22521569 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 22524096 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22524733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22525025 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22525076 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22525506 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22527502 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22530315 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22533748 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 22535005 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22536443 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22536670 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22538080 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22539276 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 X 22540129 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 22541884 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22542729 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22542937 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22543560 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22544195 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22550533 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22552637 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22553971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22554436 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22555046 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 22555210 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22555211 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22557627 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22563727 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 22570909 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22571169 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22571923 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22573810 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22574193 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22575464 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22575876 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22576226 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22576777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22578503 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22582004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22582477 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22582496 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22582724 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22583520 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22585641 G T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 22586142 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22587247 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22588001 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 22588170 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22588705 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22589382 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 22590889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22591734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22592086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22593869 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22595378 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 22596015 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22596930 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22597183 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 22598463 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22599780 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22600657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22601706 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 22602638 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22602662 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22603270 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 22604821 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22605912 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 22606013 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22606014 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22606348 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 22608608 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22608716 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22611017 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22612170 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22612469 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 22612720 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 22613126 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 22613752 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22614120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22614626 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 22615619 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 22616685 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 22616820 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 22617589 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 22617875 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22617909 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22618643 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 22619243 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 22620209 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 22620712 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22621400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22622389 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22623107 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22623657 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22623723 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22623947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22624145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22624296 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22626675 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22627120 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22627715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22628183 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22628229 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22629474 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22629747 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22631123 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22631980 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22632438 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 22632928 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22634992 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22635295 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22635387 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22635426 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22637627 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22638339 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 22638363 C T Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 X 22639133 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22647532 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22649030 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22652023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22652627 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22656022 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22659176 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22663210 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22663262 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22663334 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22664430 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22666171 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22666749 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 X 22666955 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22666958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22667399 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 22667484 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 22668221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22668431 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22668615 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22669413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22670205 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22674347 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22674712 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22675417 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22676323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22676535 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22676536 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22676615 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22677107 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22682071 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22682417 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22686191 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22686333 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 22686404 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 22688331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22688511 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22692951 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22696450 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22698197 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22699010 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22701055 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22701861 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22702415 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 X 22702819 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22702989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22704043 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22706881 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 22707650 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22709943 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22710531 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22711178 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 22711468 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22716366 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22716486 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22716526 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22717427 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 22717511 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22718148 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 22719184 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22727065 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22728996 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22729745 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 22730374 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22730380 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22730404 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22732730 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22732795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22734413 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 22736244 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 22736887 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22737092 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 22737782 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22740080 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22740378 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22740773 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22744560 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 22745402 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22746410 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22746524 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22747716 A T Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 22747717 A C Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 22748397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22750532 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 22751196 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22751564 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22753547 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22754531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22757332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22757642 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22758160 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22759757 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22760300 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 22760411 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22760643 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22761450 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22762720 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 22763130 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22763223 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22764808 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 X 22765045 C A Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 X 22765531 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 22766752 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22766972 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22767134 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22767309 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22767318 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22767399 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22768175 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22769213 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22769662 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22770439 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22771393 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22771422 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22773611 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22774050 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22774903 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22776371 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 22777395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22784923 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 22790569 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22792747 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22793695 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22795067 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 22799791 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22799889 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22803051 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22809936 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22809987 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 X 22810161 G T N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 X 22810212 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 X 22810466 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22810634 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 X 22810636 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22811333 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22811955 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22812001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22813681 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 22814368 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22814921 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 22814948 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 X 22815044 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22815091 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22815190 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22815202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22815260 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22815275 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22815276 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22815945 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22816393 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22816403 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22816604 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 22816698 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22818649 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22818679 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22818729 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22819583 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22820240 T A N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 22820252 G T N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 22820541 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 22820915 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 22824733 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22825461 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22827956 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22828871 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22830038 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 22830308 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22832749 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22835287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22839322 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22843302 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22848397 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22849323 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22858448 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22860154 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22865984 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22867430 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22868045 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22868513 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22869269 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22880517 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22881569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22883456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22883999 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 22884330 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 22888135 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 22888836 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22888955 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22890403 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22890647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22891980 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 22894918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22894939 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 X 22894970 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22895021 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22895151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22895216 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 X 22895234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22895503 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22895728 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 22895733 C T N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.181818181818182 17 5 8 1 2 X 22895804 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 X 22895908 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22895916 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 X 22895923 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 X 22896023 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22896066 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22896220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22896357 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 X 22896378 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22896876 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22896959 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22896961 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22897076 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22897407 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 X 22898360 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 X 22898397 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 X 22898514 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 X 22898584 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22898766 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 X 22899287 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22899475 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22900452 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22900602 C A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 X 22900726 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22900735 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22901097 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22902798 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22903140 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22903648 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 22904857 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 22906184 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22906836 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22910746 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 22911194 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22912241 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22913689 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22913754 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 22913766 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 22915922 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22916531 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 22917509 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 22918701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22919959 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22921175 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22921995 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 22922534 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22922832 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22923995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22924042 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22924068 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22924144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22924153 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22924504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22924579 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22924587 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22924807 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22924916 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 22925635 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22926111 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22926229 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22931222 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 22931574 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 22931995 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 22932720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22932862 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22932972 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 22934524 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22935042 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 22935372 T G N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 X 22935446 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 22935539 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 22935720 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22936119 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22936180 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22936877 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22938212 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 22940065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22941366 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 22942748 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22944196 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22945233 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22952415 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 X 22953231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22954239 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22955244 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22955882 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22956699 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22957389 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22958602 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22958652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22959857 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22962781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22963167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22963999 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22965163 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 22970884 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22971798 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 22974455 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22975020 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22975265 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22975604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22977253 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22978259 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22980906 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22981622 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22987427 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22987617 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22987776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22987840 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22988505 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22989890 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22989941 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22989968 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22991051 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22991052 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22992162 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22992858 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22994055 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22995483 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 22996895 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22997021 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22997040 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22997433 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22997525 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22997546 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 22998037 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22998039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22998059 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22998069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 22998129 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22998209 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22998367 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 22998379 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 22998875 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 22998910 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 23006069 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23007566 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 23011347 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 X 23011538 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23017935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23019614 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23021767 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23021813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23025211 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23025223 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 X 23025532 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 X 23025720 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23025949 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23026356 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 23026454 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 23026826 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23026829 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23028482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23030111 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 23030234 G T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 23030818 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23031542 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 23032615 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 23034041 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 23034661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23034817 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23034884 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23036562 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 23037310 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23043597 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23044105 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 23051864 A G Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 X 23056542 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23056999 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 23062497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23064151 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 23066664 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23067574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23068555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23069351 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23069495 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23069852 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23069873 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23072934 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 23073909 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23076346 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 23076476 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23077039 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 23082909 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23084877 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 23085365 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 23086478 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 23087118 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 23090291 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23092288 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23092565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23095278 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 23096162 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 23096245 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 23097132 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23105347 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23106084 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 23106157 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 23109735 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 23110278 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23111739 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 23111800 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 23119261 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23119732 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23120726 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 23124242 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 23124816 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 23125209 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 23126110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23126530 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23127098 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23127371 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23128896 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23129433 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23131227 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 23132552 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23133412 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23135982 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23138067 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 23138721 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 23140652 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 23146928 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23152651 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23155559 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23156118 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 23156811 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 23159746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23159754 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23159800 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23160738 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23175064 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 23175349 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23176052 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 23177286 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 23177465 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23180051 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 23180212 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 23181203 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 23182136 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 23183509 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23183594 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23184346 G T Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 23184449 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23186987 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 23187946 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23188835 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23190338 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23190397 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23192782 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 23194175 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23194472 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 23195834 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23197852 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 23202880 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23205566 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 23210438 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 23213059 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 23214684 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23216496 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 23219056 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23223144 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23223322 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23224704 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23225153 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23225187 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23226593 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 23226946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23228905 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 23229737 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 23233996 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 23234861 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23237617 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 23242018 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 23248272 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 23248277 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 23252516 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 23253320 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23254082 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23261029 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 23262665 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 23263674 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 23264626 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23265043 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23265057 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23266934 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 23273441 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23273463 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 23274316 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 23274635 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23284835 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 23285825 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 23288432 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23288853 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 23289628 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23292462 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23293893 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 23295031 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 23295254 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23295575 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 23296129 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23296564 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 23301709 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 23307887 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23321367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23324204 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23327669 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 23331978 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23336314 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 23338876 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 23340553 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23345162 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23345500 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 23346861 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 23351141 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 23357816 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 23358232 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 23358675 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 23359117 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 X 23359567 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23360065 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23360180 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 X 23361789 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 23363929 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 23364669 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 23372560 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 23372865 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 23375512 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 23383171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23383655 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 23389943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23395302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23395552 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23396098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23396745 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 23397127 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 23400265 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23404688 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23408159 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23410473 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23411310 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23415634 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23419449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23419668 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23421662 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23436332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23437915 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23439341 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23446977 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 23447354 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23448693 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 23449985 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 23455195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23456645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23459023 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23460744 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23461433 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 23464978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23467961 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23476056 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23478113 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 23492681 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 23493283 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 23494879 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 23495233 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23496411 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23497249 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 23497681 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23500271 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 23501627 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23510541 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 23514957 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 23517850 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23521141 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 23521381 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 23521636 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23522330 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 23522601 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 23523439 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23530280 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23530973 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23531136 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23532102 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23532452 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23532529 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23533328 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23533792 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 23534657 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 23535717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23535897 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23537275 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23539136 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23542272 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 23544201 T A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 23544252 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 23544288 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 23545089 T C Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 23547163 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 23547373 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23549485 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 23559718 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23568565 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23569864 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23570671 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23570857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23572031 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23576591 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23587574 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 23598538 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23601060 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23618670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23621296 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23623550 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23625910 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23626368 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 23627762 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23632228 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 23633162 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23644195 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23644921 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23646572 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 23665498 G C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 23678444 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23683631 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23688021 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23729257 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23739287 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 23751070 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 23751916 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23838606 C T N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 23862973 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 23865523 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 23867845 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 23868895 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23869866 T A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 23881191 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23881205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 23881265 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23886095 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 23896309 C G Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 23900102 G A Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 23915260 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23919067 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 23926812 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 23926813 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 23927783 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 23932301 C G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 23933691 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23939188 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 23963143 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 25848679 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 25858676 T A Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 31115597 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33028746 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33033933 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 33034267 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33052488 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 33075184 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33084141 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 33085294 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33089754 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33091766 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 33093907 C A Y N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 X 33093924 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33093943 A T Y N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 X 33096445 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33102085 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33102170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33104980 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33106679 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33110593 G C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 33122321 A T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 33123914 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33130503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33134896 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33141795 T A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 33143846 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 33143882 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 33148616 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33152496 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33164132 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33164765 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 33176121 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33181146 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33181993 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33186347 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33192852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33193432 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33193835 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33194149 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33194623 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33196962 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33197309 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33197313 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33201337 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33201963 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33238548 G C Y N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 X 33240446 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33245659 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33246737 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33248147 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33257997 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33260103 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 33263555 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33268340 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33283927 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33287093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33287224 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33288777 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33293211 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33295502 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33299963 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33303889 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 33304267 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33314602 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 33318866 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 33326111 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 33329891 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33330356 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33346855 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 33348360 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33349694 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33350592 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33353309 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33355836 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33375891 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 33386740 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33391322 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 33393450 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33393473 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33396988 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 33410993 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 X 33412446 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33412949 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33413010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33413024 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33413673 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33414591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33414699 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33414707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33414958 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33414964 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33415056 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33415214 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33415282 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33415323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33415381 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33415413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33415485 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33415672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33416878 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 33418226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33418313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33420415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33420566 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33421443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33426369 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 33427758 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33429981 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33431594 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33432200 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33432203 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33438422 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33443633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33449358 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33453482 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33453678 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 33464836 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33465362 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33465468 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 33465600 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33466676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33470763 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33470984 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33472555 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33473198 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33474093 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33474146 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33474402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33474646 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33476520 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33477378 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33478213 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 33478293 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33479476 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 33479526 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33480771 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 33484030 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33484230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33484869 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33486441 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33487258 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33487719 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 33487931 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33487966 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33488177 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33488445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33488943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33488953 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33488954 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33489752 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 33490005 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33491139 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33492537 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33494084 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 33495652 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33495869 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33497411 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33501483 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33505742 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 33508993 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 33511116 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33511342 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33515791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33517649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33517742 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33518490 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 33521147 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33521585 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33521839 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33523365 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33524653 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33524739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33524744 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33524803 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33525485 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33526050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33526387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33526648 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33526749 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 33526757 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33526988 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 33527031 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33527098 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33527247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33528457 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33528499 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33528510 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33528625 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33528815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33528872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33528916 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33528919 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33528927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33529128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33529167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33529575 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33530485 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33533018 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33533964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33534773 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33534837 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33535144 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33535145 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33535154 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33535963 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33536353 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33536412 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33536415 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33536422 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33536431 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33536586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33537297 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33537464 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33537952 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33538021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33540438 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 33540467 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33540947 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33541410 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33541777 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33546188 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 33548080 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33548719 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33549081 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33549149 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33549644 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33550148 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 33555596 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33557051 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33558654 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 33559620 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 33562569 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 33564986 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33565224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33569848 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33570835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33572110 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 33572546 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 33572564 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33574155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33576149 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33576903 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 33578501 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33581333 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33583971 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33584806 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33591414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33591671 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33591797 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 33592558 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 33592589 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33592867 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 X 33601409 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 33603781 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33603963 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33603981 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33604731 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 X 33605093 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 33609782 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33612275 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33613112 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33619984 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 33624921 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33625690 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33626344 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 33628956 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33630221 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 33634917 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 33641324 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33642434 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33644991 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 33646620 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 33646633 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33646964 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33651017 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33651836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33654432 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33654535 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33654725 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33655284 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33658010 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33659275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33661887 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33665583 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33666850 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33666851 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33667679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33668678 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33669557 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33670640 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33673251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33673306 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33674708 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33674965 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 33675338 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33676417 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33676840 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33677078 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33677585 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33678886 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33678888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33679117 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33679179 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33680538 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33680902 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33681547 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33682337 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33682405 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33682599 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33682756 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33683233 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33683270 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33683440 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 33683558 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33683562 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33684414 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33685568 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33686091 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33687124 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33687146 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33687217 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33687498 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 33687604 C T N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 33687978 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33688376 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 33688460 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 33688778 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33688906 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33690872 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33692350 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33695264 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33695613 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33695688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33696583 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33697305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33700700 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33701298 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33702502 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33703504 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33704378 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33704486 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33704721 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33704927 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33704962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33704992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33705248 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33705258 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33705587 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 33706254 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 33706498 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33706580 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 33706877 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33707484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33707526 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33708001 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 33708099 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33712512 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33719107 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33719118 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33723540 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33727966 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33728691 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33728878 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33736243 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 33737774 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33738245 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33738670 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33739238 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 33739468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33739876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33744956 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33746901 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 33747685 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33748102 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33748445 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33749281 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33753932 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33754135 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33755028 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 33756310 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 33762853 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33764565 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33764878 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33764916 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33765111 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33765880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33770584 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 33771318 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33772868 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 33773043 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 33773227 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 33775689 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33776205 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33776857 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33777764 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33778662 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33779117 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33779185 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 33779670 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33780796 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33780874 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33781561 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33782812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33784461 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33799141 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33802106 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33802511 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33803130 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33804335 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33804905 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33805775 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33811999 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33812604 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33816014 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33816631 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33818396 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33818402 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33821086 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 33823245 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33824105 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33827928 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 33833610 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33837949 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 33839027 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33841204 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 33841435 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33841669 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 33842975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33843947 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33844085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33844192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33847145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33849935 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 33851174 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33852324 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33853398 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 33855323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33856767 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 33857018 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33859762 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33861538 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 33862475 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33863137 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33863705 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 33864421 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33866835 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 33870888 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33871468 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33873814 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33874458 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33878378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33879014 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 33879073 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 33880465 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33883149 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33883750 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33885346 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33885915 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33886060 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33892712 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 33899202 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33900771 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33901380 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33902566 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 33902770 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33904362 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 33906894 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33907090 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33907313 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33907356 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33908129 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 33908455 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33908469 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 33908719 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33908776 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33909143 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33909269 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33910393 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 33910515 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 33910852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33911488 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33911939 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33912149 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 33912163 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 33912910 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33914622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33914663 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33917798 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33918150 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 33919676 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33922335 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33923927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33924289 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33924394 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33924705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33925092 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33925220 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33926501 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33927992 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33928001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33928200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33928254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33928313 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33928350 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33928875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33929172 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33929322 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 33929706 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33934912 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33935098 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33935408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33935441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33935667 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33936096 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33936103 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33936226 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 33936515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33936550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33936624 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33936696 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33936926 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33937005 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33937122 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33937781 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33939682 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 33940847 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33941997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33942435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33944527 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33945173 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 33945767 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33946881 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 33950359 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 33950544 A C N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 33951072 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33951097 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33954548 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33961973 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33970498 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33973439 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33973490 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33976119 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33976255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33977128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33977994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33978213 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33978335 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33978500 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33978674 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33978794 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 33979514 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33979570 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33989530 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 33990088 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33992983 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 33993238 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 33993406 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 33993453 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 33993509 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 33994111 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 33994858 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 33995993 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 33999780 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34009999 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34010839 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34011160 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 34011672 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34013305 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34014634 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34018548 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34018681 G A Y Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0 0.785714285714286 0.214285714285714 11 17 0 11 3 X 34019554 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34020307 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34023184 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34023512 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34035749 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34037245 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34037340 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34037434 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34037445 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34037495 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34037516 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34037554 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34037557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34037808 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34037813 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 34037829 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 34037967 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34042830 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34043906 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 34047162 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34048545 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34049509 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34049888 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34051743 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34052897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34053241 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 34053487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34053857 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34054794 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34054837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34054891 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 34055123 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34056190 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34056243 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34057527 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34058780 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34058790 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34058819 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34059260 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34059482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34061408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34061776 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34064498 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34065389 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34068418 C G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 34068635 A T Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 34069461 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34069756 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34070096 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34070209 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 34070378 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34070547 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34070572 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34070628 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34070680 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34070681 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34070698 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34070750 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34070764 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34074126 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34074851 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34074882 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34074985 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 34075021 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34075070 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 34075222 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 34075328 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 34075384 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34075387 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34075465 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 34075621 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34075624 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34075650 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34075839 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34075862 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34075879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34075951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34076163 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34076208 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34076222 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34076274 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34076468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34076491 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34076627 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34076668 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34076694 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34076744 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 34076764 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34076834 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34076837 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34076908 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34077011 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 34077224 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34077363 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34077487 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34077591 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34077593 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34077614 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34077962 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34078001 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34078775 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 34078802 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 X 34078819 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34078831 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34078839 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 34078923 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 34079110 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34079214 C A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 34079300 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34080893 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 34080910 C T N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 X 34081035 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 34081057 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34081083 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34081175 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34081225 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34081398 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34081946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34082142 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34087384 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34089070 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 34089153 A T Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 34089764 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34090539 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 34090594 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 34090751 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 34091569 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34095118 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 X 34102538 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 34107884 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34108108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34111119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34111929 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34112573 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34115373 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34117933 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34120697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34120795 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34121886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34122705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34125608 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34127230 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34129795 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34129998 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34130600 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34130660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34130748 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 34131349 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34134363 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 34137455 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 34141763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34142808 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34144060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34144454 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34145764 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34150757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34152433 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34154127 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 34154202 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34154213 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34154384 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34154564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34154579 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34154768 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 34156071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34158212 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 34163944 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34165746 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 34169014 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34170760 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 34174526 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34176000 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34176260 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 34176271 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34176337 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34176346 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34176374 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 34176417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34181301 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34182860 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34183158 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34183608 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34187033 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34187854 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34195172 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34195739 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34195938 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34199364 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34205474 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34205858 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34205883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34206966 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34209192 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34217213 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34217550 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34217551 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34218197 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34219965 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34220121 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 34220222 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34220424 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34220726 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34220727 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34220734 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34220861 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34221357 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 34221937 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34221991 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34222298 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34222556 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34222588 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 34222714 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34223116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34223251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34223404 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34223411 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34224680 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34228565 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34231022 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 34234007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34234086 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34235375 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34236372 G A Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 34237659 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34238603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34238618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34239223 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34239787 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34241578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34241993 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34242504 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 34243066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34243075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34244174 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34247891 T A Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 34250563 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34252165 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34253705 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34255670 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 34255879 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34256760 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34257722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34258028 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34258188 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 34259314 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34260394 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 34261015 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34261286 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34261694 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34263824 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34263913 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34263922 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34263987 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34264320 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34264741 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34265242 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 34265316 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 34265363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34265392 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34265504 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34265529 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34265767 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34265830 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34265840 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34265941 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34265957 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34266180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34266240 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34266277 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34266286 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34266602 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34266892 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34266894 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 34267145 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34268153 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34268179 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34270641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34271336 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34271735 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 34277009 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34278561 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 34278728 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 34279052 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34279483 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34279645 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34281119 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34281475 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34283177 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34283179 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34290852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34294378 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34295890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34297078 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 34297097 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 34301939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34302880 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34303889 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34305309 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 34306313 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34308945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34309394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34309481 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 34310706 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34312033 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34312192 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34312314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34313228 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34313979 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34314657 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34314658 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34314951 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34315453 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34315954 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34316251 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 34316257 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 34316340 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34318278 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34321366 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34321524 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34322993 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34324823 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34327710 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 34331488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34331886 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34333614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34333617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34339694 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34340957 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34345560 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34350261 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34350332 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34351975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34352114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34352630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34352984 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34353219 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 34353719 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34353856 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34354285 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34354485 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34354830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34355590 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34355692 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 34355766 A G Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 X 34355781 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 34360386 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 34361070 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34361173 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34362450 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34363588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34363652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34366277 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34366789 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34368739 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34369066 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 34369173 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 34369312 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 34369349 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 34369356 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 X 34369408 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34369915 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34369992 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34370980 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 34371882 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34373088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34373324 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34373784 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34374973 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34375189 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 34376334 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34377602 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34377662 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34378498 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34379030 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 34382889 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34383308 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34384591 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34384622 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34384789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34385730 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34386074 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 34386110 C T Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 34386301 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 34386918 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 34386936 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 34387632 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 34387769 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 34387806 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 34387810 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 34387860 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 34388027 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 34388416 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34391800 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34391976 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34392172 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34392502 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34392503 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34395710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34397424 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34398747 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34399130 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34399690 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 34399809 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34399896 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34399897 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34400035 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34400484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34400756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34401080 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34401094 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34401245 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34401248 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34401639 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34402248 C T Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 X 34402476 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 34402611 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34402985 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34403046 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34403074 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34404352 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34404409 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34404440 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 34406997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34408007 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34408167 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34410150 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 34410155 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 34410266 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34410312 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 34411337 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34411687 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34411872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34412676 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34412804 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34413581 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34414972 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 34415825 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34416875 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 34417066 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34419033 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 34419034 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 34419039 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34421388 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34430956 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34430991 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34431267 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34434555 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 X 34435116 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34436792 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34436982 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 34441788 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 34443511 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34445811 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34447166 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34456912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34459131 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34459148 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34460505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34460662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34460674 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34460803 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34460975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34461498 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34461619 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 34462064 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34462314 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34462329 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34462403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34464039 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34464188 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34464210 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34464508 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34464572 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34464895 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34465138 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34465286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34465344 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34465503 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34465651 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34465686 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34466157 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34466202 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34466888 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34467573 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34467737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34467738 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34467764 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34467826 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34475729 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 34479198 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34479610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34480273 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34481246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34482801 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34484798 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34485270 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34485308 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34485716 C T Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 34486141 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34486828 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34486965 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34488677 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 34501421 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34501595 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34502687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34504866 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34504878 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 34508779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34508929 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34510312 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34511145 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34511146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34514619 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34518635 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34519425 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34520004 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34520347 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34520619 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34521306 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34522658 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34522921 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34522982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34526197 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34528255 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34532207 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34536722 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34538649 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34539805 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34540323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34540582 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34540599 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34544511 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34548209 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34553346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34556261 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34557732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34562831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34563345 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 34565117 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34566849 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34568448 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34569681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34570807 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34572330 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34580444 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34582411 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 34583469 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 34584820 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34585354 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34585838 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34586804 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34588155 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34588443 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34588947 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34588992 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34589771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34590663 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34591290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34591764 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34592915 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34593393 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34596706 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34597465 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34597857 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34598650 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34598651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34604022 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34607019 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34608460 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34609712 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34610214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34612622 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34613303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34613779 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34615278 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34616021 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34617146 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34617220 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34617469 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 34620967 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34623221 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34625251 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34625347 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34625870 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34627189 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34627206 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34628005 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34629232 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34634756 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34634824 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34636445 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 34636609 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34636621 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34636768 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34637509 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34637984 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34638305 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34640583 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34643524 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34643903 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34644390 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34645662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34648841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34649052 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34651165 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34651290 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34659600 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34660381 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34662562 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34664168 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34666176 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34669052 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34671253 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34671299 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34671588 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34671960 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34672176 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34672495 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34672702 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34673148 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34673171 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34673780 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34674557 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34675317 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34675323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34675439 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34675808 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34675815 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34675818 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34675958 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34676014 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34676355 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 34676424 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 34676787 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34677031 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34677105 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34677815 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34678069 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34678204 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34678948 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34679234 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34679385 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34679662 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34680048 G A Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 34680055 T C Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 34682930 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34685090 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 34685976 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34686484 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34688045 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34688058 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34688322 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34688805 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34689236 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 34689503 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34689763 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 34690631 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34692231 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34695022 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34695224 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34695420 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34697904 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34698423 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34701142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34701479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34701918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34704378 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34708761 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 34710300 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 34718804 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34718921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34722815 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34722856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34725342 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34726109 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34726417 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34728490 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34728694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34730065 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34730800 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 34732857 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34735175 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34736098 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 34737555 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34738097 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34739358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34739768 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34744822 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34745890 T G N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 X 34746133 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 34746483 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34747460 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34748732 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34749313 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34749554 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34751150 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 34751227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34751306 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34751553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34751865 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34752058 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 34754635 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34754644 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34755162 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 34755179 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 X 34755314 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 34755319 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34755484 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 34755689 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34755848 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 34756237 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34756373 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34756439 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 34756704 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 34756738 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34757122 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 X 34757206 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34757564 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34758170 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34758554 A G Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 X 34759426 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34760025 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 34765962 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34769459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34773573 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 34773910 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 34776440 G C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 34987616 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 34988115 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 35004277 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 35004287 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35072316 T G N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 X 35078832 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35086038 C A N N 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 7 9 0 7 1 X 35086660 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 35086778 T G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 35094351 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35096128 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35096706 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35097424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35098235 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35100430 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 35102713 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 35103473 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35103508 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35105925 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35105929 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35106717 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 35106750 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35108060 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35109712 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35112583 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35115105 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35117689 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35168260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35168656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35169522 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35169733 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35169755 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35170526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35171692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35172278 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35172979 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35173274 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35173570 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35174321 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35181091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35181898 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35182512 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 35183138 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35202118 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35202132 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35202361 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 35204261 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35205460 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35205566 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35207155 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35207180 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35207192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35208128 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35208714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35208750 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 35208863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35209126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35210204 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35210422 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35210514 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35211932 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35212396 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35212475 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 35212758 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 35212913 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35213022 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35213236 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35213291 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35213338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35213750 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35214487 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 35214517 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35214910 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35215020 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35215023 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35215072 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35215351 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35215361 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35215368 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35215591 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35215860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35217569 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 35217859 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 35221217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35221235 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35221259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35221268 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35221270 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35223128 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35224133 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35224687 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35224751 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35224883 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35225004 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35225020 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35226708 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35227326 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35228012 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35228163 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35228213 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35228346 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 35228403 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 35230059 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35230976 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35231030 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35252757 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35255995 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35258083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35258410 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 35260873 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35261400 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35262830 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 35269880 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35271832 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35272999 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35275785 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35275807 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35276094 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 X 35277474 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35277581 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 X 35277727 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 X 35277921 C T Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 X 35278102 C G Y N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 X 35279616 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 X 35279879 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35280115 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 X 35280168 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 X 35280207 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35280266 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 X 35280457 G T N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 X 35280991 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35281999 G C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 X 35282479 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 X 35283141 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35283675 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35286129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35286327 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 X 35286432 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 X 35286434 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 X 35286466 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 X 35286499 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 X 35286688 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 X 35286707 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 X 35286912 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 X 35286945 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 X 35291663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35292047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35292881 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35293965 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35293979 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35294221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35297086 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 35297132 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 35297560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35303037 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35303488 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 X 35305374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35305484 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35305541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35305928 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35307436 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35309359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35311314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35311774 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35311973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35312019 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35314198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35314755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35314915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35320282 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35322484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35330605 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35331976 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35334449 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 X 35334955 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35334957 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35335265 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35335410 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 X 35335567 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 X 35335719 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 X 35335795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35335810 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 X 35335960 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35336036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35336420 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35336437 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35337251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35337259 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35337337 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35337343 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35337375 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35337448 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35337476 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35337495 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35337556 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35337572 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35337619 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35337637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35337896 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35337914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35337991 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35338094 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 X 35338120 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35338215 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35338324 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 X 35338557 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35338710 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35338721 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35338818 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35338824 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35338871 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35338876 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35338974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35338976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35339250 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35339262 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35339280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35339340 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35339478 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35339640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35339740 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35339786 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35339798 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35340058 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35340173 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35340439 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35340858 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35341815 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 35342322 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35345221 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35345795 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35345823 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35345993 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35346078 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 X 35346117 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35346165 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35346449 C G Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 X 35346742 A T Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 X 35346838 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35346946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35347517 T A Y N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 X 35347518 C T Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 35347565 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35347646 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35347677 T A Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 X 35347870 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35347873 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35348025 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35348055 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35348064 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35348112 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 X 35348313 A T Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 X 35348383 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35348513 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 X 35348579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35348613 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 X 35348753 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 X 35348758 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35348783 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 X 35349163 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 X 35349175 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35349220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35349549 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 X 35349705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35349727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35349893 G T Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 X 35349915 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 X 35350789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35351195 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 X 35351779 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 X 35351794 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 35352345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35352799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35354168 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 35354473 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 35354614 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 8 4 4 0 2 X 35354711 C A Y N 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 8 4 4 0 2 X 35354884 T G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 35355431 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 X 35355996 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 X 35357066 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35357112 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35357228 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35358072 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35358127 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35359270 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 X 35360948 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35360971 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 35361243 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35362059 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 X 35362449 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 35364145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35366539 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 35366997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35367006 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35367148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35369347 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35369898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35370077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35371245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35371316 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35373607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35373801 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35374104 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 35375995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35379411 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35379969 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35380199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35380229 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35380814 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35380879 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35381677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35385061 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35385202 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35387341 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35388122 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35390289 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 35390908 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 35391145 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 35398173 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35398579 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35398984 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35402919 A G N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 35403917 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35403946 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35404210 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35407395 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35407449 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35407586 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35407615 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35410093 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 35413023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35413396 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35413445 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 35414531 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 35416983 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35431369 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35431884 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35433918 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35433987 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35434062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35437984 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35440856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35441069 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35441085 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35441094 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35441210 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 35441211 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 35441980 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35442758 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 35444631 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35445065 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35445175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35445263 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35445332 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35445372 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35445639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35445640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35445693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35445859 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35446603 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35446717 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35447786 T G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 35448229 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 35448615 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35448804 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 35448858 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35449523 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35449668 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35449698 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35450222 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35450625 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35450735 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 35453590 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 35454604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35455080 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35455685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35455756 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35456061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35456937 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35457055 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35457056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35457307 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35457481 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35457632 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 35457751 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 35458886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35460288 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35460958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35461226 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35462755 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 35464519 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35465596 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35466290 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35466498 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35466536 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35466759 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35467319 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 35467563 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35467662 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35468330 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 35469962 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35474034 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 35474669 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35476451 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35476597 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35476623 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35477026 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35477416 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35478646 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 35478879 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 35478994 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35481030 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 35481273 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35482471 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35485015 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 35485319 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 35485962 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35486626 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 35487051 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 35488348 T C N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 X 35490277 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 35490392 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35490540 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35490810 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35491761 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 35492399 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35492719 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35492770 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35493382 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35494057 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35494478 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35494538 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35494595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35494601 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35494681 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35495254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35495391 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35496522 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35497386 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35497878 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35498030 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35498031 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35498087 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35498192 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35498267 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 35498381 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35498463 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35498561 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35498661 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35498662 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35498786 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35498801 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35498817 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35498833 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35498869 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35498923 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35499101 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35499119 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35499267 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35499297 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35499452 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35499493 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35499552 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35499583 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35499680 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 35499694 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 35499947 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 35500325 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 35500570 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 35500992 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 35501004 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 35501163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35501428 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 35501516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35502058 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35502302 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 35502869 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 35502870 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 35502970 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 35503032 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35503107 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 35504013 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 35504018 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 35504104 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 35504606 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35504959 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35505229 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 35505689 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35505892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35506024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35506029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35506084 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35506085 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35506372 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35506423 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35506657 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35506686 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35506809 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35507089 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35507112 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35507117 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35507146 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35507215 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35507235 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35507243 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35507438 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 35507455 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 35507509 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 35507679 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 35507991 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 35508109 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 35508265 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35508275 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 35508276 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 35508328 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35508591 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35508687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35509398 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35509743 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35510387 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35510436 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35510655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35511781 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35512550 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 35512573 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35512656 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 35512657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35512755 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 35512893 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 35513086 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35513403 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35513404 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35513420 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 35513585 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 35513679 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 35513681 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 35513691 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 35513977 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 35514366 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35515527 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35515676 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35516184 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 X 35516253 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 35516261 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 35516480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35516688 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 35517674 A C Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 35518900 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 35518955 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 35519159 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 35519169 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 35519205 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 35519240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35519314 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 35519443 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35519463 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35519506 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 35519635 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35519672 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35519786 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35519895 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35519981 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35520041 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 X 35520093 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35520198 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 35520506 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 35521044 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 X 35521260 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35521501 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35523746 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35524861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35530625 C G Y N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 X 35531518 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35531574 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35531908 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35532127 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35532130 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35532146 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35532503 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35532582 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 35532583 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 35532597 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35532655 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35532778 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 35533041 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 35533148 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 35533149 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 35533851 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35533873 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35535840 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 35536091 T A N N 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0 0.75 0.25 3 5 0 3 1 X 35537527 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 35538375 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35539099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35539726 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 35550013 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35550557 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 35551448 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35551550 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35553798 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35555054 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35559860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35562572 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35566539 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 35566629 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 35567773 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35569629 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35572342 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35572439 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35572451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35573850 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 35576551 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35578766 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35579110 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35579124 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35579141 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35579190 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35581776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35581794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35582515 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35582940 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35583723 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35587403 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35588639 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 35589011 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35589369 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35592711 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35592873 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 35592986 A G N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 35593049 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 35593115 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 35593241 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 35593701 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35593745 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35593805 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35594368 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35594369 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 35594785 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35594829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35594939 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35594983 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35595006 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35595051 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35595187 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 35595545 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35595559 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35595742 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 35595866 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 35596457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35596805 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35597175 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35597178 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35597208 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35597450 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 35598691 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35601393 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 35601425 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 35603784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35606238 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35606651 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35610482 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35610556 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35613464 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 35618214 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35620412 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 35621712 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35622885 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35623304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35623382 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 35626328 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35629164 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35632968 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 X 35634491 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35634563 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35636623 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35637200 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35639799 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35643565 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35647415 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35648516 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35657743 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35658421 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35661693 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35663167 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35664049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35664165 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35666197 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35666258 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35666486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35666982 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35673222 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35673490 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35673777 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35679909 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35680084 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35685515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35686833 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35688678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35688798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35691936 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35693064 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35694742 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35695080 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35695243 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 35696150 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35702690 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35703999 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35705604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35705673 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35707811 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35708508 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35709221 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35710764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35711682 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 35714259 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35722951 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35724788 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35726642 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35729534 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 35729912 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35730702 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35731515 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 35731900 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35734335 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 35734541 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35734890 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35737191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35737641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35743479 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35744377 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 35745812 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35747464 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 35748046 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35748197 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35748640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35749619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35751171 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35751219 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35751397 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35753050 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35753721 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35754008 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35755515 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35760609 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35762717 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35762835 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35762980 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35768401 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35769576 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35778744 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35780375 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35782512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35783694 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35784972 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35785580 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 35788301 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 35788960 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 35789100 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35789223 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35789335 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35790089 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35792494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35793973 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35794104 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 35794105 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 35794707 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35796035 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35796892 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35799850 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 35799851 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 35801071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35802036 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 35802227 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35803538 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35803629 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35806070 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35807016 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 35809331 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 35810825 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 35811891 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35812281 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35814097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35815101 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35815255 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35815722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35819146 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35819277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35821182 A G N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 35822034 T G N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 35824726 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35826176 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35826953 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35826994 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35827264 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35829333 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35829897 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 35830974 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35833258 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35833348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35833729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35834147 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35834279 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35846681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35852729 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35855759 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 35856530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35859732 C A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 35860075 C T N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 X 35860247 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35861265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35861908 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 35862204 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 35863701 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35864822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35866157 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35868521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35868572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35868726 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35869300 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35878660 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35878675 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 35880595 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35884960 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 35907377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35910545 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 35913842 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35917998 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 35929239 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35929319 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35930379 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35942784 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35958229 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 35966595 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 35967321 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 35967395 T A Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 35967398 A G Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 35967403 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 35967415 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 35968862 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35968893 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35973740 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 35974259 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35977097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35977111 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35978894 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35982282 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35983103 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35986032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35986667 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35990025 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35990585 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35992019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35993386 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 35995180 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35995425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35995613 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35996581 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35996611 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35998239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35998312 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35998560 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35998838 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 35999416 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35999487 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 35999556 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36001221 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36001400 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36004250 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 36004390 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 36004586 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 36004597 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 X 36004606 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 36004615 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 36004767 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36004871 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36005024 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36005823 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36005909 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36006020 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36006040 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 36006051 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 36006711 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36008571 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36009075 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36009291 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36009547 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 X 36010635 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36012971 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36014477 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36014561 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36014588 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36014764 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36024107 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36027010 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36028186 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 36028763 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 36032408 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 36033379 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36034826 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 36035020 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 36035140 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36036019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36036037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36036080 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36036518 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36036598 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36036670 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 36037291 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 36037377 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36037867 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36039597 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36041215 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36042440 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36043303 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36044248 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 36044259 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 36044502 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36044683 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36047393 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 36047445 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36047723 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36047746 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36048028 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36048239 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36048261 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36048283 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36048666 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 36049130 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36053064 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36053804 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 36054760 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36055030 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36056924 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36057746 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36057858 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36058599 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36060051 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36062849 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 36063662 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36064519 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36064562 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36064916 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36073936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36074010 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36074090 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36075130 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36076658 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36077221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36077337 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36077673 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36079261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36079511 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36079766 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36081121 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36081680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36081775 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36085493 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36085742 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36086780 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36087210 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36088806 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36088851 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36089463 C T Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 36090740 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36092404 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36093413 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36093820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36095402 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36100106 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36100475 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36100634 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36100714 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 36101335 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 36101476 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36102626 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 36103090 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36103413 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 36103875 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 36104363 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36104476 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36105755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36106079 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36111833 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36111858 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36112071 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36116291 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36116929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36123370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36124910 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36125188 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36126428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36127020 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36128794 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 36129321 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36129371 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36130351 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36130769 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 36131372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36132475 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36135011 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36135631 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36136518 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36136976 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 36144263 G T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 36144283 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 36145809 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36148327 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 36148460 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 36148461 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 36148634 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36149864 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 36150041 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36153027 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 36154021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36154660 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36154861 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36156372 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36161736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36164102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36165846 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36166588 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 36168448 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36168795 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36168919 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36168937 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36169593 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36171743 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36174812 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36174991 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36178170 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36179017 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36181312 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36181630 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36182618 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36183375 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36184769 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36185608 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36191292 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36201879 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36202044 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36210244 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 36210888 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36212122 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 36213163 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36214290 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36215266 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 36215290 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 36215647 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36216767 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36217031 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36218220 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36219441 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36221239 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36221362 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36224601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36227971 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 36228158 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36229072 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 36229368 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 36240541 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36245092 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36250808 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36256189 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36256311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36256504 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36257635 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 36261191 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36261455 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 36263445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36264171 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36265589 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36268729 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 36277893 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36278623 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36279668 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36280525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36281181 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36282050 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36282493 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36282833 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36283514 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 36283577 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36284710 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 36284830 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36285168 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 36286197 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36286497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36287921 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36289021 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36289501 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 36290267 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36290399 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 36290543 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 36290991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36292003 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36292050 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 36293979 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36294771 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36302599 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36304536 G A N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 36304676 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 36305388 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 36305927 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36307593 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36310531 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36310798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36312935 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 36313074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36313302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36313679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36313993 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36314307 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36314447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36316355 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36318488 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36318681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36319459 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36320022 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 36321016 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 36322346 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 36324049 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36327692 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36334907 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 36340880 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36341006 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36344051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36344150 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36344932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36349574 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 36356243 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36356786 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36361185 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36363563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36365271 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36365686 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36366659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36369408 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36371666 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36377070 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 36377364 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 36379231 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 36383466 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36384331 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 36386364 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36391729 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36391971 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 36392003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36396936 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 36410221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36410748 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36417320 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36417695 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36419797 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36429195 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 36429805 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36430945 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36432531 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 36434005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36435338 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 36436494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36440245 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 36440246 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 36440622 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 36445954 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 36446863 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36447935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36448870 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36454140 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36454631 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36454990 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 36455167 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36455893 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36456220 T G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 36456424 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36456916 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36457620 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36457763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36459935 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36460698 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36461024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36462229 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36462320 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36462805 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36462983 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 36463406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36463537 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36465120 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36465974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36467078 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36467377 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 36468700 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36469801 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36470087 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 36470967 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 36471517 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36471634 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36472407 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36475414 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 36476902 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36497775 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36497782 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 36497987 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36498029 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36504009 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36504776 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 36505961 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36506867 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36509456 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 36516304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36518373 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 36518561 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 36522474 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 X 36522929 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36526517 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 36529797 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36536341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36536370 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36536798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36537038 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36538016 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36543239 C A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 36545301 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36549012 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 36557896 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 36565360 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 36568032 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36569460 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36569851 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36580105 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 36580520 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36580888 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36583033 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36585773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36594089 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 36594660 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36597772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36599393 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36600014 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36600885 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36600892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36601251 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 36602686 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36603430 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36604153 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 36604618 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36604688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36608839 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36611394 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36617244 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36617457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36618201 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36623546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36623721 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36626036 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36626821 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36626971 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36626999 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36627194 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36627721 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36627773 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 36628111 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36632159 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36635962 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36644226 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36644342 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36645969 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 36647680 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 36647972 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 36649302 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36649697 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36655227 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 36656314 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 36656757 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36657166 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36657859 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36660336 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36661556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36663344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36664575 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36665320 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36667289 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36668020 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 36668966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36671113 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 36671516 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36672703 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36674866 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36676379 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36678057 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36680149 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 36681050 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36681173 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36681799 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 36681800 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 36683007 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36683653 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 36694646 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36696946 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 36699334 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36700681 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36700684 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36700815 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 36701630 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36702991 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 36704107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36704274 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 36705077 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 36706665 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 36707842 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36708221 G C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 36708240 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 36713153 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36724903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36725350 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 36725961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36726105 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 X 36727231 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 36727582 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 36728695 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36728976 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 36729066 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36731798 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36733303 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36740837 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36742159 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36743728 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 36743825 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 36745463 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36752882 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36755827 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 36762295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36762303 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36763464 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 36763989 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36764124 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36767103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36767909 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36767966 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36770967 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36771023 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36773946 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36774993 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36775379 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36776798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36779788 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 X 36780858 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 36781881 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36783785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36783864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36788308 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36788890 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36790119 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36790540 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36799724 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36802393 G A Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 X 36803309 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36806168 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 36806876 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36807399 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36809427 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36811029 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36811163 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36811805 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36813716 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36816004 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36819132 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36821128 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 36821722 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 36824987 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 36827881 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36829567 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 36830145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36831922 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 36832040 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36832939 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 36835585 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36836313 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 36836582 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36837457 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36838283 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36838814 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36841430 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36841727 C T N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 36841868 T G N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 36842909 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 36854548 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36856896 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36857070 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 36861351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36862803 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 36863407 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36864820 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36865118 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36865669 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36866003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36868276 T C N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 36868439 T A Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 36868826 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36868851 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36870418 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 36870530 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36870576 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 36872526 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 36876404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36883330 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 36884871 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36885108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36886776 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36886876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36887778 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36888272 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36890413 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36890660 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36892066 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36892194 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36894195 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36901243 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 36901762 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 36901950 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 36902459 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 36905658 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 36906247 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 36907346 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 36907389 C G N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 36907948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36908653 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36912129 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36913440 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36914200 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36914940 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 36915412 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36916803 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36917896 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 36917998 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36921079 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36921606 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36921797 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36921881 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 36922424 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36922593 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36923770 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 36925405 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36926679 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 X 36928239 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36928272 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36928881 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36928910 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36929570 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 36930387 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36934462 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 36935398 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 36935426 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 36936159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36937626 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36938363 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 36940950 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36941716 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36941911 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36942040 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36942173 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36942195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36942668 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 36944624 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36955613 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36957223 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 36957968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36958114 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36958195 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36959211 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 36960082 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36960568 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 36961907 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 36963250 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36966905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36967123 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 36968100 C G Y N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 36968507 G A Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 X 36969272 C A Y N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 X 36969699 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 36969849 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36970081 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36970741 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 X 36970747 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 X 36972902 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36973623 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36974005 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36974625 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 36976115 A C Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 36976486 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36976776 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36976924 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 36977317 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36977548 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36977697 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36978738 T A Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 36979789 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 36979907 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36980150 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 36983710 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 36983740 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36983764 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36984806 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36986199 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 36987159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36987676 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36988094 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36988586 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36988968 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36989142 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36990155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36990324 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36991092 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36991703 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36992103 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36992790 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36993076 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36993178 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 36993843 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 36994701 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36994895 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36995379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 36996883 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 36998291 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 37001346 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 X 37001744 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 37001996 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37003317 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37005382 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37006492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37007543 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37008070 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37008971 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37009128 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37013892 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37022133 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37023071 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 37023921 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37024751 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37025878 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37026944 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37026982 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 37027025 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37029498 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37029966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37030191 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37030369 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37030709 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37030963 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37031988 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 37032199 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 37034751 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37034820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37034892 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37034946 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 37035255 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37040196 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37040469 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37042908 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37044823 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37045468 G C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 37050888 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 37051401 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 37052575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37055319 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37055692 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37055788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37055980 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37055997 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 X 37056049 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37056730 T C Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 X 37057411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37057467 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37057799 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37058520 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37062599 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 X 37062721 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 37063079 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37063832 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37064002 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37064003 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37064319 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37064420 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37064454 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37065959 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37067069 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37067579 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37068205 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37068898 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 37069341 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37070745 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37071168 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37072199 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37072634 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37073990 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 X 37074745 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37076160 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 37078083 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37079330 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37080075 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37080262 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37080373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37082182 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 37083387 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37084422 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37084517 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37084635 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37088032 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37088047 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37088177 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 37089325 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37089624 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 37090780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37091511 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37091863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37093197 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37095380 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 37095802 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37095998 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37099715 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37099724 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37107129 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37107342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37110186 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37112725 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37113711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37114752 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37114998 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37120228 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37120539 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37121532 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37121866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37122246 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37122376 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37122488 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37122756 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37125375 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37125556 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37130906 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37131437 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37132895 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37134401 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37136089 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37136674 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37136812 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37139127 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37139422 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 37139839 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37140214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37140490 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37141799 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37141881 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37143291 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37143691 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 37144132 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 37144133 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 37144339 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37144388 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37144807 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37145126 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37145260 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37145427 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 37147170 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 37147662 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37147895 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37149036 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37149078 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37150965 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37153477 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37153714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37154025 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37154376 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 37154504 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37154554 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37156635 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 37166025 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37167538 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 37170170 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37170292 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37171495 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 X 37171917 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37173888 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37174447 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 37174726 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37175884 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37176292 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37177194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37178964 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 37182299 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37185316 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37185728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37186903 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37188581 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37193235 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37194686 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37200043 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37201144 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37205352 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37205477 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37207203 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37207748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37213809 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37213816 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37214633 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37216034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37216196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37216505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37217783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37221372 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37221902 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37225167 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 37227808 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37231293 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37233401 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37233763 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37235421 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37237102 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37237144 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37237437 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37239369 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37240029 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37241861 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 37241929 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 37243896 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37246034 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 X 37247381 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37248753 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37249604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37249687 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 37254620 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 37261086 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37261589 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37263198 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37264422 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37267972 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37268208 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 37268971 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37271437 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 37273921 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 37274570 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37276667 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37278516 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 37279673 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 37279939 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 37280293 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37284343 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 37285198 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37285280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37285484 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 37285635 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 37286378 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 37286466 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37286577 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37286578 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37293490 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37293491 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37297645 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 37300081 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37301085 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37302293 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37302478 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37302993 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37303194 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 37303722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37303831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37304232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37304288 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37305348 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37309771 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37313332 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37316654 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37318039 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37318041 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37319288 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37320425 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37320684 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37320691 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37321024 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37321193 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37321555 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37321566 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37322267 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 37325442 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37329030 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37331374 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37340472 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 37340651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37342752 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37347012 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37349799 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37354072 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37356398 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37358585 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37359426 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37359495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37360228 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 37361914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37363126 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37363691 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37363699 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 X 37366098 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 37366277 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37366352 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 X 37366602 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37366637 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37367078 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37368926 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37374169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37374687 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 37376834 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37378780 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37381443 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 37382125 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 37383279 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37384685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37389034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37389068 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37390849 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 X 37391486 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37395833 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37396232 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37396466 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 37399380 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 X 37399387 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37401771 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 37402206 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37403691 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 37404441 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 37406122 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 37406516 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 37406604 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 X 37407827 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 37408091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37408284 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37409000 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 37410991 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37411712 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37412157 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37415158 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37416564 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37417300 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 37421889 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37428793 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37430260 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 37430733 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 37430884 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37434463 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 37441900 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37449506 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 37449874 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 37454470 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37455347 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37455885 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37457155 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37459020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37475616 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37475909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37475947 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37477307 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37483610 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37485604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37487475 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37491349 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37494604 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37496016 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 37496515 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37497059 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 37498942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37502000 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37502682 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37505200 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37506210 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37507009 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37508428 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37510354 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 37514679 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37515233 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37515324 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37515337 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37516289 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37521162 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37524975 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37525631 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37527142 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37527937 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37527977 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 37528011 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37529501 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37532739 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37542380 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37545047 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37545192 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37545266 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 37545739 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 37547702 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37548023 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37548036 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37549134 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37550468 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37551845 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37553989 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 37556488 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37563166 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37566129 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 37567445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37573711 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 37575319 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37575729 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37576377 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37580877 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37583484 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37586956 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37587032 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37588738 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37591929 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37592625 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 37593553 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37602213 G T N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 37603133 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37604386 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37606252 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 37608259 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37609273 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37610821 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37615713 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37616137 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37616484 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37616677 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37617522 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37618240 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37619391 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37619478 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37619899 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37620717 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 37621563 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 37621659 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37622331 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37622460 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37623770 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37625348 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 37627229 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 37627475 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37627918 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37629053 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 37630046 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37630131 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37630222 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37630496 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37632578 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 37632882 G T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 37634594 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37641096 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 37646557 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37647129 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 37648831 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 37649053 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37650430 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 37651091 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37652759 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37655348 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37655936 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 37656142 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 37665453 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37667577 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37669006 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37670112 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37670439 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 37671900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37672051 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37672127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37673233 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37675424 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37676194 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37676259 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37676925 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37678161 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37679811 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 37679950 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37681835 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37682657 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 37684490 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37685006 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37685408 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37685501 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37686280 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37686443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37687411 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37687450 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 37687669 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37688564 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37689438 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37689788 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37691245 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37695118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37696210 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37696729 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37698739 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37699164 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37699232 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37699542 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37700667 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 37702112 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 37704049 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37706046 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37708209 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 37727063 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37727122 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37727375 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37727632 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37729464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37731969 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 37733415 G T Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 37737353 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37738123 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37739539 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37740481 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37741473 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 37745959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37746299 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37746675 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37747807 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37749506 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37749861 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37753655 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37756831 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37756912 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37757212 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37757405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37757761 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37759645 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37760425 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37761640 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37762333 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37763128 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37764692 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37765268 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 37766946 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 37767706 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37767820 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37769779 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37771987 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37772238 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37779542 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37780805 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37781359 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37784029 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 37784137 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 37791538 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37792313 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37794708 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37798091 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37800257 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37800446 A G N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 37802947 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 37803389 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 37803736 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37804266 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 37806578 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 37809076 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37812049 C A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 37813326 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 37815281 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37821138 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 37821458 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37823535 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37826080 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37826089 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37827061 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37827316 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37827894 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37828933 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 37838053 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 37839910 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37844575 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37845613 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37846567 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37848524 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37851988 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37853074 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 37854460 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37854478 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37854528 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37857401 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 37857538 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 37859201 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37860057 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37860560 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37860644 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37862955 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37863232 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37863909 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37866162 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37867595 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37867686 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37868138 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 37870019 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 37871680 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37871696 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 37872236 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37873684 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37873939 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 37874047 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 37875340 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 37877091 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37877110 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 37878401 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 37878470 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 37879138 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37879244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37879845 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37879871 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37881850 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37881889 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37882218 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37884648 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 37885133 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37885271 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37886788 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 37889183 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37889625 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37889898 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37893962 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37894561 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37897532 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37897786 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37897801 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37899140 C G Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 37899608 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37900256 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37901661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37902232 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37903745 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37903778 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37903978 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37906111 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37908865 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37909270 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 37909348 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37909500 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37915189 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37916583 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 37916631 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 37917218 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37917983 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 37918455 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37919187 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37919199 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37920910 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37923932 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37924336 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37926065 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37926869 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37927248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37927524 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37928498 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37929629 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 37931061 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 37933464 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37933597 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37934519 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 37934985 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37935285 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 37936123 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37936599 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 37939029 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37939249 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37940498 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37941540 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37942203 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 37942254 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 37942280 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 37946211 A C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 37946237 C G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 37946630 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37948082 C G Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 37948886 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37948911 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37949580 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37950360 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37951502 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37951572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37952764 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 37953978 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37955124 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37955653 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37956289 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37959136 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37960620 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 37960798 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 37963204 C A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 37963621 A T N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 37964436 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37964470 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37965092 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37967933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37968130 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 37968977 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37969559 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 37969604 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 37970250 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 37970999 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37973375 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37976158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37976706 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 37977140 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37977240 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 37979359 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37981308 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37981737 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37982838 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 37985047 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37985096 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 37985202 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 37994978 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 37995060 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37997185 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 37997852 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 37999051 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 37999396 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 37999840 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38000554 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 38000657 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 38000736 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 38000998 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 38001704 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 38001729 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 38001766 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 38003224 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38003561 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38004369 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38005420 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38005711 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38006954 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38007201 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38007306 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 38008192 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 38011652 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38011929 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38012582 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38013748 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38014747 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38017113 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38017177 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38020002 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 38020241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38021248 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38021466 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38021663 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38022210 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38025424 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38029311 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38029999 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38030265 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 38031272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38031820 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38032249 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38039026 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38041630 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38041788 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38045891 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38051037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38054087 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38055501 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38056897 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 38057585 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 38058151 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38058392 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38060599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38061040 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 38061465 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38062399 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38063866 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38068178 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38068615 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 38070821 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 38073969 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38075346 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38076674 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38077104 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38077382 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38077776 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 38078328 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 38078881 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38083407 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 38084057 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 38085293 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38087697 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 38089753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38093585 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38093703 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38099363 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38103387 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38109424 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38110653 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38111435 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38111482 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38120807 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 38122686 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 38123154 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38124532 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38125217 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38127539 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 38133947 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38135414 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38136333 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38139773 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38141070 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38145796 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 38145800 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38147378 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38147513 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 38149177 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38150459 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38151447 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 38155678 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38155882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38157074 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38157365 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38159424 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38162851 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38163381 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38164748 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38165481 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38167590 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38171395 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38171492 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38171853 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38176568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38178314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38178935 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 38179116 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 38198182 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38198530 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38198825 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38201454 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 38203094 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38205517 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 38208946 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38210893 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38213605 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 38214319 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38215816 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38216220 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38216380 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 38217463 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38217523 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38225460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38226825 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 38230119 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38231400 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 38232152 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38234513 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38239699 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38241270 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 38244184 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38253836 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38254666 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38255611 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 38260504 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38260981 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38266440 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38267404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38267557 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38269649 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38272055 G A N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 38272574 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38273222 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38273790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38274749 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38281867 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38282808 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38282892 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 38283043 A T Y N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 X 38284774 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38289740 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38290091 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38290898 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38292397 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 38292398 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38293381 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38296303 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38296681 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38296812 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 38299736 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38309229 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38309410 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38311785 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38312488 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38312720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38313781 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 38316497 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38317014 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38317817 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38317928 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38318479 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38320569 A T Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 38323264 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 38323736 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38326166 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38326573 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 38327482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38331658 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38332707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38332796 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38332847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38334179 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38334832 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38340149 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38341197 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38342298 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 38345701 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38354214 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38355371 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 38356872 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 38357102 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38358995 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38359865 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 38361348 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38362150 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38362439 G A Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 38362853 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38363195 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 38366128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38367076 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38369501 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 38371010 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 38374497 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38376241 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38377048 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38379144 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 38380403 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38381260 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38381401 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 38382164 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38384362 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38385382 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38388921 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38391261 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38391413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38391742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38395686 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 38396667 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38399835 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38404078 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38404738 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38404751 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 38408737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38409480 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38410559 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38411798 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38413482 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38415102 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38415256 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38416819 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 38418103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38418327 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38418463 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38420566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38420803 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38420922 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38421666 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38421749 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38422254 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38422296 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38422637 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38422933 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38423432 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38424027 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38427707 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38427709 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38429137 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 38431923 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38434860 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38435912 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38443048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38444405 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38445004 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38445289 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38447397 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 38454318 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38454464 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38455985 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38458310 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 38459676 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 38459789 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 38460292 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 38462444 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38462977 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38463146 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38464551 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38464689 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38464977 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38468009 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38472238 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38474952 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38475063 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 38478012 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38479126 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38479450 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 38479945 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 38480045 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38483487 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38483744 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38485656 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 38485666 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 38485847 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38489774 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38491175 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 38492083 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38495720 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38495764 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38496357 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38496683 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38498200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38499766 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38501433 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38501654 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 38502940 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 38503404 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 38505137 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38505197 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38505593 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38507944 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38508637 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38510393 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38511149 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38511412 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38512384 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38513525 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38515171 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38515901 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38517111 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 38518121 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38519020 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38519724 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38520049 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38521192 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38521672 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38521807 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38522180 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38522461 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38522528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38524774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38525644 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38525955 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38526194 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 38534500 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 38536029 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 38543905 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38548320 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38549635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38552509 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38552557 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38553918 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38553985 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38554041 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38554362 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38556228 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38558174 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38558501 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38558833 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38562719 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 38563116 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38563235 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38563741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38564947 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 38566062 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38567562 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38569667 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38572056 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38572530 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38572603 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38573022 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38573483 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38576371 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38577245 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38578846 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 38579905 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 38580926 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38582828 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38583326 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38583975 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38591769 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38592218 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38592933 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38593301 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38593555 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 38594509 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38595392 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38596147 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38596639 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38596859 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38598315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38601937 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 38604028 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38606790 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38608170 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38608888 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 38609002 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 38609991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38615253 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38618084 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38620207 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38621556 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38624557 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38625407 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38627040 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38628158 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38628384 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38630491 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38635115 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38635138 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38635495 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38639724 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38640186 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 38640872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38641509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38642914 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38643485 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38645249 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38645768 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 38645956 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38646401 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38647271 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38647543 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38649037 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38649349 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 38654773 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 38656014 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38656694 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 38656745 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 38656948 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38667990 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38669869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38670500 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38671344 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38671368 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38671522 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38674836 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 38675128 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 38680200 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38681724 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38683711 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38683963 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38684999 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38688668 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 38689362 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38689921 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38691099 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38697519 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38697956 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 38704652 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38704761 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38704961 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38706273 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38707730 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38708144 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 38708481 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 38709888 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38710656 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38711579 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38716792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38718200 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38719040 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38719298 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38720088 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38720989 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38721722 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38721869 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 38722070 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38722169 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 38725985 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 38727886 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38728044 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38728536 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38732865 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38734017 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38734261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38735118 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38737861 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38743390 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 38744617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38745337 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 38746627 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38746761 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38748062 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 38748430 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38749106 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38756989 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38759072 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38768862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38769022 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38769434 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38769485 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38769534 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38771260 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38772444 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 38774100 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38775237 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38776017 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38776273 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38780217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38780554 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38781529 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38781644 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38783429 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38783619 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 38783728 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38785269 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 38790406 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38791883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38794376 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38800916 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38801494 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38801561 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38802915 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38806450 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38807388 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38807934 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38816151 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38816843 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38817260 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38820696 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38826187 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 38830522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38833283 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38835247 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38835357 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38844337 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38844890 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 38846114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38846416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38848666 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38853047 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38857023 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38857233 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38858085 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38860543 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38862347 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38865083 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38865259 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38866147 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38866986 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38869017 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38870038 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38875914 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38876634 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38877473 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38877795 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38879434 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38879798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38880143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38880162 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38885658 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38886415 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 38889510 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38889970 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38891597 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38894144 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 38894583 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38895223 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 38895496 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38896573 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38896624 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 38899446 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38901369 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38903561 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38904534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38904671 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 38909652 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38910595 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38912611 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38915277 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 38915569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38917106 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38917223 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38918545 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38922401 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38922492 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38922761 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38923532 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38923556 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38923793 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38924920 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38925150 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38925462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38925701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38928026 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38929383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38930029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38930605 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38931607 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38934549 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38938736 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38939053 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 38939494 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 38940250 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38942223 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 38942759 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 38942789 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 38944875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38945912 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38946969 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38947440 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38948629 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38953579 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38954256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38954331 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38954985 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 38955229 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 38956407 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38958426 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38959241 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38959557 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38960071 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38961938 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 38965281 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38967355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38968227 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38970687 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 38972840 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38982790 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38983865 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38986365 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38989555 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 38989674 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 38999795 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39005432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39010372 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39014090 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 39014091 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 39014405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39015360 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39018960 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39019638 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39020321 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39021864 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39028127 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39031960 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39032759 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39033399 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39034773 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39035640 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39036284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39036498 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39037137 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39037496 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39038868 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39040199 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39040770 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39045782 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39046738 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39049094 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39049532 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39050814 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39051260 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39061377 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39061630 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39062645 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39063793 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39065209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39065616 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39068762 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39069388 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39070217 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39072684 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39074085 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39082892 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39083895 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39085042 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39088757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39093660 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39093975 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39094103 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39094214 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39104323 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39105031 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39105302 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39106045 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39106103 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39106480 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39106647 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39109495 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39111940 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39112518 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39113069 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39115008 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39116524 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39116865 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39117581 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39122511 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39130464 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39133095 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39134277 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39134366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39141016 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39141220 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39142715 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39142775 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39145562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39146387 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39146425 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39146560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39147579 C A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 39147928 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 39151165 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39163625 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 39169817 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39170437 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39170856 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39172106 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 39172437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39173653 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39179467 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39180245 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39181920 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39183510 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 39186135 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39186720 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39187692 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39188252 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39190605 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 39192723 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39193304 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39193601 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39193984 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 39194242 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39196993 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39205424 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39209009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39209100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39214394 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39216340 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 39218853 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39219809 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39221018 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 39221021 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 39223552 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39224501 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39227222 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 39228130 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39228362 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39230185 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 39231634 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 39231947 C T N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 39235041 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39249720 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39257614 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39259910 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39263834 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39264178 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39264349 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39265499 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39267462 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39267837 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 39268203 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39270184 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39272829 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 39272965 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39273170 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 39276779 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39276882 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39277706 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39280565 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39281601 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39281743 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39281876 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39283106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39283165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39286204 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39290427 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39291214 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39292202 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39297190 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39297846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39301125 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39302003 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39302032 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39303614 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39305509 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39306483 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39308657 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39308668 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39308826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39309505 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 39309818 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 39311152 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39317576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39319439 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39322522 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39323182 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39323557 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39324405 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39324585 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39325525 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39325766 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39325899 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39326397 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39326447 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 39329199 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39329777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39330276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39330880 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39332246 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39332874 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39334508 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39336563 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39337565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39339656 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39341098 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39349670 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39351277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39351599 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39352004 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39352186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39352600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39352873 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39352952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39356283 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39362274 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39362302 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39362412 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39364000 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39365504 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39365829 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39371046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39371301 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39371327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39381178 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39382347 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39382640 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39386238 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 X 39387418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39387587 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39387680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39388502 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39388759 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39389097 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39389312 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39390332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39390349 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39390388 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39390393 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39390433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39390513 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39390542 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39391058 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39391066 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39391338 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39393257 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39393286 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 39393481 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39394911 T C N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 39395422 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39398030 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39398288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39398736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39399079 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39408448 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39410228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39410680 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 39410900 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39412885 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39413722 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39415888 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39416694 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39418300 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39419257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39421447 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 39421486 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39422217 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 39424149 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39424647 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39426064 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 39426091 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 39430502 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39433287 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39433628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39433941 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39434401 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 39434592 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39434754 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39440808 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39441222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39441508 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39442002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39442187 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39442471 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39443234 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 39444544 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39447503 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39454370 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39455273 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39456179 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39457159 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39458163 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39458164 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39461431 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39461722 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39464339 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39469180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39469240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39469374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39470540 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39475581 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39477836 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39480136 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39480448 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 39481169 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39481906 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39483216 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39485418 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39487077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39490185 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39492003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39495133 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39501725 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39509997 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39510219 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 39513028 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39513504 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39513505 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39515436 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39520868 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39522527 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39523952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39524289 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39525257 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 39527831 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39528013 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 39531688 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 39531746 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39533736 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39534084 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39536578 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39537058 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39537114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39537405 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39539046 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39540958 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39541954 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39543555 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39545006 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39545040 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39547327 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39548370 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39548524 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39550746 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 39550952 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39553607 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 39554325 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39558003 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39558070 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39558741 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39558921 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39562350 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39562640 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39565730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39567934 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39568666 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 39570161 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39571833 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39575290 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39575691 G C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 39576103 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 39576322 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39577414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39577867 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39578845 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39583369 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 39583431 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 39586556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39589743 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39590512 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 39592601 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39593493 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39593519 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39593538 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39596980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39598267 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39598471 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39598854 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39598960 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39602436 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39604660 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39604929 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 39605046 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39607739 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 39607846 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39615201 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 39615824 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39616984 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39616998 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39617127 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39619792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39621934 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39623127 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39623866 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 39625358 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 39626237 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 39626628 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39627086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39630883 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39631079 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39632349 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39634917 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 39637119 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39637209 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39640096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39645362 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 39647066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39647373 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39648244 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39649028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39651198 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39651372 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39659740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39660097 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39669035 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39673027 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39674869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39675167 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 39675616 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39676786 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39677318 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39678108 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39679452 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39679591 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39680086 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39681194 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39684540 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39685069 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39686450 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39688911 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39691557 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39692172 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39694201 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39694840 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39695299 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39700030 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39701105 A T Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 39701106 A T Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 39701366 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 39702021 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39702277 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39703014 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39703196 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39704598 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 39704610 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 39704679 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39704979 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39705253 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 39706479 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39712389 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39713090 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39716574 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39717185 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 39717671 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39717864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39723137 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39723818 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39725418 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39725560 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39725646 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39725735 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39726178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39726209 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39726294 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39726768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39727105 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39727146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39728138 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39729449 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39730787 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39732942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39732974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39733101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39737026 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39737518 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 39738861 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39739173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39739961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39740246 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39740264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39743161 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39744945 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39748432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39749773 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39750972 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39754424 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39754912 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39756831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39757189 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39757425 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39758852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39758899 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39759017 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39759141 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 39759192 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 39759899 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 39761041 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39762654 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 39767252 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39768007 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39769130 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39774887 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39775528 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39778312 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 39778831 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39778925 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 39781102 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39781198 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39781717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39781804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39783107 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39784765 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39784805 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39785411 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39786830 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39787594 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39788279 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 39788474 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39788671 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39789599 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 39790183 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39790591 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 39790863 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 39791368 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 39792031 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 39793357 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39793591 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39796629 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39796735 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39796973 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39797378 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39798252 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39798418 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 39802793 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 39803425 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 39804937 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39808045 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39808943 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39808991 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39816021 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 39817473 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39817514 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39818290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39819040 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39819454 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 X 39820359 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39821165 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39822471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39822473 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39822817 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39823055 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39823371 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39823483 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39824303 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39824447 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39825277 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39825455 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 39826123 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39826224 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39826489 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39826496 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39826547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39826923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39828945 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 39829388 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 39829636 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39832478 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39833487 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39834593 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39844122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39848370 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39849000 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39851108 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39854125 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 39854160 G C Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 X 39855867 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 X 39856598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39856889 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39858118 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39858485 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39858902 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39859222 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 39859718 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 39860176 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39861427 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39861553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39862188 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39862281 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39864204 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 39865023 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 39865652 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 39865751 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 39865877 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39865937 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39866339 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39866402 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39866503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39866730 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 39866746 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39866754 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 39869044 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39874318 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39875464 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39877943 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39877986 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39878354 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 39879176 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 39879387 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39880141 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39882175 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39883939 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39884860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39886909 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 39886927 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 39887043 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 39890302 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39890414 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39892205 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 39892555 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39892654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39894208 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 39894243 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 39896746 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39897389 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39897639 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39897862 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39898046 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39898632 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39899254 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39899415 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 39899611 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 39899622 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 39900206 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39904661 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39905490 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 39906017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39907049 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39907881 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39909876 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39910303 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39912499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39912682 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39914224 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39917305 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39927660 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39928132 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39928801 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39928971 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39929937 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39930416 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39930827 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39931122 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39932139 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39932492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39932976 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 X 39933013 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39933501 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39933530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39935501 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39936740 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39937581 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39938586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39938804 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39939842 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39940575 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39941343 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39942714 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39943424 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39948800 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39949523 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39949552 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39969364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39971701 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 39972155 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39973013 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39973182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39974610 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 39977819 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39978629 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39980468 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39981305 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39982327 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39982661 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39982710 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39983184 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 39983808 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 39983887 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 39984231 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 39984800 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 X 39984806 A T Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 39984997 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39985558 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39986008 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 39992464 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 39996389 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 39997134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 39997862 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 39998299 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 40001985 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 40003266 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40005392 C T Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 40008485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40009542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40010424 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 40019896 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40020967 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40021369 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40021676 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40021746 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40022538 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40026616 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40028299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40032021 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40034452 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40037450 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40037989 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 40043722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40045795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40049135 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40052170 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40052171 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40052579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40055073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40058893 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 40059372 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40060048 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40066564 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 40066565 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40072915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40074408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40077983 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40079440 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 40081519 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 40081712 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40081767 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 40081789 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 40081793 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 40082185 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 40087683 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40088403 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 40089523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40089795 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 40091749 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40092039 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40093098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40093709 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 40094034 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40094966 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 40095002 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 40095037 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 40095108 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 40095340 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 40095559 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 40095599 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 40095622 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 40095750 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 X 40095812 C G N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 X 40095814 C A N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 X 40095884 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 40096049 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 40096088 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 40096155 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 40096377 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40096475 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 40096946 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40097363 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 40097702 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40097789 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 40098170 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40098177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40098192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40098406 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40100131 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 40101966 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 40102479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40102589 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40102664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40103050 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40103227 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 40105011 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40105251 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40105780 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40109706 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40111768 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40122835 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40126564 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40126954 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40128381 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40128942 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40129027 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40131501 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40132309 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40138355 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40144888 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40147026 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40148107 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 40148529 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40149682 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40151158 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40151537 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40151880 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40153539 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40153540 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40153644 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 40153856 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 40153863 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 40155069 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40156277 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40156808 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40156826 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40156920 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 40157170 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40157263 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40157280 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 40157698 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40158181 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40158595 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40159525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40159752 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40160307 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40160573 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40161386 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40161703 A C Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 40161875 T G Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 40161926 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 40161979 T A Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 40162130 T C Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 40162172 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 40163030 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40163238 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40163638 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40166072 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40166240 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40168257 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40169292 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 40172864 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 40173083 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 40173178 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40173245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40173286 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40173404 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40173586 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 40173682 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40174012 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 40175592 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 40176222 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40176730 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40177826 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40178811 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40180950 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 40182456 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40183125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40183138 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40183375 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40183412 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40183453 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40184038 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 40185560 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 40188757 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 40192321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40195670 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40195869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40197845 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 40202372 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 40203298 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40203990 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 40204573 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 40204842 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40205011 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40205794 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40206338 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40206480 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40206892 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40206947 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40211143 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 40213117 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40215817 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40216731 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40217443 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40218118 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40219403 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40220223 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40221770 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40223514 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40223980 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40224999 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40226414 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40226580 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 40227682 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40229760 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40231128 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 40231981 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40232107 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40232150 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40232310 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40232740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40233066 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40233489 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40234835 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40236766 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40238327 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40239375 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 40241177 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 40243914 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40244239 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 40244415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40247022 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40248871 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40249996 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40253181 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40253219 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40253567 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 40254807 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 40256374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40258117 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40259738 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 40259797 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40259859 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40263320 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 40263537 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40264518 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 40266387 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 40266447 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40267900 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 40270467 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40271692 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 40281085 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 40281086 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 40281465 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 40281715 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 40283074 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40285810 T A N N 0.5 ALT 0.95 0.95 0.5 0.5 0 1 0 1 1 0 1 0 X 40286313 T C N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 40287306 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40287450 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40288436 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40288535 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40289898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40290845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40291635 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40291883 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40296286 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40296816 G A Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 40299133 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40301694 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 40301871 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40303933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40305044 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40305049 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40305586 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40305766 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40306293 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40306408 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40307435 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40309304 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 40312145 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40312580 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40313578 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40313825 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 40314475 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 40314477 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 40316643 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40317834 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40318454 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40319111 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40319648 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40320324 T A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 40320741 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 40321485 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40322044 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 40323367 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40323999 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40326143 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 40326149 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 40326569 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 40326613 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 40327664 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 40327836 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 40328183 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40329488 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40330438 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40332334 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40332426 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 40332729 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40333061 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 40335088 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40335576 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40338567 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40338579 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40338677 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 40340878 G A Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 40341222 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40341264 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40341497 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 40342011 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40342096 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 40343551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40343558 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 40343633 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 40344099 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 40344324 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 40345809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40346013 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 40346617 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40346894 G C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 40347102 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40347800 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40347963 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40349730 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40350281 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40353082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40354986 A C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 40357264 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 40357441 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40359231 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 40359335 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40359716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40360315 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40362203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40362286 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40363311 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40363467 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40363705 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40364346 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 40364366 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 X 40364394 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 40364516 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 40364540 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 X 40364611 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 40364665 A G N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 X 40366401 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40366581 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40367421 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40368132 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 40368356 C G Y N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 X 40368900 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40369293 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40369563 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40370858 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 40370984 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 X 40371574 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40372028 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 40373468 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 40381097 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 40384098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40386113 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 40386116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40390236 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40392292 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 40398075 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40401457 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40403560 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40403600 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40404443 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 40404687 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40406410 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 40407257 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40408656 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40408852 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40410996 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40411619 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40411645 A C Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 40412562 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40412850 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40414637 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40415596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40415945 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 40416138 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 X 40416449 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40416466 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40416824 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40416943 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 40417207 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 40417309 G T Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 40417310 A T Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 40417424 C G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 40417559 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40417587 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40417607 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40417663 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40417722 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40417818 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40417819 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 40418474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40423161 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40424209 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40426940 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40427008 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40427868 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40432537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40432574 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40433215 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 40434607 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40435182 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40435818 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40438618 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40446765 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40449904 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40451903 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40453220 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40458650 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40460178 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40460231 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40460812 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40460990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40462703 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 40463690 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40466873 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40468565 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40469965 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40470385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40471293 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 40478891 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40479201 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40479541 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 40480856 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40482347 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40483899 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40484286 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40484395 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40486616 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40486813 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40487957 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40487993 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40491020 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 40494124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40494186 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40499964 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 40500594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40502500 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 40502867 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40502868 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40503099 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40507248 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 40508352 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 40508419 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40508797 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40508902 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 40508941 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40509970 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 40510064 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40510072 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 X 40510362 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 40511064 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 40511070 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 40513160 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40513528 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 X 40513821 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 40514116 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 40514757 G T N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 40515211 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 40515243 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 40515493 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 40516015 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 40516111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40516570 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40516591 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 40516614 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 40516787 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40516823 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40517489 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40523661 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40525734 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40527850 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 40529423 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 40530630 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40534123 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 40535911 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 40537821 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 40540555 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40541027 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 40541557 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 X 40541882 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 40542301 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40544426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40544463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40544636 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40545563 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40547263 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40547345 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40550774 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40551043 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40554599 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40560370 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40569361 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 40571043 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 40571668 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40571971 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 40573091 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40574285 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40575951 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 40576917 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40578611 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40585812 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 40586100 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 X 40586524 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40587225 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 40589645 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40593044 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40594198 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 40595463 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 40597624 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40599929 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40600249 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 40603130 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 40608610 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40608990 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40610414 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40611734 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 40612131 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40614861 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 40616779 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40617579 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40619066 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40621259 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 40623574 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 40627103 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40627276 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40632761 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 40633453 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40633836 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40634842 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40636586 T G Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 40637646 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40638869 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 40640388 G A Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 X 40642708 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40643770 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40644688 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 40646348 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 40647580 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40652632 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40654640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40659500 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40660515 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40662628 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40666995 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 40670801 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40671273 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40671311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40673003 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40673128 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40673470 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 40673628 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40673845 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40673872 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40675000 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40675222 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40675983 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40676094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40676785 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40678008 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 40679502 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40681777 G A Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 40682549 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40685099 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40687200 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40688528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40690875 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40691075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40692702 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40693061 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40693207 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40693577 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40695923 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40698498 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40700625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40702154 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 40703209 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40706004 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40706203 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40707387 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40708098 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40708670 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40708672 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 X 40708809 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40711492 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 40711604 A G Y Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 X 40711817 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 40717394 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40718244 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 X 40719934 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40724730 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40724825 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40725369 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40728934 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40738831 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40742961 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40743188 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40744466 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40744798 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40745315 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40745757 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40746293 G A Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 X 40747075 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40749341 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 40749854 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40752757 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40753803 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40753981 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40754445 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40755243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40755695 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40760486 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 X 40760767 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40762354 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40764009 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 40764866 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40765163 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40765648 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40765707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40766297 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40768244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40776333 C A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 X 40778857 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40779041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40781538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40790821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40793795 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 40793968 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 40797192 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40799978 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40803225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40805145 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40807669 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40809079 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40813928 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40814362 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 40815580 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40819118 G A Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 X 40820852 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40822693 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40823001 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 40835879 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 40836261 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 40841189 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40842023 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40842900 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40848554 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40849010 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40850351 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40851854 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 40852570 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 40854179 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40854600 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 40854655 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40856302 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40862228 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 40865127 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40867156 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 40870660 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40870705 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 40870860 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40873944 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40877638 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40877849 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40880674 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40881264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40881485 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40885496 G C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 40886135 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 40888974 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40894387 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40895663 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40897183 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 40898687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40899623 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 40901749 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 40902450 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 40904799 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40905545 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40909801 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 40909974 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40910587 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40913621 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40914139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40918565 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40918950 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40919527 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 40921419 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40923008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40926347 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40928598 G A Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 X 40932423 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40936126 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40936901 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40940196 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 40940694 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 40941821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40945103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40945528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40946325 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40947282 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40950334 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40951448 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40956691 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40956799 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40957810 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40958334 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40959186 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40960523 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40961398 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40966538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40967094 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40968605 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 40968793 G C Y N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 X 40969312 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40975283 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40975454 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40976221 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40987163 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40988526 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40989486 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 40991840 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40992298 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 40993478 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 40997359 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40998219 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 40998462 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 40999117 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 40999967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41021339 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41023572 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41024921 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 41025450 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41025679 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41026193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41033943 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41034553 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41035386 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41037050 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 41037082 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 41037083 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 41037123 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 41040223 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41041833 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 41042614 C G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 41046256 A C Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 41046895 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41046896 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41047108 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 41047109 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41047140 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41048773 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 41049302 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41049677 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41049762 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41051011 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41052586 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41053883 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 41055220 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41055537 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41062046 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 41062914 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41063111 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 41063113 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 41064196 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41065487 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41068614 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41071367 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 41072909 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41073122 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41078370 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41080161 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41081924 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41087925 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41088359 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41089481 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41089532 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41089698 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 41089745 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41090666 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 41095238 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41096979 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41097436 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41098064 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41098297 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41098693 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41099396 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 X 41100169 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 41100199 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 41101022 A T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 41101293 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41101486 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 41103506 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41104062 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41104184 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 41106831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41106832 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41108129 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41108735 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41110270 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 41111355 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41112590 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41113144 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41113834 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41113839 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41115617 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 41116196 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41117198 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 41117246 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 41118807 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41119830 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 41119911 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 41126962 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41130066 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41130238 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41131108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41131921 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41132718 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41133542 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 41134312 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 41134608 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41136574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41138408 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41139314 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41140163 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 41141132 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 41144633 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41146120 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41147580 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41147813 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41154294 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41155206 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 41156299 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 41160065 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 41160239 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41160858 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 41165256 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 41167604 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41172147 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 41172168 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 41173209 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41176376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41177816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41178043 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41179467 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 41183663 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41183882 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41184353 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 41185455 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 41186278 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41189172 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 41189563 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41189796 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 41191289 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41195080 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 41195521 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41197168 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 41197542 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41198953 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41204168 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 X 41208369 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41209707 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 41211616 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41212209 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 41217248 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41217253 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41218533 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 41222201 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 41223449 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 41225314 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 41225393 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 41225619 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 41230186 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 41230251 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 41230269 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 41239635 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 41241159 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 41241484 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41241485 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 41241641 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41244114 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 41244379 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41245025 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 41249005 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41249960 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41251607 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41256194 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41256496 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41259664 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 41262255 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 41267725 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 41268191 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41269020 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41271616 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41273382 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41276841 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41276907 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 41277572 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 41277904 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 41279755 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41279948 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 41280430 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 41280433 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 41281521 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41282464 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 41287078 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41287528 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41287892 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41288839 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41289050 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41289878 G T Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 41291526 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41291999 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41292109 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41294269 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41294649 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41295067 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 41297370 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41297995 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41298964 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 41298967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41299907 T G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 41310092 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 41310736 C T Y Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 X 41311131 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41312714 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 41313256 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41313465 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 41313535 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 41313738 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 41314447 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 41315305 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41316171 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41316254 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41317021 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41317787 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 41319516 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 41320113 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 41320564 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 41322191 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41322386 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41322475 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 X 41322771 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 41323409 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41328348 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 41328799 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41329365 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41331227 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41334645 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 41335349 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41336611 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41337647 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 41338329 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 41340917 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 41340938 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41341111 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41342840 C G Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 41344652 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41345302 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41345870 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41351114 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 41351150 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 41354207 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41354568 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 41355172 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41355615 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41358715 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41359220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41360482 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41360664 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 41372714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41374984 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 41377686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41377764 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 41386976 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 41390695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41391416 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41396087 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41407113 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 41407875 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41408069 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41409460 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41414047 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41414721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41420324 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41420744 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 41424296 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41424375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41424457 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41424669 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 X 41424875 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41425179 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41425405 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41427139 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41430304 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41430666 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41431122 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41431209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41435787 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41436741 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41437032 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41437038 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41437505 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41437777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41440159 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 41440292 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41442356 A T Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 X 41443777 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41444367 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41444652 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41445742 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 41446382 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 41449049 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 41451587 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 41453113 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41455786 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 41465094 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 41465734 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 41467382 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 41467480 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 41474164 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41474450 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 41474764 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 41477543 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 41478481 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 41479180 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41481681 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41482960 C T Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 41483223 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 41483561 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41485309 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41489437 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 41490926 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41493487 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41493990 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 X 41494387 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 41495003 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 41495047 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41495403 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41498001 T A Y N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 X 41499396 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41501132 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41504093 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 41504488 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41504833 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 41505495 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 41506879 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 41508450 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 41511316 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 41511344 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 41512324 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41518904 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41519101 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 41520604 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 41522129 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41522855 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41523726 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 41525785 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41529130 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 41530730 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41532454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41534380 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 41534613 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 41537268 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 41538407 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41538962 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41542021 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41543504 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41548808 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41550462 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 41550723 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41559418 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41563653 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 41565550 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41573030 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41576210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41579040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41581000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41582374 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 41582387 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 41584101 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 41586431 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41595467 C A N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 41595723 T A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 41597240 T A N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 41604042 T G Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 41604543 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41604688 G T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 41604853 C T Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 41605556 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41606140 G C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 41609284 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41609367 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41609419 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 41609710 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41611268 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41613231 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 X 41615102 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41624288 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 X 41624861 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 41625184 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 41625201 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 41630885 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41631177 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 41631985 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41633570 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41634252 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 41634518 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 41636234 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 X 41642585 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 41643210 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 41644047 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 41647018 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41648849 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41650739 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41650862 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41656018 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41658349 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 41659148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41659537 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41660333 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 41663091 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41663943 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41668816 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41674930 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 41676882 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 41678085 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41682925 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41683620 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41684109 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 41684209 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41684416 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41685605 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 41686039 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 41686120 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 41686586 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 41689905 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41694259 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41694292 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41696271 C G Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 X 41701341 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 41701796 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41702159 T C N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 41703175 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41703262 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 41703376 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 41703638 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41703884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41706842 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 41712074 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 X 41717006 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41718760 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41721603 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41721870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41722410 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41723408 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 41729993 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41732200 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41735050 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 41737310 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41737312 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41737844 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 41739878 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 41748089 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 41748492 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41749082 A T N N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 X 41749083 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 X 41749869 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 41750535 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41752756 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41754597 A C N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 X 41760747 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41761330 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 41761558 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 41763549 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41766271 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 41766581 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 41769351 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41776801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41776808 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41778201 C T Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 41779079 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 X 41779336 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41779621 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41780134 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 X 41782070 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41782113 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41782519 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 41783367 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41787072 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41789173 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41789400 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 41796742 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41799783 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 41800474 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41800780 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41801126 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 41805866 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41812905 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 41813854 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41817345 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41819785 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41819786 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41820394 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41820435 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41822121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41827153 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 41828483 C T N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 41828946 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41829018 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41832623 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 X 41835143 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 41836640 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 41837051 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 41840886 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41841525 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41841795 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41849418 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 41849611 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 41852556 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 41859119 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 41859508 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 X 41860244 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41862624 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41862918 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41864190 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41864772 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 41865524 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 41866881 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41866987 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41876745 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41876894 A T Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 X 41877162 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41877376 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41880151 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41882088 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 41882866 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41885157 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 41885939 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41886019 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41890379 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41892755 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 41897179 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 41897498 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 41898188 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41898650 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 41899657 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 41899754 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 41900300 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 41901825 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41902840 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41905811 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 41905886 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 41906898 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 41907143 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 41908027 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 41908462 C A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 41908888 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 41912947 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41920319 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 41922080 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41923797 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41925553 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41926734 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 41927017 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41927179 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41932736 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41932888 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41938563 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 41941078 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41943662 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 41952253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41952456 C A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 X 41952745 A T N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 X 41953027 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41953768 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41956672 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 41957921 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 41961365 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 41963564 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41968855 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 41968884 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 41970698 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41972069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41978079 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 41978527 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 41980587 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 41982722 T C Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 X 41983608 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 41985307 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 41985483 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 41990499 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 41991803 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 41993229 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 41999192 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 41999207 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 41999926 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42001633 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42002901 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42002973 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42005250 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42005415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42005615 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42005698 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42006649 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42006782 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 42006979 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 42015545 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42015983 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 42016412 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 42016722 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42017029 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 42018634 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42023665 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42024610 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 42026841 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42027281 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42027884 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 42028539 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 42031092 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 42031158 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 42033413 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42036473 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42036852 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 42036854 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 42038789 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42040687 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42041290 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42042907 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42043159 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42045214 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42047486 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42047622 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42049471 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 42049683 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 42050363 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42050694 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 42053953 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 X 42055263 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42055302 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 42056121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42056639 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42058025 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42061100 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42061753 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42063464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42064404 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42064991 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42066523 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42066535 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42069904 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42070433 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42074470 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42076445 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42079339 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42079441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42083411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42085437 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42092818 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42094779 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42095538 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42095601 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42096386 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42096714 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 42096859 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 42098282 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42098314 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42098497 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42098986 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42105202 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42105501 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42111537 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42111609 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42112593 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42116648 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42118069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42119677 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42121673 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42124687 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42128766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42129311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42134854 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42139125 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 42143854 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42143858 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42147273 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42147358 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42148184 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42149839 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42149850 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42151200 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 42152930 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42154143 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42154170 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42154185 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42155230 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 42158334 C G N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 42158354 T C N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 42159701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42161573 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42167166 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42169154 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 42169579 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 42171163 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42174764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42175254 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42177265 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42181910 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 42185760 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 42187752 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42188277 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 42191264 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42198491 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42204330 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 42205366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42206216 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42206271 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42206700 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42207794 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42208121 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42210233 G C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42211773 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42213526 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42213644 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42213990 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42218039 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 42220455 C G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42221697 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42221813 G T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 42224331 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42225849 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42226345 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 42227427 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42227898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42236115 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 42236161 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 42236403 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42240254 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 42240255 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 42242538 T A N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 42242823 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 X 42243783 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42244375 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42244626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42245186 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42245590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42247475 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42247942 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42248699 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42250335 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42251197 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 X 42251741 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42252038 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42252329 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42252477 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42252750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42253986 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 42255130 A T N N 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 X 42255131 A T N N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 X 42256525 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42256921 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 42257733 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42259291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42259681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42259923 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42260469 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42260830 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 X 42261751 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 42262078 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 42263003 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 42263090 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42263097 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42263137 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42264164 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42264397 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42264783 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42265410 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 42265453 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42265508 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42266024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42267103 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 42267850 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 42268151 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 42269706 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42269940 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42270353 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 42271142 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42273061 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42273340 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 42274356 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42274572 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 42276436 A T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 42277388 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42277426 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42278540 T C Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 42279321 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42279692 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42280389 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42280735 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 42281222 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42281339 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42281754 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 42285024 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 42285245 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42285566 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 42285729 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42285760 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42286278 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42286298 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42288083 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42288144 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42290205 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 42290816 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42293405 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42296221 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42296255 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42298167 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42301251 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 42306458 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 42312118 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42312289 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42313291 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 42315083 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42316160 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42318473 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42319575 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42322045 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42322850 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42324276 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 42327161 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42330123 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42332218 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42337484 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42337512 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42339846 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 42340979 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42341920 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42342557 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 42345379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42350358 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42353452 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 42357447 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 42357474 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 42358791 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42359758 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42361405 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42363494 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42364075 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42371994 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 X 42373229 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42374257 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42374275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42374842 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42375936 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42376719 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 42377017 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42379060 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 42379390 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42379391 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42379534 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42379746 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42381343 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 42384794 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42390578 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42390915 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42391577 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42392084 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42395372 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42396493 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 42399912 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42405115 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42405929 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42405960 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42411134 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 X 42415546 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42420140 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42421241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42423802 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42425921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42426472 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42433340 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42439255 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42440411 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42445051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42447035 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42452551 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42453108 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42453349 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42454144 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42454407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42460380 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42461278 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42462321 G T Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 42463281 C G Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 42466888 A C Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 42469180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42472754 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42472831 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42472833 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42473032 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42473677 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 42477524 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42480787 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 42481077 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42482356 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42482891 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42483252 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42483745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42489771 G A Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 X 42490133 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42490144 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42491188 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42496431 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42496481 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42497299 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 42497311 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 42497696 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 42497905 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 42498258 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 42499172 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42499772 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 42499874 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 42499959 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42501427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42503861 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 42509063 G T N N 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 X 42509799 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42513830 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42515603 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42516932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42517283 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42518375 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 42521621 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 42521696 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 42521708 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 42522829 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42526215 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42527255 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 X 42528975 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 42529832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42530434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42532713 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42532736 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 X 42534708 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42534911 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42535299 G A N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 X 42536073 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 42537413 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 42537585 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42539088 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 42544128 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42544596 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 X 42544742 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 X 42544771 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 X 42546278 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42547346 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42547360 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42554226 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42554951 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 42557286 G T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 42560211 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42560558 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42562819 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42563588 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 42566680 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42568340 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42569038 C T Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 42569613 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 X 42570079 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42571931 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42574051 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42574524 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 42575573 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42575610 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42579584 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42581232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42581812 G C Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 X 42582220 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42598008 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42598691 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42601075 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42602690 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 42604698 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42604928 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42605683 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42613058 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42613162 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42615291 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 42617715 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 42619015 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 42619148 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 42620542 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 42620921 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 42624186 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42631074 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 42632406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42633002 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 42634627 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42635246 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42640982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42641743 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 42644086 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42646296 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 42647772 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42648475 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 42648593 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42652996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42654882 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42655280 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42656127 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42656722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42657291 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 42657728 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 42658453 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42658875 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42659507 G C Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 42659572 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42661439 C G Y N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 X 42664449 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 42666241 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 42667945 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42670820 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42671514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42673029 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 42674541 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42676311 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42677148 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42678803 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42679074 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42679698 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42679900 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42680288 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 42680366 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 42683561 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 42684009 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42684676 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 42684785 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 42686971 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42687426 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42688263 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42688284 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42689608 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42689977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42692161 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 X 42692615 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42694028 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42694074 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42695081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42695368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42695433 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42695567 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42695720 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42695817 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42696832 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42698047 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42698179 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42698998 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 42699740 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42699867 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42700131 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42701957 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42703390 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42703872 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42705262 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42705526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42705879 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 42705958 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 42706070 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 42707308 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 42707464 A C N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 42707539 T A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 42707872 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42708560 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42708869 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42709246 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 42709848 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 42710002 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 42710374 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42711024 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42711165 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42712294 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42715059 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42715896 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42716258 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 42716427 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 42716784 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42716804 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 X 42717648 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42717991 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42719874 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42721085 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 X 42721287 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42722393 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42726670 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 42729040 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42729151 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42729236 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42730058 G A Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 X 42730247 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 42731025 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42731471 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 X 42731706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42732683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42732800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42733223 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42733320 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42733321 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42733662 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42735527 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 42736106 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 42737112 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42738395 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42738912 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42739163 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42739368 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42743082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42743460 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 42743653 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 42746778 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 42747095 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 42751971 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42755271 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 42756011 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42756480 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42760988 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42761079 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42767694 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42770379 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42771198 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42771573 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 42775851 G T N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 42776040 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 42776041 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 42777111 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 42779118 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42779310 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42779421 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42780763 C A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 42781164 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 42783795 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42784467 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42786122 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 42787056 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42788358 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42790896 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 42791327 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 42795388 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 42796157 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42799742 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42800426 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42800806 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42802745 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42803699 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 42811903 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42812580 A G N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 42812877 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42813357 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42814637 C T Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 X 42816870 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42817185 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42817812 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 42820469 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 42821011 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42827361 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 42828417 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42830153 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 42830318 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 42830572 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 42831547 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42835103 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 42835105 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 42835110 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 42835136 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42835141 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42835583 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42835883 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42836352 G A Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 42841148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42841750 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42843097 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42845090 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42845354 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42846343 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 42847263 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42849507 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42849540 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42853336 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42853525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42853843 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 42854342 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42854429 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42855019 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 42855394 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42855678 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42855914 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42856135 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42857060 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42857665 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42857769 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42858043 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42858433 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 X 42858965 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 42859043 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 42859893 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 42861348 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42862304 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42862322 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42862323 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42865005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42865478 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42866501 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 42866539 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 42868495 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42868706 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42869116 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 42869759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42870298 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42870330 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42872233 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 42873981 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 42875979 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42876287 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42876647 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42877373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42877476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42878499 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42879466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42879964 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 42881043 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42881461 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42883435 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42883589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42883835 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42884090 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42884592 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42892053 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42893302 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42893652 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 42896586 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42897407 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42898175 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 42898654 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42898768 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42900157 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42901343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42902045 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42902261 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42902774 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42903612 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42903847 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42903909 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42905076 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42905113 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 42905125 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 42905249 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42907762 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42907907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42909090 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42909719 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42909809 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42909936 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42910082 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42910454 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42911803 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42913076 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42913730 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42914797 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 42915259 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 42915672 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 42915908 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 42917323 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 42918818 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 42920627 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42921507 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42923838 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42924115 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42924836 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42927461 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42928021 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 42928101 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 42928140 G T Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 42928837 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42929550 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 42929870 T A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 42931128 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 42931553 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42931722 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42931770 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 42931931 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 42931932 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 42933595 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42935313 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42935938 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42936829 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42937294 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 42937621 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42938789 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 42939915 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42942956 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42944958 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42946008 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42947921 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42949152 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 42949275 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42949408 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42951886 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42952933 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42953202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42954772 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42954997 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42955627 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42956799 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42958002 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42960898 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42963593 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42964761 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42966098 A G N Y 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 X 42966099 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 X 42967555 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 42971100 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 42973495 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42974052 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42982819 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42983716 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 42983971 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42984436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42984739 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42984969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42985673 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 42985925 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42986050 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 42988606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42988831 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42992099 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42992133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 42992689 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43002520 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43002639 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43002738 C A Y N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 X 43004735 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 43004843 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 43005505 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 43006546 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43007185 T A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 X 43009296 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43010424 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43012267 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43020011 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 43021543 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 43021739 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43022612 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 43023279 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43023591 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 43025518 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 43025819 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43028515 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43031827 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43033065 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43035430 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 43037455 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43038849 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43040733 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 43043208 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43043266 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 43044577 T A N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 43045070 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43046532 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 43047494 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 43047932 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 43047965 T A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 43048694 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43049737 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43052940 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43053500 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43053970 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 43055953 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 43057849 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 43059710 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 43059963 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 43063549 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43065974 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 43066008 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 43066540 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43067785 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 43068298 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 43068792 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43071808 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43072170 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43073759 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43073959 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 43073998 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 43079344 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43080200 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43084990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43087783 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43088289 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43089951 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43093042 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43093910 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43094140 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43094578 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43094581 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43095443 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43106773 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43114356 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 43116300 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 43119077 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43119546 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43119642 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43120826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43122342 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 43129338 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43130133 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43134075 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43134143 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43134416 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43134771 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43137249 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43137376 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 43140512 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43141318 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43142215 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43144685 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 43145471 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43146521 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43146651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43148642 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43150876 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43156396 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43157606 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43158873 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43160663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43161181 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43162849 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 43163066 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43163189 A T Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 X 43165282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43165722 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43167047 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43167755 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43172680 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43175945 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43176220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43177250 T G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 43180294 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43182677 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43182875 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43184041 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43185656 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43187851 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43188568 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43189526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43190734 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43191055 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43192415 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 43193470 C G N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 X 43193615 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 43194043 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 43195045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43195217 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43197821 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 43198541 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43199575 C A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 43199780 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 43199978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43200009 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43200017 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43205333 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43205708 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43205868 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43207118 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43207415 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 43207861 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 43207936 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 43207937 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 43208483 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43208720 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43208918 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43215366 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43216602 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 43221275 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43222064 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43222075 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43222088 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43222278 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43227488 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43237860 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 43256084 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43256578 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43257018 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 43264803 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43265417 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43266355 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43267896 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 43272940 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43277758 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43278119 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 43279149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43279323 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43283823 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43284789 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43285161 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43290538 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43292744 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43293473 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43298732 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43303086 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43315653 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 43317548 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 43324226 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 43324960 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43325618 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 43329709 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43330315 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 43330957 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 43337690 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 43341541 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43350733 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 43355408 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 43355990 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 X 43359600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43359982 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43360668 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43361981 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43363426 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43363474 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43370393 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 43372113 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 43376727 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43377388 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43378137 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 43380624 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43380645 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43381211 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43382129 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 43384666 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43385329 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 43385408 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43386725 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43386957 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43387272 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43388739 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43391264 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 43392033 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 43397784 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43398255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43398783 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 43399852 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 43400452 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43402522 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 43406360 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43408829 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 X 43415039 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43415778 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43416483 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 X 43416487 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 43416889 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 43417774 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 X 43421841 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43422814 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 43423836 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43424284 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43424514 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43424880 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43425294 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 43425319 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 43428335 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 43430721 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43435719 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43439873 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43440227 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43440616 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43440641 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43443529 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43444298 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43444597 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 43445382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43445397 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43445945 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43448606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43450644 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 43454945 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43456882 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43457473 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43458099 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43458352 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 43459651 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 43464422 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 43467207 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 43467808 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43468296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43469391 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43470262 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 43471157 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43474267 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43474596 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43482036 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43483380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43483513 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43483736 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43483869 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43484543 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43489757 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 43490096 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 43490303 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 43490760 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43492339 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43496731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43498336 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43499184 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 43499454 A C Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 43499459 A T Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 43501105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43505149 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43516113 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43517274 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 43517702 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43522575 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43524498 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 43525023 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43525828 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43527776 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43527843 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 43528551 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 43530472 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43531709 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 43535228 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43535471 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43535790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43535876 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43537128 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43537431 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43541258 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 43542654 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43542744 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 43543671 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43543864 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 43543895 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 43545806 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43546212 C G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 X 43547731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43548873 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43550249 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43553651 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43554838 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43556152 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43556229 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43557667 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 43558959 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43559932 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43560302 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 43562066 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 43563692 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43563773 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43565707 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43568344 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 43572305 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43573498 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43574079 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43575862 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43576325 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43576522 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43584360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43585244 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43586115 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 43588957 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43589390 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43589679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43589874 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43589897 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43590133 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43590400 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43591698 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43593694 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43593707 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43594388 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43596955 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 43597788 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43597834 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43598188 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43598346 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 X 43600032 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43600258 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43601903 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43603279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43603581 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43603687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43603945 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43604942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43605233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43605408 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43605409 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43606016 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43606242 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 X 43608013 G C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 43608104 C T Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 43608524 C G Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 43608903 A T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 43610138 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 43610268 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 43610536 A T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 43610538 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 43611620 A C Y N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 43614041 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43614955 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43616703 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43617947 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43619061 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43620874 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43621667 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43623391 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 43625338 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43633980 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 43634063 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 43634184 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43637282 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43637853 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 43638215 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 43638712 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43639828 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43640035 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 43644993 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43645467 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43645593 C T Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 X 43646935 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 43647347 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43649164 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43650172 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43650473 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 43651548 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43652798 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 43652872 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 43654823 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43655065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43656483 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43659649 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43660748 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43661383 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43662106 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43667507 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43668538 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 43669514 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43672316 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 X 43672785 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43673565 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43673952 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43676474 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 X 43676864 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43677652 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43679037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43679710 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43684492 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43687594 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 43689232 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43690456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43691220 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43694697 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43698531 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 43699723 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43699882 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 43701648 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43720078 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43720876 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43721080 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43721193 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43723474 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43724542 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43727890 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43728421 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43731104 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 43736024 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 43748227 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 X 43760405 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 43766877 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43778418 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43779331 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43779678 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43782861 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43784311 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43791140 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43792015 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43796767 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 43799265 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43799636 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 X 43800868 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 43800991 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43801269 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43802404 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 43802607 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43805247 C T Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 X 43815819 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43821899 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 43824231 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43841719 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43843115 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 43843180 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43844291 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 43844380 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43853295 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43855160 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43856162 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43858386 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43858624 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43866922 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 43874247 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43886366 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43886617 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43887152 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43890667 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43894988 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43904005 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43904312 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 43908014 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43908751 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43915366 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 43915367 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 43921525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43925714 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43926821 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43927149 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43927268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43930388 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43934501 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43937759 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43939199 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43940214 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43940910 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43941565 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43941615 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43942412 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43942709 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43942996 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 43944269 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43944723 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43945815 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43946425 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 43948144 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 43948548 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43948690 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43948929 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43948940 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43949072 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43949168 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43949264 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 43949560 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43950452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43950599 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 43950805 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43951470 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 43951736 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43952535 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43952621 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43954467 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43954529 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 43956032 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43956059 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43956108 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 43956364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43956505 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43956777 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43958770 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43959191 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43959980 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43960237 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43961105 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43965481 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43965521 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43965834 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43971032 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43972159 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 43972767 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43973722 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 43974148 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43974652 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43974991 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 43976749 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43977218 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43977543 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43979487 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43979767 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43979942 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43985176 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43985387 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43986205 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43987045 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43988010 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43988101 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43989107 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43989559 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43989719 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43991740 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43993054 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 43993284 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43994403 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43995050 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43995842 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43995957 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43996166 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43996217 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43996955 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 43997204 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 X 43997392 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 43998332 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43998442 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43999524 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43999549 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 43999587 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44000864 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44001350 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44003705 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44003879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44003970 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44005522 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44005965 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44006551 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44007662 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 44008375 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44009428 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44009975 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44010635 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44012719 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 44014090 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44014544 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44015948 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 44016986 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44018071 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44018292 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44021496 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44023291 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 44023704 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44026531 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44026784 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44030533 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44032691 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44033870 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 44034446 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44035080 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 44035284 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44038102 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 44038436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44039357 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 44041226 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 44043066 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 44043320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44043935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44043971 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44044016 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44044156 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44045279 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44045720 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44046708 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44046821 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44047522 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44047913 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 44048543 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44051663 T G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 44052784 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44053588 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44053589 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44055004 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 44056159 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44056991 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44057694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44063714 A T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 44064080 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44064599 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44064791 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44068527 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44071336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44071641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44072646 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44075189 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44076955 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44077597 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44078103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44078662 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44079895 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44079959 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44080501 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 44082417 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44082422 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 44082423 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44083686 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44085626 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44086418 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44087099 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 44088333 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44088552 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44088755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44088944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44089121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44090348 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44091349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44092397 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 44093573 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 44094182 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44094246 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44094902 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44095269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44095952 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44097389 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44099282 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44099387 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44099388 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44100282 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44100668 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44103285 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44106274 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 44107236 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44107724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44108075 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44108207 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44108966 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44109863 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44109987 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44111353 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44111632 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44113719 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44114092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44115601 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 44118974 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44119555 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44121033 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 44121099 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 44121122 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 44121407 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44123339 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 44124188 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 44124664 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44124970 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44126155 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44127538 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44128466 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44131379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44131587 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 44131773 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44131968 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44133667 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44137926 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44141311 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44143618 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 44143826 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 44144542 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 44145062 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 44147066 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44147844 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 44150906 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44159265 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44159698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44160536 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44161324 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44162403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44162576 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44164029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44165174 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44166190 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44166404 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44166510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44167227 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44167694 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44167853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44168668 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44169079 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44169619 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44178583 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 44179696 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44180944 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 44183496 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44184361 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44186458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44187991 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44188594 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44189635 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 44194312 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44199450 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44203043 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44204425 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44204959 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44206013 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44209029 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 44209546 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 44211409 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44211493 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 44214796 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 44215024 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 44215610 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44216269 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44218555 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 44218585 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 44218629 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44219107 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44219274 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44219449 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44220071 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44220246 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44220571 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44220868 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44220930 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44221106 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44221113 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44221129 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44221140 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44221146 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44221309 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44221333 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44221387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44221403 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44221433 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44221517 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44222451 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44222512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44222566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44222743 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44222851 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44222988 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 44223327 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44223674 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44223689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44223914 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44224880 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44227929 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44228441 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44229507 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44229518 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44231326 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 44231369 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44231623 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44231838 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44232000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44232424 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44232637 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44232756 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44233375 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44233473 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44233474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44233548 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44233943 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44233944 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44234157 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44234331 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 44234606 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 44235391 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44235456 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44235786 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44236646 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44237208 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44237396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44237756 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44240441 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44241998 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44243145 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 44244501 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 44250449 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44251496 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44251902 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 44252251 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44252420 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44252608 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44252634 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44254744 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44254817 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44259690 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 44260186 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44268126 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44277902 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44281877 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 44298802 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44300123 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44302737 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44304787 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44309258 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44309852 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44312292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44313319 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44313596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44314453 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44314505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44314977 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 44315725 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44319157 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44319741 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 44319824 T G Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 44320239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44320799 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44321103 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44321820 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44325767 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44338763 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44342387 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 44355272 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44355592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44357020 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44357388 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44358941 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44360171 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44361727 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44362090 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 44364271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44364571 C A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 44368283 C A Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 44368866 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44369203 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 44369358 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 44370243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44370364 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44372949 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44373150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44374022 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 X 44374460 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44379167 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44381317 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44381845 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44382536 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44384188 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 44385568 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44386494 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44386714 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 44387572 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44387874 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44391304 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 44393960 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44394101 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44399973 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44400365 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44400439 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44400816 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44402178 C A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 44403097 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44406085 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44406375 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44406889 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44407110 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44407219 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44412905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44413526 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44416416 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44416936 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44421010 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44422085 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44422087 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44423629 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44423966 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 44424056 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44427131 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44431040 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44431179 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44431217 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44433427 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44435471 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44435909 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44436124 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44436598 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44436640 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44436873 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44437370 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44437493 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44437977 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 44438158 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44439972 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44440592 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44441169 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44441514 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44442288 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44442603 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44442970 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44444138 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44447121 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44448854 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44450541 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44451887 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 44451917 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 44452135 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44452424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44452653 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44452939 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44453234 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 44454067 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44454240 G A Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 44455275 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44455357 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 44455602 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 44455876 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44455962 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44456008 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44456536 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44456929 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44457178 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44458386 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44458773 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44458862 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44459460 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44460152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44460488 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44460734 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44460908 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44460942 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44460944 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44461025 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44461452 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 44463817 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44464274 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44464969 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44465618 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 44465725 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44465952 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44466303 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44466749 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44467027 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 44467028 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 44469414 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44469740 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44470298 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44470901 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44471078 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44471447 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44473064 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44473368 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 44478909 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44481183 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44481782 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44490767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44490861 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44491116 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44492006 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44492017 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44492428 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44492867 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 44493711 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44494552 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44494585 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44497069 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44497089 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44500460 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44500890 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 44501499 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 44505666 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44505979 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44508453 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44510278 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 44511363 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 44511695 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 44513031 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 44513500 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 44514007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44514333 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44516008 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 44516097 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44518086 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44518933 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44518935 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 44518995 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44521131 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44521786 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44522012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44522019 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44522509 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44523532 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44523774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44524499 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44525174 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44525247 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44528098 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 44528121 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44529691 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44531939 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 44532322 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44532373 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44534894 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44535359 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44536516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44540173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44540733 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44541540 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44541569 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44541962 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44543720 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 44544625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44547349 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44547433 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44547434 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44550512 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44554553 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44554622 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44555532 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44555707 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44558468 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 44558672 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 44560543 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44560820 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44562109 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44562568 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44563028 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44566252 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44566583 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44566813 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44569321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44573253 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44575151 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44581694 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44582650 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44584478 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44584539 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44587077 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 44587467 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 44588023 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44588608 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44589240 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44589754 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44589932 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44590171 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44592771 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 44593426 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44593626 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44596845 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44598179 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44600672 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44602178 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44603041 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 44603444 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 44603756 C A Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 44605171 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44608283 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44608565 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44608923 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44609889 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44611131 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44611718 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44614011 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44614209 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44614267 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44614719 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44619257 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44621664 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 44624572 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44626405 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44631362 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44632483 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44633289 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44633303 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44634328 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44636104 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44637412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44639257 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44642231 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44652248 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44654823 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44658807 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44662238 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44662999 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44663916 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44664338 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44664813 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44665137 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44665240 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44666719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44671335 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44671446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44673291 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 44673583 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44673832 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44680163 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 44681823 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 44688614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44688763 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44689647 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44694767 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 X 44694922 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44696270 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44696697 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 44700260 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44707158 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44707379 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44707716 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44707949 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44715392 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44716367 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44717936 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44718084 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44719050 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44719894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44721471 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44723777 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44726566 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44732325 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44733991 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44738605 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44745434 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44745602 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44747943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44750702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44751587 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 44752877 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44760209 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44763779 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44766014 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44767717 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44769767 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44782062 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44783448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44784209 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44785680 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44787825 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44788596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44799903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44815589 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44816147 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44816447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44817216 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44818267 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44818388 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44818417 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44819074 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44823383 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44823504 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44826318 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 44827457 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44829676 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44829967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44831551 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44832248 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44832967 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44837318 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44837850 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44838335 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44838518 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 44838786 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 44839037 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 44839114 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 44839315 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 44839342 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 44839565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44839764 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44840205 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44840454 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44840508 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 44840550 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 44840574 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 44840636 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44840668 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44840944 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44842183 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 44843916 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 44843980 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44844144 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44844318 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44844985 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44845155 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44847450 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44850120 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44850445 G A Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 X 44854824 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 44855741 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44863682 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44868811 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44868879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44869580 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44879740 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 44882565 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44885723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44887005 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44887069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44888803 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44889044 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44892226 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44892240 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44892924 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44892978 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 X 44895688 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44896299 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 44897108 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44897260 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44898034 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 44898687 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44898742 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44898958 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 44899556 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44899758 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44900438 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44902836 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 44904069 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44904624 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44905088 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44911597 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44915075 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44915532 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 44916101 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 44916139 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44916491 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 44916829 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44917150 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44918927 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44920955 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 X 44923220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44923390 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44924706 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44929094 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44931969 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44932149 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44935907 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44939289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44950452 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44956657 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44957220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44966266 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 44968669 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44969547 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44970026 T C Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 X 44970143 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44970471 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44973261 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44976816 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44977618 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44977738 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 44978444 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44979182 G A Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.647058823529412 0.117647058823529 0.235294117647059 24 10 11 2 4 X 44980495 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44980538 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 44981791 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 X 44983125 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44989897 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 44993491 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44996488 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 44997783 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 44998794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45003790 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 45011306 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45013234 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 X 45014359 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45014365 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45015123 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 X 45015568 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45015982 A G Y Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 X 45015995 A G Y Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 X 45016000 G A Y Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 X 45016737 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45016873 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 45016877 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 X 45017047 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45017093 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 X 45017427 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 X 45018149 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 X 45018205 C T Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 X 45018234 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 X 45018897 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 X 45019167 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45019536 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 45019650 C G N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.235294117647059 0.117647058823529 0.647058823529412 10 24 4 2 11 X 45019678 A T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 X 45019878 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 X 45019892 C A N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 10 22 4 2 10 X 45019975 A G N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.214285714285714 0.0714285714285714 0.714285714285714 7 21 3 1 10 X 45019989 G A N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.214285714285714 0.142857142857143 0.642857142857143 8 20 3 2 9 X 45020074 G A Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 X 45020099 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 45020252 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 X 45020300 T C Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 X 45020384 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 45020396 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 X 45020442 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45020479 A G Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 X 45020589 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 X 45020834 A G N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.166666666666667 0.0833333333333333 0.75 5 19 2 1 9 X 45020874 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 45021033 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 X 45021056 T C Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 X 45021164 A T Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 X 45021308 C T N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.214285714285714 0.0714285714285714 0.714285714285714 7 21 3 1 10 X 45021319 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.266666666666667 0.133333333333333 0.6 10 20 4 2 9 X 45021360 A T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.235294117647059 0.117647058823529 0.647058823529412 10 24 4 2 11 X 45021398 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 X 45021555 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 45021576 T C Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 X 45021601 C G Y N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 X 45021688 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.1875 0.0625 0.75 7 25 3 1 12 X 45021768 A C Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 X 45021855 A G Y Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 X 45021891 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 45021996 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 X 45022554 A T Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 X 45022761 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 45022776 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 X 45023515 A T N N 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.272727272727273 0.0909090909090909 0.636363636363636 7 15 3 1 7 X 45023587 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 X 45023640 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 45023913 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 X 45024060 G A Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 X 45024692 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 X 45024709 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 X 45025965 C A Y N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.235294117647059 0 0.764705882352941 8 26 4 0 13 X 45026250 A G Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 X 45026264 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45026332 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45026479 A G Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 X 45026565 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45026571 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45026572 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45026608 A C Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 X 45028002 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 45032318 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45034741 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45035019 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 45036559 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 45038243 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 45041576 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 X 45042409 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45050584 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45050624 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45050681 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45050747 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 45050892 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45050986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45050997 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45051114 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 X 45051335 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45051398 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45051767 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45051776 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45052177 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45052531 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45057478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45065785 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45065931 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 45066955 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45068428 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45071854 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 45072964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45073477 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45073714 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45080546 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 45082412 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45082456 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45082702 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 45082889 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 45083167 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45083969 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 45084033 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45084940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45085765 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45088499 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45097699 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45104757 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 45110951 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45111038 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45111057 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45111060 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45111080 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 45111538 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 45112185 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45113407 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45118117 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45123122 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45128537 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 45129325 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45129881 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45131545 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 45137520 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45137896 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 45138561 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45139519 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45140047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45140220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45140545 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 45154554 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45156627 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45160731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45162524 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45164056 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45165954 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 45166059 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45174767 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45175079 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45177325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45179185 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45179584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45181484 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 45181864 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 45182638 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45185085 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45190269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45190849 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45196300 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45200407 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45200432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45203021 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45203225 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 45209216 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45210653 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 45214870 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45216691 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45229947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45230750 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 45233384 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45235608 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45236151 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45245127 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 45246671 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45252822 A T N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 45252895 A G N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 45253137 A T N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 45254622 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45255232 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 45255862 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45258101 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45261491 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45261818 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45265539 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45270073 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45271446 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45280268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45281477 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45283877 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45285316 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45286286 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 45287528 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45287801 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45289131 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45291179 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45291687 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45291852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45293199 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45308332 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45312146 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45312153 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45315421 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45317128 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45323742 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45324140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45326203 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45326493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45326807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45328217 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45328954 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45335934 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 45338529 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 45341437 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45341692 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 45342656 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45342757 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 45343790 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45344658 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45346025 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45346061 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 45351131 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 45351333 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 45351517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45352096 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 45353442 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45355239 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45358771 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 45359703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45360346 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45362612 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 45362684 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45362934 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45362943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45363487 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45364977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45365878 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 45366008 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45366067 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 45366271 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45366670 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45368781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45369452 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 45371505 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 X 45373244 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45375192 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45375490 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45375975 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45375986 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 X 45377167 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 X 45377588 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45377736 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45377737 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45380062 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45381265 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 45381422 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45381763 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45381774 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45382374 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45382442 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45389488 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 45390410 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45390516 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 45390538 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 45390540 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45391246 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45391430 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 45391446 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45392148 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 45393473 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 45393963 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 45394227 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 45394327 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 45394445 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 45394595 T A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 45394729 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45395110 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 45396436 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 45396482 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 45397024 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45397486 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45398133 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 45398201 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 45398466 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 45398601 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 45398715 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45399034 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 45400243 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 45400525 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 45400738 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 45401711 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45404053 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45407455 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45408815 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45411081 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 45411091 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45411248 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45412667 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45413825 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45415692 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45415741 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45416231 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 X 45416374 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 X 45422414 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45422665 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45426073 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45426389 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 45426393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45427364 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45428292 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45429540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45429575 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45446629 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45447282 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45447666 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45449744 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45450674 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 45451139 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45451565 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45451816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45452400 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45452445 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 45452710 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45452735 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45452766 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45452821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45454185 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45454201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45454612 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45455065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45455190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45455285 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45455299 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45458271 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45458660 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45461005 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 45461749 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45465264 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45466731 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45470077 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45472928 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 45473033 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 45473349 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 45474948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45476359 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 45479168 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 45479170 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 45479181 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 45479209 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 45479224 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 45479231 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 45479252 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 45479284 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 45479514 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45479515 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 45479831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45480570 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 45482086 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45482274 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45482839 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45485302 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 45485734 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45487377 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 45487452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45487587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45491164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45491301 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 45491766 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 45491802 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 45496226 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45496381 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 45496553 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 45496693 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 45497068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45498392 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45498689 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45499291 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 45499330 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 45500548 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45500821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45501030 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45502408 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45509317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45511848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45514635 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45516145 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45517666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45517798 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45517835 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45519060 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45519914 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45522141 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45522517 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 45522526 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 45523801 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45525854 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45526614 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45526973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45530940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45531202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45532708 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 45539352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45540670 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45541371 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45541513 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45541802 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 45545956 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45548379 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45549546 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45550072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45552347 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 45552802 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 45553901 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 45554101 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 45554941 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 X 45554969 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 X 45556710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45559817 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 45563999 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 45564471 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45564892 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45565095 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 45565408 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 45566120 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 45566404 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45567261 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45568592 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45569647 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 45569760 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 45569951 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45570912 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 45571170 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 45572522 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 45572685 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 45573544 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45573586 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45575621 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45575905 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 45576248 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 45578132 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45578711 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45581917 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45582155 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45582165 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 45582414 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45583465 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45586040 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 45586285 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45586503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45586648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45587762 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45588328 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45589173 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45589445 T C Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 X 45589543 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45589751 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45592124 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 45592322 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 45593136 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 45593984 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45595284 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 45596014 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 X 45596021 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 X 45596107 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 45596398 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 X 45596755 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 X 45596773 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 X 45596988 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 X 45597171 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 X 45597516 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 X 45597646 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 X 45597684 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 45597798 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 X 45597853 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 X 45597995 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45598113 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45598134 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45598358 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 45598364 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 45599325 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 X 45599489 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 X 45599573 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 X 45600456 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45603810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45603977 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45606082 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45607035 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 45609845 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45610027 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45610318 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45611267 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 45611868 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45612323 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45613280 C T N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 X 45613435 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45614397 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45615405 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45616998 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45618013 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45618254 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 45619671 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45621320 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 45623080 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45623789 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45625168 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45625599 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 45626589 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45627246 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45627870 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45628804 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45629196 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45629649 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45630575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45630592 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45630712 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45631264 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45632342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45632750 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45633076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45633339 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45633798 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45636044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45636199 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 45636363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45637139 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 45639920 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45640544 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45641416 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45643640 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45643830 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45646460 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45646725 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45646735 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45648774 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45648894 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45649948 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 45649963 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 45649964 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 45650022 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 45650422 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45650477 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45651376 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 45651739 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45652451 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45652663 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 X 45653631 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45654870 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 45655083 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 45655380 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 45655674 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45655708 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 45655822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45655829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45655922 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 45656461 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45656734 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 45656736 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45656737 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45660261 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45662684 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45663434 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45665349 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45665435 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45666880 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45668420 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45673111 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45675385 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45679888 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45680300 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 45680570 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 45680707 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45680870 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 45681904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45682065 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45682260 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 X 45684404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45684483 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 X 45685260 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 45686741 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45687863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45689352 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45689374 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45691436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45692183 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45693116 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45693428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45705106 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 45705291 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45707318 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 45708021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45709763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45710620 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45712874 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45712975 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 45713492 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45717390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45725003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45728530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45728572 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45729255 C G Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 45729479 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 45730688 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 45731721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45732111 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 45732221 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45732594 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45733488 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 X 45734539 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45734653 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45734664 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45734703 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45735071 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45737486 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45738729 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45739018 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 45739159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45740443 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45741091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45742707 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45751847 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45753166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45754076 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45757624 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45758548 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 45758842 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45761903 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 45764927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45765575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45765715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45769977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45771528 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45776862 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45779955 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45784332 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 45785852 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45787160 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45789975 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45793659 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45799742 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 45800407 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45805036 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45805418 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45805441 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45811152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45815233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45815644 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45820032 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45822314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45825524 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45827882 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45827913 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45836819 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45848274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45854404 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45865612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45881626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45888631 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 45890659 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45891311 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45891678 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45895299 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45896520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45898127 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 45900823 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45903891 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45905186 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 45905763 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 45906642 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45908876 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45910578 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 45922335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45935430 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45937037 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45938501 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45939519 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45948105 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45950354 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 X 45954846 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45970801 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 X 45974116 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45980063 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 45982080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45987192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45991191 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 45991245 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 X 45992245 T G N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 X 45992518 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45993603 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45993999 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45994092 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 X 45994567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45994616 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45995319 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 X 45995520 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 X 45995891 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 X 45995919 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 45996081 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45996084 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45996249 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 X 45996397 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 45996400 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45996465 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 X 45996742 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 X 45996894 T C N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 X 45996895 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 X 45996902 G A N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 X 45996923 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 X 45996942 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 45996947 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 45997035 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 X 45997141 G T N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 X 45997231 A C N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 X 45997276 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 X 45997279 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 X 45997299 T G N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 X 45997538 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 X 45997780 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 X 45998178 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45998649 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 X 45998870 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 X 45999263 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 45999284 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 X 45999454 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 X 45999506 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 X 45999549 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 X 45999678 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 X 45999730 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 X 46000247 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 X 46000309 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46013113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46014518 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46021120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46028396 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46033036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46044817 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46051762 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 46072378 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46077484 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46082042 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46098720 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46100550 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46100689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46132629 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 46135008 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46139602 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46145189 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46148154 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 46157870 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46169595 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 46175121 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46185914 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 46199218 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46206187 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46209965 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46216264 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46231633 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46235791 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46238962 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46248257 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46248749 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 46249678 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46249859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46250273 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46250276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46252405 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 46253869 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46254444 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46254975 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46255825 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46258886 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 46260818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46260919 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46261569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46261690 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 46262321 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 X 46262814 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46264131 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 46264154 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46264163 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46264464 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 46264486 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 46264695 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 46266715 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46266853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46266961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46267262 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46267520 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46267640 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46267686 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 46267935 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 46267979 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46268092 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46268217 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46268234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46268328 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46268393 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46268496 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46268910 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 46268914 G C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 46269498 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 46269558 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 46269592 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 46269704 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46270254 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46270418 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 46270545 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 46270554 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46271067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46273317 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 46273427 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46273583 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46273640 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46273689 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 46273936 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 46274127 G T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 46274213 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 46274472 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 46274592 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 46274658 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46274689 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 46274701 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 46274727 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 46274758 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 46274875 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 X 46276700 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 46276764 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46277684 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 46277887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46277932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46279548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46284115 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46285591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46285609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46286649 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 46287213 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46287230 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46289918 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 46290070 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 46291191 T G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 46292059 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46292170 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46293938 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 46293948 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46294084 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 46294338 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46294509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46296237 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 46297094 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 46297763 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 46298320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46298922 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 46298957 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 46299443 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46300187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46301709 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46301805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46305175 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46305474 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 46305985 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46306412 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 46309910 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46310452 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46310568 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46310721 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46310788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46310896 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 X 46310949 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 46310976 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 46311166 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46311181 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 X 46311520 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 46311769 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 46312021 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46312049 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46312089 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46312148 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 46312184 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 46312243 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 46312301 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 46312362 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46312387 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 X 46312425 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 X 46312473 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 X 46312474 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 X 46312531 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 46312534 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46312620 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 46312622 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 X 46312637 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46312801 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 46312841 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 46313181 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 46313523 G A N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 46313593 A T N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 46313753 G T N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 46313788 C G N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 46314290 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 46314766 C G N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 46325535 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 46326125 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 46326221 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 46326243 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 46326316 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 46326347 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 X 46326448 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46326560 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46326579 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46326596 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46326701 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 46326778 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 X 46326958 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 X 46326999 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 X 46327382 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 46327406 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 X 46327751 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46327759 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46330246 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46330348 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46330722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46331279 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46331646 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46333002 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46335304 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46336425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46337924 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46343724 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46344004 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46344999 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46345535 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46346046 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46348237 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 46348330 T A N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 X 46349485 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 46349976 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46350152 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46351438 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46352351 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46352764 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46352922 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46353872 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46354522 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46355716 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46357506 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46357986 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46358343 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46358715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46358843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46359600 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46359849 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46359926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46362372 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46363568 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46375078 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46381541 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46381610 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46382207 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46382221 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46384752 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46385345 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46387092 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46389499 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46390031 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46390222 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46391579 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46403492 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 46414266 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 46422141 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46424643 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 46424877 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 46425006 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46425046 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46425178 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46431315 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46433772 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46441746 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 46442632 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 46443468 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46446744 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 46446865 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46450706 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 46450867 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 46450938 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 46452205 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 46464029 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46467735 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 46468846 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46469145 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46469317 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46469609 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46472899 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46473595 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46474693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46475827 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46478260 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46478852 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46480212 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46481102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46482155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46486905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46488101 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46488812 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46489536 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 46491146 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46491167 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46491357 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 46491378 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 46491853 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 46492002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46493079 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46494085 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 46498029 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 46500614 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46501271 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46501652 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46502436 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 46502958 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 46504807 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 46505912 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46514656 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46515006 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 46518716 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46519884 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46522201 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46536980 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46538119 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46538503 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 46541718 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46541807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46550109 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46555427 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46565367 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46565560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46571715 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 46573514 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46574803 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 46574820 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46574945 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 46574946 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 46574977 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 46574989 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 46574993 G T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 46575007 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 46581557 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 46586201 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46588028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46593145 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 46594154 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46599217 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46601256 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 46604286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46607643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46608040 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46608236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46608639 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 X 46609116 G T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 46609125 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 46609864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46612610 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46613450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46613638 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46614077 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 46615589 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 46616908 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46617295 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46617689 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 46617732 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46617740 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46617752 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46617769 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46620454 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46621071 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 46622780 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46631144 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 46632989 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46634189 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46634451 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 46634452 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 46636118 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 46636581 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46638530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46641817 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 46642854 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46646137 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46663632 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46671974 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 46677529 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46677604 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 46682014 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46693444 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46699667 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 46722087 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46723966 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46725510 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46727857 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46732621 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46735999 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46736198 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46738350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46740564 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46740621 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46741400 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46741404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46741452 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46742099 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46743234 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46747350 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46749125 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 46752760 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 46754683 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46759473 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 46763701 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46765189 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46767709 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46769946 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46771534 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46773858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46774333 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46777507 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 46777674 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 46777953 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46803356 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46804675 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46805556 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46806652 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46806826 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46810275 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46812721 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46814755 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 X 46815671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46818918 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46819775 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46821696 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46824740 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46828513 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46828861 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46829478 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 46831811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46838819 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 46839778 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46843480 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46844401 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46845133 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46845989 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 46847137 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46850395 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46851809 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46853036 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46855721 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46855760 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46857172 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46862597 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46864128 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46864430 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 46864932 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46866387 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46867466 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46868312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46868313 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46872950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46874677 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 46876439 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46876594 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46879071 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46879563 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46881382 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46889029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46889067 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46891956 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46895514 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 46898692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46899235 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46899705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46899946 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 46902127 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 46903761 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 46905689 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46906935 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 46908243 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46911695 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46928644 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46929168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46929671 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 46930434 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 46930908 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 46931175 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46933669 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46933976 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46937853 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 46939156 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 46940755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46943681 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46947112 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46947125 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46952662 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46952766 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46953289 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46953920 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46954013 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46954695 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46956543 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46970603 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 46974061 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46978256 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46979703 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46981488 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46983476 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46986737 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46986790 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 46988320 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46989748 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 46992666 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 46995767 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 46996077 T C Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 46998632 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47000176 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47007251 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47007495 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47007954 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47009420 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47017236 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 47017703 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47017800 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47023488 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47024515 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47028699 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47030038 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47030988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47031970 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47033208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47034152 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47034856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47035426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47036349 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47038062 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47038128 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47040592 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47041491 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47041517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47041811 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47043655 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47043688 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47044473 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47046050 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47054269 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47056994 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47058989 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47059687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47060257 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47061386 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47063278 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 47063700 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47064062 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47073176 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 47075568 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47076331 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 47078350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47080090 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47081252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47082069 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47084723 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 X 47088201 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47089758 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47090179 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47091705 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47093605 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47097204 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47100068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47100538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47103819 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47105386 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47105805 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 47110194 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 47111108 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 47111464 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 47112692 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 47115637 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47115875 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47117273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47117374 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47118289 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47118846 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47119737 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47120996 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47123469 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47126543 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47126861 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47127671 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47127672 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47128483 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47134718 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47136027 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47137512 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47139145 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 47140124 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47141667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47144747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47146093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47146755 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47147622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47148376 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47148506 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47150571 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47150886 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 47150977 G C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 47152471 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47152887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47155950 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47156092 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47162106 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 47162617 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47163694 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 47165480 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47165882 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47167362 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47170894 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47171572 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47171919 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47175606 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47176516 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47176526 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 47177495 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47177772 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47178608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47179072 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47180327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47180354 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47181179 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 47181279 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47181555 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47181586 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47181721 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47183196 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47184111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47186366 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47187963 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47190080 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 X 47194405 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 47194898 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47195551 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47196296 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47196725 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47198072 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47200527 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 47200563 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 47200675 T A N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 47203691 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47204157 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47204594 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47205194 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47206272 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 47206734 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 47207135 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47207427 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 47209886 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47209906 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47211122 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47211788 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47212353 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 47212455 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47213965 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47214139 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 47214802 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47215103 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47215474 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47226457 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47226894 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47228269 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47229243 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 47229265 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 47230805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47235390 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47242576 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47245532 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47247192 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47248094 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47251673 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 47255293 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 47257127 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 47263982 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47270414 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 X 47271836 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47272948 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47273234 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47274287 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47274999 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47281513 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47281569 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47282093 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47284403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47288713 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 47289012 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47289148 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47289293 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47289624 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47292158 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47293388 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47294363 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 47296657 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47297114 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 47297164 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47297594 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47298353 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47298630 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47300995 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47301061 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47302747 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 47303190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47310424 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 47310504 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 47311064 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 47311947 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47313630 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47313637 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47313882 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 47314039 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 47316756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47317352 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47318666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47318873 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47318891 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47322541 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47322874 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47323337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47323555 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47323981 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47325453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47325630 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47326493 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 47326513 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47327396 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47327648 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47328120 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 47328229 A G N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 47334727 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47335703 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47335824 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 47336147 T A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 47337024 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47339198 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 47339333 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47339868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47343856 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 47344096 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 47345340 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47348383 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47358402 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47358403 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 47358719 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47359645 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47359756 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47360798 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47361132 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47362357 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47363414 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47366766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47367279 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47367907 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47371247 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47371490 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47372493 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47374890 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47375578 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47375876 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47376151 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47376180 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47376301 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47376333 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47379465 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47379875 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47382736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47383431 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47384305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47388048 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47388053 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47389250 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47389327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47390589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47391551 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 47391753 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 47391779 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 47391950 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 47393174 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47394047 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47394692 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47394740 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47395600 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 47398451 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47399017 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47401273 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47401880 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47402242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47403339 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47403496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47404756 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47405476 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47406725 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47407255 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47407274 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47407466 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47407570 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47407573 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47407911 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47414643 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47416083 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47417447 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 47417481 A C Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 47419795 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47420863 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47422087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47422301 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47422303 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47424281 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47424415 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 47424646 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47425310 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47426501 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47427041 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 47427186 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47430250 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47432376 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47432761 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47444003 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47447404 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47447567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47447809 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 47449787 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47450334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47451120 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47451489 A G Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 47452106 A T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 47452905 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 47453208 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47455004 T G Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 47457454 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47458367 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47459471 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47461450 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47462164 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47463831 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47464381 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 47464497 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47467069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47467892 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47468526 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 47468860 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 47469789 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47470122 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47472361 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47474178 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47474179 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47474184 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47474365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47475262 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47478159 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47478612 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47481211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47483935 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47484043 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47488386 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47489257 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47490120 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47493028 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47495081 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47496281 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 47497309 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47499094 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47502615 C G Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 47502616 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47502800 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47503983 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47504887 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47504895 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47505453 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47505915 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47506818 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47507462 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47508193 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47510550 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47519182 C G Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 47519637 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47520093 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47520439 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47523283 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47526959 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47529345 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47532026 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 47532272 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47532336 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 47532737 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47532895 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 47533078 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 47540831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47541427 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47541794 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47541972 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47543269 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47543519 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47547442 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 47549344 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47549835 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47550202 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47550393 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 47551896 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 47552008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47552094 T G Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 47552706 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47553128 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47554358 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47554485 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47554731 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47555027 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47559401 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 47560079 A C Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 X 47560609 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47561603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47562242 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47564634 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 47572419 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 47572602 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47573418 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 47573724 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 47573759 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47575072 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 47575450 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 47578338 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47579740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47579781 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47580091 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47585145 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47586013 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47588747 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47588978 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 47589063 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47592178 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47593795 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 47594845 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47595697 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47596656 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47600299 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 47600876 A G N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 47607140 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47608162 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 47608349 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47610106 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 47610444 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47611106 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47611888 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47613171 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47613843 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47617931 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47618971 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 47622516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47624038 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47624184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47624246 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47624871 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47625668 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 47626407 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47629050 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47631664 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47639979 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47643857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47647479 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 47648842 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 47649710 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47652730 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47652999 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47654582 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47656920 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47657939 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47662863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47663317 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47663576 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47664067 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47666396 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47666952 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47667463 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47667532 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47667710 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47668923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47669053 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47669423 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47670042 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47670498 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 47670877 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47672106 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47673088 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47673233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47673388 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47674303 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47676088 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47677513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47680308 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 47680435 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47681688 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47682378 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47682777 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47682962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47683195 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47683230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47683268 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47684448 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47685025 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47686100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47687262 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47690345 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 47692799 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47693382 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47693407 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47694052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47694664 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 47694805 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47701362 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 47702112 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47703857 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 47704704 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 47705027 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47706227 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 47706250 A G Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 47706857 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47707062 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47707794 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47708802 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47708966 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47708973 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47709019 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47709140 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47709371 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47710138 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47710190 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47711355 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47712629 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47712974 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47713455 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47714031 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47714254 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47714967 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 47715468 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47715822 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47717961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47722784 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47724546 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47724633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47724723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47724828 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47724910 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47725191 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47725246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47725570 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47726009 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47726068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47726758 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47726986 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47727002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47727166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47730377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47730389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47730847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47733411 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 47733857 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47734123 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47734849 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47742303 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 47751655 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47753628 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47754100 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47754388 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47754594 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 47758147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47759444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47759981 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47761892 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47765367 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47765594 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47765668 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 47772399 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47774658 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 47775404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47775821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47776003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47776314 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47776997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47778214 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47779375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47779474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47779932 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47780175 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47780433 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47780788 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47782684 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47782890 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47783739 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47784509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47786949 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47786969 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47787091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47788136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47790378 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 47791344 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47792263 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47792486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47794271 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47794718 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47795374 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47796931 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47798950 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 47800030 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47800736 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 47801049 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 47802916 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47803936 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47804545 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47804957 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47805563 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47806726 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47808322 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47809943 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47810924 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47811541 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 47811691 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47811733 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47813264 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47820802 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47822120 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47822602 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47823823 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47824458 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47825740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47826468 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47826473 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47827344 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 X 47827640 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 47828588 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47829215 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47830950 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47831532 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47833251 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47833694 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47834234 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47836088 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47837302 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47840166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47840235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47841296 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47844410 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 47845934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47846519 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47846903 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47848298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47849891 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47853031 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47854572 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47854624 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47858216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47864597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47872148 A C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 47873466 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47880305 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47883796 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47885039 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47885685 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47885757 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47885821 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47892305 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47894010 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47894137 G C Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 47895263 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47895417 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47897714 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47901453 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47905207 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 47908239 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47908648 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47909353 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 X 47909356 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 X 47909359 G T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 47910178 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47910573 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47910794 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47911112 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 47911247 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47911818 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47912828 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47913824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47913867 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47914307 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 47915219 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47915318 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47915426 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47916651 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47918488 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47918560 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47918582 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47918690 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47919217 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47920295 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47921500 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47922934 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47928156 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47928197 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 X 47929694 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47929908 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47929964 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47930278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47930511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47933153 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 47933169 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47934145 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 47936144 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 47937658 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47937940 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 X 47939538 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 47939810 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47939896 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47942708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47943171 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47945203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47945779 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47947711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47947909 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 X 47950124 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47950542 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 47950552 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47950563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47950873 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47960743 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47960864 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47965038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47971213 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47971484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47973037 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47973186 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47974512 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 X 47975078 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47975666 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 47977923 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47978006 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47978427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47979082 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47979595 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 47979996 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 47982075 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 X 47983816 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 47992265 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 47993105 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 47994937 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47997294 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 47999503 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 48001656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48001838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48001937 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48002251 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 48008335 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48013301 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48014605 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48014932 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48014984 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48015710 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48015971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48017964 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48018314 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48019234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48021691 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48024634 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48026660 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48027436 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 48029172 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 48032000 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48032413 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48032630 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48036356 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 48036582 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 48036583 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 48036584 C A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 48036609 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 48039555 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48040172 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48040987 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48045535 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 48046211 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48046555 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48048014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48048779 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48049153 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48051423 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48052046 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 48052072 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 48058674 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48060829 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 48061387 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48061744 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48064242 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 48064503 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48065589 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48066906 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48067348 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 48068084 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48069435 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48069994 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48071663 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48071664 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48073098 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48074644 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48075849 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 48076521 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48076667 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48077214 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48078321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48079538 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48082299 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48083912 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48084381 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48085163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48088186 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48090525 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 48090893 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48093562 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48093678 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48094876 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48098273 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48099100 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 48106494 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48107230 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48109117 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 48109474 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48109957 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48111559 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48112159 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48113029 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48117021 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48119075 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 48119895 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48128639 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 48134954 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48135129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48136066 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48136915 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48139155 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48140179 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48140394 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48142733 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48142734 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48144484 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48144579 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48144667 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48148056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48151698 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48160239 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48160340 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48160535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48162728 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 48171872 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48173953 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 48173998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48174169 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48174235 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48174348 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48174794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48174902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48174920 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48176843 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48177935 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48179781 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48180390 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48180549 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48180953 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48181739 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48182195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48183058 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48183521 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48183806 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48184248 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 48185106 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48185407 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 48186950 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48188697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48191873 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48196908 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48197732 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48198086 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 48198137 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48203413 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48205631 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48207956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48210976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48211933 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 48212395 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48213814 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48214167 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48214877 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48215145 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 48215771 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48216542 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48216653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48216954 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 48216995 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48217798 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48218414 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48218435 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48218589 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48218775 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48221868 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48223793 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48223794 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 48224192 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48225334 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48226823 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48235614 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48239067 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48240752 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48241805 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48241835 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48242665 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48244169 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48247198 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48247440 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48247453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48248042 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48249371 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48250152 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48251662 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 X 48252399 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48252716 C A Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 X 48252804 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48253015 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48253578 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48256229 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48258250 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48258622 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48259336 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48260168 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48262371 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48266589 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48266651 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48267455 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48268274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48269111 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48269708 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48269941 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48270325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48270385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48270858 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48271102 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 48272020 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48272831 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48272871 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48273126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48273421 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48273445 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48273682 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48274723 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48275454 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48275502 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48275579 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48275716 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48276187 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 48276463 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48276509 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48277025 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48277148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48277968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48278492 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48286823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48286989 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48287202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48287749 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48288556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48288659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48288957 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48289017 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48289133 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48289823 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48292264 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48294087 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48294492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48299796 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 48302301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48306393 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48308358 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48311543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48313013 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48313942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48314048 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48317693 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48318599 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48320234 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48320880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48323221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48323615 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48324975 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48325025 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48326665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48326875 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48327754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48328208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48328351 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 48328423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48329465 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48330418 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48336421 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48337354 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48341729 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 48343585 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48343674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48343915 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48343950 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48345837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48348321 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48350984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48351651 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48352083 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48354261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48354803 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48355307 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48355837 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48357248 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48364233 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48367691 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48370423 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48375070 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48377355 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 X 48378092 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48384495 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 X 48387537 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48392820 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48393097 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48394440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48397842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48399508 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48405904 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48407142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48412501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48414640 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48417996 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48418154 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 48418502 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48419023 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48419502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48420841 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48422513 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 48422561 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48424163 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48424290 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48429396 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48430547 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48432907 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48433900 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48435557 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48438136 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 48439954 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48440409 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48444108 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48444144 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48444520 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 48445011 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 48445023 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 48445161 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 48445338 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 48445373 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48445553 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48445660 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 48445776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48445910 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48446102 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 48446194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48446615 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48446990 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 48447355 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 48447370 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 48447403 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 48447427 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 48447721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48447743 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48447747 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 48447838 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 48448165 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 48448808 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48450529 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 48451330 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 X 48452694 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48454398 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 48454646 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48456092 T C N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 48457174 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48457989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48461586 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48462019 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48462465 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48462801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48466313 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48467082 A C Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 X 48472044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48473137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48473811 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48474718 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48476288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48477809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48479345 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 48479908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48483910 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48484305 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48484516 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 X 48492871 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48493181 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48493299 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48494397 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48496042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48496252 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48497182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48499505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48499830 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48499935 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48500275 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48502909 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48509516 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48510122 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48511257 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 48516961 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48516996 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48520074 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 48520192 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 X 48520924 T C Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 X 48521100 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48521456 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48521501 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48522502 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48522511 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 48523914 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 X 48524123 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48524746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48531221 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 48533807 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 48533851 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 X 48534292 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48535213 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48535884 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 X 48536967 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 X 48537195 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 48537282 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48537723 G C N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 X 48538022 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 X 48538515 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48539570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48540575 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48544900 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48545984 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48546619 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48546620 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48547582 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48548671 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48549551 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48550074 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48552728 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48554471 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 48554897 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48556693 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48557171 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48559673 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48560029 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48560581 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48561787 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48565328 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48566664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48568725 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48570069 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 48570319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48574254 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48574283 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48577196 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48579932 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 48583192 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48583370 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48583623 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48586391 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48586893 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48586915 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 48587884 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48589489 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 48590379 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48591567 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48592526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48593246 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48593872 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48593904 C T Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 X 48594567 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 48599359 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48601833 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48602509 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 48604096 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48604182 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48604416 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48605234 C T Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 X 48605417 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 X 48606045 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 48606449 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48606641 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48607265 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48607755 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48615681 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48616088 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48616223 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 48616382 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48616465 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48617173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48617313 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48618410 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 X 48618426 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 X 48618429 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 X 48618444 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 X 48618453 T G Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 X 48621404 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48621462 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48621540 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48623263 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 48631875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48632284 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 48632291 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 48634285 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48636952 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48637300 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48637940 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48638614 C T Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 X 48640185 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48642362 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48644730 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48649558 T C Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 X 48649560 T G Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 X 48649568 A G Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 X 48649662 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.411764705882353 0.176470588235294 0.411764705882353 17 17 7 3 7 X 48650069 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48650099 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48650216 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 X 48650221 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 X 48650360 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 X 48650381 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 X 48650787 T C N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 48651453 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 X 48651580 C G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.388888888888889 0.166666666666667 0.444444444444444 17 19 7 3 8 X 48651727 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48651947 C T N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.4 0.133333333333333 0.466666666666667 14 16 6 2 7 X 48652057 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 X 48654608 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.388888888888889 0.111111111111111 0.5 16 20 7 2 9 X 48656060 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48657945 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 X 48664329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48670925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48674079 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 48674455 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48675434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48676169 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48677361 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48683431 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48683793 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48687167 A C Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 X 48687575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48690548 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 48692078 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48693036 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48696382 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 48696586 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48698468 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48699564 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48699992 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48700735 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48701694 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48703146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48704206 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48710760 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48710882 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48712081 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48712102 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48712775 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48713081 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48715653 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48716209 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48716983 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 48719484 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.611111111111111 0.111111111111111 0.277777777777778 24 12 11 2 5 X 48720288 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48722351 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48722883 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48723611 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48723983 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 48724069 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 48724245 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48724376 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48725685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48727094 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48727916 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48729560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48730963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48730980 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48731068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48731307 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48731946 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48732194 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48732295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48732687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48735955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48735974 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48735984 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48736112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48736575 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48736706 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48736743 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48737247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48737379 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48737432 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48737593 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48738034 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48738186 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48738617 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48738620 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48738660 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48740140 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48740739 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48742070 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48742251 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48744273 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48745181 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48745936 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48745981 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48747319 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48747701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48748222 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48749553 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48749562 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48750780 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48751657 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48752851 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48755122 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48758313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48759163 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48762942 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48764193 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48764513 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48765524 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48766581 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48767854 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 48769004 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 X 48769031 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48769147 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 X 48769305 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 X 48769612 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48770508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48771054 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48771091 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48771644 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48774962 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48776822 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48779131 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48781711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48782340 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48783658 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48783878 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48784660 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48787075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48787089 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48787768 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 48796291 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48797576 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48799573 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48801615 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48802990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48803032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48803152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48803282 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48803384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48804523 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48804548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48806411 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48809694 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48809943 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48809963 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48810309 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 X 48810964 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48811861 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48813063 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48813617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48813637 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48813695 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48813721 T C Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 X 48813831 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 X 48814877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48815323 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48817257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48820033 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48826280 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48829582 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48830405 A G Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 X 48830506 C T Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 X 48830665 T A Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 X 48831203 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48831318 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48831483 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48831530 C G Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 X 48831568 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 48831683 G C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 X 48831911 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48832114 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48832572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48832609 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48832666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48832690 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48832980 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48832993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48833490 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 X 48838299 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48839920 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 48841744 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48842996 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48844374 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48844394 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48845914 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48846984 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48847378 A G Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 X 48847585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48847972 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48848161 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 48848439 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48848485 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48849072 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48849623 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48849876 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48850166 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 48850196 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 48850956 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 X 48851996 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 X 48852153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48852387 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48852393 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 X 48852421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48852695 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48852720 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48852781 C A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 X 48852810 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 X 48855489 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48855947 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48856021 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48856062 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48858103 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 X 48858117 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 X 48858118 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 X 48858133 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 X 48858139 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 X 48858230 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 X 48858381 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 X 48858462 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 X 48859185 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48859530 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 48860524 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 X 48861950 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48864236 G T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 X 48865341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48865866 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48866221 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48866710 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48867443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48868371 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 X 48868415 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 X 48868578 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48868787 T G Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 X 48870214 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 X 48870307 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 X 48870593 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 X 48871099 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 X 48871345 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48871804 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48871843 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48872244 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48872568 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 X 48872851 G T Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 X 48872952 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48873556 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48873729 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48874205 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 X 48874206 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48874267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48875839 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 X 48875892 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48875970 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48876187 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 48876378 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48876535 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48876852 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48877633 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48877876 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48878368 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48878625 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48879710 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 X 48880291 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48881255 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48881592 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 X 48885918 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48888401 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 48888443 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 48888644 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48888681 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48888722 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 X 48889027 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48889121 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48889324 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48889364 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48890123 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 X 48890532 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48890653 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48890669 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48891036 T A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 X 48891276 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 48891668 G T Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 X 48891872 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48894322 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48894414 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48895768 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48895901 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48895928 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48896585 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48896710 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48897592 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48897865 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48898059 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 48898521 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 48898817 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 48899040 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48900907 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48903817 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48905389 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 48908614 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.65 0.05 0.3 27 13 13 1 6 X 48910120 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48914692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48918952 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48919563 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48926337 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48928560 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 X 48928948 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48929012 G T Y N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.294117647058824 0 0.705882352941177 10 24 5 0 12 X 48930144 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48930731 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48931336 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48931558 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48932274 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48932478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48932634 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48933752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48934838 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48937693 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 48940151 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48940932 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 48940943 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 48944635 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48949625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48950054 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48950202 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.3 0 0.7 12 28 6 0 14 X 48951199 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48951274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48952581 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.222222222222222 0 0.777777777777778 8 28 4 0 14 X 48953188 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48956253 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48957471 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48959811 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 48962167 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48964421 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48964678 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48965501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48968102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48968721 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48969170 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48969455 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 X 48969517 C A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 X 48969935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48974843 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 48976112 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 48977261 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48977447 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48978744 A C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 X 48978859 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 X 48981788 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48982286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48982292 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48982335 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48982420 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48983268 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48987619 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48989557 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48990257 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48990406 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 X 48990894 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 X 48991157 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48991179 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48991262 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 48991869 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48992170 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 48992694 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 48992777 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 48993080 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48993089 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 48993182 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 48993430 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 X 48993581 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 48993582 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48993987 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48994045 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 X 48994077 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 48994232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48994345 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 X 48995616 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 X 48995799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 48996935 T A N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.529411764705882 0.176470588235294 0.294117647058824 21 13 9 3 5 X 48997879 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 X 48998158 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 X 48999287 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49000207 A C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.294117647058824 0.117647058823529 0.588235294117647 12 22 5 2 10 X 49000331 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49001540 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 X 49003104 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.235294117647059 0.117647058823529 0.647058823529412 10 24 4 2 11 X 49004040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49005292 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 49005428 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49005500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49005670 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49005882 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49006064 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49006168 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 X 49008855 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 X 49012199 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 49013993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49014155 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49017472 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49018180 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49019498 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 49020616 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49020622 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49021168 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 X 49021742 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49022010 T C N Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.363636363636364 0.0909090909090909 0.545454545454545 9 13 4 1 6 X 49023339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49023555 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 X 49023720 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 X 49024039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49025012 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 X 49026080 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 49027449 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49029372 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49030155 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 49031240 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49032804 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49039814 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49040314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49040438 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49041432 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 49043090 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49043465 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49050933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49053647 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49055390 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 49055936 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 X 49056293 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 49057558 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49057873 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49058954 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49059584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49061016 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49061398 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49061510 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49064181 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49064532 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49064681 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 49065063 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49065916 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 49066257 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49067448 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49067464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49067758 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49068098 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49071168 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 49073993 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 49077056 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49077184 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49091552 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49093068 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49093137 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49104551 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49104716 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49106880 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 X 49107304 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 X 49107769 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49111977 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49112485 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49112693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49113486 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49119741 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 49119742 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 49122661 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49122917 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49123265 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 49125333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49125818 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49126483 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49126635 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 X 49126733 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49127292 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 X 49128901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49129667 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 49129990 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49130245 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 X 49130525 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 X 49130813 T C N Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.625 0 0.375 10 6 5 0 3 X 49131510 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49131573 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49131639 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49131678 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 49131696 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 X 49132036 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 X 49132097 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 49132340 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 49133631 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.176470588235294 27 7 13 1 3 X 49134625 T C Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 X 49134842 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49135401 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49135698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49136111 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 49136149 A T Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 49136989 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 49139748 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49139860 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49140008 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49140130 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49141722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49142228 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49142397 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 X 49142914 G A N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 X 49143106 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 X 49144186 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 X 49145160 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 49145315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49145840 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49146675 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 49149641 C G N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 49153172 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49153625 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49154498 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 49156111 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 49161503 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 X 49164014 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 49164915 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 49165331 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 49168049 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 49168863 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 49170457 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 49177943 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.176470588235294 0.0588235294117647 0.764705882352941 7 27 3 1 13 X 49178319 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 X 49178361 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.176470588235294 0.0588235294117647 0.764705882352941 7 27 3 1 13 X 49178583 C T N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.230769230769231 0.0769230769230769 0.692307692307692 7 19 3 1 9 X 49178726 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 X 49179072 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49180589 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 X 49181576 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 X 49181794 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 X 49181795 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 X 49182114 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 X 49183479 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49184390 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 49184393 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 X 49184404 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 X 49184536 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 X 49184592 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 X 49184782 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 X 49184851 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.1875 0 0.8125 6 26 3 0 13 X 49185111 G T N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.1875 0.0625 0.75 7 25 3 1 12 X 49185349 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 X 49185385 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 X 49185392 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 X 49185446 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 X 49185463 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 X 49185872 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 X 49185914 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 X 49185935 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 X 49185943 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 X 49185972 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 X 49186040 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 X 49186046 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 X 49186077 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 X 49186116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49186406 A G Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.1875 0.0625 0.75 7 25 3 1 12 X 49186528 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.1875 0.0625 0.75 7 25 3 1 12 X 49186622 T C Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 X 49186644 T A Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 X 49186647 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 X 49186662 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 X 49186689 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 X 49186846 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 X 49186918 T A N N 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 4 8 2 0 4 X 49186982 A C N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.1875 0.0625 0.75 7 25 3 1 12 X 49187502 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 X 49187622 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 X 49187654 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 X 49187663 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 X 49187700 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 X 49187854 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 X 49187874 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 X 49188121 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 X 49188179 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 X 49188190 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 X 49188324 C A Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 X 49188351 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 X 49188460 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 X 49188473 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 X 49188510 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 X 49188542 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 X 49188565 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 X 49188626 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 X 49188635 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 X 49188700 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 X 49188756 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 49188819 A T Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 X 49188884 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 X 49188887 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 X 49188898 G A Y Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 X 49188914 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 X 49188968 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 X 49188980 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.176470588235294 0.0588235294117647 0.764705882352941 7 27 3 1 13 X 49189039 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 X 49189079 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 X 49189088 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 X 49189124 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 X 49189150 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 X 49189218 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 X 49189234 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 X 49189256 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 X 49189277 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 X 49189334 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 X 49189366 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 X 49190232 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 X 49190858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49191127 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 X 49191274 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 X 49191403 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 X 49191965 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49192552 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 49192903 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 49193006 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 X 49193260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49193272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49193527 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49193667 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49198511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49199324 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49200917 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49205420 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 49210116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49210248 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 49211659 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49211989 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 49214799 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49217409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49218531 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 49218574 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49220435 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 X 49220464 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49222754 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49222771 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49222847 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49223539 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49224205 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49224618 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49224784 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49227442 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49232537 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 49233522 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 X 49233712 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49233742 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 X 49233916 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49234018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49234478 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 49234634 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 49234639 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 49234670 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 49234774 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 X 49235766 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 X 49235958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49236037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49236456 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49236463 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49237407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49237948 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49240476 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49240840 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49240936 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49240959 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 49241050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49241095 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 49241111 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 49241126 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 49241233 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 49241243 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 49241350 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 X 49241698 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 X 49241712 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 X 49242582 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 49242590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49242668 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 X 49242700 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49245505 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49245546 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49251070 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 X 49253123 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 49254717 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49254836 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 49256000 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49256799 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49257008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49257343 C A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 X 49257586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49257683 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49261276 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49262348 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49262353 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49263891 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49265200 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49265219 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49265785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49265886 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 X 49267141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49267273 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49268198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49268319 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49273304 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49276118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49276240 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 49276869 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49287447 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49287800 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49287844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49288981 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49289269 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 49290699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49290876 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49292139 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49293136 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49293327 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 49293483 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49293729 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49293733 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49294276 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49294286 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49294447 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49294508 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49294535 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49294547 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49294569 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49294759 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 49294790 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 49294799 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 49294879 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 49294904 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 49294988 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 49295594 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 49295654 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 49295937 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 49296662 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 49296874 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 49296890 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 49297206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49297421 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49297464 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49297785 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49297995 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49298830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49300439 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 49300815 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 49302507 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49302635 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49302671 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49302873 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49303343 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49305526 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49305708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49306863 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 49308525 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49310329 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49310385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49311871 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49312179 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49312334 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49312400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49312486 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49313620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49314117 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49314439 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49314880 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49316416 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 X 49316613 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 X 49317226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49318635 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49319533 G A N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 49319896 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49321843 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49321911 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49322904 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49326014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49327042 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49330051 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49330101 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49330762 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 49331624 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 49334643 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49335411 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49335836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49336781 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49338141 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49338158 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49339928 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49339929 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49342955 C A Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 49343981 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49344972 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49346242 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 49351902 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49355601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49358089 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49360395 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 49360921 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49367905 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49369161 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49369195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49370876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49370877 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49373831 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 49377759 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49378096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49378488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49379229 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49379924 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49381839 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49381887 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 49381946 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49385902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49386849 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49392522 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49392692 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 49394777 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 49394807 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 49394933 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 49394951 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 49395036 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49395164 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 49401987 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 49402693 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49403591 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49404549 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 49405050 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49407467 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49408329 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49411400 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 49412504 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49415060 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49415129 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49417372 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49417458 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49419321 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49419539 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49423066 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 49423109 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 49423110 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 49423846 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49425543 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49426118 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 X 49426699 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49427295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49428346 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 X 49428743 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49429658 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49433798 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49434519 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49439327 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 49439675 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 49440272 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49443305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49454533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49460991 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49461076 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 49461518 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49466007 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49466038 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 49469561 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49471130 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49475362 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49477608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49479516 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49481986 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49487410 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 49491736 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 49494089 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 49494555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49494619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49498069 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49498395 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 X 49499445 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49500401 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 49501349 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49505012 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49506264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49506291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49507226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49510285 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49512169 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49512230 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 X 49515476 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49516794 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49518082 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49521607 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49529965 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 49531727 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49532817 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 X 49533821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49534429 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 X 49534530 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49534538 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49535246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49537158 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49538274 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 X 49538359 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 49538370 G A N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.285714285714286 0.142857142857143 0.571428571428571 10 18 4 2 8 X 49538750 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49540276 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 X 49540567 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 X 49542560 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49542948 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49542993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49543196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49544175 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 49544198 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 49544529 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49544656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49546114 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49547876 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49547925 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49548129 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 49556528 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49557586 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49559136 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 49559791 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49561394 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49561531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49562893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49563522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49566500 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49575582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49576769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49578490 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49578559 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49578567 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49579857 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 49585922 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49590281 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 49590324 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49590700 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49595925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49596046 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49600514 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49600673 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49603889 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49606851 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 49606882 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49609960 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49612648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49613784 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 49616416 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49617348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49617796 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49617799 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49617958 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49619246 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 X 49619339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49620045 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49621380 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49621952 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49626883 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49628400 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49628831 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49629511 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49631980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49633432 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49637490 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 X 49639876 T G N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 X 49640763 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 X 49641009 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 X 49642534 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49643116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49643209 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 49643256 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49643429 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 49643651 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49644446 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49644949 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49645916 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49645952 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 X 49646116 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49647520 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49650313 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 49650879 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49652181 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 49652815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49652887 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49656181 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49656261 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49667059 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49667427 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49667602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49669196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49670265 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49671022 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49672919 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49673132 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49675705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49676114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49677201 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49677939 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 49678376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49679036 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49694392 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49696688 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49697987 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49697997 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49702619 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49705845 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49707130 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49707920 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49716928 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 49717348 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 49717396 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49719406 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 X 49721817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49722251 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 49722252 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 49722439 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 49736729 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49737145 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 49738279 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49738993 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49739273 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49740385 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49741932 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49744865 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49744989 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49745254 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49746981 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 49746982 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 49746988 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49749202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49751699 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49753347 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 49763451 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49764568 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49765221 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 49766399 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49769322 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49770246 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49770863 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 49770978 C A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 X 49774624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49775967 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49776067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49779101 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49780884 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49782955 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49785517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49785648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49785884 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49788544 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49790140 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 49791159 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 49792170 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49793319 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49794133 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49794232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49794933 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 49795788 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49795867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49795936 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 X 49799188 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49800298 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 49800381 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49800874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49802563 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 49803688 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49807754 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49808029 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 49812975 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49812985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49814907 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49816111 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49816426 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49816679 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49819045 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49819721 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 49823096 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49829890 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 X 49831280 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49832715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49833559 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49833921 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49835589 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 49836915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49837105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49837377 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49839914 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49840105 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49840764 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 49841441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49843448 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49843916 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49845686 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49850889 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49855097 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 49855526 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49856521 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 49856801 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49857165 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49857333 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49857505 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49858363 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49858596 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49859120 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49861953 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 49862368 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49862531 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49863307 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 49865269 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 49866791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49867188 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49867417 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49870109 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49871194 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 49871838 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49873332 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 X 49875150 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49876488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49877268 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 49879201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49880909 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 X 49881072 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49881590 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49881681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49881690 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 X 49881761 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49882006 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49882911 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 49883673 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49885207 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49887102 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49889319 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49889338 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49890909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49894005 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49896788 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 49900575 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49900829 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 X 49904335 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49904990 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49905059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49905253 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49907412 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49909117 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49914131 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49914403 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49914660 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49916708 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49916806 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49916930 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49918290 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49918674 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 49919975 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49920103 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 49921209 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 49922885 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49923273 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 49923516 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49923680 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49924271 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49924318 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49924353 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49924355 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49924648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49925181 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 X 49926248 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 49926715 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49926859 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49927902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49931052 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 49932760 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49932907 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49934958 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49935895 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 X 49936712 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49942229 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49943077 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49945489 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49945686 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 49945767 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49945797 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 49945813 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49945814 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49946192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49949387 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49950149 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49950806 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49951449 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 49952421 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49952619 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49955573 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49956778 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49956781 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 49957440 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 49958628 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49959300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49961107 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 49964119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49964999 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 49969604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49970551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49977633 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49978886 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 49981085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49983298 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 49983435 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 49986369 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49987605 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49987736 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 49987806 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 49987880 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 49987953 C A N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 49990267 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49991154 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49992183 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49992789 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49992796 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49992824 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 49993367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49993440 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49993441 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49995295 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 49998964 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50001182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50001426 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50006631 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 50007219 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 50011126 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 50012497 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 50013686 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50013726 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50013885 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50014109 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50014168 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50014170 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50015167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50015437 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50015517 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50017233 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50017842 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50018091 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50018322 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50018426 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50019047 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50019290 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50019341 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50019558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50019847 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50022252 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50024254 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50030915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50030964 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50033811 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50033885 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50033925 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50034995 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50036007 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50036134 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50037125 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 50037350 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50038469 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50039479 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50042842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50044533 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50046432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50047551 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50048261 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50048601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50048786 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50049508 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50051804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50052706 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50054551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50054810 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50055101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50055363 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50056701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50057137 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50057872 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50058777 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50060120 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 50060346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50060817 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50061414 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50061875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50064102 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50065296 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50065401 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50068191 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50068353 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 50068514 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50070852 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50071309 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50071394 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50071642 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50072211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50075457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50077683 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50081707 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 50082788 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50083135 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 50084301 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50084687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50085769 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50086270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50087283 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50087292 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50090560 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50091377 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50103195 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 50104617 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 50106772 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 50107248 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50108039 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50108724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50108841 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50110262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50113382 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50113961 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50114007 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50115659 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 50116703 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50121804 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 50125244 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50126146 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50127144 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50127877 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50128004 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50128253 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50128580 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50129104 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50129997 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 50130325 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50131740 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 50133509 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 50133759 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 X 50134997 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50136316 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50136659 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 50137268 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50138508 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 50141540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50144295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50144514 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50145897 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50146283 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50146409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50149634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50152134 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 50154145 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50154552 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 X 50155140 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50157189 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50159076 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 X 50159211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50159756 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50163707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50165707 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50168685 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 50169620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50169719 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50169753 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50169790 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50172520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50174028 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50176394 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 50176534 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 50177026 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50177407 T A Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 50180886 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 50182655 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50185844 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50185848 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50187944 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50191662 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50191946 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50192133 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50193120 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50195527 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50198684 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50199456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50199735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50200891 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50201257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50201277 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50201278 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50201514 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50201576 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 50201578 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50201677 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 50201679 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 50201767 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50201847 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50202024 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50202070 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50202157 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50202163 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50202185 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50202196 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50202351 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50202431 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50202489 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 X 50202558 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 50202921 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 50202922 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 50202964 C A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 50204205 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 X 50204209 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 50204212 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 X 50204221 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 50204245 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 50204436 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50204438 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 50204446 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50204494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50204503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50204508 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50204539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50205639 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50205821 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 X 50206263 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50209548 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 50210291 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50211211 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 50211578 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 50211600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50213384 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 50215594 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50216174 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50216372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50217157 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50217827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50218306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50218515 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50218570 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50218605 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50218802 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50220562 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50224498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50224884 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50226437 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 50226635 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 50228463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50229607 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50233408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50233959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50235171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50236945 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50240609 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50251538 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 50253277 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50257044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50257575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50257606 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50258351 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 50258638 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 50259431 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 50259436 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 50265502 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50268305 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50268427 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50268893 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50269378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50269423 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50270147 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 50270927 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50282894 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50284172 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 50285153 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50285525 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 50289263 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50290863 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 50293223 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50293254 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50299869 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50300908 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50307397 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50312075 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50313108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50315954 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 50316008 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50322162 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 50324835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50326023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50327358 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50330126 G C Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 X 50339014 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50339179 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 50339493 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 X 50340942 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50341162 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 50342266 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50343394 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50345968 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50346253 C G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 X 50348674 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50358939 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50360592 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 50365557 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 50368012 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 X 50370238 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50372061 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50375981 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 X 50377587 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50380421 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50383787 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50389083 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50395441 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50396351 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50398706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50398872 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50399763 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50402700 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50403978 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50410771 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50413072 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 50416654 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50417967 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 50419749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50421095 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50421165 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50421176 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50421235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50421331 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50421348 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50421397 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50421455 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50422095 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 50422101 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 X 50422103 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 X 50422411 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50422921 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 50424042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50424574 G A N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 50425389 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 50426062 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50427080 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50428245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50431952 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50435040 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50438000 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50438064 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50438190 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50440296 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50441024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50442208 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50443794 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 50444557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50448145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50448982 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50452925 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 50454361 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50455289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50457513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50459565 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 50459680 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50461454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50461676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50462356 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50464083 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50464303 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 50464348 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50468177 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50468631 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50469597 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50471018 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 50472076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50472332 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50473613 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50473997 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50474025 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 50477974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50480458 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50485957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50487518 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 50487790 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50487805 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50487975 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50488068 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50488125 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50488209 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50488389 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50488401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50488418 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50488438 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50488466 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50488593 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50488808 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50490794 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50492434 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50492482 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50492536 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50492541 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50492886 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50492980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50493315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50493343 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50493863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50493965 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50494222 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50494799 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50495355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50496793 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50497306 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50497944 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 50498902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50500517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50502011 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 50503388 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50503389 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50504994 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50505150 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 50506015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50507184 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50507291 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50509263 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 50509594 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50509806 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 X 50510107 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50510210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50510446 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50511212 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 50511269 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50511566 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50511880 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 X 50511953 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 X 50512063 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 X 50512072 G T N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 X 50512111 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 X 50512210 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 X 50514801 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50516188 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50517090 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 50519512 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50521249 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50522412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50526225 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50531223 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50531558 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50531657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50533270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50534013 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50535055 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50535079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50535555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50535587 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50535651 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50535777 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 50537649 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50537692 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50538870 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 50539226 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 50540200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50540299 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50540438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50540442 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50540721 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50540786 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50541532 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50545105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50547943 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50550233 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50552330 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50553806 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50557092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50557563 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50557843 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 50557890 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 50559180 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50559394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50559525 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50561905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50561927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50562346 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50562844 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50563803 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50566475 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50566698 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50567449 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50567648 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50568152 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50568651 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50568885 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50568941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50569975 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50572991 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50573153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50574427 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 50574969 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50575488 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50575799 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50575821 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50576040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50576517 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50576549 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50577019 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 X 50577020 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 50577377 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50577396 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50577435 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 50577456 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50577513 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50577546 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50577658 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50578049 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50578100 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50578122 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50578752 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50580871 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50581092 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 50587358 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 50587951 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 50588019 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50590039 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 50590957 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 50593717 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50595887 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50597545 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50600622 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50604005 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50609103 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50610348 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 50612296 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50612297 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50621741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50622156 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50622476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50623696 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50624158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50624741 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 50627623 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50630495 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50630782 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50630783 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50634964 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50635748 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50636749 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50638822 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50640935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50641131 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 50643690 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50645908 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50646019 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 50646771 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 50647413 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50648925 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 50649211 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50653695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50653987 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50654181 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50655966 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 50656725 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 50658199 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50666524 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 50668701 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50668931 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50670543 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50671502 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50675864 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 50675954 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50678278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50678900 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50679653 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50679909 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50680584 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50680905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50681912 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50685031 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 50685123 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50685250 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50685804 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50686168 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50686371 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50686489 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50689603 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50689781 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50691905 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 50692321 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 50692900 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50695037 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50695236 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50698082 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50699598 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50701874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50704306 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50704780 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50707732 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50709834 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50712249 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 50712794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50714082 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50714644 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 50714721 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 50715659 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50716196 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50717042 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 50717342 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 50717343 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 50717445 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50717466 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50717937 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 50718025 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 50718045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50719571 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50720002 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50720007 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50724034 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50725154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50725375 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50725378 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50727899 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 50728602 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50732428 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50734943 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50736443 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50738086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50738492 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50738571 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 50738628 G A N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 50740538 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50744521 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50746862 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50746876 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50746899 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50747422 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50747587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50747634 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50747715 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50748732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50750078 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50750482 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 50750602 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 50753945 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50754197 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50755276 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50757554 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 50761604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50764005 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50764375 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50765579 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50765602 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50766565 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50766746 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50767379 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50767655 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50774125 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50775248 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50777056 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50777852 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50778297 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 50778788 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50779827 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50780800 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50782308 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50783432 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 50784802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50785348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50785579 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50788546 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50789954 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50795964 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50799663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50800484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50802611 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50803623 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50803801 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 50803810 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 50804094 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50804482 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50804502 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50804503 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 50806224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50806978 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50807131 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50807257 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50808161 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50809774 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50812016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50813233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50816692 T G N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0 0.5 0.5 6 18 0 6 6 X 50816988 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50817113 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50817128 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50817413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50817497 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50820883 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50821899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50823254 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50825059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50825079 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50827466 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50880815 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50888416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50895207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50895688 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50896404 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50897120 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50898685 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50898688 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50898698 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50898715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50903914 G C Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 50903922 A T Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 50906345 A G N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0 0.727272727272727 0.272727272727273 8 14 0 8 3 X 50909246 C G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 50909290 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50910718 T G Y N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 X 50911246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50914178 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 50939053 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 50940598 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 50941336 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50942568 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 50943069 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 50943168 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 50943382 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50943488 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50943504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50943596 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50943704 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50943820 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50944233 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 50944410 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50944491 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 50945454 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50947257 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50951365 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50952222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50953870 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 50954425 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 50954445 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 50954549 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50954576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50954611 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50954663 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50954789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50954810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 50954818 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 50954859 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 50958329 C G Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 50998356 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51000481 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51001306 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51001834 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 X 51003689 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51004062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51004374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51004542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51004559 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 X 51004664 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51005285 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51005322 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 X 51006137 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51006381 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 51006903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51007979 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51008585 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51011911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51020015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51020541 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51020603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51023090 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 51024652 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 51026076 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51027819 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51029274 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 X 51031268 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51031754 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51032443 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51032923 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 51034718 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 51035340 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51036662 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 51037266 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 X 51039910 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51043055 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51043355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51044049 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 51044076 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51044196 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51044880 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51046022 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51047323 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 51049785 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 51050393 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 51051462 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 51054367 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 51054379 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 51054429 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 51054453 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 51054969 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 10 8 3 4 2 X 51054984 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 51056195 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51056924 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 X 51056953 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51057611 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51059415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51059625 T G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 X 51060249 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 X 51060552 A G Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 X 51060680 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 51060784 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 X 51061685 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 51062125 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51062236 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51062266 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51062960 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51064284 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 51065658 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 51068538 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 51070640 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 51073411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51073886 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 51074525 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51075181 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 51075430 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 51077799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51085456 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 51088299 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51088895 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 51093177 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 51094201 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51094593 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 51095670 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 51096315 C A Y N 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.333333333333333 0.416666666666667 0.25 13 11 4 5 3 X 51096330 G A Y Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 12 12 3 6 3 X 51096637 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51096659 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51096660 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 51096956 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51097627 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51097685 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51097870 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51098995 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 51099191 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 51099523 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 51099686 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 51103392 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 51104303 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51104912 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51104959 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51112968 G T Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 51113251 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 51113571 G C Y N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 X 51114420 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51114523 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51114806 C T Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 51115505 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51120334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51120403 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51120824 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 51121293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51121460 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 X 51125929 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51127241 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51130611 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 51132156 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51133072 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51136764 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51138363 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51138425 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51139479 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51144119 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 51144211 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 51145229 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 51145695 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51145911 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51146073 T G Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 X 51150681 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 51154259 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0 0.6 0.4 9 21 0 9 6 X 51154594 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51155780 C A N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 X 51160603 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51169495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51169724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51170218 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51171431 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51171740 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 51176961 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 51177604 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51178814 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 51179324 A G Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 51181606 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51182252 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 51183715 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 51184217 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51184851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51189308 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 51189908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51195828 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 51196673 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 51197094 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 51197814 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 51199802 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51200232 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51206879 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51208289 T A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 51209801 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 51212498 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 51213227 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 51213497 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 51213720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51214397 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51214988 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51215377 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51215872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51216928 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 51217663 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51217725 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51219209 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51231217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51231364 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51231863 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 51233198 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51233641 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51236433 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51237188 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51237618 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51238309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51241523 A T N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 51242743 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 51243304 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 51245254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51246233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51246680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51247201 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51254615 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51259651 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 51265576 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 51266005 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51268952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51269726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51269768 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51271403 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51271607 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51276331 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51277747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51277894 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51278126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51278146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51279128 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51279366 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51283320 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 51283323 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 51285180 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 51286005 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51287605 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 51288659 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51289195 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51289892 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51291125 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51294040 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51296240 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 51306470 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 51309003 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 51311145 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 51311467 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51314478 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 51317619 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51319193 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51329388 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 51329869 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51332558 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51333585 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 51334949 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 51335153 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51336930 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51342272 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 51348474 C A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 51357194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51357195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51359430 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 51361210 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 51361624 A T N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 51362654 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51362782 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 51369246 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 51377445 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51379175 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 51382818 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51382825 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51383736 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 51389193 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 51389669 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 51389763 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 51389873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51389906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51397199 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51400228 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51404135 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51404162 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51405867 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51407034 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51415377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51417715 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 51418107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51418475 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 51419613 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 51419978 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 51420791 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 51420797 T G Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 51426274 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51429375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51430242 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 51440830 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 51442652 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 51443063 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51443499 C G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 51445642 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51447279 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 51448395 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51448396 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 51449492 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51450002 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51456963 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51457473 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51459337 T G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 51468532 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51469251 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51469806 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51470277 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 51471261 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51471411 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51473746 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 51474893 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51475473 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51475773 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51476021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51478864 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 51479085 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 51483014 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51483087 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 51483793 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51487735 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51489195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 51489273 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 51496420 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 51496848 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 51497412 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 51498535 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 51499262 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 51559950 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 51560731 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 52609432 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 52622540 A C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 52646865 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 52655014 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 52656016 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 52660607 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 52669456 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 52763652 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 52852226 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 52875813 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 52895068 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 52895989 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 52897326 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 52897499 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 52906487 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 52908291 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 52910913 T G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 52911071 G C Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 52913999 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 52915736 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 52916712 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 52923589 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 52925094 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 52925957 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 52925963 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 52925987 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 52926003 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 52926004 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 52926065 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 52926454 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 52927185 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 52927679 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 52928176 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 X 52930166 T A Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 52933141 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 52934408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 52934516 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 52941389 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 X 52943258 A C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 52946773 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 52949969 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 52956385 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 52959419 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 52963393 A G Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 52966119 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 52967899 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 53064632 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53065657 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 53067702 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53069197 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 53069555 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53073400 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53075245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53076007 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53079443 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53081167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53083828 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53087026 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53087437 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53087987 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 53093165 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 53093864 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 53093983 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53094757 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53095297 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 53095456 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 53096858 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53098964 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53099321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53100521 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 53111583 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53112223 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 53115752 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53119403 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53129090 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53132040 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53132937 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53135617 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53136461 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53137447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53146905 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 53147490 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53156511 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 53158472 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53162318 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 53164708 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53165619 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 53187027 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53187083 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53187234 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53189506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53191300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53192324 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53195310 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53198991 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 53203373 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53207106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53214430 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53220770 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53220896 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 53226749 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 53228040 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53237067 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 53239805 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53241912 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53243835 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53246680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53259581 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 53262339 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53262399 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53266092 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53267460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53268191 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53276164 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 53280936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53283335 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 53286110 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 53288235 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53289904 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 53290207 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53291285 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 53301901 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 53302640 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53303512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53303594 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53305685 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53306014 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 53306578 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 53307646 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53312156 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53312521 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53321325 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 53322664 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53323348 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 53329760 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53329830 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53331340 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53332215 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 53333780 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 53342889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53344789 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53345466 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53347144 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53348611 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53357173 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53357377 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53358156 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 53359733 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 53360162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53360601 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53364209 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53364580 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 53365220 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53367246 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53367910 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 53381613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53383110 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 53384339 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 53386933 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53387551 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53388849 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53389315 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53402097 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 53404668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53406605 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 53407383 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53408886 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53409559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53409577 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53412539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53412589 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 53413828 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 53418990 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53419090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53420724 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53420927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53421678 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53422331 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 53424016 G C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 53424150 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 53444475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53445527 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 53450597 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53451101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53451739 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53452491 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 53459264 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53460944 G C Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 53461664 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53461768 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53461821 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53462702 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53463337 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53469071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53483163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53484271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53485786 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53486289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53487800 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53489283 G T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 53495300 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53495748 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 53496846 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 X 53498147 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53498779 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53498973 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53498974 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53504192 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 53509482 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53510358 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 53511966 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53513463 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53513495 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 53522682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53522976 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53525156 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53530472 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53530585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53534214 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53534227 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 53537333 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53547407 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53548279 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53549084 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53549391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53551264 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 53551542 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53552453 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 X 53552915 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 53553095 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53553398 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53555559 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53555943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53556409 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53556732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53560539 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53562151 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53563933 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 53563934 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 53563947 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 53564147 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53564565 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53564822 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 53565299 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 53565488 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53566393 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53570465 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53571038 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53571293 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53571568 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53571742 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 53572531 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53572622 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53573394 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53573458 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53573791 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53574011 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53574670 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53575763 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53576223 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 53576299 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53577430 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 53578766 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53579505 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53579787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53581191 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53582067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53582226 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53582246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53584484 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53584579 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53585967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53585968 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53586135 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53586210 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53586274 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53586312 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53587545 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53587553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53587617 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53587821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53589852 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53590780 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53591309 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53592117 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 53594394 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53596510 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53596557 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53596621 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53596948 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53597204 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 53597241 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 53597330 T A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 53597581 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53598618 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53599237 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 53601084 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 53603635 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 53604951 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53605555 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53606917 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53607711 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53615185 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53616502 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53618111 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53620822 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53623080 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 53623395 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 53623591 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 53623780 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 53624662 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53625239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53625733 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53626690 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 53626989 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53628338 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 53628463 A G N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 X 53631295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53631939 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53632156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53632543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53633052 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 53633684 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53638832 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53640828 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 X 53640909 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 X 53643007 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 X 53645264 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53645589 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 53645997 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53646206 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 X 53646265 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53646300 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 X 53646320 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 53646358 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 53646381 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 53646576 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 53646583 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 53646616 T C N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 X 53646701 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 53646734 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 53646805 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53646840 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53646882 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53647143 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 X 53647219 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 53647675 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53647690 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53647720 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53647748 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53647810 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 X 53647841 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53648005 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53648262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53648323 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53648505 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 53648820 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53649735 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53652065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53652066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53655569 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 53658050 C T N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 X 53661762 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 53663003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53668316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53669998 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53670511 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 X 53670515 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 X 53670622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53671023 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 X 53671065 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 X 53671083 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 X 53671089 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 X 53671124 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 X 53672024 G A Y Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.166666666666667 0.0833333333333333 0.75 5 19 2 1 9 X 53672119 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 53672128 C T Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 X 53672262 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 X 53672432 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 X 53672437 G A Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 X 53672810 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 X 53672869 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 X 53674290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53674318 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53675325 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53675550 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53676104 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53676739 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 X 53677142 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 X 53678104 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 53678132 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53679061 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53679259 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 53679966 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53680774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53680865 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53682072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53682165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53682652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53682674 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 X 53682804 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 X 53682834 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53683376 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53683402 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 53683597 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 X 53683637 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 X 53684150 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 X 53684164 A T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 X 53684245 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 53684736 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53685375 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53686053 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53686293 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 X 53686543 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53686913 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53686945 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53687653 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 X 53687788 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 X 53687846 T G Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 X 53687857 T G Y N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 X 53688523 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 53688959 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 53689071 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53689281 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 X 53690129 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 53691163 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 X 53691177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53692226 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 X 53692573 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53692857 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 X 53692863 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 X 53692978 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53693127 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53693520 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 X 53693659 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 53694007 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 53694124 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 X 53694147 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 X 53694512 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53694627 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 X 53694737 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53694852 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 X 53695006 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 X 53695448 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 X 53696421 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53696607 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 X 53696890 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 X 53696960 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53697822 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53698165 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 X 53698542 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 X 53698544 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 X 53699181 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53699218 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53699697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53699810 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53700318 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53700712 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53702037 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53702483 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53703326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53704279 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53704539 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53704628 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53705685 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53707614 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53711573 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53711825 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 X 53711916 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 X 53711925 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 X 53712088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53712216 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 X 53712490 T C Y Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 X 53712674 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 53713489 G T Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 X 53714044 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 X 53714114 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53714954 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 X 53714993 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53715137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53715238 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53715689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53716349 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 53716729 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 X 53717152 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 X 53717965 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53718408 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53720340 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53720869 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 X 53722345 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 53722772 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 53722959 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 53723772 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53724496 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 X 53724666 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53725531 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 53726156 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53726711 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 53726870 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53727160 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 X 53729142 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 53733645 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 X 53733745 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 53733936 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 X 53733973 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 X 53734102 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53734354 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53734355 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53734718 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 53737474 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53738075 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53738680 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 53739308 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53740123 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53740353 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53740559 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 53740681 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53740701 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 53741100 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 53741114 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 53741317 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 53741696 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 53741807 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53743064 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 53743383 C T N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 X 53743409 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 53744400 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 53744467 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 53744499 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 53744596 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 X 53744611 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 53744849 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53744859 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 53744995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53745115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53745136 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 53745174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53745205 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 53745223 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53745548 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53745799 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 53746142 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53746951 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53746965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53747754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53748162 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53748195 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 53748274 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 53748308 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53748347 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 53748362 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 53748488 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 53748491 G C N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 X 53748700 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 53748815 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 X 53748975 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 53749201 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 53749712 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 53749976 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53751378 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53752063 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53752282 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53752705 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53752907 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53753075 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 53753324 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53753428 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53753689 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 53753743 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 53753784 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53754472 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53754964 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53755087 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53755235 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 53755453 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53756372 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53756658 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53756882 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53756884 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 53756910 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53757603 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53757667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53758142 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53758816 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53758873 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53759085 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53759110 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53759146 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53759227 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53759647 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53759906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53759992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53760008 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53761142 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 53761962 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 53762144 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 53762648 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53763271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53765687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53765866 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53766162 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53766204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53767169 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 53767171 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 53769468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53770047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53770860 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53771561 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 53771720 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53773117 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53774249 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53774251 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53774455 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53776644 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53777658 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53779550 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53779917 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53780724 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53780928 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53781150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53781161 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53781196 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53781375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53781580 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53781885 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53781984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53782024 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53782575 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53782757 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 53782851 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 53783729 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53783880 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53783934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53784518 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 53784625 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 53784835 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 53784847 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 53785167 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 53785170 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 53785173 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 53785221 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53785298 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53785390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53785418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53785532 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53785534 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 53785563 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53785823 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53786126 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53786398 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53786427 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53786465 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53786558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53786727 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53786766 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53786789 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53786792 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53786969 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53787175 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53787198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53787240 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53787246 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53787309 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53787355 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53787385 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53787405 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53787458 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53787569 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 53787583 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 53787586 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 53787664 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53787772 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 53787790 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 53787970 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 53788106 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 53788233 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 53788234 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53788369 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53788744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53788773 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53788872 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53788932 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53788981 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53788994 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53789040 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53789051 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53789063 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53789084 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53789319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53789320 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53790038 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53790146 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53790242 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53791057 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53791896 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 53792259 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53792262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53792516 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53794338 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53794650 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53795264 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53795293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53795500 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53795514 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53795840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53795875 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53796024 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53796045 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53796107 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53796427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53796497 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53796540 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53796680 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53796886 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53796891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53797015 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53797052 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53797790 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 53798252 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53798358 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53798573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53798593 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53799069 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53800201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53800320 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53800373 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53800477 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 X 53800790 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 X 53801872 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53801921 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 X 53803351 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 X 53803628 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53804112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53804395 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 53804665 C A N N 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 X 53805365 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 53805522 T A N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 X 53805972 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53805988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53806278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53806755 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53807272 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53807815 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53807905 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 X 53807931 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 53807932 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53807965 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53808005 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 53808144 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 X 53809199 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 53809657 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53809848 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 53810319 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 X 53810467 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53810777 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53810876 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 53811145 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 X 53811158 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 53812067 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 53812528 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53812649 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53812912 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 53812987 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53813180 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53813913 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53815654 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53815797 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53815851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53815899 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53815909 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53816156 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 53816403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53816604 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53817222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53817297 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53817421 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53817480 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 53818594 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53819137 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53819573 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53820218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53820344 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 53820384 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53820923 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 53820950 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 53821144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53821365 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53821417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53821689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53821874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53822300 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53826794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53830505 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53833504 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53838200 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53839177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53843379 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53843435 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 53843832 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53849300 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53852184 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53852438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53853574 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 53856068 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 53859103 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53859480 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53862266 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53863710 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53866744 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53867024 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53867695 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53868798 G A N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 X 53879424 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53880371 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 53880398 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 53882049 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 53884554 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53886197 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53886503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53887818 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53890394 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 53891921 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53892088 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53892199 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53892208 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53892276 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 X 53892295 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 53892339 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 53892433 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 X 53893492 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53893757 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 X 53893759 A T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 X 53895060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53896025 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53896327 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53902020 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53902216 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 X 53903745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53907851 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 53911560 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53912544 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53913860 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53915968 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53917372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53917999 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53918328 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 X 53918660 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 X 53918874 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53919956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53923802 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53924657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53926793 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 X 53926833 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53929182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53930183 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53931385 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53935962 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53936877 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53937240 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53938571 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53940444 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 53941144 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53943309 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53945036 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 X 53945538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53945888 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53946191 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 53947227 T G Y N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 X 53948246 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53948445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53951024 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53952045 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 53952047 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 53952470 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53953684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53953926 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53954158 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 X 53954366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53954444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53954653 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53954954 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53955010 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 X 53955051 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 X 53955121 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 X 53955131 A G Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 X 53955172 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 X 53955209 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 X 53955291 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 X 53955303 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 X 53955320 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 X 53955380 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 X 53955744 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 X 53955843 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53955975 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 53956095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53956154 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 X 53956358 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 X 53956560 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53956911 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 X 53957159 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53957596 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 X 53957843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53964833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53965451 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53966082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53966180 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 53966315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53966695 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53967424 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53967451 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53968246 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53968661 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 53968897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53969980 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53970173 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 53970956 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53971607 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 53971779 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53973047 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 53973524 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53975879 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53979049 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53981053 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 X 53982736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53983143 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53984110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53986285 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53988910 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53989061 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 53993464 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53996876 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 53996919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 53997688 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 53998891 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54006802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54007000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54008077 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54009754 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54010242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54010500 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54010878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54011653 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 X 54011657 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 X 54011902 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 X 54012026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54014136 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54015068 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54016143 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54016506 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54018497 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54019589 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54021615 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54021914 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 54022368 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54024523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54029908 G C Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 X 54030292 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54030294 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54036031 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 X 54036616 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54037294 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54039493 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54040703 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54041790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54041884 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54042696 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54046236 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54046953 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54049107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54051401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54051513 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54052028 T C Y Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 X 54053353 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54053699 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54054415 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54054773 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 54055118 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54055243 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54055356 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54055446 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54055947 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54056039 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 54057218 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54057327 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54057990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54058012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54059435 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54060974 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 54062566 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54065080 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54065780 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54066121 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54066347 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54066535 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54066768 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 54067776 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 54068124 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 54068355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54068423 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54068480 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54068622 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 54069397 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54069446 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54069471 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54070219 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54070377 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54071644 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 54072733 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54074899 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54076087 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54076348 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54079175 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54080015 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54083346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54086443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54088288 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54088378 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 X 54088390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54088401 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54089660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54090400 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 54091310 G C Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 X 54091373 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 X 54095672 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 X 54096144 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54096384 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54096708 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 54097482 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54098231 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54098601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54098926 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 54098998 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54099050 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54100934 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54101654 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54104037 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54105676 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 54106141 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54106314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54106354 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54106586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54106725 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54107089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54107871 A G N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 X 54107874 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 X 54107958 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 54108017 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54108072 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54108287 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54108615 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 54108695 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 54109059 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 54109176 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54109189 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 54109314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54109336 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54109477 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 54110016 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 54110172 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54110552 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54110705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54111255 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 54111521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54112275 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54112294 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54112626 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54115652 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54115832 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54118518 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54118541 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54121335 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 54121678 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54123269 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54123550 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 54123552 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 54124152 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 54124202 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54124276 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54124451 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54125425 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 54125962 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54126597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54126733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54126839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54126859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54127052 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54127331 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54127844 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54128484 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 54128811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54128982 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54128993 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54129100 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 54130283 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54130416 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54130584 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54132021 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54133002 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54133526 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 54133748 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54141537 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54141886 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54142002 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54142007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54142063 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54142867 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54143335 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54143381 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54143471 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54144042 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54144543 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54145081 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54145507 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54145629 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54146107 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54146341 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54146582 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 54146762 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54146806 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 54147110 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54147477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54147582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54148118 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54148313 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54150088 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54150091 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54150118 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54150878 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54151027 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54151322 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54151471 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54152538 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 54152737 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54153995 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54154150 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54154366 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54154603 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54154740 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54154918 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54155388 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54155647 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54157440 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54159238 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 54159512 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54160220 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54162863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54162921 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54164409 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54164957 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54164985 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54166051 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54168421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54170033 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54170111 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54170820 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54172340 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54173586 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54173935 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54174661 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54174681 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54175308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54175371 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54178249 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54178550 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54179270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54180219 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54182714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54183436 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 54183521 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54184417 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54184940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54187177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54187230 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54191300 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54191494 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 54194662 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54196261 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 54196423 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 54198142 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 54199788 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54206386 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54207102 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 X 54208748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54209461 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54209473 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54209789 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54210060 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54210703 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54211057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54211128 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54211633 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54211789 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54212077 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 X 54212213 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54213402 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54213460 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54213531 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54213631 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54213874 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54214092 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 X 54214132 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 X 54214141 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54215170 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54215183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54215652 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54216403 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54216595 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54216712 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54217234 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54220040 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54220364 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54220437 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54220680 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54220722 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54221048 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54221087 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54221199 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54221228 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54223491 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54226973 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54227095 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 54227421 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 54228306 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 54228314 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 54228655 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54229929 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54230976 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 54231785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54232456 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 54232858 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54232989 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54241752 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54248269 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54250192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54251060 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54259229 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54263574 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54270886 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54272282 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54274460 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54276879 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54280867 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54283143 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54283388 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54284202 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 X 54285666 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54286123 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54288418 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54289669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54293359 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 54293809 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54294684 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 54295136 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 54297325 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54298132 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54298631 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54298884 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54299397 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54301478 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54301886 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 54302195 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 54302295 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54302404 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 54305988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54307400 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54315515 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54315517 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54316654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54317036 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54317551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54319487 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54321114 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54321909 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54321911 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54324230 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54325902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54326683 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54333865 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54334518 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54335833 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54336329 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54336425 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 X 54339233 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 54341751 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54341857 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54342242 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54342243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54342643 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54344142 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54345135 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54347502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54347530 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 X 54347652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54347688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54348479 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54350021 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54350196 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54352862 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54353657 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54354147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54354852 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54354853 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54355498 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54357710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54360002 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54360041 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54361768 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54362054 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54363211 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54365617 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54367088 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54367485 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 X 54367528 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54372118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54378784 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54380590 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54381761 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54382274 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54383031 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54383546 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 54383665 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 54387313 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54388160 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54388516 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54389551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54395022 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54397363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54397699 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 X 54399467 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54400691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54402464 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54403036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54408211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54409344 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54409418 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 54411696 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54411772 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54415139 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54417126 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54417398 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54417568 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54419051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54421381 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54426244 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54428572 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54428759 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54430567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54434793 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54434892 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54436623 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54436932 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54437990 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 X 54438350 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54438354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54438377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54438475 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54438794 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54438984 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54439160 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54439628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54439630 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54439653 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54439706 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 X 54439908 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54443042 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 54443047 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 54443050 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 54443122 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54443248 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54443292 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54443331 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54443412 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54443441 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54443453 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54443460 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54443505 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54443527 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54443634 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54443663 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54443674 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54443700 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54443866 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 X 54444644 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54446930 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54447553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54449776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54451462 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54455642 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 X 54455857 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54456189 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54456374 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54456975 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 X 54457058 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 X 54457127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54457202 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54457459 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 54457462 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 54457719 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 54457741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54458624 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54458837 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 X 54458871 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54459338 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 54459464 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54459764 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54460223 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54460296 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54461125 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54462996 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54463552 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54464621 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54464863 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54467509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54468600 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54470540 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 54474614 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54479394 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54483816 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54483849 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54484276 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54484472 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54484489 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54485946 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54486033 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54486240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54486377 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54487432 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54489846 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54490151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54492084 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 54492132 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54497584 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54499739 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54499857 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54500241 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54503482 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54504367 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 X 54504597 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54506116 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 54511182 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 X 54511531 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 X 54511668 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54511697 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 X 54511833 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 X 54511849 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54511898 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54512131 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54512273 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 54512413 G T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 X 54512494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54513423 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 X 54513467 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 X 54513590 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 X 54513597 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54513702 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 X 54513984 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54514079 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54514103 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54514869 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54514887 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 X 54515433 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 X 54515736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54516131 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54516197 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54516700 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 X 54516859 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54517117 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54517135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54518504 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54520248 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54522102 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 54522668 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54522983 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54523748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54524593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54526363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54526902 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54532234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54532455 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54537617 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54539428 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 X 54544620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54545361 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 X 54546406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54546745 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54548593 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54550886 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54551531 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 54552196 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 54552544 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54553149 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 54553205 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54554872 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54554946 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54555582 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 X 54555738 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54557122 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 X 54557190 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 54558679 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54560181 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54560380 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54560735 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54560778 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54560814 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54561206 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54562179 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54562325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54562995 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54563134 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 54565051 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54565328 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54566479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54566967 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54567398 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54568198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54568229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54568808 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54569235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54569393 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54571408 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 54572031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54572318 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54572512 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54572675 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54574238 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54575322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54575629 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54575704 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54575822 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54575842 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54576016 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54576054 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54576115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54578319 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54579732 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54580557 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54580947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54583843 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54586415 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54587092 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54587165 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54587274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54587360 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54587404 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54587454 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54588801 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54590216 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54593432 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54594934 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54594937 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54595798 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54598231 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54598695 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54599598 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54600770 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54601971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54602878 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54605189 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54605314 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54606649 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54606737 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54606880 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54607313 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54607424 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54607559 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54607825 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54608827 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54609028 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54609473 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54609487 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54609499 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54609585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54609818 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 54609940 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 54612010 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54612122 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54613079 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 54613291 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54613663 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54614965 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54615055 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54615210 C G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 54615259 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54615664 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54615763 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 X 54616712 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 X 54616745 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54617704 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54618291 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 54618570 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 X 54618607 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54619219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54619352 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 X 54619727 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 54619825 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 54619940 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 54620744 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54620898 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54622003 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 54622715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54623630 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54625920 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54625970 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54626022 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 54626081 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54626833 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54627379 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 X 54627864 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54631242 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 X 54631401 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54631846 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54632139 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54632969 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54633032 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54633319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54634492 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 54636592 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 54637394 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54637723 C G Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 X 54639655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54642260 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 54647473 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54648698 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 54654158 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54659391 T C Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 X 54660497 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54660510 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54661507 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 X 54661643 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 X 54662496 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 X 54662818 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 54664725 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 54665614 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 54665942 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 54666252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54666606 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 X 54667779 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54668471 T C Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 X 54668828 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 54669501 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 54670368 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54671611 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54671779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54671886 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54677039 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 54681099 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54681291 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 54681893 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54684669 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54685056 T G N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 54690842 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 54692673 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 54694442 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 54694773 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 54695231 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 X 54695994 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 54698120 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54699519 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 54701766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54712069 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54713365 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 54715915 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 X 54717229 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 54728420 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 54733296 A G Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 54735557 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 54736641 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 54738088 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 X 54738855 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 X 54742428 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 X 54742714 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 X 54743020 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54744562 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54745977 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 X 54746000 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54746029 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 54746823 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 54747211 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 54748917 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 54749533 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 54750743 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 54751192 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 54758873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54759769 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54759957 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54763217 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54763297 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54764510 T G N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 X 54765480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54766124 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 X 54768227 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54769024 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 X 54769133 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 X 54769203 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 X 54771826 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 X 54773338 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54776944 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 54777804 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54778037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54778427 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54779935 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 54779948 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54781753 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54781916 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54783707 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 X 54784995 C T N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 54786738 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 54787655 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 X 54787689 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54789584 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 54790624 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 54790718 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54791348 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54791868 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54796407 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54803335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54803761 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54803988 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54807008 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54808382 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54808715 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 54809005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54809791 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54809955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54811636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54813075 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 X 54815052 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54815123 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54816589 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 54817239 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 54817707 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54818422 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 X 54819782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54819981 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 54820956 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54821312 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54833481 A C N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 54835333 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 54837111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54837569 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 54838501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54839535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54839540 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54839543 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54840465 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 54840672 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54840693 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54841429 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54842011 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 X 54842515 A T N N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 X 54842644 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 X 54843067 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 54844089 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54844759 T G Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 54844830 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 X 54845758 T G Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 X 54846069 C A Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 54846071 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54846424 C G Y N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 X 54847143 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 54847195 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 54848276 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54848410 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 X 54848834 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 54860237 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 54860348 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54862494 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 54864558 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 X 54866456 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 X 54867247 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54867274 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 X 54867417 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 X 54868114 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 X 54868290 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54868619 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 X 54868874 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54869053 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 54869769 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 X 54869806 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 X 54870197 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 X 54870601 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54870984 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54871656 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54873022 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 54874337 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54874779 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54874844 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54875171 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54876347 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54877517 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54878485 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54878901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54879563 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54879918 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54880117 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 X 54882472 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54882620 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54882934 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54883158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54884060 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54885697 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 54886581 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54888591 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 54888780 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54888961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54889285 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54890930 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54891299 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54893995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54895086 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 X 54895087 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 X 54895853 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54905634 A C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 X 54906309 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 X 54907283 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54909645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54910548 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 54910773 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54911472 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54912063 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54912149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54913119 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54915002 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54916250 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54916265 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54916889 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54917325 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54920385 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54923319 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54923828 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54924430 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54924431 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 54929747 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54930688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54931381 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54931483 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54934504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54934844 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54934984 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54936708 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54937003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54937673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54939329 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54939452 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 X 54940019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54941069 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54941377 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54947188 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 54948001 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54950405 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54951759 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 X 54955528 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 54955968 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 54956063 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54956961 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 54957395 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 54957726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54960109 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 54961117 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54961606 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 54963917 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54965651 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 54968130 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 54968815 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 54969025 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 54973370 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 54979573 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54980496 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54983004 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54983260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54984015 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 54984402 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54984424 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 54984883 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 54984940 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54985204 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54985287 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54985500 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54985507 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 54985841 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54986824 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 54989773 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 54990017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 54991283 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 54992618 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54992979 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 54993616 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 X 54993704 T G Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 X 54995811 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 X 54996625 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 54996742 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 X 54996796 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 X 55000068 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 X 55000493 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 55000499 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 55000816 T C N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.333333333333333 0.583333333333333 0.0833333333333333 15 9 4 7 1 X 55000833 T C N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 16 12 4 8 2 X 55000882 G A N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 X 55001072 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 55001091 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 X 55001227 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 55002168 T A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 X 55004286 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 55005041 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 55005124 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 X 55005335 G T Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 X 55006399 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 55006640 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 55007083 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 X 55007087 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 55008757 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 55009409 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 55009417 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 X 55009451 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 55010125 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 55010522 G A N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 X 55012939 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 55013129 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 55014131 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 X 55014134 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 55014155 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 X 55014157 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 X 55014295 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 X 55014962 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 55016340 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 X 55016657 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55016848 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55016989 G A N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 X 55017544 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 55017757 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 55017909 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55017977 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55018073 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 55018347 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 X 55018515 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 X 55018737 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55019582 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 55021232 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 55021624 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 X 55021850 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 55022345 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 55022543 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 X 55023198 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 55024843 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 55024955 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 X 55025108 A G N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 X 55025306 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 X 55025319 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 X 55025488 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 X 55025811 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 X 55025865 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 X 55025907 C G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 X 55025941 C G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 X 55026938 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 X 55026941 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 X 55027007 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55027504 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55027583 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55028380 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55028645 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 X 55028656 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 55031960 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55033463 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 55033496 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 X 55034266 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 X 55034592 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 55034945 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 55040162 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 55040572 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 55040723 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55040762 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 X 55041047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55043514 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 55049609 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 55049690 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 55049804 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 55051484 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 55054457 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55058589 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55058595 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 55060429 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 X 55060822 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 X 55060895 A G N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 X 55062638 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55063286 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 55063627 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 55064547 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55065357 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55068180 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 55068629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55071632 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55078019 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55079610 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55081245 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 55082317 G C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 X 55082944 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 X 55083042 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 X 55083249 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 X 55083255 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 X 55083274 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 X 55083280 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 X 55083479 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 X 55083482 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 X 55083637 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 X 55083813 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 X 55083863 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 X 55083916 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 X 55083966 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 X 55084049 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 X 55084083 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 X 55084172 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 X 55084185 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 X 55084215 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55084273 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 X 55084378 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 X 55084424 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 55084467 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 X 55084494 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 X 55084509 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 X 55084529 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 55084535 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 X 55084621 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 X 55084716 A G N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 X 55084728 A G N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 X 55084769 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 X 55084772 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 X 55084828 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 55085262 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 X 55085321 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 X 55085434 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 55085564 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 X 55085619 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 X 55085640 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 X 55085668 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 X 55085814 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 X 55085850 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 55085855 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 55085861 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 55085963 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 X 55086215 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 55086268 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55086327 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 55086378 A T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 X 55086433 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 55086508 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 X 55086858 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 55086883 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 X 55086944 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 X 55086970 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 X 55087069 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 X 55087244 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 X 55087250 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 X 55089535 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55090023 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55090313 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 55090531 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 X 55091639 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 55091815 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 55092690 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55092753 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 55092835 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 X 55092861 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 55092867 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 X 55093576 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 55093633 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 55095236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55095260 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55095921 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 55096824 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 55097170 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 X 55097273 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 55100218 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55100839 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 55101059 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 X 55102116 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 55102136 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 55102372 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 55106611 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55108865 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55110181 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 55110350 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 55114234 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55114462 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55114582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55115924 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55116058 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55118538 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55119076 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55119083 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55119516 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55119877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55120804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55121763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55123962 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55124201 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55127460 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55132969 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55133849 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 55137493 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 55144415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55149627 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55149790 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 55153040 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55153348 A T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 55153926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55156427 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55157801 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 55158125 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55158924 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55162433 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55162455 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55163360 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55163920 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 55165380 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 55165429 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 55165519 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 55165546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55167501 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55168965 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55168987 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55170152 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 55173382 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 55173804 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55174410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55178562 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 55182089 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55183305 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55183769 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55185064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55185840 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55186938 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55187131 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 55187619 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 X 55187875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55188177 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 X 55188194 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 X 55189662 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55191520 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55195157 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55195730 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55197023 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 55197202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55197222 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 55197523 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 55198088 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55198952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55199503 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 55201314 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 55203221 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55205317 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55207222 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55207365 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55207417 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55210301 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55210380 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55211583 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 55211595 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55211904 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55211977 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55215274 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55215605 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55216019 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 55220988 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55221120 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55221480 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55221678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55222390 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55225274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55238163 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55238626 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55238668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55238669 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55241160 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55241857 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55242150 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55244769 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55245336 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55246372 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 55251115 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55253932 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 55255927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55257219 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55260762 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55262905 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55265332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55266027 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55266369 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55273253 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55274526 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55275896 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55277724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55278864 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55279192 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55282268 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55288246 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55291643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55292319 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 55297170 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 55297414 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 55297415 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 55300183 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55300497 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55302526 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55303637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55303826 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55306029 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55306688 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55306910 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55308945 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55309851 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 X 55310453 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 X 55316345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55316621 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55317383 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55317458 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55318092 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55318254 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55318269 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55319724 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55320750 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 55321470 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55322197 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55323093 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55327916 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55328161 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55333701 A G N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 X 55335684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55336893 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55338929 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 55340547 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55344356 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55344933 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55345239 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55345307 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55348095 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55348207 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55350298 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55350351 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55350778 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55351583 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55351785 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55358030 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 55358391 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55359339 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 X 55359720 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 55362244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55364504 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55364577 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55368786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55368882 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55371623 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55372288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55373144 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55373423 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55373707 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55373978 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55374305 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55374710 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55375394 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55375805 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55375996 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55376057 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55376059 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55376270 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55376459 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55376715 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55377606 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55377767 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55377769 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55377980 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55378185 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55378430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55378490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55378790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55379199 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55379347 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55380362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55383307 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55383310 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55384234 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 55384704 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 55385391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55386019 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55389895 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55396939 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55396940 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55399091 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55403781 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 55403803 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55404913 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55404918 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55409274 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55411673 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55415832 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55415964 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55420166 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55421200 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55423039 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55427665 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55430734 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55433389 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55434247 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55434889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55436824 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55437793 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55438826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55439482 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55440455 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55440490 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55441994 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55442123 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55446385 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55446677 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55448770 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55448777 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55450411 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 55451955 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55454271 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55455361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55455647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55455815 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 55456111 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55456344 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55456366 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55458335 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 55473821 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55473871 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55477999 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55479157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55479166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55480520 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55480564 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55480842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55484160 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 55486892 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55487622 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55490258 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55490789 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55492172 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55492293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55492346 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55494330 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55496900 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55502364 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55503407 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55503869 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55503999 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55505418 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55505469 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55509002 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55510093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55517280 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55518392 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55518499 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55521278 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55525248 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55526851 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55527147 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55527475 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55527907 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55528267 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55528435 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55529525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55530239 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55530732 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55530751 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55531624 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55531723 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55531782 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55531838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55532744 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55534090 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55534153 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 55534154 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 55534155 T G N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 X 55534412 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55536238 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55536357 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55536476 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 55536515 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55536897 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 55538097 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55539447 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 55539825 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55540861 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55550402 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55551004 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55552601 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 55552932 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55554293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55558390 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55564986 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 55565128 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55571934 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55572853 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55573816 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55574309 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55575733 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 55577971 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 55580005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55582859 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 55586290 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55589138 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55590846 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55599193 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55599463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55601147 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55601530 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55602930 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55604320 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55605304 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55606072 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55610490 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 55619250 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55622019 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55623720 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55626914 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55627766 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55628039 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55629502 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55629837 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55632923 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 55634804 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55635792 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55645865 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55646421 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55648138 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55649368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55656607 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55656671 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55656677 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55657298 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55658349 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55659974 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55660108 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55661345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55665849 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55666383 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55667476 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55671415 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55672976 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55675962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55676994 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55679529 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55680955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55682361 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55683764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55685033 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55685093 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55685578 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55688036 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55688102 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55688124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55688738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55688954 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55689237 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55691457 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55691885 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55691991 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 55693034 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55693497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55695199 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55695204 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55697843 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55698056 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55700125 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55702100 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55702936 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55702949 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55703631 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55704407 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55704653 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55705319 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55705329 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55705339 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55705414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55706090 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55707140 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55708247 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55709115 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55709744 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55710382 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55710829 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55711481 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55713721 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55713758 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55713922 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55714262 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55716407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55720591 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55721550 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55721869 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55722911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55724117 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55726584 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55732684 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55732926 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55735153 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55735862 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55736169 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55737012 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55737175 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55737440 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55738954 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55739850 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55739940 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55740554 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55740585 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55740750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55740910 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55743639 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 55743726 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 55743809 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 55743862 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 55744091 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55744355 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55744533 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55744568 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55744593 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55744852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55745309 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55747719 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55747775 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 55748824 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55749525 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55750784 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55750907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55758108 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55758376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55760925 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55764856 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 55767410 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 55770574 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55771115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55772403 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55773582 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55775275 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55775552 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55779413 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 55779482 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55784840 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55786285 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55786807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55787924 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55788125 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55788302 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 55788649 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55789359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55796835 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55797517 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55801225 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55801379 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55803275 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55804015 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55804147 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55804222 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55804251 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55804429 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55804434 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55805708 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55806022 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55806026 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55806441 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55807834 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55808157 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55808597 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55809120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55809483 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55810030 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 55810050 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55810264 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 55810794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55811321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55811377 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55811469 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55811736 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55812372 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55812374 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55812423 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55812429 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55812884 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55813170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55814548 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55814690 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55814841 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 55815019 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55815519 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55816218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55817315 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55819316 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 55819806 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55820249 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55820328 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55820445 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 55820707 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55822239 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55822374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55822894 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55823040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55823352 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55824344 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55825125 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55825191 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 55826600 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55826945 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55828225 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55828480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55829712 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55831126 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55831753 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55832325 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 55832646 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55833999 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55834412 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55834808 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 55835269 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55835676 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55838709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55841132 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 55843348 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55843816 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55847000 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55848208 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 55848801 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55850163 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55851346 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55852456 G C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 55855752 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 55858547 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 55859303 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55859880 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55860792 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55860852 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55861770 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55869504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55870076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55871228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55871276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55871982 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55872506 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55872621 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55874784 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 55875895 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55876023 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55878054 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55878796 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55879099 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55880123 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55880188 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55881518 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55882095 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55884723 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55885904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55885908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55887337 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55887990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55888489 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55889031 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 55889961 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55891267 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55895360 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55898268 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55898474 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55903962 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55907236 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55911425 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55913376 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55913418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55916985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55917976 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55922580 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55924269 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55926868 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55928640 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55931128 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55932086 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55934057 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55935642 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55936876 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55941809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55942424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55945032 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55946151 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55947234 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55947900 G A Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 55948526 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55949586 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55952108 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55952783 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55955330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55956246 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55956691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55959937 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 55963188 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55967354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55968167 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55968734 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55970678 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55971418 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55972305 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55974302 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55977737 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 55977799 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 55982915 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 55983500 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55985414 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55987784 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 55988205 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 55990296 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55990307 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55990878 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55992434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55996662 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55997694 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 55997914 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 55998396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 55998890 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 55999252 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 56003337 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56004820 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56006249 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 56007469 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56008339 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56019986 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56024374 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56024619 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56028342 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56028474 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56030342 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 56033705 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56033798 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56033818 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56033841 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56037384 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56038405 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56038548 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56039784 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56041282 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56041421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56048297 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 56056062 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 56056736 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 56057349 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56057847 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56058068 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56058197 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 56058471 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56061982 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56064974 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 56065285 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 56067005 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 56067091 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56067550 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 56069676 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 56070998 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 56074156 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56074378 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56074500 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56074915 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 56075890 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 56075965 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 56076244 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 56076329 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 56076703 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56077246 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56078619 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56080286 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56080805 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56082302 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56083810 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 56084249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56084305 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56084693 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56086134 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56086786 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56088765 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56089096 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56090798 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 56091312 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56091380 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 56094338 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56097140 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56100385 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 56100736 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56100889 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56102217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56102637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56102827 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56103352 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56103514 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56104210 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 56104311 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56104319 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56104321 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56105487 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56105756 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56106675 C A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 56106821 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 56108813 G A Y Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 X 56109594 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56110099 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 56110609 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 56110618 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56111193 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 56113058 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56114326 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 56122917 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56127891 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 56128006 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 56129968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56130935 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 56131456 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 56133060 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 56133397 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56136443 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56137268 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56138656 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56142190 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56144260 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56144731 T G Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 56144787 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56145243 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56146778 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 56146905 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 56149626 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 56154671 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56154708 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56155876 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 56156713 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56157670 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56160635 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 56161395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56162940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56163104 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56164753 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56165055 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56165065 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56173322 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56175011 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 56175086 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56175603 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56176224 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56178219 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56178235 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56178261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56178318 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56178505 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56179097 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 56184722 A G N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 X 56190555 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 56194687 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 56194911 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56196760 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56198278 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56201690 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56201925 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56202740 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56203388 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 56204363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56204379 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56205428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56208118 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56208604 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 56209880 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56209894 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56209929 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56211594 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 56212447 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56213436 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 56215801 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56215952 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 56224032 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56224743 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56225280 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56225306 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56225377 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56225594 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56225888 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56226838 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56227393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56228442 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56229805 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56229967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56233743 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56234248 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56236112 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 56238195 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56238713 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56239680 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56248087 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56250086 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56251386 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56252621 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 56254158 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56256713 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56257266 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56259156 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56260660 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56262243 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56262616 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56262818 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 56264780 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56266550 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56266572 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56267030 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56267186 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56269954 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56270994 A C N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 56271671 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56276089 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56276119 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56278107 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56278991 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56279556 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 56279854 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56280830 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 56285696 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 56286818 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56288947 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56290980 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 56291434 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56292293 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56293978 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56294123 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56299404 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56299488 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56299617 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56300024 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56300654 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56305514 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 56306541 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56308980 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 56313544 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56314734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56316930 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 56318042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56318289 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56318314 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 X 56318500 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 X 56318541 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 X 56319039 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 56319084 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56319325 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56320371 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56322195 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 56323024 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 56323211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56324125 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56334217 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56335454 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56335601 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56335607 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56340284 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56341579 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 56342764 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56343563 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 56344803 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56344945 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56345035 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56345323 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 56346510 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 56346543 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56346556 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 X 56346981 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 56347175 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56347371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56348201 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 X 56348463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56348533 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 56348552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56348603 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56348620 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56349146 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56349179 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 56349223 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 56349335 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 56349523 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 56349864 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 56349872 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 56349985 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56350223 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 56350500 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 56351178 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56351325 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56351341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56353362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56354880 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 56355338 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56355579 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56355797 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 56360374 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56360710 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56368638 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 56368722 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 56369397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56370466 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 56370506 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 56373855 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 56374354 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56381138 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56382776 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 56383094 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56385337 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 56390012 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56391310 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56392339 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56393025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56395623 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56397325 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 56399562 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 56406966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56407404 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56408131 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56408152 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56412825 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56416312 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56417115 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56418376 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 56422975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56428471 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 56428472 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 56429619 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56437463 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56443201 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 56443916 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56443924 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56445409 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56445919 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56446375 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56448656 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 56449640 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56449814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56451718 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56452083 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56454590 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56455781 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56463936 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 56464958 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56467442 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56472583 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56472838 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 56473737 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56475162 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 56475202 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 56479292 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56479863 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56485272 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 56486910 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 56488675 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56490485 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56491785 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 56492934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56494175 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56497940 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56499655 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 56506013 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56507833 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56508069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56511980 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56519504 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 56521103 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56521579 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 56521711 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 56525760 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56526600 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 56534678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56544219 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56548319 A T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 56552589 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56554106 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56556664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56557138 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 56557426 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 56557493 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56557850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56558173 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56558311 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56558529 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56558662 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 56560435 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56561669 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56562062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56564420 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56571039 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56572612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56574977 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56576243 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.2 0.133333333333333 0.666666666666667 8 22 3 2 10 X 56579992 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56582254 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 56582442 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 56583062 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 56583070 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 56583839 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56585212 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56587486 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 56589561 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56592550 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56592620 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56594383 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 56594570 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 56596998 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 56597607 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 56599724 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56601078 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56601476 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56602182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56604164 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 X 56604532 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 X 56604790 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56605686 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56606577 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 X 56606725 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 X 56607605 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56611041 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56612831 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56613999 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56614780 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56616291 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 X 56616819 C A N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 X 56617172 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56617229 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 X 56617514 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56618952 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56618986 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 X 56619780 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 56620410 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56620670 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56620967 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 X 56625203 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 56625463 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 56625709 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 56626062 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56628330 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 56630628 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56634024 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 56634076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56635319 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56636470 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 X 56636802 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 56637230 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56637310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56640214 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56641160 A T N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 56644764 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56647106 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56648811 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56650419 C G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 56650671 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 56651768 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 56652543 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56653000 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56655220 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56655708 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 56658597 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56660028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56660444 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 X 56660810 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56661118 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 56661617 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56664647 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56664707 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56664936 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56665133 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56666184 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56667311 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56667889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56668041 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56668779 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56669827 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56670932 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56671855 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 56672823 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56677712 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 56677741 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 56677743 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 56678501 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 X 56679219 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56679511 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 56679772 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 56679951 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 56680939 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 56681652 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 X 56681821 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56682974 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 56683336 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56683572 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56683720 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56685271 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56685371 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56685547 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56685566 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56685617 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 X 56686251 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56687342 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 56687585 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56688309 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56688369 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56688667 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56689458 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56690059 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 56690271 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 56690531 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 56690602 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 56690672 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56691814 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56692284 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56694407 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56696692 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56697031 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56697627 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56697726 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56698095 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56698106 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56702894 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56702928 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56704119 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 56704436 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 56705400 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56706561 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56710599 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 56711181 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 56712436 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 X 56719746 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 56723638 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56724573 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56725075 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56725256 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 56729435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56730353 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56731693 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 56732595 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56732742 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56733124 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 56738017 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 56740770 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 56741945 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56742114 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 56743632 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 56745386 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56751528 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56751562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56751770 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 56754261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56754366 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56754795 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56755328 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56758563 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56759196 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56759246 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 56759657 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 56760017 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56761166 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56761665 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 X 56762890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56763815 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56764064 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56764065 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56764476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56764670 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56765778 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56767794 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56770988 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56771682 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56771796 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56772459 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56773146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56774021 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 56774755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56774773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56776405 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56777080 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56779466 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56780391 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56781002 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 56781615 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56783419 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56786531 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 56786959 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 56787067 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 56792155 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 56792862 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56793583 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56793615 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56795937 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56796223 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56798334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56801972 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56810136 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56811148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56812208 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56816377 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56824280 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56826206 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 56827280 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56831105 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 56831845 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 56832745 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 56835074 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 56841726 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 56851536 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56854984 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56859764 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56860562 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56878171 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 56904902 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 56905433 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56910516 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56915115 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 56916453 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56917112 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56917804 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56917805 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56931263 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56933077 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 56934091 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 56935764 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 56938351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56949839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56953771 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 56960522 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 56990368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56990553 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 56992780 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 56998865 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57001639 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 57002249 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57018946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57028749 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 X 57036881 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57052229 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 57052547 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57053878 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 57053882 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57054346 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 57055423 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57057526 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57058392 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57061858 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57062862 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57064852 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 57065210 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 57065602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57065914 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57067606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57067721 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57069124 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57070255 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57073489 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57074013 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57075552 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57077653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57078812 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 57085717 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57086813 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57087412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57089053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57091340 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57093634 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57094097 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57094099 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57098213 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57098249 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 57102344 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57102605 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57110731 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57111428 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57112756 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57115020 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57115116 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57122751 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57126317 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57126337 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57128850 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57130063 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57130266 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 57139175 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 57141104 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57141583 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57142103 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57143898 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 57144035 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57146042 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57148742 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57153509 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57154449 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57154976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57155134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57156733 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57157633 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 57158226 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57161674 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57162717 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57166840 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57167504 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57169139 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57169944 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57170279 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57172645 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57174941 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57174959 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57175625 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57175738 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57177877 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 57181058 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57181805 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57182022 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57191157 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57194513 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 57195358 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57195899 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57196052 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 57196176 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57200007 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57200731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57201743 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57202184 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57202806 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57203381 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 57204722 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57205929 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57207097 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 57208380 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57209009 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57212899 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57214007 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57214466 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57215322 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57216135 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57216156 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57220494 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57220851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57221206 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57221473 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57221890 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57224119 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57224181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57224484 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57225651 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57226244 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57227519 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 57228034 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57228138 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57230464 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57231956 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57234684 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 57235995 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57236154 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57236453 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57236960 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57237197 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57241869 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57242015 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57244204 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57244328 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57247481 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57248881 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57249985 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57250295 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57251388 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57252149 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 57252854 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57252991 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57253289 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57253308 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57253675 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57253743 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57253844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57254001 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 X 57254204 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 X 57254236 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 X 57254253 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 X 57254319 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 X 57254327 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 X 57254460 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 X 57254476 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 X 57254544 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 X 57254606 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 X 57254631 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 X 57254656 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 X 57254667 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 X 57254686 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57254729 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 X 57254752 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 X 57254872 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 X 57254880 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 X 57255195 T G N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.411764705882353 0.176470588235294 0.411764705882353 17 17 7 3 7 X 57255291 G T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.352941176470588 0.176470588235294 0.470588235294118 15 19 6 3 8 X 57255356 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.444444444444444 0.111111111111111 0.444444444444444 18 18 8 2 8 X 57255418 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 X 57255551 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 X 57255593 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57255630 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 X 57255751 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 X 57255863 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 X 57255913 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 X 57256005 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 X 57256634 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57257027 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 57257690 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 57258533 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57259107 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57259577 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 X 57259729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57259880 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 X 57260617 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57261686 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57262498 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57263075 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 X 57263526 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 X 57263537 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57263576 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57264355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57264621 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 X 57264844 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 57265083 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57265329 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57268194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57270033 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 57275734 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57279898 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57284859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57286594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57288631 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 57288914 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 57290460 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57291283 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57294726 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57295505 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57295688 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 57295840 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57296840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57296982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57297191 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57299833 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 57303343 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57303452 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57303453 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57313219 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57315980 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57316023 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57316126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57317432 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57317493 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57318316 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57321640 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57321740 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57322491 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57322782 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57323497 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57324518 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57325104 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57325736 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57328144 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 57328195 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 57329142 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57332609 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57332775 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57334172 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57335686 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57336796 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57338434 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57339675 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57341222 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57344604 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57345077 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57346862 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 57346942 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57347442 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57348059 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57355080 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 57355810 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 57355812 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 57355905 G C Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 57356175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57356485 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 57359772 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57361388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57361509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57363649 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57365265 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57365314 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57365957 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57369376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57377439 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57383652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57384653 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 57393133 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57396330 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57399056 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 57399697 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57403688 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57403713 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57409694 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57414546 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57414806 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57417382 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 X 57419416 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57426565 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57435530 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57439720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57440292 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 57441553 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57442502 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 57442638 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57442726 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57442936 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57444743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57446128 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57449327 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 57452244 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57453767 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 57461577 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 57461728 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57465528 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57469756 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57471385 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57471711 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57472144 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57474011 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57480124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57481489 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57484149 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57488966 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57492274 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57494058 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57496031 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 57498570 T A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 X 57503746 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57504111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57504536 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57505798 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57507268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57508787 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57509671 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57512163 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57520351 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57520831 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57523978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57537327 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57539780 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57540528 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57547578 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57549037 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 57549324 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57549919 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57549943 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57550973 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57554654 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57554824 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 57554869 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57556441 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 57557957 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57558311 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 57559987 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57560075 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57560951 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57562109 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 57562269 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 57562296 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 57562339 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57562415 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 57563456 G T Y N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 X 57563492 A G Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 57566711 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57566768 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57568449 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57569352 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 57569529 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57570694 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57573247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57573631 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 57573988 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57576311 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 57577008 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57578271 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57582077 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57582644 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57586122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57587763 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57588086 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57588184 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57590926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57594461 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57595268 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 57596327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57596892 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57601219 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57601304 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57606400 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57606892 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57607026 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57607118 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57607795 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57608819 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57608981 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57611588 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57612537 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57612582 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57613821 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 57616505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57617580 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57617980 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57626525 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57628182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57629403 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57629582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57629587 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57629752 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 X 57630379 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57634243 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57637044 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57637439 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57641387 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 57642201 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 57642483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57642529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57643212 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57644736 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 57647133 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 57647295 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 57647341 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57649325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57649601 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57650669 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57651164 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57651217 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57651553 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 57651765 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 57651768 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57652650 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57653730 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57653739 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57664116 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57665223 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57670503 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 X 57670609 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 57671205 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 57671503 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 X 57671531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57671583 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57671588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57671622 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 X 57671784 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57672013 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57673006 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 57673668 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 57674403 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57677710 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57678464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57678917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57680965 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57685863 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57686112 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57693121 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57694370 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57694754 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 57695136 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57695572 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57700334 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 57701892 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 57703963 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57704890 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 X 57705062 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 X 57705462 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 X 57705608 T C N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 X 57707080 C G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 X 57707188 T A N N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.230769230769231 0.307692307692308 0.461538461538462 10 16 3 4 6 X 57710785 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 57712657 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 57712732 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 57712851 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57712893 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57712907 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57712949 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57713314 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57713373 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57713479 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57713550 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 57713898 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 X 57714050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57714455 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57714547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57714794 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57714823 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 X 57715027 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57715045 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 X 57715438 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 X 57715740 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 X 57715897 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57716829 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 57717007 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57717356 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 X 57717771 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 X 57717976 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 X 57718418 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57718687 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57718929 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57719268 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57719714 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 X 57720075 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 X 57720153 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57720548 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57720633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57720656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57720667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57720727 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57720743 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57720965 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57721489 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57721556 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57722404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57724685 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 X 57726067 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 57726076 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 57726198 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57727970 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57730056 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57730847 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57732197 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57732605 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57733604 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57734569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57734835 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57734958 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57735388 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57735398 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57736139 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 57736540 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57737016 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 57739013 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 X 57740208 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57741022 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57741360 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57741770 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57742042 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 X 57742144 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57742275 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 57742342 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57742895 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 X 57743520 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57743656 A C Y N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 X 57743693 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 X 57743873 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 X 57744074 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 57744129 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 57744225 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57745580 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 57745642 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 57745974 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 57746527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57749365 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 57749446 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57750228 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 X 57750266 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57750315 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57750318 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57750342 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57750350 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 57750353 C A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 57750375 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 57750389 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57750410 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 X 57750427 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57750469 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57750476 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57750485 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 57750492 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 57750496 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57750529 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57750537 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 X 57750557 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57750567 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57750570 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57750574 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57750582 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57750593 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57750598 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57750604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57750617 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57750632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57750635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57750656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57751799 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57752518 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57753457 C T Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 X 57753642 C T Y Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 X 57753808 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 X 57754086 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 57754226 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 57754978 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57755219 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57755236 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57755238 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57755249 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57755807 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57755808 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57756441 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 57756974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57757044 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57757630 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57758535 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57759656 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 57761429 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57761492 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57761734 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57762135 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57762333 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 57762335 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57762342 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57762362 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57762365 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57762386 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57762404 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57762784 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57762841 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57763259 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57763366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57770772 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57771509 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57777287 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57777724 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57779662 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57780510 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57780900 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57781740 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57784956 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57786239 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57787106 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57787957 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 57791558 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57791772 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57809723 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57821496 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 57822690 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 57825633 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 57826777 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57830575 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57830841 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57831515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57831984 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57832046 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57833142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57833275 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57836339 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 57837209 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57838257 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 57844237 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57844620 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57847094 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57849537 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 57849795 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 57851766 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57856196 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57858716 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 57858727 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 57859736 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 X 57861439 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 57869383 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57869829 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57870573 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57880542 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57881746 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57884458 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 57884505 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57884564 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 57886437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57886719 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57891024 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57891161 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 57891307 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 57891588 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57892752 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57898005 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57898143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57900033 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57900911 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57901980 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57905687 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57907966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57908708 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57911820 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 57912392 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57913359 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57913712 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 X 57913891 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 X 57913922 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 X 57913935 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 X 57914072 G A N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.214285714285714 0.5 0.285714285714286 13 15 3 7 4 X 57914079 A C N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 X 57914187 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 X 57914189 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 X 57914279 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 X 57914333 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 X 57914372 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 X 57914470 T C N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 X 57914685 T G N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 X 57914728 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 X 57914784 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 X 57914815 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 X 57914903 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 X 57915723 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57917506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57931662 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57935339 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57939092 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57939304 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57939364 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57939831 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57939948 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57940929 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57944333 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57944450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57945210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57945426 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57946318 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57946384 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57946668 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57946975 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57947290 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57947300 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57947445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57947636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57948679 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57949057 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57949539 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57950078 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57950698 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57956693 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57956793 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 57957615 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57958184 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57958356 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 57958391 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57958408 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57958724 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57959014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57959304 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57959400 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 57959463 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57959890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57960116 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57961470 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 57965889 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57967892 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57969948 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 57971454 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 57973750 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 57973998 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 57983031 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58006919 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58041775 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58043936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58052410 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58058486 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58069232 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58071291 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58071930 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58075191 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58076166 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58076804 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58078356 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58078602 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58079550 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58080643 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58082159 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58082249 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58086335 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58087388 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58087954 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58088129 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58090179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58094069 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58094796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58097614 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 58100633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58102032 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58102334 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58103084 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58104348 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58104349 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58104350 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58104505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58104557 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58104894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58105177 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 58106248 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58107563 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58108986 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58114652 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58116039 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58120576 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58123493 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58131236 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58131437 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 58134800 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58138253 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58144200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58144207 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58147166 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58155995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58160412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58173472 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58173997 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58174093 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58174829 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58176734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58177893 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58178050 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58179066 T A N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 X 58179547 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58180698 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58180818 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58181001 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58181283 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58181821 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 58183876 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58184508 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58185344 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58186637 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58187670 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 58189251 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 58189760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58189874 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58190910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58191024 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58191773 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58197434 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58200669 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58203552 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58216826 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58218655 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58218755 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58219381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58220022 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58220264 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58220338 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 58220447 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58220679 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 58220839 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58220849 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58222610 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58223181 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58223841 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 X 58223974 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 58224151 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58224273 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58224327 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58224346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58224407 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58224442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58224636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58224734 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58224740 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58224915 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58225144 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58225221 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58225336 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58225455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58226054 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58226359 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58226371 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 58226586 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58226611 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58226642 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58226831 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 58226917 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58226953 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 58227131 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58227371 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58227557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58227918 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58228125 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58228139 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58228193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58228596 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 58228722 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 58228757 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 58228779 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 58228789 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 58228879 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 58229164 G T N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 58229412 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 58229548 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58229656 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58229704 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58229757 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 58229758 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 58229814 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58229883 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58229913 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58229963 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 58230895 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58230918 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58231382 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 58232234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58232717 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58232728 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58232795 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58232982 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 58232984 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 58233247 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58233370 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58233515 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58233565 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58233620 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58233630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58233855 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58234050 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58234548 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58234564 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58234574 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58234591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58234597 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58234915 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58234954 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58234997 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58235207 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58235254 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58235521 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58235657 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58235685 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58237172 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58237188 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58237522 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 58238089 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 58238217 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 58238333 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 58242885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58242989 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58243342 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58249796 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58252482 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 58252491 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 58252681 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58252840 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58254202 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 58255113 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58255217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58256971 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58257122 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58257960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58257993 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58259285 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58259718 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58259812 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58262917 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58262964 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58264610 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58266066 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 58271722 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58271743 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58274247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58275870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58276048 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58276172 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58276454 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58276746 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58277644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58278406 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58278695 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58278938 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58280153 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 58281257 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 58283208 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58286716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58288652 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58289719 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58290572 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 58291819 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58294037 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58298494 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58298560 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 58298770 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58298779 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58298815 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58298904 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58300681 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58300827 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58300887 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 58304399 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 58304448 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 58304498 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58305801 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 58307849 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58308741 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58308742 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58315392 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58316509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58316671 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58316995 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58318111 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58319394 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58322122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58323789 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58327166 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58327430 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58327569 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58329034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58329113 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58330855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58332930 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58334286 C G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 58334786 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58335015 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58335537 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 58337209 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58339670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58339869 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58339950 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58339998 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58340431 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 58340449 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 58340550 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 58341026 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 58342275 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 58342296 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 58342352 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 58343613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58343681 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 58344030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58344777 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58345542 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58345566 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58345629 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58345919 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58346849 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58346912 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58347218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58347686 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58347964 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 58348181 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58348700 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58352730 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58354192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58356412 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58356605 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58358287 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58358403 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58359112 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58362213 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58363584 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 58365123 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58366290 A C N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 X 58366292 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 58366298 C A Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 58366299 A C Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 58366302 G A Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 58370552 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58371213 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 58372143 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 58372664 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58373202 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58373321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58373679 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58374407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58374986 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58375786 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58375991 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58376636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58379010 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58384283 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58389807 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 58390560 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58392394 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58394965 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58395420 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 58395690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58396709 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 58397932 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58399356 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 58402603 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58404553 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58404851 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58406246 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 58408788 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 58409133 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58410245 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58412205 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58413100 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 58419042 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58419809 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 58422460 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58424675 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58424901 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58426725 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58428173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58428275 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58429757 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58430141 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58439759 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58440679 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58442979 T G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 58444414 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 58447737 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58450269 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58451048 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58451582 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58452505 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 58454290 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 58456311 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58459056 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 58462658 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58464406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58465654 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 58466424 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 58467217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58474065 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 58475155 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58476460 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58478169 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58479513 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 58480625 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58481021 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58482448 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58483958 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58485050 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58485082 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58485982 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58486432 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 58488491 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58488591 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58490798 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 58492329 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58492831 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58493051 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58493348 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58495925 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 58498289 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58498614 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58498738 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58499117 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58499552 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58499570 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58500631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58501940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58502448 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58502678 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58502853 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58503449 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 58503782 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58503783 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58503897 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58503927 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58504200 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 58520733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58521007 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 58522176 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58522363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58522583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58524823 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58525288 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58525786 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58525955 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58526380 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58527331 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58527497 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58528350 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 58528495 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 58528542 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 58529027 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58529184 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58529287 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58529307 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58529510 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58531283 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 58532226 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 58532298 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58532424 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58532817 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 58532825 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 58532879 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58533351 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58533513 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58533519 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58533573 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58533732 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58533865 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58533886 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58533915 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58533995 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58534484 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58535653 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58535918 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58536074 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58539666 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58541955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58549835 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58554524 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 58557053 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58558192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58559146 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 58561378 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58561714 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58567737 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 58570647 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 58570728 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 58570969 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 58573968 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58574743 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58578351 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58578412 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 58579492 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58581064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58581065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58588044 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58588393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58588456 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58588485 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58589133 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58589322 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58589645 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58589952 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58599410 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58599572 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58600074 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58600926 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58601495 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58601841 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58602475 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58602583 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58602910 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58603405 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 58606388 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58607296 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58608017 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58609206 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58609918 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58611295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58612449 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58612582 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58613567 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58616310 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58618027 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58618802 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58618834 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58620706 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58623066 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58623487 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58625607 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58626183 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 58626658 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58626732 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58627893 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58629486 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58630012 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58631895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58633620 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58633805 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58634575 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 58635152 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58635243 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58635401 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58636832 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58637523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58638366 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58638380 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58638522 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58638695 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58639642 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58639964 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58640346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58641011 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58641465 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58642464 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58645965 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58646302 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58647270 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58647432 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58647615 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58648175 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58648664 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58649242 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58649329 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58649623 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58651713 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58653507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58653533 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58653724 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58653832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58653879 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58654171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58655279 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58655866 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 58656016 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58656037 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58656870 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58658307 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58658940 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58660497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58660584 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58661216 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58662772 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58665177 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58666894 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58670521 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58672082 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58672869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58674132 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58675267 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58676305 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58676327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58678406 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58679065 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58679663 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58682731 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58685096 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58685117 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58685143 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58687322 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 58687469 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58688584 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58689326 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 58692235 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58692797 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58700060 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 58703952 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 58707298 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 58707374 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 58707923 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58708132 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58708505 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58708685 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58710586 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58712663 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58715222 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58718573 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58720266 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58723704 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58725344 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58726514 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58729423 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 58738531 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58740905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58742219 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 58743336 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58746411 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 58746904 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58747037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58747083 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58747107 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58749436 G T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 58750837 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58752909 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58753848 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58757144 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58758220 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 58759704 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 58761726 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58761758 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58761795 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58762368 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 58762577 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 58763087 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 58763757 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58766099 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58766605 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58766781 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58766843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58767522 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58768513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58768892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58769093 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58770119 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58770167 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58770203 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58770367 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58771185 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58771270 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 58774359 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58776184 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 58776203 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 58776248 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 58776302 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58776393 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58776398 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58776419 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58776635 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 58778262 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58780000 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58783064 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58783852 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58784311 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58786279 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58787426 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 58788724 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 58793083 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58795355 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58804714 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58806021 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58824015 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 58824401 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58825480 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58826805 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58826975 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58827734 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58827759 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58829061 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 X 58830724 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58831006 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58831920 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58833130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58833319 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58833974 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 58834301 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58834317 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58835957 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58835962 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58836046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58836555 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58836684 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58838343 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58838391 C G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 58838659 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 58838726 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 58838792 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 58838959 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58839017 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58839097 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58839183 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58839603 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58839643 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58839666 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58839744 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58839801 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58839867 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58839880 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58839916 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58839985 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58840025 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58840043 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58840122 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58840226 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58840231 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58841636 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58841892 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58841998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58842003 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58844725 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58845528 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58845537 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58848361 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 58848362 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 58851482 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58851794 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58852534 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58853177 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58854314 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58854833 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58856034 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58856970 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58858617 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58859454 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58860006 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58860017 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58860586 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58861567 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58861843 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58864035 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58867367 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58867929 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58869545 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58872804 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58873223 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58874051 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58874149 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58875975 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58876534 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58876616 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 58877026 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58878586 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58879317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58884628 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 58884731 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 58886399 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58886521 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58887051 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58887976 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58889790 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58894016 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58898327 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58899135 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58899794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58902557 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58903744 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58905536 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58906126 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58906897 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58907286 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58908217 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58909217 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 58910004 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58910116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58910902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58913052 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58913057 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58913311 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58913518 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 58915941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58918551 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58918733 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 58923678 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58925092 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58925404 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58925548 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58925641 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58926276 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58927153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58927182 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58927521 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58927592 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58928490 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58928881 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58929919 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58929977 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58932789 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58934741 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 58937006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58937146 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58937600 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 58939345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58940405 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58944971 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58946989 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58949760 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58953858 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58959006 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58961881 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58963969 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58967885 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58970647 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58971203 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 58976756 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 58979657 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58979796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58985764 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58986108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58987513 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58988515 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 58990625 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58990976 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 58991256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 58992060 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58994466 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 58996321 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59000069 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59000094 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59000098 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 59000111 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 59000877 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59003581 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 59004946 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59006136 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59009690 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59010056 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59010213 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 59012096 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59012158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59012651 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59013440 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59013562 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59013659 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59013704 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59014661 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59014942 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59015221 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59015985 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59016543 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59016748 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59017073 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 59017102 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 59017366 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 59018269 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59018912 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59019166 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59019349 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59020445 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59020470 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59020529 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59025605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59026434 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59026903 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59027185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59027583 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59027640 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59027667 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 59028080 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59028371 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 59028514 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59028692 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59029328 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59029566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59029715 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59030109 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59030180 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59030183 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59030318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59030678 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59031081 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59031520 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59031898 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59032219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59033225 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 59033242 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 59033438 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59033700 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59033829 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 59035670 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59036070 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59037099 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59040966 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59041511 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59041842 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59041887 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59041988 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 59042330 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 59042465 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59043207 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59043608 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59043939 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59044824 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59044846 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 59046174 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 59046701 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59047543 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59048724 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59048743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59049006 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59049012 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59049538 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59050664 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59051373 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59052271 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59053142 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59053186 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59053742 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 59054391 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59057082 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59058550 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59059694 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 59059886 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59060934 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 59061147 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59062508 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59067247 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59068203 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59069282 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59069286 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 59069721 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59070644 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 59070669 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 59071800 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 59071908 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 59072272 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59072273 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59072915 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 59073611 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 59073682 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59073858 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59074885 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 59074891 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 X 59074894 C G N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 X 59074895 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 59075139 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 59075152 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 59075344 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59075516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59075664 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 59077099 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59077112 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59077628 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59077648 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59077922 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59077933 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59078689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59078714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59078779 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59079109 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59079121 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59079149 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59079307 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59079576 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59079830 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 59080111 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59080129 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59080176 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59080296 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59080333 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59081211 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59081222 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59081251 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59081522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59081672 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59082451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59082712 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59083881 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59083993 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59084263 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59084307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59084628 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59084636 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59085042 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59085594 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59085812 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59085890 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59086920 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 59087849 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59088704 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59090258 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59090933 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59091250 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59092753 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59093598 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59093987 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59094244 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59094607 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59094722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59095023 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59095129 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59095219 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59097675 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59098076 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59098760 C A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 59099013 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59101438 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59102086 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59102112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59102473 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 59102533 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 59103126 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59103904 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59106501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59106997 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59111749 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59113360 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59115327 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59116034 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59117138 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59117530 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59117651 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59128231 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59130888 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59132206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59133320 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59133339 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59135565 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59135886 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 59138995 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59141586 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59142212 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59143506 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59144508 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59146639 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 59146974 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59147226 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59147233 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59147332 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 59147676 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59147861 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59148238 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 59150095 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59150787 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59151355 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59152388 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59152509 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59152544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59155299 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59155797 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59157006 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59157020 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59157095 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59161497 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59161789 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59161832 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59163055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59164458 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59169568 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 59171825 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59172000 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59174090 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59174998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59174999 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59176502 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 59177284 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59179909 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59180844 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 59180857 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 59180959 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 59180994 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59181184 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59181306 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59181471 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59181547 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59181683 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59182136 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59182148 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59182273 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59183013 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59183495 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59184003 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59184004 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59184112 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59184258 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59184601 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 59185076 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59185180 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59185346 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 59186478 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59186594 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59186777 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59186782 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59187097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59188026 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 59188672 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 59189202 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59189222 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59189223 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59189489 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 59189496 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 59189665 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59189736 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59190135 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59190241 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59190450 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59191056 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 59191105 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59191471 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59198576 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59198928 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59199768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59200391 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59200413 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59201776 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59201784 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59201802 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59202663 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59203468 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59203717 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 59204425 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59205606 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 59206531 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 59207340 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59207478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59207738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59210644 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59211072 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59229594 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 59238682 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59247330 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59249119 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59254598 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 59256093 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59258544 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59260471 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59261976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59264538 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59266306 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59268178 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59273280 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59274584 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59275838 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59277067 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 59284715 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 59286105 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59286484 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59287559 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59289511 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59291110 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59291637 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59292456 G T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 59293029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59293266 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59295227 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59297174 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59299443 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59308782 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 59315430 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59329146 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59340985 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 59342707 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59343165 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 59344029 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59344803 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59345526 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59349093 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59349354 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59350127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59350917 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59351871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59352874 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59356679 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59356680 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59358116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59367715 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59369056 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59371134 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59372449 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59374243 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59377569 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59379770 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59380653 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 59380874 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 59381366 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59381897 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59382943 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59387574 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 59388358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59395961 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59397876 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59398476 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59399098 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59407528 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59407863 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59408361 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59421108 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 59425302 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59432260 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59443027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59444989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59445668 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59459694 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 59466506 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 59473711 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 59487465 T C Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 X 59493139 T A N N 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 X 59505733 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59511391 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59511392 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59523633 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59532577 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59534850 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59537290 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59540326 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 X 59541903 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59548862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59549549 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59559933 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59567553 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59588115 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 X 59590983 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59597197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59607887 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59622733 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 59625764 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59641990 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59644103 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59649235 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59651273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59651733 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 X 59663909 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59675349 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 59679016 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59679467 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59689061 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59692248 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59698273 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 59699379 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59707249 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59712842 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59713041 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59714021 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59715018 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59716623 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59720566 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59721439 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59721474 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59721830 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59722007 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59722032 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59722089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59722352 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59722821 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59724307 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59724718 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 59725485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59725797 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 X 59726814 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59727071 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59727185 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 X 59728089 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59729733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59730021 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59730582 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59730808 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59731345 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 X 59731531 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59731952 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 59732031 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 59732990 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59733265 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59733280 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59733364 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59733544 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59733630 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59734371 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 59734395 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 59734714 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 59734859 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59734897 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59734934 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59735138 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59735972 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 59737644 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59737914 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 X 59738332 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59739549 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 59740041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59740079 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59740619 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59740770 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 59740795 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 59740971 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 59742935 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 59743073 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 59743422 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 59743827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59748093 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59748887 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59750545 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59751300 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 X 59751792 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 59753694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59754033 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59754422 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59754627 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59755497 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59756001 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 59756233 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59756488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59759159 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59759290 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59762114 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59765131 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59770525 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 59770596 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59771221 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59809700 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59811748 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59814249 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59814461 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59814693 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59819448 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59819891 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59820792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59821172 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59823643 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59825559 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 59826767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59828210 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59830139 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 59830247 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 59832041 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59832857 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59834360 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59834773 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59836848 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 59841444 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 59841623 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 59844447 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59845154 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59850689 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59850942 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59852941 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59852986 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59854259 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59854689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59855902 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 59856132 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 59856914 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59857783 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 59858378 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 59858565 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59860284 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59862876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59863671 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59865312 A G Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 X 59877938 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 59878763 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 59887583 G A Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 59888228 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 59891705 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59892285 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 59897647 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59897656 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59900815 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59909863 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59910359 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59913144 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59915399 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 59915978 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59918887 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 59923051 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 59924163 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59926433 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 X 59926548 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59927479 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 59928544 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 59928880 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 59929698 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59931380 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59932425 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59932748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59933315 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59934046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59934633 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59935150 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59943073 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59944130 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59944392 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59947765 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 59947783 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 59947792 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 59947797 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59947800 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59948933 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59949220 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59950126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59951534 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59954990 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59954994 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59955337 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59955338 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 59955474 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59955494 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59957333 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59957678 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59957925 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59958422 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59959840 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59961309 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59961473 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59961611 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59962544 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59962696 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 59962941 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59964834 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 59966513 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59968591 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 59968776 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59971066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59971510 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59971912 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59972272 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59972814 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59973456 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 59973691 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59976749 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59976782 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59977026 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59978347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59979214 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59986245 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59986826 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59987437 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 59987446 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59987484 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 59987833 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59991746 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59994020 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59994334 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59994699 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 59995056 A T N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 X 59997168 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 59998945 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 59999219 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 59999802 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 59999980 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 X 60000433 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60007764 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60010921 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 X 60012843 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60014769 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 X 60016141 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60016868 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60017658 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60022599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60032646 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60033934 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60034373 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60037439 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60037609 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60038212 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60038591 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60040153 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 60041163 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 60041455 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60044810 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60045195 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 60045197 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 60045206 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 60045790 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60045913 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60048188 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60048227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60049747 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 60049854 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60050201 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60050347 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60056169 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60056286 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60057284 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60057565 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 60058659 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 X 60060642 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 X 60060789 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60066247 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60066557 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60067259 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60071056 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60074007 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60077104 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60077281 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60077700 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60079435 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60081030 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 60084106 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60085220 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60086983 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60089289 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60089310 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60089592 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60089747 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60091968 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60092207 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60100464 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 60100731 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 60100780 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60101195 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60101366 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60104822 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60105231 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60105715 T C N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 X 60106812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60107816 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60108469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60109503 C T Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 X 60110085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60110155 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 60111979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60112359 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60112567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60115610 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60116638 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60117889 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60118473 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60126654 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60128093 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60130851 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60133069 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60133501 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 60136391 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 60136638 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60137576 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60146184 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60146598 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 X 60147118 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 X 60147143 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60147170 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60153982 G A Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 60154466 G A N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 60161023 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 60164277 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60167567 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60168469 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60169046 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60170108 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60172786 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60174066 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60176131 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60178581 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60179608 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 60180443 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60183909 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 60193604 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60193737 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60195586 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 60196907 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 60197896 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60198894 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60198922 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60199492 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 60207110 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60207218 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 X 60208312 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 60212098 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 60212973 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60213664 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 60213921 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60215950 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60216157 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60218628 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60218740 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60219902 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 60221089 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60222369 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60232500 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 X 60234363 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60241789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60248822 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 60249027 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60250472 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60250521 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60255095 G A Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 X 60256360 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 X 60258226 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60258432 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60259350 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60267103 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60274686 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 60274955 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60279744 A T N N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 X 60280942 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60281915 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60297185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60300346 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60305533 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 60306353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60307272 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60308153 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60308909 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60310039 C G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 60311288 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60311391 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60313371 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60313463 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 X 60313466 C G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 X 60313756 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 60316195 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60316221 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60316451 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 60316767 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60317105 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 60317576 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 60317940 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60320354 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60320996 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 60321678 T G Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 60321734 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60321946 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60322308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60323174 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60326197 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60327749 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 60327866 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60327938 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60328134 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 60328363 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 60330348 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60330440 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60330884 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60330904 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60330994 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60331401 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 60331469 G A N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 60331895 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60334784 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60337121 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60337311 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60338620 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60338856 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 60340626 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60340725 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 60341308 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60343825 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60344094 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 60347459 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60351131 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 60353111 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 60353220 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60353928 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 60355296 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 60356650 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 X 60360351 T A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 60360417 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 60360468 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 60362338 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60362608 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60363679 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60368254 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60369597 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 60370338 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60371414 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60371832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60371877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60372380 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60372557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60373047 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60373547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60381553 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60382264 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60383298 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60384424 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60384784 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60387303 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60387573 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60387714 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60387924 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 60388379 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 60391532 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60393311 T A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 60393594 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 60394295 A T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 60395635 T A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 60396877 T A N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 60397551 A C N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 60398075 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 60398390 C T Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 60399038 T G Y N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 60400031 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 X 60400287 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 60400781 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60403000 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60403179 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60404580 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 60405453 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60407342 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 60407380 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 60407492 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 60407516 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 60408652 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60409351 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 60410744 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60413037 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 X 60413068 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60413158 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60413278 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60414270 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60416259 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 60419051 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60419747 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60419852 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60421705 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60422354 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60424779 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60425697 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 X 60427287 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 X 60427696 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60427767 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 60431325 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 60431629 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60432476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60433623 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60434508 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60435496 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60435646 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60436106 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60436725 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60436933 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60437989 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 60440668 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60441222 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60441963 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60442023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60442291 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60443249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60444542 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60445014 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 60445288 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60446694 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 60448544 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 60448791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60449267 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60451736 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60453910 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60455717 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 X 60456171 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60456627 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60456992 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60457975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60458532 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60460547 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60460832 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 60461038 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60461935 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60462751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60463754 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 60465089 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60466823 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60467632 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60468940 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60469173 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60469199 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60471202 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 60471605 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60471708 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60473262 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60474994 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60478667 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60479368 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60479530 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60481214 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60481215 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60481339 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60481551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60482555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60482806 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60485072 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60485312 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60486216 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60486811 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60487253 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60487328 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60487436 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60487872 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60488157 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60488332 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 X 60488448 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 60488578 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 60492435 A T N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 60493720 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 60494779 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60497337 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60498008 C T N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 60498686 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60499523 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 60502887 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60504508 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60505931 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60506303 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60506480 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 X 60506573 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60507014 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60508323 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60508406 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60508444 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60508644 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 X 60510168 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60510397 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60511671 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60511706 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60512003 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60513532 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60515051 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60515463 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60516210 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60516263 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60517050 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 60518259 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 60518434 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 60518881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60519397 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60519399 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60519808 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60520054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60520128 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60520569 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60521388 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60521433 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60522795 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60526636 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 60526991 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60533090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60533277 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60534164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60534521 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 X 60535547 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 60535560 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 60536475 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60537162 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60538146 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 60538831 C T N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 60539723 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60539959 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 60541122 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 60541363 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60541728 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60544408 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 60544772 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 60545951 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60546363 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60546689 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 60548195 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 60549993 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 60551160 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60553985 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60554997 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60558616 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 60559418 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60559461 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60560449 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60562844 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60563714 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60563791 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 60565254 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60566083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60566330 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60566361 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60569302 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60571184 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60573301 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60574232 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60576205 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60576691 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 X 60576769 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60579424 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 60583584 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 60586640 A C N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 60587162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60588228 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 60588776 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 60589856 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60591967 T C N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 X 60592162 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60592263 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60594205 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60594575 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60594601 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60595065 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60595213 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 X 60595526 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60595655 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60596137 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60596776 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60597073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60597544 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60598888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60599380 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60601017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60601815 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60602546 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60603016 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60603581 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60604059 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60604397 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 60604815 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 X 60604874 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60605792 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60606261 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60607091 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60607225 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60608629 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60608839 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60609727 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 X 60611734 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60612090 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60615091 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60615547 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60615789 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60616439 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60616823 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60616875 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60618042 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60619759 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60620188 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60620528 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60622394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60627548 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 X 60627732 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 60628711 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60629402 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60629511 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60630397 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60630491 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60631214 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60631645 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60632894 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60633086 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60633572 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60640291 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60640486 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60640503 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60640850 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 X 60641019 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60642011 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60642067 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 60644011 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60645285 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60645575 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60646012 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60646220 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60646456 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 X 60646511 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60646582 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60646823 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60646896 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60649166 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 60649313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60650684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60651861 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 60651867 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 60652045 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60652339 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60652848 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60653128 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60653808 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60653937 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60655077 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 60656146 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60656557 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 60658548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60658868 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60658895 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60660428 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 60663929 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60664051 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60664184 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60665859 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60667899 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60668012 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60668615 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60669727 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60670848 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60670947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60671077 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60671792 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60671885 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60676784 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60677558 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60677987 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60678206 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60679028 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60679150 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60679887 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60680062 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60681703 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60681783 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 60682064 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60682849 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60683850 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60684364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60686235 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60686509 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60687036 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60688188 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60688462 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60688464 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60688579 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60691801 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60692018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60692839 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60692906 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60693381 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 X 60693503 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60694007 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60694695 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60694749 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60694880 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60694937 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60696609 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60696613 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60696982 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60697017 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 60697248 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60699204 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 X 60699597 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60706681 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60706988 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60707253 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60707807 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60708947 T G N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 60709938 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60711560 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60712183 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60712970 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60713065 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60713347 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60713961 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60715129 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60716601 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60716996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60717669 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60719164 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60721618 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60722813 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60723311 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60723362 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60723901 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60724117 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60724262 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 X 60724507 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60724660 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60727880 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 60728834 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60728850 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60728875 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60731422 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60732079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60732399 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60733182 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 60734345 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60734713 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60734943 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60735926 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 60738518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60738982 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60740416 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60740887 G A Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 60741011 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60741762 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60741822 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60741823 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60742318 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60742671 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60742698 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60742973 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60743941 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60744045 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60745108 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60745170 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60745386 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 60745491 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60746690 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60748319 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60753694 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60754815 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60755533 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 60755698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60755713 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60755752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60757906 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60758933 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60759695 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60759783 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 60760908 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60761640 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 60761657 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 60761727 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60769173 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60769991 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60770406 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 60772153 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60772609 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60772613 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60772792 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60772821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60773762 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60774017 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60774119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60774482 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60775326 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60775364 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60775494 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60776875 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60777860 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60778184 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60778418 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60778687 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60780285 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60782185 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60783421 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60784039 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60784382 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 60785752 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60785858 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60785880 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60787863 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 60788161 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60788858 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60789814 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60790556 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60791449 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 60791642 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 60795644 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60796150 T G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 60799087 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60800133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60800187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60800689 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60801853 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60803835 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60805331 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60806155 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60806711 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60809146 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 60810093 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60811689 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 60812164 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60812878 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 60813297 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60815462 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60815702 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60819585 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60819966 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60820189 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60822165 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 60823630 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60824583 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 60826232 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 60827236 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60828015 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 60828271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60833182 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60833629 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60834084 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60834390 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60834599 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60834794 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60835517 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 60836675 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60836921 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60838093 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60838396 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60838888 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60839005 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60842338 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60843443 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60843918 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60844514 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60844865 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 60844963 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60848276 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60849020 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 60849049 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 60849380 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60849482 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60849763 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60849850 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60850761 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60850875 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60851130 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60851582 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60852233 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60852681 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60853398 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60853418 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60855036 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60855715 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 60856512 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60856775 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 60858427 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60859494 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60862045 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60862405 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60863287 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60863435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60863472 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60865671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60867223 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60867458 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60868039 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60868178 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60868656 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60868658 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60869239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60870250 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 60870285 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 60871164 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60872066 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60872224 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60872311 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60873476 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60873881 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60876295 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60876418 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60876609 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60876710 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60876768 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60877309 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60879883 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60879908 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60881173 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60881336 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60882037 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60883851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60883897 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60886034 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60886338 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60886360 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60886919 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 60887761 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60895805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60896136 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60896235 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60897983 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60902339 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60902974 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 60903052 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60903901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60904554 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 60905473 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60908480 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60908975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60911380 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60912698 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60915217 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60915621 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60916971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60917064 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60917803 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60919145 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60919473 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60921336 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60922213 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60922916 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60923136 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60925178 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60926159 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60926297 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60927453 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60929302 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60931270 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 60931763 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 60932473 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60932727 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60936026 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60936429 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60936633 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60937355 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60939272 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60940603 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60941641 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60942090 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60943366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60943949 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 60945224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60947853 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60950153 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60950749 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 60950824 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60951186 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60953260 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60953685 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60954160 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60956358 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60961002 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60963661 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60963768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60963779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60970294 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 60970506 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 60971032 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60972201 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60972229 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 60972561 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60973258 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 60973421 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 60975765 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60978813 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 60979692 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60982144 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 60984132 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 60984470 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 60985032 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60985065 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60986510 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 60988558 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 60989636 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 60990016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60993158 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 60993966 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 60994597 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 60995739 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 60997742 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 60998484 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61001197 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61001342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61001472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61001552 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61002388 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 61003407 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 61003716 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61007550 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61007566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61008151 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61012450 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 61018951 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61020264 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 61024227 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61030895 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 61033074 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61034817 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 61035079 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61037762 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61038639 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61041174 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61045573 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 61047177 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61047951 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61050251 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61051290 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61051541 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61051581 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61053965 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61054918 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61056858 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61058662 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61058679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61058681 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61060038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61060283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61061278 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61061763 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61063859 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61066985 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 61068379 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61068463 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61070215 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61070302 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61072732 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61073749 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61073783 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 61074334 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61074691 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 61074709 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 61075821 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61077755 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61078049 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61080298 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61080652 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61080661 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61080871 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61082510 A C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 61082716 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 61082767 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 61082989 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 61082999 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61087048 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 61087343 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61088599 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61091167 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61091617 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61092671 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61093057 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61093362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61096775 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61097140 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61099121 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 61099126 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 61099406 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61100036 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 61100564 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61101926 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61102141 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61102582 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61103152 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 61103585 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61105847 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61105988 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61112268 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 61114508 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61114756 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61118891 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 61119534 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61119815 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61120357 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61120444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61123359 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61123686 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 61124020 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 61124648 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61124888 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61126496 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 61126997 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 61127484 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61127970 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61127990 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61128953 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61129708 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61130166 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61130237 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61130935 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61131263 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 61131398 A T N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 61146524 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61148523 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61149859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61150967 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61151043 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61151174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61153997 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61155168 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61156167 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61157650 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 61158049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61159585 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61160361 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61161188 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61161288 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61161607 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61162006 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61162046 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61162711 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61162766 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61162772 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61167675 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61169610 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61170425 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61170584 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61171342 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61171622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61172111 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61173414 C A N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 61174862 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61175290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61175822 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61175926 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61176102 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61176829 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 61177995 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 61187256 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61187626 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61188252 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61189789 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61190554 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61191565 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61192311 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61192431 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61193227 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61195047 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61195050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61196960 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 61196972 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 61197745 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 61198378 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61198655 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61206080 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61206650 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 61206997 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 61208292 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61208782 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61209134 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61209603 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61209604 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61209682 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61209784 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61210539 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61210921 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61211636 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 61212630 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 61213142 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61213837 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61215402 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61216353 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61216915 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 61217923 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61219184 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61220524 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61220687 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61221264 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61221504 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61222520 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61222533 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61222549 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61222574 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61222575 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61223227 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61223788 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61224621 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61225423 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61226106 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61226299 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61226659 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61226678 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61227209 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61228131 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 61228246 C T Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 61228281 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 61228724 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61229229 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61229354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61229427 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61229870 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 61229967 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61231175 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61231781 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61231862 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61232041 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61233202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61233780 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61235035 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 61235084 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61237508 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61237673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61238108 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61238313 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61238321 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61239860 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61241009 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 61241513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61241567 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61241593 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61242203 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61244360 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61244569 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61245604 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61246638 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61247618 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61248061 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61248634 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61251207 C A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 61251551 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61252212 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61252990 A C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 61253423 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61253558 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61253823 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61254368 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61254495 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61254854 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61255597 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 X 61255628 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61255736 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61255790 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61256203 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61258805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61259084 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61259639 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61261490 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61261797 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61263393 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61263599 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61266034 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61268546 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61268778 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61273732 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61274350 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61274851 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61278412 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 61279696 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 61281869 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 61282218 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 61297622 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61299101 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61300106 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 61302887 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61305165 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 61306895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61313309 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61314092 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 61316068 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61316211 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61316405 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61316605 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61317791 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61317950 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61320420 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61320492 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 61320998 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61321858 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61322105 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61322866 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61323038 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61325123 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61325344 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61327185 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61327851 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61328059 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61328749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61329573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61329873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61331658 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61332562 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61332921 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61334345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61334713 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61335705 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 61336315 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61338951 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61344705 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61345244 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 61345805 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61345917 A C N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 61346786 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61347683 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61347758 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 61348081 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61348330 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61348427 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61348954 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61349219 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61350326 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61351118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61352593 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61352807 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61353201 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 61353781 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 61355391 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61355616 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61356013 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61359770 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 61359877 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61360115 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 61360719 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61360732 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61361177 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61361561 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 61363321 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61363625 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61364106 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61364602 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61365659 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61366627 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61367028 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 61367793 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 61367867 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 61368106 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61368107 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61370388 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61372291 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61373054 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61375068 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61376571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61377565 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61379120 T G N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 61387673 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61388901 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61390354 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61391582 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61392373 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 61394237 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 61396370 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 61396536 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 61397091 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61397190 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61397692 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61398163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61398966 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61400335 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 61401873 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61402622 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61404522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61408157 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61409362 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 61409387 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61409694 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61409912 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61410013 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61411711 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 61414282 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61415695 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61418094 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61419062 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61426860 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61428740 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61428926 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 61429226 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61429623 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61433846 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61436135 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61436198 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61438220 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61438826 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61438893 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61439335 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61439664 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61440049 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61440264 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 61440470 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 61440772 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61440917 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 61440989 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61441083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61442184 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61442397 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61443079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61444331 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61445480 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61446714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61447785 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61448011 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61448393 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61448429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61448463 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61448549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61449247 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61450230 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61450611 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61450658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61450941 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61451666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61452136 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61452249 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61452628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61453203 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61454558 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61455480 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61456380 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61456840 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61458402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61458589 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61458833 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61462769 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61463572 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61468890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61469137 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61472788 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 61473051 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61474581 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61475453 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 61481429 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61482895 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61484196 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61489030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61490278 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61492626 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61494958 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61495573 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61500640 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61502948 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61508571 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61510441 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61512434 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61518470 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 61520408 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61522733 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 61524687 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61525521 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61526332 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61526448 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61526880 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61532186 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61538201 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61538848 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 61541751 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 61543553 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61548276 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61548525 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61548783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61549090 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61551518 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61554693 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61555941 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 61556373 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61557136 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61558042 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61559301 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61559306 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61559837 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61560262 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61560603 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61561701 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61563348 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 61563420 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 61566077 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61566886 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61567194 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61568465 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61568848 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61570568 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61571512 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61572089 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61572539 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61572767 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61575239 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61577822 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 61586306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61586694 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61587334 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61587920 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61588027 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61592382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61592403 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61592775 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61593462 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61593741 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61595306 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61595413 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61597592 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61598083 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61602909 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61604385 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61604620 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 61605015 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61606341 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61609906 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61609933 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61610938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61611001 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61611629 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61611816 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61614892 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61621001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61622347 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61623935 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 61624855 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61628077 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61629544 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61630394 G A N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 61630644 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 61632572 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 61634241 G C N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 61634584 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61635290 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61636631 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61640507 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61641588 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61642119 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61643388 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 61643850 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61647222 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 61649124 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 X 61649450 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 61649801 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61650039 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61650310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61650628 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 61651620 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61651788 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61652238 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61653328 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61660614 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61665428 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61667893 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61681143 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61687615 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61697623 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61700399 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61709911 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61716224 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61719177 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61726836 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61726838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61730431 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 61741019 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61741449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61741556 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61741559 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61741663 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61749743 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61750431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61751184 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61751209 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61752653 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61754558 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61754932 T G N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 61755251 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61755604 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61757185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61757699 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61757995 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 61758797 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61758834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61759142 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61762193 A C N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 61762464 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61762547 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61762812 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61763244 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61763818 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61764588 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61765369 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61765544 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61766846 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61768014 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61768051 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61768108 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61768803 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61769251 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61771047 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61771906 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61772066 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61772141 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61773363 T A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 61773400 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61773786 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61774427 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61774613 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61774664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61775999 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61778177 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61780719 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61780922 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 61781812 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 61782388 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 61782532 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 61783429 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61783969 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61785617 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61785854 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 61788186 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61789004 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61789318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61789349 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61790206 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61791517 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 61799383 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61799593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61799623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61801954 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61803466 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61804869 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 61805425 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61806646 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61807317 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61807407 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61814995 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 61815949 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61816472 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 61816934 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 61818506 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61818942 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 61821021 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61821614 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61821652 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61824359 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61825789 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61827785 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61830161 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61831494 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61831593 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61831978 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61832082 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61832150 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61832393 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61832452 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61832667 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61833822 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61834089 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61834210 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61834244 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61835698 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61835820 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61836074 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61838719 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 61838747 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61841161 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 61844232 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 61846766 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61847873 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 61848290 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61848291 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61851369 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 X 61852871 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61854830 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61854840 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61856104 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61856707 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 61856964 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 61859264 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61861398 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 61862393 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 61864124 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61864738 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61864939 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61865820 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61866030 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61866749 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61866893 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61867539 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61867911 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 X 61869418 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 61870567 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61871552 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61873146 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 61875422 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61875726 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 61876581 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61876619 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61876670 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 61878461 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 61886813 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61886865 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61887159 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61888160 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61888195 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61888352 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61889199 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61895191 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 61896966 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61897320 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61897999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61898632 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61899192 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61901068 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61901870 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61901986 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61903781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61905469 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61905990 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61906992 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61907948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61912784 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61913131 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61916308 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61916381 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 61916475 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61918732 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61920716 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61922397 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61923762 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61923856 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61926486 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61928021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61928078 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61928079 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61928450 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61928571 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61929649 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 61936288 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61938760 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61939059 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61939255 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61940269 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61940279 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61940404 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61941282 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61942529 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61943126 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61943222 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61943761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61944230 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61944236 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61945526 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61945636 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61945743 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61946337 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61946573 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61947468 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61947554 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61947717 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61949294 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61952139 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61953102 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61954763 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61955048 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61955186 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61957806 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61958380 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61959184 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61959266 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61960509 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61960752 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61960946 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61961643 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61962288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61963032 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61963507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61964136 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 61964964 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61965872 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61967009 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61967426 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61967518 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61967870 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61969673 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61970082 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61970714 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61971400 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61973273 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61974536 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61974537 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61974621 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61975801 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61976977 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61976993 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61977458 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61981708 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61982489 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61986722 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61987307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 61988457 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61990110 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61990304 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61990467 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 61992070 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 61993184 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61993469 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61995044 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61996884 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 61997810 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 61997929 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 61998622 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62007164 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62008210 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62011154 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 62012101 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 62012148 A T N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 62018190 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62019297 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62022871 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62023783 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62024371 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62024622 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62024700 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62025186 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62025958 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62027078 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62027714 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62027920 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62028036 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62032706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62033948 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62034904 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62038449 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62038633 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62041781 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 62042749 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62049130 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62049163 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62049453 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62049482 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62049822 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 62050053 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 62054344 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 62055511 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62057814 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62058521 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62059722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62061409 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62062880 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 62063343 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 62064407 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 62064928 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62068039 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62072128 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62073831 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62080425 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62080954 C T N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 62084853 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62085164 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62089809 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62091202 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62095818 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62096770 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62098300 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62099022 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62099183 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62102377 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62103114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62104157 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62104767 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62106000 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62106240 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62107020 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62107870 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62109554 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62110451 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62110839 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62111700 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62112813 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62112982 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62113283 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62114507 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62115152 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62115787 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62116440 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62117859 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62118009 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62118431 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62118506 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62118796 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 62119158 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62119428 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62119679 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62119713 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62119728 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62119933 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62120226 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62120240 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62120377 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 62120493 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62120938 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62121442 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62121767 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62121768 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62121841 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62121866 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62121891 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62121932 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62121961 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62122063 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62122524 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62122869 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 62123106 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 62123426 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62123681 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 62123846 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62124029 A C Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 62124108 G T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62124638 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62124654 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62124700 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62124744 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 62124802 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62125010 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62125196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62125237 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62125520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62126168 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62126283 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 62126305 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 62126891 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 62127425 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62129821 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62130794 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 62130826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62131320 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62133015 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 62133984 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62134268 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62134753 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62135470 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62135885 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62144076 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 62144398 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62144796 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62147099 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62148074 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 62158670 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62159670 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62160958 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62161297 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62165434 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62170090 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62173877 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62180095 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62180674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62181404 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62181563 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 62184284 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62185088 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62185635 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 X 62192002 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62197929 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62198589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62199582 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 62202958 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62203308 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62204847 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 62204848 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 62204959 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 62205767 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62208000 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62211184 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62211286 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62211289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62211291 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62211555 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62211642 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62212340 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62212825 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62213338 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62213435 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 X 62214274 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62214298 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62215457 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62215885 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62216243 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62216629 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62217143 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 X 62217163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62217234 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 X 62222810 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 62225315 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62227468 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62229593 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62229897 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62230267 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62232825 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62233926 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 62236143 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62240402 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 62241945 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62245157 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62245324 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62247534 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62248186 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62256237 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62261260 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62261848 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62262606 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62263729 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62265419 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62269590 C T N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 X 62269905 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62270226 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62272774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62278532 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62278635 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62278636 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62280105 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62281129 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62282456 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62284476 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 62286192 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62287209 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62287220 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62288651 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62288715 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62289881 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62294350 T G Y N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 X 62296667 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62297172 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 62297928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62298633 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62300504 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62308073 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 62313863 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62317996 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62319569 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62319886 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62322511 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62323260 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62324005 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62325509 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 X 62327600 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62329199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62330400 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62331141 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62331143 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 62333158 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62334752 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62335357 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 62336326 C G N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 X 62336540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62336558 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62336559 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62336899 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62337011 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62338481 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62338927 C A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 X 62339132 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62339555 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62339681 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62340121 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 62348187 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 X 62348821 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62349236 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62351616 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 62353750 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 62354354 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62355746 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 62356588 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 62358544 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 62359471 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62359472 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62361278 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62364415 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62364437 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62368080 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62368550 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62369434 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62370781 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 62370813 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 62370854 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 62371139 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 62372194 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 62377056 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 62377912 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 62378123 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 62378230 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 62378365 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 62381878 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 62381887 C A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 62382428 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62382562 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 62383859 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 62384075 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 62384299 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62385268 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62385362 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62388031 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62389250 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62392463 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62392661 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 62392907 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 62393842 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 62394250 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 62397237 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 62398160 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 62401276 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62401454 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62402764 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 62404715 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 62415928 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62416173 G T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62416591 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62416772 C T Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 62416798 C A Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 62417197 T A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 62418143 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62418229 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62422721 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62422722 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62423011 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62425175 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62429349 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62430988 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62433150 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62434981 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 X 62437224 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62437551 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62437933 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62438403 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 62439114 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62441145 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62444227 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62445897 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62446179 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62446418 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62449224 C A N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 X 62450667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62452119 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62452845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62453114 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62454056 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62454138 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 62457622 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62458209 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62459116 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62460818 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62461303 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62462627 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62463551 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62465618 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62466152 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62466396 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62467151 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62474808 T A N N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.181818181818182 0.0909090909090909 0.727272727272727 5 17 2 1 8 X 62476012 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 62476137 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62476207 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62477229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62477955 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62479796 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 62482676 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62483137 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 62486027 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62488324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62488449 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62488693 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 X 62489100 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62491917 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62492142 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 X 62492373 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62492691 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62492817 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62493210 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 62494981 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62495605 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62496644 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 62498055 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 X 62498846 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62499486 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62500017 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62501336 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62504530 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62504924 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62505665 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62505783 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62506177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62506414 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 X 62508292 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62509918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62510529 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62510567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62513091 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62514307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62514412 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62516689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62517482 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62517967 G T Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 62518705 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62520187 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 62520188 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62521465 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62522126 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62524927 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62525070 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62525371 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62525704 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62529430 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62529911 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 X 62530297 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62530608 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62534240 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 62534488 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 62537536 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62538007 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62538868 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62540593 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62542414 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62542507 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62544056 T C N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 62545331 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 62546234 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62547737 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62548225 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62548509 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62548609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62548828 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62549934 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62549966 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62550587 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62552650 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62554353 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 62555332 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62557333 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62558108 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62558192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62558742 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 62562351 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62563449 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62564843 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62564887 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62566333 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 62566737 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62568660 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62570772 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62570878 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 X 62573099 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 62574684 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62577771 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62578707 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 62578895 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62579224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62580025 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 62582962 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62585846 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62586452 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 62588431 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62588615 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62588851 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62592768 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62593331 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 X 62594405 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62596442 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62596484 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62599236 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62600930 C G N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 62601009 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 62601472 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62602523 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62604620 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62605033 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62605538 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62606778 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 62606864 A G N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 X 62608274 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62608864 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62609951 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62610232 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62610821 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62613086 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62615566 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62616635 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62618293 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62618789 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62619482 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62620987 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62621022 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62621214 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62621428 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62622573 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62623203 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62623204 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62623725 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 62624028 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62624107 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62624458 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62624937 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62625461 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62626809 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 62629417 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62632430 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62632633 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62633651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62635581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62636325 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62637494 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62638517 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62638945 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62639500 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62639530 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62640490 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62641070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62641346 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62642988 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62643249 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 62643524 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62643681 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 X 62647599 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62648483 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62648552 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62648623 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62649224 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62649378 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62649415 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62649529 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62651018 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62651268 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 62652579 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62652866 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62654986 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 62655161 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 62655905 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62657016 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62659337 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62667769 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62668746 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62674917 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62675231 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62676530 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62679554 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62680312 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62682183 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62682401 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62682673 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62682924 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62683044 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62683144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62683697 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62683980 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62684072 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62686457 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62687198 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62690417 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62691001 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62691431 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62693097 G C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 62693516 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62693658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62694997 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62695309 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62695661 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 62697223 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62703447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62704202 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62704831 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62706240 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62708115 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62708398 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62710860 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62710900 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62712327 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62713217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62714163 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 62714166 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 62715666 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 62715763 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62716215 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62717217 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62717926 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 62719791 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62719843 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62721355 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62724272 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62724401 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62724937 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62725514 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62725528 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62725610 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62726087 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62726094 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62726310 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 62727240 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62730361 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62731160 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 62732741 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62733442 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62735484 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62735626 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62736144 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62736226 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62737324 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62738087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62739328 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62744506 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62745341 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62747523 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62747611 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62750015 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62752171 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62752172 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62752527 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62753493 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62753673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62754060 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62754314 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62754545 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62755234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62755650 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62756807 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62757990 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62758026 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62758906 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62759790 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62760100 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62764215 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62764729 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 62765506 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62767240 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62767553 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 62768988 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62769150 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62771386 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62773272 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62773865 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62774525 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62775453 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62777039 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62777450 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62778204 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 62782088 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62782228 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62782288 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62782312 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62783120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62785137 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62785141 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62785295 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62786314 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62786702 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62786809 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62787347 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62789023 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62789103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62789134 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62789769 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62790891 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62791263 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 62791677 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 62800496 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 62800665 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 62801227 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62801958 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62802329 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62802475 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62802641 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62805078 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62806407 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62807014 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62809244 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62809458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62809523 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62811303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62814708 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 62814981 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 62815801 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 62816154 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 62816379 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 62816478 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62817061 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 X 62818264 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62818949 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62820982 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62822118 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62822862 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62826817 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62827605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62828276 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62829316 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62829357 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62831252 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62833798 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62835313 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62836393 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62837505 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 62838249 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62839801 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62839953 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62843133 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 X 62843257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62843490 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62844081 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62844353 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62846140 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62846291 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62846596 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62847960 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62848530 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 62850339 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62850673 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 62851061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62851509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62852810 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62853865 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62854390 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62854561 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62859867 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62859955 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62860402 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 62860477 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62860517 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62861148 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62861158 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62861397 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62861630 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 X 62862396 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 X 62863216 T C N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.666666666666667 0.133333333333333 0.2 22 8 10 2 3 X 62863642 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 X 62864181 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 X 62864319 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 X 62864335 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 X 62864405 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62868722 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.6 0.133333333333333 0.266666666666667 20 10 9 2 4 X 62868759 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62869158 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 X 62869435 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62869526 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 X 62869661 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 X 62870151 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62870309 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62870450 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62871193 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62871418 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62872251 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 62872268 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62872961 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62874119 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62874754 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62875404 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62875465 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62875540 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62877014 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 62877114 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62877614 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 62877867 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 62879056 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62881098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62881993 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62885477 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 62886663 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62891548 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 62892021 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62892412 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62893129 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62893423 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 62893878 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 62896015 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62898590 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62899199 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62899721 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62900200 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62900648 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62901760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62901801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62904225 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 10 22 4 2 10 X 62904518 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62905458 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62905545 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62906529 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62907087 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 62914210 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62914559 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62915649 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62916195 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62917159 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62918262 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62919180 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62927421 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62928953 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62929384 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62929571 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62930940 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62930988 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62931087 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62931140 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62932269 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62935481 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62935622 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62936146 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62936179 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62937587 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62938996 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62939947 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62941217 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 62942232 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 X 62942275 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62942507 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 X 62942550 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 X 62942569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62942637 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 X 62942869 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 X 62942931 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 X 62943206 A T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 X 62943435 A T Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 X 62943468 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 X 62944070 C A Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 X 62944698 A G Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 X 62944762 T C Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 X 62944821 C G Y N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 X 62945063 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 62945163 A T Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 X 62945178 T G Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 X 62945284 G A Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 X 62945749 G A Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 X 62945962 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 X 62945986 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62946068 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 X 62946086 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 X 62946149 G A Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 X 62946220 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 X 62946341 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 X 62946623 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62946868 A C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 62947419 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 62947899 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 X 62947936 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 X 62948349 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62948655 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62948891 A C N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 X 62949009 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62949021 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 X 62949150 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62949200 C A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 X 62949212 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62949229 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 X 62949375 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 X 62949380 C G Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 X 62949600 G C Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 X 62949772 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62949817 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 X 62949884 T G Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 X 62949987 T A Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.6875 0.0625 0.25 23 9 11 1 4 X 62950017 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 X 62950163 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62950199 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 X 62950216 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62950309 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 X 62950351 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 X 62950411 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 X 62950558 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 X 62950597 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62950724 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 X 62950780 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 X 62950803 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62950878 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62950927 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62952427 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62952548 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62952810 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62952841 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62952913 T C Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 X 62953127 C G Y N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 X 62953177 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62953400 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62953415 C A Y N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 X 62953420 A T Y N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.571428571428571 0.214285714285714 0.214285714285714 19 9 8 3 3 X 62953438 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 62953570 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62953740 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62954011 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62954055 G T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 X 62954459 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62954692 C T Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 X 62955168 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62955213 A C Y N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.571428571428571 0.214285714285714 0.214285714285714 19 9 8 3 3 X 62955218 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 62955453 C T Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 X 62955726 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62955769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62955801 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62955957 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62956124 C A Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 X 62956152 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62956276 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62956296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62956320 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62956324 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62956696 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62956744 C T Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 X 62957452 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62957616 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62957641 C T Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 X 62957688 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62958093 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 62958128 G A Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 X 62958163 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62958200 G A Y Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 X 62958266 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 62958472 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 62958806 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62958891 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62958892 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 X 62958922 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62959187 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62959197 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62959450 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.647058823529412 0.117647058823529 0.235294117647059 24 10 11 2 4 X 62959701 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62967193 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 62967372 C T Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 X 62967394 A T Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 X 62967686 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62968033 T C Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 X 62968429 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62968598 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 62968611 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 62968615 C G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 62968798 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62969028 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62969036 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62969384 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62969418 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62969424 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62969730 G A N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 62969752 A T N N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 X 62969801 A T N N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 X 62970057 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62970320 C A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 X 62970354 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62970454 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62970506 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 62970592 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62970847 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62970946 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62970973 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62971314 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62971962 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62972006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62972507 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 X 62972837 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62972941 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 62973076 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62973464 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 X 62973507 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62973656 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 X 62973709 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62973991 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62974754 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 X 62975127 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62975251 T G Y N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.6 0.133333333333333 0.266666666666667 20 10 9 2 4 X 62975275 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62975500 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62975534 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62975679 C T Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.666666666666667 0.133333333333333 0.2 22 8 10 2 3 X 62975744 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 62975927 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62976020 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 X 62976134 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62976338 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62976456 A C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 X 62976598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62976942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62976974 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62977091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62977311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62977340 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62977920 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 X 62977958 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62978892 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62979560 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62979695 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 62979961 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62980111 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62980348 C T Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 X 62980384 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62980684 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 62981471 T A Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 X 62981826 A G Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 X 62981953 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 X 62982138 T G N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 X 62982773 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 X 62982792 C T Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 X 62983053 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 X 62983465 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62983704 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62984020 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 X 62984495 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 X 62984512 A C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 X 62984562 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 X 62984757 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 X 62985109 G A Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 X 62985728 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 62986207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62986746 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 X 62986942 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62986961 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 X 62987062 G A N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 X 62987384 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62987787 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 X 62987945 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.1875 0.125 0.6875 8 24 3 2 11 X 62988746 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62988945 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62989202 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62989499 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 X 62989973 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 10 14 4 2 6 X 62990076 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 62990141 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 62990187 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 62990485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62991218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62991289 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62992701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62992776 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62993041 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62993186 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 62994856 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 X 62995005 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 X 62995344 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 62995600 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 X 62995814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62995870 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 62997888 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 62998386 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 63002924 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63004522 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63007584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63008731 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63009119 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63009121 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63012351 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 63013743 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63016364 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63016562 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 63020549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63021197 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63022392 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63022564 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 63025850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63026975 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63029578 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 63032790 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63037871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63038974 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63039214 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63039950 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 63039989 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 63041282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63042245 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 63043294 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63045580 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 63045618 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 63047290 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 63047951 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63048900 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63048914 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 X 63049090 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 X 63049869 T A N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 0.142857142857143 0.214285714285714 20 8 9 2 3 X 63050030 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.583333333333333 0.166666666666667 0.25 16 8 7 2 3 X 63050934 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63051816 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63052253 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 63052483 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 63052684 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 63053300 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63053538 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63054694 G A N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 X 63055192 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63062528 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63065606 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63065846 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 63067406 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63067515 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63068105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63068285 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63068297 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63070047 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63079623 A G Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.222222222222222 0.0555555555555556 0.722222222222222 9 27 4 1 13 X 63081539 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63082064 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63084188 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63085099 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63086135 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63089374 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63092032 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63092461 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63093437 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63094514 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63097956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63099382 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63099749 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 63101716 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 63103058 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63103648 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 63104214 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 63105250 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63107504 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63107961 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63110669 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63112771 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 63113678 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 63115169 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63115881 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63116011 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 63116152 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 63117055 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63118519 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63120827 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 63120887 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 63121334 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 63122720 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63125586 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63126655 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63130639 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63131958 T A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 63134724 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63135367 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 63135910 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63136876 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63138532 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 63138533 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 63138557 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63138840 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63145886 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 63146632 A T N N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 X 63147844 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 63149138 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63149797 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63150264 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63150386 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63151404 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63152709 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63154536 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 63154582 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 63154929 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63155460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63156163 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63156775 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63158174 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63158317 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 63158423 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63159858 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63159903 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 63160329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63160403 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63161015 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 63161424 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 63161865 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63163316 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63163878 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63164494 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 63164496 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 63164976 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63165033 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63165107 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63165317 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 63165821 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63166240 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 63166273 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63166676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63166730 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63168018 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 63168061 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63168314 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63168627 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63170864 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63173187 A C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 X 63173464 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63174589 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 63180158 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63181190 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 63181806 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63182018 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63183098 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63184584 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 63184777 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63185670 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63187124 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 63188313 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 63188317 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 63189044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63192150 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63192747 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63195147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63195345 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 63197013 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63197598 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63199211 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63199352 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63199815 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63202545 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63203664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63203930 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63203956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63204048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63204055 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63204846 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63206341 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63208767 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63209093 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 63210464 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63210467 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63211487 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63211571 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 63211829 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63211860 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63213082 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63214215 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 63222864 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63226361 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 63227248 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63227487 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 63235516 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63235822 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 63237670 T A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 63238011 T G N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 63238956 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 63239092 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 63239708 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 63253085 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 63253201 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 63253227 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 63253376 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63254238 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63254453 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63254460 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63254781 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63254805 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63255056 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63255796 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63256797 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63259455 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63260501 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63260515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63260759 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63261727 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 63262205 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63264807 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63266264 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63267119 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63267832 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 63269203 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 63270334 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 63270975 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63271310 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 63272773 A G Y Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 X 63273835 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63274268 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63276488 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63278700 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63279294 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63279922 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63281152 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 63282686 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63283249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63283799 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63283968 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63284787 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63285712 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63287266 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63288562 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 63288678 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 63289471 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63289888 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63290231 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63290382 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63290819 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 63291162 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 63291813 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63291954 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63292018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63292098 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63292565 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63293732 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63294627 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63295554 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63296375 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63296435 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63296662 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63296857 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63297159 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63298263 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 63299234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63299373 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63299556 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63300987 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63301162 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63301353 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63305317 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63307559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63307649 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63308376 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63310002 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63310016 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63311390 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63312776 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63313418 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63313750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63313939 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 63314223 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63314542 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63314627 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63315308 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63317812 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63318399 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63318959 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63319770 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63323415 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63324020 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63324942 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 63325602 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63326135 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63327168 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 63329670 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63330330 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 63330335 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 63337343 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63337708 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63338315 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 63338919 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 63340763 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63340926 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63341018 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63343353 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63344294 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63347590 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63349002 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 63351072 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 63354005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63354176 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63355610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63355643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63355810 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63356083 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 63357151 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63358546 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63359094 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 63359510 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 63360209 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63361230 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 63361249 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 63362905 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63363589 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63363877 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63365397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63368038 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63368857 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63368908 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63368957 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63370379 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63371102 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63371957 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63372087 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63372635 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63372921 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 63374006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63376657 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63378427 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63378428 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63379390 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63381475 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63382263 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63382404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63384013 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63388651 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63391941 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63399183 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 63399379 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63404255 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63404501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63409655 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63410815 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63411173 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63411982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63413170 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 63413466 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 63413639 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63414359 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 63415412 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63416412 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63416945 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63417771 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63419182 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63419939 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63420071 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63420537 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 63420591 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 63420733 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 63420822 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 63422588 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63425268 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63426629 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63427275 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63435597 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63435932 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63436035 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 63437168 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 63437226 A G Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 63437607 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63438672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63442535 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63444125 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63444185 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63446088 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63446298 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63446446 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63459271 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63459770 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63461078 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63461255 T A N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 X 63463454 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63463833 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 63464711 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63467003 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 63467677 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63469302 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63470391 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63471779 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63472246 G A Y Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 X 63472539 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 63475608 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 63475927 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63475957 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63476416 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63477568 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63482238 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63490574 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63491214 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 63493351 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63494757 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63497546 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 63500871 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63502643 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63502875 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63504230 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63504712 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63505058 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63506659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63510621 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 63511178 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 63511933 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63513102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63513984 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 63514632 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 63514810 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63516116 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63516393 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63517677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63517754 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63518647 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63518865 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63519051 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63525216 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63525911 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63528047 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63532791 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 63534509 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63534757 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 63534792 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 63535904 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63535933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63537468 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 63537669 C T Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 X 63538999 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63546631 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 63547135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63549431 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63549818 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 X 63552958 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63555853 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63561980 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63564146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63564420 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63564474 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63564761 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63565064 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63565251 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 63566127 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63571351 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 63572233 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63573824 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63575211 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63581202 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63582848 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63583043 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63583237 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 63584060 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 63593067 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63595600 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 63596575 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 63597300 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63598774 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 63600027 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63601128 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63601701 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63602281 G T Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 63603395 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63603426 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63603650 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63604369 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63606965 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 63611214 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63613206 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63615192 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 63620121 G A N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 63620705 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63622552 C T Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 X 63622910 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63623093 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63623996 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 63625401 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63627677 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63630133 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63631650 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63639205 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 63644502 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63644902 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63646064 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63648299 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63649671 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63652101 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 63656171 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63656978 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63657359 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63658154 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 63659410 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 63664150 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 63665848 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 X 63669307 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63669884 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63671359 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63673469 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63674952 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63676724 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63678763 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63680356 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63683043 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63683279 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63684125 G T Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 X 63684234 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 63684696 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63687568 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63689212 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63689948 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63691084 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 63691915 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 63691978 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63692759 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63693935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63695024 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 63700588 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63702622 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63712036 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63714331 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63714561 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63718477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63718614 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63721607 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 63723675 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 63724957 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 X 63735848 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63736124 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63737581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63738611 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63741903 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63744026 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63746574 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63755453 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 63755705 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63756197 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63756544 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63756804 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63757300 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63759586 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 63760826 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63766020 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63767546 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63768873 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63770207 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 63772021 T G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 63776677 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 63778664 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63783650 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63783772 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63787329 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 63787502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63788004 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63788155 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63792313 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63797859 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 63800821 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63801789 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63803198 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 63804763 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63804781 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63804902 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63806223 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63808734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63809011 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63809611 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63810032 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 63811232 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 63811897 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 63812252 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63812331 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63814170 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63816233 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63817220 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63817861 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63818866 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63819376 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63820063 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63820366 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 X 63821226 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63828374 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63831505 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 63832498 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63832868 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63833359 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 63833798 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63835686 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 63837097 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63839126 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 63840837 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 63842837 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63843379 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63844356 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63844449 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63847629 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 63849756 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63854012 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63855111 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 63856060 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 63857179 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63858258 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 63858969 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63868520 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63869596 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 63869974 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63871654 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63877209 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63878389 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 63878870 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 63879935 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63880135 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63880901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63882187 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63882287 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63882316 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63887833 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63890149 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63894443 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 63898018 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63898329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63902901 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63904656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63907418 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63915307 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63917637 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63923253 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 63923839 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63943153 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 X 63960916 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63961136 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63966126 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 63966438 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63966568 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 63968411 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 63971257 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63978740 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63979442 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63982025 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 63982510 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 63984771 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63984772 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63984860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63989512 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63990982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 63992123 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 63995723 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64001339 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64001680 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64001681 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64004108 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64008157 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64008985 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64009137 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64009142 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64016471 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64017886 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64018718 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64019447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64019748 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64023161 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64023165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64023975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64024211 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64024295 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64027447 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64028821 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 64031090 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64033822 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64035509 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64041379 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64043544 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64044140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64044596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64044823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64045897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64048616 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64051483 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 64052403 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64053433 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64054488 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64055552 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 64056330 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64057618 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64061103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64066633 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 64067774 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64073234 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64073698 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64074071 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64089895 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64090962 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64093073 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64094018 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64094209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64094622 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64094924 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 64095014 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64100028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64102692 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64102697 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64105263 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 64107165 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64107679 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64108783 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64110481 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64116809 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64119092 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64121141 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 64122694 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64123664 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64128385 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64129248 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64130957 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 64134109 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64136939 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64137483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64138169 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64139194 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64139440 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64139457 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64141768 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64142066 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64142239 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64142655 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64144090 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64144577 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64146811 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64148144 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 64150704 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64155338 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64156365 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64156636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64156957 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64156967 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 64158609 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 64160904 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64161524 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64163511 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 64164125 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64165738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64166164 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 64167450 A C Y N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.230769230769231 0.615384615384615 0.153846153846154 14 12 3 8 2 X 64168523 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 64175400 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64175753 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64176795 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64176872 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64186078 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64186486 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64186967 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64186997 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64187093 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64187299 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 64190574 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64190580 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64190804 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64194596 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64196534 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64196912 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64196979 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64198047 C G Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 64199032 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64200936 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64200964 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64204876 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64204905 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64205634 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64208328 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64210748 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64212044 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64218123 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64218144 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64219452 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 64222180 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 64223052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64228107 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64230501 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64231166 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64232027 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64232385 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64232386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64233395 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64235599 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64236145 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 64240125 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 64240934 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64242661 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64247613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64252974 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64256467 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 64257180 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 64258702 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64258777 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64260893 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64262079 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 64262925 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64266183 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64273897 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64274294 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64274555 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64274665 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64284388 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64284606 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64284720 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64291819 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64305996 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64306164 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64310629 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 64313169 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 64317293 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64317294 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 64317362 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64317595 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64317712 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64318928 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 64319259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64320469 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64320485 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64320843 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64321021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64323540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64324111 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64324796 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64325223 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64325636 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64326087 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64326302 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64326343 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64326621 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64327104 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64327150 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64327386 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64327795 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64330472 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64330649 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64332240 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64332825 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64333102 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64333419 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64333472 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64335736 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 64336661 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64337051 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64337120 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64337209 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64337672 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 64339537 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 64341174 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64342319 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64343972 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64347903 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64349448 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 64351284 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64351961 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64351962 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64353517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64357191 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 64358472 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64359379 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64360004 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64363578 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 64365005 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 64365100 G T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 64366959 G C N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 64368365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64368471 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 64371774 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64373290 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64374357 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64377228 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64377835 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 64378103 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64379180 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64381191 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64381277 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64382831 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64383325 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64385311 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64386370 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64386942 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 64387260 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 64389472 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64392836 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64394045 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64395583 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64395656 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64396224 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64403839 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64404972 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64405082 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64405230 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64405882 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64405951 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64406364 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64409605 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64413825 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64415554 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64415836 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 64416121 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64416361 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64416367 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64416544 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64417553 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 X 64417571 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64419004 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64420068 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64420849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64420906 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64423005 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64424575 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64425856 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64425970 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64426173 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64428282 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64428710 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64429280 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64429557 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64429831 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64430115 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 X 64432140 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64434238 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 64435061 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64438100 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64438436 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64438998 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64439088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64439654 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64440328 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 64441324 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64442747 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64443531 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64444389 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64445387 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64452400 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64452939 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64453752 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64458622 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 64461200 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64462235 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64463083 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64465532 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 64465607 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 64466777 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 64468679 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64470380 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64473870 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 64474984 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64477534 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64480074 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 64480251 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 64489187 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 64489509 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 64489723 A C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 64491033 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 64491842 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64492156 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64493070 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 64493136 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 X 64493413 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64493985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64495475 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64496051 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64496516 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64496717 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64497723 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64498463 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 64499673 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64500027 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64503717 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64504062 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64504867 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 64505872 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64505890 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64508105 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64508108 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64508111 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64508141 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64508164 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64508165 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64508267 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64509867 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64510110 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64510318 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64514511 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64514814 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64523141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64523299 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64524761 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64528537 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64537408 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64538779 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 64539766 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64539967 G T N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 X 64540038 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 64540791 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64541229 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64545817 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64545902 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64546275 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64548184 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 64550322 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64553080 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 64553953 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64554062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64556216 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64557710 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 64558361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64566870 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64567575 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 64569581 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64571637 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64572694 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64572925 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64574327 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64574760 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64578617 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64578711 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 64579768 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64581269 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64583358 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64583642 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64584573 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64585798 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64587153 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64589522 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 64591775 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64592462 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64593185 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64594093 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 64595165 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64606207 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64606980 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64614281 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 64614288 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 64614326 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 64614720 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 64616794 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64617257 C T Y Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 5 9 1 3 3 X 64620961 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 64621087 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64625905 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64626057 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64633962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64636009 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64636980 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 64638025 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64639360 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64639926 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64641597 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64642468 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 64644580 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 64648282 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64652065 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64652605 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 64652987 C A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 64659211 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64659787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64660706 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64660821 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64662306 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64663071 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64664369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64665202 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 64667009 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64667124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64667610 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64670564 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 64674644 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 64675114 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 64676161 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64676336 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64677179 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 64677865 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64680889 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 64681120 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64681164 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64681246 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64682436 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64683309 C A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 64684430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64687213 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64687265 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64688412 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64695067 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 64695650 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 64697214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64698686 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64702893 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 64707631 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64707763 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64708849 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64709419 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 64711053 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64713771 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64714156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64714753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64716766 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64717310 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64725908 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64728928 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64730027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64730034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64731137 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64731919 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64741901 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64752819 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64753644 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64755847 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64759517 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64760844 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64761369 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64761904 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64763365 G C Y N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 X 64764636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64765028 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64767381 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64770074 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 64771620 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64772063 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64773709 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 64775988 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64776581 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64777006 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64777152 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 64778829 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64779723 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64786417 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 64787535 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64788067 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64788391 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64790970 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64806052 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 64806446 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64807214 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 64807503 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64809845 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64811399 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 64816296 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64816994 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 64817450 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64818705 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64820299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64820998 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64821840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64824053 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 64826956 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 64826971 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64828581 T G Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 X 64829637 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64829683 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64831057 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64831117 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64831544 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64832909 C G Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 64833226 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64833736 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64834137 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64834900 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 64836584 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64841989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64842766 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 64843529 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64845065 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64847668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64851407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64854457 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64855450 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64855570 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64858794 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 64861072 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64862506 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64864107 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64867699 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64868099 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64868350 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64869305 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64869403 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 64872232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64882100 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64891207 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 64893133 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 64898338 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64898568 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64900214 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 64903336 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64910606 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64912172 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64913527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64913528 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64917843 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 64918921 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64919761 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64919927 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64920706 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64921057 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64922311 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64962098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64962536 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64967578 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64967930 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 64970231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64973626 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64974186 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64974572 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64977243 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64979833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64980408 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 64982686 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 64985266 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 64988512 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64989917 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64993620 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64994076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64994077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 64995293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 65003568 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 65013703 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 65018706 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 65020214 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 65026648 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 65033773 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 65034160 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65043379 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 65043638 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65056435 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 65058327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 65064874 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65072430 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 65073968 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 65077840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 65078618 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65079903 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65080400 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65085196 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 65086488 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65087604 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 65087615 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 65088574 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 65094677 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65096687 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 65097423 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 65099962 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65105302 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 65105984 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 65109062 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65109653 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65110042 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65112922 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65113870 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65116069 G C N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 65116527 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 65116538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 65118333 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 65118910 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65119125 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65119236 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 65119525 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 65119781 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 65121547 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65121685 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65122180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 65122656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 65123126 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 65124642 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 65124955 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 65128385 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 65131634 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65135184 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65137234 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 65138401 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 65139132 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 65140413 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65140549 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65143000 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65143069 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65152732 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65164924 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65165685 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 65171018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 65173312 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 65175600 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 65177943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 65181181 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 65188305 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 65195088 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 65195869 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 65196260 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 X 65198404 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 65198454 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 65201456 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 65202453 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 65207055 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 65218572 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65227268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 65236849 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 65236982 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65237533 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 65238798 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65260322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 65268589 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 65273032 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 65278817 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 65294554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 65295513 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 65296368 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 65297081 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65298071 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 65315392 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 65317015 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 65318776 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65328992 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 65337017 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 65342440 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65347144 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 65364629 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 65376310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 65379233 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65381268 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 65387402 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 65392211 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 65398774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 65402756 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 65407354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 65410412 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 65412852 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 65413876 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 65415706 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65416209 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65417971 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 65418790 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 65439951 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 65443387 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 65443453 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 65447938 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65459644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 65464619 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 65468599 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 65474475 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 65475157 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65475164 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65479309 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 X 65485693 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 65489646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 65502070 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65508857 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65509420 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 65512893 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 65514451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 65523602 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 65527050 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 65539140 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65543727 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65557864 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 65561289 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 65565155 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 65570062 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 65583051 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 X 65586050 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 65611418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 65617454 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 65643302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 65645605 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65648003 A T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 65649160 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 65654943 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65665882 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65668002 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 65675008 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 65676637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 65676710 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 65678905 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 65688762 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 65702630 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 65708632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 65711074 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 65736935 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 65739734 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 65741754 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65745371 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 65747132 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 65757388 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 65762662 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 65763760 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 65769294 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 65778204 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65790202 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65797939 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 65799134 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65801573 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 65807957 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 65828980 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 65829909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 65830693 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 65856371 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 65891168 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 65907287 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65913840 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 65917509 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 65917907 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 65919615 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65926950 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 65927991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 65930650 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65931739 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 65932190 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 65933539 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 65935962 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 65936330 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 65937019 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65937274 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 65940099 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 65940644 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 65943855 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 65945622 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65945623 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65945657 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 65952075 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 65953483 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65953503 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65955151 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 65957240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 65957962 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 65958377 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 65958379 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 65960362 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 65966890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 65969007 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 65971933 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 65972377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 65973714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 65976353 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 65978706 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 65986434 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 65987543 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 65989772 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65991436 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 X 65991485 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65993555 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65993903 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65994423 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 65994535 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 65994564 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 65994632 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 65995005 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 65995123 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 65995231 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 X 65995248 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 65995282 G A N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.214285714285714 0.5 0.285714285714286 13 15 3 7 4 X 65995521 T C N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 X 65997417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 65997977 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 65998684 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 65998797 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66000187 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66007265 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66008265 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66009122 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66014891 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66017695 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66018559 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66024799 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66025996 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 66031399 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66033987 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66034208 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66034599 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66036398 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66039541 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 66040124 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66040389 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66045324 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66045638 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66046327 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66046861 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66047076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66050525 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66050661 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 66051081 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66055767 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66057480 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66059275 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66061848 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66066377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66066455 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66070199 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66070567 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66070961 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 66073264 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66079179 G T Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 X 66079882 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 66080300 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66083447 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66084441 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66084485 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66084844 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66085901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66086619 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 X 66087020 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 66087784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66088266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66089245 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66089868 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 X 66090512 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66091069 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66092254 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66092830 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66093244 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66093258 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66093371 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66093582 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66096200 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66096511 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 X 66096553 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66096895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66097531 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 X 66097595 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 X 66097597 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 X 66097685 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 X 66097731 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66097873 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 X 66097989 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66100157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66102257 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66102941 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66103823 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 X 66106289 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66107255 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66107761 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66107789 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66111415 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66113792 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66114206 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 66114558 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 X 66115871 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66118865 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66120109 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66120866 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66121715 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66122508 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66122627 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66124150 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66124912 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 66125008 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 66125651 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66126603 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66133277 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 66133728 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66133802 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66133998 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66134365 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 66135249 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 66135670 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66135740 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66138085 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66141759 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66149433 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 66149598 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66151836 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66164943 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66165823 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66166564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66166762 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66166958 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66167470 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66169967 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66172202 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66173176 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66175782 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66177970 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 66178178 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 66180953 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66180959 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66186788 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66189912 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66195411 G A Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 X 66197251 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66202417 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66203989 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 66204541 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66210233 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 66213358 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66217331 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66221548 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66221628 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66226641 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66228565 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66229336 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66230726 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66231096 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66231097 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66232196 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 66236432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66237440 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66238483 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66240392 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66241582 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66242250 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66243667 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66253597 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66260382 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66267846 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66268207 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 66269290 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 66270805 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 66278090 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 66278291 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66279448 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66279714 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66282432 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66283088 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66283143 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66284835 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66291915 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66295037 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66297104 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66297740 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66297857 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66304246 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66306579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66306967 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66307573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66311154 T A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 66311155 T A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 66315763 T A Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 66316498 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66316542 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66316830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66316877 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66318474 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66318976 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66319176 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66319362 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66319433 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 66319483 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66320071 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66320143 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66320468 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 66321162 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 66321197 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 66321391 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 66323152 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 66323215 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 66323786 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 66323865 T A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 66323891 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 66324575 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 66325258 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 66326292 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 66327518 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66328667 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66330228 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66330254 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66331888 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66333058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66336301 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66337059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66337867 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66343569 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66346961 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66348371 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66348682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66349648 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66352173 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66355558 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 66355604 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 66356228 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66357176 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66358129 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66360435 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 66361262 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66361456 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 66362435 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66363710 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66364742 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66365251 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66365546 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66370826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66371904 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66375537 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66376053 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66379022 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66389155 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 66392900 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 66395150 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66395292 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 66402076 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66404637 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66407297 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66407625 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 66413389 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66414309 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66431231 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66445782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66447946 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66448024 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66449011 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66450013 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66452946 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66453405 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 66455943 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66457761 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66458018 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66458451 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66458641 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66458651 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66461397 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66461815 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 66461833 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 66463811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66466675 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66466689 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66467498 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66467585 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66469348 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 66471328 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66471715 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66472265 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66472561 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 66474308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66474341 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66474555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66477523 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66477646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66480350 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66480654 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66480776 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66483038 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66485882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66488216 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66489796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66492546 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66494750 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66495332 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 66498670 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66507371 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66508016 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 66508198 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 66509392 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66510147 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66511008 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66512910 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 66513232 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66514560 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66514782 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66515214 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66519978 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66520200 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66521635 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66523192 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66523933 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66524124 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66524410 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 66525312 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66525527 C G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 66526140 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 66526714 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66528823 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66529231 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 66529232 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 66530236 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66530304 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 X 66531671 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66531777 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 66532797 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 66533115 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66539568 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66540519 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66541822 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 66542568 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66542634 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 66543307 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 66543867 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66544581 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66544819 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66546787 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66549871 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66550524 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66551319 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66560240 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 66560638 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66561450 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66565616 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66565731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66566116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66568749 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 66576011 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 66583738 G C Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 X 66584524 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 66588242 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66602777 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66604142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66605865 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66611614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66629416 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 66629758 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66636447 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66646299 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 66647623 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66649314 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66649949 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66650667 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66651680 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66656616 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66656775 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66657029 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66657696 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66657872 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66660728 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66660957 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66661326 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66662148 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66662230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66663300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66663402 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66664291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66664942 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66665268 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66665331 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66665380 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66665615 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66666900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66666903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66666924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66667900 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66668086 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 66670316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66671467 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66671614 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66674298 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66681585 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 66682610 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 66689146 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66689737 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 66689820 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66692360 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66693334 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66693706 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66694646 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66696587 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66699097 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66699221 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66700901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66701701 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 66703003 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66706602 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66706962 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66707940 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66707957 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66708029 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 66708490 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 X 66709265 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 66709316 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66710731 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 X 66711122 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66712307 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66714314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66715669 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 66715811 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66716497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66716666 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 X 66717000 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 X 66724391 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66724662 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 66724775 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 66727249 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66727407 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66731933 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 66733088 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 X 66735234 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66735853 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 66741128 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 66741152 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66741157 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66744641 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66745199 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66746716 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66746745 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66746953 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66747141 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66748500 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 X 66748841 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66748843 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66748859 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66748860 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66749136 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66751013 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66752046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66752459 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66752856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66753992 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66757157 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66761276 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 66762010 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66764228 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66766639 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66767593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66767929 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66768167 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66770985 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66776229 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66777658 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 66779893 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 66782680 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 66783098 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66784204 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66784387 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66784765 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66785030 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 66785032 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66785135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66785235 C A Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 X 66785332 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 X 66785412 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 X 66785593 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 X 66785820 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 X 66786695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66787169 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66787435 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 X 66787470 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 X 66787583 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66787636 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66789684 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66790371 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 X 66790379 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 X 66790395 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 X 66790469 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66791013 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 66791575 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 X 66791972 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 X 66791987 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 X 66792261 A C N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 X 66792365 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 X 66792420 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66795398 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66795814 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66797598 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 66798088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66800594 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66801320 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66801930 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 66802237 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66802875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66803160 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66804759 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66805080 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66805216 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 66805663 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66807016 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66807092 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 66807127 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66807305 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66807803 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66808701 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66808842 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66809354 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66809593 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66813507 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 66813648 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66814053 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 66814861 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 66815319 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66815753 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66815780 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 X 66815866 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66817152 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66817662 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66820791 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66821639 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 66822345 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66822381 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66822382 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66822466 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66822559 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66824228 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 66825959 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66834017 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66835475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66835734 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66836213 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 66836228 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 66837268 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66839285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66839364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66843023 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 66843496 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66843670 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66843843 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66843998 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 66844646 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 66846810 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66848291 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66848308 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66848492 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66848703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66849134 T G N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 66849721 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66850112 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 66851431 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66851997 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 X 66852046 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66852129 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 X 66852729 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66854893 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66855287 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66856998 G C N N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 X 66857126 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66857942 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 66858008 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 66858175 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 66859919 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 66860449 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 X 66860647 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66860653 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66860789 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66860917 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66860928 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66860950 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66861138 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66861735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66861788 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66861857 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66862615 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66862639 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66862648 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66862681 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66862730 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 66863208 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 66863284 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66863648 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 X 66863839 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66864116 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66864251 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66864269 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66864460 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66864649 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66864835 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 66866143 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 X 66866487 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 66866736 T C N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 X 66866750 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 66866928 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66867047 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66867185 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 X 66867317 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 X 66867339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66867636 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66867646 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 X 66867843 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 X 66867998 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66868612 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66868888 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66869572 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 66869993 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66870809 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 66872086 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66872105 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66872540 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66872671 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66873253 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66873750 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66874115 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66874532 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66874760 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66875139 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66876467 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 X 66876583 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 X 66876666 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 66877390 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66877592 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 X 66877880 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66878754 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66878841 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66879552 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 66879847 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 X 66880308 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 66880334 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 X 66881760 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66881784 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66881912 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 X 66882421 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66890348 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 X 66890349 G C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 X 66890506 A C Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 X 66890984 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66891122 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 X 66891934 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 X 66892589 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 X 66892616 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 X 66892641 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66892698 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 X 66893451 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 X 66893484 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 X 66893724 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66894358 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 X 66894411 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 X 66894566 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 X 66894572 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 X 66894652 G A Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 X 66894908 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66895901 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 66896573 A T N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 X 66897010 G A N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 X 66897416 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66898113 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66900274 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66901630 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 66902490 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66902839 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66903900 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66903924 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66906152 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66907899 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66907948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66908633 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66908724 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66909012 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66909706 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66910528 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66913227 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66915814 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66917859 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 66917944 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 66928709 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 X 66928781 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66929730 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66931961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66933189 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66935523 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 66936217 C A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 66936691 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66938246 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 X 66940767 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 66941325 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66941708 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66942546 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66942686 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 X 66942809 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 X 66943083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66943288 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66943345 C A Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 X 66943545 G C Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 X 66943954 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66944013 A G Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 X 66944122 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66944219 G A Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 X 66944252 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66944691 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 66945779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66946251 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66947500 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66948322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66948474 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66951064 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66955095 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66955787 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66957341 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66959217 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66960092 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66960486 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66961632 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 66963138 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 66963919 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66964592 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 66964936 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66967279 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66967361 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66969720 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66971911 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66971987 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 X 66973932 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 66973984 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66976647 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 66977807 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 66978117 T A Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 X 66978305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66978698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66978768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66979004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66983515 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66983789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66984804 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66985365 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66985959 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66986093 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66987884 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66987975 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66988921 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 66989591 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 66991194 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 66994094 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 66996048 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 66996089 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 66997328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 66997427 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 67000325 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 67000953 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67001488 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67002120 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67002151 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67003057 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 X 67003228 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 X 67008933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67011086 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67012224 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67012671 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67012871 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67013523 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67014846 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 67017062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67018682 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67019474 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67019705 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67022039 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 67023117 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 X 67023622 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67024180 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67027608 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67028806 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67029622 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 67029902 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67030585 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67031008 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67032293 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 67038120 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67040212 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 67041396 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67042438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67042819 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67043142 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67043252 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67044565 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 67045113 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67045163 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 67047369 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67047831 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67047977 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 67048958 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67049783 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 67050819 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 67052703 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67052928 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67054839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67054885 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 67057707 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 67059588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67062628 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67062788 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67063096 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67063607 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67063795 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67064810 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67065282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67065438 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67066239 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67072081 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 67072896 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67073869 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67074139 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67074160 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67075974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67077200 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67077611 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67081183 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 67081934 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67082541 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67082945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67083920 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67090605 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67091704 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67092101 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67092358 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67095423 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 67096545 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67096647 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67098019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67099482 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67100560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67103347 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67103758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67104169 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67104205 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 67104350 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67104999 T G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 67109720 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67112501 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67115049 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67118181 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 67118624 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 67120864 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67122120 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 67122863 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67123044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67123134 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67125411 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67127422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67130145 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67130610 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 67131089 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67131300 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 X 67133456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67133708 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 67135795 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67135877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67136529 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67136674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67138882 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67138885 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67140860 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67141954 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67141976 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67146402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67146440 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67147284 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67147448 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67149136 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67163589 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 67163790 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 67164484 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 67165989 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 67168103 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67171020 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 67171419 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67172662 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67174065 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67176016 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67179201 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67180083 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67180654 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67182517 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67182667 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 67183398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67192122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67192168 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67192709 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67192830 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67193197 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 67193198 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 67193256 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 X 67195654 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 67195848 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 67196227 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67197247 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67197504 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67203081 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67204357 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67205357 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67205474 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67205900 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67209654 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 67210099 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67213227 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67214915 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67215177 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67215380 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67216213 A G N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0 0.6 0.4 9 21 0 9 6 X 67216764 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67219558 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 67221155 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 67222501 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67224723 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67225723 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67228599 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 67229513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67231694 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67234636 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67234668 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67235175 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 67236188 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67237261 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67241306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67241652 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67241878 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67243266 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67243306 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67243307 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67245935 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67246613 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67247391 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67253786 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67254106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67254213 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67255122 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67257982 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67258447 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67259819 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67261886 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 67266225 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67266901 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 67269169 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 67269484 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67269987 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67271029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67271737 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67271946 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67272209 G A N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 67272569 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 67274476 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 67274809 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67275221 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67275679 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67275922 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67277873 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 67278282 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67278685 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 67279305 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67281667 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67283095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67283142 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67284210 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 67284936 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67285137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67285145 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67285761 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67286002 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 67287270 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67288064 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 X 67288342 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 67288459 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67290268 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67292014 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 67293541 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 67294904 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 67295714 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67296326 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67296351 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67297989 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67298705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67300116 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 67301256 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 67301944 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67301955 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67302871 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67303699 C T N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 67305135 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 67305136 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 67305672 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67305917 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 67306124 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 67306854 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 67307680 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 67316220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67316892 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 67317133 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67317313 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67329815 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 67330800 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 67330878 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 67331247 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67331481 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67332225 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67332477 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67332491 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67332982 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67333718 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67333778 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67333872 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67333874 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67334405 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67334414 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67334818 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 X 67336662 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67337408 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67338501 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 67338552 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67339102 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 67339766 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67341534 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67343354 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 67344421 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67345102 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 67345710 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67347034 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67347285 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67348778 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67353468 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67353944 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67355281 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 67355660 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67356018 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 67356161 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 67357942 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67357949 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67359671 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 67362344 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67362345 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67364940 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 67365414 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67367300 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67369784 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 67374229 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67377512 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67378032 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67378087 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67380704 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67381537 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 67383190 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67383252 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 67383829 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67383858 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67385400 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 67386638 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 67387976 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67389732 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67390555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67392544 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 67393238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67393570 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67394504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67394507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67395627 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67396420 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67397159 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67397474 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67398915 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67401076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67401214 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67401801 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 67403399 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67404164 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 67406802 T C N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 67409382 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67409691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67411094 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 67411624 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67411772 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67412287 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 67412342 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67413090 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 67413897 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67414478 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67414765 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67416808 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67417396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67421025 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67421434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67423354 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 67423359 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67423900 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67423996 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67426299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67426544 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67427367 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67427754 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67433760 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67434079 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 67434421 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 67435199 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 67436650 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 67436913 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67437530 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 67437710 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67438029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67445132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67445290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67445557 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 67447104 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 67451769 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67454426 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67455339 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67461063 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 67461646 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 67463041 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 67468737 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 67470067 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67470111 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67471486 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67473086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67473445 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67473463 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67477104 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67478217 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67478603 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67479908 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67480793 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67480805 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67481235 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 67490082 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67490501 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67490923 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67491624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67491797 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 X 67491822 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67492521 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 67494392 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 67495512 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67496813 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67499433 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 67514126 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 67515666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67516742 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 67528911 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 67529814 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67530798 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67531448 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 67531546 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 67532539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67534239 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 67535608 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 67535666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67536171 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67537250 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67537497 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 67538192 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67539123 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67540417 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67540889 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 67542434 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67543055 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67543258 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67543920 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67546980 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67547289 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67547917 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67549667 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67550689 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67550808 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67552060 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67571616 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67572525 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 67574162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67574747 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 67583152 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67584115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67587769 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67588649 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 67589386 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67589416 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67590052 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67590652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67593643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67593676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67593777 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67593849 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67593853 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67593858 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67593875 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 67593928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67593938 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67594072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67594722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67594941 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67595077 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 67596470 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67598418 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 67598814 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67601214 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 67601551 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 67601997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67602031 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67603552 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67603553 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67603590 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67603910 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67604250 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 67604437 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 67604594 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67604656 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67604721 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67604985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67605246 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 67605508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67605627 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 67605653 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67605658 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67605702 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 67605781 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 67605948 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 67606159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67606497 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 67606524 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 67606731 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 67606732 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 67606877 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67607081 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 67607677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67607786 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67607851 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67608167 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67608181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67608421 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67608489 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 67609144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67609367 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67609760 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67609813 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 67610042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67610944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67610964 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 67611394 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 67611397 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67611457 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 67611622 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67612433 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67619203 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67619933 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 67621385 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67621480 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67621531 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67621687 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67621811 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67622030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67622330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67622342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67622343 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67622348 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67629503 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67629522 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67629640 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 67629753 C A Y N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 67629754 A G Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 67629876 A T Y N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 X 67632227 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 67632472 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67632561 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67632564 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67632582 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 67635894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67636070 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67636243 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 67643005 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67646267 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67651718 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67709807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67710092 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 67710148 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 X 67711687 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67712911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67715103 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 67715273 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67716927 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67717446 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 67718716 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67719148 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67720010 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67720952 A T N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 X 67721107 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 67725239 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67725624 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67727761 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67727892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67728844 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67729723 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67729769 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 67729817 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 67729990 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67732726 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 67732834 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67733397 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67733917 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67734229 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67734687 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67736364 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67736793 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67737261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67794131 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 67795494 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67798077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67802491 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67802601 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67803029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67805916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67806025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67806802 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67814605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67814978 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67815290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67816318 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67816429 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67816446 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67817249 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67817431 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67817744 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67818387 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 67820782 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67820806 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67828911 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67828972 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67829430 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 67829742 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67830645 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67831196 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67832715 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67833872 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 67833881 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 67833966 T G N N 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 4 10 1 2 4 X 67835231 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 67836321 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 67837275 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67837452 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67837635 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67838128 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 67838724 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67840299 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67840994 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67841665 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67842179 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67842436 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67843835 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 67846188 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 67846298 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 67847538 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 67849734 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67849950 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67850000 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67850979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67851024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67851226 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67852359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67852427 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67853340 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67853609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67857420 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 67858014 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67858524 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67859721 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67860073 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67861811 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67861989 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67862872 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67863249 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67863252 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67863257 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67867926 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67868601 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67870464 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67872284 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67872780 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67872903 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67873163 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67874158 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67874524 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67875891 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67876473 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 67876685 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67876686 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 67880481 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 67881474 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 67885828 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67886277 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67886399 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67890268 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 67893499 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67893943 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 67894060 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67898159 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67899609 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 67899769 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 67899772 C T Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 67904058 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67906186 G C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 67910486 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 67911865 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67912189 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67920202 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67923489 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67924695 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 67924935 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 67925139 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 67927718 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 67931962 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67932863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67933496 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 67933589 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 67934539 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 67934771 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67934883 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67937873 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67938191 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 67939931 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 67940595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67940741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67942451 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67944239 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 67947724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67948045 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67949977 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67951137 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67952803 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67956709 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67957883 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 67958203 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 67958605 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 67960386 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 67961431 C T Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 67962863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67963962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67964248 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 67965398 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67966847 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67975939 G T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 67978241 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 67982694 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67983177 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 67983606 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67984637 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 67987414 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 67987474 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 67987908 A T N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 67992928 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68002026 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68004878 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68006800 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 68009670 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 68010020 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68010904 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 68011776 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68014530 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68015916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68015989 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68017922 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68022056 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68022903 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68023615 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68023798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68025617 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68026069 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68027942 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68029126 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68029194 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 68030004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68030231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68031793 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 68032310 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 68033082 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68034984 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68035479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68038696 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68039652 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68040059 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68040266 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 X 68040654 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 68041040 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68042262 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68043241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68044420 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68044481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68047609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68049000 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68054175 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 X 68054420 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68054528 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68054604 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 68055350 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68056003 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 68056345 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68057418 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68058344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68065158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68065551 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68065698 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68066825 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68067198 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68072808 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68073962 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68075876 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68077177 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68077622 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68079159 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 68079325 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68079686 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68079996 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68080266 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 68082845 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 68082993 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68083564 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68083688 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68084102 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68084364 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68084499 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68084747 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 68085230 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 68086909 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 68095465 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68096937 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 68101783 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68102930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68110014 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68110817 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 68112745 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 68122149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68124151 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68124744 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68125375 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68126505 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68126522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68126719 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68126730 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68126913 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68127159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68127229 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68127654 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68127730 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68128001 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68128412 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 68128595 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 68128621 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68128773 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 68128923 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68129214 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68129498 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68130269 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68134738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68135001 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68136460 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68136504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68136825 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68139905 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 68142151 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 68142406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68143525 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68143650 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68143677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68144953 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68146745 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68147255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68147890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68152899 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68153040 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68155909 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 68155990 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68156627 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 X 68157142 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68162353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68164517 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 68164765 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68164782 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68167020 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68168198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68168371 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68168690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68173083 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68175217 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68178041 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68183680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68186492 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68187468 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68188323 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68190008 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68190359 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68191686 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 68193206 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68194914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68195462 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68195528 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68195570 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68196460 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68196595 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68197889 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68197955 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68198317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68199123 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68199831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68201673 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68202099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68204615 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 68205564 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68205678 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68205973 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 68206133 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 68208112 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 68208165 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68208177 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68209237 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68209847 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68213605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68215222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68218856 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68220593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68225584 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68226440 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68226884 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68229669 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68230855 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 68231268 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68231513 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68235888 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68236820 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 68241754 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68242048 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68244291 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68244398 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68245399 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68246567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68247579 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 68248102 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 68248811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68251431 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 X 68251765 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68253399 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68257636 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68259414 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68260350 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 68262024 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68263999 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 68265048 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68265135 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 68267636 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68267754 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68268312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68268434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68268922 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68269030 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68272590 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68272593 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68274003 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68275789 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 68276503 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68279057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68279209 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68280841 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68282755 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68284442 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68285287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68285827 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 X 68285961 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 X 68286631 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68286701 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 X 68286714 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 68287958 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68294958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68295045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68296118 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68301491 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 68301581 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 68302973 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68304523 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68309481 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68313564 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68314116 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68314117 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 68314167 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68315041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68317603 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 68318026 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68318200 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68319777 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68321407 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68325496 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68325789 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 68325895 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 68326937 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 68328921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68329950 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68332449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68334079 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68335513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68335974 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68338742 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68339126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68342008 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68344963 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68348123 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68348997 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 68349958 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 68351353 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68352945 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68353980 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68355000 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68356685 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68357048 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68358653 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68361894 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68363809 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 68364553 G C Y N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.333333333333333 0.0555555555555556 0.611111111111111 13 23 6 1 11 X 68364686 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68366065 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68367360 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68367987 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68368078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68368629 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 68368649 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 68376799 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68377972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68379229 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68379260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68379402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68379642 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.65 0.05 0.3 27 13 13 1 6 X 68379999 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.315789473684211 0.0526315789473684 0.631578947368421 13 25 6 1 12 X 68380330 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.3 0.05 0.65 13 27 6 1 13 X 68380452 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68380986 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 68381463 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 68381467 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 X 68382779 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68383443 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68383469 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68384925 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.3 0.05 0.65 13 27 6 1 13 X 68386070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68386101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68387421 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 68389998 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 68390783 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 68391775 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68392067 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68393356 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68393684 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68394806 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68396002 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68396012 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68397179 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 X 68397881 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68401796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68403861 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68406571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68407130 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68407546 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68408084 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68411731 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68413264 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68414445 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68416132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68416654 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68418404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68420632 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68421231 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68423695 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68424276 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68426663 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68427832 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 68427873 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 68427939 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 68428297 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68431651 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68432433 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68432797 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68433244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68433559 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68433829 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68433849 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 68434689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68435070 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68435759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68436982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68437338 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68439035 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68440297 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68440580 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68445493 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68445504 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68445763 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68445861 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68446163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68446171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68446179 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68446260 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68446289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68446301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68446325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68446387 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68446456 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68446532 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68446910 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68446993 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68447058 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68447210 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68449257 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68452479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68452942 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68454157 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68454333 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68456043 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68460104 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 68461508 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68464257 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68465630 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68466929 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 68468623 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68469564 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 68470604 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 68473513 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 68475327 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68477010 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68478017 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68479726 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68479747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68482962 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 X 68483496 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68484434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68486166 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68487918 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68489920 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 68490833 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68491295 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68492196 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 68492301 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 68492422 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68493203 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 68494998 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68495342 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68495921 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68497313 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68499056 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68499122 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 68499248 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68499545 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68501970 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68502336 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68505438 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68506628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68510061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68511124 T G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 68513108 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68519175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68520817 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68520850 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68520919 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68520939 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68521042 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68521045 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68521629 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 X 68521630 C T N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 X 68523568 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 68525300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68525816 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 68526088 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 68526550 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68529111 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68530964 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 68531821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68532582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68533632 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68534186 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68534493 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68534948 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68535003 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68535681 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68536445 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68540607 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68540639 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68541480 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68541744 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 68542303 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68542315 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68542657 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 68543051 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 68544052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68544396 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68546282 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68548444 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68551377 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 68552357 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68552934 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68553493 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 68554173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68554601 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68555166 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68555192 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68555204 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68555231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68555262 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68555459 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68556019 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68556030 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 68556105 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 68556136 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 68556379 G A Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 68556745 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 68557192 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 68557678 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68557721 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68558009 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68558044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68558122 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68559496 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68563397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68563847 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68564102 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68564410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68568507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68570992 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68571223 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68573179 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 68573329 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68573510 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68579535 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 68579670 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68579912 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68580026 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68583814 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68584521 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68584948 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68585326 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68585754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68586501 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 68587522 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68589162 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68590782 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68591044 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68591909 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68593248 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68593743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68593746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68597734 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68598514 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68599538 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 68602265 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68604711 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68604834 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68605274 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 68605443 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 68606843 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68609118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68609969 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68610112 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68611991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68612148 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68612576 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68614120 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 68617090 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68620513 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 68621693 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68623123 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68624527 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68624737 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68627455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68629766 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68631631 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 68633184 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68633374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68633511 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68634222 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68635841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68636885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68637024 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68638756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68639785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68641762 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68642524 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68643906 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68644496 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 68644550 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 68644749 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 68645039 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68645503 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68647102 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 68647350 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68647351 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 68647792 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68647939 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68649572 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68649843 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68651178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68651679 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68651981 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68653465 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68654453 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68657133 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 68657293 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 68657370 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 68659117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68661827 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68662152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68662403 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68662556 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68663570 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 68663589 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 68665062 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68665199 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68666973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68667394 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68667963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68668853 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68676350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68676433 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68677774 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68680102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68680198 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68680219 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68680906 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68683954 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68684002 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68684543 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68688763 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68692612 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68694051 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68694131 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 68694415 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68694572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68695732 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68696585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68700493 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68701334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68701520 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68701920 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68707159 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68707616 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68707710 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68707764 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68707813 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68708896 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68709090 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68709369 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68710891 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68712380 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68712776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68713257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68714586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68715209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68716277 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 68716861 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68717152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68717263 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68718801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68719850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68720100 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 68720697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68722208 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68722307 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68723965 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68724768 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68724805 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 68724893 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 68729000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68729348 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68732553 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68732568 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68732596 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68732835 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68733103 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68733105 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68734646 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 68735917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68737481 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 68738503 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 68738516 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68738517 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68739208 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68739478 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68739578 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 68740257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68742494 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68742744 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68746391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68754368 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68757696 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 68757910 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 68758056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68759316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68763513 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68763677 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68764091 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68768120 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68769022 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68771776 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68772215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68772944 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68773665 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 68777318 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68781437 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 68787999 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68793077 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68793581 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68794479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68794513 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68796112 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68796182 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68804610 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 68817099 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68817268 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68817933 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68819554 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68819961 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68820731 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68820878 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68822873 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 X 68823383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68823440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68824161 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68826126 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68826410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68826616 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68827107 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68828424 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68830123 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68832350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68833290 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68833330 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68833332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68841635 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68843032 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68844448 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68846330 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 68847234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68849544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68849583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68855559 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68856314 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68858462 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68860545 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68861162 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68863603 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68865144 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68866592 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68868202 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68871628 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68872108 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68873013 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68874198 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68876676 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68876875 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68878369 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68879406 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68880746 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68882088 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 68885635 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68886466 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68888672 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68890606 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68894924 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 68899162 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 68903035 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 68908294 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 68911657 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68914500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68915171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68918037 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68918480 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68922386 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68922970 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68926784 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68928696 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 68930244 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 68932273 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68945911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68953969 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68954011 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 68955349 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 68965073 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68969107 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 68969574 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68973786 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 68975359 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68975776 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 68976669 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68977793 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 68977844 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 68996567 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 68997387 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69001329 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 69003768 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 69010073 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 69010893 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69010982 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69014364 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 69017083 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69017084 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69017576 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69018886 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69019413 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69023262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69023683 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69024643 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69025962 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69026858 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69029503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69029558 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69030866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69032636 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69038318 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 69038715 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69039987 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 69040469 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69049833 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69051025 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69059268 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69061051 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69061152 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69062623 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69064042 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69065953 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69068885 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69069106 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69069665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69073520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69074252 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69074331 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69075724 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69076252 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69078782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69079268 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69079287 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69079457 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69080161 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69088198 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69092063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69092428 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69093897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69097297 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69097314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69098199 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69098426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69102805 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 69102911 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 69105922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69107754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69108165 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69109350 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69112624 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69113334 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69114473 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 69114651 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 69117725 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69121177 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69122004 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69125213 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69132375 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69133999 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69134786 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69135043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69139268 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69155770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69167799 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69169164 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 69169475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69169877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69170211 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 69179457 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69184277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69188010 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69189725 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69191448 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69193801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69200741 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69203310 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69203789 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69204070 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69209935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69211480 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69212148 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69213962 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69218246 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69220559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69220733 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69220923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69221004 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69224738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69225016 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69228365 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69230933 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69232195 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69233059 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69233179 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69233992 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69236766 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 69238368 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69239451 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 69239553 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69240480 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69240484 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 69240972 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 69246054 G A N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 X 69260897 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69266672 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69267555 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69267825 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69269222 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69270486 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69271867 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 69275228 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69278618 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 69280243 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69280741 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69288622 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69290166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69291308 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 69292555 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69297945 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69300463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69304354 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69306211 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69306260 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69306729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69309252 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 69314432 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69315693 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69319516 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69320040 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69321101 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 69323523 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69331982 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 69332621 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69334727 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69341934 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69341974 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69344505 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69354681 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69357110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69360892 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 69362319 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 69367317 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69377419 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69377947 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69378299 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69400829 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69412816 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69419021 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 69419335 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69433235 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 69446377 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69446782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69450421 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69452167 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 69452432 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69452527 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69452586 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69454699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69455239 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69458043 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69459168 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69462198 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69467156 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69468117 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69469344 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69469403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69477864 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69478393 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69478907 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 69479511 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69482516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69482961 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69484777 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69493585 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69493690 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 69501097 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69501768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69501938 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69503993 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69508064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69511162 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69512012 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69513711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69516891 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69521315 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 69524717 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69533158 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69541225 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69543785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69543857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69548710 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69549538 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69554969 T A Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 69555299 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69556671 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69557220 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 69560250 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69561504 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 69565119 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69565943 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 69567658 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 69567663 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 69569086 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 69570967 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69571629 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69571690 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69573626 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69574382 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69575880 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69580238 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69581396 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69583319 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69583323 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69588156 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 69589650 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 69589724 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69589845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69591021 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69591279 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69592586 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69592756 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69594677 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69598208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69598806 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 69601694 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 69603871 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 69605495 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69605789 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69607508 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 X 69607624 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69613148 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69613699 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69614070 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69614442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69614567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69614782 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69621953 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69622873 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 69627766 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69627896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69629196 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69629520 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69631013 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69631497 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69632940 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69634005 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69634337 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69637805 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 69638686 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69642007 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69642605 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69651259 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69651328 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 69655229 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69656741 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 69659188 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69659370 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69659807 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69661048 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 69661392 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69661741 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69663375 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69671385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69673031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69680653 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69685109 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69687504 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 69689738 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69692974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69693985 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 69697363 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69697698 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69697895 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69697955 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69700329 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 69701207 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69701325 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69703459 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 69704418 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69706304 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69707183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69708155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69708816 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 69709076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69711918 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69711992 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69713936 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69715465 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69715470 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69717146 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69717147 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69718527 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69718708 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69718958 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69719139 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69719541 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69720061 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 69722206 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 69722865 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69726225 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 69728358 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69728495 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69728505 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69728779 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69728902 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69728933 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69728946 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69728958 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69729131 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 69729408 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69729522 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69729955 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 69729971 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 69730269 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 69730459 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 69732436 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69736283 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69740341 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69741530 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69741641 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 69742152 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 69743187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69744192 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69745304 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 69747641 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 69747667 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69748770 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69749648 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69750363 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69754203 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69754923 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69756032 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69756569 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69758454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69762970 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 69766828 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69767240 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69767725 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69770895 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 69771453 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69775720 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 69776398 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 69776413 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 69776733 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69777728 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 69785985 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69786049 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69787326 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 69788092 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 69788685 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69788895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69789165 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69791289 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69793885 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69797026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69801904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69802615 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 69802750 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 69803350 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 69806848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69811840 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69811872 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69812828 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 69815803 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69817948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69835249 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69837720 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 69837755 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69840438 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 69841618 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69843815 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 69849918 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69854055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69856575 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69865989 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69866400 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69873925 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 69877140 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69878552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69878936 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69880017 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69883136 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69884412 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69887826 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69888223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69889021 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69889436 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69892500 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69895335 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69895449 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 69895841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69896191 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69896611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69896893 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69897012 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 69898835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69903522 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69903797 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69906878 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 69911247 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69913125 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 69915939 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 69917272 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69917941 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69922977 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69931051 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 69932900 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69933034 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 69933038 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 69933185 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 69933568 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69933821 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69934272 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69934588 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69934727 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69934742 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69934900 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69935096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69935773 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69935857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69935942 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69936985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69937015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69937454 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 69937556 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69939084 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69939895 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 69941319 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 69942328 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69944335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69944499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69944522 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69944557 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69944581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69944731 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69944799 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69944894 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69944918 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69944991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69945071 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69945127 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69945139 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 69945227 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69945237 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69945329 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 69945410 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69945586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69945603 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 69945681 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69945700 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 69945717 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69945802 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 69945837 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69945842 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69945857 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69946244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69946502 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 69946725 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 69946745 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 69946927 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69947571 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69947576 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 69949255 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 69952558 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 69956571 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69956705 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69957453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69957759 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69957941 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69958513 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69960277 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 69960593 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 69961191 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 69961206 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 69961207 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 69963720 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69966340 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69966482 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69966983 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69967059 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69967237 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 69968369 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69968379 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69968540 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69970356 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 69970363 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69970532 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69970779 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 69971425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69973268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69973663 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69974279 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69974389 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 69974515 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69974695 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 69974704 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 69974723 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69974861 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69974866 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69975934 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69976902 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69976922 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 69977116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69977501 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69977728 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69977759 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69977790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69978224 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 69978321 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69978634 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69978817 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 69978945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 69978998 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69979445 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 69981045 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 69985885 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 69986208 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 70002686 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70004565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70005024 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70006103 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70006403 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 70007096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70007275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70009119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70010987 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70011495 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70012285 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70013253 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70013952 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 70015553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70017089 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70017706 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70021505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70022143 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70024171 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 70025047 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70026142 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70030590 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70030695 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70032109 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.2 0 0.8 8 32 4 0 16 X 70033050 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70035086 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70035247 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70035962 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70036032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70036141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70036527 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70036751 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70037780 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70038059 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70038110 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 70038227 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70039135 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70039758 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 70040116 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 70041758 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70042684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70042718 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 X 70042733 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 70043102 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70043988 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 70044064 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70044259 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70044497 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70044961 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70045187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70047730 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70050125 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 70050285 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 70056877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70057107 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 70058167 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70058192 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70060455 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70061153 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70064337 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 70066391 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 70067388 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 70067756 A C N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 70068153 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70069908 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70071805 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70072862 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70073707 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70074384 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70074444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70077902 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 70077903 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 70077906 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 X 70078909 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70079334 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70081380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70082482 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70082517 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70085427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70086463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70087355 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70087423 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 70087429 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 70087874 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70088271 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70091314 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70091423 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70091987 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 70092096 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70092487 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70092968 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70093012 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70094203 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70094382 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70094708 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70094754 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70094978 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70095127 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70095732 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70095842 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70096137 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 70097832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70097939 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70098186 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 70098960 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 70099409 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 70099763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70100081 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70100658 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70100964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70101665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70102279 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70102409 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70102530 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70102937 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70102999 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 70103112 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70103423 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70103562 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70103728 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 70103786 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 70103881 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70103882 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70104021 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70104110 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70104111 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70104315 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70106540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70106605 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70106633 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70106724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70106739 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70106805 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70106810 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70106873 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70106906 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70107723 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 70113305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70113518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70114817 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70115072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70115155 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70115448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70116614 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 70116637 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70116641 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70124494 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70124907 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 70125263 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70125785 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70126446 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 70126729 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70126765 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70128420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70128592 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70129501 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70129719 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70130052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70130309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70130323 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70130794 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70131539 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 70133505 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70135031 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 70136405 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70137116 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70137359 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70137545 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70139510 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 70140102 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70140173 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 70140576 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 70140796 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70142390 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70143200 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70143404 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70144113 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70144252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70144503 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 70145572 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70145717 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70145722 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70145773 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 70145792 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 70145854 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 70145865 T G N N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 X 70145878 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 70145942 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 70145995 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 70146000 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 70146001 A T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 70146035 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 70146039 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 70146044 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 70146070 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 70146108 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 70146193 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 70146453 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70146462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70146567 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70146693 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70146702 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70148377 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 70150431 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70150674 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70150723 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70150726 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70155981 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70159960 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70163244 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70164724 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70165747 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70166804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70168433 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70171018 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70172306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70172935 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 70173042 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 70174211 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70176549 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70176700 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70177112 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70177398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70183854 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70194687 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70195407 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 70196279 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70196280 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 70199375 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70199408 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70199444 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70199470 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70199488 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70199572 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70199579 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70199821 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70200010 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70200012 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70200656 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70200836 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70202057 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70204054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70204296 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70204583 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70205277 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70206228 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70207310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70212124 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70212169 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70212221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70212483 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70214101 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70214722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70214932 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70215052 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70216460 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 70217802 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70217861 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70218473 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 70218557 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70218699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70218995 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70219324 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70219417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70219745 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70219780 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70219846 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 70220029 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 70220180 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 70220738 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70220739 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70220858 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70220863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70220915 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70221089 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70221110 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70221127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70221298 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 70221494 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70221655 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70221721 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70221723 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70221732 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70221764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70222006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70222077 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70222203 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70222226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70222315 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70222343 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70222394 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70222637 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70222865 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70222964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70223593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70223648 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70223689 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 70223835 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 70224089 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70224243 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70224245 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70224364 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70225284 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70225466 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 X 70226664 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70227322 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70227391 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70227519 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70230314 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70231290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70232740 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70233025 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70233882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70235274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70236755 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70241291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70241969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70242197 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70242356 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70242724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70242736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70242853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70244103 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70244126 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70244164 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70244456 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70244938 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70245098 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70245325 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70245333 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70245359 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70246173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70246657 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70246677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70246915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70246942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70246986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70247013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70247688 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70247991 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70248403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70248497 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70249826 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70250201 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70252272 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70254400 C T N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 X 70255238 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 X 70255274 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70256777 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70257159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70259978 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70261115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70262633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70263386 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70263753 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70263941 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70264046 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70266343 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 X 70268434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70268707 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70268834 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 X 70269744 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70273591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70274563 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70274645 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70275241 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70275342 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 X 70276483 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70284226 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70285878 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 70291576 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70291584 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70291817 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 X 70292050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70292635 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70294309 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70294329 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70308878 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70311293 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70313011 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70313232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70328889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70329438 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70329440 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70329535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70342436 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70343520 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 70344081 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70378930 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70378954 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70379071 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70379158 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70407649 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70471527 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 70472419 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70472864 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70472902 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 70476725 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70507852 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 X 70508526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70554511 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70563234 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70563288 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 70563773 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70566935 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70567655 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70568391 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 70571423 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70572400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70572807 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70575161 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70576997 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 70578434 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70582790 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70586633 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70591777 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70597763 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 70601149 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70605937 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70607486 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70608030 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70609145 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 70609482 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70609649 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70609885 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70610646 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70612502 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70614061 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 70622229 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70624534 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70624805 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70624913 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70624981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70625489 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70625493 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70628508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70652030 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70654824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70656472 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70663204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70665452 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70666742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70667413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70667426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70667661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70667682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70669184 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 70670216 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70671211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70672902 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 70673083 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70673363 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70673620 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70674232 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70675377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70676574 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70678209 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70678692 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70679001 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70682427 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70691088 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70695709 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70696823 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70698227 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70698314 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70699873 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70700654 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70701513 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70702080 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70705617 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 70711732 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70713123 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 X 70713581 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 70721218 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70722119 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70724059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70727250 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70730673 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70731530 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 X 70732080 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70732865 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70738813 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 X 70740911 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70742085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70742490 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70773551 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70779879 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70780164 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70781787 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70781907 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 70782684 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 70784876 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70785012 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70785311 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70785450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70785631 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70785685 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70786558 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70788191 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70798757 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70804159 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70811620 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70828147 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70832272 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70837142 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70837903 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70841756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70844390 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70845433 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 70846807 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70848251 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70850642 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70851816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70852560 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70854557 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70855814 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 70856403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70858313 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70859747 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70862530 T G N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 X 70862932 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70865228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70865785 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 70866125 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70866130 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70869793 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 X 70871429 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70871867 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70872171 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70872875 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70873089 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70875450 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70876769 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70876950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70877656 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70878282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70880072 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70881409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70887359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70890887 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 70893316 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 70894462 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70895808 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 70896682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70896766 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70896881 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70897107 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70897849 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 70898000 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70898452 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70899693 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70899708 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70899718 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70899741 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70901146 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70901357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70906945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70907486 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70908020 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70908520 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70912806 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70914068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70917300 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70921872 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70923263 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70925473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70927841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70933330 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70934222 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70939894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70940016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70944634 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70952971 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 70955614 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70955959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70960137 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70960993 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70968612 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 X 70968957 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70969330 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70969752 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70969947 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 X 70970197 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 70970202 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 70970207 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 70970456 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 70972667 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 70972804 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 70978524 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70981079 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 X 70983099 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70984686 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70987668 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 70993374 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 70994252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 70998129 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71012236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71017887 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71017903 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71017994 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71018203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71019300 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 71022462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71022836 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71023259 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71024696 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71027627 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71027727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71030794 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71037711 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71043323 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71059416 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71076707 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 71077017 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 71078689 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 71079656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71086504 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 71099990 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 71113331 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71114198 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 X 71114830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71115764 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 71116067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71116447 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71118233 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71119806 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71122066 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 71123436 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 71123984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71125349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71128413 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 71132926 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71133233 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 71133418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71133841 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71133898 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71134017 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71134219 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71134348 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71134709 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71135256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71139961 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71145233 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71145451 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 71145486 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71145743 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71146845 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 71147954 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 X 71149392 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71155694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71156573 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71157517 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71159710 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 71160208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71160306 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 71160404 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71160448 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 71162095 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 X 71164351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71164475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71164577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71165975 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 71167345 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71169930 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 71170311 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 71171162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71171431 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71171591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71173367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71173570 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71175424 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 71175471 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71176262 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71176531 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71176930 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 71176931 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 71177171 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 X 71178168 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 71178422 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71179207 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 71180333 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71181156 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 71181829 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 71182031 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 71185523 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 71185994 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71187610 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71189896 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71217961 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 71218879 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 71218977 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71218994 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71219364 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71219441 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71221331 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71221433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71221498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71221822 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71222449 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 71223120 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 71225203 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71230435 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71231499 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71233926 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 71235534 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 71235648 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71236238 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71237086 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 71242604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71245049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71246372 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71251693 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71252935 G A Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 71253691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71255789 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 71259276 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 71260469 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71264688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71265161 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 71271400 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71280893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71281959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71282606 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71283341 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 71285732 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71287221 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 71289544 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71290235 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71298148 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 71304527 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 71306314 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71307091 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 71308499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71309602 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71319505 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71322168 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 71323676 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 71323759 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 71328178 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71329628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71331359 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71332040 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71333450 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71334618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71334630 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71335128 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71336372 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 71338580 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71340291 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71340770 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71352759 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 71371374 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 71371645 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71427302 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 71452881 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71472841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71487754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71491394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71502142 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71507792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71508709 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 71510661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71516179 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71526977 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 X 71532719 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71542730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71580816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71587221 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71590972 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 71595840 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 71597981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71598051 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71601341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71607300 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 71607516 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 71607718 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 71608540 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 71608565 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 71612462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71615848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71616232 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71616379 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71617138 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71617196 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 71617408 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71617412 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 71617441 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71617559 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71618103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71618163 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71618195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71618618 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71618665 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 71618699 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 71619361 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 71619576 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 X 71619626 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 71619684 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71620102 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71620272 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 71620317 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 71621334 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 X 71622051 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 X 71622093 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71622123 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 71622386 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 X 71623640 G A N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 71624405 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71625600 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71625825 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 71627733 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 71631994 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71636047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71637253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71638049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71638294 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 71638399 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71638647 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71638704 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71639041 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71642469 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71644811 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71645102 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71645653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71646548 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71646616 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71647495 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71647680 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 71649005 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71650347 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 71651320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71653846 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 71655224 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71655313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71657045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71657147 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71657160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71658592 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 71658712 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71659644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71659803 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71661230 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71661925 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 71662009 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 71663888 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71664246 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 71669594 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 71671862 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71675054 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71676880 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71679001 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71679038 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71679111 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71680164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71680221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71680850 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 71680970 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 71681028 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 71681068 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71681080 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71681111 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71682077 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 71682733 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 71685335 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71688660 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71691618 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71692767 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 71693110 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 71693232 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 71693378 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71694246 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 71696534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71698223 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71699275 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71699971 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71700311 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 71701852 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 71702462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71702725 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 71703907 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 71705316 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 71705325 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 71705404 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 71706752 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 71706807 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71707490 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 71709830 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 71710539 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71710568 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71711636 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 X 71711951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71712170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71712640 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 71713024 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 71713459 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 71713694 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71714997 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 71715726 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71729692 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 71730217 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71730280 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 71734680 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71735757 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71736495 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71737882 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71737906 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71740812 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 71741862 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71744108 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 71747421 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71754084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71762434 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 71763554 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 71764022 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71770321 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71770542 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 71771880 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 71772324 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 71776279 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71777024 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71779346 T A Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 71790906 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71791470 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71792906 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71793349 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71796575 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71803972 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 71806571 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 71810336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71811827 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71815633 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 71817905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71823838 C T Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 71824810 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 71825567 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71832500 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71835249 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 71835693 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 71836867 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71837320 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71838349 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 71848260 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71851496 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 71856596 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 71868417 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71869150 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 X 71876995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71877035 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71940734 A G Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 71940780 A G Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 71941075 C G N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 71966207 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 71966221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71980182 G T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 71980192 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 71980193 A T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 71980208 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 71982110 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71992502 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71992897 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71992935 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 71993472 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 71994002 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71995334 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 71996437 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 71997423 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 72009439 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72009932 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72010528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72011593 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72015848 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72036599 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72036834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72036840 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 72036861 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72037106 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 72093309 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72101850 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72104252 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 72104511 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72105204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72107949 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 72157870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72158599 C A Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 72162230 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72167020 G C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 72175783 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72176357 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72176388 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72177157 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72186129 T A Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 72188440 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 72198479 G A Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 72198588 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72198714 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 72198716 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 72200290 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72206368 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 72208381 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72211572 T G Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 72216924 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72218271 A C N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 X 72218562 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 72218673 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72219134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72220827 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72221836 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 72223738 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72224959 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 72224987 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 72227155 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72227157 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72228417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72228419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72228658 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72230050 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 X 72230284 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 X 72231018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72231888 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 72232690 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72232902 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72233122 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 72233581 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72234459 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72234683 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72234832 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72234883 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72235594 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72236263 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72236532 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72236815 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72237160 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72237423 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72237431 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72238714 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72238784 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72239174 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72239442 T C Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 72240252 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72240444 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72241305 T A Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 72241395 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 72242200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72242917 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72242936 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72243145 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 72243167 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 72243319 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 72243450 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 72243962 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 72245784 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72246521 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72248328 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72249649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72252905 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72254967 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72255070 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72255083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72256081 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72257089 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 72257381 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 72257506 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72258195 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 72259895 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 72259956 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72262858 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72263560 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72264758 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 72264766 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 72264894 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 72265610 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72266312 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72266618 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72269083 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 72269109 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 72269305 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 72269816 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72272605 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 72272717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72282574 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72287348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72290291 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72292227 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72298078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72298586 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72300578 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72300923 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72303388 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72305816 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72309119 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 72309396 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 72309422 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72311177 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 72313500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72313654 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72314269 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72315106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72316579 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 72316685 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72318833 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72321169 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72321819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72327542 T G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 72330635 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72332722 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72333621 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72336840 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 72338493 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72338574 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72338591 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 72339018 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 72339223 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 72343190 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72343650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72344617 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72344619 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72345289 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72345290 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72345292 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72345294 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 72346937 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 72347138 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 72347498 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72348434 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72351911 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72356701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72358811 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 72360227 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72360249 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72362656 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72364288 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 X 72364289 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 X 72365352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72366940 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 X 72369176 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72370890 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72370990 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72372994 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72377158 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72380170 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72380905 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72384465 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72388378 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 72391380 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 72392530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72393160 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 72393163 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 72394146 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72394190 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72395137 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72395921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72397554 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72397597 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72398763 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72399752 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 72400263 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72402364 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72402568 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72402597 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72403144 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72404753 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72407060 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 72410341 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 72411020 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72412663 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72413908 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72414615 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 72415910 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 72415963 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 X 72416314 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 72417222 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 72418690 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72419168 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72419464 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72419852 G A Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 72421460 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 72426661 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72427046 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72427780 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 72428139 G A N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 72428314 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 72428364 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72428398 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72428407 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72429321 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72429576 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72429897 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 72431702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72431777 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72431897 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72431924 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72433360 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72433838 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 72433962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72433997 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72434450 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72434641 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72437977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72447014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72447154 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 72448492 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 72449491 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72450130 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 72456398 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72456585 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72458656 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72461536 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 72462759 A T N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 72462760 T G N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 72463202 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72465801 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72466074 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72469750 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72477892 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 72477913 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72481164 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72482190 T A Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 72482441 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72483719 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72484758 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72484775 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72484947 C G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 72484987 T G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 72485058 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72485422 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72485503 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72485852 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72486842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72488901 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72490233 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 72492087 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 72493700 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 72495065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72495463 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 72496974 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72498359 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72500453 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72501094 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72506007 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 72507173 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72507570 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72510944 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 72512955 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72514375 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 72517843 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72520144 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72521622 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72521897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72522606 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72524123 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72525162 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72525479 G C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 72525552 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 72527827 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 72528152 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72528428 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72533971 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72535467 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72536034 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72536035 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72539201 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72539337 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72543272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72543770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72546752 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72547125 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 72557433 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72558545 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72561722 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72563807 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72566903 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 72567014 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 72568189 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 72570477 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72570894 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72574064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72574221 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72575021 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72579575 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 72580154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72582769 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72585309 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72588002 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72588208 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72588281 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72591228 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72595851 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72598806 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 72601276 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72602078 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 72607820 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 72609183 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 72609690 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72610068 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72610256 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72611578 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 72611644 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 72615093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72616111 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72617428 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72620309 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 72620706 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 72621374 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72622396 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72622538 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 X 72622657 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72623645 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72624149 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72624399 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72625146 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 72626038 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72627407 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 72627860 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72628768 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 72630512 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 72632860 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 72633714 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72634022 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 72634654 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72636323 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 72636552 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 72637694 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 72640220 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72640336 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72645499 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 72645762 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72645940 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72646879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72648413 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 72648589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72649818 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72654018 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 72654126 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72654666 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72656435 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72656513 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 72658262 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 72660028 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72661058 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 72661190 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 72661827 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72662284 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72662875 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72663684 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72664332 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72664591 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72664697 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72666687 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 72667346 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 72668332 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 72669783 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72670154 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 72671664 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 72674552 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 72674698 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 72676251 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72677446 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 72677891 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 72681539 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72682183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72682237 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72683717 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72689361 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72689545 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72689547 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72689549 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72690042 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72690242 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72691732 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72692067 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72694870 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72695116 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 72696006 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 72696082 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 72696271 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 72698132 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 72698860 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72699573 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72699597 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72699646 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72701391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72701404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72702588 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72704103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72706243 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 72706744 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72709759 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72710437 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 72711824 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72713727 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 72713898 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72715134 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 72720230 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 72726034 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72726789 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 72727652 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72727782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72729300 C G Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 72733213 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72733939 A T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 X 72734463 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72734553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72734730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72735727 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72736272 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 72737145 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72737446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72738824 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72739185 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72739286 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 72743323 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 72744676 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72744835 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 72745405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72746979 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72747335 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 72747351 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 72748099 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72748377 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 72748593 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 72748810 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72748828 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72748837 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72748853 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72749270 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72749705 C A Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 72755844 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 72759650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72760121 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72762032 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 72762322 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 72768074 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72772203 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 72772783 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72774322 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 72775186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72776002 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72777695 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72777784 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72781829 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 72784203 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 72784488 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72784910 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72789348 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 72792920 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72793037 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72800406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72800599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72800768 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72801020 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72802255 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72802384 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72802424 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72802665 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72802666 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72806572 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 72806726 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 72806767 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72807930 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72808218 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72808455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72808571 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72809964 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 72811418 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72812357 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72812519 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72812581 T A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 X 72813265 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 72814084 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 72814260 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72815436 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 72815610 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 72816143 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 72824827 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72825359 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72825541 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 72825783 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 72833958 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72840601 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72845372 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72848245 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 72848257 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 72853097 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 72858867 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72859565 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72862748 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 72867822 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72867833 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72868225 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 72869465 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 72873644 G A Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 72874295 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72875626 A T Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 72876444 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72876733 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72878473 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72879629 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72882502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72883330 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 72884666 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72916515 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72916649 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72916788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72919147 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72919371 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72929538 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72929597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72929619 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 72930074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72930862 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72931412 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72937431 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 X 72937735 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72938302 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 72938986 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 72942030 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72949192 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 72950401 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72950410 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 72951398 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72958154 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72958221 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72964524 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 72966603 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 72973693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 72974176 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73013934 G A N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 73018022 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 73019361 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73023859 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73024428 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73025052 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 73025526 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 73026405 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 73026421 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 73026965 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 X 73029215 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 73030036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73031064 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73031475 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73032564 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 73033337 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73033698 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73034639 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73034768 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73035065 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 73035386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73036029 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73036128 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73036277 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 73036285 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 73036472 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 73036514 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 73036552 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73036839 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73039233 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73040050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73040300 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 73040364 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73040564 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73040925 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73043075 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73043426 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73043434 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 73043752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73043867 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 73044250 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73044322 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73044353 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 73044638 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73047552 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73050027 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73050051 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73050470 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73050592 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 73050750 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73052363 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73052702 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73052740 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73053007 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 73055180 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 73055851 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 73057493 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73057632 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 73057686 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 73058174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73058623 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73060072 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 73060199 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73062790 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 73067105 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73068704 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73068726 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73069754 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73070785 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 73072820 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73073644 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 73076343 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73076572 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73077635 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73078423 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 73079330 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73080045 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73080127 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73080129 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73080187 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73080702 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73085172 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73085895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73089970 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73090370 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73091087 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 73091177 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 73092382 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73094001 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73096058 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 73097533 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73097630 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73099007 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 73100709 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73101891 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73102963 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73103232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73103270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73104750 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73106578 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73106773 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73111390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73112113 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73112516 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73113091 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73120197 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73120628 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 73122490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73122536 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73125557 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 73125721 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 73127325 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73129223 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73129365 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73130017 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 73130410 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73131182 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 73131818 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73132030 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73132340 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73132503 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73132513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73132570 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73132589 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 73132590 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73132654 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73132831 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73133108 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73133203 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73133927 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73134280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73134661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73137725 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73139251 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73143545 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73146875 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73147833 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 73150828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73151349 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73153002 T A Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 73154032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73154035 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73156695 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73160149 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 73161626 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73162384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73163328 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73168272 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73170789 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73174651 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73175096 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73176864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73179022 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73195133 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73195229 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73195310 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73207441 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73208472 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73211135 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73212632 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73213673 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 73213810 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73215406 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73215626 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73217098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73217236 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73218561 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73220135 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73220845 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 73220979 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 73222021 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73222022 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73222023 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73224129 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73224620 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73224775 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73224828 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73225131 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73227588 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73228873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73229055 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 73229063 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73229341 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73229420 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73229610 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73229720 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73230197 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73230253 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73230471 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73231399 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73232047 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 73232061 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 73234352 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73235118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73239249 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73240680 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 73243075 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73243296 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73245620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73246272 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73247279 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 73248899 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73249092 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73251081 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73253489 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73253801 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73255060 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73256037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73256458 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 73259056 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73262101 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73264645 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73272817 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73275339 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 73280795 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73293954 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 73295536 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73309298 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73311862 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 X 73312660 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 73318675 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73321185 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73325727 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73329258 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 73331659 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73333901 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73343686 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73344459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73346126 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73346913 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73347460 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73347791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73350453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73350607 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73351594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73351675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73352153 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73353683 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73354691 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73359660 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73360358 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73360685 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73361197 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73361336 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73365280 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 73365756 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73366695 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73368753 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73369423 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73369532 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73369884 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73370051 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 73370059 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73370309 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73370672 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73371234 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73371378 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73371495 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 73371510 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 73371912 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73372126 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73372836 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73372863 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73373240 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73373856 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 73374136 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73374170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73374204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73374239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73374468 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73374505 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73374586 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73375580 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73375765 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73375783 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73376546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73376730 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73376887 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73377945 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73378396 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73378403 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73378423 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73379394 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73380762 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73381852 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73382029 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73383775 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73384081 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73384799 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73385433 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73385453 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73386024 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73386444 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73386794 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73386910 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73387009 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73387091 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73387513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73387794 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73389160 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73389449 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73389760 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73390096 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73390129 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73390685 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73391008 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73391678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73391806 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73391809 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73398616 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 73399335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73400025 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73400028 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73400059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73400294 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73401210 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73402299 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73402517 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73403065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73403264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73404179 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73404236 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 73404262 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 73404506 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73404803 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73404854 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73405421 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 73406743 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73406746 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73406757 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73406773 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73407292 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73408919 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73409176 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 73409424 T C N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 73409438 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 73409577 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73409582 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73409610 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73409733 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73409769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73409902 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73409985 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73410197 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73410225 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73410383 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73410654 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73410713 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73411009 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 73411265 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73411271 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 73411304 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73412116 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 73412209 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73412410 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73412709 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 73412988 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73413024 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73415514 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73415618 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73415661 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73415742 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73416738 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73419056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73419239 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73419695 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 X 73419792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73419854 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73420023 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73420036 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 73420198 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73420257 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73420262 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 73420540 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73420674 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73420682 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73420853 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 X 73420867 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73421894 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73423069 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73423635 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73424359 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73426120 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73429840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73431683 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73434143 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73434907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73435235 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73435530 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73435848 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73435991 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73437790 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73438249 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73438346 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73439923 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73440791 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73441433 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73443126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73443615 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73444248 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 X 73446641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73448555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73450561 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73451405 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73451964 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73452178 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73454574 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73456616 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73457657 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73460379 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73460519 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73460636 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73460930 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73461252 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73461569 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73463779 T C Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 X 73465412 T G Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 73466654 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73467530 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73468481 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73472853 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73473397 T G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 73473736 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73473957 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 73474927 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 73475399 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73476124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73477847 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73478033 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73479847 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73480059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73480319 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73488697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73489751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73490141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73491222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73493392 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73494373 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73495522 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73495975 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73495999 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73497313 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73497375 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 73497782 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73498270 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73498397 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73498616 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73498670 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73498671 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73498968 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73499061 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 73499560 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73500380 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73500400 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73500415 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73501430 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73502072 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73502170 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73502213 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73503216 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73503272 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73505085 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 73505210 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 73505904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73506467 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73507013 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73507567 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73508092 G T N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 X 73508093 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 X 73509837 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73509899 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73509906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73510948 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73512127 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73512501 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73513736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73514052 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 73516194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73516552 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 73526756 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73526831 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73528898 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73529915 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73530531 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73530596 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73531413 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 73531737 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73533262 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73533613 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73533694 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 73536244 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73536268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73537437 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73537774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73538179 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73538212 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 73539664 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73540036 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73541756 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73547295 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73547830 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 73549302 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73550933 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73551088 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73552548 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73552852 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73553178 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73554577 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73554602 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73555312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73558194 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73559047 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73560158 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73563251 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73563252 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73564611 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 73567011 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73568060 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73568807 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73569008 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73569047 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73569412 T G N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 X 73569962 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 73570485 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 73570710 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73570959 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73574344 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73574345 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73574846 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73575321 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73575829 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73577258 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73577759 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73578239 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73578286 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73578875 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73579917 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73580781 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73581058 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73581128 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73582439 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73583418 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73583663 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73584686 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73584992 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73591745 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73593479 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73594025 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73596982 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73597055 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73597551 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73599772 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73600107 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73602466 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73602818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73603043 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73604430 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73604438 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73615216 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73615442 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73615975 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73617055 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73620568 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 73622454 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73623843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73624436 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73630558 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73631559 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 73632612 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73632984 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 73633399 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73634455 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73635853 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73636846 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73638009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73638089 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73638977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73642191 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73650914 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73651730 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73651881 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73653221 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73653836 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73655543 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73656665 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73658378 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 73658983 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 73659069 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73660082 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73663489 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73665064 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73665266 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73665358 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73665797 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73665876 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73667061 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73667360 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73667506 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73667788 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73669338 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 73673300 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73676425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73676681 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73681558 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73682716 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73684697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73685662 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 73686400 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73688392 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73689931 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73690359 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73690484 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73695440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73696214 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 73697893 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73698505 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73699607 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73700255 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73700326 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73700834 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 73701764 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73703448 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73703837 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73704132 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73708136 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73708773 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73709093 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 73716140 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73717043 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73719655 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73722366 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73723024 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73723888 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73724439 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73724733 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 73725166 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73726309 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 73726517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73726797 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73726842 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73727840 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73727885 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73729373 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73731772 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73731906 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73733401 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73733589 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73734746 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73735291 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73735682 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 73735816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73736299 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73736964 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73737630 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73738191 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73742924 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73743089 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73743784 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73746271 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 73746334 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73747283 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73748854 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73748966 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73749276 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73750261 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73752749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73753050 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73753109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73753183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73753823 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73754275 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73758626 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73758931 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73760762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73761104 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73761111 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73761719 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73762522 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73762531 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73762850 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73762872 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73763003 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73764143 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 73764154 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73765671 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73766233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73767208 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73768633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73772087 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73773428 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73773461 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73773931 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 73774569 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73774621 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73775636 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73777312 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73777358 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73777376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73777563 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73778579 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73779372 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73779547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73779683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73780595 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73782083 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73783445 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73783982 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 73785123 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73785734 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 73786180 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73790378 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73790605 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73790688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73790763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73790992 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73791059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73805500 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73806249 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73807952 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73808613 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73809125 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73810513 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73811495 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73813404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73814144 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73814205 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73814885 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73818089 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 73818267 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 73819408 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73819706 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73819758 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 73820938 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73821207 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73824044 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73824791 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73826137 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 73826663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73826714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73826816 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73828079 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 73829089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73830836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73831461 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73832426 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73844750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73845247 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73846300 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73846457 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73848573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73849411 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73850007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73850555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73850561 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73851088 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73852608 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73853260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73853415 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73855516 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73855665 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 73856116 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73857085 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73857186 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73859342 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73859618 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73860316 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73861933 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73862027 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73862363 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73862751 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73863396 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73867429 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73867519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73868912 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73870768 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73872208 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 73874236 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73874262 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 73875321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73876471 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73878546 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73878876 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73880619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73880703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73883571 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73886719 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 73887000 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73888476 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73890115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73890654 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73891562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73892477 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73895491 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73896034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73899291 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73900402 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73900458 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 73912196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73912654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73912960 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73913040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73913060 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73913306 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73913368 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73913588 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73913589 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73913833 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73913968 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73913987 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73914265 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73914697 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73914802 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73915064 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 73915383 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73915507 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73917346 C T Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 73917578 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73917867 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73918136 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73918183 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73918210 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73918763 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73918844 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73919141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73919210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73919531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73919736 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73919881 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73920784 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73921021 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73922346 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73922564 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73922771 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73923595 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73923800 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73924004 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73924361 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73924445 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73924446 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73924464 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73925174 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73925734 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73927116 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73927118 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73927181 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 73927246 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 73927789 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 73927992 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73928612 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73928800 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73929916 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 73930217 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 73930409 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 73931873 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73934254 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73935229 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 73935702 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73936180 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73937062 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73938332 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73940368 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73940716 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73941326 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73941524 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73941687 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 73945865 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73946307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73946312 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73953021 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73953494 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73953622 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73954811 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73954903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73954904 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73955006 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73955574 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73955609 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73957028 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73957128 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73957837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73959244 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73960299 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73963635 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73964636 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73965015 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73966149 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73968803 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73969390 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73970321 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73971103 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73971172 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73971631 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73971745 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73972898 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73973771 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 73973772 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 73973859 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73974077 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73974184 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73974394 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73974467 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73974479 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73975599 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73975643 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 73976533 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73976586 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73976614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73977477 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73978263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73979006 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73979119 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73979990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73981014 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73981878 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73982182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73982209 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73982947 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73983119 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73986099 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73987329 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 73987347 C A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 73992242 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73992939 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73993749 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73993948 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73994533 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 73995362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73996353 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73996485 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73996531 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 73997162 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 73997303 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73997304 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73997641 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 73997903 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 73998987 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 73999977 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74001947 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 74003571 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74003693 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74003842 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74004218 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 74004459 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 74004562 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 74004610 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 74005009 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 74013330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74013370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74013545 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74013615 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74013758 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74014330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74015166 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74015298 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74015800 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74016083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74018628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74018736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74019045 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74021128 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74022493 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 74022964 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74024033 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74025804 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74026273 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 74026471 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74026523 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74031990 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74032112 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 74035843 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74038943 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 74039033 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 74039769 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74051731 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74056279 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 74056869 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74057171 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 74059996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74061050 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74061141 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74063056 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74064133 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74064134 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 74065278 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74068035 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74070545 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74071037 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 74071270 T G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 74072395 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 74074697 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74074743 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74074789 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74075773 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74075789 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74077968 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74086842 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74087014 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74087185 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74091904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74091949 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74093108 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74093188 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74093499 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 74093814 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 74094172 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 74094221 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74094471 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74094873 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74094883 C G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 74095028 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74095191 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74095283 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74095399 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74095460 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74097157 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74097167 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74097381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74097684 T C N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 74098369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74098426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74098525 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74098792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74099062 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74099518 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74099537 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74100275 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 74100352 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74100388 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74101528 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 74101529 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 74102073 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74102149 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 74102614 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74102893 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 74103382 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 74104600 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74104909 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74105697 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74105886 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74105924 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74106768 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74107921 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 74107973 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74108138 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 74108940 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74109143 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74110678 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 74112165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74112254 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74112520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74113700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74113757 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74115004 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74115178 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74116454 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74117213 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74117842 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74118103 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74118517 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74118640 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74118894 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74119400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74119498 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74121412 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74121842 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74124417 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 74126300 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74126510 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74126578 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74126613 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74126959 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 74127789 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74128918 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74128923 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74128952 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74129945 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74129966 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74130017 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74130325 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74131975 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 74132462 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74132586 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 74133267 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74133390 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74133449 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 74133733 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74135002 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74135899 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74136265 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74136330 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74136909 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74148244 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74148494 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74148748 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74148752 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74149546 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74149842 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74149987 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74151496 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74151571 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74152145 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74152639 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74152964 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74153526 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74154921 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 74155387 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74155437 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74156059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74156238 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74158649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74158871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74160531 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 74161491 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74166797 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74166861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74167360 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74167810 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74169946 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74170233 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 74173154 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74173198 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74173528 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74174389 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74175257 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 74175472 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74175869 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 74176631 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74177819 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74178414 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74179947 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74180608 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74181264 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74182046 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74183827 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74184646 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74184957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74185896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74188164 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74189183 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 74189997 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74190301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74190946 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74199701 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74199843 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 74200538 C A Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 74201229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74202114 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74202224 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 74204601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74204893 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74205106 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74205401 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74207301 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74207805 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74207835 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74208026 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74208248 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74209049 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74209211 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74209422 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 74209478 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74210170 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74210409 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74210762 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 74212422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74212586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74214030 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 74214919 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 74215513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74215742 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74215818 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74217586 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74218081 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74218113 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 74218686 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74219309 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74220216 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74220555 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 74221327 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74221452 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74221627 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74222699 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74222700 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74222733 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74224193 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74224221 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74224968 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74225540 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74226057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74226533 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74229656 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 74229743 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74230252 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74230452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74231475 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 74232211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74232512 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 74235657 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74236510 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74240073 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 74240251 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74240258 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74240685 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74243218 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74243520 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 74244969 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74250684 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74251430 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74252388 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74257195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74263398 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74263647 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 74263926 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74264252 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 74265610 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74267729 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74271865 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74273511 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 74273636 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 74276277 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74276322 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74277321 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74278450 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74283460 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74284062 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74284197 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74284816 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74285708 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74285752 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74287676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74288251 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74289990 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 74290386 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74293186 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74297834 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74301163 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74303166 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74303894 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74304545 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74304900 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 74310252 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 74310974 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74310985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74312043 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 74312501 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 74312687 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 74313839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74314836 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74315205 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74315574 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74316810 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 74318040 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74318086 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74318492 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74318545 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74325874 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74326498 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74328491 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74330362 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74330761 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74331667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74331787 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74333567 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74334118 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74335663 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74337663 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74338838 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 74340438 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74342005 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 74342399 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74343631 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74343918 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74345094 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74345912 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74346822 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74347608 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 74347672 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 74349800 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74350061 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74350506 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 74355258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74355798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74370361 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74371241 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74371628 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74373296 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74373688 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74378898 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74380238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74380428 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74380526 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 74381019 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74383263 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 74384021 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74384087 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74387065 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 74387285 G A Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 X 74388639 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74388668 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74388672 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74390791 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74392056 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74392127 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74392128 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74393217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74395746 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 74396107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74400482 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74401439 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74402329 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74404732 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74405333 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74405342 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 74406012 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74406303 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 74407128 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74408619 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74408985 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 74410187 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74410800 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74411484 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74411679 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74411992 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74413081 C A Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 74423641 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74427506 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74427821 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74431818 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74432003 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74432320 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74432581 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74433272 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74434881 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74435979 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74436747 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74437061 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74437209 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 74438043 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74438299 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74438683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74439603 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74439720 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74440131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74440183 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74440184 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74440358 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 74440535 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 74440629 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74441534 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 74441935 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74442777 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74443242 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 74443452 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 74444335 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74444377 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74444624 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74444951 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74445347 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74445590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74447089 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74448065 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74448323 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 74449484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74449773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74449847 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74450201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74450356 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74450978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74451275 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 74451320 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74452910 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74453325 G C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 74455939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74456086 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74456491 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 74456886 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74458776 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 74458848 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74460710 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74460787 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74460805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74462650 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74464169 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74464506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74464522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74465666 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74465736 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 74468503 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74468914 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74470750 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 74470971 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74471016 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74471670 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74471856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74474890 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74475184 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74477920 A T Y N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 X 74478245 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 74478647 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 74478701 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74478845 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 74480972 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74481160 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74482170 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74485610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74486464 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74487574 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74487575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74487738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74493892 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 74493926 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74497387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74497963 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74499943 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74520591 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74521075 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74521394 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 74521575 G T Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 74523721 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 74525090 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74539569 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74544742 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 74545275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74545645 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74545764 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74546049 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74546094 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74546369 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74546452 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74546796 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74548159 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74549366 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74549464 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74550764 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74554397 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 74554616 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74556391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74557497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74559491 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74559640 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74559687 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74560049 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74567695 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74568304 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74572163 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74572922 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74573185 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74573274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74573635 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74573645 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74575751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74576347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74576694 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74577891 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74578200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74579267 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74579665 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74580196 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 74580253 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74584631 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74584751 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74587160 G C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 74598405 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74601747 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 74603999 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74608417 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74611866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74612186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74612844 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74612883 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 74615062 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74615406 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74616555 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74616675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74616775 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74617075 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74618142 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74618459 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74622451 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 74623408 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74624685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74631256 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74631893 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74632511 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74632938 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74633730 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74637444 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74638832 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74651731 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74651802 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74651943 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74653573 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74653831 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 74657611 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74659431 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74660880 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 74665687 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 74667204 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74673233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74680090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74680816 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74682920 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74683117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74683578 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 X 74684314 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74687004 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 74687392 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74688705 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 74690009 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74690501 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 74691221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74691856 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74692319 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74693967 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74695108 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 74695937 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74696043 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74697942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74700048 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74700161 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74700304 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 74700658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74700946 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74703934 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74704028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74704476 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74707136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74707593 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74709915 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74712004 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 74712656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74717369 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 74718262 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74719438 T C N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 74722008 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 74723904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74725065 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74728145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74729508 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74729553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74730169 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 74730257 A G N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0 0.538461538461538 0.461538461538462 7 19 0 7 6 X 74731691 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74733328 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74739094 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74740262 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74740890 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74742222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74742885 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74748068 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74750603 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 74751008 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 74752539 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74752799 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 74758900 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74763449 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74764945 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74766461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74767576 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 74770048 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 74772059 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74772934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74775175 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74777993 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74784224 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74784699 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 74792192 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74794937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74795113 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74798605 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74799276 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74799561 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 74799686 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74801385 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74804840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74806106 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74807143 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 74808549 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74808929 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74808957 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 74812790 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74813967 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74815309 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74822950 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74823115 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74824785 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74828487 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74829760 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 74836353 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74837852 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 74841091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74844233 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74846839 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74848506 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74849838 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74853941 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74858919 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74859553 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74859915 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74861732 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74865023 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74865070 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74865391 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74866673 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74868920 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74870902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74871229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74874779 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 74879880 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 74880121 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 74882014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74884440 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74884804 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74885381 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74885390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74885621 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74888292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74890120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74891128 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74892184 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74894267 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74895963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74897196 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74907192 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74910852 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74914634 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74914686 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74916972 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 74924125 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74924549 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 74924676 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74925214 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74926401 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74935898 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74936224 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74937813 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 74938337 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74939564 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74939858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74941293 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74941302 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74941739 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74943275 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74943338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74943860 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74946117 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74947161 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74947327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74948166 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74948515 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74949585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74950173 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74950304 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74950639 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74951062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74951930 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74957797 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74958798 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 74960863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74962748 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74963698 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 74964176 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74967064 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74967204 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74967415 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74967478 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74967497 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74967655 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74969446 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74969925 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74975341 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74977141 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 74977463 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74979809 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74980346 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74980752 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74981049 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74981447 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 74983484 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 74984923 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74985058 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74986745 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 74988897 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74990585 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 74991463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 74992184 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74997784 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 74999240 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 74999371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75003906 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 75004271 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75004449 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75005995 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75011058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75012556 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 75014701 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75015035 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75015038 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75016747 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75016820 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75021881 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75021947 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 75022144 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 75022368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75023307 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75023662 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 75023721 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 75024438 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 75025835 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75028581 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75029680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75030221 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75030441 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75030499 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75030679 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75031133 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 75031731 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75032175 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 X 75032200 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75032300 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 X 75033144 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75033164 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75033568 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 X 75035024 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75035817 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75035944 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 X 75036373 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75036477 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 X 75039006 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75040651 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 75041161 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75041955 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75044986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75053067 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 75055714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75056258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75056932 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 75058616 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75059071 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 75059591 C A N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 X 75059624 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 75059643 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 75059851 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75059857 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75063514 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75067507 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75068291 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 13 5 5 3 1 X 75069394 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75069680 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 75069856 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75073276 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75075945 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75081225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75086753 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 75090779 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75093448 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75093632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75098001 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 75098040 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75098392 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75098630 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75098719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75101933 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 75101967 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 75103264 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75104891 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 75105072 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 75105868 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75106643 A C N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 X 75108920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75113407 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 75113809 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 75114642 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75119329 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75119330 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75119873 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 75120107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75120258 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75122473 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75123110 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.25 0.0625 0.6875 9 23 4 1 11 X 75127237 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75127356 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75127725 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75128155 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 75134650 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75135055 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 75138087 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75146781 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 75149051 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 75149319 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 75150936 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75154959 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75155222 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 75155902 A G Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 75156041 G T N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 X 75156259 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75156539 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75156735 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75157894 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 75158814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75159453 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75160552 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 75161734 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 75172861 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75174198 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75176144 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75176273 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 75176640 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75176975 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75178757 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75180541 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75180828 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 75181444 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75181896 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 75182508 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75190570 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75190693 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75191255 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75192140 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 75192208 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75193594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75196542 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75197468 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75198060 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75198206 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 75198412 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75202434 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75204748 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75210195 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 75211084 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 75211268 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 75212503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75213257 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 75213906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75217983 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75218369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75218719 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75219521 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75220207 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75220208 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75221250 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75222253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75224138 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75225264 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75226611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75227261 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75227338 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75227402 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75227458 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75227493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75242703 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75242717 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75243083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75248920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75248999 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75254335 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75254608 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 75255021 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75255194 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75255248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75255959 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75256126 C G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 75257276 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75258563 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75258568 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75258740 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75259023 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 75259944 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75260896 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75261077 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75261249 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 75261731 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75261844 G C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 75262212 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75262573 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75266092 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75266878 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75267980 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75280386 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75280908 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75281806 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 75282652 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 75284102 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75284801 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75285494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75286258 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75286343 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75286733 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75296365 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75296790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75297969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75299528 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75299594 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75300177 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75300379 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 75300469 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 75300791 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75301815 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75301984 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75302284 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 75303126 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 75303272 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 75303726 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75304381 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 75304948 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75307553 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75308866 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75309337 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 75312096 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 75312597 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 75314643 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75315103 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75315988 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 75316425 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75316473 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75316729 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75317240 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75318055 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75319431 C G N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 75319583 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 75328305 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 75328580 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75329521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75329711 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75329762 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75330790 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75330913 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75331159 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75331749 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75332753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75333079 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75333212 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75335693 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 75335840 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75336251 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75336568 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75337532 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75343124 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75343239 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75343302 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75343536 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 75350515 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 75354570 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75354642 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75355278 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75355661 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75356453 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 75362321 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75362724 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75364482 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75369154 T C N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.363636363636364 0.454545454545455 0.181818181818182 13 9 4 5 2 X 75369860 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75373353 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75373768 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75374982 G T N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 X 75375688 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75377207 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 75380137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75380242 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75383325 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75383508 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75384072 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 75384750 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75393132 C G Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 X 75395242 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 75398299 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75399129 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75400341 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75400431 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 X 75400511 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75402858 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75406683 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 75410435 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 75410452 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75412340 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75421499 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75422550 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75422735 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75424614 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 75428565 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75429117 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 75440093 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75440122 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75441257 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 75444027 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75444245 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 75445629 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75447609 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75447839 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75450091 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75450499 G T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 75450967 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75452860 A G Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 75455498 T A Y N 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 X 75458569 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 75460457 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 75461277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75461474 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 75463199 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75464324 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 75469075 T G Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 75473284 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75484592 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 75493727 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75495018 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75496756 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75498877 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75499675 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75499760 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75500019 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75500811 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75501051 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 X 75504777 T C N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 75507247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75508190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75509345 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 X 75510278 T C N Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 8 6 3 2 2 X 75511278 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75511279 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75512058 A C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 75520008 C A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 X 75521431 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75522271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75522805 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 75524193 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75527700 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75527731 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 75530679 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75532163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75532560 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 X 75533274 A C Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 75537909 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 X 75547018 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75547455 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 75549252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75549524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75550271 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 75551557 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 75551736 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 75551896 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 75554114 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75554802 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 X 75561225 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 75562680 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 75565637 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75567086 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75567834 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 X 75573046 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75573541 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75574414 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75574415 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75575650 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75577329 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75578347 A T Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 75600273 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 75603997 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 75604052 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 75604650 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75607939 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 75608099 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75608572 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75609436 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 75610770 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75611287 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75612809 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75615731 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75617215 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75618061 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75622343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75622550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75622770 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75623027 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75623608 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75626659 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75626706 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 75628455 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75630152 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75633213 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75634202 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 X 75635800 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75638348 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 75641974 A C Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 75644603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75645367 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 75645796 C A Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 75649722 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75652505 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 X 75668383 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 75672027 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75675294 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75679471 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75681267 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 75681665 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 75683246 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75684839 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75690847 A C N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 X 75691936 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75693919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75694874 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 75700211 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75714701 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 75719081 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 75726786 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75727252 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75727293 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75731589 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75732052 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75733025 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 75733391 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 75733951 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 75736668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75739746 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75745301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75746506 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75747322 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75748433 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75749131 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75749509 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75749633 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75750459 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75750591 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 X 75751085 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 75751122 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 75753486 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75753592 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75755072 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75755677 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 75757066 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 75758229 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 75761557 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75762908 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75763294 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75765036 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75766431 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75770227 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75771089 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75781149 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 75782441 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 75783139 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75783361 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75787310 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75788936 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75796085 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75797984 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75803973 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 X 75804493 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75808499 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75810537 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75822038 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 75822346 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 75826282 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75829189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75829803 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 75829870 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75831343 T A N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 X 75836603 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75836828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75836967 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75836986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75838072 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75838370 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 X 75839212 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 75841041 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 75841323 T C N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 75846222 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75846585 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75847771 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75848732 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75852964 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75853265 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75853957 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75854175 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 75855727 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75857192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75857618 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75857844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75859599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75859770 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75860197 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 75860198 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 75860199 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 75860303 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75860472 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75861888 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 75861924 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 75862805 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75863633 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 75864318 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75867047 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75869049 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75870713 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 75871257 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75872343 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75873835 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 75875730 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75879124 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 75885112 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75887853 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75889011 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75891339 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 75891924 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75896138 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75896152 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75898105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75899102 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75900430 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75901665 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75904813 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75906227 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75906860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75908272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75908388 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75917185 C G Y N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 X 75917349 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 75917429 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 75918093 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 75918373 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75923390 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75924002 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75924273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75926482 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75928884 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75933636 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75934215 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75938476 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75938654 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75942155 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75946157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75946640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75946749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75949722 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 75951134 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 75962982 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75962983 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75965662 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75965762 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75965994 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75968175 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75970920 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75971143 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 75971694 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75971787 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75973387 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 75974267 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75974853 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75975238 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75976973 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75978675 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 75983461 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75984933 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 75985789 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75991146 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 75991497 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 X 75991984 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75992586 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 75994146 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75995027 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 75996190 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 75998575 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 75999146 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 75999704 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 75999956 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76000033 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76001352 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76002833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76005885 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 X 76007062 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76008148 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76008938 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76009617 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76010918 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76011544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76011571 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76012263 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76012721 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76014402 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76018873 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76020449 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76020604 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76023466 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76024384 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76024426 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76024878 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76025011 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76026774 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76027782 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76029850 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76031502 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 76032080 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76033499 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76036790 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76038751 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76040764 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76040772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76041007 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76041054 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 76042746 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76042985 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76043852 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76044081 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76045513 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76046214 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 76046460 T C Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 76046850 T A Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 76047753 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 76048624 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76051697 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 76051812 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 76052823 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76054167 T C Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 X 76056409 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76058668 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76059217 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76059556 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76062453 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 76066703 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76066904 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76068185 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76068973 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76070978 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 76072174 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 76072969 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76075035 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76076297 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76080288 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76080929 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76082912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76084611 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76089073 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76090027 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76090707 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76091454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76093488 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76095977 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 76096421 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76102068 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 X 76102252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76105270 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76107484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76107568 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76109111 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76109407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76110433 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76111616 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76114474 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 76117191 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 76117528 A C N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 76118624 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 76120146 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76121289 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 76121420 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76121482 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76121991 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76122280 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76123501 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76123833 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76124033 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76124715 C T Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 X 76124757 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76125079 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76125529 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76126291 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76128330 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76128507 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76131665 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 X 76142338 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76142377 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76142448 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76142558 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76144279 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76145075 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76145076 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76145134 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 76145721 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 76146052 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76146515 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76146556 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76147836 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76148035 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 76149377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76150170 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76150760 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76150834 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76152747 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76153400 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 76153886 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76154089 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76155466 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 76156805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76158506 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76159537 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 76159809 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76160699 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 76162370 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76163471 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76164285 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76164810 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76166182 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76168038 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76168056 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76169641 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76170960 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 76171061 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76174140 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 X 76176376 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76176862 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 76177675 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76178020 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 X 76179726 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 76179935 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 76182505 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76182917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76195093 A G Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 76196083 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76197088 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 76198619 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 76198955 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 76198984 G A Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 76200229 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 76203303 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76204437 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 X 76205156 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76205220 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76206223 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76206980 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76208422 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76208448 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76208488 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76208492 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76208905 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76210785 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76212447 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76212592 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76212706 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 76212777 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 76216416 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76217439 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76217660 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76219483 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76220034 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76220346 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76220869 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76223688 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 76227391 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76227509 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76227633 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76227699 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 76227749 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 76228405 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76228848 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76231045 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76234539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76237230 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76238135 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76239123 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76239831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76241899 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 76242066 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76244418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76244543 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76244637 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76245376 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76245806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76246001 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76246236 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76246640 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 76247004 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76247779 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 X 76250105 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76251531 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 76258081 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76258564 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 76262816 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 76262968 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 76263355 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76264618 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 76265020 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76265874 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76266342 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76267662 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76269765 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76269972 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 76271458 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76272354 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 76272422 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76273154 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76274271 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76285001 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 76285550 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76286723 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76287295 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76287478 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76288921 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76289796 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76289969 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76290542 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76291257 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76292073 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76292378 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76292743 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 76293182 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76294312 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76295038 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76295081 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76295082 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76295344 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76295947 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 76296709 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76297820 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76301638 T G Y N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 76302002 T C Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 76303135 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76303445 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76303494 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76303687 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 76304936 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76307287 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76307507 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76307607 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76308765 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76310279 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76311897 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76312364 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 X 76321681 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76322200 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76323452 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76325606 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 76326603 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76326951 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76328953 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 76329243 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76329750 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76331098 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76334090 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76334986 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76346497 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76346787 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76347594 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 X 76347665 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76348707 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 X 76349639 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76353331 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76358023 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76358692 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 76360878 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76365227 A C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 76365626 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76366479 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76366915 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76367565 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76367826 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76367879 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76369188 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76371250 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76372376 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76372589 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76372607 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76377271 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76378813 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 76379726 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 76379869 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76380016 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76383009 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76383226 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 76383369 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 76384732 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76385979 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76396309 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 76399406 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 76400241 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 76400573 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 76401719 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 76402392 G T Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 76403122 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76405279 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76405599 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 76411667 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 76412374 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76412600 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 X 76413577 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76415029 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76416696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76420310 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76420493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76421168 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76421763 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76422867 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76424283 T C Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 76425174 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76427417 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76432305 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76433799 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 76436539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76439235 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76442277 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76442577 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76443909 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76444078 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76444210 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 76444419 A T Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 76450180 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 76450208 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 76450378 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76450388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76451952 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76454304 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76456211 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76456829 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76460076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76462870 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76463146 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76469940 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 X 76471019 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76473110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76473532 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76475764 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76475925 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76476244 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76476855 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76476963 G A Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 X 76479028 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76479112 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 76481086 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76482293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76482378 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76482660 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76485050 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76486181 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76486537 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76486622 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76486836 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76487229 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76490542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76492223 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76492228 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76494822 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76498926 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76499139 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 76499386 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76501950 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76503624 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76506077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76507339 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76509228 A C N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 X 76509450 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76510149 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76513313 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76513570 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76513707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76516888 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76520569 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76527267 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76527311 G A Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 X 76529698 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76530377 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76531892 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76540346 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 76541296 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76543835 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 76544710 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76546178 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76546490 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 76546981 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76549515 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76552899 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76552977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76553789 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76554012 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76554998 C G N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 76555782 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76556478 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76564696 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76565963 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76567236 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 76567824 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76568023 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 76568111 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 76568785 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76569440 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76570184 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76571188 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76571462 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76572672 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76573437 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76573803 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76573804 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76574269 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76575626 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76575638 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76575944 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76576329 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76576335 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76576401 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76577075 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 76577570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76577583 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76577836 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76581319 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76581498 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76582523 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 76582639 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76582810 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76583611 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76584049 G T Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 X 76585162 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76587321 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76587642 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76588167 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76590165 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76590439 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76590479 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 76591249 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76591447 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76591773 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76592830 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76593968 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76594197 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76594510 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76594715 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76595412 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76595940 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 76597025 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76598515 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76598628 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76598879 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76599660 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76600313 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76600648 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76602517 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76602659 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76602722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76603363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76603585 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76605063 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76605301 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76606992 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76608146 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76608733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76609888 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76610498 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76611862 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 76613940 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76614125 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76616608 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76617648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76618029 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 76618666 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76619341 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76620027 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 76622143 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76623725 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76624243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76625946 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 76626535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76627345 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76628698 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76631107 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 76631615 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 76635484 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76638098 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76638504 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76638880 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76640135 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 76641115 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 X 76643080 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 76644571 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 76647284 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76647420 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76647571 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76650869 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76651014 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76651053 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76652074 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76661779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76663038 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76663983 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 76664207 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 76668121 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76668432 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76669045 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76669391 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76672363 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76673427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76674535 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 X 76676401 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76678309 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76679678 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76681334 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 76683685 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76684431 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76684981 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76691400 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76691965 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 76692569 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76693444 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 76697194 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 76697197 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 76701831 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76703657 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76705372 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76706847 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76711843 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76711844 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76711985 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76712499 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76713690 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76715007 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76716343 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76716861 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76717076 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 76717867 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76720173 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76723294 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76726161 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76727813 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 76728749 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 76729786 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76732103 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 76741447 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76743006 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 76744220 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76747262 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 X 76750999 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76752933 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76754830 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76755924 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76756498 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76760238 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76761836 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76762340 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 76762896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76767795 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 X 76768052 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 76769193 A C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 76770072 C G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76772701 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 76773058 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 76775543 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76790311 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76790756 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76791560 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76792464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76795621 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76796689 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76796941 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76796955 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76797682 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76797726 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76799692 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76800104 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76801964 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76802521 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76803007 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76806236 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 76813828 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76814157 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76815487 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76815833 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76815835 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76815940 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76819283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76819907 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 X 76820121 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76820278 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76820767 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76823109 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76825334 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 76827717 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76828836 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76829127 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 76829966 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76830208 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76833010 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76833021 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 76833439 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 76833492 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76834274 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76835684 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76840378 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76841248 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76842073 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 X 76842077 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76842692 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76844996 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 76847085 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76848416 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 76848878 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76849074 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76850278 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76853923 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76855157 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 76855326 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 76862598 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76862850 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76866708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76871448 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 76872120 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76872303 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76873471 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76873903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76875537 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76875672 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76875837 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76877873 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76878883 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76878986 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76881464 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76882121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76882721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76883033 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76883577 G A Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 X 76884612 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 X 76884729 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76885365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76885799 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76886251 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76886965 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76887047 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76887754 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 76887858 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 X 76888105 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76888106 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76888304 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76888363 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76889495 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76889533 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76889896 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 76890501 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 76890503 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 76890512 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 76890868 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76890948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76891129 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76891355 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76891391 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76891453 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 76891891 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76892700 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76900230 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76901126 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76903246 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76907002 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76909326 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76911903 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 76913106 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76913190 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76914198 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76915427 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76916919 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76919330 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76920124 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76929971 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76930643 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76941058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76941815 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76941959 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 76948164 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 76949052 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 76950089 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76951491 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 76953210 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76953853 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76955996 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 76956815 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 76964080 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 76964686 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76964973 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76965636 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 76966157 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 76972535 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76973658 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76975543 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 76977332 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 76977922 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 76981664 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76991094 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76991738 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 76991930 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76992677 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76992848 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 76994823 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76997818 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 76999853 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77000042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77000961 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77001476 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77002393 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77004220 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77004838 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 77006651 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 77007801 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 77009277 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 77009690 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77009908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77010329 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77011149 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77011235 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77011672 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77012626 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77012914 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77014578 A G Y Y 0.5 ALT 0.95 0.95 0.5 0.5 0 1 0 1 1 0 1 0 X 77014584 A G Y Y 0.5 ALT 0.95 0.95 0.5 0.5 0 1 0 1 1 0 1 0 X 77014623 T A Y N 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 2 4 0 2 1 X 77014988 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77015117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77016326 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77016815 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77017551 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77019527 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77020054 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77020173 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 77020430 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 77021646 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 77022441 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 77024609 G C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 77024830 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 77025117 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 77025232 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 77026378 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 77026743 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 77026757 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 77028024 G C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 77028110 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 77028998 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 77030146 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 77039524 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 77040151 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 77040470 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 77043298 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77045358 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77046328 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77047629 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77047667 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77049102 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77049114 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77049523 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 77049739 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77051178 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77051247 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77051649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77052887 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 77053176 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 77053216 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 77053558 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77054440 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77055125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77057332 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77061421 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 77061441 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 77072456 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 77075308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77075445 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77081129 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77082966 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77084405 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77084964 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77086786 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77088303 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77088360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77088695 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77089792 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77090096 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77090230 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77090282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77091355 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 77091796 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 77092988 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77093334 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77095936 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77096908 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77097394 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 77098195 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 77098367 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 77099964 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 77109917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77109956 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77111412 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77111800 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 77111827 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 77111870 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77117483 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77120054 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77123733 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77123907 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 77126877 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 77128399 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77129435 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77130214 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77131557 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 77133536 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77133754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77134182 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77135977 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77137557 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77138505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77138695 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77140134 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77140161 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77140674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77141201 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77141954 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77143434 A C N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 77145128 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77146888 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77152691 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77153880 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77154664 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77155156 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77155285 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77155464 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77156169 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77156308 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77156500 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77156948 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77158653 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77163579 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77165544 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77166411 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 77173766 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77173843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77174655 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 77174842 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 77175187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77176461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77178301 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77179450 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77184279 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77184400 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 77188437 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 77189545 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77189646 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77192080 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 77192980 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77193793 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77195339 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77196006 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77196289 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77200643 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77201482 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77205273 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77205291 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77209982 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 77215021 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77216800 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77217152 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77217442 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 77219057 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77220126 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 77222153 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77222642 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77226124 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 77227065 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77230147 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77230663 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 77230928 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 77234920 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77237277 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 77237659 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77238276 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77238364 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77242774 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77244342 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77244837 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77245877 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 77248708 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 77248894 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 77249500 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77250334 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77250336 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77250662 T C N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 77251653 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 77255782 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 77256686 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77256787 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77258515 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77258999 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77260261 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77260370 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77264191 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77264795 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77266662 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77266867 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77266882 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77267643 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77268063 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 77269335 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 77269710 A C N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 X 77271985 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77274458 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 77275017 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77276929 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 77276995 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77279109 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77280719 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77282093 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77283881 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 77285119 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77287581 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77288438 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77288457 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77294305 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77295603 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77295766 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77296905 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77298579 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 77299810 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 77301509 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77302473 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 77302474 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 77303132 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77304457 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77305620 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77306488 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77306684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77308302 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77309778 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77309983 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77310394 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 77310414 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 77314014 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 77314618 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77314824 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77314957 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77315048 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77315122 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77315219 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77315383 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77315825 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77316049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77316516 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77317600 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 77317730 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 77319213 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77319957 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 77319993 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 77320304 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77320362 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77321413 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77321657 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77324175 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77325272 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 77325650 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77325740 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77326269 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77326658 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77327546 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77327753 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77328851 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77329164 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77329249 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77330533 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77331802 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77332385 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 77332399 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 77332489 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 77332929 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 77340648 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 77341319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77341369 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77342242 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 77342290 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 77342348 T C N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 77343052 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77352383 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77352613 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77352625 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77352704 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77352752 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77352905 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 77352978 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 77353340 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77353451 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77354526 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77354551 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77357756 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 77357961 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 77359458 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 77360016 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 77361522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77361986 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77362228 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77362892 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 77363051 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77363229 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 77364163 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77364654 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77365363 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77365640 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77366782 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77366941 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77367213 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77367684 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77368863 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77368913 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77372680 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77373366 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 77373640 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 77373677 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 77373995 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77374693 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77375607 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 77379582 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 77382224 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77382691 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 77382796 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77382863 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 77383421 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77383493 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77384128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77393005 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77396487 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77397407 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77399619 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77401195 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77402482 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 77403911 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77404444 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 77408988 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77409805 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77412390 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 77413188 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 77413953 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77414240 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77414907 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 77417247 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77417449 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77419551 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 77422282 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77424348 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77425428 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 X 77426495 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77426861 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77427556 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 77431825 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77432437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77434420 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77435845 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 77441497 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77441516 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77442176 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77444133 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77444298 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77444667 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77444745 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77445007 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77446180 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77446461 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77446818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77446822 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77447284 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77449098 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 77449108 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 77450508 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77450718 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77451676 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77451687 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 77452484 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77452666 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77452755 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77452878 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 77453231 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77462108 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77462344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77462553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77463627 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77465944 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77466990 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 77467849 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 77472341 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77474794 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77476447 A C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 77478328 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77479575 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77479759 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77483015 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77483515 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77485981 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 77489581 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77490836 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77492590 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77493494 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77493695 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77493750 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77495504 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77496469 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77504184 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77504933 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77507339 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77508132 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 77510490 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77510942 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77511599 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77513049 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 77513155 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 77513632 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 77514417 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 77514826 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77515014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77515311 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77516834 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77518614 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77519225 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77520173 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77520579 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77521247 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77521848 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 77522126 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77522583 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77522861 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77523549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77523778 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77524837 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77524846 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 77524878 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77525482 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 77525605 C G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77526704 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77528041 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77528189 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77528459 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77528703 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77528762 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77528866 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77529497 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77529658 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 77532983 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77533430 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 77533594 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 77533655 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77535267 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77536447 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 77536756 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77538546 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 77539082 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77539808 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 77541681 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77541933 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77542767 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77542944 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77543769 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77544469 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77545383 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77545397 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77546869 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77547405 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 77547565 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 77548147 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 77548567 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 77549349 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77549350 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77550305 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 77551003 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77551627 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77552102 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77554122 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77554668 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77555477 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77556078 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77556571 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77556754 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77559840 C G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 77560230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77560372 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77560373 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77560474 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77560690 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77560731 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77561277 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77563448 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 77564120 C T N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 X 77564460 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77564896 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77565381 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 77565749 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 77566298 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77566826 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77567490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77567727 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77567730 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77568808 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77569031 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77569099 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77569337 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 77569650 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77570068 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77571175 T G N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 77571750 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 77571751 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 77574805 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77576416 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 77576447 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 77576565 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 77579040 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77579239 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77579244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77580646 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 77584315 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77584917 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77585907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77586196 A G N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 77587190 T A N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 77587322 C T N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 77591121 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77591122 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77592091 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 77592546 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77593345 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77593582 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77595069 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77595392 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77595603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77595672 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77596213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77598326 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77600296 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77600338 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77602152 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77602616 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77603601 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77603950 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77604084 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77604741 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77605144 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77605547 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77605673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77605891 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77607050 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 77610079 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77610100 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77610207 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77610259 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77610528 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 77610537 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 77618045 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77620647 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 77621719 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77622875 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77630459 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77630928 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77631341 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77631361 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77634939 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77635404 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77635488 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77636129 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77636711 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77636776 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77637033 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 77637115 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77637762 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77638854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77638958 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77639277 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77639976 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77640652 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77641351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77641830 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 77642047 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77643807 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77645105 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77647008 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 77647623 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77647981 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77648575 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 77649866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77649944 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77651105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77651199 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77652379 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 77652409 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77652437 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77652908 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77653321 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77653442 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 77653892 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77654282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77654825 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77654987 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77655669 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77655851 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 77656754 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 77656783 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 77656971 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77656986 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77657508 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77657848 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77659670 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77660287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77660379 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77660715 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77661133 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77661891 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77662148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77663093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77664584 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77665970 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 77666387 T A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 77666458 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 77666557 G T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 77666790 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77667048 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77667217 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77667564 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77668328 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77669550 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77669551 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77670143 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77670245 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77670434 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 77670790 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77671252 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77671580 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77671624 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77672402 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 77672731 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77673322 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 77676533 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77677538 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77678106 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77679184 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77682962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77686525 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 77686564 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 77686726 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 77687137 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77688127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77688213 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77688797 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77688882 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77689086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77689159 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77689515 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77690564 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77690802 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77691094 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77691575 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77691836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77692136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77692668 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77694318 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77694764 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 77694941 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 77695222 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77695232 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77695765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77697137 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77697185 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77697784 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77697987 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77698069 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77698838 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 77699716 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77701155 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77704202 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 77704247 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 77704277 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 77704894 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77705147 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77707831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77708045 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77708570 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77709800 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77711177 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77711316 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77711555 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77711861 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77717787 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77718318 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77718801 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 77718831 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 77720298 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77720536 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77720764 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 77722139 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77722518 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 77722899 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77724451 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 77725238 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77726252 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77726272 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77726331 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 77734068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77734171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77734237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77734376 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77734490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77734592 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77735266 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 77735511 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77735752 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77736478 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77739277 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77740722 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 77740905 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77741218 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77742952 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 77743156 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77743744 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77744009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77745078 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77746149 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 77746390 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77746593 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77747889 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77747948 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77748004 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77748009 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77748210 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77754760 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 77756482 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77756979 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 77757346 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 77757457 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 77757727 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 77757737 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 77758255 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77759109 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77759349 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77760199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77760701 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77761006 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77761284 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77763158 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77763531 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77764058 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77764889 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 77765336 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77765479 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77765655 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77766175 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 77766472 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77767224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77767552 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77767830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77768443 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77768960 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 77768988 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 77769101 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 77769500 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77769537 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77770925 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77771357 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 77772018 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77772479 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77772711 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77772739 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77772983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77774068 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77774626 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77774949 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77780681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77780805 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77781285 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77781987 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 77783054 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77786131 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77798170 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77798186 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 77798188 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 77809189 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77810467 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77810775 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77817329 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77824013 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 77835464 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77836217 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77841132 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 77841351 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 77851301 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77852933 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 77857477 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77858294 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77858944 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77860846 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77861282 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77865919 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77873548 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77874377 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 77874384 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 77876352 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77877372 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 77878989 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77879474 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 77881764 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77886866 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77890448 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77890511 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77893182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77893278 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77896394 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77896395 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77896495 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77900547 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77901292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77901774 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77901798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77904284 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77907058 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 77909039 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77909192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77911739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77912214 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77912226 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77918197 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77919832 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77920356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77921427 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 77921468 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77922254 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 77922748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77923714 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77925086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77925692 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77925832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77926278 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77927793 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77929587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77929785 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77931624 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77931648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77937179 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 77938063 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 77939087 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77942566 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77942696 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77944229 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77944231 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77944834 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77945034 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 77945954 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77946462 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77947140 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77947855 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77947924 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77951890 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77952226 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77952325 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77952740 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 77953731 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77957494 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77960455 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77960525 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77961880 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77963770 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77964729 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77966638 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77966727 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77967393 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77968849 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 77970024 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 77971076 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 77971084 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 77971127 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77971923 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77972974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77974533 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77975075 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77975176 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77975737 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 77976770 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77977466 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 77978512 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77979805 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77980547 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 77981002 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 77982459 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77987200 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 77987515 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77988019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77988925 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 77989793 T A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 77989956 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77990246 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 77991719 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 77993163 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 77993647 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 77993963 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78000995 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78001185 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78001898 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78002388 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78002605 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 78002857 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78003327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78004744 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 78004963 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 78005274 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78006401 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78006776 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78008306 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 78015816 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78015817 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78016184 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 78016986 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78017423 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78025590 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 78027882 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78028687 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78033335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78035038 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 78036483 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78037028 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78037883 C T N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 78037934 C A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 78043564 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78044210 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78047955 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78048670 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78050136 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 78051247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78051754 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 78053114 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 78053726 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78058489 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78069385 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78069394 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 78069620 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78076395 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78077787 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78078875 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78078966 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 78079204 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 78079347 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 78081104 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78081497 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78081670 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78082938 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78083510 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78083519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78083827 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78084208 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 78085110 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78086395 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 78087294 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 78087385 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 78087752 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78088047 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78088620 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78088848 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 78088917 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 78089011 C T N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 78089341 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78089531 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78090296 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 78090541 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78092308 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78093095 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78093462 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78095202 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78095398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78097497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78098657 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 78103501 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78103900 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 78106362 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78113968 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 78114149 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 78114367 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78114535 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 78115500 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78116309 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78117282 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78117422 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78117779 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78120356 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78120624 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78121131 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 78122985 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 78124796 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78125455 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78127055 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78129067 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78130529 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78130916 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78131205 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78131251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78131416 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78131715 T A N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 X 78145920 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78146034 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78150861 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 78150996 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78151323 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78151324 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78151491 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78151691 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 78152076 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 78152193 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78152222 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78153017 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78153090 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78153461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78155348 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78156983 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78158525 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78158532 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78159393 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 78160627 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78162481 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78165069 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 78165352 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 78165897 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78165913 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78167063 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78167141 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78168567 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78169316 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78170101 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78171771 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78171798 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78175781 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78176713 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78177259 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78177381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78178969 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 X 78178979 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 78180170 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78180358 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78181880 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78183532 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 78183939 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78184944 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78184972 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78185172 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78185847 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 78185961 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 78188266 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 78189081 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78190228 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 78191599 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 78192186 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78192589 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78192818 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 78192959 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78194309 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78194905 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78195681 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78195814 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78196737 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78212748 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 78213161 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78216093 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 78216300 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78218474 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 78218922 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 78219775 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78220930 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 78220979 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 78221236 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78222185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78222541 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 78223178 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 78233103 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 78233547 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 78235812 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78240862 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 78240922 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78244158 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78244231 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 78244336 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 78245269 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 78245495 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78246944 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78246994 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78247084 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78249268 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78250790 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78251714 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78252662 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 78253477 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 78254977 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78255405 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 78257465 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78257720 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78257814 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78258320 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78259180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78259427 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78259488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78259925 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78261169 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78261375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78263332 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78263462 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78264292 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 78267272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78268846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78270372 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78276646 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 78277834 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78279374 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78279378 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78282622 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78282997 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78283122 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78284005 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78284356 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78284881 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78285080 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78285213 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78285781 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78286123 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78288571 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78288676 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78289372 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 78290307 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 78290796 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 78291550 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78292990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78293704 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78293824 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78298832 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 78299308 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 78299979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78302002 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 78303803 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78305065 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78305439 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78306732 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78308125 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78308701 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 78308980 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 78309171 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78309591 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78311811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78312131 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78312886 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78315678 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78316989 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 78317979 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 78321644 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78322464 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78326867 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 78329512 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78330569 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78331349 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78333089 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78334249 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78337426 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78337525 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78338035 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78341326 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78342106 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78342210 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78342596 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 X 78344498 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 X 78345741 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 X 78346082 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78346094 A C N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 X 78346099 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78346428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78347465 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78347778 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78348888 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78351575 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78352127 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78352355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78352397 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78352699 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78353400 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78354828 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78355143 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78355793 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78355827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78356047 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78359652 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78361455 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 X 78362259 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 X 78363380 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 X 78363823 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 X 78363833 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78365962 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78366258 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78366838 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78367445 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 78367657 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78368355 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78371286 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78371315 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 78371358 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 78371669 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78372301 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 78372857 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 X 78372984 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 X 78373179 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 X 78373984 A G N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 X 78374583 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78374895 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78375403 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78375410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78375420 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78376174 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78376889 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78377022 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 78377047 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 78380617 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 X 78380692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78380739 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 X 78380898 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78380985 T G N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 X 78381312 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 X 78381330 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 X 78381373 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 78382550 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78383934 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 78384061 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 78384704 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 78384952 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 78386835 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78388232 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78388412 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78388501 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 78388525 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 78389210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78389336 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78389756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78389944 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78390158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78390246 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 X 78392459 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 X 78392479 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 X 78392881 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78393261 T C N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 78393429 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 78393900 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78394082 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78394139 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78394876 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78395195 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78395330 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 78395665 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78395687 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78395710 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78395771 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 78395843 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 78396268 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 78402950 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 78403127 G A N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.133333333333333 0.6 0.266666666666667 13 17 2 9 4 X 78403172 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 78403226 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 78403279 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 78403304 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 78403443 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78403832 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78403840 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78403854 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78404022 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78404727 T A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 X 78404738 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 78404740 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 78404790 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 78405122 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78405293 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 78405370 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78405388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78405514 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78406475 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78406476 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78406484 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78406514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78406719 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78406768 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78406877 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78406991 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 78407072 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78407973 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78408266 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78408408 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78408464 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78408515 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78408545 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78408764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78409038 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78409489 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 78409872 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 78410690 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78411282 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78411488 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78411624 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78411644 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78411648 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78411963 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 78411981 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78412026 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78412030 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78412074 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78412166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78412291 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78412355 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78412395 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78412475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78412568 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78413150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78413184 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78413193 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78413214 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78413463 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78413498 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78413518 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78413541 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78413570 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78413693 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78413694 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78413763 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78413859 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78413904 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78413999 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78414019 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78414260 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78414587 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78414760 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78415053 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 78415287 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78415303 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78415489 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78415714 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78415746 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78416962 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78416999 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78417023 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78417028 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78417749 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78417766 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78418014 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78418015 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 78418048 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78418080 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78418156 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 78418353 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78418630 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78418757 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78418823 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78418836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78419046 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78419220 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78419225 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78419294 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78419388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78419409 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 78419411 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78419575 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78419600 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78419608 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78420026 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78420061 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78420478 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78420479 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78420557 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78420576 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78421847 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78421996 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 78422073 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 78422116 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78422168 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78422312 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78422747 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78422860 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 78423246 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 78423252 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 78423372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78423661 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78424032 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78424120 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78424130 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78424131 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78424223 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78424589 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78424608 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78424704 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78425381 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 78425424 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78425451 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78425619 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78425735 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78425876 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78426275 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 78426313 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 78426963 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78427062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78427064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78427081 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78427175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78427321 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78428105 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78429045 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 78429221 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 78429680 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78430026 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78430303 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78430404 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78430637 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78430771 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78430774 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78432430 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78432622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78432773 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78433353 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78433492 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 78433658 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 78433863 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78434044 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78434099 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78434453 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78434718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78435240 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78435961 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78436253 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78438826 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 X 78439585 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78440031 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78440055 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78457268 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78457651 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78458365 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78461130 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78462303 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78463175 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78464337 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78465266 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78467634 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78468192 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78468618 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78472494 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78478948 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78479829 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 78481890 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78482858 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78484084 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78486974 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78495437 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78495753 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78495872 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78500353 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78500358 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78501290 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78501520 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78501647 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78502597 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78503183 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78503252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78503327 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78503695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78504052 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78504394 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78505774 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 X 78505891 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 X 78506497 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78506782 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78506839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78507158 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78507208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78507386 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78507564 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78507658 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 78507689 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78507875 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78508042 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78508083 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78508190 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78508354 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78508399 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78508437 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78508467 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78508558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78508602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78509238 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78509408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78509420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78510704 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78510939 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 78510957 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 78511146 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78511180 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78511649 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 78511702 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78511730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78511790 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 78511857 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 X 78511895 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78511933 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78512484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78513313 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 78513768 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78513988 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 X 78515044 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78515113 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78515253 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 X 78515443 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78516053 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 X 78516079 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78516697 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 78517314 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78517341 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78517385 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78517839 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78518690 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78518816 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78518870 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 78519015 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78519041 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78519568 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78519658 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78519761 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78519870 G T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 78519976 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 78522032 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78522177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78522391 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78523559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78523847 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78524053 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78524245 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78525507 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78525873 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78526173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78526258 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78526963 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 78527411 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78528444 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78528542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78528765 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78528778 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78529133 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78529135 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78531266 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78532873 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78533077 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 78533633 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 78533701 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78535057 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78535302 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78536376 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78536997 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 78537644 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78540783 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78540803 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 78542196 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78542523 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78542561 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 X 78543151 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78543807 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78543864 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78544113 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78545645 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78547957 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78548159 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78548327 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78550089 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78553371 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78557208 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 X 78559516 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78565195 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78565598 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78568179 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78572128 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78572719 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 78574892 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78575706 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78576007 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 78577510 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78577532 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78577906 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78578760 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78580206 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 78580487 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 78583246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78583255 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78583335 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78583710 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 X 78583931 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78584446 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 78584753 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 78585296 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78586068 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78586079 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78586171 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 78590205 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78591571 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78592997 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78593246 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 78595914 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78597021 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78597523 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78600928 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78604097 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78604614 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78604867 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78606187 T A N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 X 78606903 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78607483 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78610614 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 78611279 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78611877 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78613316 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78613577 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78613993 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 78614641 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78614696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78616220 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 78616714 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78617864 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78617895 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78618270 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78621898 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78622532 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78623424 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 78624933 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78628338 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78629685 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78630377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78630758 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78636658 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78639118 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78639335 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78639342 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78640591 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78644095 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78650412 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78652009 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78652198 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78665720 C G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 X 78665899 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78670294 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 78670817 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78673690 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 X 78678287 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78680003 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78687637 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78687770 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78687812 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78690479 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78691633 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78693649 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78696929 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 78697411 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 78706351 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78706532 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 78706918 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 78708202 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 78710451 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78711383 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78712430 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78715407 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78716096 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78717489 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78719376 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78720021 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78720737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78720748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78721987 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 78725490 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78728159 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78733752 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 78735175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78737177 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78738298 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 78742112 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 X 78745378 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 78745993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78746812 A C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 X 78746819 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 78750324 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 78751145 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 78754839 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 78761424 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78764678 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 78764982 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78766495 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 78767240 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 78767731 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 78767863 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78767908 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78768168 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78768256 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78769032 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 78770002 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 78772228 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78773161 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78773638 T G Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 78776652 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78778726 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78778813 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 78779118 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78780115 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78780820 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78781036 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 78781764 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 78782413 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 78782981 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 78785007 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78785158 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 78785562 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 78787021 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 78787076 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78787178 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78787374 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78787816 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78788233 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78788730 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78791156 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 78793490 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78795848 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 78796423 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 X 78796636 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78797784 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78803074 G T Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 X 78806498 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78806932 A C Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 X 78807430 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78807887 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78808027 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78808609 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78808717 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78810730 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78810904 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78818829 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78819665 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 X 78820956 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78824042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78824399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78825268 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78825272 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78827062 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78828449 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78832246 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 78833057 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78834922 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78838192 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 78839626 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78841916 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78843390 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78845179 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 78847190 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 78849172 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 78852643 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 78852645 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 78852788 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 78852805 G C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 78854626 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78859035 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78860230 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 78860300 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 78863033 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78864540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78870219 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78870264 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78873297 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78873389 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78874192 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78879247 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 X 78879261 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78881451 A C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 78882264 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78885484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78885912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78886104 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78888403 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78897654 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78897888 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78900599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78901477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78901978 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78904854 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 78907597 C T N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.615384615384615 0.153846153846154 0.230769230769231 18 8 8 2 3 X 78907704 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 78908032 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78908531 C G N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 X 78909261 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78909291 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78909372 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78910419 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78911138 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78911341 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78911363 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78912442 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78914682 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78915206 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 78915444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78915521 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78915879 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78916075 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 78917224 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78919632 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78935492 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78937635 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78943671 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 78943840 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 78944060 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 78944090 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 78944623 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 X 78944734 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78947356 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 78948978 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78949174 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 78949422 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78950346 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78950635 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 78950790 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78953298 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78953724 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78954333 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78956324 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78957231 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78957663 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78958815 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 78960516 G C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 78961897 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 78962380 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 X 78966194 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78967013 A T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 X 78969482 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78974887 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 78976539 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 78978762 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78979984 C A N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 X 78981134 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78983065 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78983378 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78983786 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 78984283 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 78985231 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78988399 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 78989314 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 78989754 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 78992835 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 X 78995301 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78995305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78995419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 78995813 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 78998126 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79000059 C T Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 X 79001195 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79012253 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79012328 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79014509 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79015880 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79019696 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79021976 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79025793 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79025827 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79028353 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79031223 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79033904 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79036305 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79038909 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 79039348 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79039920 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79042536 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 79043907 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79044672 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79044674 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79045840 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79045910 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 79046399 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79047767 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79050398 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79052237 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79052484 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79054040 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79054604 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79061095 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79061338 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79063484 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79064718 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 79065065 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79065975 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 79067135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79070099 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79070606 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79070801 T G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 79079113 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79079248 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79083399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79084308 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79084675 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 79092510 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79093509 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79095441 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79095673 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 79096070 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79096832 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79103522 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79106028 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79114599 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79116156 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 79116212 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 79116650 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 79117886 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 79117898 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 79117976 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 79122600 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79124004 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79124853 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79126755 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79128102 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79128320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79129020 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79131724 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79131855 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79132237 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79132949 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79133027 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 79133853 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79134225 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79137050 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79139369 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79140725 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79143677 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 79143873 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79145765 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79146304 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79146943 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79147176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79147743 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79148097 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79149929 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79149934 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79151540 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 79151696 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 79153908 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79163424 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79164260 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 79165587 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 79169085 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79169093 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79169861 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 79174247 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 79174634 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 79175607 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79177671 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79178582 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 79178891 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79178987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79179083 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79179157 T C Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 X 79179243 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79179338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79179370 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 X 79179372 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79179463 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 X 79180137 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79180606 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 X 79180919 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79181134 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 X 79181436 C A Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 X 79181578 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79181591 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79182360 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 79182815 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 79183543 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 79183861 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 79184178 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 79184309 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 79184502 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 79184796 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79185324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79185536 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79185944 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79186053 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79187295 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 79187491 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 79187543 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 79187722 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79187830 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 79187973 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 79188047 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 79188643 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 79188746 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79189333 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 79189349 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 79190033 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79190106 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 79190107 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79190110 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79193535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79194608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79195207 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79195572 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79195923 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 79196352 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79196757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79199071 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 79200770 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79201769 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79205759 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79206067 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79206673 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79206901 G C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79207367 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79207619 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79208057 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79208915 T C Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 79208916 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 79208928 G C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 79209506 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79212259 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79212907 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 79213008 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 79213148 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 79214460 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 79214816 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79215258 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79221560 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79221670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79223230 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79223559 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79225200 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79226744 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79234202 G A Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 X 79234360 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 79241328 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79241504 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79242214 C G Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 79242780 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79244407 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79245486 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79248573 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 79248773 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 79249004 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 79249666 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 79249670 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 79253267 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79255250 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 79256676 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79257667 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79258521 T A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 X 79258740 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79259005 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79259800 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79260532 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79261213 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79264141 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79264520 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 79266314 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79266822 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 79269676 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 79272660 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79273988 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79274689 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79275632 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79276313 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 79276500 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79277346 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79277822 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79277880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79277952 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79284799 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 79285341 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 79291871 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 79291920 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 79292214 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79292374 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79292908 G A Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 X 79293738 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79293940 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79295053 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 79295072 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 79296960 T C Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 X 79298141 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79298553 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 79302945 T G Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 79305189 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 79305192 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 79305293 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 79305455 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 79305550 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 X 79306123 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 79308136 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79309062 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79309289 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79310765 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79310809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79312489 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79314149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79314898 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 79315049 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79315347 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79315789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79316337 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79317562 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79318315 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79318320 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79319592 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 79319625 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 79320879 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79322040 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79323422 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79323910 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79326408 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 79327054 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79327740 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79328532 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 79328790 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79336650 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79337082 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79337916 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79339725 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79339742 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79339772 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79340735 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79340949 T A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 79342627 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 79343465 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 79343911 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79344285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79344295 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79344348 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79344741 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79345632 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79345840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79346976 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79347138 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 79348090 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 79348414 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79348485 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79348939 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 79349133 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 79349999 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79350676 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 79351332 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79352090 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79352295 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 X 79352941 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79353000 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 X 79353169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79357264 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 79358313 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79360468 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79361085 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79364303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79365624 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 X 79366267 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 79366490 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79369168 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79369474 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79369733 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79370123 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79370308 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79371904 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79372295 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 79373367 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79373395 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79373850 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79373853 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79374228 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79375563 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79375897 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 79375994 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 X 79378003 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79378058 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79378786 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 79378984 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 79379338 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 X 79380291 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79381375 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79381542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79382592 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 79383663 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79383760 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 79384364 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 79385512 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 79387007 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79387917 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79388346 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79388347 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79388637 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79388708 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 79389120 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79389605 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79389693 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79389727 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79390814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79392912 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 79394019 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 79396961 G T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 X 79398024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79398199 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79399070 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79399226 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 79399578 A C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 79399747 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79402765 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 79403373 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79404001 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79408373 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79408569 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 X 79411024 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 79412542 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79412614 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79413403 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79413603 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79413849 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79414712 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79416787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79416963 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79417293 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 X 79417879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79418778 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79418859 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 79421626 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79422965 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79424047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79427450 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79427643 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79431349 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 79431510 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79431759 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79435212 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79446179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79446614 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 79456622 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 79457758 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 79457792 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79461851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79462953 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 79467334 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79467395 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79467423 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79468881 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79475255 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79485751 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79487633 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79493894 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79496861 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79498548 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 79500628 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79501184 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79503064 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 79503473 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 79503695 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 79503951 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79504415 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79505922 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79507258 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79516699 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79525571 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 79525801 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 79528079 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79528537 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79528685 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79529753 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 79530436 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 79534202 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79536652 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79536717 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79542186 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79542208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79546227 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79547172 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 79547849 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79548281 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79552030 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79552873 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79553880 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 79554309 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79554361 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 79555902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79557044 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79560433 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 79561539 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79563491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79563991 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79564890 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 X 79564953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79565060 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79565321 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79565414 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 X 79565975 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 79566456 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79570776 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79571969 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 X 79575247 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 X 79577541 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79577571 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79578519 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 79580215 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79583161 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 79586506 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 79587683 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79589241 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 79589556 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 79592609 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79594089 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79598280 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 79598356 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 79599948 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 79603871 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79607686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79608827 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79610195 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 79611531 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79613820 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 79616957 G A N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 X 79617228 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79619088 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79622570 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79623450 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79623537 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 79624850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79624884 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79624932 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79628377 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79628910 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79630236 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 79630237 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 79630463 T C N Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.272727272727273 0.545454545454545 0.181818181818182 12 10 3 6 2 X 79630804 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79631992 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79632193 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79632639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79632765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79633149 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79633528 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79633610 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79633830 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79633957 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79641336 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79643053 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 X 79643312 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79643354 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79643646 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 79643741 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 79645401 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 X 79645507 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79646449 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79647659 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 79648538 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79649558 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79650209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79650358 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79651027 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 79652266 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79653070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79653312 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79653839 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79654602 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 79654633 G T N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 X 79655477 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79655520 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79655774 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79656359 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 X 79657817 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79658146 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79658573 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79658574 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79659503 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79659971 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 79661466 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79662041 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79663095 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 79669453 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 79674156 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79674690 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79675866 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 X 79678394 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79678395 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79678489 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79678722 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79678759 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79680459 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 79682170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79687352 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79688316 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 79690425 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79690453 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79690908 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79694167 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79694802 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79697198 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 79698963 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79699034 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79699524 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79700492 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79702903 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 79703451 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79703659 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 79704818 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79704819 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79705024 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 79706772 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79707653 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79709712 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79709934 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79712477 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79712907 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79717651 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79718260 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79719490 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79719511 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79719704 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79720121 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79720422 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79720700 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 79728605 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79729837 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79734601 T G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 79735992 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79736647 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 79737147 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 79737609 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79738348 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79739218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79744594 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79745015 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79746108 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79748140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79749766 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79750098 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79751964 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79752116 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79752124 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79753925 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 79754283 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79755722 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79756702 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79758033 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79758484 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 79760328 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 79761780 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 79762115 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79763508 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 79763566 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 79764280 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79768684 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79768877 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79768934 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79769335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79769857 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79772674 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79773600 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 79777101 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79777230 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79784433 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 79786425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79786464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79787142 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79789621 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 79790844 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 79791973 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79792517 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 79793371 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 79793895 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79794025 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79794037 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79795817 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79795829 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79796462 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79796958 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79797189 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79797965 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79798078 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79798743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79799266 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79799642 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79800385 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79800678 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 79801289 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79801511 A T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 79801621 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 79802662 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 79802910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79803091 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79804709 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 79805387 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 X 79805856 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79807936 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79808279 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 79808365 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 79808631 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79809581 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79810061 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79811470 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 79812924 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79813067 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 79814938 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79819393 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79820268 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79820514 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 79820634 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79821618 A C N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 79824950 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79825245 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79826572 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79830900 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79831025 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79831038 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 X 79837219 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79838276 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 79838510 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 79840975 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79843609 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79844228 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79845746 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79846411 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 79846574 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79847168 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79847526 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79854382 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79854491 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79867395 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79869643 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79871673 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79874451 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79874566 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 79882086 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79882254 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 79882823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79883437 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79885002 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79887689 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 79888840 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79891180 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79892597 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79894320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79896059 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79896546 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79910694 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79910704 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79911458 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 79911459 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 79911465 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 79911677 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79912328 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79912447 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79913122 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79916126 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79917827 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79919251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79923353 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79924146 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79924499 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79925929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79932286 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79933815 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 79935109 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 79935515 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 79936153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79937446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79937481 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79937893 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79937970 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79940922 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 79941562 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79942836 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79942875 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79944220 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79945378 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 79945596 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79947334 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 79948319 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79948484 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79949706 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79950596 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79950707 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79951042 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79952607 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79952627 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79955164 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 79955645 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79955646 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79956096 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 79959032 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79960147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79960186 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79964404 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79966835 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 79971062 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79971196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79972223 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79973956 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79974804 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79974845 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79975042 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79975911 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79976601 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 X 79977501 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79978041 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 79978396 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79978463 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79978751 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79978764 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79978970 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79979232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79979239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79979344 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79981158 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79981959 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79982004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79982414 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79983457 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79983783 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79984196 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79984380 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 79984468 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 79985098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79985510 C G N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 79986063 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 79986189 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79986882 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79986985 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79987063 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79987728 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79988030 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79988101 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 X 79988590 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79988855 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79989049 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 X 79989600 G C Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 79990850 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79990948 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 X 79991375 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79991522 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 79991901 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 79992702 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 79993542 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79993714 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79993731 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79993790 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 79994781 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 79995208 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79995982 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79996005 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 79997778 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 80000951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80001003 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80001682 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80002691 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80002692 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80002935 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80007148 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80008373 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80008703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80008833 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80010556 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80011105 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80011358 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 80011565 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 80012174 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80013470 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80013872 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80014149 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 80014919 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 X 80015490 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 80016356 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 80018577 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80020172 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80026161 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80028757 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80029223 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80029224 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80029585 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80029783 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 80030059 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80031756 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80032980 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80033428 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80033440 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80040205 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 80041150 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 80041902 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80043624 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 80043798 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 80045675 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 80046404 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80047607 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80047996 C A N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 X 80048704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80050389 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 80051187 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80051260 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80058609 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 80059029 A C N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 80059487 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 X 80061387 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80062142 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80070551 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80079229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80079851 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 80082189 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80084147 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 80091893 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80091898 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80096884 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 80099135 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80099190 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80105293 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80106387 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80109505 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80109685 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80109786 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 80110679 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80111589 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80113287 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80115308 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80116943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80117083 T C N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 X 80117773 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80117878 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80118957 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 80120682 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 80121703 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80122651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80123958 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 80125389 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80126173 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80126917 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80127743 C A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 80127796 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 80128361 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 80129024 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80129506 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80131322 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80132173 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80132382 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80133322 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80134447 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.529411764705882 0.176470588235294 0.294117647058824 21 13 9 3 5 X 80138244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80139271 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 80139433 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 80139596 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 80140713 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80142251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80144353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80145127 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80146759 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80147786 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 X 80148226 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 80149166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80149808 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 80156329 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 80158517 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80162823 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80163218 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80165939 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 80166173 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80166294 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80166994 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80167578 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80168437 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80168462 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80168635 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80169998 A G N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 X 80170006 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 80171378 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80171632 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80171737 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 80172206 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 80172494 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 80172968 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 80173181 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80173193 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80173293 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80173296 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80173396 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 X 80173875 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80174211 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80176092 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80176946 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 80177521 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80178273 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80187184 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80188627 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 80189161 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 80189364 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80189480 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80189845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80190724 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80191343 A G N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 X 80192708 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80193208 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80193240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80193292 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80193568 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80193622 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80193819 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80194258 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80194598 G A N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 X 80194800 T G N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 80195786 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 80197225 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 80197507 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 80207341 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 80208182 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80210085 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80210157 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80210160 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80211690 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80211878 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 80213062 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80214281 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 80222644 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 80224148 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80224757 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80225439 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80229552 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80229748 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 80230310 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80231291 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80237684 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80237841 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 80238206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80238387 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80238956 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80240075 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 80240189 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 80243149 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80243205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80243671 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80243710 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80244079 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80245421 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80245647 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80248170 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80248184 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80252013 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 80253749 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80254103 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80254524 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80256180 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 80258515 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80261058 T G Y N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 X 80261085 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 80262440 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80265532 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 80265546 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 80267797 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80269841 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80270041 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80270894 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80271723 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80274221 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80274288 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80275760 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 80276947 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80277150 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80279617 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 80283015 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 80286433 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80288198 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 X 80289498 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 80290245 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 80296069 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 80298505 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 X 80298794 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80301072 T C N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 X 80302753 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80305255 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80312440 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 80312981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80316342 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80317635 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80317659 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 X 80319268 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80320919 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80322353 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80324614 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80324882 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80326561 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 80328454 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80337343 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80341809 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 80342042 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80349528 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80353451 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80354840 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80364487 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80368061 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 80368557 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80374547 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80379678 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 80383375 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80386349 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80387220 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80392647 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80396534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80396571 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80396670 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80401184 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80402751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80404302 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80409821 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 80412145 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 80413111 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80414989 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80415266 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80416276 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80417349 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80418155 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 80419452 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80419941 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80420250 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80420997 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80429255 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80433914 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80434057 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80434744 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80435290 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80435785 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 80438463 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80438549 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80439810 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80440109 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80440278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80440921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80442799 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 80447414 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 80447603 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80447849 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80448510 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80450191 T C Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 80451169 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80452139 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 80452395 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80453519 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80454475 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80456336 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80457872 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80458067 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 80459181 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80460677 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80460985 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 80463478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80463632 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80468659 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 80469630 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 X 80474345 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80480015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80480667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80483942 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 80491902 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80496414 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80499674 G T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 80506617 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80508010 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80509603 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80512970 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80513563 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 80517265 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80519415 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80523207 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80523766 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80523787 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80524037 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80525907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80526488 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80527434 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80529089 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 80532689 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 80535076 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80539600 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80540290 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80542896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80545293 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80547346 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80548347 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80549703 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80550588 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80550669 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80551532 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80552922 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80552977 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80553817 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80553893 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 80555022 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80555823 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80556220 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80556463 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 80557324 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80557358 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80557984 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80561066 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80561851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80562661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80563473 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80565076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80565374 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80568415 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80568726 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80572287 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80581571 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 80591119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80591195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80593258 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80598688 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80600166 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80601228 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80602634 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80603235 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 80603889 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80604741 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80606335 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 80612687 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80612789 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80613588 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80614006 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80614259 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80614381 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80614681 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80616002 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 80616222 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 80618314 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80619371 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 80621203 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80622807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80623518 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80623928 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80624176 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80625170 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80625839 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80626373 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80626743 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80627315 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80630891 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80633230 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80641411 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80645502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80646312 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80646339 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80647127 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80647314 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80647526 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 80649819 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80650343 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80652305 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80653259 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80655533 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80656218 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80657031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80657135 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80659835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80659939 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 80661206 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80662726 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80664530 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80664597 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 X 80664738 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80668098 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80668521 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80668966 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80669106 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80669201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80669214 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80670962 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80671032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80671987 G A Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 X 80672011 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80672219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80672682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80673013 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80675230 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80675587 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80677383 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80679946 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80680483 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80682560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80684533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80685399 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80685983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80686000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80688346 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80689212 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80689694 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80689793 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80690197 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80691161 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80691246 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80692355 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80692753 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80692945 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80693722 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80693916 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80695097 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80695321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80696467 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80696801 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80698234 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80698910 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80701722 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80701786 T G N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 X 80702603 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80703557 C A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 80708030 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80708321 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80708840 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80709060 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80709851 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80711479 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 X 80715732 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80717750 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80722670 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80728085 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80728097 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80728367 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80728931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80729119 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80730176 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80730634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80733136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80733392 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 X 80735250 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80735711 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80739720 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80739727 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80742304 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80760025 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 X 80760583 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80760679 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 80762605 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80763846 G A Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 X 80765831 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80765839 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80766003 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80767439 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 80771362 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 80774776 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80779467 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 80779945 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80785800 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80785911 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80787350 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80788017 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80788593 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80789034 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80790248 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80794606 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80805881 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 80806605 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80809126 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 80809643 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80812579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80817267 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 80819498 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80819808 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80821573 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80822495 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80825509 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80825753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80827298 G A Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 X 80837661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80840074 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80841842 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80844369 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80846628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80847067 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80847620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80848059 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80848868 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80849379 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80849800 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80853288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80853873 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80854087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80857136 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80858719 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80858720 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80858815 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80860551 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80860917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80862809 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80862890 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80863411 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80866614 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 80869188 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80871499 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80873010 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80873578 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80874790 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 80875887 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80875964 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80876544 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80876823 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80879293 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80880427 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 80880892 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80882089 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 80884829 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80884880 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 80885940 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 80886567 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80886793 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80888361 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80888631 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 80889523 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80890326 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80892353 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 80895741 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80897202 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80898523 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80899222 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80900067 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80901451 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80902766 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80903164 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 80907079 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 80908294 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 80910601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80911380 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80912118 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 80913360 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 80914035 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80914303 T C N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 80916136 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80916656 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80916956 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 80916995 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 80941055 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 80941224 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 80941745 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80942183 G A N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 80942456 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80944557 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80944587 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 X 80945112 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 80945113 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80945360 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80946568 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80947576 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80947994 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80948837 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80950069 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80951985 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 80952588 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 80952795 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80953553 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80953941 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80955065 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 80956924 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 80957715 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 80959261 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80960089 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80960293 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 X 80961568 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80962631 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 80964744 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80964929 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80965722 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80966163 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 80966524 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80967528 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80970184 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80974397 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80974963 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80976222 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 80978088 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80978763 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 80979172 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80979173 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80979459 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 80979460 T A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 80983651 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 80984092 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 80984796 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80985253 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80986010 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 80987862 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80989731 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 80992099 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 80993813 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 80999500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 80999872 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81000434 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81000613 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81001632 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81002929 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81002988 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81003286 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81006174 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81006417 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 81009401 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 81011543 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 81013500 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 81013501 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 81014911 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 81019106 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 81022951 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81029381 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81031733 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81033001 T A N N 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 X 81033669 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 X 81033979 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81039114 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81039449 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81041373 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81043499 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81044184 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 81044688 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81045078 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 81045697 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 81048610 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 81048778 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 X 81051716 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81052594 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81053807 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 81055265 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 81055835 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81056181 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81056312 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81060020 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 81061557 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 81063422 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81064159 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 81065820 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81070968 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81072709 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 81073848 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 81076869 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 X 81079253 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81084259 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81087374 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81095016 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81096165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81096632 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81096701 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81097216 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81097687 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 81098064 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 81108440 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81108915 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 X 81114636 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81115394 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81115772 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81120661 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81124742 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81127070 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 81142565 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81143699 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 81145815 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 81151645 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 81154391 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81154964 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 81159392 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 81163105 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 81164264 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 81164318 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 81164964 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81168276 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 81179289 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81179468 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 81181258 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81184921 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81189895 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 X 81191341 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81193639 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81194733 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 81198467 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 81199623 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 81199797 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81200437 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81201789 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81202398 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81203233 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81203304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81203519 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81204622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81205122 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 81206490 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81206790 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 81206982 C G N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 X 81207762 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 81208505 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 81208506 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 81208633 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81210092 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 81210277 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 X 81210675 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 X 81210831 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 81211037 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 81211133 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 81211549 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81211626 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81212738 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81213438 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81214039 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81214972 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81215176 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 X 81215753 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81219125 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81219266 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 81219693 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81220397 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81220597 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81220922 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81221136 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81222869 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 81223086 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 81227834 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81228589 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 81230160 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81234256 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81235217 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81235471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81235481 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81235697 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81236192 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81237652 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81237778 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81240862 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81241895 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 81243690 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81245470 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81248596 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81249844 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81259504 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81262155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81268183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81270380 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 81271137 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 81271920 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81273775 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81275900 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81276477 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 81277974 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 81278510 C T N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 X 81279297 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81279322 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81279589 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81280345 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81281202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81283274 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 81285198 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81285998 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81288994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81290011 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81291079 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81292378 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81293288 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 81293430 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 81293656 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81294659 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81295823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81297633 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 81298310 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81300370 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81300523 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 81302439 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 81304036 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81306226 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 81306227 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 81306579 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81307361 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 81307572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81307599 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81308728 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 81310709 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81311234 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81313240 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81317466 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81317533 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81318406 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 81318807 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81323868 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81326577 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81327509 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 81328224 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81331256 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81333265 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81336514 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81336921 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81339327 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81342162 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 81342240 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 81346720 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 81346920 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81349090 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 81350237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81351506 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81351672 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81351865 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 81354234 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81354295 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81355686 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 81356024 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81356073 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81356108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81356136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81356300 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81356302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81356307 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81356404 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81356462 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81356614 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81356792 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 X 81357308 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81358580 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81360586 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81362502 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 81363393 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81363981 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81364247 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81365001 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 81366916 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81369192 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81369476 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81371515 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 81371534 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 X 81371960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81372047 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81372347 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81373257 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81374442 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81382548 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81387893 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81388397 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81389035 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81389816 C A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 81390098 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 81391810 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81392604 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81394277 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81395697 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 81397932 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 81398514 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 81406346 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81409217 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 81409304 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 81411307 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81413592 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81419064 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 81419492 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 X 81423385 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81423847 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81425769 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81426258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81427858 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 81428135 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81431322 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 81433744 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81435608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81436321 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81436383 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 81436727 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81439207 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 81440672 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 81440699 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 81441085 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81442039 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81442158 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81443857 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81444219 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81444705 C T Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 X 81444710 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81445343 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81446067 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 81450977 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 X 81452927 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81453288 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 81453835 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 81455010 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81456110 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81457522 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81458475 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81461608 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 81463165 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81465221 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81467324 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81467995 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81470715 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81471320 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81473197 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81474467 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81475482 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 81476967 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 81484534 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81486561 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81490551 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81490907 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81493062 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81495357 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 81496983 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81497728 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81503747 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81507233 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81508441 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 81514561 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81514796 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81514877 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 81516827 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 81522243 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81522929 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81524262 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81527360 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81527363 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81529706 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81531278 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81531293 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81531296 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81531942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81532215 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81533046 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81533187 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81533417 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 81535759 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81542565 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81544529 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81547222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81547280 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 81548129 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 81549332 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 81551282 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81553567 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 81553743 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 81554730 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81555566 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81556714 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81557763 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81558338 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81558833 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81560352 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 81560490 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81562797 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 81564782 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81568097 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81571855 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81573901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81574003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81574249 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81580486 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81584605 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 81585615 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81585859 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 81591827 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81592793 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81596246 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 81597997 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81598193 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81600461 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81602593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81603114 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81603186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81603603 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81606627 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81607304 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81609171 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 81609589 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81609651 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81610673 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81611583 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81612410 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81612583 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 81614019 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81616471 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81619090 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81619304 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81620247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81622919 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81623200 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81623245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81627150 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81628690 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81631006 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81631240 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81632030 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81632372 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81632972 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81633896 G A Y Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 X 81634002 G A Y Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 X 81634026 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 81641537 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81642359 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81642651 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 81643166 T G N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 81643167 T A N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 81644338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81645268 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81645403 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81649503 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 81650176 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81651373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81651955 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 81653171 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 81653330 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 81653754 G C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 X 81653798 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 81654009 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81657766 G C N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 X 81659853 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 X 81659954 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 81661538 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81661915 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 81663059 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81663200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81663751 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81663953 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81664828 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81665503 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81667196 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81667208 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81667456 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 81667964 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81668877 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81669850 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81670115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81671040 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81671067 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81671972 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 81672912 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81674090 T C Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 81674873 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81675008 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81676755 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81676903 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 81677213 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81678148 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81679635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81680248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81680642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81681918 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81682262 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81683108 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81683860 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81685007 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81688624 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81690976 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81692570 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81697530 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 81699120 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 81701935 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81702943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81703832 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 81708988 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 81715718 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81716978 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81718421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81718813 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81718939 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 81722197 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81724542 C A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 81725629 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81725679 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 81731848 A G N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 X 81732149 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 81732629 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81734391 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 81736238 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81739392 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81740335 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81740377 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81743149 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81744709 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81748100 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81748406 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 81752530 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81753035 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81760327 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81766541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81767504 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81767711 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81769868 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81770376 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81773186 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 81775300 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81775583 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81776294 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81776856 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81777543 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81778144 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81778659 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81782176 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81782204 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 81784123 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81791840 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81792035 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 81792351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81793064 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81793882 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 81795078 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 81796405 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81797977 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81799912 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 X 81800589 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 81802215 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81802216 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81802279 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81802390 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 81802440 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 81803575 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81803982 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81804047 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81804413 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 X 81804749 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81805295 A T Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 X 81806615 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81806782 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81806936 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81807013 C T Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 X 81807018 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81807441 T G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 81807719 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81807738 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81807971 T A Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 X 81808172 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81809075 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 81809079 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 81809091 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 81809784 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81810437 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81811163 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81811251 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81813171 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81814757 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 81816314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81817267 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 81817379 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 81819526 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 81820349 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 81821331 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81821590 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 X 81821627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81821692 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81823839 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 81825414 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81826670 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 81829371 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81831811 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 81832777 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 81833705 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81834147 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81836785 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81837723 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81837853 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81838862 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 81839063 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81841154 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81842527 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81843462 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81847018 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 81847119 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 81849734 A T Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 X 81850629 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81862903 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81863667 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81864196 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81864467 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81864986 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81868622 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81868989 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81870174 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81871424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81876370 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81877293 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 81877545 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 81877816 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 81879327 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 81879654 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81882063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81884021 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81884804 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81886041 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81887140 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 81887150 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81887696 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81888647 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81889275 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81890420 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81892107 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81893948 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 81896069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81896348 A T Y N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 X 81898353 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 81898922 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81900420 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 81902518 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 81902869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81904329 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 81905544 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81909909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81913132 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81914563 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 81914734 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 81916118 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81917207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81922069 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81925985 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81928364 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81932692 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81936755 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 81937063 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81937648 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 X 81937757 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81938148 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81939064 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81939100 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81941243 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81941833 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81942112 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81942242 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81942326 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81943377 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81943593 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81945233 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81945751 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81945898 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 81947971 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 81949991 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81951830 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81958007 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 81958298 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 81959880 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81961503 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81962865 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81963559 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81963677 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 X 81967266 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 81971922 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81973574 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81974147 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81974148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81974408 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 81974860 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81981151 C G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 81981584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81983964 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81985609 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81989212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81990072 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 81990390 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 81992323 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81992887 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81993411 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81993523 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81994144 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81995137 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 81996239 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81998158 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81998847 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 81999756 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82000050 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82002489 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82007645 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82010709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82014436 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82014490 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82018280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82019743 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82022328 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82023330 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 82025382 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 82025853 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82025864 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82026773 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82027588 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 82028860 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82035369 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 82037101 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82038116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82041042 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 82046480 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 82047796 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 X 82048958 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 X 82049602 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82049924 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82052753 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82060201 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 82060669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82060873 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82062457 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 82064947 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82082114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82085962 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82085990 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82086304 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82087294 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 82088968 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82090069 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82090269 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82091311 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82092166 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 X 82092352 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 X 82092908 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82093397 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82094266 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82094315 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82098434 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82105224 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82107325 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82108010 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82108890 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 6 12 0 6 3 X 82109136 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82109358 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82111645 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82111918 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82112874 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82114148 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82115934 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82115967 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 82117739 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82118720 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82124681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82128637 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 82129707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82133393 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 82134908 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82136109 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82136800 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82139911 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82142205 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 82146198 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82148890 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82155206 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82156031 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82156781 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 82157636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82159549 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82161379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82162050 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82163258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82164648 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82165792 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82168114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82170640 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82175209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82178736 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82179911 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 82181309 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82182629 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82185136 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82185475 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82189155 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82191792 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 82192041 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 82193818 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82194419 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 82194433 A G N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 X 82195753 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82197163 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82197823 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82198256 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82199251 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82199639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82200429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82200692 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82201935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82202843 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 X 82203817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82205923 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82206350 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82207307 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82210313 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82212964 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82213413 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82213733 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82215025 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82215195 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82217194 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82218313 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82218427 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82225136 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82229967 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 82231014 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 82232444 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 82232493 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82233113 A T N N 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 6 10 2 2 4 X 82233167 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 82233364 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82240370 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82240427 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82242402 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82245463 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82248188 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82261146 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82266082 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82319829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82320599 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 82321226 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 82335350 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82344304 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82348405 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82350260 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82351988 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 82352576 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82354350 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82356273 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82359159 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82359401 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82359800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82365587 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82365926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82366913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82368178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82371609 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82375231 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82376037 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82378954 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82379083 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 X 82379269 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 82379603 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82379877 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82380149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82380217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82380690 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82380721 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82380880 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82380942 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82381172 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82381291 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82381331 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 X 82388075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82389248 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82390039 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82390636 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82391528 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82392366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82392843 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 82394662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82396952 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82397395 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82398715 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82400483 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82401987 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82403348 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82412136 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82415925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82416327 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82416899 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82417494 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82417902 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82420611 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 X 82420684 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82421595 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 X 82421899 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 X 82422054 A C Y N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 X 82422300 A G Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 X 82422319 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 X 82422325 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 X 82422419 C G Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 X 82422459 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 X 82422658 C T Y Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 X 82423037 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 X 82423109 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 X 82426963 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82426985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82427890 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82427905 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82428655 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 X 82428737 G C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 X 82428960 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 X 82428993 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 X 82429176 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 82429337 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 82429520 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82429818 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 X 82429945 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 X 82430378 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82430435 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82430450 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82430452 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82430491 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82430649 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82430746 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82430762 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82430789 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82430808 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82430871 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82430874 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82431216 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82431373 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82432023 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82432221 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82432621 C A N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 X 82432734 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 X 82435830 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82436179 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 X 82436208 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 X 82436284 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82436436 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 X 82437942 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82438283 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82438879 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 X 82439073 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82440371 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 82443106 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82443198 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82444130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82445953 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82447778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82449991 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 X 82450515 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82451174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82453506 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82453880 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82454395 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 82454473 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82454487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82457050 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82458035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82458535 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82460329 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82461917 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82463419 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 82464657 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 82465424 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82469297 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 82469422 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82470755 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 82473193 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82473729 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 82474505 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82475174 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 82475515 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82476245 A G Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 82476867 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 82477146 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 82477282 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 X 82477807 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 82477899 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 82478490 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82478685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82478768 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82478910 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82478911 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 82479266 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82479311 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82479327 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82479491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82479862 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 X 82480038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82480342 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82480536 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 X 82480603 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 X 82480780 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82481860 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 X 82483167 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82484291 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82485072 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 82485747 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 X 82485825 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82487974 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82492345 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82492884 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82496798 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82498271 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82499213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82499537 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82499881 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82500157 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82501017 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82502314 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82502356 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 X 82504988 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82506169 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 X 82506182 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 X 82507160 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82509018 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 X 82509020 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 X 82509129 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 82509783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82510979 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82514531 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82514720 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82515305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82516374 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82516643 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 X 82517401 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 X 82517410 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82521546 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 X 82522204 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82522249 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82522507 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82523121 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82523262 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 X 82523697 C G Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 X 82524063 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82524236 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82524404 C A Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 82524615 G C Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 82524939 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 X 82525367 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 82525610 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 82525779 G T Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 X 82526242 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 82526366 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 82526586 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 82526968 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 82527106 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 82527135 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 82527450 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 82527927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82528483 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 X 82528589 T C N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 82529306 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 X 82529377 A C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 X 82529476 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 82531205 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82533498 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82534703 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82534863 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82536274 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 82536985 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 X 82537626 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82539773 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 82543143 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82549108 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82549321 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82550099 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82550347 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 X 82551518 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 82553195 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82553755 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 82556058 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82556504 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82556546 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82556724 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 X 82558034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82558738 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82559202 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82559353 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82559943 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 82560690 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82560898 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82561059 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82561396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82562033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82562524 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82562770 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82566949 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82571281 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82571493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82577588 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82577895 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82577897 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82578325 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82578865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82580544 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82581060 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82584290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82584965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82585201 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82585549 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 82585700 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82590167 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82590604 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82594182 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82594392 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82597252 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82597320 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 82597427 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82600471 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82601976 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82603603 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82606930 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82608057 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 82609027 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82611486 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82613034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82616215 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82616436 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82616548 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82616741 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 82616936 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82617073 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 82620373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82620399 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82620972 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82621986 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82625804 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82625878 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82626025 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82635731 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82636848 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82637370 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 82637403 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 82639652 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82640383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82641000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82647701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82648528 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 82650215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82650687 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82651712 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82652392 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 X 82655823 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82659370 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82659371 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82662737 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 82667209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82668492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82672216 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82672643 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82673493 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 82676416 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82679729 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82680671 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82682272 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 82682694 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 82683035 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82685016 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82685542 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82685875 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82687518 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82687796 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82687839 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82687875 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 82687935 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82687950 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82688019 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82688109 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82688135 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82688139 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82688240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82688302 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82688510 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 82688518 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82688674 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 82688743 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 82689113 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 82689211 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 82689615 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 82690110 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82690745 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 82691762 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82693544 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 82695048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82695434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82696713 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82696734 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82696813 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 82699874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82702047 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82711584 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82712705 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82714768 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82715319 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82717057 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82717769 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82719077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82719165 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82721978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82726430 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82727564 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82728921 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82729165 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82729167 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82729299 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82729359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82729682 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82729727 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82729732 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82729897 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 82729991 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82729994 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82730389 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 82730513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82730623 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82731098 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82731188 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82731323 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82733411 A C Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 82735975 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 82736297 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82739905 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82740129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82740153 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82740427 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 82741118 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 82743905 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 82746673 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82747108 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 82747600 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82747821 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82747822 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82748657 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82750193 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 82750359 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82756987 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82756988 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82757550 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 82757993 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82758826 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 X 82759305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82759522 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82760696 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82760750 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82761569 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 82762872 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 82763469 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82763774 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 X 82765326 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82765489 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82768279 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82770474 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 82771026 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82771524 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82772559 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 82772565 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 82772736 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82773259 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 82773610 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 82774401 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82774437 T G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 X 82774625 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82774776 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 82774950 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82778476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82778796 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82779756 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82780055 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82781150 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 82781387 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82783232 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82783695 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 82784094 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82784298 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82784544 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82785382 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 82785548 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82785830 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82786529 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82786569 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82786629 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82786648 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 82787030 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82787709 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82789318 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82790727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82791591 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82797724 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82797965 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82798587 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82799149 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 82799531 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82800158 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 82800419 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 82803381 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82803686 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82803742 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82804661 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82804958 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82804967 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82808329 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82811448 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82812838 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82815873 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82816192 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82820339 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82820652 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82820891 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82822198 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 82824880 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82827373 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 82834671 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82839377 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82842465 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82846510 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82853575 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82857262 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82857822 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 82859433 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82860844 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82869117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82872673 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82872820 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82872928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82874864 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82875294 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82877983 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82883312 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82884303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82886904 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82886907 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82889040 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 82897765 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 X 82898675 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82899127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82901135 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82901299 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82902570 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82902744 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 82904147 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82913761 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82917582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82919636 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82920245 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82920805 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82921319 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82921836 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82923148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82923225 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82923353 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82924353 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82925176 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 82927040 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82927352 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82929219 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82930379 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82932516 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82933464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82934722 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 82938382 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82938580 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82941055 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82941097 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82943950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82944464 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82948710 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 82949390 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82949482 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82949619 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82951111 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 82951279 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 X 82951502 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 82955013 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82955263 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 82956599 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 82956884 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 82957040 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 82957631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82960284 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82961883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82962010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82964162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82964459 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82966051 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82968742 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82969079 A T Y N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 X 82972211 A T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 X 82973365 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 82975788 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82976147 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 82977039 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82977050 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82978835 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82979264 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82979954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82980998 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 82981692 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 82981878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82981989 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82983772 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 82986611 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82987412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82987665 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 82990104 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82991863 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 82992680 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 82992975 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82994005 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 82994534 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 X 82997468 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 82999476 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 83001753 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83002576 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83002650 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83003107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83004230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83006493 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83006558 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83008318 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 83009902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83010593 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83011225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83011824 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83012783 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83012852 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83013212 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83013494 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83013818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83014468 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83014707 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83014756 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83015083 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83015089 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83015288 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83015298 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83015469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83015540 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 83015745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83015823 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83016515 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83020036 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83021370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83023896 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 X 83024208 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83027386 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83027560 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83027607 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83027618 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 83028499 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83028577 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83028710 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83029131 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83032203 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83032480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83033166 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83033373 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83034428 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83034543 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83034558 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83035949 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83037559 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83038085 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 83039683 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83040059 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83040855 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83040878 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83041763 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83042123 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83042650 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83044868 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83045028 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83045073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83047399 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83048248 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83050053 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 83050462 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83051075 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83052008 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 83052412 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83054404 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83054657 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83054669 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83055153 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83056171 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83058211 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83060542 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 83060760 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83060948 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83062372 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83062882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83063149 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83063710 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83064006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83064215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83067592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83068015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83068245 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83070574 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83071833 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83072598 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83072859 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83073315 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 83076205 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83076367 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83078049 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83078924 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83081986 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83083789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83084325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83086526 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83093120 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83095271 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83097521 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83099150 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83099371 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 83103473 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83105709 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83108255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83108926 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83110389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83111128 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83111742 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83111988 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83126668 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83128097 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83130044 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 X 83131577 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83134269 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83135614 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83136605 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83137947 G A Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 X 83140000 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83140049 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83140320 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83144286 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83144359 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83144816 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83146874 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83147818 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 83148020 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 83149049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83149290 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83149412 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83150326 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 83151125 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83158150 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83160111 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 83161017 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83161182 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83161358 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83161530 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83161662 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83161819 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83162376 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83163047 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83163384 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 83164429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83166023 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83171086 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 83171161 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 83171635 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83171663 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83172428 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83172458 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83173492 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83177793 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83183664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83184292 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83185142 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 83188990 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83188991 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83189223 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83189709 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83193676 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83194572 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83196634 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83196941 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 83197134 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83198828 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83199481 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83199749 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83200006 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83203567 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83203691 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83203962 G A Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 X 83204254 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 83204774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83205303 C A N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 83209380 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83209463 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83209920 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83210412 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83217662 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83223263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83223353 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83223530 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83226601 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83241857 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 83241858 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 83242299 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83242397 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83243320 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83244504 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83246712 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83247177 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83247376 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83249147 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83251089 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83251575 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83251730 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83252254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83252590 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83253873 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83254482 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83255101 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83257073 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83257550 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 83258086 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83259538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83259675 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83274840 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83274976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83275004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83277228 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83278647 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83289941 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83293718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83297259 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83298067 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83304622 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83310156 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83311009 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83311111 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83311830 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83312723 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83313385 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83313754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83317277 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 83319613 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83319966 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83320176 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83321938 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83323987 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83325010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83325390 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83325413 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83325541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83326166 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83326796 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83327706 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83329476 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83329539 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83333695 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83339259 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 83348069 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83349678 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83349994 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83351986 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83353281 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 83353887 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83354794 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83354914 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83355647 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 83355764 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 83355851 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 83355946 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83356893 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83357403 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83358734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83359723 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83360754 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83360803 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83364161 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 83364291 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83364693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83365434 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83365791 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83366246 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83366349 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83366352 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83366598 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83366708 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 83371625 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83377058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83377286 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83377420 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83378266 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83378878 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 83379558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83379726 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83379972 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83380201 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83380210 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83380390 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83380460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83380591 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83380758 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83380829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83380913 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83380935 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83381120 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83381207 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83381368 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83381398 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83381516 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83381556 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 83381641 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83381690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83381823 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83381980 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83382043 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83382091 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 83382341 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 83382681 G A Y Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 X 83382684 G T Y N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 X 83382964 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83383296 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 83383766 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83383951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83384026 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83384072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83384135 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83384317 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 83384332 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 83384704 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 83384864 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83386174 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 83388290 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83390585 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 83394529 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83394904 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83396542 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 83398333 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83398473 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 83398840 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83400039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83402446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83402794 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83402966 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83404200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83406816 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 83407652 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83408442 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 83410533 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83417200 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83417660 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 83418373 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 83421220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83422810 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83424544 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83428449 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83431275 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83432482 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83433011 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83433111 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83433600 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83433719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83436336 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83437318 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83439843 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83439845 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83443561 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83445597 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83445689 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83448031 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83448091 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83448751 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83449280 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 83450770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83451914 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83453496 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83454770 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83455583 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83458225 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83458744 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 83461230 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83472064 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83472193 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83474831 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83475063 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 83475064 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 83475967 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83479049 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83480604 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 83481229 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 X 83488006 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83488842 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 83493049 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83495022 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83502671 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 83503653 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 83504945 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 83505826 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83507886 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83508864 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83510273 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83510463 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83512054 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83512257 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83512285 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83512696 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83512734 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83512982 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83513329 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83514041 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83514051 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83515180 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83515801 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83516142 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83516952 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83517659 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83517662 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83520792 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83521195 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 83525301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83525694 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83526048 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83526059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83527488 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83527648 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 83531594 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 83531615 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83533045 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83533501 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83534313 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83534351 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83536552 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83536800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83538306 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 83538676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83538692 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83540499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83541039 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83542301 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83547582 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83547726 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83547782 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83549191 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 83551409 C G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 83551861 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 83558020 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83558511 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 83558582 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83559575 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83559645 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83560157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83560238 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83561213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83562304 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83563458 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83563484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83565600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83568757 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83570604 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83571289 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83575890 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83577202 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83578335 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 83578379 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 83578384 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 83578390 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 83578395 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 83578411 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83579349 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 83581619 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83582688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83583669 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83584007 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83585306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83585436 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83586518 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83586602 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83587264 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83587472 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 83587776 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83589019 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83591043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83591217 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83592131 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83592244 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83593120 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83593390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83593992 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83595647 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83596207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83596210 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83596887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83597389 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83599506 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83599669 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83599891 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83601185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83601198 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83601251 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83601300 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83601354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83603022 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83603450 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 83608343 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83609900 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83610734 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83613610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83616438 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83617171 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83623306 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83624599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83626186 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83629359 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83629768 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83632157 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83633547 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83633885 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83634231 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 83635152 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83636214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83638354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83639491 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83639800 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83639837 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83640500 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83643351 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83643698 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83647466 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83649217 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83650782 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 83653490 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 83653939 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83654064 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83655608 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83657590 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83659260 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 83661418 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83661987 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83663885 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83664379 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83665087 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 83665967 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83666670 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 X 83666717 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83667467 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83668956 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83670288 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83670356 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83670364 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83671125 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 83671636 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83671958 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83672461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83672721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83672926 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83673026 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83673048 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83673867 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83674443 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83674909 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83677918 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83678966 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83679868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83682272 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 83684508 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83687608 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 83689692 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 83690441 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83690926 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83691569 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 83691865 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 83692035 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83692554 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83693173 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83693667 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83694180 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83698117 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83700898 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83700981 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83701591 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 83702051 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 83702163 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83702562 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83702640 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83702649 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83702734 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 83702814 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83702944 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83703031 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83703212 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83703399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83703597 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83703648 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83704225 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83704485 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83704529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83704780 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83705503 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83705781 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83706761 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 83708916 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83709792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83717379 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83717380 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83721811 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83722720 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83722773 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83722988 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83722994 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83722998 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83723301 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83731745 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83731800 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83731931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83731965 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83732003 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83732053 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83732219 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83732318 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83732426 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 83732996 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83734032 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83734138 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83734425 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83734836 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83735352 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83735655 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 83735717 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 83735797 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 83738188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83740987 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83741866 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83742410 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83742838 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83745538 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83745642 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83746827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83748232 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83748986 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83752150 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83755868 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83757024 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83758233 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83759665 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83760464 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 83762707 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83766787 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83768342 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83775541 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 83781566 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 83781612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83781820 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83781862 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83782766 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83784554 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83784589 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83788009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83789110 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83790910 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 83791202 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83791274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83792034 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83795524 G C N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 X 83796559 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 83798001 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83798951 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83799469 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83799581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83800065 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83800201 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83801117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83801130 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83801137 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83801204 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83801268 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 83802135 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83803613 C A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 83806130 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83807345 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83807750 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83808181 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83808519 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83809127 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 83809255 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83809461 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83810430 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 83810532 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83810789 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 83811132 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 X 83811278 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 83812095 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83812275 G T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 X 83812452 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83813428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83813475 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83813873 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83814036 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83815082 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83815320 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83816210 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83816361 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83816427 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83816547 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 83816640 C A Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 83817770 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83818616 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83819366 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83820359 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 83820617 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 83820919 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83821790 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 83822013 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 83822226 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83829562 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83832860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83833430 T A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 83836853 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 83836981 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83837170 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83839798 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83842503 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83843672 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83843679 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83844173 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83844775 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 X 83845032 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83845180 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 83846903 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 83847758 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83847942 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83847997 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83848014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83849685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83851546 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83852023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83853695 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83853999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83854170 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83854899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83858726 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83858854 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83859284 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83859684 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83860491 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83860508 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83861561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83861601 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83861952 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83862036 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83863697 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83864434 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83864548 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83865627 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83865753 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83865899 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83866272 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83866659 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83867653 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83867662 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83868162 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83868434 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83871395 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83872594 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83872807 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83876110 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 83876218 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83878675 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 83880398 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83882319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83883450 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83883763 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83885208 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83885260 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83886592 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 83892272 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 83892340 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83892529 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83893038 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83893974 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83894448 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83896233 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83896444 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83897206 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83898154 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83898691 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83898936 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 83899695 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83901502 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83901503 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83902158 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83904233 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83905013 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 83905552 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83905687 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83905908 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83906060 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 83906544 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83907016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83907518 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83908352 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83908441 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83908607 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83909243 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83909386 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83910283 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83910443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83910463 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83912590 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83912803 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 83917065 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 83917570 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 83918710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83918809 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83919247 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83919775 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83920247 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83920515 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83923006 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 83923643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83923875 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83925024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83928031 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83928401 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83928846 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83931554 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83931738 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83931815 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83933165 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83938554 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 83938912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83939084 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83939953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83940113 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83940403 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83940603 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83940718 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83942467 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83944932 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83945207 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83948177 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83949449 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83950067 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83952392 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 83953413 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83953913 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 83954347 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83954643 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83956438 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83956851 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83960666 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83961654 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83961779 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83963762 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83964322 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 83964327 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 83964328 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 83965096 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83965500 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83965696 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83966322 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83967129 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83967957 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 83967968 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 83968126 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 83970462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83970503 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83971143 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83972354 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83972572 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83973489 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 83975888 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83977603 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 83979255 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 83983058 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 83983300 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83992890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83996732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 83998176 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83998797 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 83999764 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 84000836 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84001330 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84013774 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84019493 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84021424 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 84023635 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84024704 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84027450 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 84032018 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 84034623 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84038316 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84039112 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84039891 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84043960 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 84046249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84052746 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 84053261 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84053279 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84053802 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84054537 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84060974 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84062764 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 84063470 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84063740 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 84075731 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84075940 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84076197 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84077181 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84077504 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84077535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84078604 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84079067 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84079527 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84080276 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84083007 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84083019 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84083512 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84084084 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84084176 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84084608 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84086982 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84087254 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84087255 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84089132 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84091055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84093064 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 84093285 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 84093825 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84094195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84094277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84094667 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 84095292 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84096490 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84097501 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 84097533 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84098090 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84098723 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84100707 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84101377 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84103323 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 84103749 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84103980 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84104810 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84105499 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84107119 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84110157 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84110904 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84110942 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 84110995 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 84112289 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 84112459 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 84113901 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84114178 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84114428 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84118291 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84123363 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84123771 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84124505 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84124507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84124888 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84125203 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 84125419 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84125660 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84127225 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84127296 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84131049 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 84133800 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84134137 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84135119 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 84135205 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84135796 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84136923 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 84145222 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 84145263 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 84145552 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84146851 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84147454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84148562 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84148904 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84149639 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84149994 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84152462 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84153944 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 84156157 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84156199 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84157396 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84157467 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84160207 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84160451 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 84160615 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84160829 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84161875 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84162746 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84163691 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84164268 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 84165093 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84165586 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84166415 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84167313 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84168417 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84168654 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84169091 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84170227 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84170720 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84171596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84171630 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84173613 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84174516 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 84175886 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84177804 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84179125 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84180461 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84180735 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84180742 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84180854 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84181155 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84181166 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84181387 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84181470 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84181859 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84181903 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84181923 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84182050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84182141 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84189305 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84189333 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84189380 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84189732 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84189752 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84189891 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84189949 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84190213 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 84190354 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84190416 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84191623 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84192353 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84193202 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84196630 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84197157 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84197317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84199075 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 84199458 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84200563 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84200941 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84200955 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84201700 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84206182 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84206310 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84212273 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84212289 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84212370 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84212598 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84212695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84212943 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84213157 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84213234 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84213698 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 84213718 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 84214277 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84214963 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84215081 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84215445 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84215509 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84215539 G T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 84215542 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 84215619 G C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 84215862 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 84215922 G T Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 84216045 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84216460 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84216910 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 84216947 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84217577 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 84218138 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84220184 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 84220291 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84221149 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84221163 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84221170 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84221712 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84224343 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84224596 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84224806 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 84224886 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84226126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84226333 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84227281 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84227580 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84228191 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84229633 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84229653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84231902 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 84232478 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84235060 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84235317 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84236134 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84239615 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84241897 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84241900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84242063 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84245298 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84245417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84246470 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84247641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84251904 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 84253078 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84253452 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84253647 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84253871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84254033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84254867 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84255066 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 84256368 G T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 84256410 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 84256469 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 84257552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84258863 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 84265744 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 84267371 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84269240 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84270383 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84270847 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84275790 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84275866 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84277676 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84278420 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84278423 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84281336 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 84283113 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84285129 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84285919 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84286757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84286793 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84287008 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84287228 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84287501 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 84288058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84289051 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84291147 A T N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 84292201 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84292901 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84294064 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84294065 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84294524 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84294822 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84294990 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84297024 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84297183 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84297398 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84298041 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 84298202 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84298520 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84298935 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84298938 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84303214 A T Y N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 84303944 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 84304072 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 84304527 G T N N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0 0.727272727272727 0.272727272727273 8 14 0 8 3 X 84304575 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 84304839 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 84305496 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84306483 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84306560 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 84307671 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84308927 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84309550 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84310689 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84311490 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84312535 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84312918 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84314051 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84314487 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84316756 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84319513 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84321002 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84321306 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84321748 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84322371 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 84331282 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84332907 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84333008 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84333038 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84333359 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84333854 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84336461 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84338228 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84338293 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84338367 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84339056 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84340312 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84341975 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 84343050 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84343692 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84344191 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84344966 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 84345139 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84345805 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 84347344 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84347564 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84348486 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 84350861 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84350984 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84351491 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 84351601 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 84352925 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84353333 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84354518 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84354674 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 84355003 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 84355058 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84356235 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84356812 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84357249 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84358894 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84360794 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84360920 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 84364368 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84364537 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84365130 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84366546 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84366617 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84367302 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84367320 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84367707 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84369316 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84370792 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84372699 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84372712 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84372724 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84373311 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84374660 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84375074 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84375656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84375753 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84376204 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84376597 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84376870 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 84380689 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84381220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84381503 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84381624 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84384833 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 84385109 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 84386225 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84387563 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84388956 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84389578 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84390771 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 84391376 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84391849 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84392927 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84392950 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84393027 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84394003 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 84397403 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84397952 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84398177 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84399658 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 84399844 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84399964 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84400174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84400713 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 84401232 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84401522 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84403657 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84404485 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84406186 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 84408078 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 84408079 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 84408591 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 84408592 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 X 84408720 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84409509 T G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 84409723 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84409884 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84411054 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 84413322 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84414071 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84419357 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 84424407 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84426057 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84426335 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84428730 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84430127 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 84431855 A T N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 84432590 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84438489 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84444853 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84444973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84445363 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84447764 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 84448124 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 84450481 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 84451241 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84452227 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84452573 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84452693 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84453265 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84455662 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84457292 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84457667 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84458509 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84458725 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84464746 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 84466236 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84467525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84472764 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84476923 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 84478125 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 84479189 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84479527 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84479727 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84481987 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84482521 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84485366 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84488003 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84494956 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 84495514 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84496825 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 84497087 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84497242 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84497371 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84497575 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84497599 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 84497746 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 84497886 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84497887 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84497967 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84498550 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 84498832 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84498965 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84499018 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84499155 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84499173 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84499240 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84499551 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84499779 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 84499823 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 84500040 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84500105 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84500109 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 84500110 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 84500123 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84500367 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84500379 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84500421 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84508143 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84508338 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84508825 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84509082 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84509707 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84509743 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84509935 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84510230 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 84510246 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84510530 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84510716 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84511008 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84511083 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84511106 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84511221 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 84511292 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 84511673 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84511916 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84512268 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84512385 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84512390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84512704 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84513018 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84513320 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84513339 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84513411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84514173 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 84514179 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 84514236 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 84514314 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84514870 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 84514874 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84514886 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 84515677 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84515741 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84516156 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84516845 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 84518810 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84519071 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84520277 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84520486 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84521247 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 84522406 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 84523739 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84530264 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 84530716 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 84531370 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84531446 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84531744 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84533672 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84535954 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 84537303 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84537477 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84537494 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84538709 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84540124 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 84540143 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 84540364 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84540716 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84542443 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 84543652 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 84544809 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 84545533 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84546371 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84546598 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84547008 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 84548067 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84549358 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84549412 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84549643 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84550768 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84551065 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84551290 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84551301 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84551754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84551762 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84552035 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84553186 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84554298 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84555041 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84555073 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84556266 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84557126 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 84557286 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 84558052 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84559714 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84559866 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84561392 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 84561690 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 84562132 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84562202 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84562393 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84562659 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84562765 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84563803 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 84564628 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84566553 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84567598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84567944 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84571166 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84571724 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84571804 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 84572751 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 84573167 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84574548 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84574832 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84575053 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84575403 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84575511 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84575551 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 84575727 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 84576444 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84576965 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84578297 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84578522 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84581251 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84584715 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84584829 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84585208 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84589987 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84590152 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84591073 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84591316 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84591409 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84591712 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84591741 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84591750 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84591931 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84592527 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84592715 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84592764 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84592862 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84593000 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84593221 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84594109 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84594132 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84595160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84595251 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84596245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84596382 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84596488 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84596532 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84596533 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84596579 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84596798 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84596950 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84596988 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 84597028 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84597043 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84597104 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84597203 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84597216 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84597226 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84597240 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84597310 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84597355 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84597606 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84597655 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84597775 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 84597861 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84597959 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84597987 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84598025 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84598170 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84598186 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84598187 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84598665 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 84598796 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 84598800 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 84598820 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 84599124 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 84599276 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 84599348 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84599482 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84599726 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84606558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84609191 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84613144 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84613157 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84613808 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84614103 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84617895 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84618665 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 84618762 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84619993 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84620089 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84623047 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 84623557 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84625376 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 84626322 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84630253 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84634045 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 84635775 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 84636179 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 84637699 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84638460 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84640017 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 84643678 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 84644007 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84644073 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 84645155 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84645426 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 84645506 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 84646048 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 84648530 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84650393 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84651174 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84651658 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 X 84652392 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84658793 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 84659152 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84660720 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84660810 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 X 84662207 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84664628 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84666530 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84667085 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84669286 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84670596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84673197 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 84677745 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84678266 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84681379 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 84682826 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 84685779 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84685791 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 84685807 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84686747 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 84687883 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 84692528 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 84692962 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 84693072 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 84693145 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 84694896 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 84697601 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 84698566 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84699361 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 84700780 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84702205 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84702765 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84703872 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84704635 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84712477 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84712503 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84713019 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 84714233 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84714252 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84716623 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84717644 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84718014 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84718992 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 84728426 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84732632 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84737747 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84738336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84738915 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84739214 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84739960 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84742011 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84745829 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84746861 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 84748523 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 84748679 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 84749461 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84752895 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 84752936 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 84755423 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 84758410 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 84758826 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 84758966 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 84761085 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84762412 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84762600 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84762761 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84764672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84767633 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 84768739 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84769315 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 84769857 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84769864 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84770276 T G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 84775063 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 84777921 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84779328 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84779567 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84779620 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 84779695 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84788454 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84789135 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 84793123 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 84793387 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84801002 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84801191 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 84802031 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84802295 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84802714 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84805086 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 84807622 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 84813082 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84813244 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 84813776 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84814282 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84815120 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84817379 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84818335 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84819078 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 84819628 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84822280 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84822738 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84823905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84825622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84826141 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 84828330 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84831185 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84832355 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84832943 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84833423 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 84836375 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84839123 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 84839772 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84839802 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84840345 T C N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 84841169 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84843955 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84845008 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84845545 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84845645 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84847751 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84847952 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84848279 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84853188 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84853600 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84854240 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84855962 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 84859636 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84864979 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84867882 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84868233 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84868937 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84870121 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84870975 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84871140 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84871198 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84873116 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84880787 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 84881423 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 84884761 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 84885940 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 84887282 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 84888103 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84889010 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 84890253 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 84892188 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84892815 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84897834 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 84898127 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84898175 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84899016 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84899911 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84900995 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84900996 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84901325 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84904360 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84906302 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84906608 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84914650 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 84915486 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84916599 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84918278 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84918500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84919496 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84919804 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84921258 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84922200 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84923677 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84923722 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84925932 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84925949 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84930383 T A N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 84935638 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84937105 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84938814 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84939603 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 84942819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84945231 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84948911 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84954243 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84955336 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84956225 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84958744 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 84959373 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84959390 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84964395 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84965742 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84965878 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84969302 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84969929 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84970915 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84973696 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84973721 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84976690 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84977243 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 84979409 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 84980196 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84980587 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 X 84980618 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84981920 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84982242 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84982499 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 84982652 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 84983065 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 84986243 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84987143 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84988975 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84990412 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 84991177 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 84991247 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 84994043 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 84994947 C A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 84997001 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 84998509 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85000283 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85002034 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 85004678 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85006003 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85007675 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 85008192 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 85009291 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85009687 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 85012127 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 85013132 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85015582 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85015787 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 85016392 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 85016812 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 85019269 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85020194 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 85022849 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85024859 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85027461 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85028564 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85032911 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 85033291 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85034137 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 85034189 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 85034241 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 85036841 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85038723 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85039399 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85043090 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85044237 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85044923 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85045432 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85051294 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85052239 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 85056308 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85057605 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 85061686 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85062595 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85065699 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85066269 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 85067476 G A Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 X 85068159 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 85068206 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 85069121 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85069491 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85070119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85070729 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 85071863 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85072955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85075165 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85075389 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85075392 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85077915 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85078356 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85079457 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85080478 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85081509 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 85082979 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85091679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85096959 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85100515 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85101013 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85109688 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 85111065 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85111151 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85111403 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85113540 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85113589 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85114703 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 85116714 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85119366 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 85119678 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 85121391 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85121721 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 85121913 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85124251 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85125077 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85127640 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 85130353 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85131869 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85132411 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 85133189 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85133401 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85135351 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85135557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85135862 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85136121 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85136607 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85137379 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85138418 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85138544 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85140433 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85140729 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85140779 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 85142106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85142884 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85145328 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 85145623 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85146091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85148224 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85149698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85150658 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85151245 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85151622 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85156535 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85157401 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85158349 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85159309 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85160932 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85161115 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85161636 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 85161914 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 85163162 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85182881 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85185332 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85185625 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85186517 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 85187364 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85194235 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85194863 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85197463 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85205749 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85206262 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85213728 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85215184 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85216769 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85217079 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85217883 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85219203 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 85221868 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85223417 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85227006 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85227790 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 85229317 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85231304 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85232094 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85233655 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85234424 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85235680 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85238347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85240088 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85243594 G C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85257982 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85258220 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85267163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85273338 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 85284794 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85286943 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85287581 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85289814 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 85289815 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 85293516 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 85294051 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85295733 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85298167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85329175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85331474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85331585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85332261 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85336076 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 85336484 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85339539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85339710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85341434 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85350912 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 85353145 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 85355154 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85356677 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 85358322 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 85359450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85360345 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85360497 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85361685 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85363922 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85365999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85368843 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85373673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85374538 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85376039 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85376994 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85377716 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85381980 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85387130 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85403591 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85406631 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 85406679 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85406726 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85407646 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85408445 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85416692 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85417208 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 85418517 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85418672 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85422676 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85423420 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 85424138 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85426207 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 85428295 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 85436583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85439723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85441473 A C Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 85441522 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85441837 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85445798 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 85448773 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85450913 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 85451300 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85451901 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85456333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85456516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85458412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85458611 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85458615 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85459158 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85460744 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85461068 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85463531 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 85465639 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85465838 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85466327 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85466946 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85469750 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85469994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85472103 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85473697 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 85474258 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85484659 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85485292 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 85487367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85488804 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85493420 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85494815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85495602 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85495922 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85497265 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 85497669 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 85497675 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 85497758 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85499392 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85501939 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85502077 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85506960 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 85507410 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85508179 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85508203 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 85509893 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85511089 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85511983 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85512878 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85513097 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 85513650 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85514265 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85515467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85518327 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85520696 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 85520835 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85521063 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85522471 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85522810 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85522921 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85523668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85524458 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85525370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85526047 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85526178 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85526842 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85527094 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85528251 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85529393 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85530136 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85531037 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85531466 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 85531666 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 85531916 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 85531975 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 85532699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85533409 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85536107 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85536195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85536236 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 X 85536551 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 85536887 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85540400 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85541730 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85542296 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85544610 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85545388 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85549956 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85550085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85550312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85553340 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85557142 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85559491 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85559694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85559952 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85561811 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85562080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85562503 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85563444 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85564040 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85567269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85569185 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85572260 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85573714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85574429 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85574563 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85574602 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85575842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85579118 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85579237 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85580622 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 85580931 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85581851 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85583548 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85584734 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85588032 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85589913 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85589915 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85591164 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85591326 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85598814 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85602043 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85602941 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85603890 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85605372 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85605663 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85607171 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 85607411 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85607799 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85609941 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85609987 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85611982 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85615005 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 85616959 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85619078 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85622348 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85623289 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 85628572 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85630096 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85630137 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85630238 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85630458 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85630830 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85631159 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85631656 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85632995 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85638802 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 85639535 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 85649118 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85651314 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85651860 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85656780 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85656781 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85658437 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85658760 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85659398 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 85660440 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85660535 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 85661330 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85661814 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 85662427 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85662483 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 85668588 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85668719 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85669068 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85673016 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85674812 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 85675562 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85675810 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 85676427 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85676544 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85676548 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85676691 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85676698 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85676883 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85677865 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 85679448 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85679931 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85680399 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 85681322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85681435 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85682298 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85684429 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85686531 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85687319 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 85688527 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85690388 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85690767 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 85694627 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85695621 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85698172 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 85699478 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85704026 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 85704567 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85713485 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85714899 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85714914 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85717225 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85719772 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85720357 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85720630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85723106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85723563 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85723831 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85723931 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85726990 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85726997 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85728403 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85728411 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85728440 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 85729676 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85732893 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85734344 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85738695 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 85740895 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85741410 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 85741732 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85741817 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85741906 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85742524 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 85742641 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85745379 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85746478 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 85746771 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85747230 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85749307 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 85750903 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85751163 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 X 85751165 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85751277 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85753928 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85760031 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85760204 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85760942 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85761060 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85764562 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85764810 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85765675 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85766669 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85770035 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85770061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85771359 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85772678 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85775110 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85775534 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85777420 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85781602 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 85781716 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 85783659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85784012 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85785578 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85786670 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85787193 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85795565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85797759 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85799020 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85801207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85802444 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85802843 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 85802845 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 85803135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85803179 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85804663 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85806139 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85812920 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85812922 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85813023 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85813041 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85813591 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 85814436 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 85815302 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 85815893 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85816508 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85819970 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85821632 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85822561 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 85822563 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85822658 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 85826087 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 85827286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85828371 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85830582 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85831016 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85831341 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85831478 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85833111 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85833127 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85833483 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85833576 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85838205 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85838382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85838948 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85839314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85839352 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85840171 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85840463 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85843258 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85845014 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85845213 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85848464 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 85850226 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85851061 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85851342 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85851497 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 85852478 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85854748 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85854907 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85855454 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 85856241 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85859003 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 85859666 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85859809 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85860744 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85866805 T A N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 X 85868820 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85868942 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 X 85870937 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85871926 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85872874 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 85874910 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85875664 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85876287 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85877693 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85881909 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85886010 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85888848 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 85889540 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85890224 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85893055 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 85894235 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85894738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85895466 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85895727 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85895856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85896067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85896870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85897912 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85898453 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 85898583 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 85899773 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85899972 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85900045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85901433 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85904782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85906395 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85911245 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 85911740 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 85913176 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85913680 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85915514 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85916731 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 85922040 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85923057 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85923192 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85923200 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85923354 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85929420 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85929554 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85930960 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 85932319 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85932600 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85933966 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85933990 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85934022 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85934361 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 85934403 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85935010 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85935626 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85936845 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85937788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85939301 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85943256 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 85943356 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 85947979 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85949463 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85951560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85952862 T G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 85953195 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85953404 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 85957954 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85964932 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85967911 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85974819 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85976822 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 85993006 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 85993219 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 85993322 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 85995940 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86003681 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86006620 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 86025171 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86025236 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86026338 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86026942 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86029223 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86034353 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86035200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86043297 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 86044749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86045857 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86046682 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 86052880 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86063493 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86065591 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 86065620 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 86069720 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86069936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86073318 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 86075526 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86075967 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86080000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86084620 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86084989 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86087442 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86093443 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86098013 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 86099195 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86102612 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86108272 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86108321 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86109943 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86111137 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86112074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86118539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86124043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86125253 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86129452 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 86129662 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 86130823 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86131008 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86139602 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86139660 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86140380 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86141246 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86144825 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86144871 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86145105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86145334 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86146299 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86148102 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 86149257 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86150201 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86150752 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 86152029 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86152180 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86153173 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 86155227 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 86155228 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 86155881 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86157899 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86159377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86160388 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86161516 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86161602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86162000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86163554 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86163598 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86163976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86164432 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 86164453 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 86164461 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 86165039 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86165660 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 86165951 A T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 86166910 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86167559 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86168010 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86168129 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 86168157 T A N N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 X 86168159 T A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 86168741 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86168753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86168913 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86169720 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 86170304 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86170350 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86170403 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86171777 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86172271 T G N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 86172560 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86173836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86174054 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86174211 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86174238 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86174358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86175089 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 X 86175583 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86176805 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86177589 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86179500 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86181788 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86182843 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86182977 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86183646 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86184505 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86184572 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86186582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86187525 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86187592 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86187809 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86188543 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86189407 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86190864 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86190995 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86191946 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86192283 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86192441 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86192576 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86192668 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86192875 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86193211 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86193529 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86193539 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86193727 G T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86193744 C A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86193829 A T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 86193830 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86193933 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 86194041 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86194568 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86194824 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86194990 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86195187 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86195835 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86196188 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86196671 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86196674 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86196701 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86197155 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86197174 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86197225 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86197272 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86197346 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86197415 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86197542 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86197698 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86197794 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86203309 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86203497 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86209270 T G Y N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 X 86210506 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86210971 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86212229 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86212297 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86212299 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86213576 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86214802 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86214873 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86217682 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 86217736 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 86218471 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86219115 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 86221911 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86226162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86229246 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 86230020 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86230685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86231267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86232349 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86232437 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86232739 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86233218 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86233964 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 86236554 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86244497 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86244772 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86245141 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86246080 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86246593 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86248963 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 86249868 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86252420 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86254117 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86254714 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 86256214 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86256310 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86256374 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86266343 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86267586 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86268903 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86269825 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 86271287 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86271394 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86271440 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86272236 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86272426 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86273023 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86273391 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86273582 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86274838 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86275645 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86279196 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86280122 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86283947 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86284266 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86285190 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86286351 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86286891 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86286912 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86287054 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86287205 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86288134 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86288743 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86289711 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 86290242 A G N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 86291572 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 86292779 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86294677 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86299300 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86301195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86301552 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86302042 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86305281 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 86313168 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86313404 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 86314519 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86315447 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86315453 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86322730 T G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 86323030 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86323306 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86325812 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86326040 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86326156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86326701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86328107 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86331117 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86333417 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86334566 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86335818 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86336791 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86337879 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 86337978 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86338491 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86338859 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86340866 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86343894 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 86345176 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86351610 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 86352274 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 86354113 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 86355399 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86355588 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86356069 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86356541 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86357332 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86357651 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86358709 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86359339 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 86359777 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86362145 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 86362440 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86362539 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86364354 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86365466 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 86365887 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86365967 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86366624 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 86367312 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86368039 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86368138 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86368675 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86369423 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86369886 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86369894 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86371243 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86371650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86372360 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86372767 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86373172 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 86376654 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 86377316 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86378221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86378259 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86381610 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86384736 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86387502 A T Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 86388658 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86388761 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86389236 C G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 86389552 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86390246 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 86390502 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 86391090 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86393030 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86393461 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 86393712 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86393743 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86394628 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86395743 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86396045 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86396145 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86396595 A C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 86396670 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86398090 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86398685 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86401754 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86402054 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86402392 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 86402470 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 86402556 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86403240 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 86404211 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 86404486 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 86405328 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86406478 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86407551 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86409412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86409869 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86410485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86411306 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 86411401 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86411927 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86412734 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86412821 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86413961 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86414301 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86417243 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86417685 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86418114 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86419582 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86419714 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 86419715 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86420411 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86420981 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86421779 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86422109 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 86422501 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 86424396 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 86424731 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86424940 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86427389 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86431216 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86432264 G A N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 86432311 T G N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 86434644 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 86434680 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86438446 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86438865 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86438866 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86440417 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86440861 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86442754 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 X 86443496 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86444084 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86444448 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86444526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86444716 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86459856 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86459962 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86460513 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86460784 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 86461228 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86461469 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86461658 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86465057 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86465283 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86465413 T A N N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 X 86465668 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 86465685 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86465875 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86466294 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86466844 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 86467711 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86468436 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 86468913 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86470960 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86471015 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86471208 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 86471907 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86473231 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86473478 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 86475247 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86475486 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 86475635 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86475969 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86476069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86478262 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86478328 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86479200 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86479605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86479810 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86480450 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86480770 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86480772 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86482315 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86483375 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86484555 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86485065 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86487559 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86487768 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 86489653 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86490744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86491895 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86493221 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86493632 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86493797 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86494182 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86494807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86494981 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86497454 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86498582 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86499606 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86499787 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86500399 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 86502005 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86503235 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86504568 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86505518 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 86506922 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 86507555 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86510723 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86513741 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86514102 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86514493 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86514592 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86515218 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86515244 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86516234 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86516705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86518917 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86518919 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86520224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86521452 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86521726 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86522918 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86523422 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 86523477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86524517 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86525518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86527956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86528173 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86528919 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86529100 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 86530673 A G N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 86531244 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 86531271 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 86531734 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86534101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86534540 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86535390 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 86535971 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 86537068 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86537315 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86537316 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86538123 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86539554 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86540237 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86543700 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86544801 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86552827 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86553724 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86555219 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86555295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86556455 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86556732 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 86556752 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 86556779 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 86564436 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86567340 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86568216 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86568279 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86569334 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86569974 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 86570003 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 86570302 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86571319 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86578291 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86580505 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 86582496 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86583493 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86583495 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86584033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86586659 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86588179 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86588662 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86589682 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 X 86590624 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86590826 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86590882 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86592951 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 86593163 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 86594829 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86594886 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86594942 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 86595037 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 86595631 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86596021 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86596201 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86597084 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86598599 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86598969 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86599216 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86600027 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86600336 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 86600404 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 86601504 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 86601532 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 86601777 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86602750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86603123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86603725 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86604036 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 86606434 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86607036 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86607079 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 86607467 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 86607511 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86607637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86607736 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86612403 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86612446 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86613710 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86616668 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 86617228 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86617324 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86619211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86619429 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86620441 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 86620621 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 86621270 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86621461 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86621905 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86623268 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86624597 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86624732 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86625335 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86625433 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86625999 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86626215 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86626833 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86630562 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86630825 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86631273 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 86631902 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 86632403 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 86632666 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86634157 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86634383 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86634873 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 86635402 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86645244 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86660492 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86674687 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86675347 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86679840 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86701472 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86702587 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86747912 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86747914 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86748082 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86749522 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 86753005 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86756190 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 86757796 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86758856 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86763758 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 86773057 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86777632 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86779953 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86781918 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 X 86782413 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86783528 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86787750 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 86791047 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 86791368 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86793625 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86797760 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86800758 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 86810019 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86810623 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86811291 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86812085 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86818203 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86820057 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 86827744 A C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 86829236 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86831338 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86837835 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86839371 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86839575 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86839793 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86841024 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86842609 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86844130 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86844276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86844477 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86844832 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86845123 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86845659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86845696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86847458 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86847694 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86848489 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86849011 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86849281 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86849681 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86850657 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 86883208 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 86890942 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 86890943 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 86893313 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 86893497 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86893498 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86914710 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 86917182 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 86917994 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86929134 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 86929571 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86942298 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86955831 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 86967122 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 86967226 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 86981811 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87006352 G A Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 87023057 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87028634 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 87034818 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87038019 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87051587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87054295 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87057695 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87082805 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87100326 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87102400 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87115509 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87118688 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 87122910 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 87137641 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87139900 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 X 87141933 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87147628 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87150315 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87157261 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87157541 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87157596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87166275 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87166276 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87168673 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87169203 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87178491 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87181467 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87181818 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87193861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87197004 G A Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 87199299 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87200671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87201414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87210372 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 87210645 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87211559 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87212062 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87212637 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87215365 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87215975 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 87216209 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 87216761 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87218371 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 87218752 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 87219763 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 87222684 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87223991 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87224521 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 87226375 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87227817 C T N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 87228884 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87229786 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87230849 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87232865 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87233407 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87234904 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87236356 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87236411 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87239849 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 87239859 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 87239925 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 87240558 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 87241696 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87242352 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87242528 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87244128 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87245031 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 87247425 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87248000 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87249422 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87249475 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87250843 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87253546 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 87253715 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87254903 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87255490 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87256992 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87257007 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87257729 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87258138 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87259659 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 87259762 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 87261644 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87262363 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87263053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87264798 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 87267111 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87267123 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87268919 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 87269238 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87269250 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87270216 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87270337 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87270694 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87271114 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87273082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87273182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87276369 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87276544 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87280061 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87281443 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87282095 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 87286106 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87287052 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87287657 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87287809 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 X 87288069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87289933 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87290057 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87294193 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87295330 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87295348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87295351 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 X 87295967 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87296003 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87296830 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87296953 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87297407 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87297551 A C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 87298204 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87301819 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87303221 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87303333 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87309319 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 87310178 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87310549 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87317857 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87318333 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87318434 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87324347 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87325814 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 X 87326916 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87327188 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87327808 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87328634 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87330607 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87333803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87333886 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 X 87336669 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87338388 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87338911 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87338942 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87339199 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87339600 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87340640 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87348619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87349194 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87349768 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87350730 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87351108 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87351109 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87354273 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 87355370 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87355500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87355847 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87356876 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87357888 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 87363287 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 87365445 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87365722 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87366011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87368444 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 87369547 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87369893 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87370546 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87374390 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87375247 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87377931 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87379324 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87383096 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87383958 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87384091 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87384412 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87388920 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87393818 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 87397104 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87397820 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 87398577 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87398854 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 87398860 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 87399217 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87399983 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87400781 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87402355 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87402972 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 87403458 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87405022 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87406107 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87407696 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 87407989 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87408540 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 87408738 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 87409229 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 87411976 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87421513 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87422076 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87423140 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87423146 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87425737 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87425895 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 87428844 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 87430513 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87430560 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 87431417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87431793 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87431947 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87432033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87434731 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87440160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87440321 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87440324 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87440887 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87440888 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 87442212 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 87442548 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87446539 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87447441 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87449225 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87451903 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87453175 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87453199 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87453249 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87454390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87455147 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87455369 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 X 87458889 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87460716 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 87461675 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87463462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87463921 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87464578 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87468721 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87474009 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 87477642 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87481712 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87488216 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87488432 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87490515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87509018 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87514904 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87515053 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87517658 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 87520300 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 87524425 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87525993 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87530332 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 87539084 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87539647 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87539823 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87540398 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87540463 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87541100 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87541320 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87541442 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87543005 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87543438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87545720 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87545751 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87548150 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87548860 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87549516 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87550938 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87551024 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87559639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87559667 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87561456 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87562381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87563844 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87564126 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 87565648 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87565859 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87567193 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87567486 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87567932 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87568050 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87568062 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87569497 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 87571085 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 X 87582252 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87582595 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87585710 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87586650 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87594299 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87594393 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87595160 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87598942 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 X 87603181 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87603576 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87606375 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 87607641 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87608140 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 X 87608252 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87609097 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87609241 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87610430 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87611075 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 87612962 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87619293 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87621288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87621860 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87623193 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87635015 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87635178 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87639466 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87641783 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87644987 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87651043 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87652910 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87656055 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87658371 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87658855 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87661311 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 87662742 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 87662789 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87669484 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87670178 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 87671717 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87674655 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 87675936 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87678263 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87679984 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87680304 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87680750 T C N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 87681932 G A N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 87682642 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 87682714 C G N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 87690637 C A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 X 87690647 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87690725 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87691593 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87694708 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87695078 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 87697423 A T Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 87697846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87699364 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87699516 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87700245 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87700627 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87701350 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87702363 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87705709 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87707512 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87707762 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87707938 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87708599 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87713478 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 87714960 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87716942 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 87717065 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 87718134 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87718200 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87718213 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87719024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87720504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87722020 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87723826 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 87724030 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 87724553 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 87725772 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87728963 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87733388 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 87736056 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 87739543 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87739858 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 87740408 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87740982 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87742075 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87742185 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87743233 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 87744345 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 87746358 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87747779 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87750732 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87754725 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 X 87755751 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87756407 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87757816 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87757837 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 87757838 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 87757839 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87758845 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87759066 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87760017 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87761104 A G N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.8 0 0.2 24 6 12 0 3 X 87763076 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 87763317 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87764234 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87764264 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87764461 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87766000 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 87766139 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87777880 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87778051 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87778064 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87778403 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87779161 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87781446 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 87787519 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 87787520 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 87788694 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87788927 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87789111 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87789772 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87790847 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 87792844 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87793246 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87794182 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 87796276 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87797576 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 87797899 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87798100 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87801290 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87803736 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87805821 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87806154 T C Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 87806458 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87811436 T G N N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 X 87814984 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87824835 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87825750 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87828953 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87829434 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 87831248 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 87831364 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87831499 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87831554 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87834185 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87834674 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87838207 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87838383 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87838508 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87839760 A T Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 87842907 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87843494 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87843503 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87843660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87844434 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87844996 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 87847033 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 87847417 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 X 87850725 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87860842 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87864706 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87865139 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 87866936 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87867816 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87873157 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87875269 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87875270 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87875718 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 87875721 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 87876475 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87876699 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87877904 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87878644 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87878851 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87879368 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87879490 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87880458 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 87880718 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 87882117 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 87882385 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87884194 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 87890790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87891397 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 87891612 A C N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 87892310 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 87892571 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87892572 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87892692 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87894075 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 87898617 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87900555 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87900798 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87900940 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87903990 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87907434 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87907774 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 87910170 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87910171 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87910200 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87918368 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87918628 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87920229 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87920230 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87921658 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87922059 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87923182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87923346 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87923446 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87926049 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 87926107 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 X 87928093 C A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 X 87928415 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87930329 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87931231 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87931959 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87932113 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 X 87932401 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87932402 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87932694 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87933503 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87935210 G C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 87935284 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87936246 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87936624 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87942335 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87945797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87963889 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87964589 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87969267 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87969392 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87969965 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 87980320 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87981907 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87985489 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87987073 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87993980 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 87995267 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 87997226 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 87997435 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 87997969 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 87998379 G A Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 87998554 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88000524 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 88000530 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 88001662 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88001786 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 88005446 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 88008207 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88009260 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 88009860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88010374 C G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 88010762 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88010805 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88015839 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 88017646 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 88018272 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88029457 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 88031483 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 88032851 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88034414 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88035676 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 88035739 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 88037481 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88039518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88040943 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88041216 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 88041703 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 88044499 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 88045558 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 88047561 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88049179 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88049913 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 88050129 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88050407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88053935 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 88055248 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88056064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88056748 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 88061796 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 88063885 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 88067224 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 88067741 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 88068725 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 88069303 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 88070574 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 88073272 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 88076140 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 88077566 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 88079029 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88079480 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 88091224 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 88093368 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88094349 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 88099202 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 X 88105514 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 88106360 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 88107488 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 88110758 C A N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 88113376 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 88115577 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 88115852 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 88116335 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 88117440 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 88117847 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88120890 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88122588 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88123954 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 88125727 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88127194 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88129604 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 88131132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88136780 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88140171 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88141943 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88142312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88146450 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 88150037 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 88150508 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 88151499 G A N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 88151928 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88154441 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 88159092 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88160820 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88163383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88164457 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 88164594 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 88165398 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88165546 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 88165579 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 88166082 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 88168157 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 88168916 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 88170909 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 88176187 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 88185132 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 88188137 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 88190536 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 88191569 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 88206086 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 88208663 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88211747 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88212001 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 88212485 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 88216645 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 88220623 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 88226316 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 88230638 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88232609 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 88244582 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88257911 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 88267133 T C N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 88268730 T C N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 88271061 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 88273094 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88276767 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 88277588 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 88280153 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88281817 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88283716 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 88284477 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88284890 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88287885 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88288606 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 88294863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88303962 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 88308829 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 88310317 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 X 88312899 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 88314835 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88314921 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88315079 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 88316153 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88319130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88319489 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 88323088 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 88325814 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 88331270 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88331658 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88333924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88334189 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88334201 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88339999 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 88340454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88341627 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88342449 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88344780 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88352704 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88353199 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88354272 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88356619 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 88357497 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 88357836 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88358220 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 88358695 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 88359494 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 88363026 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 88364456 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 88364570 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88377420 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 88379175 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88379690 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88381493 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 88384106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88385598 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88386361 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 88387706 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 88387806 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 88390449 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88391550 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 88395114 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 88395457 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88396054 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88396752 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88400914 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88409301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88411803 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88412846 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 88418534 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88419000 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 88424551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88424830 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88424840 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88425169 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 88425620 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 88425702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88425941 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88426356 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88426420 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88429907 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 88431635 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88434085 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 88435404 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 88435475 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 88437237 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 88438652 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 88438767 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88440548 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88442082 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 88442283 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 88442324 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 88446795 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 88449064 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88452786 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 88459456 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 88459566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88459990 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88460320 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88461957 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 88462241 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 88462246 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 88466401 A T N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 X 88466602 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 88466616 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 88467409 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88469262 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 88472319 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 88475923 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88487945 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 X 88489784 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88490476 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 88497879 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 88499516 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 88502949 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 88508847 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 88509451 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 X 88517738 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88519782 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88520368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88521822 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88522929 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 88532827 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 88532841 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 88539315 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 88545956 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 88551171 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 88552075 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 88574226 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88594502 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88595087 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 88596529 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88602015 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88603043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88603374 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88604521 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 88607926 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88608067 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88609051 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 88611310 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88614910 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 88615025 C G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 88620079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88620342 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88620984 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 88623364 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88623914 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 88626510 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 88627395 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 88627679 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 88630182 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88634497 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 88635822 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 88643913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88645261 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88647668 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 88652487 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 88653222 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 X 88655382 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88664832 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88666271 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88667183 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 88667381 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 88676965 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88679761 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 88680059 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88680465 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88683662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88687337 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 88690562 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 88727357 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88731625 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 88734675 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 88735163 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88737018 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 88737502 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88741351 G A Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 88742769 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 88745931 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 88747328 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 88753598 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 88754021 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88757043 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 88762333 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 88763396 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88766193 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 88766482 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88767443 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 88768937 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 88769314 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 88772139 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 88780871 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 88784124 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88787958 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88789098 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 88789772 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 88791918 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88794131 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88798316 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 88800519 C G N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 X 88800738 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 88803992 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88807964 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88807982 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88814706 C T Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 88815508 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 88818408 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88822677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88826048 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88845483 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88850362 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88864807 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88865428 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88869995 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88897504 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88908142 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 88914232 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 88915900 C G Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 88917773 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 88919137 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 88922409 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88925308 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 88925869 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88927541 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88931376 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 88931820 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88942435 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 88945272 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 88949228 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88953888 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88959368 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 88960108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88962739 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 88962740 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 88963877 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 88964373 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 88969367 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 88969505 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 88969873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88983478 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 88985921 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 88987623 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89009330 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 89014608 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89041095 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 89045596 G C N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 X 89050958 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89055131 G T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 89056975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89057646 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89059054 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 89075943 A C N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 89098884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89103990 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 X 89107626 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 89112104 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 89117077 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89118643 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 89119141 G A Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 X 89132687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89133136 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 X 89134457 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89138860 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89157030 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 89158300 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 89159245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89162472 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89165974 T A N N 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 X 89166597 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89169347 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89171909 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89173082 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89211586 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 89211616 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 89222110 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 89222381 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89226387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89227962 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 89229437 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89230033 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89243498 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89243547 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89244924 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89246895 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 89278031 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89278032 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89278892 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89280490 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89281705 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89283689 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89284168 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89286786 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89286792 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89290151 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89290256 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89291249 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89291345 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 89300387 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 89300679 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 89307949 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89309783 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89310619 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 89318618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89320750 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89326560 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89329124 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89329599 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 89334256 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89342745 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 89342880 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 89362107 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89375576 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 89376032 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 89378752 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 89380577 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89386566 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89390795 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 X 89391047 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89393670 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89394702 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89397375 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89397757 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89402972 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89410349 G C N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 X 89412127 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89412712 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 89412883 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89414134 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89415531 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 X 89415606 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 89417078 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89419273 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 89428298 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 89437745 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 89443403 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 89443469 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89443488 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 89444747 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 89449437 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 89453763 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89475993 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89479951 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89484781 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 89486005 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89486360 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89486960 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89500406 T C N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 89507506 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 89509844 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 89510724 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89511224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89524198 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 89525718 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 89526718 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 89528673 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 89528705 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89530198 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89533282 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 89533531 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89537871 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 89542391 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89551764 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89560370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89563460 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89567753 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 89577498 A T N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 X 89579708 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89579882 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89584015 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 89584319 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 89584928 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89586405 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89587950 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 89588538 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89589943 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89591138 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89591155 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89592573 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89594924 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 89596206 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 89596519 G T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 X 89598731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89599642 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89602871 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89603545 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 89604226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89606133 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89606530 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 X 89607686 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 89608975 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 89611637 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 89619786 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 89623729 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 89625720 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89628256 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89628535 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 X 89630537 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89631127 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 89631347 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89632184 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89633778 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89634114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89635077 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 89636430 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89637175 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 89637391 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 89637392 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 89637548 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 89638872 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89640362 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 89641561 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89641739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89642695 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 89643273 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89647382 A G N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 X 89647386 G A N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 X 89648683 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 89651364 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89651381 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89651746 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 89653405 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89654927 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89657351 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 89658223 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 89659284 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89660767 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89660894 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89661119 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89662409 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89664954 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89665088 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89665857 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89667757 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89668094 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 89668955 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89670073 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89671660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89672873 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89674575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89678996 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89683155 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 89683702 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89689563 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89690120 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89691428 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 89696948 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 89699334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89701269 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89702042 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89703993 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89706088 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 89714635 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89714898 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89716028 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89720995 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 89720996 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89721649 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89723260 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 89726018 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89726244 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89726495 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89729105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89730950 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 89731919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89732648 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 89733996 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89736418 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 89738384 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89740702 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 89744514 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89749165 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 89750139 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 89752593 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89753683 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89753804 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 89761158 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89763653 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 89765534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89765538 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89767815 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89768036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89768259 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 89768716 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89769870 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 89771591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89771726 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89773508 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89774215 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 89780141 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89781332 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 89781375 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 89781575 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 89782129 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89784157 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89785549 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89785667 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89788202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89789487 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 89789796 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 89791176 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 89791177 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 89797235 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 89797458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89807544 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 89828236 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 89832532 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 89832990 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 89834054 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89834189 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 89834310 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89836219 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89837056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89837584 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89837741 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89838152 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89838502 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89838586 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89839603 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89840614 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89841061 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89841963 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89843251 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89845311 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89846424 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89847489 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89848786 A G Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 89848836 C A Y N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 X 89850205 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89853223 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89857127 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89858026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89858978 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89866651 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 89866793 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 89866831 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89866846 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89867100 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89868398 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 89868541 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89871975 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89872668 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 89872696 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89875960 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 89880616 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89881618 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 89881719 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89883412 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89883864 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89883972 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89884655 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89885136 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 89885173 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 89885193 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 89887146 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89888493 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89891866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89892707 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89893272 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89907288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89908892 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89909445 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89909526 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89912701 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89913197 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89930737 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89930983 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89931008 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89936490 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89937838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89941287 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89942050 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 89942343 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89944736 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 X 89945627 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 89949665 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89951864 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89951916 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89955080 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89957463 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 89965294 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 89965618 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 89967260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89969922 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89970391 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89970401 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89976851 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89977568 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 89978234 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 89979059 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 89981500 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89983670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89984647 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 89986571 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 89987121 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 89988773 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 89989124 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89989183 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89989462 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 89989989 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89993777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89994380 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89994536 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89996094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 89997458 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90002729 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90003174 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 90004079 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 90005559 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90007956 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90008318 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90009251 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90009264 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90009431 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90013941 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 90014176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90017479 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90017506 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90017584 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90018671 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 90019084 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 90019544 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 90020093 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90020098 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90020149 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90020613 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90023265 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 90023326 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 90024557 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90025076 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90025132 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90025483 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 90026069 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 90026101 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 90029957 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 90030458 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90030514 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90031846 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90033110 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90034933 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90038611 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90039228 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 90040757 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 90041682 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 90042166 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90053208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90057064 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 90058794 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90061742 G A N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 90065155 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90066326 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 90068480 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90069857 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90071835 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90071933 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90072192 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90072814 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90078155 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90081078 C A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 90082623 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 90083278 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90085677 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90086229 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90086613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90086776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90088298 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 90088689 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 90089335 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 90093133 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 90093330 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 90093726 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 90093850 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 90095128 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90096522 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 90099646 A C N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 90100169 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90103987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90104107 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90107429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90109836 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90111234 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90112157 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 90113307 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90115616 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 90121597 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90122203 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 90124941 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90126515 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 90126565 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90127751 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 90129534 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 90134993 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90135548 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90136261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90136630 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90139699 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90143120 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 90147340 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90148538 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90149498 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90150868 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 90152605 C T Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 X 90153469 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 90170568 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90173429 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 90175456 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90175461 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90175591 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90176558 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90176817 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90176960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90177851 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90178192 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90181788 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90181816 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 90182067 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90187934 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 90188035 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90188585 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90196336 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90197214 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90198724 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 90199760 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 90200129 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 90203782 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 90203816 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 90204625 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90215877 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 90216176 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 90218632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90220177 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 90220867 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90225076 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 90225403 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90226633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90230040 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90232322 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 90236136 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90236302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90240986 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90241337 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90248694 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90249306 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90249397 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90251663 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90256115 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90258294 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90262582 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90264335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90265172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90266788 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90273066 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 90273202 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90279875 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90280298 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90281454 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90283397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90285556 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90285946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90286307 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90288160 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90289096 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90289118 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90289632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90290631 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 90290805 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90290809 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90291313 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90292716 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90294086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90296018 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 90296405 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90297039 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90297610 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 90297839 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 90300444 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 90300732 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90300930 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90300991 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90303267 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90304003 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90304839 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90305560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90309507 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90309700 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90310087 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90312406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90314037 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90314618 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90315353 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90315505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90316721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90316891 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90319023 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90320613 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90324016 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 90328362 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90329517 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90331880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90340270 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90341305 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 90341308 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 90341456 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 90343082 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90348761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90355912 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 90359759 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90375948 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90380651 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90380657 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 90380663 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 90383020 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 90383790 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90383955 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90384326 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90386261 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90388416 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90389486 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90389494 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90407158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90411186 T A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 90411700 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 90412384 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90414086 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90414160 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90415494 G C Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 90426092 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 90428307 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90430810 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90431303 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90436977 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 90437084 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90439087 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90440205 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90442600 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 90442725 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90443509 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90443756 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90445053 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90445330 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90448562 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90448648 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90450827 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 90450999 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 90451261 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 90451267 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 90452159 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90454892 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 90455765 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90461857 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90463070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90463392 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 90465688 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 90470278 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 90472456 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 90475019 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90476790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90478400 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90480222 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 90481422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90482237 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90483632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90486733 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90496210 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 90497687 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90497942 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 90500936 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90501755 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90502208 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90502261 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 90503527 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90509971 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90514222 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90514947 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 90514962 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90518333 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90523800 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90524089 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90530821 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90539635 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90548656 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90553427 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90554352 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90560905 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 90565450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90576188 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90579902 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90580067 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90580955 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90581422 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90584221 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90585418 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 90586441 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90586579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90588051 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 90588068 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 90588114 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90589513 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 90592572 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 90593290 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90593973 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 90596438 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90606434 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90617160 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90622464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90623660 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90629243 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90629746 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90631150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90631699 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 90633612 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90642002 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90642010 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90648624 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 90686316 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90687150 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90690623 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90704824 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90722388 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 90735666 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 90738161 G C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 X 90744311 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 90745930 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90751833 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 90763404 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90770466 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90794619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90796148 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 90796151 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 90797506 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 90800470 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 90800941 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90801631 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 90803036 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 90803414 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 90806824 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90807970 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90808566 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90808866 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 90808900 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 90808928 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90809293 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90809847 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90809856 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90810070 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90811062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90811107 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90811357 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90811684 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90812210 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90812686 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90812687 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90813571 G A Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 90813692 T A Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 90813699 T G Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 90814093 C T Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 90816023 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 90818030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90818736 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90825511 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 90826390 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90826865 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90828803 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 X 90831485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90831741 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90836215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90840891 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90842099 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90842785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90845905 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 90845907 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 90846013 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 X 90846014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90850163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90850625 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90851352 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90851362 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90851867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90861324 C T N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 90862108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90862380 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90865560 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 90878468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90879435 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90886648 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90887570 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90889519 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90896715 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 90898719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90898731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90900645 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90901183 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 90902061 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90903309 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 90911259 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 90935509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90944356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90945246 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90946592 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90951154 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 90953902 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 90956696 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 90965923 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90978971 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90978972 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 90979762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90981124 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90981643 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90982645 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90985785 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 90988648 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90988732 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90989259 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90989370 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 90990988 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 X 90994225 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 90998578 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 90998638 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 90999849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91001952 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91004182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91004557 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91005256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91008029 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91008323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91009048 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91009389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91009748 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 91009910 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91010157 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91010421 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91010679 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91010708 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 X 91010834 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 91010839 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 91011037 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91011168 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 91011486 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91011683 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91011686 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91011828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91011894 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 91012122 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 91012161 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 91012224 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91012250 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91012289 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91012293 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91012368 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 91012479 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91012480 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91012634 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91012635 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91013003 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91013021 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91013192 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91013426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91013665 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 91013666 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 91013826 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 91015180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91015749 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 X 91015884 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 91016315 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91017625 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91018254 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 91019238 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 91020199 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91020639 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 X 91020975 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91021023 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91021265 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91021456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91021492 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 91021569 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91022891 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 91023648 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91024861 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91025191 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 X 91027231 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 91027782 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91028415 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91028936 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91029427 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 91029706 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 91030547 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 91030873 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 91030965 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 91031112 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91031582 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91031894 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 X 91031899 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91031913 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 91032035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91035239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91035618 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91036713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91038059 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91039387 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91039657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91041706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91041941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91041970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91041996 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 X 91042002 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 X 91042267 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91043832 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91044244 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91045439 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91046740 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 91048001 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 91051346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91051515 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91053526 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 91053607 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 91053852 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91054742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91054816 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 91055113 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91057208 T A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 91058622 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91060216 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91061991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91063090 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91066688 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91069621 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91074641 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91085173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91088771 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 91097220 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91105129 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91113851 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91115075 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 X 91122417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91124266 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 91129579 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 91129602 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 91129611 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91129837 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91129963 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91130247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91130381 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91130562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91130696 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91131350 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91131669 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 91135835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91135895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91137795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91137971 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91138097 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91138155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91138441 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91139111 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91139249 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91140022 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91140060 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91140086 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91140342 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91142403 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91142469 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91142835 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91142959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91143449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91143488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91147188 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 91147245 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 91147359 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 91147718 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 91147792 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 91150210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91150211 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91150405 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91150681 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91151905 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91153271 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91153359 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91156432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91156578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91157460 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91157513 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91158069 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91163619 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91164169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91168086 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91171510 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91175994 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91176023 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91176780 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91178602 C A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 91178809 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91179186 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91179682 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91180524 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91181377 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91182778 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91183897 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 X 91186933 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91188015 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91200426 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91201522 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91202194 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 91206402 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 91210354 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91211123 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91212549 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 91212801 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91212977 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 91213037 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91215037 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91216836 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91217758 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91219259 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 91220666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91221193 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 91223168 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91224143 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91224912 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 91228000 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91229678 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91233650 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91233797 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 X 91235250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91236635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91238760 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91240456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91242449 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91242555 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 91245597 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91245621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91248118 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91249622 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91250056 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91250132 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91253945 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91254933 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91255460 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 91257240 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91261931 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91261947 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91262796 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91263232 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 91263638 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 91265370 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91266447 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91268800 C G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 91268917 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 91271156 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 91271985 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91273030 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91275100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91276567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91277368 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91278410 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 91278602 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 91279510 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91279734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91279966 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91280079 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91280702 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91281204 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91281627 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91283413 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 91283524 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 91283534 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 91283916 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91283964 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91288098 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 91288621 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91290206 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91291304 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 X 91291669 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 91292896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91293396 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91293641 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91294104 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91295609 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91296613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91297721 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91299081 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 91301961 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91305387 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91307294 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91307341 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91308289 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 91311623 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 X 91314053 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 91316798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91317471 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 91318016 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91318898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91331055 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 91334998 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91338785 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91339287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91341659 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91342129 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91342566 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91347343 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91349816 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91350365 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91350758 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 91353117 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 91353193 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91353585 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91353587 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91353588 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 X 91353607 G A Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 91353696 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 91355631 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 91356576 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 91357795 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91358084 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91358695 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91360096 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91360138 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91360849 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91361899 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 91361975 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 91362510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91363057 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 91364709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91365171 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91370769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91371355 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91372016 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91373409 C G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 X 91375036 G A N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 X 91376719 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91377363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91378843 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91382451 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 91387568 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91389592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91391849 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91393660 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91396434 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91398442 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 91400621 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 X 91410480 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91412850 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91413031 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91417003 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 91417041 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91417089 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91417131 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 91420305 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91420836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91421865 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 X 91423174 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91424572 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 91424584 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 X 91424940 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91425134 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 91425481 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91426557 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91428023 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91428482 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91428847 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91429674 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 91432830 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 91436934 A T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 X 91437242 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91437310 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 91437913 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 91439056 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 91439731 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91440533 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91441845 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91442277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91442597 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91442854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91443311 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91443704 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91445428 A C N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 X 91445902 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91445999 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91446193 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 91447350 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91447521 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91447816 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91454989 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91455324 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91461297 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91461457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91467485 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91469043 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 91475522 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 X 91475655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91477928 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91478194 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 91481320 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91482425 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 91482965 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91483959 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91485594 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 91487775 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91490278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91492958 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91493091 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91493301 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91493347 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91493512 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91493615 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 91494265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91494455 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91498456 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91499849 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91499927 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 91500378 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 91503822 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 91506489 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91507125 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 91507833 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91508199 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 91510493 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91514342 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91515955 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91516113 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 91516496 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91516977 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91516978 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91521426 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 91525358 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91526003 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 91527196 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91528094 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91528895 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91530112 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91530480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91530848 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91535676 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91535893 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91539155 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 91541089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91542286 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91546309 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91546594 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91548728 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91549656 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91555300 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91560017 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91569490 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91570755 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91571729 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91572058 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91575820 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 91576237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91577708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91579611 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 91583117 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91583942 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91583996 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91586996 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91589724 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91590528 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91590633 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91590662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91592853 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91597833 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91600143 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 X 91600162 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91600255 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91601083 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91601628 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 91603980 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91604657 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91609925 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91609969 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91612661 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 91613311 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91614765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91619721 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91620247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91620894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91621826 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91624015 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91624575 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91629288 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91631010 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91634232 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91634565 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91635657 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91637121 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91637145 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91638475 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 91640089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91644789 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 91651667 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91657188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91659441 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 91659626 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 91660645 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91662203 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 91663588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91668365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91668515 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91669290 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91673098 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 91673451 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 91674118 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 91675632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91679043 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91682016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91683610 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 X 91685867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91687657 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91688437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91689333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91689736 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91690232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91697810 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91697984 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91698274 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91699239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91699899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91700334 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91700994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91701136 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91702524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91702537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91702629 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91702818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91703012 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91703494 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91703729 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91704612 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 91704620 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 91704674 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 91705003 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91705363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91705416 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91705852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91706575 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91712662 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91712687 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91713900 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 91714064 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 X 91714261 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91714635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91714808 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 X 91714881 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 X 91714882 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 X 91715086 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91715355 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 X 91715380 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91716075 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 X 91716415 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 X 91716466 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 X 91716532 T G N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 X 91716583 G A N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 X 91716618 C T N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 X 91716619 T C N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.384615384615385 0.307692307692308 0.307692307692308 14 12 5 4 4 X 91717106 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 91717150 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 X 91717267 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 91717367 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 X 91717412 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 X 91717989 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91718052 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91718090 G C Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 X 91718707 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91718788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91718793 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 X 91719180 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91719355 C A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.0588235294117647 0.705882352941177 0.235294117647059 14 20 1 12 4 X 91719427 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91719450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91719522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91720180 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 91720269 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 91720316 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91720344 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91722630 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91722811 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91722856 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91722857 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91722883 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 91723178 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91723619 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 X 91723842 C A N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 X 91723913 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 91724096 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 91725024 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 X 91725349 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91725448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91725593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91726669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91727130 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 91729612 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91729854 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91731187 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 91731253 C T Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 X 91731613 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 91734302 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91734312 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91734378 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91734430 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91734503 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91734504 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91734514 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91734518 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91734671 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 91735324 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 91735786 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 91735837 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91735896 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91736001 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91736030 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 91736071 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 91736081 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 91736210 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91736682 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91736772 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91737002 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91737017 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 X 91738113 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91738135 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91738228 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91738270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91738391 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91742000 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91742759 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 91743586 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 91743614 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 91743647 A G N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 X 91744202 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 X 91745352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91745399 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 X 91745406 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 X 91745849 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 X 91747020 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 X 91747934 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 91748148 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91748357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91749092 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91749102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91749220 G T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 X 91749369 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 X 91749533 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 X 91749541 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 X 91749873 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 X 91749980 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 X 91750258 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91757583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91758938 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91760686 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91762169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91763986 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 91768816 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 91769456 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91769592 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91769682 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91770246 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91773370 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91789443 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 91793352 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 91795154 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 91801952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91801969 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91804189 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91804258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91806215 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91809844 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91811143 A G N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 91811910 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91813405 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91815881 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 91818217 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 91818579 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91819100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91820586 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91826277 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91840316 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 91844780 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91845966 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91849404 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91852243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91853688 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91854427 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91858614 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91861075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91861577 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91861751 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 91862317 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91863479 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91863621 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91863989 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 91864244 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 91865582 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 91865784 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 91867722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91867907 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91868001 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91868666 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91868857 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91870715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91872058 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 91873288 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 91875440 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91880165 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 91882184 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91883122 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91883529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91886464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91886685 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91886776 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91887649 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91888430 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91889169 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91889551 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 91890666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91891621 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 91894565 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 91897035 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91900095 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 91906602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91910015 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91913264 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 91915986 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 91916750 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91916796 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91917815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91917930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91917950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91920745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91972948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91976498 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 91978373 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 91981646 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 X 91982204 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91982344 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 91989717 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91989954 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 91993566 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 91999410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92001440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92002495 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92002678 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92003207 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 92003926 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92007696 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 92010416 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92010529 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92019989 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 92019990 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 92020668 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92021582 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92022905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92028940 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92029235 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 92030474 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92038285 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 92038467 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92040209 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92045576 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92046308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92062045 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 92062304 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92062796 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 92065168 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 92069162 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92069181 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92069746 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92070501 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92070625 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92070678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92070770 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92070957 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92070975 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92072210 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92072507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92073157 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 X 92073203 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 92077811 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 92102718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92103954 G C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 X 92104752 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 92107113 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 92107687 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 92108217 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 92109891 A C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 X 92111622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92113777 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92114000 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92177206 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 92179156 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 92186011 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92190626 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 92191671 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 92196407 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92198825 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92217045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92217263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92219773 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 92223903 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 X 92231106 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 92232599 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92241394 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92241601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92241839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92242064 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92243885 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 92244790 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92245427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92245657 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92248723 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 92248724 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 92251723 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 92256363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92261136 A G N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 X 92267201 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 92267460 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 92268598 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92274773 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 92276204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92288034 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 92291255 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92291340 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 92292670 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92295372 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92296516 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92297032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92298249 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 92300783 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 92303858 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 92303951 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 92304647 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92309794 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 X 92312936 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 92315432 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 92317346 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92319013 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92319923 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 92321443 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92322687 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 X 92323371 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 X 92323954 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 92324994 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 X 92325584 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 92325828 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 X 92326706 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 92326744 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 92327433 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92327457 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 92327582 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 92327620 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 92327639 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 92327732 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92327920 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 X 92328124 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 92328151 C T N Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 6 10 2 2 4 X 92328152 A G N Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 6 10 2 2 4 X 92328204 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 92328400 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92328426 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 X 92332168 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92332525 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 92333866 T A N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 X 92337319 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 92338047 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92338459 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 92341014 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 92341197 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 92342693 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 92344088 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 92347075 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92347980 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92349016 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92349201 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92349932 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92353024 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92355855 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92356985 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92360564 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92362717 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92363510 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92363931 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92363957 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 92363974 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92364038 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92364115 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92364145 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92364185 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92364236 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92364412 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92364448 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92364583 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 92364606 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92364622 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92364773 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 92364846 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 92364950 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 92364972 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 92365229 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 92365237 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 92365701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92366079 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 92366122 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 92367738 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92367954 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92368478 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 92368891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92369608 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92372095 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 92372236 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 92373918 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 92376494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92378040 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 92378107 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92382719 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92383579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92385279 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92385760 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92385779 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92389861 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 92389878 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 92390541 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92393129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92393491 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92394221 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92394856 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92401668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92403378 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92404310 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92404804 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 92406785 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92407226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92411740 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 X 92412665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92413181 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92413378 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 92414217 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 92414432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92414457 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92414466 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 92416029 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 92416932 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 92417413 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92418917 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92419018 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92419023 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92419179 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92419806 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92420490 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 92420644 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 92422709 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92422934 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92426070 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92427235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92428148 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92429353 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92430637 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92430708 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92436736 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 92438019 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 92438155 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 92438355 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92438793 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92439933 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92440375 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92441464 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 92452785 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92456010 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 92458178 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92469563 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 X 92470433 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 92478688 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92480326 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92480386 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 92494087 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92494582 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 92496940 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 92499653 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 92499654 C G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 92511284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92513376 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92513630 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92516668 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92516783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92520014 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92521061 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92521461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92522844 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 92523389 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92523465 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 92543209 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92543211 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92543938 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 92544992 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92551299 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92551917 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 92552255 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 92552443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92553283 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 92553284 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 92553326 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 92553946 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 92554062 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92554306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92554370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92555284 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 92556011 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92558620 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 92578358 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92578809 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 92586451 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92592593 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 92606989 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92640736 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92655456 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 92657682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92658268 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 92663965 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92668466 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92670804 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92696891 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 92700251 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92707761 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 92719975 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92720133 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92721362 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 92725990 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92727456 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92739920 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92743127 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92743490 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92746897 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92749117 C A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 92751752 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 92757022 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92760808 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92780446 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92787012 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92787462 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 92787683 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 92788054 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92789744 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92790656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92791055 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92791162 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 92791651 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92791653 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92792107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92794259 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 92794405 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 92796676 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92797355 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 92797397 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92797617 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92797963 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92798171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92798206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92798208 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92798272 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92798678 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92798694 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 92798729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92798749 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92798992 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92799245 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92799252 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92799253 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92799516 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92799630 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92799689 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 92799755 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 92799868 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92800001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92800142 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92800211 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92800827 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92800835 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92800861 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92801053 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92801400 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 92801718 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 92801922 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 92802518 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92803707 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92806718 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92808039 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92809604 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 92810548 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92810635 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 92812815 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92814309 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92815560 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92816407 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92817244 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92817609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92817649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92817895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92819613 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 92819630 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 92823504 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 92823721 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 92823980 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 92824961 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 92824974 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 X 92826394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92829146 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 92829147 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 92829616 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92837203 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 92839799 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92843426 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92847786 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92848021 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92848450 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92848507 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92848930 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92849545 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 92852066 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 92854695 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 92854831 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92855547 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92856744 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 92860051 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92860142 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92861449 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92863158 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92863728 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92863820 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 92865813 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92866816 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 92867376 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92867841 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92868336 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 92869389 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92869761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92869872 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92870129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92871577 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92872866 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92873076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92874871 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 92905864 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 92907386 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92912536 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 92915626 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 92921360 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 92921575 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 92925915 A T Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 92928885 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 X 92930760 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92932142 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92933806 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 92935230 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 92938910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92947873 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92947931 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92955817 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92959421 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92960772 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92967273 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92967486 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92967888 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92974369 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92981087 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92982202 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92982767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92984576 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92984870 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92984888 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 92986892 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 92987602 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92987623 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92989586 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92990528 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92990922 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 X 92991900 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 92992646 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92992986 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92996341 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 92996524 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92997210 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 92997219 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 92998784 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 92999030 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 92999998 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93001999 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93002085 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93003720 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 93006268 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93006495 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93006496 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93009509 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93011169 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93013255 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93013302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93013854 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93014053 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 93014085 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93014478 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 93024602 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93025013 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93025076 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93026394 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93027525 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93027895 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 93028708 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93028897 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93029964 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93030599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93031584 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 93032460 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 93034620 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 93038267 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93038651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93039002 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93039093 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93039129 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93040295 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 93040483 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93040549 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93040961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93041118 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 93041967 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93043512 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93044844 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 93045568 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93045815 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93048188 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93048601 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93048636 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93049318 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93049388 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93051065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93052423 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93056691 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 93057779 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 93058104 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 93061552 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 93064896 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 93074233 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 93076547 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93076803 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93079391 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93082014 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93084718 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 93085507 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 93091884 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 93092576 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 93092850 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 93094917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93094935 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93095110 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93095378 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 X 93097414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93107895 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93108472 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 93108777 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93109222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93109808 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 93110127 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 93110409 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93110835 T G Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 93110897 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93112018 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93112101 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93112257 G A Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 93112975 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 93113523 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 93113525 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 93113537 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 93113747 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93113799 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 X 93113809 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93113842 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93114017 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93114087 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93114117 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93114229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93114383 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93114462 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93114732 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93115117 T C N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 93115458 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93118787 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93130828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93132508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93134171 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93136892 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 X 93140693 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 X 93152429 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93152505 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 93154483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93157925 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93158407 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93158627 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 93158695 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93164000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93174615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93176241 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93176558 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93189571 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93192571 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93198307 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93198380 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93202209 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 93203578 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 93204944 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93207480 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93208443 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93209315 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93209443 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93216475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93218586 G C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 X 93227202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93229993 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 93230720 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93230965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93233008 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 93233992 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93236418 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93240126 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93241479 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 93241768 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 93243369 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93245431 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93245437 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93245667 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93245839 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93245851 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93245852 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93246133 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93249949 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93251476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93254806 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93258979 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 93259263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93259517 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 93260006 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93263651 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93263655 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93271327 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93282367 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93288394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93294094 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 93296780 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93300880 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 93301787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93303901 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93306500 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93308437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93309897 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93312006 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 X 93312106 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 X 93316410 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93316455 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93316456 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93317162 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93318378 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93323263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93328815 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93328985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93331197 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93331929 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 93332939 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93333441 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93333620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93334961 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 93335096 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93335362 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93336552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93340802 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93341633 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93343308 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93344235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93347388 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 93347521 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 93347562 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 93347757 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93350109 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93351569 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93351832 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93354801 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93356624 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93362417 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93366157 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93372658 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93373623 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 93373741 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93373869 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93373961 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 X 93377275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93379252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93383301 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93389176 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 93389915 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 93394432 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93396535 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 93397102 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93400174 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93400175 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93401897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93406250 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93406405 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93406466 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 93409400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93415218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93423468 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 93424355 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93431510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93434937 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93440982 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93442974 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93443685 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93446669 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 93447281 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93447903 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 93447905 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 93450554 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 93453290 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 93454093 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93455846 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 93459512 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 93465014 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93467273 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93476143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93488789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93491521 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93497456 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 93498530 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93502971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93508539 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93513543 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93514567 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93515293 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 93517184 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93519389 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 93523908 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93530143 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 93531241 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93531843 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93532233 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93535639 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93535819 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93537567 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93540942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93542007 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93548681 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 X 93551735 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 93553958 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 93555432 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 93556154 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 93557685 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 93558820 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93559881 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 93561414 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 93561711 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93561911 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 X 93563387 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 93563622 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93564469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93564515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93565765 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93566092 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93566799 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93567565 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93567758 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93568471 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 93568923 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93569882 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 93571015 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93571914 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 93572164 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 93572443 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93572589 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 X 93573052 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 X 93581567 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93582564 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93582592 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 X 93582673 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 93582914 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 93583326 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 X 93583463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93583742 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93584498 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93584674 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93584824 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 93585183 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93586308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93587385 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93588038 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93606943 A G Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 93608794 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93609196 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93611293 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93615025 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93621308 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93629335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93631083 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93638994 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93646263 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 93646264 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 93649168 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93649708 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93651127 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93652906 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93653386 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 93653387 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 93654092 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93656317 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93657309 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93658226 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93661338 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93661537 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93663675 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 X 93663761 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 93664795 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93667561 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 93669834 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93673415 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93675527 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93676087 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 X 93676135 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 93676260 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 93677781 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93681329 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 93681710 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93686841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93688901 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 93691394 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 93696653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93699729 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93702556 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93704175 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93706861 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93707609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93709131 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93709433 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 93709639 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93709678 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93709786 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93709969 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 93710898 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93717020 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93717757 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93717847 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 93717985 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 93719099 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93720541 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93721537 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 93723400 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93724095 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93726393 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93741591 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 93744363 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93745380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93746154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93747584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93747601 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93748325 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93748732 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93749446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93749705 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 93752113 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 93752326 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93753334 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93754073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93756791 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93758859 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93758915 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93759022 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93759581 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93761263 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93761998 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93762379 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93762936 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93763395 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 93765562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93765696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93770291 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93773304 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93773690 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93774634 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 93775008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93776023 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 93777926 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 93778117 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93778246 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93778617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93778841 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93778850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93778892 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93779026 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 93779104 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93779213 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93779631 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93779655 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93779825 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93779974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93780124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93780872 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 93780905 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 93780944 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 93781309 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93781360 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93781562 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93781689 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93782007 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 93782034 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 93782080 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 93783078 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93783896 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93783935 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93784465 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93784700 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93785520 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93785908 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93786251 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93787966 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93787996 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93788910 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93793319 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93795175 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 93798982 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 93801386 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 93801705 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93803144 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 93803207 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93803248 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93805352 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93805373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93807020 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 93809162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93809568 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93812462 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93814275 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93815394 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93816752 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93818490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93818876 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93820449 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 93827855 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93837127 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93840123 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 93841381 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93841403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93845672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93856492 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93859943 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93861477 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 93863208 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 93865873 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93866220 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 93868839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93871153 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93871869 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93873146 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93873506 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 93884042 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 93885280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93887828 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93890048 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93891375 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 93892051 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93893721 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93895243 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93895804 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 93896532 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93897899 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93900421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93900806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93904539 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93907679 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93909298 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93913420 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93915147 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93917494 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 93920192 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93921037 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93923570 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93925691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93932632 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93942547 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93944163 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93948237 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93965738 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93970563 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93983125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 93992037 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93992568 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93992804 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 93993683 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 93995638 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 94002668 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94004092 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 94004226 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 94013215 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94014667 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 94015009 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94015265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94036901 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94037772 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94038929 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 94039782 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 94040694 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94042121 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 94043840 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 94048085 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 94048236 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94050358 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94051002 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 94051360 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 94051776 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94055640 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94055796 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94056330 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 94066175 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 94070091 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94077532 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 94080367 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 94080439 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 94084092 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94092333 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 94099208 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94100260 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 94103725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94104469 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94106779 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 94106832 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 94107423 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 94109894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94112063 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94121243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94122671 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 94124869 C G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 94125157 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94125189 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94125956 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94127230 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 94135258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94136486 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94136523 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94141762 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 94142826 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94143405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94145515 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 94146456 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94147604 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94147806 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94148322 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94148389 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94148650 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94150538 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 94150637 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 94150687 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 94152095 T A Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 94152100 G T Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 94153516 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 94155797 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 94157398 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94157404 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94157788 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94158902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94159484 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94159662 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94161059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94162794 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94163708 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94164769 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94165325 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 94168642 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 94169154 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 94171734 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 94171855 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 94171861 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 94173671 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 94174503 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94177458 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 94183976 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 94184576 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94186116 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94186852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94190805 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94190946 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 94191193 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94191339 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94192286 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 94193133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94200089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94200513 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94200901 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 94201170 A G Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 94202488 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 94203367 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 94203425 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 94204466 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94207035 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 94207515 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 94208167 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 94209125 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 94210781 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94210782 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94210834 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94211171 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94211748 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94211760 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94213166 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 94213270 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 94214110 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94214236 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 94214490 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 94215627 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94216289 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 94218594 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 94219732 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 94219755 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94224883 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94225639 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94226013 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94231352 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94231445 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94233599 G C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 94234583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94239005 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 94251758 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 94251793 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 94256317 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94258955 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94259575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94259809 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 94259864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94259866 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94259870 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 94260668 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 94262299 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 94262361 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94263848 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 94265190 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 94265850 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94265900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94266216 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94267850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94268818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94269825 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 94270171 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 94270971 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 94271029 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94271198 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 94272298 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 94275669 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 94275775 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94279180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94282874 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94283512 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 94283577 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 94285538 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94285850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94293131 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 94297147 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 94298650 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94304901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94305127 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 94305174 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94310343 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94312978 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 94324049 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 94325423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94327973 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 94328863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94330570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94336625 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94342342 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 94352509 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94362868 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94391694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94396630 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 94424198 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 94425339 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 94429722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94432868 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94434400 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94441174 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 94449453 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 94459076 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94465946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94466009 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94482071 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94486103 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 94525769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94525866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94526053 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 X 94531604 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 94532416 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 94532774 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94533772 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94536219 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94540554 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94540586 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 94541529 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94542089 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 94542310 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 94542634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94543013 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 94545263 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94545415 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94545656 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 94546551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94546822 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94548108 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 94549910 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 94550586 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 94551505 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 94551938 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 94552348 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 94552574 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94553645 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 94553725 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94564594 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94565001 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94567076 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94568082 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 94575218 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 94582331 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 94589520 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 94597089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94597094 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94613013 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 94613256 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 94619580 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94631370 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 94636442 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 94649477 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94652811 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94679053 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94707037 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94711052 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94725627 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94730852 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 94731496 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 94733225 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 94736703 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94739731 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94743582 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94745295 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94745925 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 94750284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94753477 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94759563 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94763700 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94765094 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 94786987 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94793466 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 94809846 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 94815198 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 94821100 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94822506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94825538 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 94826358 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94829994 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94838309 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 94849836 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94852175 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94852752 T A N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 94862112 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 94865562 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94868418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94872386 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 94874653 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94878849 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 94879176 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 94880363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94881311 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94882507 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 94882584 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 94885488 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 94886218 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 94889323 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94897761 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94913488 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94917101 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 94917104 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94917106 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 94917782 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94922655 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 94934660 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94936291 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94943718 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 94944298 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 94956720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 94973146 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94977964 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94978680 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94981646 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94985980 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 94987312 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 94991757 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 94995093 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95007685 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95017326 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 95035726 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 95036312 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95036315 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95036321 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95053976 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95058141 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95060163 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95063150 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95066322 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 95071370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95074742 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95078384 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 95084676 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95114048 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95115154 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 95119353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95149476 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95181876 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95189611 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95192532 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95193058 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95216112 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 95228642 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95269782 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 95292625 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 95293874 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95318568 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 95323544 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 95325962 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95337602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95339033 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95344047 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 95344539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95344914 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 95359840 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 95375857 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95376910 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 95383160 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95383252 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 95386628 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95386836 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95389420 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95394108 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95395080 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95395663 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95395696 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95395762 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95395790 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95395984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95397602 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 95397798 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95397990 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95400283 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95400520 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 95424976 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 95434567 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 95442530 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 95449584 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95450432 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95455702 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95458956 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95460796 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95468455 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95471964 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 95474983 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95480233 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 95482098 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95487735 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 95488425 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 95490688 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95491016 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95492925 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95495312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95495794 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95497657 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95501019 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95503510 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95503817 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95506476 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95509458 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95510667 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95511024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95520627 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95523065 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 95525928 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95526527 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95527855 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 95528321 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95528814 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95529826 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 95530327 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95532171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95532993 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 95533858 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 95536235 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95538683 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95542476 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95542858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95544747 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95547018 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95548402 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95548905 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95549349 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95549608 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95550273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95551551 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 95553511 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95554483 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95557453 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 95557880 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 95561941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95562180 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 95562375 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95562934 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95564646 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95564754 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 95566336 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95566380 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95566942 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95569347 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 95570102 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 95573831 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 95573836 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 95574379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95574570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95575018 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95575631 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95576723 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95577139 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95577799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95578423 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95581586 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95583143 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95586616 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95590697 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95590746 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95594109 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95598236 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 95599556 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 95600925 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95601742 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 95602176 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 95602590 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95603690 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95604890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95605062 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95606431 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 95608372 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95609853 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95612185 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95612296 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95613058 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95613757 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 95615892 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95616889 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 95619282 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95619780 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 95626508 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 95627840 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95629473 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 95630456 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 95632523 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 95632631 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 95633020 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95633730 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95634243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95634466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95634610 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95639557 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 95640932 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 95641453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95645073 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95645994 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95649424 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 95651348 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95652863 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95653396 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95653802 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95659166 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95666215 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95666326 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95668218 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95669831 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95670408 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 95670710 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 95670920 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 95671863 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 95674151 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95679998 T G Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 95680946 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95683187 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95684351 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95686796 A T N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 X 95686990 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95687681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95688622 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95691504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95698879 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 95700649 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 95701079 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95706183 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 95708267 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 95710869 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95711025 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95712451 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95714722 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 95716547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95716995 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95717672 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 95719327 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95719853 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95721452 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95721911 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95722780 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 95724728 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95729748 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95729772 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95730100 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 95730532 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95731356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95735323 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 95735899 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 95736458 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95736754 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95737370 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95737615 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95739051 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95739992 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95740485 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 95742063 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95742093 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95748015 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95751869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95751922 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95754990 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95757017 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 95761703 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95762044 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 95762071 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95762526 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95767307 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95769993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95771153 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 95775771 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95775859 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95778727 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 95820689 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 95839939 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95851409 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 95861243 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95883110 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95893757 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 X 95896045 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 X 95901010 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95903540 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95903783 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95904944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95905453 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95906372 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95906526 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95907061 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95909888 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95912777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95914722 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95916360 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95921196 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95921452 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 95921834 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 95923125 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 95927056 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95928411 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 95930161 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 95933010 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95952033 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95952759 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 95955942 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95962593 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 X 95964426 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95964833 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 95965097 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 95965286 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95965296 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95967954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95968870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95969101 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95969211 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95970005 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 X 95970027 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 X 95970116 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95970279 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 X 95970518 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 X 95971496 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95971631 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 X 95971882 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95971985 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 X 95972060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95972173 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95972345 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 X 95972636 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95972879 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 X 95973248 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 95973735 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95974078 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 X 95974231 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 X 95974264 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 X 95974481 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95974522 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95974730 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 95974781 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 95974901 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 X 95975038 A C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 X 95975047 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 X 95975110 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 X 95975142 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 X 95975316 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 95975361 C G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 X 95975542 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 4 2 1 2 0 X 95975689 T A N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 X 95975712 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 X 95975716 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 X 95975856 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 X 95976052 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 X 95976092 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95976142 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95976174 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95976232 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95976392 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95978709 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 95980386 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95980597 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 95981132 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95981636 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 95982044 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95982077 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 95983361 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 X 95984581 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95985258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95986068 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 95995881 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 95996728 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 95997016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 95997558 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 96001042 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96001813 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 96002002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96006833 T G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 96007304 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 96009537 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 96012005 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 96013247 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 X 96018676 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 96018739 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96018899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96018952 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 96022978 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96024613 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 X 96031468 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96031572 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96032244 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 96032829 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96033082 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 96034432 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96034473 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96037001 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 96041945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96046242 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96046275 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 96049549 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96050635 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 96056404 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 96059044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96061212 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96063006 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96063557 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96064885 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 96065516 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 96067709 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96076320 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 96079400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96081477 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 96081854 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96093685 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96111354 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96111782 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96111993 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96112193 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 96116495 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 96116529 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 96116532 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 96117398 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96117887 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96121002 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 96122461 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 96122820 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 96122868 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96123076 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96125154 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96125440 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96126141 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96127514 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96127689 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96131615 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96133699 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96136548 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 X 96136700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96137175 A T N N 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 X 96137214 G C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 96137894 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96139118 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 96139281 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96141303 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 96142287 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 96146553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96149027 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 96150053 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96150663 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 96150713 T G N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 96150911 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 96151237 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96151399 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96152573 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 96153235 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 96154391 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96154678 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96155498 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96156637 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 X 96156644 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 X 96156690 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 X 96156697 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 X 96156728 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 X 96156889 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 X 96156891 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 X 96156911 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 X 96157042 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 X 96157245 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 X 96157511 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96158056 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 X 96158682 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 X 96158915 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 X 96158937 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 X 96159457 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 X 96159592 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 X 96159634 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 X 96159752 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96161686 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96162973 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 96163156 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96164430 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 96164831 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 X 96165278 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 96165419 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96165937 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 96166057 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 X 96166200 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 96166427 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 96167020 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 96169019 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96169972 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 96170046 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 96170097 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 96170122 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 96170595 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 96170616 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 96173732 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 96174043 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 96174333 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96174363 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96174878 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 96175050 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 96175151 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96175384 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 96176442 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96176633 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96176834 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 X 96176869 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 96177296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96178100 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 96178331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96178527 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96180396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96180762 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96183837 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96186989 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96189128 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 96189321 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96192576 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96194289 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96195134 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96205281 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96211687 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96215561 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96218014 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 96219178 C A N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 96219680 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96221428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96225365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96226345 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 96226585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96226798 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96227082 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 X 96227529 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 X 96227530 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 X 96227541 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96227599 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96227893 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96227896 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96228025 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96228036 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96228047 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 X 96229131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96229834 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 96229998 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 96232544 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 96232704 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96237133 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96239025 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96239292 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 X 96239561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96240245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96240295 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96241816 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 96241849 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96242072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96243475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96243754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96243784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96243848 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96243965 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 X 96244196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96245801 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 X 96245997 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96247108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96250237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96252009 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 X 96252228 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 96252274 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 96258019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96258496 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96259400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96261235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96262097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96262754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96264604 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96268564 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96269790 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96269848 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96274989 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 X 96281853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96283374 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 96284369 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 X 96284376 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 X 96284687 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 X 96287618 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 96288598 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96290234 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 X 96290815 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96292140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96292696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96295700 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96297422 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96300565 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96301108 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 96302180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96304840 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 96305630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96308155 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96308698 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 96309336 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96310634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96311291 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96314077 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96314688 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 96314797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96316521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96316892 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 X 96317192 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 96317214 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 96317314 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96317479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96319668 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 96322402 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96322869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96325658 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96326770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96329577 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96333443 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96333830 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 96335922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96336191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96337274 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96338143 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96338435 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 96338734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96339885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96343789 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 96346398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96348705 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 96349632 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96350000 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96350508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96351900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96352190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96352277 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 96352648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96353066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96354973 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96355044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96355568 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96356356 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96358109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96359740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96360042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96360730 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 96361995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96364303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96365769 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96366411 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96366633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96366890 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 X 96367541 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 96369303 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96370332 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 96373286 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96373613 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96377161 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96378123 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96378519 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 X 96379595 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96380001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96380405 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96381599 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96384399 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 96384907 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 X 96386701 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96387437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96387661 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 96388595 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96388689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96391675 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96395117 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96395487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96396435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96396560 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96397273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96401643 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96402167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96402216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96402862 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96403988 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 96404342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96405615 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 96407136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96407924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96408150 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96408192 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96408231 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96408256 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96408452 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96408784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96409788 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96409946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96410113 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 96410133 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 96410637 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96411740 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 96411861 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 96413346 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96413724 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96417625 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96418107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96423224 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96423702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96424592 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96430419 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96431213 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 96431428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96433380 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96435266 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 96435267 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 96435547 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96438363 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96438494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96438563 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 X 96440722 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96441196 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96441612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96443278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96443412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96443795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96446923 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96457048 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 96464354 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96465447 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 96466510 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 X 96466543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96486108 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96494993 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96509906 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96511829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96525300 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96525648 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96528294 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 96528297 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 96529779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96531146 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96532913 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 96534741 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 96538732 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 96538956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96541105 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96542177 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 96542790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96545998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96548058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96550631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96551365 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96554037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96555364 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96555535 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96556360 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 96557316 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96557811 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 96558132 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96558453 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96558835 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96559023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96559074 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96559080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96560038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96563449 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96563788 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96568343 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96570971 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 X 96571659 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 96575706 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 96576358 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96577052 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96577178 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96578369 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96578485 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96580268 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96580329 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 96581679 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 X 96581734 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96582782 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 X 96584597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96585026 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 96585305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96589685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96590250 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96590888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96591651 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96591671 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96593063 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 96594891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96596819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96597589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96598413 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96598665 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96598748 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96599621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96599878 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96600456 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96602988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96604284 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96605208 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96606025 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96607815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96608403 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96615210 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96617824 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96620884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96622572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96626381 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96627120 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96631888 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96641607 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96641749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96642000 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96642552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96643240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96644104 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96644911 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96645821 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96646023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96647148 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96647311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96647928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96651203 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96651400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96652822 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96655928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96658328 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96665750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96670378 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 96678525 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 96679487 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96679946 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96680808 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96681850 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96697751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96699702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96705542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96706333 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96707288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96707364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96707683 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96709720 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96709823 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96710511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96710543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96712062 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96712890 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96713152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96717052 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96720696 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 96731687 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.222222222222222 0.0555555555555556 0.722222222222222 9 27 4 1 13 X 96740803 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 96745914 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96749511 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 96755358 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96762582 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96763111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96770593 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96779649 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 X 96781907 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96785227 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 X 96785258 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 96785262 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 96786441 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 96790531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96799145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96832827 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96834178 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96839806 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 96844849 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 96923130 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 96930716 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96932698 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 96935875 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 96936413 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96938001 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96940025 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 96942874 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96944760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96944968 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 96946756 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96946774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96946797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96947129 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96947494 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96948851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96949135 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96950559 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 96952201 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96953236 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96957320 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 X 96963367 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 96963668 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96964865 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96968858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96974693 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96974808 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96975784 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96980389 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96981390 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96984331 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96987444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 96987488 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 96990881 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 X 96992175 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97001105 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97001670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97002424 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97002891 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97004471 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97007432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97012458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97013966 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 97019030 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 97021419 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97021740 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97022646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97024028 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97031184 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97032305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97032875 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97033034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97046359 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97046418 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 97046578 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97047299 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97047647 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97049549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97049876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97051419 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97052993 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97058927 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97059541 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97060767 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97066923 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97068821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97069844 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97072327 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97073816 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97073947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97075959 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97079040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97079250 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97079295 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97080175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97081072 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97083437 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97084366 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97084459 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97087768 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97087773 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97088420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97091954 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 97093230 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 97094040 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97094710 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97095282 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97095765 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97096195 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97096568 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97104291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97105070 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 97105169 T C N Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0.25 0 0.75 2 6 1 0 3 X 97106117 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 97106574 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97108176 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 97109138 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97109564 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97110444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97111705 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97113484 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97113754 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97113996 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97114649 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 97115030 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 97115386 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 97115399 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97115566 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97115569 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97115784 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 97115850 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 97115963 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97116049 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97116105 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97116106 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97116144 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97116214 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97116334 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97116409 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97116426 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97116445 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97116585 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97116641 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 97116692 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 97116736 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 97116906 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 97117178 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97117181 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97117227 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97117235 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97117248 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97117349 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97117378 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 97117418 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97117490 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 97117507 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97118046 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97118518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97118560 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97118789 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97119254 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 97121352 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 97124551 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97124848 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97129585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97140985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97146217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97146895 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97146906 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 X 97149217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97150525 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97152659 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97152835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97152932 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97155041 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97161068 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97162658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97163415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97164718 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97165575 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97166619 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97167798 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97169101 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97169243 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97172031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97173374 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97174500 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97175549 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97175901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97176023 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97176024 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97183776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97187310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97188649 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 97195275 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97195769 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 97196150 G C Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 97196176 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 97206136 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97212251 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97214375 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97214465 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97218220 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97221870 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97222339 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 97222877 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97223640 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 97223942 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97224744 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 97232600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97235043 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97235313 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 97236697 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97237690 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97243560 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97243608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97245001 A T N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 97247573 T A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 97249528 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97251552 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 97252667 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97254473 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97255438 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97258128 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97259205 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 97259282 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 97263042 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97265263 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 97265294 T A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 X 97265373 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97266996 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 97267982 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97270367 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97270977 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97275833 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97276462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97281203 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97282020 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 97282949 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 97289563 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 97290562 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 97291739 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97291950 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97292127 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97292392 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97294986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97299093 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 97300938 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97301070 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97301232 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97302318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97302885 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97303164 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97313435 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 97315963 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 97321740 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97325966 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 97329063 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97329957 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 97332797 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 97336233 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97337984 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97340099 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97346289 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 97347233 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 97349147 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 97353865 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97355572 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97357822 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97358309 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97360523 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 97361637 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97361923 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 97362758 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97362850 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97365515 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 97377557 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 97379508 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 97380284 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97381413 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 97383217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97385575 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97386648 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97388496 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97389772 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 97390996 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97392429 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 97395855 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97396384 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97398814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97399930 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97401026 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97403996 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97405573 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 97408207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97413671 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97416080 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97417900 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97420885 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 97422300 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 97425485 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97427098 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 97427573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97428097 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97428481 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97429981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97431314 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97433188 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97439584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97442650 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97442792 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97443117 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 97444760 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97445316 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97445743 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 97447586 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97452330 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 97452433 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 97453857 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 97460210 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 X 97460268 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 97460565 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97463598 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 97464249 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 97465275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97473442 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97474818 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97475870 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 97475954 C G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 97477877 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 97480328 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97488377 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97488882 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97489837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97497975 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97498627 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97501278 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 97505992 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97507771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97510192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97512078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97513114 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 97513789 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97514449 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97515593 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97516982 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 97517407 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 97523211 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97523378 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 97524888 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97525402 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97526792 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 97529202 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97530182 T C N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 X 97531269 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 97532299 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97533233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97537936 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97537937 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97540427 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 97541851 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 97544458 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 97544631 T C N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 X 97545188 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 97547430 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97547969 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97547977 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97550549 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97552052 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97552289 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 97553701 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 97554070 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97555543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97556732 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 97573220 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97575326 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97575870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97576299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97577406 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97577407 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97582763 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97583074 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97583639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97585881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97587406 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97588291 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97588360 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 97588544 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 97588731 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97591267 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97591480 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97593128 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97594805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97596147 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97600221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97601673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97601702 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97601703 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97602739 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97602799 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97603135 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97603169 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97604046 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97605085 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97605601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97605711 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97605783 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97606097 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97606114 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97606135 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97606345 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97606638 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97606710 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97607182 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97607391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97607435 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97607770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97608726 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97609801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97609903 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97610648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97611881 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97612535 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97613553 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97614813 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97614860 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97615331 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97619581 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97623593 T A N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 15 15 3 9 3 X 97624711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97625624 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 97627782 A G Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 X 97629577 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97630356 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97631685 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97633547 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 97635031 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97637675 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97639148 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97641541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97642610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97643200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97645463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97647336 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97648013 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 97648156 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97655183 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97658010 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97659201 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 97660321 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 97660504 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97661982 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97662293 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97663193 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97664782 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97665331 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97667110 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97667906 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97668667 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 X 97668745 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 X 97668776 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 X 97669293 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97670514 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97671152 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97682954 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97685055 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97685453 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 97689246 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97691430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97691507 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97691703 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 X 97691758 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 X 97691816 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97696498 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 97697210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97697796 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97699516 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97702073 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 97702119 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 97703726 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97705435 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97705449 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97705467 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97705610 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97705721 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97706652 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97706731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97708014 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97708938 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 97709296 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97712836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97719695 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97722458 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97724579 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97731220 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97731464 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97732359 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 X 97732903 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97733601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97738791 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97742554 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 97751718 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97752910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97757508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97759260 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97778676 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 97779194 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 97779289 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97782111 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97783240 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 97784705 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97790812 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97795961 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97797811 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97797933 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 97798147 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97798240 A T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 97798243 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 97798251 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 97799862 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 97800151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97800901 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97801164 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97801458 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97802039 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97802175 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97802306 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 X 97802549 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97803265 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 97804453 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 97804910 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97805408 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97805568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97806042 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 97806286 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97806673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97806925 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97807082 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97807576 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97809071 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 X 97809434 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97816016 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97818058 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97818088 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97819120 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97819312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97819318 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97819576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97819770 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97820422 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97820441 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97820580 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 X 97821095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97822538 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97828845 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 97839971 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97858820 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 97864660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97875171 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97876578 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 97882989 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97883771 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97884714 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97885530 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97886090 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97887228 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97887619 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97888053 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97889425 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97889724 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 97890515 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97891090 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97899699 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97900283 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97909851 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97910134 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97913140 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.5 0.1875 0.3125 19 13 8 3 5 X 97913768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97913888 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97914471 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97915162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97915326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97916700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97917346 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 97918054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97920485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97921635 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97922028 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97922505 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97923799 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97924410 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97925626 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97925993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97930416 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97931500 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97932417 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97937426 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 97941175 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97949925 T A N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 97960858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97961994 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97965465 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97965468 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97966734 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97968096 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 97968345 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97968357 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97968888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97969170 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97972511 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97974692 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97975156 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97975961 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97976225 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97976519 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97981483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97981837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97983842 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97984300 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97985589 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 X 97986138 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97988801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97990116 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 97990280 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97996347 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 97997251 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97997491 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 97998483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 97998782 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98016351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98034983 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98037143 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 98039101 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98041106 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98043679 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 98054042 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 X 98061402 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 98062761 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98063381 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98065382 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 98066350 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98066442 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 X 98066554 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 X 98067030 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 X 98068103 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 X 98068396 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 X 98068979 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 X 98069076 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98069237 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 X 98069259 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 X 98069354 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 X 98070002 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 X 98073871 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 X 98075568 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98078516 C T N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 X 98078997 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98079191 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98081620 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 98082772 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98086559 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98088330 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 X 98088578 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 X 98088817 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98089432 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98091710 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98091720 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98091735 G T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 X 98091749 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 98092316 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 X 98092387 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 X 98092477 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 X 98092582 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 X 98092956 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 X 98093179 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 X 98093480 T A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 X 98093939 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 98093953 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 98094034 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 98094669 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.8 0.0666666666666667 0.133333333333333 25 5 12 1 2 X 98095501 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 98095632 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 X 98095634 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 X 98095773 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 X 98095840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98096522 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 X 98096586 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 X 98101768 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 98102419 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98105691 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98106879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98122505 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 98122966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98127631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98128662 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 98130040 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 98133362 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 98138145 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 98138822 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98139434 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98140721 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98141257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98151240 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 98154506 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 98155115 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 98155780 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 98158903 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98159070 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98159120 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98159357 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98159658 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 X 98159961 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 98160097 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98160351 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98160376 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98160471 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98160475 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98160495 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98160686 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 X 98161544 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 98161715 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 98161774 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 98161877 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 98162009 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 98162157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98162237 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98162320 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98162636 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98162643 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98162967 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98163205 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98163233 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 98163808 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98164045 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98164132 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98164150 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98164169 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98164212 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98164238 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98164239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98164293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98164368 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98164400 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98164529 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98164693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98164701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98164730 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98164830 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 98164950 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98164979 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98165332 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98165369 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98166467 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98166543 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98166794 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98166795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98166895 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98166966 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98166986 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98167157 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98167251 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98167309 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98167404 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 98167469 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 98167495 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98167763 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98168000 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 98168018 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 98168127 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 98168415 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 98168469 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98168493 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98168848 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98169012 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98169089 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 98169090 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 98169239 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98169745 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 98169778 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 98170241 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98170252 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98170716 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98170941 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 98171207 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98171379 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 98171547 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98171602 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98171655 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98171726 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98172169 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98173122 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98173149 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 98173211 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 98173271 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98173371 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98173626 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98173848 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98173851 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98173854 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98173891 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 98174266 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 98174447 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 98174479 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98174489 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 98174657 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 98175043 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 98175243 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98175734 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 98180254 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98180692 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 98181974 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 98181979 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 98183228 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 98183658 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98184093 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98184175 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98187419 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98187514 T A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 98187939 T C N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 98188919 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 98189247 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98190213 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 98190351 G C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 98190885 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 98190927 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 98191565 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 98191701 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 X 98191898 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98191980 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 98192085 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 98192236 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 X 98192394 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 X 98192456 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98192619 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98192643 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 X 98192942 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 98193472 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 98193474 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 98193477 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 98193482 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 98193486 A T Y N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 98193676 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98193738 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 98193752 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 98194015 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 98194235 T C Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 98194409 C G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 98194656 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 98194720 A G N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 X 98194737 T G N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 X 98194789 C G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 X 98195016 G A Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 98195064 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 X 98195272 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 98195572 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 X 98195800 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98195886 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 98196044 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98196077 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98196284 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 98196333 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98196546 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 X 98196569 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98196975 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98197009 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 98197381 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 98197491 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 98197803 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 X 98197877 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 98197888 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 98197929 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98198009 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 X 98198185 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98198207 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98198259 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 X 98201523 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 98201525 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 98201657 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 X 98201662 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 X 98201850 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98201897 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 98201912 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 98201997 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98202018 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98202046 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98202066 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98202170 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98202223 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98202309 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98202320 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98202350 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98202497 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 98202508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98202551 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98202996 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 X 98203150 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 98203262 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 98203494 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 98203813 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98204629 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98204929 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98204933 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98205176 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 98205480 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 98205628 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98205744 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 98205749 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 98206065 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 98206154 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98206232 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 98206289 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 98206324 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 98206785 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98207467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98207615 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98207658 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98207887 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98208813 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98208854 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98209121 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 98209360 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 X 98209395 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 98210607 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98210784 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 X 98210930 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 98211038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98211152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98211488 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 98212038 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98212917 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98212948 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98214015 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 98214016 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 98219661 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 98220486 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98220761 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98221226 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98222900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98222917 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98225817 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 X 98226750 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98228279 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 98230764 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98230915 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98231148 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98231248 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 98235937 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 98235993 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 98236010 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 98236670 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98236922 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98237044 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 X 98237514 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98238274 A G N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0.2 0 0.8 2 8 1 0 4 X 98238477 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 98238495 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 X 98238987 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98239050 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98239128 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98239419 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 98239594 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98239726 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 98239842 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98240386 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 98240611 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 98240640 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98241015 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98241053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98242006 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 98243682 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 98247484 A G Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 98249251 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 98253662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98254587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98255671 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98258083 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98261898 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98264077 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98277817 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98284969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98296854 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98297301 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 X 98303580 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98305702 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98306017 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 98317892 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98347719 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 98354584 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98357669 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98358267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98359102 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98359103 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98363192 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 98367608 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98367949 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98369591 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98370906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98381056 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98381288 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98381364 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 98386357 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98387671 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 98395999 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98396870 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98397299 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98397799 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 98397927 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 98399434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98400119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98402064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98402869 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98404353 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98405006 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98413319 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 98414133 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98414309 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98418215 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98422766 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98423141 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 98424420 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 98424570 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 98426754 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 98429731 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98429777 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 98430711 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98430885 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98434564 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 98436759 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98439272 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98439284 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98439288 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98440082 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98440434 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98440452 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 98445937 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 98470029 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98486000 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 X 98497187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98566487 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98576809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98598566 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98648353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98650224 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98651277 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98652966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98652998 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 98653074 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98653808 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98653810 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98653819 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98653891 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98653939 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98653966 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98654027 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98654087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98654382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98654772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98654908 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98655156 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98655187 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98655265 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98656524 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98658720 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98660725 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 98665875 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98668585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98668725 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 98668729 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98674890 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98676899 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 98677195 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98677573 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98678370 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98680718 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98680922 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98681294 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98681649 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98683171 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 98688385 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 98690112 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98695482 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98696937 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98701514 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 98703693 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 98704085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98706547 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98706552 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98710634 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98712712 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98715328 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98717446 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98717675 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98723365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98724301 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98725635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98726500 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98728468 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98732861 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98733662 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 X 98733668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98735784 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98735793 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 98736420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98736508 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98736963 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98738687 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98740014 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 98741716 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98743405 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 98743921 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 98747388 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98747440 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98748428 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98750175 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 X 98754825 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98755313 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98756559 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98756893 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 X 98759363 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 X 98760920 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 98767028 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98768092 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98769036 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 98769446 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98769660 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98771475 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98772335 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98772352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98772619 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98777141 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 98777632 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98778260 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98781662 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98784035 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98788170 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98788204 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98807577 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98812077 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98822601 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 98844740 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 98870753 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98921295 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98945260 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98953063 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98954367 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 98955854 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 98956109 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99023404 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99031282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99042185 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99049234 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99051398 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 99052803 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99053030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99053068 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99054181 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99054395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99055639 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99056206 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 99056663 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 99061846 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99062393 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 99062401 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99064033 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99064128 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 99067521 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 99068941 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 99068977 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 99069483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99070580 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99072129 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99078928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99079358 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99080521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99084760 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 99085874 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99086279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99091265 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 99094546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99094762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99095079 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 99095970 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99101118 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99101371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99103412 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99104592 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 99111918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99117760 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99120157 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 99120816 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 99122785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99123308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99123423 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99125973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99128267 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99128545 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99129396 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99130161 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99131357 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99135772 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99136508 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99138385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99139646 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99142711 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 99142898 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99144047 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99146296 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 99150362 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99152000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99156186 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 99156502 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99156872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99159665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99161371 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99161603 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99162027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99169056 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99169776 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99171688 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 99173236 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99173621 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99176506 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99178258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99178442 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 99181240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99182455 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99183388 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99183435 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99184035 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 99187693 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99192175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99192909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99193467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99196529 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99199166 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99201978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99207071 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99208333 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 99208357 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99209121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99210030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99213606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99213889 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99216129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99218142 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 99218161 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 99220961 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99223224 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99224467 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99225342 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99230242 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99231687 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99232129 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99244514 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99246453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99246774 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99246853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99246886 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99248770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99252023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99254624 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 99255296 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 99255492 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99256903 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99257956 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99257969 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99258273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99259033 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99260312 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99260926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99261066 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99261155 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99261156 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99261252 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99261255 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99261281 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99263082 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99263375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99264360 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99264789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99267028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99267199 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99267204 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99267294 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 99267394 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 99267541 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99267661 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99272433 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99273722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99275041 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99275766 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99277683 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99277698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99287035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99288372 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 99292537 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99293046 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 99293170 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 99295695 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 99297688 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 99297870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99297904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99298399 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99300815 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 99300879 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99302519 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99303428 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99310463 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99311658 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 99313496 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99313721 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99313846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99317749 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99317940 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99318192 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99318392 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99320255 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 99320696 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99321688 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99321995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99322510 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99323744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99324413 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99324415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99324811 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99324928 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 99325033 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 99326014 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 99334508 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99335261 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99335355 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99336029 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99336932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99336960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99337958 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99338693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99339715 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 99344794 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99345350 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99346954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99347904 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 99349034 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99351315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99352417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99353867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99354266 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99355025 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 99356056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99356429 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99357699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99358301 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99359724 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 99360176 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 99360553 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99360646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99360836 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99361577 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 99363563 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99363571 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99364948 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99366345 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 99371010 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99371590 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 99371905 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 99373178 A T Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 99373571 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99373760 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99374297 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99376173 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99377112 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 99377553 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 99378527 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 99379337 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99379608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99381874 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 99382500 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99382840 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99383115 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99383880 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99384253 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99384296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99385422 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 99387662 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99388659 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99389514 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 99389867 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 99389980 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99393476 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 99393562 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 99393815 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 99395981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99401123 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 99403889 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99404211 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99404790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99405273 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99405987 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99418846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99419413 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99440022 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99449985 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99454289 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 99469647 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99487060 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99496005 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 99497523 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 99499355 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99499641 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 99499788 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 99501255 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99503700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99504224 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99507511 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99509417 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99510149 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99510150 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99510598 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 99511364 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99511848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99513894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99514260 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99517539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99532591 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99533332 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99542077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99542091 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 99546543 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99549303 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 99549438 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 99560711 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 99561994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99565319 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99568150 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99570993 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 99571001 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 99571261 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 99577253 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99577806 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99581688 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99585007 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 99588978 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99590686 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 99596688 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99598493 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99600416 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 99602555 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99602689 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99606212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99609275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99609865 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 99611310 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99611488 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99611551 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99611669 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99612955 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99613597 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 99615564 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99615880 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99622905 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99622956 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 99623265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99624525 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 99625695 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99627222 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99628076 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 99630473 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 99637611 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 99637829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99638152 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99649594 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 99655415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99682491 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99684341 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99696610 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 99733178 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99737184 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 99740764 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 99764273 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99766154 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 99780857 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 99783592 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99797833 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99798778 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 99811195 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99830402 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 99835809 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 99839685 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99840364 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99842380 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99844496 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 99845428 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99852434 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99853557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99854682 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 99854945 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99861531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99865578 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 99880568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99889192 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99906481 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99910647 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 99912985 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 99919184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99921682 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 99923638 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 99974386 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 99974390 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100008549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100010188 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 100020270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100020571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100068957 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 100075661 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 100075782 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 100079971 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 100083893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100093349 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100094717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100096000 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 100103545 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 100119750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100137716 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 100140957 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 100141214 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100146383 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100148069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100154073 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100164214 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100164453 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100165148 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 100168479 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100169475 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 100171077 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 100172032 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 100177404 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 100179448 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 100212231 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 100216573 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 100220029 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100227910 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 100233047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100233772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100234092 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 100239817 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 100240465 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 100240670 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 100240790 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 100242555 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 100243695 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100247220 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100249772 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 100254922 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100256602 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 100258919 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 100273385 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100278557 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100279759 A T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 100284460 C T N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 100290907 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 100294615 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 100295293 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100296550 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 100296604 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 100296741 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 100296783 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 100300578 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 100301915 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100305659 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 100305716 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100305819 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100311561 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100313475 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 100313948 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 100315557 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100322444 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 100322487 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100323056 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 100323223 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 100332633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100332634 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100333328 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 100333434 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 100333648 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100336648 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100337310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100337477 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100342397 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 100343366 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100343948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100345007 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100347220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100349257 T C N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 100352424 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 100361959 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100362405 A C Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 100366580 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 100372438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100377998 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100379210 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 100389093 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100391884 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 100396250 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 100396292 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 100397509 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100400423 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100404077 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 100409084 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100409086 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100418916 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 100421124 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 100426967 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100438730 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100440339 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100448187 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100450510 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100453131 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100456127 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 X 100456157 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 100457342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100460761 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100461845 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100462774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100462797 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100462805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100462973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100466943 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100470401 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 100470402 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 100470522 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100471010 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100471072 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 100471226 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 100471247 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 100471519 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 X 100471528 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 X 100471547 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 100471564 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 100471590 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 X 100471647 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 100471810 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 100472069 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 100472109 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 100472346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100472359 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 100472989 G C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 100473234 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 100473528 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 100473785 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 100473796 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 100473882 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 X 100474359 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 100474865 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 100475035 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 X 100475392 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 X 100475632 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 X 100475743 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 X 100476015 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 X 100476730 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 100477609 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100478593 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 100478610 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 100483682 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100483709 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100483734 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100489129 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 100491451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100496027 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100496823 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100509645 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 100510483 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 100514943 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100522466 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 100524371 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 100527207 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100529803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100530049 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100531150 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100533766 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 100534417 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 100539871 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 100540297 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100543040 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 100544549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100545103 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 100549441 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100554404 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 100557409 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100557500 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100562689 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100567203 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 100567689 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 100569838 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 100570362 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 100573348 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 100580718 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100580751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100588667 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 100589364 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100590741 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100591846 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100592822 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100593160 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100596377 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 100600671 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100600714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100602170 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 100602652 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100602653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100608974 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100610969 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 100619826 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100636386 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100637770 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100639166 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100648884 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100649474 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100653444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100663386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100663387 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100663671 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 100664254 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100669496 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 100669643 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 100670177 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 100680835 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100682005 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100682360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100693257 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100700651 T G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 X 100703611 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100714997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100717163 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100734582 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100734583 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100736156 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100738028 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100738102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100738841 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 100739938 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 100745076 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100745672 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 100747410 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 100751965 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100756603 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 100757790 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100766032 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100772569 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100775447 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100801262 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 100807707 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 100815709 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 100819826 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100822197 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 100823229 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 100875844 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100883863 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 100931615 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 100933338 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100934925 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 100936061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100936398 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100937349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100944735 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 100951470 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100951900 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100954108 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100962299 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 100962611 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 100968459 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100968503 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100968606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100970207 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100970555 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100970563 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 100971030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100971989 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 100972309 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 100972392 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100974010 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 100975443 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 100975738 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 X 100975739 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 100976713 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 100976994 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 100977062 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100979362 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100997634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 100999474 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101004383 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101004526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101009281 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 101012136 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101012171 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 101014357 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101015024 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101016062 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101019309 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101019866 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101020708 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101021856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101022878 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 101023582 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101024276 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101026532 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101027902 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101032058 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 101037574 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101038846 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 101040058 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101046195 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101047182 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 101048553 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 101049539 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101049864 C G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 101051992 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101052666 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101055728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101056301 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101056930 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101060422 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101061278 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 101061502 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101061530 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101061652 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101061732 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101061756 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101062139 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101062252 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101062257 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101062492 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 101062556 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 X 101062743 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101062839 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 101062853 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101063261 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101063466 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101064288 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 101064700 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 101064704 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101064805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101070868 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101071009 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101071233 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101073047 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101084480 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101100098 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101102059 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101103354 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101103849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101106275 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101106828 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101111890 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 101112407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101117630 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 101119723 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101120246 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101123564 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101124585 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 101125033 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101126556 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101126636 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 101128472 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101128831 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101131103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101137388 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 101137393 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 101137854 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 101140969 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101141115 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101141916 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 101143835 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101151353 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101153299 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101158058 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101160460 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101161495 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101162425 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101162496 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101162735 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101163824 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 101165294 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101166618 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101166769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101166832 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101167422 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 101168698 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101168824 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101169907 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101170148 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101170876 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101172205 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101173074 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 101173726 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101174040 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101177695 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 101179313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101181588 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101182092 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101185185 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 101185933 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 101187000 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101188333 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101188422 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101188963 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101189624 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101193364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101193595 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 101195589 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101195867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101198474 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101198770 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101204035 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101204522 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101204523 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101205569 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 101207412 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 101209500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101210069 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101210311 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101210724 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101210908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101211244 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 101211311 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101211482 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101213199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101216242 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101219396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101220488 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101223787 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101224632 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101224700 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101225591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101228189 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 101228781 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101228983 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 101229638 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101232134 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101232135 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101233119 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101233926 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 101234820 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101235673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101236391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101237188 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101237207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101238140 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101240047 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101241274 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101246785 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101248056 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101251802 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101251907 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 101252612 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101253563 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101255107 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 101255468 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 101256270 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101257095 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101257758 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101257802 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101257993 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101257994 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101258986 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101261017 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101262518 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101263150 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101263967 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101266855 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101267788 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101270920 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101273888 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 101278295 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101281549 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101283449 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101284088 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 101286426 T C N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 101289069 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101291317 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101291320 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101297430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101302647 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 101303830 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 101303837 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 101305044 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101306789 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 101307158 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101309679 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101311198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101315079 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 101317958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101321301 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101324340 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 101327307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101327711 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 101328956 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101329458 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101331178 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101332228 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101332966 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 101334638 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101335046 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 101336255 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101338445 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101343721 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101344351 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 101344819 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 101345913 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101347681 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101349472 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 101350329 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101353358 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101353453 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101353557 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101354119 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 101357105 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101357412 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101360026 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101361521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101361635 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101362054 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101370848 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 101370967 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101371091 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101371583 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101374451 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 101375206 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101375219 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101376037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101378195 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101378696 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101378783 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101379295 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101380218 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 101380550 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 101383744 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 101383938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101385677 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101386352 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101386589 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101386677 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101387245 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101387615 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101387931 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 101388855 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 101388936 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 101389337 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 101389859 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101389897 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101391874 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101392777 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101393449 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 101393520 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 101394730 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 101397848 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 101401832 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101403222 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101410478 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101411650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101411913 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101413963 G A N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 X 101414031 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 101420267 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101423248 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 101424214 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 101425012 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101426347 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 101427238 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101428186 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 101428907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101429054 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101429362 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101429757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101430097 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101430349 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101430693 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101431773 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101433745 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 101433816 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 101433828 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 101435490 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 101437041 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 101439609 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101439611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101440788 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101442071 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101442337 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 101442721 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 101442746 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 101442824 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101443229 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 101443339 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 101443497 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 101443502 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 101443723 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 101444255 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101444787 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101445088 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 101445859 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 101445907 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101446119 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 101447271 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101448759 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 101450257 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101450282 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101452038 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101452288 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101453339 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101453366 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101453717 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101453838 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101455722 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101456850 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 101458161 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 101458285 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 101458400 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 101469229 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101469804 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101472826 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101473122 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101473254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101473292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101473606 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101474780 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101474859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101474860 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101474929 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101475611 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 101477917 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 101482677 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101482730 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101483122 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 101486584 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 101486817 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101487754 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 101490473 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101491364 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101493627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101496919 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 101498104 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101498105 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101500123 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 101501598 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 101501625 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 101502129 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 101503702 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101503852 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 101504176 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101504585 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 101505438 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101507849 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101510584 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 101511818 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101515460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101519313 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101519621 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 101520530 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101524114 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101525648 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101527369 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101529274 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 101529281 G T Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 101529296 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 101529304 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101535436 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101536436 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101537790 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101538712 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 101539274 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101552641 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101553061 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 101556102 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101559598 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 101561406 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101571868 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101573273 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101578553 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101578572 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 101578576 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 101578579 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 101584874 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101586035 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101588106 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101588208 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101591982 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101594885 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101596065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101596896 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101597004 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101598750 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101598771 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101600833 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 101605336 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101605598 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101609519 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101612401 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 101613531 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 101615413 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 101615527 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101615646 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 101617675 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101618501 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101619854 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 101621443 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 101623046 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101623679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101625585 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 101626081 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101626635 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101626651 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101627835 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 101630436 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101631401 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101632363 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101636543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101637649 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101637784 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101640821 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 101642938 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101644800 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101651082 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 101652904 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101653441 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101653888 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101659986 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101661935 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101664192 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101664258 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 101664622 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101664893 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101666101 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101666112 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101666881 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101667766 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 101668556 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101670488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101672440 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101674220 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101676090 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101678306 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101680445 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 101680620 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 101685171 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101685491 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101685553 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101685890 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101688989 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101689161 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101690762 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101691814 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101691969 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 101692661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101692710 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101694287 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101696446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101702042 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 101702476 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101702931 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101705281 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 101706187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101706534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101706694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101706971 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101707521 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 101707547 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 101707896 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101709367 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 101709533 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 101711777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101711850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101712570 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101714809 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101714841 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 101717151 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101718561 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101719243 T G Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 101722118 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101725877 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101729341 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101732893 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101733773 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101736886 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 101736998 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 101737290 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101737482 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 101740437 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101743542 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101744817 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 101746525 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 101747207 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101758937 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101759526 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101766365 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101766562 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 101766619 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 101767314 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101767765 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101768063 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101768306 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 101769818 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101770756 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101771067 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101771237 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101771477 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101771483 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101771504 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101771970 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 101772042 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 101772356 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101772796 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101772928 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101773088 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101773459 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 101773667 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 101773926 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 101774361 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101774426 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101774562 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101774590 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101774634 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 101774686 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 101775107 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101775108 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101775993 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 101776011 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 101776035 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 101776266 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 101776281 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 101776640 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101776796 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101776946 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101776965 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101779621 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 101781320 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101782214 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101783670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101788545 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101791354 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101793163 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101794721 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101794845 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 101800827 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101802926 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101805228 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101806826 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101808564 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101809796 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101816541 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101824561 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 101827498 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101828379 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101830183 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 101830734 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101831360 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101832221 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101832548 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101832587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101832652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101832808 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101833958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101841084 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101841147 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101841550 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 101841747 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 101842403 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101843923 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101844594 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 101846136 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101846556 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101848274 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101849051 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 101849272 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 101849437 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101849441 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101850684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101850917 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 101853358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101853554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101855025 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101856165 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101856375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101856899 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101856902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101857196 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101857880 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101858393 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 101859516 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101862980 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 101862989 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 101863160 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101864835 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101865319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101867568 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101868395 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101869677 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101871681 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101871723 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101873229 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101875013 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 101875264 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 101887086 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 101889203 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101889430 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 101889905 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101891695 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101892367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101893767 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101895859 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 101896738 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 101896858 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 101897052 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 101898708 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101899270 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 101902045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101902213 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101902835 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101904158 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 101905806 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 101906028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101908019 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 101909660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101909788 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101910698 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101912800 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101912920 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 101914131 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 101926262 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101926841 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 101927001 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101927410 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 101928578 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101928666 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101929034 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 101930322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101931245 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 101931863 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101932196 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101932685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101934504 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101936137 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101936438 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101937897 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 101938296 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101938656 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101940873 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101941125 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101941142 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101942972 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101944103 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101946783 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101947693 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101948596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101950937 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101951312 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101955669 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101956137 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101956524 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101958902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101962514 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101962652 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101962895 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101965588 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 101966563 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 101968432 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 101970452 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 101970461 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101977580 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 101981282 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 101983211 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 101985362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102009234 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102012028 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102013506 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 102014630 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102016864 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102018523 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 102027593 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 102027598 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 102028718 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102029110 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102030493 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102030494 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102031778 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 102032337 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102033178 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102033308 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102036716 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102042244 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102043144 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102047719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102048972 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102052875 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102053778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102054324 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102055208 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 102055515 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102055704 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102056214 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 102065341 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 102075807 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 102080180 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102085869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102087195 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102088718 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 102089592 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 102093265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102093580 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102095594 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102098943 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 102099654 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102102597 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 102105411 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102112481 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102114261 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102115182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102117987 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 102119381 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102121013 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 102121358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102122001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102124449 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 102126659 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102128628 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102130297 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102131468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102131538 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102131699 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102132396 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102133583 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102134400 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102134447 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102134575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102136223 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102137282 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102137426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102137427 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102137947 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102147836 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102150169 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102151918 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102151925 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102154194 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102154434 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102161672 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 102162612 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102163678 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 102163746 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102164516 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102167381 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102172459 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102173080 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 102173118 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 102173683 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102174848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102175238 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 102176217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102176629 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 102176883 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102177379 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102177864 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102180674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102181077 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102181309 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 X 102181349 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 102184259 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102185091 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102186406 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102187144 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102189609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102190113 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102190175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102190948 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102195170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102195356 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102197126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102197174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102200330 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 102201535 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102202866 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102202947 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102204092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102204113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102205483 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102205847 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102206013 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102206675 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102207850 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102210780 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102211414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102212891 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 102224126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102227710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102227758 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102229717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102230806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102231710 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 102233508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102233873 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 102235104 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102235112 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102236419 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102238005 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102240390 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 102241527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102244434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102244787 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102246409 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102247250 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102248845 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102249142 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102249563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102249565 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102250198 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102252443 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 102252578 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102252918 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102253114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102253971 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102254349 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102254350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102255880 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102255941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102257547 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102257929 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102258498 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102258979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102259105 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102259967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102259988 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102260663 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102261414 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102263369 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102263384 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102263388 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102263670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102264457 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102264566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102265594 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 102266279 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102270845 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 102271708 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102271709 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 102275811 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102275924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102276028 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102276220 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 102276258 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 102276285 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 102276371 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 102276394 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 102276401 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 102276423 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 102276432 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 102276436 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 102276489 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 102276503 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102276555 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102276561 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102276574 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 102276664 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102276790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102276794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102276818 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102276820 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102277039 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102277061 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102277205 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102277239 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102277352 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102277494 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102277800 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 102277833 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102277844 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102278865 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102279215 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102279540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102280392 G T N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 X 102282475 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 102284193 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102284811 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102285064 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102286120 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 102288527 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 102289172 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102296885 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102297249 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102300443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102303767 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102303837 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102304892 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102306376 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102306750 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 102307298 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102307349 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102308025 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 102308549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102308734 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 102309587 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 102309869 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102318903 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102321331 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102323778 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102326802 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102328472 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 102330879 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102334597 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 102344399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102350368 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102351811 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102352318 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 102353904 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 102354801 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102355031 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102355317 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 102356531 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102361252 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 102361648 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102362309 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102362467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102363046 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102363806 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102364392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102365700 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 102366353 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 102366542 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 102367752 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102368522 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102372853 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102376434 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 102380438 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 102380862 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102381606 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102381917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102382096 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102382501 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102382517 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102382967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102383817 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102383947 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 102384012 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 102384330 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102386121 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 102386725 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 102389855 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 102390191 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 102391434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102391968 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 102396143 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102396241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102398349 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102398450 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102399690 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102401219 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 102402111 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 102402443 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102403117 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102403888 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 102404649 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102406299 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102406380 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102407185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102407858 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102409285 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102411088 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102412759 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102413950 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 102414897 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102414898 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102414969 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102415464 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102415750 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102415969 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102416944 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 102417695 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 102418590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102420608 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 102420945 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 102421709 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102421921 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 102425061 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 102427875 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102428346 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102429072 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102429533 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102429882 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 102432087 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 102433747 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 102434432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102434654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102435261 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102435585 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102436470 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102437480 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 102439385 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 102440664 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102441246 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 102442772 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 102442843 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 102443722 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102443801 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 102443946 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102444010 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102451673 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102452567 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 102452683 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102452852 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102456783 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102457755 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 102457923 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102459380 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102466145 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102466413 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 102467411 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102468492 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102471145 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 102474512 A T N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 102479144 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102480195 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102481215 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102484379 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102494717 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102494846 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102496335 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102498541 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 102502514 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 102504385 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 102506599 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102507316 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102507484 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102517019 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102517921 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102521260 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102523332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102525956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102528798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102529585 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102529802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102530508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102531553 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102534563 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102541288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102541926 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102545984 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102546455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102547518 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102549631 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 102552431 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102558550 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102565146 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102567941 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 102571425 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 102572291 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 102575754 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102576117 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102577050 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102577363 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102579159 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102581167 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102582378 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102584274 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102585759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102587570 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102588246 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102589567 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102589610 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 102590194 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 102592434 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102593728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102596162 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102596830 G T Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 102597354 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102601830 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102602520 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102602911 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102603316 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102605688 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 102607618 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 102607975 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102615878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102615946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102616310 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102617281 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102617608 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102618071 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 102618277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102618644 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102619971 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102622579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102622720 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102624753 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102629541 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102631058 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 102631596 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102632330 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102634062 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 102634417 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102638063 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102639877 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 102640494 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102642331 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102643929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102645102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102645944 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102646622 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102647086 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102647803 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102648629 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102648967 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102649240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102650314 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102650816 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102651369 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102652444 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102653873 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102654712 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 102658300 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102659591 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102662623 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102663610 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102665758 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102665953 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102670799 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 102672419 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102675250 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102675251 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102675341 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102677412 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102677427 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102678904 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102680044 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 102680820 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102681106 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102682691 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102684022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102686754 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 102687127 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 102688630 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 102688700 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102690305 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102691609 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102692680 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102692698 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102692730 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102693341 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 102694004 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102694222 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 102694901 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102696427 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102696802 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 102698812 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102703891 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 102704612 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102704638 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102706271 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102706515 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 102709982 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102710678 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102710764 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102715806 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102715807 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102715808 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102715809 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102725881 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102725919 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102725986 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102728564 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 102730785 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 102731778 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 102732602 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102732703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102732738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102732739 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102734314 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102736261 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102740410 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102741862 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102742245 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102743058 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 102743093 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102743992 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102751988 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102756805 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102757455 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 102775566 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102786331 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102786576 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102789770 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102797047 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102797130 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102798116 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102798785 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 102807895 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 102808210 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 102808760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102808970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102816718 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 102820328 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 102821638 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 102822176 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102822624 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 102823401 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102824163 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102824222 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102826325 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102826425 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102826625 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102827506 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102828625 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102829163 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102831290 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 102831374 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 102831516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102831875 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 102832227 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102832785 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102832872 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102834020 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 102836342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102837548 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 102837552 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 102837661 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 102837677 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102838267 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102838298 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102840604 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102841345 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102842682 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102849652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102849907 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102851097 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102851735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102851815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102852352 T A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 X 102852737 G T Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 X 102853117 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 102854566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102854656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102855333 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102855396 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102857288 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102859830 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102862227 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102864169 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 102865153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102865492 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102865881 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102875576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102876152 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102877019 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 102877749 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 102878531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102880472 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102881970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102882938 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102884284 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 102892380 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102895305 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102899219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102899860 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102902146 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102904764 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102909589 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102910893 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102911295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102914870 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 102915154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102916383 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102928550 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102929349 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102953730 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 102954744 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102957374 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102957698 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102958034 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102964014 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102968664 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102973480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102977709 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102978266 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 102979925 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102985157 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 102985649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102986732 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102987013 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102988428 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 102989384 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 102989763 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103000550 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 103000630 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 103000985 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103002811 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 103003878 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103008380 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103009015 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103009216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103011687 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103011716 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103011726 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103011755 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 103013044 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103013282 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103014393 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103015488 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103015562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103016777 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103017984 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103018075 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 103018760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103022046 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 103022337 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 103022708 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 103022719 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103023086 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103023277 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103023729 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103026380 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103026381 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103028066 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103028867 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 103028907 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103030631 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 103032162 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103036076 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103036792 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 103037711 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 103037753 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103037999 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103038161 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 103038162 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 103038166 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 103038193 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 103039406 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103041924 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103042079 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103042460 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103042599 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103043156 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 103043516 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 103049383 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 103049862 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103049890 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103055916 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103056643 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 103059142 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 103067949 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 103067961 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 103067962 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 103068566 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 103077901 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103081330 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103085158 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103085159 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103085537 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103089105 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103089554 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103089907 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103092225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103092824 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 103096521 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 103099435 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103099677 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 103099715 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103100528 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103101198 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103103383 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103108453 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103108561 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103109085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103114478 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103114489 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103121053 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 103121203 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103127188 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103129917 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103130024 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103131975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103132108 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103133067 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103134989 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103136216 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103139018 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 103141167 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103141168 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 103141173 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103144797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103145122 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103145278 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 X 103145883 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103146275 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103146835 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103147413 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103150873 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103151158 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 103155840 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103157232 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103157376 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103157562 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103159176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103159235 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103160173 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103162102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103164107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103165746 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103166672 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103167692 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 X 103170759 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103170887 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103173724 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103176908 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103177293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103180740 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103181168 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103192244 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103195131 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 103197319 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103198279 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103199398 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103205242 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103209845 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103211065 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 103215605 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 103220352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103241485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103241787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103242728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103270673 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103275436 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103275828 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 103276072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103282299 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103282326 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103282552 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103283328 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103283425 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 103283749 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103283901 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103285303 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103286234 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103289162 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103292018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103293076 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103293349 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 103294325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103294450 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103295401 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103296709 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103296762 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103297602 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 103299098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103299924 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 103300388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103303922 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 103304504 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103305558 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103307706 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103308962 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103311173 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103311748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103312155 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103319423 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 103320185 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103321301 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 103322061 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103323291 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103324330 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103324387 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103324714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103325015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103325110 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103328408 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103329713 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103330528 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103331148 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103331766 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103334012 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 103349393 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103351790 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103388966 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103397758 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103401344 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103403627 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103404886 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103411925 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 103415850 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 103425633 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 103425657 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 103428665 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 103431874 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103439048 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 103439916 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103440171 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 103441014 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 X 103441017 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 X 103441039 T G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 X 103453180 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103453662 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103467156 T C Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 103468345 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103475809 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 103482415 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103489344 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 103490438 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 103490902 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103491757 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103493390 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103495072 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 103496880 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103499205 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103503969 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 103504016 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 103510188 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103511060 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103512969 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 103512970 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 103512973 C A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 103512995 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 103513154 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 103531490 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103533774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103541577 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103544825 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103544927 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103548767 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103555268 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103558509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103561752 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 103562469 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103573178 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103575610 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103576168 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103579179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103582521 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103593725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103594425 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 103595329 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103600765 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103604384 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103604441 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103606036 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 103606656 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 103607365 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103608157 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103610357 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103611443 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 103612158 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103616224 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 103617181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103617798 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103621341 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103626847 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103633264 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 X 103634338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103634838 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 103637190 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103637550 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 103640765 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 103641296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103645987 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 103658831 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103659496 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103667237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103669206 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 103671585 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103673056 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103673263 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 103676440 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103679959 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103681592 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103699296 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 103699848 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103700887 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 103700959 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103702352 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103703272 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 103704949 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103705262 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 103705600 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103705747 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103706406 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103707338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103708574 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103709122 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 103709913 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 103712268 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103712913 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 103714031 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103716086 T G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 103716961 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103717673 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103718571 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103718845 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103719686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103720555 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 103721594 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103723773 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 103726093 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103728404 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103728653 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103728896 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103728897 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103729906 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103738536 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 103742499 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103743891 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103747106 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103747682 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103748267 A C Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 103762268 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103762761 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103762762 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103763492 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 103765057 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103765301 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103766584 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103766927 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103767603 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103768257 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 103772941 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 103774624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103793022 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103793999 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103794512 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103796588 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103860044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103860596 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 103861878 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 103862207 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103864244 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103864373 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 103867571 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103867894 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103868483 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 103871544 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103874651 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103876608 C G N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 103879145 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103880844 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103882195 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103885396 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103898536 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103899435 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103900897 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103902484 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103910047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103911732 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103912463 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103919627 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103940331 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 103945426 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 103946315 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103946878 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 103949197 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 103949245 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103949870 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 103950786 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103967722 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 103975650 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 103992378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104015273 C G N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 104038260 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104044985 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104047471 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 104047580 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 104055924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104060461 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104061068 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104062238 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 104065189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104067067 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104071709 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104072402 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104072783 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 104075997 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104076657 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104077261 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104078584 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 X 104079283 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104080134 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104081770 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104082205 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 104082260 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 104088327 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 104094450 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104096980 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104098268 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 104098317 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 104098983 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104100592 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104100801 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104103870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104104423 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104106957 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 104107324 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104109244 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 104111210 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104111413 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104111870 T G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 104112171 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104113071 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104113446 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104113727 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104114052 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104115350 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 X 104115403 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 X 104118051 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 104118072 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 104121010 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 104121548 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104121585 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104121587 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104122382 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104123453 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104126282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104126730 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104128006 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 104132858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104133326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104133720 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104134612 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104134836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104135299 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104136132 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 104136379 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104136468 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104136688 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104137419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104137847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104138545 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104139341 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104140364 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104140614 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104142187 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104142658 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104142773 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104147592 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104150452 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104151958 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 104152087 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 104155382 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 104159003 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104171954 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104174619 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 104178399 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 104183680 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 104195439 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104199044 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104199968 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104203382 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104203656 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104203968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104204773 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104214327 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104214369 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104214725 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104215115 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104217358 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104218427 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104219537 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104219827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104225488 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104225812 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 104226190 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104231071 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104234224 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 104234465 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104236099 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104237233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104240291 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 104258771 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104260911 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104266172 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 104270835 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 104271589 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 104279754 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 104288634 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104291084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104293000 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104297451 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104306185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104313555 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104317980 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104319821 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104320565 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104320629 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104322836 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104323976 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104325577 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104326884 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104330098 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104330843 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 104332577 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104332629 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 104340348 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104341063 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104342707 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104343068 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104343717 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 104344141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104345044 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104345286 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104348792 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104354702 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104356545 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 104358958 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 104360866 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104363381 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104363900 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104365458 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104366232 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104367747 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104368464 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 104368807 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104369015 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104369968 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104372368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104378441 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104379621 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 104380030 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104380940 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104381826 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104384004 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104389672 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104392967 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 104393233 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104400307 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 104400392 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104402995 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104405631 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104405638 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104406127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104406528 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104407453 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104410117 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104411785 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104413523 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104413552 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104413926 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104415671 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 104415705 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 104417651 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 104418495 G A N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 104418722 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104420232 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104420904 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104420952 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 104422997 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104423944 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104425744 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104428140 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104428431 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104430220 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104431467 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104432161 G A Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 104435396 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104435572 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104442455 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104445612 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104448129 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 104448537 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104450597 C A Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 X 104452996 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104454404 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104454620 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104455197 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 104459024 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104483423 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104483799 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104497965 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104498167 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104498663 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104504248 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104504810 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104512876 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 104512909 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 104515498 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104519751 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104521481 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104524908 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 104538728 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104553004 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104554229 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104557651 G T N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 X 104557805 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 104562323 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104565713 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104567026 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 104567482 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104574527 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 104575083 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104575407 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 104577129 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104584966 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104587570 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 104587708 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104592163 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104597402 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104605551 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 104606053 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104606839 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104608388 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 104609494 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 104611339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104612808 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104613934 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 104614771 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104616822 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104617107 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104617531 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104617647 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 104617711 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 104618526 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 104618712 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 104619748 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104619820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104620260 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104621178 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 104621374 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104621482 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104621491 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104621602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104621759 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104621829 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 104622016 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 104622314 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 104622315 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 104624220 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 104629248 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104631963 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104631964 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104632063 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104632302 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104632996 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 104635855 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104637226 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104637250 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104638698 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 104641843 C T N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 104642249 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 104642278 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104644366 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104653787 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104653886 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104655973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104656028 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104656442 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104658623 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104658714 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104659505 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 104661867 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104665851 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 104666092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104666306 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 X 104667908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104668281 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104668797 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104668966 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104670022 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104673623 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104674932 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104676537 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104676585 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104677756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104677828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104677847 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104678907 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104679342 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104680109 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104680169 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104682465 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 104683146 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104683678 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104683809 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104684807 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104685434 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104687704 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104687852 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104689671 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104691300 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 104691301 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104691423 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104699150 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 104700512 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 104702478 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104704398 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104705203 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104705591 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104706151 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104707034 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104707462 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 104708039 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 104718469 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 104720000 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 104720047 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 104724256 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 104725262 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104725472 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104725980 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104726289 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104727302 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104727342 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104727910 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104728024 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104733792 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104734122 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 104734650 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104734660 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104735251 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104735678 G C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104735792 T A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 104737780 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104741641 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104742992 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 104743248 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104744427 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104745977 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104745989 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104746217 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104748171 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 104749443 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104751639 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104751880 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104754013 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 104754396 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104764357 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104766354 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104766537 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 104770157 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104770298 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104771164 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104771295 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104771828 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 104772231 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 104773775 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104773805 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 104774283 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104777010 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104777114 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104782739 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104783119 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104783210 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104783970 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104785990 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 104786170 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 104786861 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 104787091 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104787342 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104787820 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104787891 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104787908 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104792623 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104792647 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 104795559 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104796749 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104804361 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104804517 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104804586 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104805210 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104805382 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104806010 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104806218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104806469 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104811661 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104812114 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104812952 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104813613 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 104814671 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104814840 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 104814896 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 104815319 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104816632 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104816704 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104817444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104817802 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104818443 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104819258 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104819797 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 104820135 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104820731 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 104821344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104822034 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104822143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104822596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104822827 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104823352 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104823693 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 104825983 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104826125 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104827161 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104828009 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104830377 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 104831884 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104832265 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104832656 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104832780 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104833733 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104833944 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104835092 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 104835407 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104835745 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104836379 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104838753 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104838755 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104839878 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 104840132 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 104840476 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104840804 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 104840807 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 104841348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104841605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104844350 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104844797 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 104845084 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104845213 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 104845744 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104846265 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 104847763 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104848472 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104850180 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104851278 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104855431 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104855827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104855949 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104856673 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 104857890 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 104858125 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 104859705 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104859933 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104860264 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 104861519 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 104863960 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104864562 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104864905 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104865475 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104866232 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104866506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104866649 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104866684 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104866830 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104866834 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104866874 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104866903 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104866955 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104868257 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104869052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104869091 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104869380 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104869755 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 104869773 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 104870079 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104870262 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104870835 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 104871343 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104871667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104871794 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104871849 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104872047 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104872576 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104873488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104875973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104881859 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104882754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104884876 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104885814 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104886110 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 104886929 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104887162 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104888284 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104888725 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 104891369 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 104891541 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104891745 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104894516 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 104896624 G A Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 104896824 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 104896825 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 104897208 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 104897895 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 104898235 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104898666 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104899024 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104900637 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104901239 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104901515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104901530 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104901887 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104901903 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104902151 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 104904664 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104906981 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 104906982 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 104907304 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104907771 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 104908147 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104908208 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104908225 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104908435 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 104908521 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 104908828 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104908829 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104908836 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104909034 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104909065 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104909103 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104909151 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104909210 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104909218 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104909283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104909650 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104909742 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104910326 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104911949 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104912469 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104912769 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104917093 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104919948 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 104919949 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 104921434 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104924401 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104924410 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104925421 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104935415 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104938025 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 104938121 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 104939360 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104946142 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 104946926 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 104948115 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104950141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104951679 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104952369 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104953061 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104954200 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104956927 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104957622 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104958048 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104959619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104959899 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104959947 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104962365 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104964328 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 104965227 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104965921 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104966369 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104967479 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104969260 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 104969279 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104969393 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104969644 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104969763 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 104969764 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 104969766 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 104969779 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104969801 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104971861 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104972979 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104975279 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104976861 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104977099 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104977528 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104977831 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104979937 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104980332 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104980562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104981086 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104981344 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104981440 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104981531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104981562 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104981809 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104982562 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 104982597 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104989439 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 104990391 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104991133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 104992508 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 104993511 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 104995357 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 104998739 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 105001175 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105001551 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105002089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105009280 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105009816 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105010145 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 105011460 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 105013216 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 105013238 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 105017313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105017974 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 105021285 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 105022800 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105024013 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 105025677 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 105030244 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 105030709 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105037358 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105037680 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105041858 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105042824 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 105048015 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105049092 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105053970 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105056283 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105059220 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105060668 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105061553 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105062178 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105062868 T A N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 105069205 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 105070221 A G Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 X 105072706 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 105073507 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105074663 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 105077034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105082329 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 105086897 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105093087 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 105093432 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105094934 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 105097816 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105101506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105105556 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 105107822 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105107974 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105109897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105110211 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105110937 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105116688 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105117137 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 105118113 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105119476 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105120048 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105122084 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105122956 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105123180 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 105128994 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 105131331 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105135229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105136727 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105139555 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105141085 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105141584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105141929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105143647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105143734 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105145045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105146441 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105146738 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 105149627 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 105152197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105153265 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 105164170 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105164280 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105164582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105169445 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105184403 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105185343 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 105186947 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 105187612 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105188665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105189759 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105190219 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105190243 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 105190812 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 105195148 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 105197943 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 105201045 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105205504 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105206371 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 105213864 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105217848 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 105218101 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 105218733 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105225140 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105225621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105227058 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 105227108 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105231030 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 105231727 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105233002 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105233091 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105234683 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105240583 G T Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 105242177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105246098 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105247802 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105251923 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105253742 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105264132 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105264421 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105273612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105274659 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 105275918 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105280763 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105283571 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 105284031 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105288038 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 105294849 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 105294946 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 105310189 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 105321570 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105321951 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105323899 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105329555 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 105332502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105333433 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 105333815 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105337197 T A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 105341257 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105341511 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 105343078 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105355866 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105358420 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105358658 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105359866 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105361944 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105362864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105363664 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 105370267 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105370734 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105370913 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105377703 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105378090 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105384420 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105385147 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105386045 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105390770 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 105393094 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105393328 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105396146 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 105396385 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 105402672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105409639 T G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 105410098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105410494 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105410495 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105410551 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105420313 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105420596 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105422765 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105423314 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105426494 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105429470 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105439317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105439740 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105441251 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 105441390 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105441652 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105441955 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 105442817 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105445325 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 105447950 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105448254 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 105448963 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105452186 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105452446 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105452575 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 105465191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105469520 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 X 105470474 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 105471720 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105475154 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 105476227 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105476555 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 105478445 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105479034 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105479677 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105480207 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105480285 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 105481311 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 105481890 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 105482729 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 105483222 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105483754 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 105484907 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105485572 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105486049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105486437 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105486670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105489849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105495131 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105499682 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 105508294 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105509741 G C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 105511637 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 105512793 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105515060 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105516098 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105517945 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105518523 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105518706 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 105519194 T G Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 105519201 A C Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 105520273 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105522601 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105526052 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105526115 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105527774 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105530995 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105532134 T A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 105533419 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 105536244 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105536284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105536528 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105539001 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105543963 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105545563 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 105550135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105551660 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105558145 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105560687 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 105563368 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 105565576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105568051 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105572977 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105574023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105574782 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105575571 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 105576411 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105577612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105580403 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105580650 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105600430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105605916 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105608124 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105608424 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105609027 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105610061 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105610647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105611660 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105614307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105619813 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105621699 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 105623729 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 105626444 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105626750 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105626954 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 105627321 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105629593 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105638543 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105640808 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105643188 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105648871 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 105655500 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 105656283 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105657198 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105660285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105663452 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105664091 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 105664181 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105665965 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105671271 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105671977 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 105678239 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 105679414 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 105683999 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 105685932 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105686280 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 105688086 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105689991 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105705455 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105706570 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105709855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105715188 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 105715810 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105716544 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 105721164 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105725667 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105726885 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105728042 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105729918 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105730650 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 105733323 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 105733880 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 105734068 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 105736549 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 105747530 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 105752432 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105752868 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 105757448 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 105762061 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105791189 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 105791872 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105794646 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 105796028 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 105796117 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105796725 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105796735 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105798029 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105798155 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105798469 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105798995 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105799904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105800556 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 105801197 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105802341 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 105803494 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 105803940 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105805497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105805911 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 105808257 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 105808260 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 105809787 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 105809992 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 105812338 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105812387 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105813304 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105813383 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105813468 T G Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 105813746 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105814196 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105814443 A C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 105815231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105815346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105815853 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105817192 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105818038 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105818051 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 105818501 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105818652 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105819122 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 105819702 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105820126 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 105820566 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105822173 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105823044 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 105824070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105824973 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 105825863 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 105825944 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105826467 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105828293 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105829737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105829802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105834177 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105836051 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105836319 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105836417 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105837659 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105837718 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105837835 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105839645 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105840040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105840900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105844319 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105844538 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105845864 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 105845980 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105846084 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105846114 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105846493 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105846701 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 105847589 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105847661 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105850981 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105851681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105853761 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105854099 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105854401 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105854706 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105855121 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105856502 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 105857096 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105857338 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105862140 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105862486 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105865151 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 105866249 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 105867245 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 105868334 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105871711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105872813 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 105874603 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 105875527 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 105879081 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105879542 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105879623 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105880181 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105880942 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105881029 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105882403 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105882484 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105883142 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105884207 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 105887361 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105888871 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105893985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105894046 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105894301 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 105899026 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105899568 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105900325 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105900691 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 105902316 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 105903074 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 105904773 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105904978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105908536 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105909981 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105910716 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 105911262 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 105911962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105913194 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 105916717 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 105916783 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105917351 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 105918323 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105923186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105925246 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 105929238 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 105935768 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 105946968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105948708 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105948793 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 105949844 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 105950192 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 105951254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105951537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105953443 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105954011 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 105955415 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105956108 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105957385 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105957853 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 105957987 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 105960358 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 105962510 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 105962825 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 105963058 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105964940 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105965351 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 105966487 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105966588 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105967200 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105967206 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105967919 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105968387 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105968392 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105968985 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105970685 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105972154 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 105974094 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105976358 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105978787 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 105979677 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105980499 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105983915 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 105985020 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 105985186 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105985309 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105987036 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105987839 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 105988115 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105989217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 105989415 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 105990482 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 105995144 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 105995549 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106000943 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106001776 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106002892 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106005374 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106005572 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106006328 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106007119 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106008350 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106008683 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106009129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106009628 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106010320 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 106011555 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 106011831 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106012241 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106012330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106013441 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 106013560 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 106014640 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106015690 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106016102 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 106017492 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106019028 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106019915 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106021051 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106027902 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 106028877 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106031738 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 106034466 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106034619 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106037165 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106037904 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 106038176 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106042968 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106045469 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106046029 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 X 106046030 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 106046687 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106047095 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106047430 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106048395 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 106049574 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106049699 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106049700 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106049909 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106050104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106050201 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106051797 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106053566 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106054037 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 106056287 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106059432 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106060847 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106062157 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106063645 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106078231 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106078960 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 X 106080385 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 106080905 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 106081331 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106081367 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106081482 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106081497 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106082208 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 106085291 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106085358 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 106085362 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 106085378 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 106085744 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106086493 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106086551 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106086945 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106087063 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106087141 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106087452 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106088258 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106088805 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106090452 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 106090556 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 106091204 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106091664 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106091768 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106091790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106094105 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106094243 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106098258 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 106100251 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106100361 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106101259 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 106101828 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 106104479 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 106105751 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106105874 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 106105942 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106107524 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106108713 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106108862 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106120122 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 106120638 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106121070 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106121846 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106123200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106124393 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 106125416 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106130982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106132274 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 106132649 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106133653 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106134714 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106134815 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106134908 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106135104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106136286 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106137121 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 106137411 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 106137840 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106138464 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106139713 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 106140087 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106140091 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106140276 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 106140916 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 106141283 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106141932 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106142361 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106142795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106143124 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106144632 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106145625 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106146739 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 106148540 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106149238 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106149536 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106149537 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106150164 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106150733 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106152118 A T N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 106152255 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106154479 T G Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 106155968 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 X 106157119 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106157559 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106157603 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106157612 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106157799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106158626 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106158813 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 106158814 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 106159467 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106160731 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106160804 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106162559 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106162818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106162825 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106164337 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106165071 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106167621 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 106167865 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 106168321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106168840 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106168917 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106169409 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 106172318 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 106172773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106172951 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106175278 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 106175782 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 106178602 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106180454 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106182967 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106183034 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106183972 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 106184849 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 106186451 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 106186850 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 106190588 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106190637 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106192917 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 106193136 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 106193617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106193791 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106194311 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 106194356 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106195225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106195293 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106195425 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106195427 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106195642 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106196133 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106200481 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106201042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106202641 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106202865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106204062 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106204730 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 106205193 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106208203 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106209607 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 106212402 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106213332 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 106215971 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106216110 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106218198 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106219217 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106219353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106221548 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106223825 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106223876 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106224951 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106225426 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106226632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106231087 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106239600 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106239761 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106241346 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106242718 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 106243893 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106244180 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106244508 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106244861 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106256065 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 106256149 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 106258585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106258592 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106259828 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 106260998 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106260999 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106261005 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106261007 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106263214 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106263431 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106267945 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106268289 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106268971 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106271638 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106273496 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106274164 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106274556 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 106277784 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106278028 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106278442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106279192 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106279838 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106281305 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106285538 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106286504 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106287453 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106291576 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 106293932 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106295270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106295667 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106299248 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 106299903 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 106300161 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106300875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106301114 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 106301581 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 106301906 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106301958 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106302073 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106302135 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106302619 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 106302784 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106302827 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 106302828 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106302855 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 106302969 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106303380 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106303381 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106303437 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106303526 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106303560 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106303604 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 106304231 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 106304521 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106304982 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106306139 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106306355 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106306901 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106307617 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106307778 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106308024 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106308073 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106308153 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106308155 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106308521 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106308524 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106309746 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106310233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106310303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106310313 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106310322 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106310471 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106310506 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106310536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106310560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106310689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106310738 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106310752 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106310777 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106310786 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106310792 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106311296 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106313317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106315287 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106316286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106316494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106319349 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106320400 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106321617 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106321757 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 106322102 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106322176 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106322684 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106322935 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106323167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106323282 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106325506 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106328025 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106331521 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106333625 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 106333634 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 106335488 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106335502 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106335973 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106340280 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106342256 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106343554 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106343996 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 106347435 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106348650 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106350138 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106356156 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106357430 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 106370950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106390994 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106398079 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106403856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106405877 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106428613 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 106434868 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106435456 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106436591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106437853 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 106437912 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106437924 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106438115 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106439731 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106439956 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106441769 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 106441920 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 106443242 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106443546 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106445037 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106445931 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106447218 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106451660 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106457541 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 106458256 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106468987 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 106470256 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106471516 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106483292 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106483695 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106483996 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106483997 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106484974 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106486087 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 106488733 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106489005 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106489097 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106489615 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106489616 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106492394 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106493422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106493705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106494212 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106494584 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 106496686 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106497941 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106498448 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106499132 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 106499251 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 X 106499381 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106499629 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106508799 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 106516079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106517662 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106517774 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106518124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106518179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106519299 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106519734 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106519785 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106519929 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106520816 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106522084 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106529170 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106532171 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106535048 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106538699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106539115 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106539168 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106539694 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 106541767 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 106543683 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 106547613 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 106548225 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106548998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106550398 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106550751 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106553474 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106556941 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 106584827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106587580 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 106587668 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106588233 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106589625 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106589866 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106590883 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106592610 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106592671 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106593057 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106593145 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106593347 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106594645 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106595218 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106596150 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106596928 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106598857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106602904 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 106603454 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106603557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106604171 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 106605855 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 106610613 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 106612726 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106614518 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106615313 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106615727 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 106616907 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106618886 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 106619470 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106621350 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106622589 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106622614 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106623694 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 106626395 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106627235 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106628811 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106630385 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106630459 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106630657 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106637848 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106638058 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 106638088 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 106639838 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106649475 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106652202 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106657428 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 106658709 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106659101 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106660166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106661797 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106663724 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106664624 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106665358 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 106676447 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106676540 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106676631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106678620 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106679488 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106680206 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106680471 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106686519 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 106687733 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106693175 A C N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 106699910 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 106703441 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106704094 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106707104 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106716601 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 106722350 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106724886 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 106729905 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106746286 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 106752546 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 106758314 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 106763043 G C N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 106763334 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 106764223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106766049 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106766050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106771908 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 106775401 C A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 X 106775403 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 X 106788619 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106789239 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106790697 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106793310 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106793483 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 106795370 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106795562 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106797619 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106805973 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106808874 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 106810584 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106819902 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106828117 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106830762 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106832394 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106835289 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106839112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106842319 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106846288 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106852233 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106862628 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106867801 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106871159 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 106875571 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106876182 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106877396 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106880255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106881436 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106882488 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 106887429 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106888619 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106893267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106896992 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106913292 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106926606 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106935409 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106936212 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106939354 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106940864 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 106944515 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106952887 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106957514 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106958412 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106961459 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106978423 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106978964 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106978965 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 106982091 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106983223 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 106990165 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 106993503 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 106994073 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 106994074 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 106999806 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107002772 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107006713 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107007190 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107007735 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107008188 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107008675 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107011207 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 107014319 G T N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 107014921 A C N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 107015231 A G N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 107017553 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107019469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107044109 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 107046246 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107049929 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107049959 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107055085 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107058486 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107061179 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107065311 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107065983 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 107066315 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107076901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107077900 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107078293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107078563 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107085173 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 107089416 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 107096395 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 107097884 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107098314 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107105278 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 107120030 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107125320 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107126521 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107129747 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107129832 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107135992 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107138618 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107138910 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107139694 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107140142 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 107140649 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107140868 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107141772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107144760 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107148035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107156160 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 107158783 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107159639 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107160835 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107160860 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107162692 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107162841 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107166405 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 107166655 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107168760 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107169599 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107169639 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107180641 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107180920 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107183869 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107188300 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 107189826 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107191234 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107191297 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107193687 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107196891 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107203282 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107203819 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107204911 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107208959 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107209485 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107210159 G T Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 107211946 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107212681 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107214689 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107216868 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107216929 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107218490 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 107219076 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107221832 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107222070 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 107234756 T C N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 107236120 A G N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 107244899 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 107247498 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107248161 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107264001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107264525 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107266421 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107270502 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107270676 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107271093 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 107271667 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107271674 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107289779 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107297376 C A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 107306069 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 107309172 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107317418 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107319992 T G Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 107327503 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107337025 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107345158 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107345385 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107346490 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107353850 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107354059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107361149 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107363128 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107372455 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107373383 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107375090 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107375981 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 107377958 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107382979 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107383526 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107384739 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107386077 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107387012 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 107387602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107387804 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107388735 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107389166 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107390344 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107393929 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107394254 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107394588 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 107396019 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 107396077 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107397276 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107398039 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 107398082 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107398638 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 107399905 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107402006 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107408643 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107409539 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107421605 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107425005 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 107425187 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107426684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107433554 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107433804 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107434558 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 107438563 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107440542 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107440828 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107442165 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107445387 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107445738 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107448139 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107451063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107452537 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 107453328 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107454363 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107457215 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107459191 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107459640 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 107462680 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107463448 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107466145 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107468468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107476303 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 107481403 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107483062 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107483702 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107484380 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107485566 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107487084 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 107487657 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 107489169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107490517 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 107490813 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 107490959 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 107495316 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 107496981 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 107499154 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 107500082 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107500375 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107500435 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107504539 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107505809 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107506800 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107507153 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107507506 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 107507608 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107507682 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107507947 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107511979 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 107513254 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107514698 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107514762 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107515226 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107516962 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 107518933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107521311 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107522697 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 107524054 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107527815 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107527823 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107530463 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107532898 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107534245 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107534696 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 107536049 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107537304 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107537526 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107538490 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 107540980 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107540981 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107541282 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 107541927 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107543564 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107544498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107544572 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107546750 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107548954 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107550842 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 107551175 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 107552238 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107554590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107554856 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107555533 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107561594 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107561894 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107562063 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107562228 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 107565426 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 107566680 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107568349 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107568428 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107568469 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107571924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107572293 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 107572649 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107577190 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107578119 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107582958 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107589742 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107595399 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107596280 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107597406 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107597972 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107597999 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107598645 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107599068 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107599635 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107599783 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107601098 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 107601887 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107607011 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 107610847 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107620706 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107621180 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107621689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107622044 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 107622271 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107624406 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107627525 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107627526 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107627980 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 107635387 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107636143 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 107640255 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 107640760 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 107649619 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107651838 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107652126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107652992 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107653428 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 107653788 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107655246 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 107656041 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107657612 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107658498 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107658768 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107659513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107659595 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107661075 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107662594 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 107663099 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107665221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107666683 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 107669494 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107669698 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107671145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107674017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107674792 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107676354 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107676355 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107677639 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107683342 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 107683517 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107686709 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107688310 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 107689455 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107690248 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107694153 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 107707938 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107708249 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107708442 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107709855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107716703 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107716830 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107716954 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 107717088 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 107717988 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 107721881 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107721993 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 107722250 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107723575 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107724160 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 107724866 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 107725142 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107725333 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107728626 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 107728704 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 107729576 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107730663 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 107731793 A C Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 107733551 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 107733606 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107735811 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107737279 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107739661 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107739766 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 107740214 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107740366 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 107740614 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107741204 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107747451 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107749164 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107749178 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107749614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107751958 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107752073 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107752216 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107752790 T G N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 107756573 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107757924 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107758742 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107760256 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107760849 T A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 107764502 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 107765398 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107765730 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107767719 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107768403 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107776178 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 107776813 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 107777037 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107782463 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 107782746 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 107783171 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 107783491 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 107783852 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 107784939 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107789589 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 107789807 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107791713 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107792253 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107792976 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 107794146 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107794254 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 107795621 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107796806 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107797218 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107797225 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 107797858 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107797955 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107799818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107801251 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107801309 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107802902 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107803297 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107803312 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107803924 C A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 107806084 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107806404 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107806656 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107807231 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 107814058 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107817328 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107818307 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107818755 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107821871 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107822058 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107824062 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 X 107824969 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107825348 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107825491 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107829404 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 107829844 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 107831822 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 107832696 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107835614 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 107836805 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107837113 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107837664 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107841889 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107844403 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107845375 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107845575 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107846193 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107848666 T C Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 107850131 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107850459 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107852756 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107853110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107854024 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107855273 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107855737 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107855773 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107855810 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107856484 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107860770 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107861479 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107862203 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107865168 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107865419 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 107865930 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107867830 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107869035 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107870935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107877360 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 107878278 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 107878768 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 107881836 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107883808 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107884510 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107891847 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107894503 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 107894593 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 107897726 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107899395 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107899568 T C Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 107902801 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107904015 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107906154 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107908027 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 107908627 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107911016 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107911551 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107913881 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107914661 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107916284 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107916625 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 107918329 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 107919316 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 107919568 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 107928640 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107933049 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 107933198 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107933199 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107934302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107934763 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107934973 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 107935692 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 107935829 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 107937779 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107937874 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107939467 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107939995 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107940633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107940844 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107941016 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107941040 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107942519 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 107943026 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107944090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107944298 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107945065 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107945073 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107946099 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107946340 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 107949021 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107949146 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107949147 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107952694 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 107953981 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107960718 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107960950 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 107960953 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 107962376 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107963868 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 107965755 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 107968861 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 107969171 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 107969737 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107969817 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107970284 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107970476 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107971434 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 107973214 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 107973507 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107976083 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107978403 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 107979744 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107980622 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 107988278 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107988316 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107989608 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 107994075 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107996608 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 107999986 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 108000058 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108006295 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108006973 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 108009056 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108012762 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108019910 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 108024257 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 108027292 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 108028465 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 108030400 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 108033340 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 108033707 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 108034316 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108034549 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108036813 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108037815 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 108040579 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108043570 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108044531 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108049525 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 108054364 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108055762 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 108071443 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108072560 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 108072985 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 108073153 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 108073273 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108083438 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 108083749 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108084511 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108085104 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108086484 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108087480 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108087800 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108088315 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108088451 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108091120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 108091793 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 108097403 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108097510 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 108097595 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 108102115 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108102206 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108104044 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108106550 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 108106640 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 108106670 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108108642 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108108994 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108109499 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108110889 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108111043 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 108111771 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108115851 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 108121991 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108122487 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 X 108122970 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108124755 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 108124758 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 108126754 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 108126917 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 108127037 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 108127446 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108127760 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108128283 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108129642 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 108131290 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108136547 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108150145 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 108156458 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 108161946 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 108165036 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108168180 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108175340 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108176689 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108178562 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 108179228 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 108216909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 108216982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 108225048 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108238319 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108250166 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 108251488 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 108274172 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108274885 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108284478 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108284796 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108293432 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108293675 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108300890 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 108304661 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108314322 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 108330902 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108330923 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108335478 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108335484 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108336623 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 108339554 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 108339558 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 108339661 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108339662 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108340837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 108346312 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 108347883 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108347901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 108347910 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 108348030 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108350810 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 108365149 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108365629 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 108366052 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108370460 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108371344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 108373259 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108373349 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108373840 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108374555 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108375834 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108380186 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108381167 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 108381839 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108382042 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 108382489 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 108382713 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108383582 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108383614 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108384179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 108384723 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108386040 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108386492 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108386551 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 108386738 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 108386772 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108386876 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108387094 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108387847 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108387898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 108388535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 108389013 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108389331 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 108389433 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 108390765 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 108390778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 108391557 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108392234 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108392276 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 108392338 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108392379 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108392383 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108392385 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108392700 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 108392704 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108392885 C A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 108392888 C A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 108392889 C G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 108392891 C A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 108392901 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 108395250 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108395251 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108395467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 108395470 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 108395514 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 108396984 T A N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 X 108396986 T A N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 X 108397514 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 108398005 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108399139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 108399309 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 108399740 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 108399974 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108402784 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 108403585 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 108403740 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 108404558 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108405387 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 108405562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 108406303 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 108408390 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108409872 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 108412049 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108412627 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108414376 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 108418332 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108472772 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108473408 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 108484372 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108486455 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108486749 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108492373 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 108493053 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 108495877 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108497701 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108499259 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108499344 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108500998 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 108501954 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 108503091 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 108507958 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 108508077 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 108509930 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 108528165 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108542339 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 108561831 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108563726 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 108564712 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 108564922 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 108565438 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108565445 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108569975 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108571196 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108571881 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 108577574 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 108577677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 108580766 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 108581482 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 X 108588944 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 108599037 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108602099 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 108602401 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108604263 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108617697 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 108618324 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 108620056 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 108620267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 108620468 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108623048 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108625098 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108634480 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108635589 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108642591 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 108646495 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 108646523 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 108649367 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 108649401 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 108649558 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108650982 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 108654194 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108655200 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 108655224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 108658368 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 108660818 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108661176 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108663266 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 108664842 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108665850 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 108670800 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108672652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 108674542 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108674544 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108677909 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108678632 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 108679802 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108686553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 108689718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 108690205 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 108693730 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 108696000 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 108698810 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 108699155 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108699817 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108701167 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108706232 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108708141 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 108708934 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 108710756 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108715664 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108718320 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108718839 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108720369 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 108725301 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108728325 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108728669 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108729817 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108733992 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 108740786 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 108742550 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108742602 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108742914 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108744099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 108747210 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108747923 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 108749401 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 108750608 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108751956 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 108752066 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108754893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 108755651 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108757498 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108757520 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108757556 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108762904 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108764706 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 108770594 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 108771796 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 108774783 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108775922 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108783799 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 108787042 A C Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 X 108793533 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 108795775 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 108797840 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 6 30 3 0 15 X 108798223 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108798464 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108798476 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108800136 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108800265 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108801830 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108801877 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108808423 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 108811013 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108815251 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 108840830 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108854245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 108856610 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 108859451 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108863217 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 108866867 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 X 108893006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 108894405 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108903761 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108903858 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 108904045 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 108906341 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 108913787 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 108915062 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108920649 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108921079 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108921895 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 108929708 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108936331 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 108936539 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108936544 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108936890 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 108940405 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 108948382 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108952273 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 108964823 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 108968034 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108968801 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 108979126 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 108980331 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108980973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 108995940 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 108996822 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109005232 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 109012087 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109014844 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 109014880 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 109021782 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109027222 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109028545 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109028547 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109028579 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109028582 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109028584 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109030430 C G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 109031688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 109038842 A G Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 X 109041670 G T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 109041777 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 109042310 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109043708 C G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 109045282 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 109046715 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109052917 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109053242 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 109056435 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 109064972 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109066029 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109067366 C T Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 X 109067963 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109069487 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 109070953 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109071289 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 109077301 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 109077357 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 109078580 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 109079587 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 109080292 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 109080702 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 109080819 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 109082320 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 109082795 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 109087874 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109093113 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109097203 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 109098098 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109098389 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 109098404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 109100970 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109101190 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 109101933 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 X 109104484 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 109107063 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 109107355 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109107621 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109108326 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109108605 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109109765 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109114154 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 109115947 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109118937 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 109119224 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109125760 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 X 109125761 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 109128592 C T Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 109133389 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 109135151 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 109139703 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 X 109140897 T A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 X 109141722 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 109143788 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 109145847 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109147583 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109148073 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109148612 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109148893 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109149484 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 109152333 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 109158272 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 109160197 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 109162945 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109163317 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 109165133 T G N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 X 109167771 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109169760 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109171618 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109175535 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 109178006 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109189453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 109189469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 109194854 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109195004 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 109195980 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109196548 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 109199419 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 109202279 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 109202504 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 109203219 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109203345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 109204751 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 109207060 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109210027 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109213600 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109215716 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109216135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 109218623 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109221091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 109221802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 109223269 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109224717 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 109224781 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 109226415 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 109228053 C A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 109228752 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 109229554 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109229862 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109231204 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 109231205 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109236485 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 109238615 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 109240823 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 109241769 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109242140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 109242819 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109246652 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 109246845 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 109253195 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 109256910 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 109267984 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 109270506 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109271849 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109276629 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 109283631 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 109285764 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 109291283 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 109292156 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 109293720 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109296821 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 109300017 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 109301292 T A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 109301576 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 109302086 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 109302298 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 109302484 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 109303593 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 109304934 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 109307232 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 109307526 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 109308785 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 109309928 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109309960 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 109310315 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 109310393 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 109310522 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 109310554 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 109314228 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109315868 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 109317646 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109318284 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109323332 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 109326190 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109332744 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109333715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 109333862 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109334030 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 109335095 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109335135 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109335241 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 109335627 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 109336292 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 109337700 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109338466 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109338687 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109338856 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109346752 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 109347001 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109349924 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 109358143 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 109360969 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 109361800 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 109372198 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109373272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 109374319 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109374853 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109376133 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109377369 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109385050 C G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 X 109390065 C T Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 X 109390606 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109391559 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 109394740 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109396342 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 109400095 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 109401756 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109402210 C A Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 X 109403828 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109404993 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109406090 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 109414342 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109423828 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 109426426 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109427842 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 109428265 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 109428266 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 109476444 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 109527477 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109531897 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109560272 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 109565793 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109567389 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109569370 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109571216 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109573620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 109576111 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 109577216 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109578091 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109584474 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 109587248 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 109588690 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109592258 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109593129 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109601258 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109604715 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109608143 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109610251 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 109611358 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 109611604 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 109612000 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 109612752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 109612800 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 109612845 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109613578 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 109613788 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109616066 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109616281 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 109616671 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109616760 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109617093 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109617142 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109617320 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109617326 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109617688 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 109617943 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 109619009 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109619302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 109619794 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109631269 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109631740 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 109633900 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109639805 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 109641157 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109655140 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 109656987 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 109666663 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109667543 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109675839 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109677233 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109680421 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 109686069 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 109689540 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 109689596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 109689789 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109698373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 109699391 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109702928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 109703071 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 X 109703162 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109703657 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 109713314 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 109713330 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 109715541 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 109716026 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109732489 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109732505 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 109749228 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109750406 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 109753598 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109753937 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 X 109754251 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 109756044 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109759904 A T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 109761974 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 109763367 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 X 109763368 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 109766204 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 109768537 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109770516 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 109772154 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 109774431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 109776107 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 109778341 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 109778342 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 109780589 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109780652 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 109781943 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109782413 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 109786743 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109788735 C G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 109791571 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 109793587 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109794422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 109800447 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 109804255 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109807357 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109812684 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109838683 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 109839858 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109877230 A C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 109879094 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109884072 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109889974 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 109895866 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 109900709 C A Y N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 109900715 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 109907361 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109914450 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109917365 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 109919521 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 109934316 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109941466 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109948734 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109952172 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 109953175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 109964827 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109966908 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109970609 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 109971554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 109972230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 109978728 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109979748 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 109984661 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 109984900 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 109984948 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 109985340 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 109985542 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 109985763 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 109988695 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 109996278 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 109996791 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 109997971 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 109999422 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110001052 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 110001701 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110001877 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110002732 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 110003962 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110004153 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110006175 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110006684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110012537 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110014053 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 110015682 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110017154 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 110017160 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 110017201 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110018080 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 110018504 A G N Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0 0.714285714285714 0.285714285714286 5 9 0 5 2 X 110019569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110020193 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110020302 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110020931 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110021260 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110021313 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110021367 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 110021377 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 110021551 T A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 110021574 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 110021955 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110021981 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110022014 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110022027 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110022036 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110022161 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110022206 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110022231 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110023282 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110024213 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 110024305 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110025741 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110026318 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110027935 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110028810 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110028934 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110029530 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110030751 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110031639 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110032513 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110032783 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 110034884 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110035923 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110036070 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110037199 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 110038513 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110041272 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110041880 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 110047274 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110047984 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110049138 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110050619 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 110058138 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110058790 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110059405 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110063868 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110067047 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110070638 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110071940 G T Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 110079780 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 110085397 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110085674 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 110086181 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 110087336 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110090308 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110090963 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110092635 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110092843 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110094478 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 110095198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110096607 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110096864 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110097313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110100867 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110101222 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110102465 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110102820 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 110102969 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110102997 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110104032 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110104701 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 110104929 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110106919 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 110107387 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 110107574 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110108927 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 110109780 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 110110071 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 110110288 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 110110822 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 110110866 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 110111310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110112162 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110113308 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110114462 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 110116035 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110116869 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110117133 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110117726 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 110118559 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110119058 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110119141 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110119206 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 110119413 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 110120891 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110121717 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 110122135 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110122864 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110123023 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110123369 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110126571 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 110134840 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110141322 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 110149377 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110151830 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 110152786 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110153904 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110156610 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110157226 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110158846 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110163015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110163555 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110164862 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110164863 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110165464 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110170112 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110172579 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110175733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110175940 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110176117 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110180553 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110180619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110181521 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110181681 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110181904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110182602 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110182682 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110183026 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110183277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110184549 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110185014 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110185089 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110185227 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110185474 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 110185899 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110187858 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110188178 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110194218 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110195384 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110195627 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110196572 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110197389 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110197647 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110198300 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110201175 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110201197 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110202072 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110202958 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110204470 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110207043 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110207247 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110207691 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 110207868 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 110208242 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110210420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110210548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110211269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110211778 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110211817 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 110213381 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110214841 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110216439 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110217437 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 110217578 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 110218444 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110218604 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110221246 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110222032 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110222228 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 110223050 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110224470 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110224510 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110224639 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110225899 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110227321 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 110227594 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 110227726 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110230238 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110230354 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110246246 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110246888 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110246942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110247035 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110247236 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110247317 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110247523 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110247574 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110249123 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 110249154 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 110249650 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110249888 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 110249958 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110249969 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110250030 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110250157 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110250561 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110251256 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 X 110251322 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110251395 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 X 110251436 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110251440 G C N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 X 110251441 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 110251541 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 X 110251542 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 X 110251684 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 110251688 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 110251748 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110251758 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110251922 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110251927 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110252177 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110252568 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110252768 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 X 110252837 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110252839 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 X 110253145 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 X 110253164 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 110253172 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 X 110253177 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 X 110253508 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 110253509 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 110253677 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 110253905 G C N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 X 110253956 G C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 X 110254265 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 X 110254282 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 110254292 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 110254463 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 110254492 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 110254774 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 110254827 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 110254942 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 X 110255280 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110255322 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110255442 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110255443 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110258825 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110259339 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110260667 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110262468 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 X 110263756 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 110263943 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 110264464 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110264566 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110264667 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110264884 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110266901 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 X 110267014 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 X 110267554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110267562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110267804 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110268406 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 X 110269204 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 110270704 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110271088 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 110271159 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 X 110271942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110272076 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110273259 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110273955 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 110277044 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110277990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110278270 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110278797 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110278807 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110281760 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110282940 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 110283108 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 110285248 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110286104 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110289736 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 X 110291050 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 X 110291065 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 X 110291493 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110292307 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110292749 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110292873 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 X 110292987 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110293041 C G N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 X 110293183 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110293278 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 X 110293284 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110293559 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 X 110293804 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 110294367 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110294734 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110294886 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 X 110294971 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110295398 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 X 110295578 A G Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 X 110296127 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110297224 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110297599 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110298097 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 X 110300911 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110302646 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 110303207 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110303246 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110305151 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110305549 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110306014 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110306177 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110306442 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110308928 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110309005 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110315460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110316115 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110318370 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110318852 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110320895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110321035 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110321154 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110322082 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110324283 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 110326339 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110328324 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 X 110328964 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110329241 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110329267 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110330084 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110331943 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 110333533 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110334380 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110336857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110338927 C T Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 X 110339117 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 X 110339434 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110340056 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110340437 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110341114 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 110344793 T G Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 110344905 G A Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 110347760 A T Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 X 110348883 T G Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 110349469 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110349552 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110350475 C A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 110351407 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 110354667 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110355881 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110355952 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110356089 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110357036 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110357237 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110357467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110357489 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110357670 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 110368056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110371177 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110373090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110373157 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 X 110373797 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110374095 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110375194 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110375587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110375914 A C Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 X 110376929 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 110377097 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110378346 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110379680 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110380125 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110380165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110380613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110381142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110383985 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 110384537 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110385006 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 110386350 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110386943 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 110393229 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110394447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110394825 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110394848 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110395340 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 110395682 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110395982 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110396102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110396127 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110401443 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110405369 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110407776 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110410446 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110410473 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110413754 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110421543 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110426115 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110427375 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110427590 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110428029 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110429190 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110433680 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110434607 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110435959 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110436844 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110437032 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110437395 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 110442416 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 110442610 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 110444663 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110446611 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 110446748 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 110447726 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110450744 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 110453500 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 110454040 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 110460507 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110473412 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 110477256 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110477870 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 110478673 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110481470 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110483914 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 X 110488707 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110488741 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 110488766 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110488974 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110489171 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 110489728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110490135 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110490761 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110491161 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110491207 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110492707 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 110492936 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 110498287 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110500892 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 110501078 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110502665 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110504636 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 110505399 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110505879 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 X 110508467 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110508561 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110509126 G T Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 X 110509296 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110509310 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 110510084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110512419 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 110516447 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 110518238 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 110518634 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 X 110520401 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110520536 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110521663 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110522989 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 110523311 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110527927 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110530548 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110530912 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 X 110532302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110532881 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110533490 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110534778 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 110536057 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110536811 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110537838 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110538473 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110538971 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110539635 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 110539934 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 110539943 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 110541254 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110542176 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110543808 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 110544173 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110544511 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 110544920 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 110545922 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110549647 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110550411 T G N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 110551406 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110551702 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110552100 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 110552306 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 110553256 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110554880 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110557090 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110557451 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 110557989 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110558056 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 110558221 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 110558865 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110560568 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 110560932 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 110561010 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110562548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110563482 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 110564659 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 110567459 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110567692 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110568172 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110568774 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110569121 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110569449 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110570950 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110570988 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 110571079 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110571472 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110571516 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110571820 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110573088 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 110573201 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 110573358 C A N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 X 110573556 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 110574792 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110574950 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110575079 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110575908 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110577416 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110577515 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110577708 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110579393 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 X 110579494 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110579931 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110581403 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 X 110581765 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110582367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110583087 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 X 110583887 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110584867 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110585000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110585252 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110585312 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 X 110592037 T A N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 X 110592109 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110592600 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110593374 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 X 110594222 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 110594263 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 110594686 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 110595828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110596153 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110597723 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 110597892 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110598171 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 110598242 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 110598740 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110599093 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110600368 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110600605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110601431 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 110602508 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 110603624 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 110603672 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 110605228 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110605726 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110605972 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110607754 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110609114 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 110614218 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110620061 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110621208 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110622511 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 110629135 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110629898 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110634198 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110634926 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110641182 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110642406 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 110646105 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110646314 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 X 110647423 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 110651631 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110654146 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110655127 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110657089 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110659373 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110661991 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 110662292 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110662447 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 X 110662623 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110662718 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 X 110663197 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 X 110664444 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110664839 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110665173 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110665341 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110666909 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110667149 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110667515 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110667655 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110667846 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110668369 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110669348 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 X 110669662 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 X 110670526 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 110670750 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110671806 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 X 110672611 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 110672927 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 110675192 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110675539 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110676215 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110676257 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110676792 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110676975 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 110679533 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110680656 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110686720 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 110686904 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110690092 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 110690262 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 110694189 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 110696035 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110698738 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110699328 A T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 110699436 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 110699651 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110701210 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 110701497 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 110702573 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110703072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110703140 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110703970 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110706796 C T Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 110707700 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 110709346 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110709676 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 110714020 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 X 110714244 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 110715520 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110715784 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110723927 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110724271 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110725096 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110728161 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110729408 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110730143 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110730535 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 X 110731773 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110731826 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110734387 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 110739915 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110739990 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110740906 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110742315 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110742576 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 110744233 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110744802 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110745079 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110746253 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 110746945 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110749416 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110749980 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110751212 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110752721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110753660 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110753736 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110754115 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110758271 C T N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 X 110760193 A C N N 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 2 4 1 0 2 X 110761470 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 110762963 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 110767344 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110768834 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110768881 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110770238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110770575 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110770750 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110771088 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110771416 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 110776732 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110777171 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110777805 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 110779299 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 110781444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110785365 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 110785839 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110786663 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110787880 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 110788262 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 110790363 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110793746 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 110796673 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110800273 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110801810 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 X 110801939 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110802378 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 110802385 G T Y N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 X 110803912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110804026 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110804199 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 110804206 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 110804450 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 110805290 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110806001 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 110806032 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 110807524 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110807646 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110807911 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 110808173 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 110809832 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110812006 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 110817832 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110821818 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 110823020 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 110823384 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 110827952 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110829305 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110832820 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110834322 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110837127 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 X 110839675 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110840423 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 110841097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110841298 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 110841322 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 110848442 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110848874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110849031 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110849087 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110849584 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 110850710 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 110851588 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110852039 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 110852697 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 X 110853157 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110853430 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110855727 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110856127 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110856600 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110857220 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110860871 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110861716 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110862036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110862187 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110863695 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110864184 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110864401 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110864429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110867599 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110868207 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110868267 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110868473 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 110868585 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 110869467 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110869588 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 110869768 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 110869795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110869957 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110870233 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 110872335 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110872612 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110872776 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 X 110873254 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 110873330 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 X 110874112 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110874161 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110874167 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110874770 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110875038 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110875331 G C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 X 110875408 G C N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 X 110875712 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 110877123 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110877351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110877885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110878131 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 X 110878191 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 110878407 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 X 110878694 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110879165 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 110879620 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 110880176 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 110880323 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 110880493 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110881762 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 110883381 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110887910 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110888453 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110890273 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110890478 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 110891075 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110891450 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 110894238 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110894504 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110894604 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 110894835 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 110902913 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 110913667 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 X 110915686 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 110923959 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110925352 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110926281 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110926505 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110927932 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 110929047 G T Y N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 X 110936797 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110937434 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110938453 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 110943058 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110945789 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110945790 G C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 110946609 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110947201 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110948798 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 110949183 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110949212 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110949653 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110949734 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110949772 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110952433 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110953008 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110954054 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110955121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110957642 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110958721 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110959695 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 110962310 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 110963052 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110964814 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 110966527 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 X 110971790 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 110977929 C T Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 110991341 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 111009669 A C N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 111015434 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 111032724 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 111042395 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111051586 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 111052278 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111053793 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 111056767 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111066910 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111068776 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111074173 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 111079003 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 X 111079514 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111079518 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 111079532 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111079537 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111079719 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 111079771 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 111079801 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111079817 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 X 111079918 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 111079926 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 111079965 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 111080006 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 111080011 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 111081173 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 111081284 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 111081433 G A Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 111082614 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 X 111082671 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 111082689 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 111082715 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111082807 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111084293 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111089532 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111095753 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111098553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111099249 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 111106902 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111170935 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111199320 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111211554 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111212798 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111223056 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 111224310 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111225139 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111225308 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 111236117 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111260705 A T N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 X 111268063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111272413 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 111273114 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111280402 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 111281929 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 111287531 C G N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 X 111305115 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 X 111307222 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111315913 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111318909 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 111328041 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111329474 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111333805 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111335698 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111336010 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111337491 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111340344 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111340705 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111341146 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111341177 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111341235 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111341578 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111341606 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111341673 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 111341783 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111341808 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111341925 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111342395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111342580 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111343056 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111343293 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111343309 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111344056 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 111344104 C A Y N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 X 111344415 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 111344892 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111345218 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111345322 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111345439 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 111345453 T C Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 X 111345701 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111345780 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111346198 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111346594 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 111346758 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111346922 G A Y Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 X 111347500 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 111347588 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 111347669 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111347911 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111347979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111347989 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111348163 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 111348555 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111348808 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 111349387 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111351238 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111351407 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111351743 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 111351950 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 111354745 G C N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 X 111357495 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 111362862 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111364073 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 111364239 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 111364386 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 111373478 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 111373665 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111381894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111388678 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 111389732 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 111390247 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111391677 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111391691 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111393683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111393871 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111394284 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 111395472 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111398131 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111398887 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 111405725 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111405765 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111405811 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111406555 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111406909 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111407036 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111407103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111409065 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111417327 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111417601 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111420736 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111420976 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 111421243 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 111421774 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 111422039 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 111423409 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 111423578 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111423611 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111425168 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 111426201 A G N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 X 111426237 G A Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 X 111429290 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111430914 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 111431128 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 111432427 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111433364 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 111436329 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111436604 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 111436769 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111439080 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 111440291 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111446678 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111447808 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111448350 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111450498 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111450757 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111455066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111455078 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111456646 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111456654 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 111456655 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111456855 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111456864 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111458724 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111459848 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111460929 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111461302 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111463647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111463678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111463905 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111464997 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 111465670 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 111466917 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111467032 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 111467059 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 111468037 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 111468753 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 111469002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111469835 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 111470844 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 X 111470845 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111470992 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 111474117 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111476241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111479863 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 111483879 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 111486051 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111488120 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 111490337 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111492346 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111492606 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 111494931 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 111498094 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 111498219 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 111500141 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111500233 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 111506842 A T N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 111507889 A T Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 111510159 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111510352 G T Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 X 111512598 T A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 111512907 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 111513367 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 111517728 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 111518298 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 111519080 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111519230 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 111519869 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111521266 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111522115 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111523322 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111536305 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111537558 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111538226 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 111538743 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 111540680 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 111541099 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111542741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111544050 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 111546466 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111549698 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 111550418 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111552433 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 111554150 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 111554190 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 111555877 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 111557895 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 111558352 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 111558834 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111560250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111562487 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 111568874 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 111571218 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 111574898 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111576681 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 111578541 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111579577 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111581195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111581336 C G Y N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 X 111584060 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111585647 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 111590368 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 111590975 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111590976 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 111596058 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 111597270 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111597796 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 111602347 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 111604463 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111605376 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111607114 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111607146 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 111607246 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111607988 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111621195 T A Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 111622066 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 111622551 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111622601 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111622776 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111623966 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111624235 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111624832 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111625438 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111629986 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111630409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111630473 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111632283 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111635654 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111635849 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111636060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111639052 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 111639149 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111646596 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 111646597 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 111654863 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111655312 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 111655497 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111655627 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111658643 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 111664649 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111671646 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111672643 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111672974 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111674036 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 111675951 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111676764 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111677083 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111678575 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 111679999 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 111680078 T C N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 111683157 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111685377 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 X 111687135 C G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 111689727 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111690700 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111692025 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111694599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111696593 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111699359 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111699843 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 111703938 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 111707692 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111711094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111711158 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111711388 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111711400 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 111711816 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 111713216 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111713803 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 111715072 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111715554 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111717147 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 111717232 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 111717445 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111717992 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111718005 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111718227 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111719060 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 111719299 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111719354 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111726095 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111727909 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111729800 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111730248 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 111731275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111732131 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111732186 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111734183 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 111735342 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 111735417 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111737767 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 111738345 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111738859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111739449 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111739729 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 X 111740309 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111741460 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111741606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111741619 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111742393 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111742652 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111743149 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111743234 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 111743621 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111743691 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111744121 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111744206 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111744731 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111744789 A C N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 4 24 2 0 12 X 111745182 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 X 111745402 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111747433 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111747696 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111748127 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111748188 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111748237 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111748421 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 111749022 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111749168 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 111749361 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111751124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111751489 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 111753703 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 111753712 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 111758406 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111758996 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 111759123 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 111759895 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111760106 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111763362 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 111767953 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111769998 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 X 111776674 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 X 111776987 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111779485 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111781198 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 111781466 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 111785723 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 111785729 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 111787184 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111787796 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111788672 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111790825 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111791338 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 111791548 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111792069 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111793459 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111799126 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 111801566 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111802440 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 111802500 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111805715 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111806686 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111806832 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111807253 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 111807569 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 111808186 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111809155 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111809780 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 111810971 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111814677 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111815919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111817197 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 111824474 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111827861 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111828867 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111830910 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 X 111831485 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111832545 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 111833910 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111835143 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 111835577 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 X 111836323 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 111836901 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111840733 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 111840909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111844242 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111846783 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 111846976 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 111848192 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 111848386 A G N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 X 111851616 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111860079 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 111860991 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111862136 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 111862655 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111878850 T A N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 X 111880890 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 111881290 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111881488 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111883272 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 X 111883596 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 111885127 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 111898432 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 111900920 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 111900921 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 111908476 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 111910984 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 111912667 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 111912674 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 111913362 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 111915154 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 111920552 C A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 X 111921810 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111922483 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111922499 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 111925744 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111926600 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111926863 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 111927451 C T N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 X 111928301 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111931173 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111931653 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111934436 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 X 111934594 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111935421 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111938227 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 X 111938490 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 111939734 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 111941354 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 111941670 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111941971 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 111948526 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 X 111949631 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111950951 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 111951037 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 111951722 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111951753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111955850 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 111959768 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111960074 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 111960144 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111960564 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111962709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111962968 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 111963476 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111964203 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111965323 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111965910 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111966034 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 111966464 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111968584 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111971319 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111973089 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 111974774 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111975007 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111976785 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111976847 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 111976902 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111978810 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 111979883 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 111980174 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 111980622 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111981741 G A Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 X 111984327 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 111984909 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111985093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111985537 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 111996298 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 111996989 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 111997385 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 111997715 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112001886 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112015768 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 112021281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112022922 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112029838 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112036025 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112039312 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112042535 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 112046172 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112049776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112050817 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112052342 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 112052850 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112053358 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 X 112054604 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 112063857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112068681 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112070786 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112070975 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 112071438 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 112071625 G T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 112077499 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112077843 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112081746 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112083533 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112086019 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112086306 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 112090743 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112097590 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112098397 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 112101048 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 112103902 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 112104491 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112122974 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112122988 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112127640 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112131126 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112133782 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112139751 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112144977 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112146865 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 112152588 T C N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 112153049 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112159761 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 112163098 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112163247 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112165179 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112166449 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 112168779 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112169597 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112170397 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112171376 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 112175600 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 112176053 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112176054 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112177033 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112177264 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112180286 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 112182776 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112184300 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112184548 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112187314 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 112189228 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112196007 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112196746 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112197655 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112200763 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112201252 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112201319 C A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 112202184 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112202929 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112207354 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 X 112214699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112216005 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 112216312 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112217785 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112224245 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112224251 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112224794 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 112234490 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112239317 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112241293 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 112241520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112241563 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112241699 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 112247026 C T Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 112248505 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 112248824 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 112250931 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112251229 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112251431 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112252097 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112252291 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112252373 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112276245 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112276551 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112279675 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112280346 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112284365 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112285104 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112285487 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 112286230 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112287666 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112289168 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112290389 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112292438 G A Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 112292718 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 112295219 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112295590 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112296960 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 112304161 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112307516 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112309939 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112310212 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112313230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112314434 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112314563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112316981 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112317747 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112319506 C G N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 X 112319775 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112319776 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112320344 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 112325209 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112326541 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112326702 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112328028 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112328139 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112328711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112330650 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112334009 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112336423 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112338709 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112339049 A T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 112341180 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 112341182 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 112341313 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112342096 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112342391 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112346209 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112346273 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112346471 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 112347427 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 112348544 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112348640 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 X 112349796 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 112350059 C A N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 X 112350230 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 112350868 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112351358 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112351544 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112354566 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112356741 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112360158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112360354 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112361256 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 112363306 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 112368259 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112368273 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112369666 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112371999 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112375759 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 112377343 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112377416 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112379701 C A N N 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 X 112385378 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112385527 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112387078 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 112387130 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112391306 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112391867 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112394095 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112395750 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112396352 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112396853 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112397826 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112399720 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112400688 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 112403064 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112403130 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112403533 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 X 112403722 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 112404194 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112404696 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 112405132 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112406695 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 112413376 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112414011 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112414318 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 112414579 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112419980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112426802 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 112426829 C A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 X 112431181 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 112432291 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 112436835 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112437755 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112446216 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112447652 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112447704 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112447815 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112448567 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 112449685 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 112449858 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 112451895 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112457321 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 112457899 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112458765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112459152 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112461251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112468176 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112468639 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112469780 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112469902 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112469921 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112470099 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112470534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112472374 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112472683 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112473789 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112474565 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112475535 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112476369 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112477739 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112480431 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112481504 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112483344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112483710 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112489188 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112489568 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112489604 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112491544 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112491846 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112494734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112494880 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112494923 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112495623 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112497598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112497877 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112504818 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112507527 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112508994 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112509166 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112513318 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112513346 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112513625 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112514746 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112515817 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112516216 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 112516513 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112516677 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112516875 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112517624 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112520381 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112520728 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 112520745 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112521179 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112521378 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 112522430 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112522913 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112524131 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112524244 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112524944 C T Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 X 112526786 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112527274 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 112536436 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112538482 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112539036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112539903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112540127 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 112540666 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112541606 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112541752 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112543208 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112543313 G C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112544612 T A Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 112549041 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 112549168 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 112549302 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 112549857 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 112551826 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112553293 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 X 112553399 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 112553587 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 X 112554372 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112557312 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112557653 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112557977 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112558934 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112559648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112559812 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112560519 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112562298 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112562504 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112563921 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112563954 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112564245 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112564986 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112565243 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112565704 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112566529 A G Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 112566578 C T Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 112567014 C G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 112567179 T A Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 112567587 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112569268 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 112569381 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112569400 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 112570062 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112570752 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112571126 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 112571447 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112572263 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112573221 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112573558 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112573603 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112573724 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112574369 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112575521 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112577258 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112577375 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112577838 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 112578008 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112578045 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112578306 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 112578430 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112578959 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 112579980 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112581034 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112581331 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112581478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112583033 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 112583126 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112583685 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 112583772 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112583894 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112585640 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112585991 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112586443 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 112586460 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 112586552 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 112586887 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112587145 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112587632 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112587687 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112589260 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112589364 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112589385 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112589695 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112590279 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112590683 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112590827 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112591450 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112591768 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112592072 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 X 112592182 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112592404 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112593218 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112594219 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112594560 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112595352 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112595957 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112596207 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112597304 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112598537 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112598605 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112600447 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112602504 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112603652 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 112603692 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112605823 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 112606319 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112607993 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 112612365 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 112612634 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112612699 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112613346 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112613622 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 112614248 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112614286 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112615415 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 112616488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112618539 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112625924 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112626012 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112626930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112627422 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112628237 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 112631046 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112632462 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112633001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112633429 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112634118 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112634674 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 112635102 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112635179 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112636288 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112636882 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 112638041 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112640924 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112642498 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 X 112643760 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112644926 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112645712 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112645772 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112647189 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112648763 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112649729 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112651214 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112651329 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112651425 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112651998 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112652297 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112655159 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112656170 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 112658133 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112658208 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112658419 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112658693 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112659951 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112660801 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112660966 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112660971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112661936 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112662455 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112662515 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112670759 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112671087 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112671421 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112671884 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112672061 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112672793 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112678970 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 112679259 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112681284 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112681456 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112681813 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112681974 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112684422 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112684581 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112685571 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112685867 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 X 112686823 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112686904 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 112687377 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112688251 C T N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 X 112695233 A T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 X 112695235 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 112696596 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112697151 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 112697559 C T Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 X 112699331 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112699428 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112699544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112699802 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112700171 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112700233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112700236 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 X 112700433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112702197 A G N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 X 112704120 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112705330 C G N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 X 112705372 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 X 112705749 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112709788 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112710330 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112712015 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 112714388 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112714391 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112716698 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112720157 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112720740 T A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 X 112721396 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 112721439 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112721453 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112722054 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112723862 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112724192 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112724197 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112724198 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112725897 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 112727137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112727192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112729726 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112731229 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112733746 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 112734336 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 112734338 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 112734339 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 X 112734727 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112736730 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112742757 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112745999 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 112746000 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 112746054 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112746820 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112747608 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 112747867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112750888 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112751117 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112753467 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112753817 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112754530 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112755087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112755300 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112755663 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112756058 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112756234 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112756477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112756977 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112758499 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112763561 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112763987 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112765955 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112766583 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112766899 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112769595 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112770584 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112771151 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112772546 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112780597 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112780690 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112783828 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112788737 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112788845 C G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112789970 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112790142 T A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 112791313 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112795344 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112795448 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 112796204 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112796684 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 112797634 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112797903 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112798130 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 112798810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112804983 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112809197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112809470 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 X 112811488 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112811847 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 112816328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112816860 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112821964 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112822964 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112828173 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112829744 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112829946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112832151 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112832482 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112834326 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112834803 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 112838180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112838315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112838637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112838956 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112841978 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 112845375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112846571 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112846871 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112846885 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112847018 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112847843 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 112849033 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112853071 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 112853097 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 112853572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112854001 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112854219 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112855754 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112857850 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112867958 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112869019 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112871495 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 112872499 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112874312 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112874670 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112876903 T C N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.181818181818182 0.0909090909090909 0.727272727272727 5 17 2 1 8 X 112879424 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112879561 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112887378 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112888350 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112888457 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112888986 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112889732 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112891619 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112893760 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112894237 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112895337 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112895346 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112895420 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112898782 G T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 112900329 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112901671 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112902211 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112902884 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112903555 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112907628 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 112910586 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112912960 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 112916080 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112920080 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 112920213 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 112921075 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 112922486 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112923337 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112926954 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 112931210 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 112932601 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112932787 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 X 112936653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112939018 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112939412 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112939801 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112941394 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112942122 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112942602 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112943282 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 X 112947282 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112948249 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112949011 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112952937 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112953634 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112955928 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112956429 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 112956641 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112957061 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112960310 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112960791 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112960931 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112961262 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112964563 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 112965073 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112972217 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 112975682 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112976264 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 112980108 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112981037 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112982393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112982480 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112983024 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 112983198 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 112987399 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 112989644 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 112991822 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 112992062 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112992153 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 112995188 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 112996621 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 112997632 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 112997772 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 112998069 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113000597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113003983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113006191 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113007252 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113007621 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113008079 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113008617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113012169 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113012608 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 113014658 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113020229 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113020776 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 113021159 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 113022526 C T Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 X 113025158 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113025610 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113026219 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113026803 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113027534 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113029159 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113038996 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113039818 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113040024 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113040488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113040702 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113042915 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113047319 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113048571 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113049213 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113055798 A T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 113056100 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113056862 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 X 113056873 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113059460 A C N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 113060817 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113064721 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 113064972 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113065180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113065405 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113066486 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 113067747 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113070020 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113070184 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113071403 G A Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 X 113073805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113074839 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113079567 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113086213 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 113088150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113089047 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113089778 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113091131 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113091689 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113092702 G A Y Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 X 113098343 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113099019 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113099444 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113100342 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113101595 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113101811 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 113102295 T C N Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.636363636363636 0.0909090909090909 0.272727272727273 15 7 7 1 3 X 113105864 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113105953 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113108145 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 113111797 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113111923 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113113789 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113115207 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113116063 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113116156 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113118928 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113119232 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113119670 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 113120301 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 113123971 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113124288 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113125015 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113133047 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 113135585 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113138657 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113141947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113144485 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113147487 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113147657 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113147658 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113149451 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113151780 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113156540 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113157227 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113158940 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113159064 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113163601 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 113165887 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113166145 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113169128 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113170121 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 113170300 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 113170527 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113171148 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 113172894 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 113174196 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113177392 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113178832 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 113178959 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 113180809 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 113181732 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113186767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113189919 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 113189923 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 113191773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113193344 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 113195770 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113196308 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113198610 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113201846 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113202651 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113202911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113204621 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113206445 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113206575 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113206864 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113207078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113213688 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113217444 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 113218565 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113219035 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 113219548 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 113222038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113225628 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113226875 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113227235 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113227698 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113229868 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113230401 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113234005 T G N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 113235847 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113236531 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113237331 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 113238403 C G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 113240559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113242306 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113243325 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113244131 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113244614 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113245056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113245113 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113245380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113246346 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 113246365 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 113247377 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 113247418 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 113248057 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113249212 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113251771 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113252363 C T N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 113252478 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 113252762 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113253114 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 113254009 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113256480 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113256520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113257575 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113258301 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113258554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113261471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113261509 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113262631 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113262797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113264549 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113265264 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113271949 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113273031 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113275496 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113277411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113277628 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 113280435 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 113280909 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 113280965 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 113281806 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113282999 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113283571 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113284470 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 113284556 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113285596 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113286153 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113286215 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113286773 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 113286809 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 113286903 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 113287479 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113287734 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 X 113288252 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 X 113288913 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113289216 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113289453 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 113289996 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113290087 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113290166 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113290176 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 X 113290748 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113290863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113290942 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 113291095 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113291807 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113291896 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 113292542 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113293821 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113295394 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113295815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113296349 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 113298973 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113299959 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113300393 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113301040 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113301222 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 113301507 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113301594 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113301694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113302109 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113302145 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 113302394 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113303736 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 113305774 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113307449 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113307840 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113307902 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113308304 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113309414 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113309538 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113310318 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 113310956 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113312038 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113312963 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113312967 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 113313037 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 113313099 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113313409 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113313462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113313698 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113313931 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113314520 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113316431 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113317531 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 113317891 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 113325369 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 113325394 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 113325647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113328764 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 113328908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113329229 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 113329282 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 113329678 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 113330066 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113331444 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 113331871 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113332555 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113332569 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113333435 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113333954 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113335267 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113335727 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113336580 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 113338275 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113338611 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113345123 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 113345335 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113346465 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 113347332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113349659 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113349948 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 113350907 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113351238 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 113353204 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113355330 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 113355494 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 113355576 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 113356634 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113357789 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 113357914 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113358104 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 X 113358937 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113359129 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113363360 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113364783 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113365261 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113365313 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113367094 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 113367579 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113368702 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 113371221 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113373132 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113375812 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113375817 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113376153 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 113377841 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113378375 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113378831 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 113379031 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113379416 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 113381175 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113381520 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 113381533 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113382342 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 113382858 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 113383427 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113388926 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113389027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113390303 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113391992 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113395179 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113395413 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113399204 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113399459 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113401741 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113403187 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 113403385 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113406420 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113406457 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113407528 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113409742 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113409893 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113420853 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113423814 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 113424125 T C N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 X 113424309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113425787 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113433285 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113433474 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113434708 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113434752 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113437908 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113438201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113438537 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113443636 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 113448565 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 113451081 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 113452554 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113454054 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113455734 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 113456568 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113461160 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 113467943 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113467979 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113470300 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113473197 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113477180 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 113480132 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113481183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113483175 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113484921 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113487674 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113488031 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 113489131 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113491915 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113492929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113493966 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 113494190 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 113499743 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113500670 C T Y Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 X 113500921 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113502760 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 113506149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113506189 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113506816 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113508008 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113509208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113510111 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113510136 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113512585 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113513903 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113515809 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113516831 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113517078 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 113517851 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113530489 A G Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 X 113531937 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113531976 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113532362 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113535591 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113538567 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113541337 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113551618 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 113552032 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113552748 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113553507 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113556742 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113556916 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113557608 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 113557980 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113560257 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113560356 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113562297 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113562308 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113564593 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113565277 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 113577384 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 113582497 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 113582864 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113585912 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 113589999 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113590588 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 113595269 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 113595776 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 113609272 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113611008 G A Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 X 113613622 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113614148 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113616212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113617322 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 113620734 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113623252 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113626538 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 113626920 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113628639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113629888 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113630334 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113633543 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113634524 C T Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 X 113635613 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113640480 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 113660176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113660553 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113661329 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113665296 A C Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 X 113666202 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113666768 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113667513 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 113668161 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113668883 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 113668954 G A N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.583333333333333 0.25 0.166666666666667 17 7 7 3 2 X 113669854 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 113669994 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113671400 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113672233 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 113673105 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 113674774 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113676362 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113679603 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 113680487 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113682195 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113684932 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113691325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113695284 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 113695970 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113697728 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113698757 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113704061 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113704559 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113704661 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113711359 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 113714878 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113727654 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 113730063 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113731080 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113733383 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113734566 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113737245 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 113737253 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 113737739 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113738871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113744012 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 113744770 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 X 113746209 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113746318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113746822 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 113748612 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113748713 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113751117 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113752040 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113754155 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113756180 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113758237 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113759451 T A N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 113760232 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 113762717 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 113763230 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 113770592 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 113770751 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113771537 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 113772532 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 113773898 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 113776523 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113779381 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 113781204 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113782187 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113782577 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113783280 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113783896 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113785692 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 113786252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113786261 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113787008 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113787234 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113789205 G C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 113789735 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113791414 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113791582 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113797430 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113802279 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 113802568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113802734 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113805750 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113811492 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 113812439 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 113816642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113817986 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113819124 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113823769 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113824295 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 113824850 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 113825300 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 113825876 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113826267 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113826443 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113827174 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113833480 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113833688 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113833771 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 113834253 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 113835086 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113835478 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113838363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113838413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113838751 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113838754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113839526 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 113839545 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 113840065 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 113840503 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113840834 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 113840952 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113843048 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113844654 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113847990 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 113848446 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113850969 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 113855463 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113858613 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 113858985 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 113859138 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113860447 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113860808 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113860952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113861189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113861256 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113863112 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 113865247 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113865388 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 113865558 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113865559 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113865651 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113870455 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113870489 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113870511 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113871050 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113871750 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113871877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113872021 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113872041 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113872109 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113872562 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113872744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113873197 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 113873879 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 113874236 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 113874582 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113874719 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 113875836 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113876168 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113876693 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 113876710 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 113877297 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113877758 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113878355 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113878596 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 113878654 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113879929 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113880055 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113880334 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113881139 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113881860 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113882610 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113883467 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113883795 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113889195 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113889286 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113889721 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113889722 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113889928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113890647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113890881 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113892557 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113892673 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113893595 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113893987 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113894068 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113894117 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113894123 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113894162 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113894239 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113894276 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113894342 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113894569 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113894894 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113895508 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 113895583 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113895986 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113896222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113896231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113896232 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113896361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113896364 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113896386 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113896391 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113896495 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113896605 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113896697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113896733 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113896978 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113897076 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113897125 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113897144 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113897160 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113897210 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113897217 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113897559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113897573 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113897589 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113897705 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 113898340 C T Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 113898434 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 113898913 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113898960 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 113899491 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113901108 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 113903604 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113905171 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113906152 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113909058 G T Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 113911405 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113912856 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 113917454 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 113919503 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113919760 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113919842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113920819 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113921007 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113922537 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113923270 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113923550 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113923866 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 113923867 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113925463 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113925905 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 113928138 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113932092 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113935071 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 113936466 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 113936874 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113940751 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113942411 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113946330 T A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 113947308 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 113947492 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 113948069 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 113949401 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113949688 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 113952182 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113952308 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113952763 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113953549 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113953736 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113953868 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113953873 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113954530 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 113955560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113955974 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113956961 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 113957194 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 113957242 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 113961189 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 113962382 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113962459 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113964428 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113966130 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113968301 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113971264 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 113971307 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 113972776 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113975973 T G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 113976049 A G N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 113980671 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113983198 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113986988 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113988477 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 113994937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 113999508 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114004919 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 114005011 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114005674 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114005982 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114006644 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114007702 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114007797 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114010231 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114011962 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114015015 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 114016548 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114018958 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114020060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114020777 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114021665 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114022081 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114022148 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114022411 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114023466 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114025333 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114025923 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114026566 G C Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 114029283 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114029761 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114029861 C G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 X 114030253 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114031862 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114033739 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114034709 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114035411 G C N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 X 114035522 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114036096 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114036174 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114036176 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114037235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114037383 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114037438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114038143 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114038599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114039118 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114039240 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114039302 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114039350 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114039477 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114041223 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114042938 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114042959 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114049138 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114049355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114049478 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114049704 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114050453 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 114050595 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114053567 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 114054581 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 114055764 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114055835 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114056258 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114056511 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 114056722 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114056821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114056963 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114056994 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114057221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114057301 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114057664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114058493 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114058590 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114058661 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114058724 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114058733 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114058758 T G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 X 114058817 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 114058828 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114058859 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114058879 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114058885 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114058972 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114059033 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114059163 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114059223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114059310 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114059319 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114059412 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114059470 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 114059481 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114059510 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 114059519 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 114059520 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 114059686 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 114059687 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 114059741 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 114059822 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 114059827 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 114059930 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 114060088 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 114060318 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114060383 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114060393 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114060403 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114060434 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 114060512 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114060523 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 114060651 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114060663 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114060664 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114060721 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114060742 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 114060824 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114060882 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114060913 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114060996 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114061521 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 114061550 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114061707 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114061828 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114061845 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114061857 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114061953 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114061995 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114062013 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114062048 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114062115 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 114062137 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114062231 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114062272 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114062314 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114062334 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114062684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114062689 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114062695 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114062698 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114062765 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114062802 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114062882 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114062891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114062893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114062966 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114062972 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114063077 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114063085 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114063402 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 114064052 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114065725 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114067966 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114069284 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114069302 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114071102 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114071348 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114071855 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 114074571 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114079054 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114080076 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114083649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114084748 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114084851 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114085182 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114085213 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114087696 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114087760 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 114087964 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 114097090 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114098057 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114098651 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114099288 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114100450 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114101929 G T Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 114102482 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114103385 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114104965 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114105026 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114109580 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114110223 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114110890 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114111837 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114112233 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114112784 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114112918 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 114113228 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114116248 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114116829 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114117225 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114117641 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114117956 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 114118070 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114118380 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114118395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114118727 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114118940 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114119006 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114120649 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114121112 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114121627 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114121755 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114124566 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114125234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114129292 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114129813 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114130790 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 114132399 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114133201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114133681 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114134504 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114134514 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114139686 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114147463 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114148637 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114148747 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114149066 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114149536 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 114150889 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114152801 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114153317 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114153332 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114153844 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114154677 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114155032 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114155450 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114155715 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114156850 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114157661 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114157932 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114160185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114160196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114160745 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114161153 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114161673 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114163013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114163281 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114166493 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114169392 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114169455 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114169479 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114173469 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114176902 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114178471 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114179663 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 114180577 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114181524 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114185078 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114185383 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114185459 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114187879 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114188039 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114188705 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114189273 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114190475 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114190576 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114190815 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114191721 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 114192512 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114192918 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 114193312 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114195117 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114195678 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114196826 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114196883 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114199588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114209806 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 114210723 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114213456 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114215247 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 114216242 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114218087 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114219736 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114221040 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114221391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114225430 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114225505 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114226055 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114226582 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114231948 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114239479 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 114239480 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 114239893 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114241528 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114242266 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114242616 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114242688 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114242697 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114243081 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114243478 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 114248366 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114251049 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 114251696 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 114251807 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114254889 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114255962 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114256526 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114256654 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114257307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114258663 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114259495 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114259588 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 114260575 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114262238 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114262430 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114262566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114263405 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114267025 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114268396 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114269261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114270759 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114271621 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114272413 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114273875 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 114275158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114275929 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114276664 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 114277751 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114278296 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114278827 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114279060 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114279617 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114280893 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 114284424 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114285339 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 114285751 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114287047 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114287092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114287196 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114287290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114287550 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114287621 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 114287760 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 114288269 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 114289637 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114290176 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114291203 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114294587 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114294839 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114295090 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114295180 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114295283 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114296552 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114296609 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114298980 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114302133 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114302170 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114304427 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114304633 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114304922 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114304939 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114305063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114305142 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114305866 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114306780 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114308394 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114309329 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114309422 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114310066 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 114310901 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114311147 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114311148 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114311835 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114312439 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 114313496 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 114313728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114314089 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114314311 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114316799 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114317932 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114318219 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 114318811 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114318815 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114319156 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114319164 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114319275 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114321020 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114321914 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114322518 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114323012 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114323102 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114329744 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114329966 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114330364 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114330969 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 114333393 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114339226 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114339964 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114342791 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114344344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114350472 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114352304 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114355071 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114355292 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114356044 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114359497 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114364634 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114365140 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114365900 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114367311 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114368301 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114368736 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114371946 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114372394 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114374992 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 114375687 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114376935 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114378184 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114378776 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114380266 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 114380299 G T N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 X 114380580 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 X 114381214 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114381545 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114381572 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114381732 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114382685 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114382934 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114383544 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114385091 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114385161 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 X 114385250 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114387592 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114388082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114388376 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114388991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114389289 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114389661 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114390025 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 X 114390068 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 X 114390242 G A N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.2 23 7 11 1 3 X 114390257 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 114390540 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114390557 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114390611 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114390615 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114391010 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114391251 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114391269 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114391429 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 114391431 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114391435 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 114391456 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114391513 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114391526 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114391726 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 114391769 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 114391859 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 114391863 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 114391875 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 114392074 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114392484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114392552 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114392824 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114392856 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114392863 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114392894 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114392944 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114393372 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114393373 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114393376 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114393718 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114393833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114394626 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114394708 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114394865 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 X 114394907 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114395051 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 114395310 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114395571 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114397090 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114401140 C A N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 114405633 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114406233 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114406542 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114406557 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114412625 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 X 114412903 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 X 114413430 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 X 114413688 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 X 114413882 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114416804 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114417767 G C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.176470588235294 0.0588235294117647 0.764705882352941 7 27 3 1 13 X 114418303 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 114419180 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114420352 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 X 114420360 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114420614 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114422279 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 114423496 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114424541 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114425007 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114425226 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114425817 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114426279 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114426563 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 114426848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114426955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114429896 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114443070 C A Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 X 114443670 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114447738 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 114448037 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114448392 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114449933 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114450751 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114455317 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114455869 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114457157 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114459479 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 114462706 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114467030 G T Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.235294117647059 25 9 12 1 4 X 114473706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114473874 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114473880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114474293 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 114474546 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 114478535 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114480279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114480858 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114483722 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114485038 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114488331 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 X 114491660 T C Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 X 114492270 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114497648 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114497770 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114498281 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114502522 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 114502534 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114504625 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114505311 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114508484 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114511402 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 114514070 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114514539 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114515197 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 114515201 G C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 114515853 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 114517289 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114518045 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114519749 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114523477 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114526274 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114526763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114526796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114527401 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114527541 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114528291 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114528307 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114528542 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 114530809 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 X 114536891 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114537313 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114538921 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114539968 C A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 114540273 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 114544318 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114547350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114547536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114547871 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114551929 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 114552278 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114553791 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114554243 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 114555048 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114556499 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 X 114556875 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 114558139 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114558867 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114559498 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114571115 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114571174 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114573843 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 114574776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114577415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114580267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114582469 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114582612 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114582779 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 114583058 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 114589000 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114595860 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 114597364 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114598188 T C Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 X 114599653 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114600375 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 114605788 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 114606949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114608049 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114608072 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114608777 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114610568 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 114611746 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 114612606 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114614046 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114614604 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114614852 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114617766 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 114618932 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114623793 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114624455 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114624494 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114624563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114624949 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 114625672 A G Y Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 X 114627647 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 114627821 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 114628716 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 X 114631270 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114633604 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 114634695 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114637004 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114637009 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114639348 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114640801 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114642285 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114642386 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114642779 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 114643504 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114644018 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114644322 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114647420 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 114648722 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114649497 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114650127 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114650555 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114650629 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114650887 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114651356 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114651479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114651758 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114652302 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114652360 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114652395 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114652529 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 114652872 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114652878 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114653113 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114653179 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114653372 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 114653468 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114653501 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114653824 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114653850 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 114653902 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 114653911 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 114653928 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 114654466 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114654760 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114654999 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114655363 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114655439 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114655494 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 114658659 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114662240 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114662505 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114663398 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 114664121 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114665662 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 114668033 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114669261 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114669271 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114670130 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 114671467 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 114672038 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114672194 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114672371 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114674590 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114676303 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114677378 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114677924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114680332 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 114686209 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 114688174 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114689126 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 114689131 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 114689145 T C N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 X 114689825 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114692286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114693639 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114695119 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 114696195 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114701664 T C N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 114701665 G C N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 114702391 A C N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 114704535 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114707399 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114707525 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114707790 T C Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 114711934 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114712377 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114712996 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114713920 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114717279 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114718280 C T Y Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 X 114718867 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114718871 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114719429 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 114721072 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114721565 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114721588 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114725190 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114725399 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114730352 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114731763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114732044 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114733627 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114734459 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 114735156 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114735215 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114735406 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114735467 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114736648 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114737689 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 114738063 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114738638 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114739689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114739911 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114740092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114740932 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114742164 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114742230 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114742314 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114742937 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114742969 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114742999 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114743856 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114744578 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114744778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114745316 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114745709 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114746273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114746525 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114747167 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 114747367 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 114748021 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 114748022 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 114748917 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114749514 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114749598 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114750295 A C N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 114750538 C A N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 114751538 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114752186 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114752940 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114753135 T A Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 114754418 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114755200 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114756030 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 114757587 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114758363 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114758880 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114759181 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114759310 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114759546 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114759658 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114759667 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 X 114760016 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114761339 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114761362 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114761797 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114762346 C G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 114763376 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114764002 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114764159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114766785 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114766798 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114766987 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114768729 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114770701 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 114771071 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114771695 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 114772036 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 114774085 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114775352 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114775456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114775649 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114777276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114777583 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114778952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114779019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114779048 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114783319 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114784945 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114786985 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114787403 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 114791020 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114791089 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 114791755 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114793971 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114797123 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114800315 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114804099 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114804740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114807632 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114808244 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114811473 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114812294 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114813155 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114815973 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 114817168 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114818055 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114818475 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114819318 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114819326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114821382 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114821491 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114821560 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114822604 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114822774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114822893 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114823053 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114823992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114824598 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114825921 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114825941 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114825991 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114826246 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114826247 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114826323 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114826466 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114827825 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114827836 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114830747 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114831324 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 114834195 G A N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 114835075 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114835914 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114836679 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114838627 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 114838628 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 114841221 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114844410 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114844638 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114848584 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114848635 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 114848636 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 114848825 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 114849540 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114851485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114851487 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114852519 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114852741 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114853884 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 114855131 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114858983 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 114863424 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 114864488 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 114864511 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114864513 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114865924 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114866281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114866290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114866418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114866635 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114868044 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114869646 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114869927 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114870226 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114870265 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114870328 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114870803 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114871675 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114872023 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114872024 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114877361 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114877527 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114880805 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114883162 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114885881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114888217 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114888766 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114892239 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114897435 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114898038 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 114898952 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 114898958 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 114900206 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114900597 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114902327 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114904172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114905376 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114905420 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 114908289 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 114914378 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114914775 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 114915517 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114916572 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114918154 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114919506 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 114919692 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114921046 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114921213 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114922456 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114922869 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114924714 A C Y N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 X 114925586 C G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114925828 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114928372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114933668 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114935433 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114936002 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114936626 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114937800 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114942889 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114948241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114949768 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114951532 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114951609 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114952664 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114959350 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114959807 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114960896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114963106 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 114965065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114965582 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 114976522 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114977241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114978138 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114980794 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114983117 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114983593 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 114984056 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114984118 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 114988951 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114990322 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 114992783 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114992803 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114994279 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 114994584 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 114996674 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 114997118 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 114997120 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 114997134 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 115000685 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115001410 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115004577 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115009054 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 115009449 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 115009966 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115010295 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115011782 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115014904 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 115016118 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115017387 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 115017459 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 115018679 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115023906 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 115025416 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115030006 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115031853 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115034608 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 115034848 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 115037100 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115038816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115038916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115039139 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115039810 G T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 115041370 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115044392 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115044570 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115045913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115046708 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115046890 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115050787 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115051355 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115051799 A C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 115052926 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115054208 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 115058009 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115059474 A T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 115062486 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 115069542 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 115070143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115075001 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115075217 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115075331 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115076444 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115077669 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115078032 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115079327 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115079498 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 115080645 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 115082392 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 115083528 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 115087991 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115088586 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 115089074 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115090227 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115091272 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115091845 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 115096128 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 115100999 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 115101262 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115102079 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115102548 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115105725 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115106448 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115109117 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115109143 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115111626 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115114557 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115114759 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 115114892 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115115136 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 115115701 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115116217 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 115117346 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 115118531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115119731 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115120373 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 115120498 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115120893 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115121364 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115122640 C A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 115123960 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 115124336 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115125074 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115125537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115131701 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115134385 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 115135405 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115136042 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115136861 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115141813 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 115143270 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 X 115144702 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 115147974 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 115150538 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 115151096 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115152232 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115152395 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115152464 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115153478 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115156673 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 115157361 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115158864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115159877 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115160085 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115160304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115160678 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115162787 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115163087 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 115163775 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115166061 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115166735 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 115167041 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115167591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115168802 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115169440 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115170964 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115173374 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115174257 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115174839 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115177331 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115178524 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115180752 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115185969 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115186728 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115187796 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 115188120 T G N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 X 115188266 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 115188349 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 115188639 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 115189202 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115190707 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115190875 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115191355 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115191356 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115191776 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115194240 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115194821 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115198491 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 115199682 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 115201961 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115201973 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115202259 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115202339 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 115202740 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115203705 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115203880 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115204492 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115205183 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115205503 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115205568 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115206759 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115207160 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115207649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115210270 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115212225 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115213290 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115214468 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115214938 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115214996 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 115217585 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 115219227 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115219820 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115221347 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 115222457 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 115223542 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 115224551 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 115227368 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115228956 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115230146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115232185 C T Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 115234032 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 115234692 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115235128 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115236977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115237155 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 115237165 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 115241075 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115241783 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 115241899 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115242408 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115242490 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115243543 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115243631 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115243751 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 115243980 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 115244405 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115244407 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 115245533 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115247755 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 115248933 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115249787 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115260664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115263098 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115263213 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115272162 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 115274648 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115276378 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115279571 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115279660 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115282875 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115285720 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 115285827 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115286684 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 115286686 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115287131 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115289450 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 115292321 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115293102 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 115293578 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115296799 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115299388 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 115301414 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115301657 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115304693 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115306652 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115308662 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115312342 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 115320332 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115320657 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115324285 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 115326380 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115326476 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 115327191 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115328800 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115328906 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 115331028 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115331379 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115331446 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115331543 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115331896 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 115332016 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115332037 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115334640 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115335766 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115336126 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 115336190 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115336971 G C Y N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 X 115337013 A G Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 115338214 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115341050 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115343795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115345270 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115345706 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115346030 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115347574 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115354145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115354390 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115355379 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115355698 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115359944 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 115360277 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 115362155 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115363280 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 115363660 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 115363908 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115369737 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115379474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115381502 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115384232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115384353 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115392082 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115394368 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 115394579 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115394754 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115394946 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115396965 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115397958 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115397990 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 115398084 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115398085 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115398320 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 115398442 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 115401694 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115401841 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115407552 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 115408184 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115409950 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115411504 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 115412772 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 115415953 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 115416644 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115418233 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115418437 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115418529 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115420266 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115421595 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115421727 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115421874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115424486 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115426559 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 115427576 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115430034 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 115432946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115434358 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115434606 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 115436993 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115437159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115437891 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 115439775 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 115441008 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115442670 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 115446273 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115448912 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115449515 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115451877 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115452183 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115452268 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115453542 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 115455965 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115456654 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115456769 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115459482 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 115459863 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 115460224 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115460534 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 115461281 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115461877 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 115464476 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115465401 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115469347 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115469541 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 115470856 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 115471336 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115472202 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115472255 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115472280 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115474511 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115474744 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115475266 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115476284 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 115476959 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115477401 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 115477824 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115480319 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115482243 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115486567 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 115486977 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115488322 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115493218 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 115493334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115494965 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 115495168 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115496488 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115496852 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115497154 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115503406 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 X 115513526 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 115514974 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115515815 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 115517294 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115518915 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115519076 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115519762 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115527955 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115529242 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115529579 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115529690 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115530247 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115543747 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115544263 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 115547180 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115548096 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115550778 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115551136 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115552962 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115554210 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115554352 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115554403 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115556051 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115556670 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 115557031 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 115557871 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 115558906 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115559675 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115562619 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 115564113 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 115566590 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 115567000 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 115570944 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115571943 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115572290 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115573185 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 115574605 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115579332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115579601 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115580248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115580443 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115580480 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115583696 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 115584936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115587664 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115588097 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115588098 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115588646 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115588774 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115589134 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115590298 C G Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 115595618 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115607594 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115608321 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115609762 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115610041 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115610756 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115610841 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115611640 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115612050 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115612162 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115613369 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115613755 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115614369 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115615050 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115615446 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115616189 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115616190 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115617811 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115620234 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115621446 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115623395 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115623824 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115624621 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115625475 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 115626424 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115627299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115630819 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115630820 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115631568 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115633035 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115633312 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115635901 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 115636386 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115636852 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115638605 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115639819 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115639988 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115640126 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115642540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115642618 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115643561 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115644344 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 115652638 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 115653102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115655139 A C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 115656939 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 115660034 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115660199 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115660743 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 115660953 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115663162 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115664759 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115664795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115668033 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115668857 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115669294 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115669541 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 115670163 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 115670175 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 115670689 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115672867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115673011 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 115673144 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 115675494 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115677993 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 115678080 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 115678258 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115681468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115691629 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115695976 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 115696231 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 115696330 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115696596 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115698129 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115700903 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115701489 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115704930 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115705230 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115705340 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115706125 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115707442 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115709151 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115709179 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115711035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115711895 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115713479 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115713850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115714844 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115715381 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115715623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115716069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115717657 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115720290 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115720794 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115724395 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115725845 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115726925 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115730687 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115730826 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115731896 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115732601 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115733066 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115733532 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115734674 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115734691 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115735937 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115737060 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 115737531 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115738911 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115739702 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115742018 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115742048 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115743972 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 115744245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115747282 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115748233 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115748685 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115749535 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115749894 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 115750427 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115751002 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 115751003 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 115752169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115753430 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 115753508 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115753538 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 115753561 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115755284 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115756228 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115757448 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115758646 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 115759676 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115759911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115760102 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115760946 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 115762347 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115763305 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 115764296 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115765021 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115765659 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115765662 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115765843 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115766772 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115767863 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115767915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115768334 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115768398 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115770101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115770434 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115770933 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115771254 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115772800 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 115773245 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115775284 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 115778453 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115779508 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115779626 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115780960 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115782070 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115783668 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 115783870 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115785128 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 115785389 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 115785409 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 115785414 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115785415 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115785863 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115793753 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115794061 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115794336 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115794516 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 115794641 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115795087 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115795182 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115795478 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115796130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115796554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115796569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115796817 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115797138 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115797236 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115797801 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115797802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115797850 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115798368 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115798786 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115798802 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115798811 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115798963 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115798975 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115799412 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 115799784 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 115800138 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115800824 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115801401 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115801554 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115801866 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 115802836 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 115802961 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115803629 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 115803800 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 115804183 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 115804351 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115804546 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115804671 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115804875 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115805015 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115805107 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115805121 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115805793 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115805962 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115806172 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 115806495 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115806859 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 115807399 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115807722 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115807821 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115807987 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115808804 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 115808887 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 115809141 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 115809213 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 115809706 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 115809730 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115809842 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115809935 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115810042 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115810044 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115810204 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115810348 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115810715 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 115810739 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 115810753 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 115810754 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 115810865 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 115811363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115811586 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115811627 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115811659 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115811682 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115811867 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115811896 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115811919 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115812130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115812246 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115812521 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115813434 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115813747 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115814062 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115824724 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 115824986 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115825164 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115825210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115825708 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115826211 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115826662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115827781 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115827833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115828351 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 115828475 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115828813 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115830339 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 115830626 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 115830886 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115831178 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115831417 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115832413 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115832614 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115833303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115833637 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 115836131 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115837484 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115837738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115838731 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115838891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115840784 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115843355 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115844729 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115845712 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115847565 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115848186 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 115849983 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115850557 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 115853430 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 115853719 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115854205 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115855754 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 115857318 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115859601 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 115860064 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115861112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115861132 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115863574 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 115864655 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115865646 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115866966 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115867432 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115867536 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115867766 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115868069 G A N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 115869307 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 115872332 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 115873022 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115873614 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115876530 A G N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 115877777 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115878288 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115879188 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115882380 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115882935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115884541 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115884935 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 115886267 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 115888449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115890149 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 115890373 G C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 115890590 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 115893539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115898712 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115898995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115901102 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115902265 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115905133 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115905764 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115907545 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115908594 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115908613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115911143 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115911741 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 115912571 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 115914587 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115914825 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 115916440 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115918658 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115918914 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115919573 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 115919753 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 115920935 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115921605 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 115922590 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115924788 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 115925195 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115926777 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 115927355 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115928958 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115932282 T A N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 X 115936540 T A Y N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 115937305 T A N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 115938151 T A N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 115943434 A G N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 115944022 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115944138 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115945475 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 115946208 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115946621 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115946958 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 115947002 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 115947816 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115949160 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 115949183 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115950119 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 115957290 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115958053 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 115958059 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115959518 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115961337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115961434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115961497 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115961532 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115961740 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 115962525 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 115963338 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115963603 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115963732 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115963909 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115964209 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115964249 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115964255 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115964589 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115965745 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115966078 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 115968095 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115968294 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115968448 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115968837 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115969772 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115970321 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115970379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115970711 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115970729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115971546 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 115972154 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115972809 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115973137 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 115973319 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115973593 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115976323 A G N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 X 115977102 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115977586 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115977673 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115978581 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115979551 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115989073 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115989516 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 115989993 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115990713 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115993253 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115993757 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115994129 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115994143 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115994144 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115994204 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115994239 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115995082 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 115995632 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115996593 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115996764 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 115996776 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115998295 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 115999229 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 115999505 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 115999669 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116000172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116000740 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116001141 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 116001412 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 116001786 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 116001791 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 116001969 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116002638 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116002849 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116003257 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116003911 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116004057 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116004144 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116004764 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116005553 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116005678 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116006610 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116006793 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116007453 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116007518 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116007648 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116007696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116008186 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116009271 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116009835 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116009881 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116010197 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116010258 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116010768 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116011013 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116011147 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116012370 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116012371 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116012590 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116024544 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116024804 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116025166 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116025444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116025828 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 116025840 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 116026659 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116026823 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116027333 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116028145 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.277777777777778 0.111111111111111 0.611111111111111 12 24 5 2 11 X 116028180 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116028287 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116028638 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116028801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116029681 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116029816 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116031200 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116031523 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116031784 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116032302 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116033426 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 116035340 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116035537 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116035679 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116035892 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116035978 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116037836 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 116037971 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116038947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116039700 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116040303 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116040449 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116040541 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116040655 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116040793 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116041147 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116042040 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116042518 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116043947 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 116044127 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116045149 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116045212 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116045752 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 116045818 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 116047119 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 116047484 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116047519 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116047631 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116047869 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116048354 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116048969 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116049229 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116049749 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116049864 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116050023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116051894 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116052696 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116053435 C G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 116054092 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116054688 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 116055032 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116055173 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116055323 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116055561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116055562 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116062373 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116062450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116062728 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116062872 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116063146 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116063694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116064371 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116065439 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116065615 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116065851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116066097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116067070 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116067617 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116068518 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 116068707 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116069191 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116069695 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116069728 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 116069954 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116070591 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116071662 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116073669 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116074433 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116074438 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116074568 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116075093 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116075132 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116075160 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116077030 T G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 X 116077306 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116077609 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116078438 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116079769 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116080700 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116082380 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116082389 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 X 116083290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116083734 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116083848 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116084012 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116084551 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116084964 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116086093 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116086421 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116086940 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116086977 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116087023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116087546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116088527 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116088797 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116088981 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116089209 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116089485 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116090365 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116090437 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116091176 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116091716 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 116093698 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116094562 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116094603 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116094685 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116095044 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 116095806 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116095938 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116097006 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116097089 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116097166 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116098946 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116099208 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116100246 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 116100346 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 116101343 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116101440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116102704 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116103023 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116103062 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116103159 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116103283 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116105483 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116105552 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116107084 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116107676 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116107824 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116108969 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116110305 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116110319 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116110828 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116111051 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 116111078 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 116111627 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 116112342 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116112575 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116112650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116112915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116113153 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 116113475 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116113694 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116113733 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116113774 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116114177 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116114352 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116115336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116116669 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 116116722 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116116798 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116116866 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116117094 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116117472 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116118295 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 116118405 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 116118408 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 116118677 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 116118758 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116118977 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116119028 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116119403 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116119886 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116120008 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116120348 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 116121221 A T N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 116122544 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 116123110 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 116123385 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116123568 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116125076 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116125086 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116126032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116126253 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116126254 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116126910 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 116126912 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 116127175 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 116127571 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 116127800 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116128271 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116128571 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116129045 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116129331 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116129334 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 116129938 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116130232 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116130484 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116130493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116130494 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116130746 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116131525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116131540 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116132149 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116133807 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116133844 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116134942 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116137382 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116138485 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116140066 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116140933 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116141109 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116142380 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116143293 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116143862 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116144043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116144835 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116146508 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116147166 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116147229 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116147436 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116147463 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116147841 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116150976 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116151850 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116152174 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116153124 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 116153140 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 116153160 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 116153502 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116154523 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116155328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116155899 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116156762 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116157857 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116158991 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116159110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116159456 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 116159993 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116164082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116171016 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.277777777777778 0.111111111111111 0.611111111111111 12 24 5 2 11 X 116171984 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116174921 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116174962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116175244 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116175445 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116175511 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116176033 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116176170 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116176289 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116176791 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116178393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116179258 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116179449 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116180582 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116181595 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116181891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116182870 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116183616 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116183829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116184416 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 116184846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116187315 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116188425 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116191688 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116193093 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 116194884 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116195701 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116196024 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116196774 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116196783 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116198306 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116199531 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116199727 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116200111 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116201041 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116201510 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 X 116205809 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116207960 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116209263 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116210958 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116211460 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116211712 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 X 116212666 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116213165 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116214925 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116216283 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116218690 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116219030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116219467 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116219811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116220434 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116223741 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 116224214 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116226540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116227210 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116228102 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 X 116228494 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116228780 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116231500 T A N N 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0.2 0 0.8 2 8 1 0 4 X 116232535 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 116232536 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 116232854 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 116238015 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 116238016 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 116238601 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116244199 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 116244283 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116244817 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116246298 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116246760 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116248473 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116250592 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116256134 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 116257326 T A Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 116259658 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116262384 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116263334 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116263379 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116269980 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116270795 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116270876 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116270927 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116273162 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116273669 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116273979 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116274363 T G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 116275210 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116275285 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116275777 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 116277317 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116279928 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 116281732 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 116287830 G A N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 116288371 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116289345 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116290051 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116292296 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116292540 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116293332 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 116299235 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116300852 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116305023 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116305062 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116307471 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116309809 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116310407 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116311535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116311588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116311817 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116314653 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116315290 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116315339 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116316210 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116316654 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116318300 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116318623 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116320247 G T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 X 116320751 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116322798 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116324958 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116325351 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116326416 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 116326437 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 116327444 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116327878 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 116328908 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116329187 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116329467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116330073 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116330863 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116331208 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116331785 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116334296 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116336209 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116336432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116336947 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116337329 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116340098 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116340477 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116341541 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116342825 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116343634 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116344263 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116346282 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116347200 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116347564 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 X 116347908 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116348689 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116348776 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116353403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116354020 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116355741 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116356308 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116356603 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 116356761 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 116358471 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116359006 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 116360029 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116360132 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116360909 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116362491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116362591 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116363135 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116364356 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116371617 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116371621 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116371670 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116373095 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116373922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116374161 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116374251 C T Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 X 116374559 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116379800 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116380113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116380475 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116381476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116382349 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116382415 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116382639 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116382682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116382747 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116384041 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116387720 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116387721 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116388856 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116389159 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116389575 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116389734 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 116390252 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116390698 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 116391206 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116391220 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 116391713 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116392367 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 116394033 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116394044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116394180 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.3 0.1 0.6 14 26 6 2 12 X 116394787 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116395323 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116396358 C A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116397198 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116397659 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116398027 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116399279 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 116401366 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116403949 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116405147 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116405279 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 116405662 A C Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 116411251 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 116411422 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116411463 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116411692 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 116412303 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116413722 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116413733 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116413862 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116414431 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 116415039 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116415667 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116416543 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116417092 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116417155 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 116418352 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 116419064 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 116419921 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116420249 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116421367 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116421830 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116422253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116422602 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116422694 C G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 X 116423382 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 116423645 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 116423801 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116427585 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116429474 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116429704 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116429991 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116430429 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116431230 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116431410 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116432100 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 116432628 T G N N 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 5 13 2 1 6 X 116434040 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116434197 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 X 116434403 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116434858 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116435215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116435390 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116435391 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116435508 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116438799 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116440299 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.315789473684211 25 13 12 1 6 X 116440442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116441259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116442426 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116442995 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116443344 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116444064 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116444087 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116444088 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116444190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116444927 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116445187 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116445543 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116446964 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116446977 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116447859 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116453246 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116454054 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116454095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116454653 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116455076 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 116455849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116456565 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116456929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116457354 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 116457725 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 116457748 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 116458051 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 116461933 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116461957 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116462407 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116462790 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 116462962 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116463160 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116463339 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116463400 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116466401 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 116468778 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 116469808 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116469920 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 116470245 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116471142 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 116471625 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 116472811 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116473545 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116473911 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116473941 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116474632 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116479481 T G Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 116483728 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 X 116484628 T A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 116485174 G T N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 116485286 T A N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 116485624 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 116485720 A T N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 116485883 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 116486454 C G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 116486917 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 116489434 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 116489672 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 116489948 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 116490355 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 116490762 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 116490899 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 116491728 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 116491756 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 116491832 A T N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 116492113 G A N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 116492614 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 116493143 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 116493731 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 116496854 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 2 10 1 0 5 X 116497257 C A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 116498747 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 116498795 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 116501194 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 116501374 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116501419 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116501424 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116505000 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 116505761 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116505927 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116506119 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116507515 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116507869 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116508427 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116509772 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 116510594 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116511268 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116511437 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116511505 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116511698 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116512315 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116512504 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116513378 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116513704 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116516101 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 116516225 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 116517350 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 116517437 A T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 116517902 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 116517957 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 X 116518197 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116518926 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116519195 T A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 116519366 T G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 116519652 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116520638 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 116520706 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 116521460 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116522382 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116522504 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 X 116522976 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116523415 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 116524252 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116526565 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116527553 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 116527554 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 116528221 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116528610 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 116529319 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 116529357 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 116529517 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 116529878 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 116531049 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116532788 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 116533071 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 116533653 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 116534216 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116535825 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 116535941 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116536434 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 116536675 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116538821 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116538847 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116545495 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116545946 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116546468 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116547532 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 116553777 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116554727 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116555269 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116560289 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 116561812 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116562261 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116562737 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116562811 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116562848 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116563203 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116563227 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116565983 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 116567153 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116567407 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116567432 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116568624 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116572245 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116573666 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116574380 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 116576381 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116576584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116577060 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116577870 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116579017 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116579054 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116579802 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116580050 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116580342 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116580563 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116582468 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 116584615 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116586097 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 116586224 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116586304 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116587904 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116589532 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116590842 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 116591346 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116592272 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116592679 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116594684 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116594717 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 116594721 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 116594987 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116595763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116596824 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 116598774 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116601852 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116603559 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116606347 G A Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 116606797 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 116608628 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116608638 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116609087 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116610036 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116610571 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116611876 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116614993 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116624804 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116626411 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116628917 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 116629088 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 116629191 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 116629934 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 116630640 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 116632300 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 116632573 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116632911 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 116633016 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 116633300 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116633490 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116633761 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 X 116634044 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116635157 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116635813 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116641020 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 116644713 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116645740 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116645939 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116645942 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116645944 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116647159 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116648071 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116648409 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116649957 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 X 116654870 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116655205 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116655842 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 116656348 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116656598 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116657529 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116659969 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116660944 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116661418 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116662023 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116662575 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116663867 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116665799 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 X 116665904 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116668578 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 116669331 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116670390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116670415 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116673666 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 116674334 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 116675177 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116675178 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116676435 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116677418 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116680066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116680111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116681136 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 116682432 A C N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 116692475 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 116692571 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 116694063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116695002 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116695753 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116698261 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116699141 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116705116 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 116705623 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116705740 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116707598 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116708274 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116710033 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116710103 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116711645 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116714545 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 116717904 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116722126 G A N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.533333333333333 0.2 0.266666666666667 19 11 8 3 4 X 116723045 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116723595 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116725822 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116726632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116727631 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116728772 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116729133 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 116729529 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116729862 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 116732507 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116733231 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116734728 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 116735044 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116737061 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 116737586 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116738643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116740146 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116741358 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116742570 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116743677 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116743819 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116745565 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116745745 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116746744 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116748439 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116749571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116749933 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 X 116753224 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116754241 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116754899 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116755776 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 X 116757089 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 116757390 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116757852 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116760180 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116760227 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116763170 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116763345 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 116763512 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116764935 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116765587 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 116766728 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116768991 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 116769639 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116770413 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 X 116771426 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116772030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116772175 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116772351 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116773239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116773552 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116773952 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116775400 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116779013 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116779285 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 116779996 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116782517 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116785042 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116785196 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 116785952 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116786212 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116787129 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116787362 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116787391 G T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 X 116787461 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116788950 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 116788951 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 116796733 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116797001 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116801059 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116801563 G T Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 116802191 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116802770 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116803354 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116803523 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116803747 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 116804015 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116805070 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116805348 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116806155 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116806800 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116807354 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116809161 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116809644 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116810167 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116812533 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116812977 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116813552 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116815336 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116816017 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 116816354 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116816493 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116816772 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 116817240 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 116818021 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 116818243 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116819245 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116819541 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116819646 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116820331 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116820359 C T Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.5 0.1875 0.3125 19 13 8 3 5 X 116820725 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116821528 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116822233 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116822248 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116822699 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116823235 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116823374 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116823460 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116823655 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116824449 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116824453 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116826016 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116826324 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 116826742 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 116827039 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116827072 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116827327 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116827461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116827549 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116827666 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116828099 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 116828295 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116829091 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116829439 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 116832108 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 X 116832915 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116833870 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 116834262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116834397 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116834398 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116835583 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 116835600 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116835922 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 116836476 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 116836490 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 116836709 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116838344 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 116839775 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116840360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116841321 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116841399 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116843117 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 116843411 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 116843467 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 116843831 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 X 116843913 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116844372 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 116844446 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116844634 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116846027 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116846248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116847883 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116849157 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116849422 A C Y N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 X 116849848 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116849864 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 116850077 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116851043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116851530 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116851554 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116851694 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116851857 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116852066 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116852770 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116853159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116855507 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116857860 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116858276 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 116858560 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 X 116859855 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116859917 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116859981 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116863852 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116865945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116866103 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116866280 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116867195 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116868254 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116868617 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116868764 G T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 X 116868800 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116870252 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116870880 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116872280 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116873549 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116875578 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116876293 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116876935 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116877115 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116878431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116878714 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116878772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116878921 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 116880333 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116880610 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116880684 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116882765 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 116882999 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116883308 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 116883770 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116884291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116884681 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116885318 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116885822 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116887505 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116888480 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116888608 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116889886 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116890434 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 116892216 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116892362 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116893089 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 116899682 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 116899769 T A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 116899899 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 116900558 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 116900837 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 116901137 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116901558 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 116903468 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116904531 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116906847 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116907060 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 X 116907497 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116908374 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116908757 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116908829 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116909009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116909542 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116909759 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116910352 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116910697 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116910958 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116911002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116911049 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116911455 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116911601 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116911683 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116911972 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116912095 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116912272 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116912794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116912812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116912947 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116912982 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116913155 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116913794 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116914147 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116914696 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116914965 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116915039 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116915116 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116915324 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116915448 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116915670 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116915733 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 116915783 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 116916459 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116916751 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116917064 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116917238 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116917286 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116917393 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116918630 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116918873 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116919350 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 116919726 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 116921103 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116921144 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 116921245 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116921323 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116921335 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116921396 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116921475 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116921529 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116921740 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116922030 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 116922817 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 116922973 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116923280 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116925436 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116925538 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116926375 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116926793 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 116927562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116927563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116927724 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116928261 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116928370 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116929247 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116929847 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116929862 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116930813 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116930848 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116931322 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 116931335 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 116932382 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116932696 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 116933582 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116933694 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116933727 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116933942 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116934713 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116935209 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116936641 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116938586 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116939751 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116939767 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116940399 T C N Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 7 9 1 5 2 X 116940885 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 116941453 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116941762 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 116942658 C G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 116943685 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116945210 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116947852 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116948972 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116950171 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116950993 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116951585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116951990 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116952504 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116957663 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116960427 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116964240 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 116964727 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116965343 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 116966067 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116966240 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 X 116974790 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116977032 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 116979135 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116979175 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116984730 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 116988834 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116990771 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 116998179 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 116999377 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117000355 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 X 117000599 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117001972 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117002370 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117002451 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 X 117003002 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117003939 A T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.529411764705882 0.176470588235294 0.294117647058824 21 13 9 3 5 X 117004318 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117005241 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 X 117005312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117006457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117006509 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117006512 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117007815 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 X 117008339 G C N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 X 117008425 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 117009000 A C N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.571428571428571 0.0714285714285714 0.357142857142857 17 11 8 1 5 X 117009509 A G N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 X 117009512 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117011157 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117011766 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117011778 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117012144 A G Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 X 117012336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117013416 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 X 117013687 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 117016246 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117019430 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117019621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117020623 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117021527 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117021757 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 117022274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117023819 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117023846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117024565 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117024613 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 117024933 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117025159 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117027995 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117030508 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117035064 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117036478 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 117038245 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117038660 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117041241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117041790 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117042657 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117043143 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 117044699 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 117045752 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117045818 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117049238 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 117051312 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 117051373 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 117052457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117053657 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117053800 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117053848 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117056001 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117057652 A T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 117063525 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117063857 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 117064512 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117064539 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117069337 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117069338 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117069379 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 117072201 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117072683 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117074193 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117074957 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117075416 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117077020 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117077093 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117077225 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117080625 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117080659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117080942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117081101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117081298 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117081879 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117083799 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117090721 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117090907 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 117091078 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 117091637 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117092991 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117098658 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117100876 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117105271 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117106294 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117109747 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117113102 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 117116396 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117116706 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117119307 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117120266 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117120728 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 117124329 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117125508 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117127346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117127387 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117128199 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 117132084 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 X 117133568 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117138364 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117138788 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117141572 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117153798 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117155356 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117156912 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117159401 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117160047 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117160336 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117160762 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117161562 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117163924 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117164934 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 X 117165045 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117168126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117169365 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117170284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117171236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117172712 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117172775 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117172807 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117172967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117173548 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 117173804 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117174281 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 117174806 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 117174815 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 117174832 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117175083 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 117175322 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 117177232 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117177947 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 117178331 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 117178491 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 X 117178659 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117180658 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117181336 T C N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 X 117181607 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117184061 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 117184228 A T N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 117184522 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117186496 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117187168 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117190982 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117191693 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117193076 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117202133 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 117202924 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117203219 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117203515 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117204275 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117204680 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117204856 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117205378 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117207624 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117208455 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117210007 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117210261 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117210398 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117210915 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117212215 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 117213094 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117214612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117215984 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117215985 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117216183 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117217630 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117217709 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 117217787 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 117218008 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 117223077 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 117223297 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117223787 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117224036 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117224088 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117224559 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 117225596 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117226151 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117226491 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117227491 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 117228800 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117229561 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 X 117229683 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117229783 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117229894 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117230580 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 117230697 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 X 117230856 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117231512 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117232455 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117233349 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117234132 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117234376 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117234781 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 117234842 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117234897 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 117235594 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117238038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117238490 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117238626 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 117239791 A T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 117243392 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117244275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117244348 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117245371 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117246149 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117246968 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117246998 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117247244 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117247811 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117248684 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117250444 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117251868 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117251939 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117252554 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117253818 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117254762 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117255030 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 117255373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117255707 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 117257690 C G N N 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 X 117258123 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117259279 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117259594 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117259986 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117260237 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117260248 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117261272 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117261445 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117262136 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117262606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117262710 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117264118 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117264499 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117264732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117265232 C A N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 X 117265553 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117265792 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117267567 A G N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 X 117267668 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 117269400 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117272751 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 117275946 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 117276082 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 117278850 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117279353 G A Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 X 117280127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117280764 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 117282149 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117284273 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117284340 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117284356 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117284768 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117285199 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 117285670 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117285729 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 117285730 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117285942 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 117286381 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117287393 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117288180 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117288505 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117288521 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117289274 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 117290338 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117290482 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117292107 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117293750 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117293879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117295626 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117295793 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117297692 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117299416 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 117300585 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117300775 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117301885 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117302704 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 X 117304064 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117304781 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 117305107 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117306334 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117309071 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117309546 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 117311634 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117313351 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117313658 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 117315297 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117317061 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117318222 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117318256 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117318751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117318885 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117324023 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117326157 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117326207 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117327053 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 117328602 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 X 117330207 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 117331293 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117331985 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117334352 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117334657 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 117337943 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117338226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117339898 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117340718 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 X 117340868 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117342736 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 117343932 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117348876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117349798 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 117350149 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117350196 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117353668 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117358831 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 117363703 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117367927 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117370701 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 117371249 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 117373922 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117375036 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117382244 G A N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.416666666666667 0.416666666666667 0.166666666666667 15 9 5 5 2 X 117383591 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117386142 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 117386243 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 117387901 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117388605 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117390176 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 117391002 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 117392954 A T N N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.230769230769231 0.153846153846154 0.615384615384615 8 18 3 2 8 X 117395483 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117399363 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117399743 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117404133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117404967 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117405261 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117406521 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117407582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117411415 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 117411583 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117412800 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 117420577 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117421670 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117421967 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117423606 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117429283 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117432770 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 117435909 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117441273 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117442458 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117445843 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 117447129 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117451016 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117454138 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117456273 C G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 117456542 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117458127 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 117458147 A G N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.230769230769231 0.230769230769231 0.538461538461538 9 17 3 3 7 X 117459535 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117463357 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117470813 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 117471920 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117475271 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 117477796 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 117478284 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117479333 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117480889 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117480890 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117482467 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 117484043 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117487494 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117492437 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 117492540 C A N N 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 X 117492714 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117494076 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 X 117495177 A C N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 117496375 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 117497930 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117506493 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 117511024 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 117514552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117517546 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117519391 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117520157 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117524845 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 117527357 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117527790 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 X 117527814 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117527818 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117530229 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117533725 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117535164 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117535272 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117535366 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117535962 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117536245 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117536867 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 117538917 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117538918 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117542109 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117542321 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117545808 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117545951 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117546920 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117547139 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117547377 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117549478 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 117550433 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 117553210 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117553251 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 117553253 G A N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 X 117553642 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117553669 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117554310 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117554554 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117556170 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117556171 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117556576 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117556647 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117558379 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117559175 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117559362 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 117559946 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 117560530 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117564190 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117564636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117564716 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117567224 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117567399 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117568984 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117572715 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 117574613 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 117574649 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 X 117574713 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117575977 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117579795 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117582634 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 117590414 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117593215 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117593610 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117593728 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117598004 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117601074 G T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 117602382 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 117603346 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117603819 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117604831 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117605356 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117606802 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 117607039 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 117607480 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 117607906 G C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 117609518 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117610255 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117613307 T G N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 117617443 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 117617843 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117618022 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117627231 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117628051 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117629216 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 117629953 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117630180 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 117630824 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 117631919 T C N Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0 1 0 2 2 0 2 0 X 117632551 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117633893 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117633908 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117634584 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117635423 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117636315 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117637087 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117637141 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117637614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117637668 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117638352 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117638953 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117639078 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117639757 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 117642502 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117644504 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117645129 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 117646569 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 117648463 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117652571 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117652667 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117652834 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117662762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117666470 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117667207 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 117667879 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117671018 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117677494 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117677573 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117678962 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 117681437 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117682298 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117683810 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117684340 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117685512 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 117685848 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117686833 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 117686918 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 117687687 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117688438 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 117692825 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117693236 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117694988 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117695128 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117695363 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 117696717 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117698453 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117703105 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117703420 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117703573 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117708249 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117709028 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117709611 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 117710224 C T N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 117713744 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117714090 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117718225 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117718289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117718836 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117719299 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 117719763 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 117720429 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117721140 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117723647 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117725921 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117725983 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117727900 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117729646 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 117730063 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117730797 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117732468 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117732942 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117733048 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117733657 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117733722 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117733800 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117734982 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 117735420 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 117736105 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 117736513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117736529 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117741123 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 117742153 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117744590 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 117744765 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117745279 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117746122 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117746945 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117755391 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117756518 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117757608 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117758914 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117763270 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117767446 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117770387 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117770584 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 117771873 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 117773518 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117774019 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117775703 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117778681 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117781375 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117782209 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117784353 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117787120 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117800690 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117801345 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 117801346 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 117802456 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 117804123 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117804153 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117804227 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117804906 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117804923 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117807102 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 117807299 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117807351 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117808122 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117809784 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117809785 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117811028 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117811096 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117811601 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117814464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117814638 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117814807 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117816752 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117817635 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 117817637 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 117817812 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 117818379 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117821180 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117821512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117823017 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 117823938 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 117824311 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 117824481 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 117826501 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117827109 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117828520 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117829067 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117829604 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117830866 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117831145 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117831201 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117834473 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 117838977 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 117840569 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 117840832 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117843661 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117845379 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117845671 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 117846379 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117847141 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117847261 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117850384 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 117850933 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117855045 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117859978 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117860590 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117860927 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 117861429 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117863036 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 117863046 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 117863077 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 117863299 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117863725 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 117864026 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117870704 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117872827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117873213 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117874068 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117874480 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117875829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117875942 G A Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 117876115 G A Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 X 117876178 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 117877616 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 117877631 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 117877743 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117878110 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117878114 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117879686 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117880291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117880334 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 117880656 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117881118 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117881119 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117882622 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117882855 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 117883673 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117885764 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 117885935 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117887614 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117887817 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117893112 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117894973 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117895125 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117895233 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117897522 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117898593 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117900744 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117902207 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117903300 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117903598 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 117904127 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 117906890 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 117906948 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 117907062 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117908203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117908491 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117908571 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117909098 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117910082 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 117912243 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117915903 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117916624 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 117917496 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117918475 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117918801 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117919279 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 117919669 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 117921020 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117921355 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117922574 G C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117922717 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117922852 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117924580 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117926799 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117928698 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 117930993 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117934462 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117936860 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117941245 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117944023 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 117951039 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 117951211 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 117953276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117957076 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 117959749 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117964840 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 117967328 T G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 117968729 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117968761 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117969046 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117973746 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 117974071 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117974359 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117974743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117975911 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117976130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117976627 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117976766 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117976767 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117976820 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117979716 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117980417 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117980548 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117982158 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 117984934 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 117986226 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 117987879 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 117989536 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 117990103 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117993995 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 117995586 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 117998291 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 117998773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 117998861 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118000179 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118000365 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118000429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118001358 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118001752 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118003378 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118004576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118004853 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118004939 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118006120 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 118006830 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 118007614 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118008243 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118008854 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118009140 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118009154 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118009816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118010480 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118011210 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118011624 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 118012655 G A Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 118012825 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 118013269 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118013301 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118013709 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118013824 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118013917 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118013952 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118014208 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118015853 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118016941 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118017133 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118018147 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 118019072 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118019519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118020381 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 118021500 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118021955 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118022272 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 118022312 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 118022627 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118022680 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118024097 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118024612 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118024971 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118025234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118025957 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118026416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118028454 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118032349 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118032396 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118034273 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118036338 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118037066 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118038500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118038543 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118038625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118039585 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118040620 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118041492 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118041868 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118042086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118043761 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118043809 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118043997 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118044001 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118044571 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118044713 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118044941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118045145 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118045533 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118045734 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118045740 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118045834 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118045847 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118046382 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118046779 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118047314 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 118048143 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118048361 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 118048552 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118048692 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118049134 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118049694 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118049845 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118050047 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118050394 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118050514 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118050871 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118051463 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118051625 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118051678 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118052068 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118052842 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118052993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118053022 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118053095 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118053253 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118053390 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118053566 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118053809 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118054071 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118054281 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118054368 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118054573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118054586 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118054606 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118055505 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118056003 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 118056088 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118056089 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118056374 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118056839 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118056936 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118057019 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 118057196 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118057305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118057329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118057416 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118057535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118057735 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118057871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118058151 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118058172 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118058356 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118058434 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118058723 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118058738 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118059744 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118059909 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118060003 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118060374 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 118061242 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118061297 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118061957 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118062398 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118062512 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118062534 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118062661 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118062693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118062696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118063351 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118064224 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118064645 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118065804 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118065853 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118066311 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118066340 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118066455 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118066513 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118066547 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118067604 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118067860 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118068136 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118068735 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118068874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118069876 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118071152 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118071883 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118072338 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118072382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118072594 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118079784 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 118079957 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 118080384 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118080468 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 118080547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118080823 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118082077 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118082114 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118082553 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118082756 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118083290 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118084030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118085729 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118086253 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118086405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118086995 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118088097 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 118090197 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118099087 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118099566 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118099578 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118099646 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 118102939 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118106940 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118108619 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118109691 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118111316 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 118113582 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118117438 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118118890 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118125895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118126555 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118128236 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118130881 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118132682 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 X 118132962 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118133072 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118133611 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118134007 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118134033 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 118134151 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118134601 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118135685 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 118136462 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118137530 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118139468 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118141195 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118141323 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118141729 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118142850 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 118144406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118145097 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 118145177 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 118145189 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 118145978 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 118148022 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 118150904 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 118151507 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118152695 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118153977 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118155712 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118155942 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118156864 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118156914 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118157364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118159895 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118160783 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118160819 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118160850 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118163015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118163086 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118163232 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118163264 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118163473 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118163592 C T N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 X 118163596 T C N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 X 118171872 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118174059 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118174377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118174395 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118174617 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118174732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118174817 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118175598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118175916 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118176762 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118176874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118177055 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118177325 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118177372 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118177861 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118178064 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118178331 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118180248 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118181015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118181068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118181596 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118182188 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118183234 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118183312 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 118183357 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 118184451 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118184671 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118184721 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118185025 C G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 X 118185280 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118186352 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118186588 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118186937 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118187581 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118187908 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118188141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118188870 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118189577 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 X 118190142 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 118190769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118191100 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118191240 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118191451 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118191725 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118194381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118195506 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118195593 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118196041 G T N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 118198978 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118199266 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118200190 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118200632 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118201403 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118201468 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118202414 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118204148 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118204515 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118204688 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118204774 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118207089 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118207440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118207945 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118207997 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 118208364 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118208889 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 118209184 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118209302 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118209668 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118209949 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118210407 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118210408 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 118210696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118210807 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118211463 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118211464 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118211482 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118211518 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118211890 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118211897 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118211908 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118212344 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118212569 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118212916 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118214394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118214465 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118215519 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118218013 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118218527 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118220958 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118221257 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118224339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118225755 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118227058 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118227352 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118227660 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118227967 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118228354 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118228453 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118228920 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118230647 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118231060 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118231065 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118231603 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118232444 T G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 118232560 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118232904 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118233595 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118235680 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118235841 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118236195 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118236545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118237394 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118237629 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118239708 C T Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 X 118241175 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118241347 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118243245 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118243631 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118243648 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118244148 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 118244228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118246741 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118248479 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118248758 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118249865 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 118250388 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118250461 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 118251180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118251853 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118252120 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118252593 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118254137 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118254256 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118254281 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118254883 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118255441 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118255585 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118255586 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118255972 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 118256864 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 118257005 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 118257014 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118257258 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118257721 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 118257916 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 118258830 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118260490 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118260580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118260972 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118261474 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 118261687 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 118275979 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 118276263 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118277426 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 118277433 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 118277453 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 118277630 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 118278920 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118280189 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118280268 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 118280346 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118281669 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118284012 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118284767 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118285529 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118285989 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118286536 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118287378 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118287427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118287440 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118288281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118288833 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118289117 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118289787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118290260 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118291259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118291874 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118292233 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118292352 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118293833 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118294240 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118296391 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118297144 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 118297440 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118298296 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 118299338 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118299784 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118299908 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118300414 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118301599 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 118301781 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118301953 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118302010 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118302597 C A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 X 118302869 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118302934 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 X 118303021 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118303265 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118303539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118303564 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 X 118303712 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 118303782 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118303804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118303809 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 X 118303874 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118304054 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118305383 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118305740 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 X 118305851 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118305952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118306298 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118306695 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118306897 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 X 118306959 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118306986 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118307728 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 X 118308202 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 X 118308246 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118308314 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118309028 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118309429 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118310397 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 X 118310538 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118310562 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 X 118311467 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118311512 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 X 118311600 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 118311788 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 X 118311934 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118312607 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118312874 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118313116 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118314127 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118315269 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118316909 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118317193 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 118318737 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118318825 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118318949 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118320164 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118320836 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118321853 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 118321854 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 118323146 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 118323227 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 118323951 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118325214 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118325256 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118326707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118326795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118326946 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118327601 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118328724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118329499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118329935 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118329951 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118330040 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118330160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118330166 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118330371 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118330382 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118330644 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118331131 G A Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 X 118331422 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118331684 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118331685 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118332765 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118332847 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118332933 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118332993 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 118333085 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118333147 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 118333179 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118333335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118333342 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118333406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118333749 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118334174 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118334269 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118334401 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118334412 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118334540 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118334669 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118334704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118334782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118335081 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118335193 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118335243 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 118335468 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118335469 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118335655 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 118335708 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118335777 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118335846 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118336376 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118336700 C A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 118336903 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 118337011 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118337373 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 118337641 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118337648 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118337690 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118337733 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118338150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118338368 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118338520 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118338597 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118339085 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 118339193 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 118339211 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118339851 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118340075 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118340269 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118340486 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118340571 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118340808 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118340955 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118341088 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118341373 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118341452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118341523 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118341576 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118341632 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118341821 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118342292 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118342324 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118342398 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118342542 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 118342639 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 118342764 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 118342781 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 118342849 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 118342914 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 118343203 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118343288 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118343553 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118343808 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118343977 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118344290 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118345285 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118345444 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118347034 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118347202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118348720 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118349561 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118352282 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 X 118352609 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118352701 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118353955 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118354562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118355543 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 118355849 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118356127 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118356834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118357727 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118358494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118359832 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118359890 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118362390 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118362536 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118362836 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118363008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118363119 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118363121 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118363900 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118365050 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118365123 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118365364 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118365371 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118365428 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118366098 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118367191 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118369579 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118370427 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 118371941 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 118372074 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 118373489 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118375032 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118376682 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118376868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118378923 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118379966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118380120 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118381293 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118382412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118384766 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118385464 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118385727 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118385944 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118388274 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118389028 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118389213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118390457 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 118390706 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 118390766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118391137 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118391681 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 118393258 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118393423 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 118394402 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 118394867 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118395608 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118395878 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118395884 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118397485 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118399173 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 118399709 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 118400158 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118401282 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 118401326 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 118402304 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 118402368 T G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 118403413 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118403626 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118403678 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118404371 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 118404487 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 118404809 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118405234 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118405612 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118405891 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118406086 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118406267 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118406946 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118407349 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118408315 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118408684 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118408725 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118409944 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118412170 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118415772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118419286 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118419724 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118419830 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118420063 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118420817 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118420924 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118423070 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118423489 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118423752 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118429221 G A Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 118431284 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118433769 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118433956 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118434341 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118434873 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118435446 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118435820 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118436498 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118438909 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118439490 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118440585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118444615 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118448960 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118449158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118450034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118455710 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118456180 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118456419 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118457259 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118459644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118460567 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118461645 G A N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 X 118462329 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118464161 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 118464452 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 118464473 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 118465230 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118465747 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118466226 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118467271 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118468096 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 118471740 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 X 118471822 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118473589 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118474647 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118474757 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 118474764 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 118475060 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118475114 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118475393 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118477571 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118478382 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118478989 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118487175 T C N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 118494373 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118503676 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118503938 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118503939 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118504562 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 118507360 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118508133 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 118508709 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118509841 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 X 118510684 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118511680 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118513213 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118513442 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118514020 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118515915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118516034 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118517635 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118518123 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118519148 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118519264 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118519475 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118520508 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118524482 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118525031 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118526260 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118528329 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118528393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118532290 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 118534359 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 118534443 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118534895 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 118535145 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 118536302 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118538318 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118539215 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118539788 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118542563 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118546384 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 118547178 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118547346 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118547929 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118549812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118550674 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 118552203 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 118560915 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118563564 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118565610 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118573189 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118573562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118573967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118574403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118576449 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118577041 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118578614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118579876 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118579940 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118580417 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118582413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118583504 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 118585277 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118586178 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118587017 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118589374 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 118590536 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118591043 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 118591384 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118592275 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118594517 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 X 118594798 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118596632 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118596805 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118599388 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 118600616 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118602940 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 118605922 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118608126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118608420 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118610398 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 118610928 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118612516 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 118612979 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118614730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118615723 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118615731 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118615938 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118618832 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 118619764 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118622511 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118622672 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 X 118630109 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118631517 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118631530 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 118632262 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 X 118632471 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 118632911 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118633363 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118634439 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118637244 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118638609 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118638826 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118640869 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118641056 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118642123 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118642227 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118642655 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 118642891 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118644407 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118644480 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 118647310 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118650750 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118651270 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118652601 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118654652 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118655055 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118655699 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 118656217 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118661272 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118661593 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118661695 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118662046 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118662208 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118662496 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118662894 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 118663131 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118663178 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 X 118671509 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118673239 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118675546 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118677490 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118678210 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118678698 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118679438 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118679484 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118679499 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118681445 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 118683144 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118686183 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118687391 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 118687528 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118690702 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118691042 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118691118 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118691406 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 118691461 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118691580 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118691718 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118692067 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118692328 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118693155 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 118695782 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118695983 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118696857 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118705805 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118705815 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118706158 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118707268 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118707596 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118708701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118713300 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118714289 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118714666 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118715036 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118716754 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118717755 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118718650 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118720277 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118720379 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118720966 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118721608 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118721875 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118721987 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118722031 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118722597 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118722662 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118723619 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118727417 A C N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 118728780 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 X 118729159 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118729249 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118731313 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118731522 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118736459 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118736787 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 118737066 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118737389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118738406 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 118738949 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118739187 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118740481 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 118741064 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118743490 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118744880 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118745909 G A N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 X 118747164 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118747241 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118747982 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118749071 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 118750483 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118750644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118750691 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118752000 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118754049 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118754571 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118755712 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118755837 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 118761267 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118762534 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118762890 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118763829 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118764290 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 X 118764748 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118764764 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118765260 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118765908 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118765949 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118766052 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118766787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118767096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118767894 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118768471 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118769772 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118769936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118770381 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118770823 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118771099 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118772142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118772664 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118773443 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 118774215 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118774251 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118774729 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 118774759 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118775003 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118775365 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118777239 A G N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 X 118777249 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 118777836 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118777980 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118778107 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 118778374 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 118779358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118779443 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118779473 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118780770 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118781557 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118782715 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118782789 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118782973 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 118783018 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118783189 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118783873 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118784360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118784410 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118784474 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118784475 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118786440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118786441 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118788091 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118788468 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 X 118788563 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118790651 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118791965 T A Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 X 118792349 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118793655 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118793924 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118794574 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118794650 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118795388 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118796000 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118796497 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118796554 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118797429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118797755 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 118800763 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118801967 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118804385 T G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 118804806 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118807293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118808165 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 118808749 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118809000 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118809695 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118810038 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118810319 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118810348 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 X 118811195 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118811913 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118812488 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118812635 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118813495 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118813909 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 118814237 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118814990 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 118815212 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 118815265 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 118817788 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118818272 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 118818987 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 118819093 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118819617 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118822212 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118822734 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118823553 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118823694 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118823867 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 118824412 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118824454 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118824734 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118825375 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 118825938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118827178 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118827855 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 118828024 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118828142 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118828350 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118828474 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118830029 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 118830626 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 118831880 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118832631 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118832807 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118834472 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 118835460 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 118837367 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 118837661 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118839466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118840749 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118842886 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118843297 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 118844136 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118845052 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118845077 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118845288 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118845960 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118846036 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118854485 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118856708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118857522 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 118859502 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118860503 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118861034 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 118861369 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 118861633 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 118861768 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118862081 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118863289 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118863911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118864326 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118865048 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118865680 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118865734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118867037 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118867160 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118868900 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118873135 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118874543 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118875376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118875810 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118876089 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118878222 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118879866 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118880309 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118882248 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118885597 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118886070 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118886406 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118887501 A T N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 118888395 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118889367 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118889910 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118890207 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118890954 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 118892783 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 118893622 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118897212 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118897585 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118898176 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118899053 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118899461 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118901274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118901480 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118902714 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 118903904 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118906659 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 118908320 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118908384 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118908699 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118909136 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118909452 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118909958 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118911179 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 118911614 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 118911686 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 118911914 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 118912131 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118912149 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118912235 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118912265 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118913012 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118913029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118913042 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118913162 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118913375 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 118913692 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118914910 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118916106 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118916761 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118917390 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118918270 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118918922 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 118919230 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118920212 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118921090 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118921668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118922429 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118923030 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118923182 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118923268 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118923524 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118925705 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118926302 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118927084 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118927106 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118928149 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 118929030 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118929171 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118930305 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118932236 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118933090 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118934165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118935295 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118935488 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118936916 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118939219 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118940016 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118940381 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118941112 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118941123 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118941507 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118942205 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118943580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118943876 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118943982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118944304 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118945506 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118945737 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118946646 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 118956806 A C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 118957502 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118957841 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 118958328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118958788 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118960777 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 118960833 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 118961253 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 118961861 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 118964014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118964482 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118964623 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118964685 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118964698 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118964765 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118964970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118964971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118965350 C A N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 X 118966634 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118967032 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118967175 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118967206 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118967793 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118967886 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118968094 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118968508 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118968998 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118969144 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118969200 C A Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 X 118969547 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118970127 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118970130 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118971831 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 118971847 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 118972230 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118972497 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 118973789 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118974365 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118974621 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118975154 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118975366 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118975436 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 118975943 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118976223 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118977476 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118977694 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118979909 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118980821 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118981070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118981151 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118982934 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118983080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118983356 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 118983423 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118986150 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118986191 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118987545 C G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118987792 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118988104 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118988394 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 118989621 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 118990604 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118990793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118991127 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118991978 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118992409 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118992570 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 118993469 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118994512 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 118994592 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 118996209 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 118998625 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119002780 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119002899 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119004063 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119005063 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119005687 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119008472 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119010531 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119012335 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 119012336 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 119012994 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 119021157 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119022575 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119022957 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119023557 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119023954 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119034468 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119035544 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119035892 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119036442 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119036999 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 119037722 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119038365 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119039448 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 119039683 T A N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 X 119040606 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 119041360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119041843 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119042787 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 119049018 T A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 119049053 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 119049496 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 119049763 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119053519 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119054962 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 119055180 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119055327 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119055829 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119055999 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119057523 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119057919 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 119060259 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119062061 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119070555 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119070703 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 119070718 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119070746 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119073055 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119073600 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119077118 A C N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 119077147 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 119084390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119084857 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119085107 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119086419 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119088922 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119092115 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 119094082 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119094719 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119095002 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119095276 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119095936 A G Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 X 119096408 G T Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 X 119096668 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119096989 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119098716 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 119098788 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 119100490 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119100759 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 119101021 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119102931 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119102991 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119104396 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119105469 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119105670 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119106108 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119106109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119109970 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119111543 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119112827 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119112852 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119113451 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119113961 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119114085 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119118185 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119118468 A C Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 119122295 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119124078 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119126045 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119126475 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 119126763 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119127574 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119128686 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119129266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119130822 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 119131006 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 119133419 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119134162 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119134392 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119134591 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119137194 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119137307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119137556 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119139495 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119139852 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119140733 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119141229 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119142080 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119142784 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119147267 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119149056 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119149681 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 119150644 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119150646 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119152196 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 119152690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119152941 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119154844 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119155998 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119156221 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119157028 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119158229 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119159178 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119162981 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 119163684 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119163870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119164212 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119166602 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 119167736 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119167816 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119167878 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119168491 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119169537 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119169559 C G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119169692 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119171891 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119172572 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119173352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119174686 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119182544 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119182817 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119183001 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119184639 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119185972 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119187063 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119187967 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119188137 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119188854 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119190301 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119192290 A G Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 119192833 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119193083 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119194087 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119194226 T C Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 119194836 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119195862 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119197277 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119197524 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119197840 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119198982 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119198989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119199666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119199918 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119200148 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119205057 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 119205891 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119209814 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119210711 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119211627 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119211847 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 119212485 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119212622 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 119213081 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119213219 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119214745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119215394 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119215838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119217676 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119218307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119218681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119218752 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119222733 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 119224182 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119225605 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 119225989 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119226056 C T Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 119226425 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119227682 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119227813 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119230191 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 119230724 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119230943 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119231256 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 119231288 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 119237977 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 119240147 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119240676 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 119241128 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 X 119241531 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119243234 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119243492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119244987 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119245199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119245470 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119245531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119248142 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119248392 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119250664 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119253718 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 119254032 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 119259262 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119259312 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119259942 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 X 119260134 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119260992 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 119261873 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 119264676 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 119265260 T A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 X 119267754 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 119268281 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119268786 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119268793 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 X 119270862 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119271267 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119272736 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 119274550 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119274720 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119275489 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 119275594 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 119277473 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119277767 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119278429 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119279466 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119280108 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119280499 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119280784 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119280848 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119281108 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119284169 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119285900 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119286400 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 119286593 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 119286947 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 119288261 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119288593 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 X 119289085 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119289090 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119290677 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119290785 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119291037 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119292033 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 119292635 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119292914 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119299725 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119300680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119300786 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119301171 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119301419 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119301679 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119301809 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 119302191 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 119303000 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119304247 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 119304820 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119305931 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 119311436 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 119312869 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119313213 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119313575 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119315118 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 119316799 T A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 119318826 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 119318867 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 119319063 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119321123 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119322881 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119328077 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119328650 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 X 119328715 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119329392 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119330757 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 X 119331226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119331416 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 X 119331419 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 X 119331542 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119331963 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 X 119332086 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 X 119334025 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119339093 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119344490 T A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 119345094 A C N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 119347050 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 119348055 T C N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 119351134 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 119355811 A G Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 119374953 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 119376402 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119376999 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119378040 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119378913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119379366 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119379606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119380408 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119381987 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119382594 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119382949 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119383007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119383430 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 119384045 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 119385306 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119385424 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119385853 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119386793 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 119394707 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119395161 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119395597 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119395816 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 119396899 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 X 119397875 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119398049 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119398859 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119398863 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119398955 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119400440 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 119400576 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 119401174 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119401208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119401289 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119401506 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 X 119402360 A T Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 119402516 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119402556 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119403596 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119404444 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119404485 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119406269 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119406432 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119406568 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 119407185 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119407545 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119407597 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119408106 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119409029 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119409861 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119409925 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119413651 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119414936 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119415627 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119416203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119418518 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119418789 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119421402 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119421824 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119421832 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 X 119422518 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119423414 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119423962 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119424936 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119425385 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119425552 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119425723 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119425831 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119426482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119426534 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119427643 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119428926 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119431389 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119433411 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119434135 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119434339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119435233 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119436125 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 X 119436207 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119437134 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119437265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119437507 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 X 119437528 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119437679 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119437779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119445020 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119445588 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119445674 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119445908 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119447363 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119447364 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119449229 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 119453858 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119454230 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119455162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119455490 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119456284 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119462882 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119463233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119463346 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119463381 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119463489 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119464208 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119465311 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119466830 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 119467219 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119468299 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119468599 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119468600 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119470790 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119470792 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119475309 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119475816 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119476532 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119477662 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119479088 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119479338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119479553 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119479686 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119479701 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119480230 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119480787 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119480888 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119482267 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119482287 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119482792 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119483327 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119484238 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119484581 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119486048 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119486469 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 119486588 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119488694 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 119489654 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119490604 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119491169 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119491423 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119492384 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 119492458 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 119492671 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119493494 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119495474 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119496044 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 119496240 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119497281 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119497814 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119498257 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119502112 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119503897 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 119507863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119509758 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 119509888 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119510504 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119510718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119510847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119511238 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119511986 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119512001 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119513189 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119513242 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119513808 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119514299 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 119514402 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119514961 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119515020 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119515865 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119516172 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119516324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119516940 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119517076 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119517254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119517258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119517312 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119517341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119517377 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119517713 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119517878 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119518029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119518182 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119518399 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119518811 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119518814 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119518851 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119519187 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119519312 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 119519559 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119519572 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119520771 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119520834 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 119521143 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 119521262 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119521550 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119521625 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119521695 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119521712 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119521833 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119521878 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119521998 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119522542 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119523032 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119523267 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119523804 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119524059 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 119524280 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119524606 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119524670 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119524716 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119524901 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 119524997 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 119524998 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119525130 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 119526276 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119527108 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119527746 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119527841 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 119528008 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 119528452 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119528468 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 119528955 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119529051 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119529080 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119529955 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119530477 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119531193 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119531214 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119531508 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119531613 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119532502 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119533008 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119533641 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119534361 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 119534459 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119534554 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119535510 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119536721 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 119536909 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 119537044 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 119537188 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 119537386 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 119537521 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119538083 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119538515 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119538900 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119542612 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 119542845 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119543201 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 119543798 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 119545063 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119545158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119545238 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119545845 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119545989 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 119546493 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 119547411 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119548292 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119549071 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 119549324 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119550232 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119550434 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119550656 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119551746 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119552039 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119552222 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119552669 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119555002 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119555014 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119555297 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119555377 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119556093 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 119557721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119558003 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119558029 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 119558363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119561335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119562061 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119562432 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119562564 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119563616 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119565329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119567157 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 119567500 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 119567677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119568377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119568502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119568562 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119568745 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119570125 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119570161 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119570343 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119571256 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119571549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119571972 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 119572621 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 119575495 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119576234 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 119576524 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119577433 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119580422 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 119580559 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 119584916 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119586135 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119586334 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119586765 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119587088 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119587430 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 119588081 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119588334 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119588675 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119588681 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119588924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119589891 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 119590332 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119591400 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119591501 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 12 24 0 12 6 X 119591690 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119592600 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119593293 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119593519 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119594683 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119594893 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119595211 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 119595612 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 119596695 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119596893 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119598811 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119599715 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119602970 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119603646 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 119605649 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119606353 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119609502 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 119609762 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119610093 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119610285 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119612079 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119612570 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 119620056 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119622024 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119623319 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119624963 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 119628022 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119628071 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119628699 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119629588 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119630049 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119630509 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119631475 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 119633504 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119634385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119634666 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119635825 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119636170 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119636308 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119636500 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119637601 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119638760 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 119639795 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119640201 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119641930 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119643485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119644809 C G Y N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 119645334 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119645663 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119646314 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 119646545 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119649985 A T Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 119650791 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119652136 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119654099 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119655068 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119655153 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119655180 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119655502 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119657268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119658011 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119658364 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119659199 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119661403 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119661684 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119663790 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119663956 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 119665085 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 119665527 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119665980 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 119672081 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119672389 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119674153 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119674173 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119675071 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119676025 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119677436 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119677817 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119679693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119681314 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119681412 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119683285 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 119683309 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119686697 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119691817 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119692703 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119693077 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119694461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119695164 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119695720 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119698951 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119703394 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119704093 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119705386 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119705576 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119707384 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119708385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119710634 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119711980 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119718902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119719163 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119719426 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119727202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119728329 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 119728571 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 119732855 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119733872 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119734799 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119736897 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119738176 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119738643 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119739673 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119740310 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119741942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119742950 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119745576 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119746747 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 119747554 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119748698 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 119748828 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119749549 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119750339 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119750435 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119754423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119754930 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119756857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119759120 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119760264 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119762252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119764122 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119764639 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119765527 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119766021 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119767764 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119768668 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 119772147 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 119775381 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119775427 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119776504 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119777539 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119778222 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119780155 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119780396 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119780780 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 119780809 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 119781268 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 119781658 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119782138 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119782581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119782835 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119784234 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119791433 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119791450 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119791451 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119792101 G A Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 119793343 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119793644 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119793716 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119793795 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119794579 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119800522 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119805198 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 119807357 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119807413 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119807875 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119808289 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119809586 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119810941 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 119811954 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 119814647 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119815007 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119817393 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119818054 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119821059 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119821168 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119824033 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 119824061 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 119827493 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119827618 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119828369 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119829327 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119830425 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119830665 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119832885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119834458 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 119835335 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119836627 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119837547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119837671 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119848220 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119849595 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119850927 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 119853069 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119853623 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119853834 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119857116 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 119858147 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119859113 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 119866405 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119867020 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119867129 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119872757 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119873192 G T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 119873627 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 119873873 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119874751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119874947 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119874966 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119875045 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 119876072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119876406 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119876484 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119877102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119878631 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119880047 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119880178 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119881474 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119881758 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119882249 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119882852 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 119883164 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119883698 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119884058 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119884072 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119886163 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119886424 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119887831 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119888990 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119888991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119889390 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119889670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119890912 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119891067 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119893135 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119894537 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119895939 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119895940 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119896482 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119896659 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119896833 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119897857 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119897934 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119899299 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119900985 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119901942 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119902275 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119902496 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119902622 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119903208 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119903367 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119903947 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119905127 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119907379 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119907395 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119907916 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119908632 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119910200 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119910783 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119910851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119911211 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119911926 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119914976 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119915211 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 119915503 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 X 119916376 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119916625 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119919469 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 119920226 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119920311 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119920769 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119922462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119924856 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119925305 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119925442 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119926265 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119926443 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119926538 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119926779 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119927143 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 119927333 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 119927425 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 119927621 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 119927731 C A N N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 X 119927828 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 119928342 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119928420 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119930304 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119932068 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119932438 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119933294 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119933295 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 119933380 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119934084 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119934793 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119936332 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119938100 G C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 119938241 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119938284 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 119938306 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119938596 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119938767 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119939642 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119940363 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 119940406 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119940722 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119941587 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119942016 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119942738 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 119944005 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 119944433 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119944572 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119945396 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119945930 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119946250 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119946622 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119946703 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119947322 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119947896 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119947955 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119948021 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119949807 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119955349 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119956319 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119956994 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119957185 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119958252 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 119958502 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 119960031 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119961797 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119962707 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119963514 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119964588 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 119966029 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 119966153 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119968137 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119968858 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 119971164 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 119971168 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119972927 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119973629 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119974328 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119975517 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119975770 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119987889 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119988393 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119988989 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119989634 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119989931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119991370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119992171 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 119992409 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 119993142 A C N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 119993683 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119994106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119994772 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119995554 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119996148 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 119996330 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119996721 A T N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 119997163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119997216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119997810 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 119998133 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119998943 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 119998988 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 119999245 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 119999689 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 119999912 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 120001441 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 120003324 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 120003988 T A N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 120004070 A C N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 120004723 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 120005199 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 120007787 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 120007918 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 120008898 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 120009626 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 120010389 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 120010853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 120011371 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 120012812 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 120015036 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 120024686 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 120025245 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 120025963 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 120027261 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 120027272 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 120028176 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 120029269 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 120030594 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 120031046 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 120031386 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 120031550 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 120032502 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 120032786 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 120033164 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 120033337 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 120034097 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 120034716 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 120035217 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 120035767 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 120035812 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 120035831 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 120035931 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 120036544 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 120040204 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 120041590 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 120042049 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 120043403 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 120044404 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 120044405 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 120044903 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 120045235 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 120045460 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 120047135 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 120047655 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 120048156 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 120048294 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 120048382 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 120048833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 120048945 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 120049191 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 120051244 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 120051786 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 120052815 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 120053865 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 120054513 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 120055008 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 120055009 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 120055710 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 120056306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 120056462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 120057560 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 120058066 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 120058760 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 120058768 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 120060593 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 120060606 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 120061067 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 120063411 A C N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 120064565 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 120065351 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 120065515 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 120065816 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 120066049 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 120066364 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 120066407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 120067012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 120068552 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 120070023 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 120070036 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 120070256 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 120070572 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 120072754 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 120073005 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 120073393 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 120075213 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 120075519 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 120077222 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 120077799 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 120077944 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 120078392 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 120078444 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 120079012 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 120079654 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 120080027 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 120080048 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 120080515 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 120081263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 120081952 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 120082060 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 120082252 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 120082911 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 120083297 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 120083959 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 120084565 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 120085828 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 120086080 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 120086119 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 120086467 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 X 120088817 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 120090830 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 120091112 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 120098847 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 120099064 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 120099193 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 120099515 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 120100064 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 120100184 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 120101339 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 120101944 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 120102868 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 120103214 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 120112253 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 120112523 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 120112725 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 120114810 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 120116873 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 120118042 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 120120950 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 120123779 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 120123924 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 120124331 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 120128324 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 120130854 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 120131497 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 120131613 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 120139032 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 120139300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 120146146 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 120192797 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 120200485 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 120201889 G C Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 120203352 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 120207188 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 X 120208378 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 120208391 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 120210803 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 X 120211125 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 120212712 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 120214803 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 120218407 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 121164412 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 121212575 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 121212826 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 121212963 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 121213334 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 121216539 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 121217558 G C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 121217570 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 121228165 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 121228715 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 121229097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 121229103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 121229104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 121229547 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 121230523 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 121232073 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 121234826 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 121237687 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 121237738 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 121238522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 121245368 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 121254286 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 121254343 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 121254385 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 121254457 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 121254655 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 121254747 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 121257664 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 121257676 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 121266200 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 121270047 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 121270899 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 121270917 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 121272209 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 121272649 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 121274723 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 121277070 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 121278692 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 121281860 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 121282200 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 121282341 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 121285340 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 121293125 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 121294212 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 121296908 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 121301137 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 121305850 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 121311060 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 121312852 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 121315185 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 121315487 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 121315691 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 121315718 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 121315821 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 121316059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 121316494 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 121316876 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 121319081 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 121319928 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 121323128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 121326177 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 121326274 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 121326862 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 121329484 A T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 121338231 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 121338900 T G N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 122688772 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 122688862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 122690186 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 122690483 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 122690520 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 122700134 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 122705485 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 122710997 C A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 122712293 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 122713123 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 122713913 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 122716231 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 122720758 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 122721165 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 122723997 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 122724749 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 122724848 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 122725021 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 122726648 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 122728380 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 122729189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 122729476 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 122730370 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 122731747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 122733526 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 122733558 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 122733803 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 122734018 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 122734020 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 122739315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 122739344 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 122740024 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 122741459 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 122749015 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 122749346 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 122749535 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 122757987 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 122757998 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 122758269 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 122758435 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 122759172 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 122760191 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 122761132 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 122764154 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 122764291 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 122764983 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 122765873 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 122768306 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 122769288 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 122769799 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 122770035 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 122770987 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 122771332 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 122775512 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 122776108 T G N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 122778090 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 122788157 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 122790307 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 122790842 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 122791850 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 122792050 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 122792647 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 122794536 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 122796885 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 122797370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 122797893 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 122801454 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 122801847 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 122802001 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 122802298 A C Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 122810817 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 122811275 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 122811777 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 122814871 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 122815214 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 122815574 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 122817473 A T Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 122817868 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 122819294 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 122819750 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 122823299 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 122823700 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 122824755 A C N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 122826014 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 122828388 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 122828683 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 122829418 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 122830173 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 122838285 T G Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 122838818 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 122840861 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 122841633 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 122842219 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 122842395 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 122843878 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 122850451 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 122851455 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 122851742 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 122852339 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 122852651 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 122873843 A C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 122873877 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 122876114 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 122877795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 122880341 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 122880367 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 122883986 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 122887353 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 122893216 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 122893247 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 122895848 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 122896390 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 122896826 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 122897016 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 122897372 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 122898573 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 122898815 G T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 122899325 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 122899989 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 122902146 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 122903089 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 122903718 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 122907517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 122908415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 122910147 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 122910702 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 122910720 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 122912062 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 122912423 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 122912984 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 122920802 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 122922581 A T Y N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 122922729 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123016703 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123017001 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 123017592 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123018304 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123020004 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123022404 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123022531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123023117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123025799 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123027331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123027975 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123029093 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 123029517 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123029606 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 123031595 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 123036794 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 123037953 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 123039723 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123039843 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123043984 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 123044402 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123046199 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123046734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123055319 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123057435 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123058418 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123060484 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 123067349 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123067792 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123072602 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123073268 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 123074708 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123077085 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123077865 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 123084785 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123087051 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 123091031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123099813 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123102064 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123102204 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123102283 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123103185 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123104367 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123106849 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123107774 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 123108151 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123108202 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123112989 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123114652 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123115109 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123115420 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123116961 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 123118875 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123121356 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123121562 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123122110 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123122884 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123123587 C A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 123124039 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 123124074 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 123124374 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123125273 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123125395 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123125783 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123126252 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123126542 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123126671 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123127171 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 123127431 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 123129908 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123130723 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123130771 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123131649 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123132512 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 123132735 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 123134479 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 123135932 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123136281 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123138105 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123138184 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123156826 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123156878 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123159259 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123161269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123162267 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123164440 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123165427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123165675 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123166016 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123167132 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123167327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123167866 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 123168925 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123169344 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123170090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123171367 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123173103 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 123173836 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123173885 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123174664 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 123175704 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123175708 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123176038 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123176678 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 123176737 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 123177595 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123177928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123178561 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123179043 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123179090 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123179957 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123182768 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 123183399 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123186598 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123187229 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123191325 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 123207243 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123210697 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123211949 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123212214 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123212896 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 123219391 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 123219474 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123225376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123226655 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123227200 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123227530 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 123228892 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 123229802 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 123230067 G T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 123231877 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 123234074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123234449 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123235314 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123238891 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 123239119 C A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 123239182 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123239732 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123241198 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123241944 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123242807 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123245125 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123246018 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123247007 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123247193 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 123250789 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123253668 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 123254313 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 123255043 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 123258502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123259796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123261071 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123262079 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123262216 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 123262723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123275166 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123275248 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 123275841 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 123277107 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123277696 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123277815 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123281872 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123285338 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 123285509 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123285592 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123288101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123289589 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 123290452 C T N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 123290803 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 123291266 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 123293322 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 123293526 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 123294216 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 123294745 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123296780 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 123298584 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123298613 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123300042 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123300275 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123313965 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123314331 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123315447 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123316158 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123318338 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123319294 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123319390 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123319833 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123322469 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 123322915 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 123322926 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 123323032 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 123323172 G T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 123324588 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 123326504 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 123329549 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123329720 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123330407 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123332181 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123334518 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123334621 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123335558 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 123336643 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 123336748 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123337520 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 123340800 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123344876 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123345243 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123345734 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123346698 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123355512 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 123365239 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 123367231 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123368756 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123368905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123369848 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123371595 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123371897 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 123373827 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123381336 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123382965 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 123384143 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 123386182 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123386587 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 123387916 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123388637 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123399336 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123404112 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 123404339 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123417431 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123420132 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123423900 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123424314 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123425182 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 123430161 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 123433358 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123433367 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123439390 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123443605 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123449701 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123450452 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123460275 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123461116 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123466144 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123466152 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 123466385 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123466819 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123472940 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123476090 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 123476284 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 123476321 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123490331 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123497348 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 123497563 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 123499612 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123500943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123501714 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123502570 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123503360 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123503954 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123505045 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123514146 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123515607 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123516359 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123517055 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123519687 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123526342 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123526545 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 123530577 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123531373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123534744 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 123534756 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 123545801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123546116 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 123548152 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123549996 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123550386 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 123550432 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 123550698 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123561736 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123562142 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 123564803 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123566210 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 123568718 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123568856 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123569670 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123570410 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123570481 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123570787 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123570820 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123570971 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123574233 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123577391 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123580602 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123582062 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123582065 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123582354 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123584082 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123584102 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123584843 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123587824 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123590925 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 123592597 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 123592868 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123595212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123595923 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123596844 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123597926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123598632 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123598866 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123601551 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123601565 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123602697 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 123603673 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 123603829 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 123604304 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123604668 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123605999 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 123607240 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123607319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123607887 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 123608825 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123609266 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 123610947 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 123610996 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123611304 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 123611647 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 123611927 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 123612343 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123612519 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123612787 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123613020 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123613263 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123613694 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123614053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123614447 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 123615332 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123616945 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123617126 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123618296 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123618930 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123620044 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 123620677 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123620730 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123621300 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123621657 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 123621927 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123622143 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123622230 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123623966 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123624529 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 123625200 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123626673 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123627851 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123629856 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123630181 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123630307 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123630764 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 123632006 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123632305 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123633152 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123633496 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123633706 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123635034 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123635587 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123636665 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 123636890 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 123637275 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123638157 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123639609 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123640653 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 123641410 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123642857 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123643650 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123644126 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123644692 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123647620 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123648216 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123648336 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123648562 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123648875 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123648894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123649502 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 123650007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123650032 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123651920 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123652382 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123655149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123656335 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123656477 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123656633 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123656874 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123666084 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123669729 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 123674071 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123675167 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123675799 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123675893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123676061 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123676450 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123677483 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 123678720 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123678721 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123679024 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 123680000 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123680317 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123680498 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123680894 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123681296 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 123681367 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123685236 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123686599 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123687676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123689486 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123689996 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123695200 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123696234 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123697704 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123698370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123699287 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123709041 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123712078 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123712178 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123714073 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123715759 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123716275 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123716416 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123716860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123717612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123719736 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123724109 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123725762 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123725898 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123735679 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123737928 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123738641 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 123739164 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123739486 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123739504 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123740878 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123741318 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 123742367 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123742977 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 123743238 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 123744041 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123745130 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 123747249 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123747503 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123747652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123747981 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123749551 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123750745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123751767 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123753512 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123753779 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 123753849 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123755302 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123756773 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123757885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123758176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123760399 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 123760482 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123761448 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 123762466 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 123763136 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123763884 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123767006 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123769279 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123770854 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123776786 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123777068 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123778192 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123779440 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 123780196 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123781061 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 123783295 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123783926 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123784461 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123784520 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123784691 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123785137 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123785599 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123785605 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 123785782 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 123786630 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123788717 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123788898 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123791246 C A Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 123791816 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123794548 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 123795669 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123796240 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123796357 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123797546 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123798334 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123800179 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123801143 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123803034 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 123810608 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 123814674 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123816437 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 123816724 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123819820 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123821076 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123823524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123823789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123823932 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 123824196 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123824672 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123824708 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123825213 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 123825722 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 123826841 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123827664 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123830249 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123833515 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123834297 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123836044 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 123837454 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 123837466 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123839497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123841266 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123841485 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123842660 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123844663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123846059 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 123848560 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123851205 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123853550 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123853568 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123855862 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 123856226 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123857022 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123857539 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 123858518 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123859397 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 123860505 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123861201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123861930 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123862331 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 123863320 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123863609 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123864913 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123865471 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123865477 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123865511 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123866172 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123866476 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123866796 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123867156 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123868250 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123869824 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123870492 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123870885 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123876283 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123877056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123879663 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123879815 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123880376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123888768 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123890311 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 123891589 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123892205 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 123901904 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 123902433 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123903139 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123903148 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123903496 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123903503 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123912449 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123913228 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 123913532 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 123915240 T A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 123916060 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123916321 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123918533 C G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 123923812 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123926788 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123927308 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123929623 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123931826 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 123934504 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123934784 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 123935929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123937357 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123937449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123937495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123937548 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123938127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123938470 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123939561 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 123940476 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123940876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123941531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123943714 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123945543 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 123947216 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123947768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123948331 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123949181 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 123951393 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123951561 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 123952444 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123955432 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123956286 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 123956701 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 123956721 A T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 123959002 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123959098 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123961229 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123963316 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 123963883 C A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 123963992 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123964217 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123967448 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123967513 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123967745 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123968513 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 123971868 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 123972915 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 123973360 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123973840 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123976437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123976751 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123976860 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123978380 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 123980185 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123980209 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123980677 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123981886 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123982359 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123982984 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 123983264 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123983730 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123985735 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123987609 C A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 X 123987631 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123988320 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123988521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123988622 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123988720 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123990519 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 123991150 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123992663 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 123993741 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 123996984 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123999312 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 123999430 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 124000645 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124000837 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124001130 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124001727 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124003245 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124003916 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124005791 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 124008960 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124008972 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124009011 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124009544 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124009883 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 124011186 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 124011582 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124011774 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124012147 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 124012882 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124019086 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124019930 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 124020699 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124023954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124024480 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 124025866 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124026621 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124031598 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124031919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124032282 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 124033252 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124036144 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124038393 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 124039438 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 124042709 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 124043345 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124043660 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124044285 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 124044481 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124047351 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124048285 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124049037 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124049527 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 124049542 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124050396 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124051330 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124051962 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124053025 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124054199 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124054200 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 124055211 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 124056044 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124056692 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124056800 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124057481 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124058383 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124058397 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124059174 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124059784 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124059941 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124060220 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124061204 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124061331 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124061764 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 124068918 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 124069069 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 124070249 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124070813 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124071426 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 124072076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124073552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124074759 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 124075228 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124075712 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 124075748 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 124077609 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124079116 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 124082197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124083668 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124084686 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124085551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124086883 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124087986 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124088395 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 124089540 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124092330 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124093094 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124093544 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124093923 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124094764 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124095817 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124095819 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 124095831 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124095866 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124100254 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 124101179 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 124101187 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 124102343 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124102493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124102932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124104394 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 124104768 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124104846 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124106815 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124106881 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124107801 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124108121 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124108150 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124110518 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124110691 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124110858 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124111983 A T N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 124112557 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 124112908 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124113417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124114340 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124114592 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124114840 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124115113 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124115150 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124123037 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124124719 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124124962 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124126932 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 124127644 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124127746 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124128787 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124131715 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124138650 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124142156 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124142524 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124147885 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124154504 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124155075 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124158320 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 124159392 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124159993 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124160159 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124160268 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124160918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124163095 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124163711 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124167150 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124168964 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124170163 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124170164 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124171871 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124172044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124172791 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 124173191 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 124173752 C A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 124177065 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124178477 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124178947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124180656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124181832 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124182055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124182641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124183692 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124184240 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124185086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124185550 A T N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 124191225 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124193271 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124193281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124200274 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124202920 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124203188 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124204155 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124204158 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124205678 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124206056 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124206673 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124210486 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124212166 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124212214 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124212559 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124214719 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124215167 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124215566 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124215862 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124217793 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 124219798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124221771 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124225933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124225996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124226017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124226027 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124227421 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 124227694 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124230055 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124230070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124231302 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124234278 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124234333 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124236715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124237299 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124237948 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124239623 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124240149 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124241364 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124241444 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124241454 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124244403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124245002 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124245216 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124249398 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 124250213 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124250395 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124250583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124251554 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 124252804 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124252834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124252886 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124253320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124254868 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124256420 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124257705 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124258464 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124266935 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124267684 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124269841 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124270611 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124271245 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 124273661 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124277091 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124278795 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124280434 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124282465 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124284852 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124285331 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124285819 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124286965 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124287982 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124288354 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 124289361 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124290676 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124290859 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124291083 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124291372 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 124295319 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124297110 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124298637 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124299374 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124300006 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124300252 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124300326 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124300866 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124300878 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124303294 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124304158 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 124304260 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 124304400 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 124305685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124305739 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124306948 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124307323 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124307397 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124307618 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124307960 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124308744 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 124308912 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124309919 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124311011 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124311205 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124311437 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124312130 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124312945 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124313002 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124313365 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124316034 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124316305 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124316326 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124316713 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124317113 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 124318278 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124318379 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124319052 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 124319862 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 124320641 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 124321175 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124323363 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124323507 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124323613 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 X 124323626 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124324432 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124324788 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124324798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124326256 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124326794 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124327370 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124327723 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 X 124334901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124335094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124336747 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124337014 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124339811 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124340693 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124341014 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124341523 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124343446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124343535 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124344397 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124344419 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124344433 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124346202 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124346537 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124347583 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124347701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124348211 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124349466 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124349670 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124350471 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124351589 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 124351831 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 124352629 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124355523 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124355700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124356390 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124356438 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124356439 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124357850 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124357916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124360128 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124360177 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124362410 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 124362671 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124363310 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124363649 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124365247 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 124365329 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124365715 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 124367827 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124370192 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124370508 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 124371425 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124371531 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 X 124372453 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124374777 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124375158 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124375204 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124375829 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124376193 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124376429 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 124378034 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124378298 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124379899 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124381025 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124382590 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 124382595 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 124383268 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124383674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124384546 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124385796 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124386178 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124386435 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124386661 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124386905 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 124387193 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124387346 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124388737 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124390121 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124390546 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124391847 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124394649 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124394818 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124395359 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 124395432 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124395634 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124395671 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124396252 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124396357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124396479 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124396771 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124397362 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124397518 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124397560 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 124399212 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124401038 T C Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 124401457 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124401777 C A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 124402698 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124402778 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124403493 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124403550 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124403634 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124404237 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124404612 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 124405898 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124406939 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124407300 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 124407689 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124408797 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124409494 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124409495 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124409682 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124411034 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124413716 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124414165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124414565 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124414581 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124415448 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124415882 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124416201 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124416585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124416686 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124417323 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124417506 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124418601 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 124419197 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124419321 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124420063 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 124421021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124421986 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 124422483 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124422596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124423285 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124423720 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124423968 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 124424280 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124424706 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 124425761 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 124425903 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 124427119 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 124427859 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124428260 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124428617 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124430384 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124431216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124432028 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124432170 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124433117 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124434285 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124435771 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124437400 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124437742 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 124438080 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124440670 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124440853 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124441092 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124441226 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124442038 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124442368 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124442756 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124444614 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124446374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124448260 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124449315 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124452648 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124453630 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 124457518 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 124457793 C A N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 X 124458270 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 124458722 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124458737 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124459032 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124459487 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124460728 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124461015 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124461171 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124461314 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124461970 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 124463741 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124465126 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124465293 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 124467516 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 124468090 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124468574 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124469183 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124470108 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124470278 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124470285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124470356 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124476403 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 124476554 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 124477365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124479973 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124480091 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124481079 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124482252 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124483150 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124483307 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124484131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124484454 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124484850 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124485332 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124485787 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124486036 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124487357 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 124487452 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124487492 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124487818 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124488044 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124488048 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124488270 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124499842 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124499942 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124500226 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124500317 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124500823 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124501051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124501079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124501406 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 124501430 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 124501483 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 124501998 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124503290 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124503491 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124503492 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124503848 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124506067 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124506407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124506598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124506683 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124507067 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124509120 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124509146 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124512663 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124512920 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124513075 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 124513081 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124513087 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124513205 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124513599 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124514280 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124514913 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 124515084 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124521613 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 124522435 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124522814 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124523938 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124524487 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124524766 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124525165 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124525822 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124526713 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124527658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124527891 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124527961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124529628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124530485 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124530824 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124531121 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 124533961 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124533980 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124534561 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 124535057 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124535472 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124535476 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124535607 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 X 124536067 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 124536070 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 124536181 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 124537518 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124537631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124538610 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124541182 G C N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 124541664 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 124543568 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124543599 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 124543622 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124544468 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 124544549 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 124544711 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124544953 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124545874 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124546083 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124546567 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124546953 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124549189 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 124549891 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124550500 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124550789 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124552327 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124552476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124552625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124553467 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124554628 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124556181 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 124556249 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124557310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124560414 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 124561548 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124562382 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124562878 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124564133 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 124564511 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124564549 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 124565880 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 124568582 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124568592 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124569544 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124570007 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 124575218 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124579809 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124579881 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124581941 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124582306 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124582330 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124583326 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 124583842 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124584195 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124585251 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 124587392 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124588879 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124591596 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124591962 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 124592129 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124593678 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124594347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124594390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124594762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124594939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124595067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124595377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124595611 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124595978 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 124598709 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124599438 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124599521 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124599638 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124600498 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124600841 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124601657 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 124605794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124605844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124606989 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124608356 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 124609003 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 124610392 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124610842 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 124613516 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 124614002 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 124616379 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124622128 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 124625003 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124625018 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124628127 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124629087 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124630206 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124630270 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124632755 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124633401 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 124634609 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124634862 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124634970 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 124636803 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124637602 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124640292 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124642334 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124642912 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124644027 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 124644930 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 124647037 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 124649383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124650174 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124650198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124650357 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124651641 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124651725 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124651854 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124657348 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 124658452 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 124658917 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 124660431 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124663563 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124663585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124668937 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124672132 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 124672133 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 124672320 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 124672373 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 124674530 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124678631 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124680295 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124681912 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124683003 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 124683014 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 124685328 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124687921 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124688643 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124688665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124691297 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124692273 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124692499 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124697126 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124698701 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124700309 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 124702366 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124707287 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124707541 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124708321 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124708335 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124708428 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124709635 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 124710165 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124710633 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124710849 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124711063 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124711113 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124711456 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124711488 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124712630 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124712742 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124712749 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124712765 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124713307 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124713648 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124713734 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124714077 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124715669 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124715670 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124715686 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124717994 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124719088 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124719614 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124723647 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124725210 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124725426 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124726074 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 124726108 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124726943 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124728318 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124729099 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124729130 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124730009 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124730656 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124730660 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124730854 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124731633 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124731905 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124733756 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124734715 C T Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 124734744 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124735382 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124736126 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124736159 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124738740 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124739231 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124739874 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124739892 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124740349 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124741580 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124743589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124745814 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124745928 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124746470 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124747221 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124748396 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124748535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124748690 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124748779 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124749396 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124749613 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124750268 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124753209 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124754616 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124754792 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124756340 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 124757491 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124757640 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124762942 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124763413 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124764064 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124764255 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124764770 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124764776 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124764781 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124767421 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 124767776 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124775453 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124776481 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 124782010 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124783208 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124783209 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124783641 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124783966 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124785125 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124785465 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 124785696 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124786094 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124788607 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124795988 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124796146 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124796147 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124798724 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 124798875 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124799426 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124799872 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 124799994 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124800281 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 124800301 C G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 124800384 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 124800498 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124800687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124800822 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124800924 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124803159 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 124803371 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124803741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124803811 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124804343 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124804634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124804831 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124805001 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 124805318 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 124805903 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124806713 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124807258 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124807430 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 124807556 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124808303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124808490 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124809125 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124809200 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124809815 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124811480 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124811964 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124813067 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124813123 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124813718 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124814369 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 124814796 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 124815997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124816859 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124816910 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124817623 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124817738 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124818197 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124818298 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 124819499 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124819655 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124820279 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124820881 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124821071 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124821158 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124822674 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124824975 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124825462 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124825747 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124826187 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124826798 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 124829070 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124830284 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124830907 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124831573 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124833649 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 124835342 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124836445 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124838288 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124838580 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124839340 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124839717 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 124841480 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124841766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124842426 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124850392 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 124860623 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124861403 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124862319 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124863370 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 124863563 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124863984 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124864877 G A N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 124865121 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124865612 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124866370 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124866800 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124866957 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124867848 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124869352 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124874965 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 124875348 A T N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 124876319 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124876437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124880069 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124883905 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124884208 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124887003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124894578 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124895318 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124895335 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124904837 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124907830 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124908354 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124909759 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124911009 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124911134 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 X 124911477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124911505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124914220 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124914271 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124914730 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124914731 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124916694 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124917981 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 124918699 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 124918966 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124919550 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124921036 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124922576 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124922673 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124923373 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124924840 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 124927038 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 124928033 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124928112 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 124932839 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124933869 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124934370 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124936155 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124939848 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124940521 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124944033 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124948295 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124950977 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124952311 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124954357 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124954791 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124955892 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124956039 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124960272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124960535 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124961163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124961305 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124962261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124963026 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124964944 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124967001 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124967977 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124971001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124971083 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124971334 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124972026 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124972147 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124973346 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124973479 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124973530 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124973828 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124974633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124975184 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124976387 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124976607 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124977012 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124977218 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124977346 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124978781 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124979803 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124980041 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124980264 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124980330 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124980775 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124981554 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124981595 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124981697 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124982068 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 124982075 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 124982317 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 124982447 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124982454 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124982712 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124982796 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124983028 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124983139 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124983168 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124983494 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124983628 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 124983687 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124983803 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 124983866 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 124983885 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 124983959 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 124984121 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 124984144 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 124984219 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 124984222 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 124984415 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124984730 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124984795 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 124984939 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124985097 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124985267 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124985327 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124985357 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124985390 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124985483 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124985637 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124985786 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124985887 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124985951 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124986359 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124986398 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124986399 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124986704 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 124986978 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 124987033 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 124987145 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124987175 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124987272 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124987655 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124987687 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124987739 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124987863 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124988109 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124988404 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124988430 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124988726 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124988888 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124989002 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124989329 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124989588 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124989697 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124989994 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124990328 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124990543 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124990654 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124990813 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124990915 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124990945 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124991023 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124991095 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124991284 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124991411 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 124991446 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 124991501 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 124991535 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 124991541 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 124991658 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 124991742 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 124991871 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124992023 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124992519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124992651 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124992710 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124992856 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 124993062 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124993382 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 124993749 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124993752 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124993801 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124993999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 124994122 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124994677 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 124994928 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 124995015 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 124995501 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124998741 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 124998744 C A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 124998799 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 124998837 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 125001561 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 125003698 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 125008525 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125009288 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 125009693 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125020341 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125025885 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 125032561 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125032563 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125034443 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125038418 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125046114 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125046758 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125050989 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125051791 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125060175 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125061340 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125062081 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125062084 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125062654 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125063151 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125064484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125064776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125066039 A T Y N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 125070325 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 125071135 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125071275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125071639 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125072091 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 125072413 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 125072563 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 125074496 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125074748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125075292 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125075376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125076116 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125078138 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125090160 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125090294 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125092091 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125092402 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125093434 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125094089 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125094265 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125095436 A T Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 125097160 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125098131 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 125099665 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125101139 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125101274 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125104300 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125105508 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 125105939 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 125105993 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 125106679 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125107592 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125107937 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125109880 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125110114 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125112054 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 125112424 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125114153 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125114228 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125115505 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125116267 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 125118241 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125119574 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125120388 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125121176 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125121310 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125122468 T G N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 X 125122756 T G N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 125123146 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 125123740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125126096 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125127361 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125128222 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125128286 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125129081 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125129187 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125138666 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125141390 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125141666 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125143929 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125144064 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 125147223 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125147620 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125149429 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125149597 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125149598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125150970 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125151090 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 125151392 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125151514 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125151609 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125152169 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125153005 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125154147 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125158817 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 125160245 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125162253 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125162300 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 125163485 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 125164029 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125164043 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125164324 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125164599 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 125165555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125165903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125167082 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125167087 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125167593 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 125168663 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125172133 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125174484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125176126 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 125177730 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125178586 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 125178641 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 125181747 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 125185555 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125188550 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125189067 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 125189068 T G Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 125189757 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 125194049 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125194737 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125196345 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125201060 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 125201064 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 125203312 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125206588 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125207247 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125220189 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125222349 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125222350 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125222474 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125223691 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 125226287 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125227581 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 125227685 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125228191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125228210 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125235760 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125236248 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125237833 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 125239022 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125239793 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125240511 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125240657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125242141 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 125242389 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 125252001 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 125254990 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125255250 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 125256078 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125259685 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125259805 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125265333 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125266891 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125267589 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125268036 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 125268063 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125268741 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125269081 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 125270742 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125274023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125277979 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125278020 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125278187 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125278703 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 125279228 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125282187 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125283331 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125284735 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125285843 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 125287580 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125290723 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125291279 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125293150 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 125294264 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125294754 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125295425 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125295517 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125296063 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125296772 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125297148 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125297539 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125297591 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125298928 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125299885 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125300303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125301374 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125302594 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 125303766 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125304078 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125305591 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125306222 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125308136 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125308398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125308757 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125308872 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125309781 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125311008 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125311464 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125311731 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125313324 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125314119 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125315442 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 125317904 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 125318093 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125318845 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125319759 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 125320618 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125321656 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125323643 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125323754 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125323768 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125326514 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125328534 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125328940 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125336491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125337595 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 125338459 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125339557 T G N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 X 125339659 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125341330 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125341963 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 125343055 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125343465 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125344764 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125345312 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 125345958 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 125346106 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125350796 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125350998 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125351851 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 125352219 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 125352984 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125353276 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125353558 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125355076 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125356940 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 125357975 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125359416 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 125359481 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 125360847 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125361381 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 125363279 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125364042 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125369448 A C N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 125374125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125377287 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125379838 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125381647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125382734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125385796 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125385819 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125386252 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125387612 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125388372 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125392814 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 125394489 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125401182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125401437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125401854 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125402940 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125403697 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125404640 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125404769 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125404836 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125404901 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125407241 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125407410 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125408588 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 125410931 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 125411187 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125419768 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125420039 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125420607 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125425927 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 125429979 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125429983 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125429988 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125430585 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125431167 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125431289 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125435579 A C Y N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 X 125435626 G A Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 125438734 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125439108 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125450077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125450263 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125451865 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125451959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125457094 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125465256 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125466863 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125466921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125467078 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125468245 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125469626 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125470930 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125471408 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125477286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125479062 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125480936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125482058 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125483361 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125485199 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125486674 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125486683 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125486696 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125492436 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125501567 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 125504593 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 125507522 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125509644 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125512896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125513560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125515346 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125521116 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125525824 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125527874 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125528059 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125528802 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 125534584 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125535406 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 125535804 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125539249 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 125541392 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125542568 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125545860 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125546335 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125549129 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125552570 G T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 125554076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125561715 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125563764 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 125564012 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125564498 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125565832 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 125571520 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125573324 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125574773 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125579579 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125584207 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 125586533 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125586612 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125589964 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125592081 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125592544 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125593912 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 125594123 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 125597191 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 125598995 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125600667 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125600955 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125608405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125608634 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125609504 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125610453 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 X 125610584 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125612703 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125612903 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125613993 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125615980 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125618947 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 125623026 G C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 X 125624293 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125625138 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125625891 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125626444 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125627790 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125628114 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125628115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125628320 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 125629271 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125629314 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125635780 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 125636077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125636703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125636767 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125644291 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125645981 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125651526 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 125651658 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125651988 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 125663392 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 125663673 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 X 125664448 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125664882 G T Y N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.5 0.1875 0.3125 19 13 8 3 5 X 125666897 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125668602 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125669081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125671675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125672197 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125676932 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125676988 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 125677260 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125677434 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 X 125679355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125695555 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 125699498 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125700497 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125703762 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125706057 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 125708175 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125715193 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125715370 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125716466 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125716577 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125719411 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125722172 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125722189 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125722892 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125723929 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125725027 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125725133 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125728035 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 125728934 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125730361 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125730632 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125733836 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125734985 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125735920 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125736594 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125738281 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125740233 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125740384 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125740540 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125741523 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 125741537 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 125741647 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 125742197 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125742488 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 125743764 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125745293 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125745370 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125745797 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125746730 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125750667 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125754012 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125755353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125756673 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125757351 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125758543 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125758806 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125761153 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125761715 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125764664 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125767631 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125771196 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125776423 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125777616 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125778536 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125778554 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 125779010 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125780624 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125784694 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125787769 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125788277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125788485 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125788680 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125788722 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125789804 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125789903 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125790073 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125791421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125793086 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125794662 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125797912 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125798857 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125802657 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125802906 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125802909 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125803056 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125803347 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125806750 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125807115 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125809501 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 125817537 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125817844 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 125819322 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125819567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125819946 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125820010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125820089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125824148 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125824287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125825368 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125828564 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125830186 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125834909 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125837820 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125841293 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125844055 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125845272 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 125846757 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 125847193 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125847586 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 125847884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125848311 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125848533 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125856579 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125856797 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125857669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125857689 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125857830 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125857858 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125858315 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 125858428 T G N N 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 X 125858834 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125859055 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125859243 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125859434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125859750 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125859824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125859857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125859937 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125861311 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 125861798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125863215 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125864326 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125864685 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125865028 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125865465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125865547 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125865658 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125865775 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125866195 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125866717 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125867903 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 125868133 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 125869571 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 X 125870184 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125870185 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125870700 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 125871311 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 125871934 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125872099 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125874817 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 X 125878068 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 125878186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125878327 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125878757 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125880317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125881702 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 X 125881892 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125882347 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125882514 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125883470 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125884383 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 125885969 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125888174 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125888545 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 125888582 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 125888810 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125889549 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125890648 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125898057 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125901891 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125904837 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125905160 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125906204 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 125910229 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125911734 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 125912359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125913311 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125917782 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125917970 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125918686 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125919827 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 125920390 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125920987 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125938293 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125938795 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125939955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125940412 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 125942010 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125944887 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 125950032 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125950627 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 125951480 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125952257 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125962676 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 125982997 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 125985258 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 125988473 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125988977 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125991578 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 125992727 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125995924 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 125996941 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 125997333 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 125998032 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 125998950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126000274 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126002501 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126002588 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126003510 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126003561 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126004389 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126005029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126010899 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126011184 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126011251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126011474 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126026229 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 126028430 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126030834 A G Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 X 126037209 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126037714 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 126044053 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126045268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126048457 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126053676 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126059924 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126060167 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126061096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126061362 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126062607 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126063538 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126063976 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126064737 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126067946 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126068825 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126070309 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126070338 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126073134 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126080044 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 126085205 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 126086782 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126090100 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126095355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126097852 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 126100775 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126101730 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126106212 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126106760 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 X 126108689 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126108807 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126109672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126109690 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126110279 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126110518 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 X 126111747 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126111945 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126112548 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126112917 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126116275 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126116468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126118198 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 126119783 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126120477 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126122106 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126122197 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126123577 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126124464 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126126195 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126126222 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126126225 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126128111 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126129188 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126129986 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126130049 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126130767 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126131570 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 126131640 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 126138955 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126139527 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126140703 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126141318 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126143616 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126144275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126146179 C A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 X 126148151 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 126148700 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126148778 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126148996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126149764 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126149778 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126149994 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126150349 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126151240 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126152296 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126154171 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126154639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126159743 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126160421 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126160527 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126162132 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126163288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126164030 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126172593 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126205941 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126213778 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126213931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126236706 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126240942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126241420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126247545 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126281457 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126282973 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126290171 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126290658 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126291433 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126291693 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126300708 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 X 126301722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126301830 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126302373 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126302604 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 X 126302815 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126304752 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126305504 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 126305507 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 126305741 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 126305931 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126305940 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126306059 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 126306160 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126306331 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126306564 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126307805 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 126307997 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 126308157 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126308257 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 X 126308920 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 X 126308924 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 X 126308940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126309195 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126309244 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126309352 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126309363 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126309456 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126309498 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 X 126309524 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 X 126309611 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 X 126309665 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 X 126309702 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126313014 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 126313464 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126317286 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126320333 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126322271 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126322901 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126323076 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126324435 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126324714 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126325010 A C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 X 126325011 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 X 126326377 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126326624 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 126327280 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 126327621 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 126330096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126330696 G C Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 126333349 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.611111111111111 0.111111111111111 0.277777777777778 24 12 11 2 5 X 126333366 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126333966 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126333975 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126334049 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126334096 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126334777 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 X 126335408 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126336223 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126336918 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 X 126336922 A C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 X 126337353 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 X 126337380 A T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 X 126338097 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126338280 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126338545 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126347189 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 126347298 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126347306 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 X 126347412 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126347466 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126347522 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126348447 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126348659 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126348666 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 X 126350080 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126350206 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126350367 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 126350596 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126351051 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126351780 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126352949 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126353679 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 126354813 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126354893 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126354910 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126356222 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 126359988 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126360983 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126363402 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126364128 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126364399 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 126365218 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126365351 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126374678 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126375920 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126376438 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126376949 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126379052 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 126379454 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126383186 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126384231 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126386073 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126386634 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126388603 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126392389 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126393968 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126395856 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126396112 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126396333 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126396719 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126398145 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126398363 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126402283 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126404146 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126405578 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126406242 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126407618 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126407632 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 126409762 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126410473 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126411659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126412241 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126413261 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126414425 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126416032 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 126418267 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126418902 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 126420268 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126423233 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 126427828 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126427857 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 126429519 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 126430015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126431410 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126432995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126434879 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126436209 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126445081 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 X 126446683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126447490 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126447605 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126447772 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126448252 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 126451089 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126456217 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126458491 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126458812 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 126461685 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126461932 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 126462221 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126463918 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126464117 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126464425 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 126468173 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126468261 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126469683 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126470336 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126471345 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126472003 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126472063 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126473605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126474341 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126474794 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 126479896 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126486133 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 126487706 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 126488124 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126489148 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 126489266 T A N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 X 126490870 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126491322 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 126495402 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126495515 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126495951 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 126496260 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 126496506 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 126496507 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 126498433 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126499924 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126500047 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126500095 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126501037 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126501205 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126501815 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126501879 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126502421 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126502649 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126503526 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126503585 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126504397 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126504448 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126504726 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126509032 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126509107 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126510896 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126511614 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 126511849 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 126512199 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126512676 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 126513427 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126514884 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 126517459 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 126517486 G C N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 126517620 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 126519947 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 126520777 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126521204 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126521573 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126524053 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126527878 T G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 126528149 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126528358 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126528617 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126528673 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126529075 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126529951 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 126530805 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126530811 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 126531123 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126531452 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126533059 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126535739 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126537178 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126539165 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126539214 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126539914 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126543346 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126552499 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126552720 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 126553097 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126554809 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126559789 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 126560063 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126562210 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126563383 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126563735 T C N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 126568200 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126571974 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 126572885 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126574694 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126575668 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126576209 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126576480 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126577384 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126579385 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126581288 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126581552 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126582448 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126583244 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126583283 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126583351 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126583367 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126587192 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126587820 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126588331 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126588556 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 126588580 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 126588590 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 126588874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126589167 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126589287 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126590001 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 126591015 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126592437 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 126593095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126593891 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126593934 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126594501 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126595219 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126596101 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126596255 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 126597002 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126602045 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126602047 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126602600 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126603106 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126603350 A G Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 126604938 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126605437 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126605900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126606279 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126607212 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126610171 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126612420 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126615443 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126615695 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126617564 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126617953 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 126620204 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126620245 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126620478 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126620826 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126621945 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126622665 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126625419 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 126625913 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126627151 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126628824 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126629315 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126631079 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126631131 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126631662 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126636222 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 126641160 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126641250 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126646111 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126646335 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 126648876 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126649213 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126651337 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 126657346 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126657853 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 126660707 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126660965 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126660973 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126661911 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126661991 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126662660 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126663749 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126663762 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126666139 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126671448 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126677343 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126688072 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126688420 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126688661 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126688755 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126690135 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126690426 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126690651 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126691652 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126691858 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126691936 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126692544 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126692813 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126698287 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126701633 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126703503 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 126706082 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126709980 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 126711748 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126713803 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126713991 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126714401 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126715693 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126715798 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126715948 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126716200 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126721034 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126725193 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126726333 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126726422 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126727904 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126730849 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126740875 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126741677 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126744736 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 126745925 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126747287 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126749258 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126750110 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126750913 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126751307 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126752981 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126755600 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126756117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126758214 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 126758896 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126759700 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 126759773 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 126760972 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126761718 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 126762054 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126762481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126765007 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126768125 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126773569 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126773606 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126773987 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126776853 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126780647 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 126782180 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126786639 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 126787119 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 126788291 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126788665 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 126789777 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 126791094 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126791629 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126791824 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126792478 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126792915 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126792983 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126793237 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 126793354 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126793364 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126795288 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126795757 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126795936 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126796163 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126796705 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126796766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126796841 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126797474 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126797663 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126799824 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126802064 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 126804609 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126805220 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126805294 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126806932 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126809308 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126809890 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126810024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126812148 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 126813626 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126814986 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126815421 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126820244 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126822555 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126822639 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126823460 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126823511 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126823945 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126826523 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 126827701 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126829402 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126830240 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126832195 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126833015 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 126833706 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126836016 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126837939 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126841579 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126844181 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126844350 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126848482 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126853547 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126855299 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 X 126855664 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126856262 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126856271 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126856972 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126857003 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126857048 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126858368 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126862067 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126863023 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126865301 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126865322 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126866444 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126866908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126869219 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 126870253 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126870943 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126871341 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126875612 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126876868 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126879512 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126882951 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126884179 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126884180 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126886167 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126886652 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126888082 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126888658 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126889788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126892546 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126892599 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126892842 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126892898 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126893091 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126893109 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126893208 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126893311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126893577 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126893892 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126895031 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126895323 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126896055 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 126896161 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126896437 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 126897860 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126897865 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126898334 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126898658 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126898665 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126899768 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126900063 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126900445 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126900583 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126901290 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 126901646 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126903279 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126903770 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126904064 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126904183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126904267 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126910673 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126910676 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126912784 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126913767 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126915540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126916598 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126917492 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126917754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126917778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126918182 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126920409 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126924405 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126925098 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126925646 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126926063 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 126926210 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 126926619 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126926633 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126926669 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126928081 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126928698 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 126929973 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126931262 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 126931381 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 126931814 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126932357 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126932923 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126933365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126933597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126935030 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 126937550 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126938530 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126939125 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126939836 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 126944291 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126948110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126948134 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126950729 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126950773 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126951018 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126951030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126951037 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126951520 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126951521 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126951770 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126952549 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126953953 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126954175 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126954190 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126955003 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126955466 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126957596 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126957993 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126958987 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126960734 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126961322 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 X 126962254 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126962976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126967388 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126967685 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126968432 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126970795 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126972361 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126972560 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 126972817 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 126973381 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126974115 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126974257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126974289 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126976658 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126976740 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126976742 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126976815 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126976974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126981535 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126983553 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126983554 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126984696 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 126985411 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126988687 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126989026 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126992189 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 126993363 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 126995345 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126995846 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126997317 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 126998107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127000212 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127005718 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127006476 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127007695 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127008234 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127009521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127012674 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127014218 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127014537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127016893 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 127017417 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127017880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127018012 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127023338 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 127024067 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127027108 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127030308 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127032969 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 127034128 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127034263 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127035003 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127036711 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127038339 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127039267 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127039958 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127040274 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127040975 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127041153 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127041287 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127041388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127042159 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127042282 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127042327 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127042338 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 127042518 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127042591 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127042666 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127042743 C T Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 127042805 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127043195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127043944 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127043990 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127044435 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127044487 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127044899 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127046197 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127046326 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127046365 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127046366 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127046441 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127046851 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127047033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127047075 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127047186 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127047296 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127047319 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 127047465 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 127047611 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127047937 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127047984 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127048081 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127048102 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127048199 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127048224 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127048294 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127048610 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127048927 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127048969 T G Y N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 X 127049188 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 127049449 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 127049451 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 127049532 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 127049556 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 127049586 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 127049592 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 127049778 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127050162 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 127050225 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 127050328 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 X 127050432 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127050544 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127050948 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127051185 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127052252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127054768 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127055747 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127055907 T A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 127056229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127056533 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127056627 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127057116 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127057254 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127057317 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127057532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127057641 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127057797 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127057847 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127057867 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127057917 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127057951 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127057991 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127058024 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127058101 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127058124 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127058194 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127058270 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 127058475 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 127058567 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 127058921 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127059168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127059175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127059198 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127060027 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127060954 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127061027 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127061141 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127061148 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 127061362 A T N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 127062463 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127062591 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127063055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127063887 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127065855 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127066376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127068000 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127068552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127068887 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127070603 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127073846 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127074072 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127074109 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127075117 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127075937 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127079634 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127081928 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127081929 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127084710 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127084894 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127084897 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127088105 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127088993 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127089409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127089752 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 127089762 T G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 127090198 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 127091369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127091929 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127092708 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 127092862 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 127093358 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 127094197 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127094786 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 127096962 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127097407 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 127098138 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127098421 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127099088 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 127099161 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127099795 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 127100576 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127101016 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127101100 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127101375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127101656 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127104180 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127104231 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127104697 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127106522 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 127106728 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127107018 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127107138 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127107471 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127107491 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127108208 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127108469 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 127108661 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 127108931 G A Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 127109007 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 127109030 C G Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 127109078 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 127109079 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 127109145 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127109235 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127109253 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127109287 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127109293 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127109307 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127109379 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127109404 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127109470 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127109697 G C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 127109772 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127109917 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127109923 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127109955 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127110199 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127110563 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127110879 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127110916 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127111482 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127111488 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127111621 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127111772 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127111859 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127111883 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127112303 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 127112420 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 127113622 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127113654 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127113994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127114015 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127114109 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127114115 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127114306 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127114530 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127114991 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127115115 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127115322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127115456 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 127115493 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 127115658 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 127115699 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 127116224 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 127117130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127117534 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127117571 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127118059 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 127118829 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 127118881 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 127119836 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127120839 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127121000 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 127122745 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127123402 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127123534 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127123571 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127124082 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127124938 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127125215 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127125448 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127125498 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127125586 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 127125667 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127125687 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127125884 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127125912 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127126066 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127126133 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 127126153 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 127126249 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127126290 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127126451 A G Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 127126565 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 127126585 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127126592 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 127127361 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127127487 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127127508 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127127902 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127127910 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127128131 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127128199 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127128228 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127128726 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127128879 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127128912 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127129163 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127129255 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127129293 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127129319 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127129470 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127129504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127129639 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127129677 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127129838 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127129893 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127129947 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127129948 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127130013 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127130083 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127130120 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127130496 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127130770 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127130793 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127130982 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127131941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127131966 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127132300 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127132864 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127133768 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127133813 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127133865 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127133956 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127134743 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127134893 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127135352 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127138104 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 127138731 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127139959 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127142140 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127142244 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127142279 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127142385 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127142414 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127143044 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127143061 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127143067 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 127143071 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127143445 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 127147620 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127148788 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127149979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127150131 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127150850 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127151316 G T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 127152251 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127152888 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127153315 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127153535 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127153663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127153713 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127156774 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127158278 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127158664 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127160655 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 127161637 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127162083 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 127162163 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 127162164 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 127163393 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127166571 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127166881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127168008 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127168435 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127168714 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 127168755 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 127169049 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127169095 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127170473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127170552 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127170568 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127170806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127170811 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127170812 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127171050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127171072 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127171084 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127171115 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127171335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127171354 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127171521 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127171553 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 127171723 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127171739 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127171829 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127174471 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127174879 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127175133 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 127175463 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127175550 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 127176440 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127178196 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127178501 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127178702 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127178752 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127178812 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127180035 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127180053 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127180263 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127180576 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127180656 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127185810 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127187870 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127194856 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127194863 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127195571 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 127197339 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127198467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127200873 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127201405 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127203786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127204893 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127205183 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 127205886 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 127207593 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127207881 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127208655 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127210867 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127212743 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127214083 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127214217 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127217696 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 127217950 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 127219296 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127219573 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127219872 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127220238 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 127220243 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 127226817 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127227319 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127227763 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127229060 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127229680 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 127229854 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127230510 A C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 127238368 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 127239652 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 127239664 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 127239950 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 127240074 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127241603 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127242165 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127242584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127244983 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127248702 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127248977 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127249259 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127249268 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127250835 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 127250984 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 127252602 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127252765 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127253554 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 127254148 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127254764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127255000 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127255154 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127256058 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127257273 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127257841 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127260129 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127260208 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 127261638 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 127262304 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127265547 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127265550 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127274011 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127274156 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127275580 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127277117 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127277141 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127280938 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127282613 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127283908 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127284846 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127287331 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127297392 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127297814 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127300338 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127301110 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127303748 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127304192 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127305531 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 127306287 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127307101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127308427 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127308430 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127311007 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127313800 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127317844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127319529 T C N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 127320735 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127321784 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127323773 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 127324296 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127325297 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127326011 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127326764 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127327258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127328093 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127332663 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127333770 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127341817 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127343376 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127343492 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 127343536 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127343563 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 127343573 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 127344337 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127344527 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127344643 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127345205 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127345933 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127346108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127346159 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127347140 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127347413 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 127347796 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127347939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127349030 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127351701 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127352741 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127353480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127358089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127359498 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127359806 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 127360173 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 127364833 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127365427 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127365431 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127365573 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127368947 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127371328 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127371558 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127372199 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 127373656 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127373728 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127373769 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127376720 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127378984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127381944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127383743 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 127383846 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127390896 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127391038 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127391077 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127393468 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127394544 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127395666 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127397294 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127399256 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127404469 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127404581 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127406062 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 127406694 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127406883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127410157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127410695 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127412976 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127418292 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 127419474 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127420351 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127420486 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127420958 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127423533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127424850 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127426037 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127429038 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127429078 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127430880 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 127431110 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 127431390 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127431451 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127431995 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127432253 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127432987 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127433556 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 127435022 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127435233 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127435301 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127438150 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127438335 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127438588 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127439325 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 127440691 A T N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 127440782 T A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 127442621 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127442700 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 127442844 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 127442919 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 127443390 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127443843 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127447155 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127448948 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127453810 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127467235 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127467334 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127468982 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 127469224 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 X 127469306 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127469934 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127470421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127470667 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127470702 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127470711 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127471822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127474352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127474418 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127474677 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127474813 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127474882 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 127477293 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127480938 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127483664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127484768 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127494609 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127495046 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127496534 T A Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 X 127499786 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127505257 G T Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 X 127506433 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127506514 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127508258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127509835 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127511336 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127511859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127511894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127513172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127517950 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127519666 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127525969 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127526168 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 127527217 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127529395 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127530031 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 127531587 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127533196 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127533999 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127534546 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127535705 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127538677 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 127538708 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 127541133 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127541974 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127555166 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127560301 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127571404 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127572284 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127572487 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127575477 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127578720 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127582778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127582867 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127586878 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127590151 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 127590763 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127591050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127591634 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 127601077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127603745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127604260 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127607590 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127608142 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127608203 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 127608418 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 127609022 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127611457 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127613471 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127618248 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 127618362 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127619332 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127622041 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127623905 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 127625619 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 X 127626051 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 X 127626177 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 X 127626222 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127626387 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127626594 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127626788 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 127627590 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127630345 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127633275 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127634686 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127636061 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127637515 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127638608 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127639137 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127639746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127642700 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 127647186 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127648785 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127648967 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127654316 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127655432 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127655760 T G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 127657210 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127664496 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127669362 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 127669363 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 127677412 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127687639 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127693233 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127698444 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127701343 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 127701472 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 127702919 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127706047 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127708019 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127708671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127713766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127713966 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127716041 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 127717321 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127721724 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127722956 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 127724619 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 127725836 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127726886 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127727945 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 127728666 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 127729868 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127731386 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127731868 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127732039 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127738357 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127738815 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127740383 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127740663 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127740826 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127741215 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 127741626 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127742080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127742531 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127743094 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127743176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127745195 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127749600 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127751154 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127751321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127751416 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127751528 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127751848 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127751934 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127753425 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127755802 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127760039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127760293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127762349 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127762389 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127764736 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127765358 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127765366 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127770571 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127770696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127774017 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127777214 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127777804 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127778492 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127780543 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127783061 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 127785956 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 127786436 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127786650 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127787728 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 127787942 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 127787969 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 127789617 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127812163 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127819801 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127826449 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127827102 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127828227 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127830521 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 127830696 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127834036 C G N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 127835409 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127838184 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127855911 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127856500 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 127856631 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127861417 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127862877 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 127863137 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 127865197 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127866136 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127868460 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127870576 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127874006 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127882485 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127885817 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127885871 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127886644 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127889822 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127893764 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127902124 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127908214 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127915976 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127926683 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127946931 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127947020 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127947337 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127950953 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127956242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127965767 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127969349 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 127969549 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 127969552 C A N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 X 127969561 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 127969582 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 127969908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127971317 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127971333 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 127971347 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127971507 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 127971598 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127971607 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 127971617 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127971635 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127971678 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127971994 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127972035 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127972310 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127972689 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 127972776 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127972975 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127975789 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127977456 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127978177 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127979253 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127979276 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127980468 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 127981197 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 127986906 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127988717 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 127991726 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 127991785 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 127993086 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 127994224 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127997833 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 127999976 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128001503 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128001574 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128003167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128003586 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128010609 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128011932 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128013411 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128014081 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 128015217 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128015943 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128016638 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128019079 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128020136 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128021688 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128022645 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 128023724 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128028492 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128029153 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128031243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128031858 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128036040 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 128036119 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128036138 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128043880 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128049526 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128050512 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128050697 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128051156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128051835 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128053729 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128054299 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 128054719 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 128054739 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 128056870 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128067157 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128067214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128068017 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128068252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128072117 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128073611 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 128074061 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128074096 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 128074102 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128074271 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 128074651 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 128074655 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 128076166 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128076238 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128077796 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128077860 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128078401 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128079412 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 128079726 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128079821 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 128079960 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 128080026 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 128080899 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128085222 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 128087263 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128087860 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128088132 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128091305 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 128092010 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 128093168 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128094306 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128094434 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128094728 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 128094956 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128096854 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128099684 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128099749 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128099906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128102480 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 128102856 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128102861 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128103171 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128103743 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 128106433 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128106677 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128106697 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128107938 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128107957 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128107960 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128111427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128112344 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128112470 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128114214 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128114233 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128116312 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128127651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128149074 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128149846 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 128156319 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128156603 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128156847 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128172620 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128198981 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128220478 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128221083 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128227948 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128244814 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 128252146 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128253473 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128270769 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128282769 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 128286866 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 128290723 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 128293525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128294556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128296845 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128307656 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128310064 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 128314121 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128340458 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128360072 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128374737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128374866 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128375545 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128375546 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128379904 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128380803 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128383190 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128384839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128391336 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128392379 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128394303 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128396329 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 128397436 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128397936 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128398295 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 X 128399805 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128399855 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128400433 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128401727 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128402244 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128403802 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128404234 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128404531 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128406386 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128407237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128409439 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128413309 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128414506 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128419139 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128422350 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128423479 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128424993 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128429713 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128436225 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128437145 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128438811 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128442243 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128442733 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128442879 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128446256 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128450034 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128451508 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128452492 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128458722 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128459197 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128459610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128469306 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 128470906 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 128473772 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128474705 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128475582 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 128477552 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128478598 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128479379 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 128481543 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128482959 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128485280 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 128485474 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 128485642 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 128487564 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 128488344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128491318 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128493405 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 128493633 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 128494105 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128503091 G C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 128503989 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128506300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128507437 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128507720 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128510186 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 128518968 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128522820 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128523477 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128526469 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128527711 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 128534590 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128538354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128538739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128545775 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128550805 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128551686 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128555910 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 128558082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128558309 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128565097 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128565697 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128565710 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 128571201 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 128571695 A T Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 128572677 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 X 128573294 G A Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 128579690 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128580141 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128580527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128581365 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128581388 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128587839 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128588573 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128591607 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128602022 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128602270 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 128605119 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128605347 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128606193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128606240 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128606254 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128607516 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128607956 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128608798 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128608829 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128608916 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 128609269 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128611085 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 128611155 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 128611591 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 128611816 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 128612157 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 128612755 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128613554 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128613715 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128616053 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128616950 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128617044 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 128617236 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128617534 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 128617824 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128618434 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128618875 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128619551 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128620040 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128620434 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128620456 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128620918 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128621311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128621467 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128622181 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128624298 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128625973 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128627143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128627278 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 128627640 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128628030 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 128629133 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128629251 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128629950 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128630112 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128630419 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128631051 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128631111 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128631238 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128631578 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128631586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128632035 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 128632973 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128633127 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128633477 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128633553 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128633866 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128634421 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128634698 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128635368 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128635633 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 128636081 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 128636107 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128637029 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128638164 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 128638325 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128638806 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128639995 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128640457 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128640524 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128641788 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 128642390 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128643290 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128643324 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128643325 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128643326 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128643783 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128644929 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128645155 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128646414 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128646676 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128647371 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128647682 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128647821 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128648050 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128648252 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128648271 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128648571 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128649088 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128649705 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128650316 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128650370 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128650983 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128651009 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128651198 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128651696 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128652555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128653663 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128653968 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128654411 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128654643 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 128654672 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 128654928 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128655038 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128655063 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128655091 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128655094 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128655158 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128655492 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 128655531 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 128655532 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 128655621 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 128655645 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 128655794 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 128656185 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 128656203 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 128656389 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128656705 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128656896 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128657173 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 128657189 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 128657254 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128657292 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 128657462 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128657516 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 128658024 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 128658618 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128659043 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 128659227 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128659235 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128659416 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128659606 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128659629 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128660184 C A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 128660314 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 128661252 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128661453 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128663452 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128665298 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128665623 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128668095 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128668866 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 128673261 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128673534 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128673869 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128674221 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128675258 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128676207 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128676339 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128676417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128676512 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128676814 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128677111 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128677413 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128678433 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128679861 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 128680529 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128681418 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128681427 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128681462 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128681609 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128682259 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128682570 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128682903 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128683011 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128683018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128683433 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128683608 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 128683694 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 128683910 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 X 128684396 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128684434 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128684879 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128685705 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 128685706 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 128686263 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 128686532 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128686540 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128686819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128687002 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128687048 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128687119 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128687171 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128687662 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128687946 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128688220 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128688557 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 128688735 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 128688780 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 128688917 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128689207 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128689465 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 128689506 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 128689637 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128690134 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128690979 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 128691005 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 128691035 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 128691738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128692142 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 128692221 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 128692271 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 128697001 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128697020 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 128697021 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 128697170 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128697212 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128697277 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128697352 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128697622 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128698192 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128698338 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 128698945 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128698998 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128703363 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128703698 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128703815 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128705577 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 128705704 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128706609 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 128707724 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128708037 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128712819 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128713348 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 128718250 C A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 128721827 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128723063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128725109 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128725332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128726559 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 128731016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128734709 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128736917 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128737694 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128739366 G C N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 128747262 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128747951 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128748487 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128750490 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128756171 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128756458 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128759063 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128759131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128759413 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128759854 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128761404 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128764079 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128766659 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128768389 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128770849 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128771383 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 128772149 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128777701 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128777726 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 128781353 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 128782287 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128784096 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 128785001 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128785197 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128788402 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 128789548 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 128792311 G C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 128792565 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 128793128 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128793680 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 128794686 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128795527 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128795649 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128796339 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128798955 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128800355 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128800618 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128800823 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128801831 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128803076 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128804569 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128805151 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128805779 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128805783 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128805852 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128806904 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128812353 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 128814678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128814836 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128815625 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128815699 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128816440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128816469 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128817469 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128817871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128818037 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128818239 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 128818859 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128819039 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128819636 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128820908 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128821249 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128823882 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 128824491 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 128824755 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128824917 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128825541 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128826412 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128827889 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 128828405 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128828651 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128829515 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 128832855 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128834622 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128835383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128836407 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128838817 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128839339 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128839360 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128839388 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128839392 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128840608 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128842164 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128843137 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128844972 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128846972 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128848311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128849003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128849049 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128850296 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 128851103 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 128851404 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 128852046 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128855099 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128859341 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 128859402 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 128861135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128862895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128863012 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128864332 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128868248 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 128871401 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 128871737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128872748 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128872769 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128873172 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128874335 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 128874837 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128875237 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128875511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128875586 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128876730 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128877414 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128877852 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128878012 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 128880539 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128880783 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128880943 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128882338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128883727 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128884782 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128884799 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128885491 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128885923 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128888250 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 128888748 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128889919 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128889977 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128890915 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128890993 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128891578 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 128892462 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128893384 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128893597 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128893869 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128894560 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128895460 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 128895876 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128897001 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128897258 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128898923 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 128898931 C A N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 128900405 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128900680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128902286 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 128903136 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 128904307 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128904820 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128905103 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128905177 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128907577 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128907762 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128909386 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128909623 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128910361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128910856 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128911275 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128912147 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128912670 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128912731 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 128913492 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 128914207 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128915926 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128917859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128919119 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 128919622 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128920227 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128920295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128921478 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128922319 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128922849 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 128923602 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128923861 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128924685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128925461 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128926638 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 128926775 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128927999 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 128931939 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 128934844 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128935078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128935221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128936084 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128937645 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128937852 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 128937853 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 X 128938155 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 128939260 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128939261 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128940032 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128941882 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128942732 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128943146 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128944148 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 128944685 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128944708 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128945656 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128946011 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128946851 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 128947373 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 128949147 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128949581 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128950219 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128950573 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128951422 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128951564 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 128951902 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 128952938 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128952940 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128953268 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 128953455 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 128953544 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 128954420 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 128956836 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 128957306 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128957549 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 128958556 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128959682 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128959746 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128960871 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128961712 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128961956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128961983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128962059 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128962439 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128962440 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128962530 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128962744 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128963271 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 128964275 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128964284 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128964291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128965484 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128966852 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128969037 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 128969968 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128970345 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128970392 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128970885 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 128971452 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 128971600 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128971739 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128971824 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128971905 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128972132 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128973174 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128973274 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128973353 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128973681 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 128973764 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 128973962 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128974024 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 128974124 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128974128 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128974178 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 128974244 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 128974727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128974809 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128975355 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128975396 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128975518 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 128975656 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 128975875 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128975898 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128976268 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128976391 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128976412 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128977059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128977256 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128978771 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 128979257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128979889 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128980205 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128986984 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128988526 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 128988856 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128989162 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 128989990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128990977 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128993301 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128993748 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128994201 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 128994912 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 128996796 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 128999231 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 128999986 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129002313 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129004039 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129004306 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129005372 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129006720 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129007315 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129010138 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129010155 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129011056 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129011090 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129011290 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 129011355 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 129011570 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129012012 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129012356 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129015395 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129017588 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129020447 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129021144 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129021290 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129022407 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129024047 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129024697 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129026076 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129026535 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 129026563 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129027061 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129032104 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129032287 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129032628 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129034557 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129035371 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 129036298 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129037429 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 129038574 T C N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 129039967 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129040853 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 129041493 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129041738 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129041967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129042237 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129042655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129043452 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129044961 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129045528 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 129045965 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129048670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129049030 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129049919 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 129049958 T G N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 X 129051831 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129052213 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 129056394 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 129058846 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129058959 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129059019 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129062051 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129062531 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129062555 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129062606 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129065843 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129067226 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129067480 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 129069077 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129076136 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129079363 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129083693 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129084680 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 129084865 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129086404 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129086405 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129087272 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129087306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129088448 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129088553 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129088588 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129089527 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129091028 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129091512 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129092340 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 129092382 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 129093470 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129094596 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 129094718 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 129095729 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129096049 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129096210 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129096720 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129103520 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129103563 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129103812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129106385 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129107089 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 129107446 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 129108217 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 129108288 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 129108688 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129109104 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129110185 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 129110946 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129111141 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 129111586 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 129118867 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129119104 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129120852 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129121194 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129121801 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129121824 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129122858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129123519 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129123804 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129123882 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129123971 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129124166 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 129124245 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 129124259 A C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 129124349 T A N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 129127196 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129130193 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129131553 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129133311 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129134138 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129134648 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129135678 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129136338 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129136771 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129139260 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129139498 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129141693 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129141855 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129143618 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129145846 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129146759 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129147678 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 129147765 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 129149450 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 129150730 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129151928 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129153000 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129154182 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129159144 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129162221 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129168813 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 129172070 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 129172298 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 129173230 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 129173419 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 129173651 A C N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 129174663 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 129174966 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 129176400 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 129177716 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 129178100 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 129181050 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 129182976 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 129183197 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 X 129189260 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129189314 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129189655 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129192980 G T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 129193846 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 129194102 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 129194847 G T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 129195679 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129195771 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 129196991 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129197149 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129197458 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129199245 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129199603 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129200891 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129203113 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129206449 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129207542 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 129210760 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 129213683 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129213893 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129214360 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 129216048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129218696 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129219815 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 129220733 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 129221007 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129221206 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129221303 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129221338 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129221383 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129222353 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129223696 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129224026 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129224083 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129224744 T G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 129225380 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129226525 G T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 129229290 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 129231586 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 129231759 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129233362 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129233648 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129235249 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129238467 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129241583 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129243571 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129246084 G C Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 129246472 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129247094 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129247977 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129248296 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129248984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129249036 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129251596 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129252460 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 129254180 A C N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 129254814 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129255760 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129260442 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129261952 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129262143 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129263025 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129266790 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 129267006 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 129267604 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 129269546 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129271275 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 129271297 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129276375 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129278365 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 129278585 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 129279821 A G Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 129289710 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129291255 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129292962 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 129294313 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129294351 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129294558 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129294601 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129295469 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129297756 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129298690 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 129298876 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 129298983 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 129300464 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129301415 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129301424 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129302695 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129303701 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129306147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129306237 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129307390 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129308872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129311329 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129312186 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129312398 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 129312531 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 129317640 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 129318029 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129318552 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129318754 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129319772 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129320406 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129320883 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129321077 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129321102 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129321139 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129322415 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 129323141 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129324092 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129326121 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129332669 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 129333599 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 129333719 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 129334211 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 129335524 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129336242 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129336318 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129338225 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129345388 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129346163 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129347024 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 129353076 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 129353698 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129358019 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129359977 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129361716 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 129364149 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129366042 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129374170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129374656 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129374665 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129378128 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129380003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129383364 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129385396 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 129388114 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129389652 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 129389952 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 129393526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129394477 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 129396350 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 129396994 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 129397002 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 129398091 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 X 129398948 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 129402714 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129406743 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129407127 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129409805 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129411403 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129412023 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129415052 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129415580 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129418119 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129418761 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129420271 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 129420925 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129422511 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129422682 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129422968 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 X 129423865 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129425042 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129434109 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129434306 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129434684 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 129435275 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129436066 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129436636 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 129437742 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129439997 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129443799 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129443965 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129444539 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129444591 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129445270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129445829 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 129452165 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129453380 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129454767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129457452 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 129457665 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129459043 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129460176 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129464008 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129464036 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129465038 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129467407 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129469851 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 129471597 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129474578 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 129479552 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 129480074 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129481658 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129481737 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 129482111 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 129487834 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129488549 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 129490108 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129492394 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 129495362 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 129497132 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129497187 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129497767 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129498949 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129498989 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129500768 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129502251 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 129502356 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 129503542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129504100 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 129504867 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129505321 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129505516 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 129505934 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129506811 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 129508324 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 129509129 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129509279 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129510608 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129512256 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129512285 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129513060 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129514715 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129514937 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129514968 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129515098 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129515277 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129515846 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129516393 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129517927 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 129518009 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 129518443 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129518945 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129518992 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 129519158 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129519210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129519568 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 129519621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129520280 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129520413 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129521013 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129522004 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129522715 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129523342 G A Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 129524411 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129524639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129524646 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129525067 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129527005 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 129527409 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 129527958 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129527995 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129528402 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129528696 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 129529185 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 129529224 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 129529245 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 129530595 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129530876 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129530913 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 129531557 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 129531626 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 129532283 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129533995 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129533996 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129534594 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 129539683 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129539695 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129539713 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129539722 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129539979 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129539997 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129540016 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129540527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129540538 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129540699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129541191 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129541226 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129541296 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 129541737 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129541761 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 129542100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129542370 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129542494 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129542714 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129542833 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 129542899 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129542920 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 129542922 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129543069 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 129543307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129543497 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129543836 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129543883 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129544616 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129544971 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129544972 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129545118 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129545563 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129547047 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129547096 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129547399 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 129551510 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129553424 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129554486 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129555428 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 129556680 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129559096 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129561857 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129563155 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129563981 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 129565056 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129570344 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129570686 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 129570928 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 129571499 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129572506 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129573033 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129573744 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 129574572 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129578274 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129580210 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 129584225 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 129587228 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 129588862 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129589881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129592780 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 129592805 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 129593691 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129594251 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 129594265 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 129594929 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129596526 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129596528 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129596871 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129597689 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129601529 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 129605150 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129606356 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129609091 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 129609996 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129610709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129611709 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129612775 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129613255 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 129613262 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 129614651 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129617345 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129618358 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 129620693 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 129622461 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 X 129624319 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129624508 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129639408 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129647787 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 129647973 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 129648047 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 129654348 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129658225 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129659214 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 129663135 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129673976 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129673977 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129675950 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 X 129679036 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129686303 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 X 129688585 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129691001 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129697328 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 129699834 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129704103 A C N N 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 3 7 1 1 3 X 129705194 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129707773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129710223 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129710561 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129717403 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129718251 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129721934 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129727720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129728652 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 129732209 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129734656 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129745610 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129747289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129749358 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129751264 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129751270 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129753669 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129755959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129756368 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129760499 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 129762981 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129764925 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129765127 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 129768481 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 129768932 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129769625 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 129773730 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129775730 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 129776519 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129776713 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 129778771 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 129779305 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 129779355 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 129779848 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129780030 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129784367 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129785588 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129786157 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 129786681 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129787775 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129788388 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129788677 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129789061 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129789237 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129791212 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129791606 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129792446 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129794052 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129794184 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 129795045 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129804023 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129809472 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 X 129810524 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 129811390 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 129812556 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 129812785 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129813584 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129813668 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 129815952 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129815996 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129816471 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 129818584 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 129818630 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129818941 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 129819548 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129819666 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129822742 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 129825148 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129825737 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129825883 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129826326 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 129826601 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129827804 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129831574 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 129831585 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129831750 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129834346 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129834400 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129835402 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 129835460 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 129835612 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 129838778 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129839928 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129841671 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 129845209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129845525 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129846475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129846631 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129848069 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129849393 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129849523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129850588 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129851757 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129851866 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129852788 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129853223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129853232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129853590 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 129856900 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129857325 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129859099 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 129860771 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 X 129862814 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129865048 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129865580 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129865818 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129866054 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129866305 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 129867567 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 129868347 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129868568 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129868644 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129868674 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129869639 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 129870568 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129871483 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129871551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129872524 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129873211 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129873236 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129880583 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129883142 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 129885518 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 X 129886062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129886669 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129888034 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129888398 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129890417 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 129895923 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 129896290 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 129896719 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129897335 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129897753 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129898429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129898483 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129898557 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129898625 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 129899610 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129900074 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129900574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129901159 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129901310 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129901425 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 X 129902962 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 X 129903065 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129903693 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 X 129903749 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 X 129903887 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 X 129904721 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129905480 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129907030 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129907436 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129907517 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129908818 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129910317 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129910816 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 129911152 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 X 129911334 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129911799 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129911969 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129912203 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 X 129912688 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 X 129913285 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129914172 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 X 129914232 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129915522 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 129916974 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129917099 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129917336 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129918700 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 129921060 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129921065 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129922623 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129922804 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129923705 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129925245 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129926690 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129926849 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129927508 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129927535 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129927829 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129928112 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 129928199 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129931593 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 129931959 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129934969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129935355 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 129935899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129936793 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129937782 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129943158 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 129947103 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129947301 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129951569 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129951908 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129953265 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129954162 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 129954596 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129954667 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129954982 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129955584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129956810 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129957062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129958605 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129959363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129962259 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129962378 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129969946 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129970095 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 X 129970285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129973412 T G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 129974375 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129975723 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 129978643 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129978709 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 129981302 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 129981726 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129987686 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129991730 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 129991875 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 129993012 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 129995426 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 129996562 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 130001400 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130002636 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 130003543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130005820 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130006639 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130007789 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130009179 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130011572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130011617 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130012667 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 130013157 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130015755 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130015759 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130016582 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130019470 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130019921 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130020440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130022356 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130022488 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130023383 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130023501 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130024402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130026258 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130027410 A T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 130027654 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130027703 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130027839 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 130027969 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 130027970 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 130028356 T G Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 130029291 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130029429 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130029534 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130032458 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130032564 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130033021 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130033197 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130034998 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130035440 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130038002 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130038763 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130040293 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130042637 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130044443 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 130045084 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 130046111 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 130047395 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 X 130049490 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130051185 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130051378 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130053125 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130053294 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 130053705 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130053939 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130054984 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130059490 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130059757 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130061347 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 130061375 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 130061986 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130062097 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130062107 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130062425 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130064029 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 130064072 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 130064934 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130064935 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 130064937 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 130065014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130065320 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130065619 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 130066618 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130066772 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130068538 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130068713 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130068861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130075462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130075722 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130077276 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130078186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130080003 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130080472 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130080671 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 130080789 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130081579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130081757 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130081793 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130082163 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130082773 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130083198 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130084359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130084835 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 130084924 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130085979 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130086290 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130086387 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130086780 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130086793 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130087081 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130087124 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 130087236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130087467 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130087488 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 130087551 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 130087776 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130087818 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130087845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130087852 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130087870 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130087998 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130088011 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130088157 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130088248 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130088996 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 130089099 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130089252 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130089318 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130089383 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130089948 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130089984 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130090169 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130090617 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 130090798 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130091145 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130091574 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 X 130091805 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 X 130091926 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130092292 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130092513 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130092580 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130092591 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130092653 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130093025 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130093069 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 X 130094923 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 X 130095304 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130096285 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130099932 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130100625 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130119165 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130124862 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 130125124 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 130126723 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130128626 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130129251 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130129372 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130129427 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130129454 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130129659 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130129664 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130129678 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130130945 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130131058 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130131307 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130131470 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130131711 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130132322 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130132494 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130135579 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130138340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130143125 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130148140 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130149384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130150163 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130150977 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130152790 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130153076 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130153944 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 130155434 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130156161 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130156308 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130157319 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130158427 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130160239 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130161506 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130163824 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 130166350 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 130168408 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130171895 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130173204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130174538 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130176686 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 130178448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130179592 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 130182930 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 130188700 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130191025 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130191229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130198517 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130200262 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130202679 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130202811 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130204445 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130204643 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130205312 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 130205455 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 130205629 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 130212659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130215213 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130219381 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 130225450 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130226424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130235890 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 130237103 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 130248821 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130250301 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130255207 G A Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 X 130260920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130268242 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130268686 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130268893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130269119 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130273319 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130274008 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 130279063 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130279203 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130279224 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130283182 T G Y N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 X 130285066 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130287179 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130289203 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130289912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130291046 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130292129 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130294309 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130294385 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130295405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130299791 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130303791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130307003 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130308238 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130313895 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130314718 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130314735 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130317983 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130319239 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130319602 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130323260 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130323418 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130343998 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130349186 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 130351549 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130353360 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130355113 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130357896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130358040 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130364759 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130364810 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130365902 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130366654 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130369427 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130370322 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130370398 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130370479 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130370934 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130371164 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130371531 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 130371658 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 130371844 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130372029 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130372469 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130372614 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 130372642 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130376793 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130377798 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 130378137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130378981 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 130381320 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130381355 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130381613 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130381708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130382692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130383237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130384901 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 130384927 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130385476 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130386549 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130386610 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130389802 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130392011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130393093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130394324 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130394856 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 130394910 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130395095 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 130395118 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 130395542 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 130395580 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 130396243 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130398403 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 130399318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130399602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130400514 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130400632 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130401010 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130401020 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130401237 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 130401319 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 130401574 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130401992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130402102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130402802 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130403011 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130403025 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130405582 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130405824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130405835 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130406133 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130406689 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130407141 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130407637 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130407654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130408959 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130409382 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130409412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130418263 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130418705 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130418880 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130419284 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130419440 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 130420055 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130420448 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130420862 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130421198 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130421408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130422550 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130422877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130423062 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 130424885 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130430845 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 130433920 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130433922 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130436570 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 130441711 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130442280 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130446924 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 130449738 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130450134 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130450383 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130452728 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130455217 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130457444 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 130458046 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130458668 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130458958 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130459738 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130459931 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130463543 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130464620 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 130464657 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 130468518 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130469580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130470335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130471418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130473451 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130475212 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130475262 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130479460 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130479757 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130480234 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 130481003 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 130481358 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130483366 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130484453 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130485571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130486556 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130488414 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130488568 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130489015 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 130490037 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130497114 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130497563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130500924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130506394 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 130512503 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130520743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130521713 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130521754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130522105 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130523410 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 130523988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130525359 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130528425 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 130532013 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130532063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130533392 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 130536125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130536542 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130541610 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130568299 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 130583529 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 X 130587855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130588253 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 X 130595229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130596127 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130601912 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 130602642 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130606446 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 130607406 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130610538 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130610546 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130610553 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 130624324 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130625012 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130625599 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 130625669 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130625737 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130626473 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130626638 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130626697 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130626728 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130626850 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 130627002 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130627014 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130627122 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130627150 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130627157 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130627361 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130627416 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130627759 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130628478 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 130628762 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130629006 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130629286 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130629826 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130629866 A T N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 X 130630408 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130630950 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130631416 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 130631611 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 X 130631760 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130632564 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 X 130632608 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130633117 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 130633123 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 130633402 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 130633725 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 X 130634062 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 X 130634147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130634216 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 X 130634263 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 X 130635241 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 X 130635354 A C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 X 130635572 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 X 130635771 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 X 130636252 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 X 130636554 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 X 130636703 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 X 130636727 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 X 130636748 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 X 130636759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130636790 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130636852 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 X 130636911 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130637229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130637772 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130638847 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 X 130640124 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130640148 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 X 130640331 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 X 130640564 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130640646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130640737 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 X 130640875 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130641319 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 130641320 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 130641868 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 130641924 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130641932 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 X 130641937 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 X 130642137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130642377 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130642451 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130642520 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 X 130642585 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130642775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130643039 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130643495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130646617 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 130647429 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 130648117 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130648610 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130649230 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130649637 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130650514 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 130652273 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130652539 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130653470 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130653859 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130654602 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 130654886 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130656832 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130656950 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 X 130657265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130658032 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130658109 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130658242 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130658348 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130658447 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 X 130658892 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130659087 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130659136 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130660010 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130660189 C T N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.285714285714286 0.5 0.214285714285714 15 13 4 7 3 X 130660471 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130660718 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130660848 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 X 130661432 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130661580 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130661608 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 X 130662365 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 X 130663608 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 X 130664162 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 X 130664177 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130664303 G A N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.571428571428571 0.214285714285714 0.214285714285714 19 9 8 3 3 X 130664418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130665163 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 X 130665264 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 X 130665406 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 X 130665565 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 X 130666058 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 X 130667417 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 X 130668450 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130668561 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130669516 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130672143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130673877 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130680657 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130680797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130684298 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130684974 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130685151 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130685288 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130685893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130686036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130688119 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 130691374 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 130691703 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130692592 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 130692833 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 130694257 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130694641 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130695896 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130699582 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 130699583 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 130700193 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130704564 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130704625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130706573 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130707232 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130707826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130707895 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130708354 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130708810 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130710385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130710441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130710779 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130711394 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130712503 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130713625 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 130714333 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130715910 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 X 130716592 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 X 130716619 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 130718829 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130719347 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 130719946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130722378 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130722942 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130726560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130726978 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130728748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130734203 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 130734419 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 130735250 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130735373 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130739814 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130743139 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130743556 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130743769 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 130744374 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130745760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130747738 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 130751490 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130751491 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130754886 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130760662 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 130761751 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130762943 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130763531 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 X 130764135 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130766783 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 130771169 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130771532 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130772746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130773327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130774702 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130775849 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130776654 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130776681 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130777848 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130779505 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130780156 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130780638 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 130783488 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130784012 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 130786554 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130789862 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130789993 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130790025 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130790029 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 X 130790253 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 130790629 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130791056 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 130791349 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130791616 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130792143 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130792406 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 130792698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130792917 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130792984 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 X 130794800 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 130795018 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130798256 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130799786 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130800077 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130803527 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130806515 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130809529 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130815725 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130815933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130820198 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 130824188 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130826238 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 130826843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130826960 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130828201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130828595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130828619 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130829228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130829544 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 X 130829556 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 X 130829569 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130829804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130830372 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130831732 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 X 130839814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130842347 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130842469 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130842510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130842612 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130843794 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130844517 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130844686 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130850415 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130850416 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 X 130851220 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 130861897 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 130869426 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130873483 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130874140 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130874573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130874585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130875647 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 130875666 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 130876325 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 X 130877052 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 130877662 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130878411 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130878510 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130878651 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 130878668 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 130878918 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 130879024 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130879027 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 130879281 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130879288 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130879484 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 130879615 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 130879648 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 130880258 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 130880397 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130880412 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 130880527 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130880755 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130880811 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 130881707 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 130881913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130882313 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 X 130882717 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 X 130883344 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 130883461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130884590 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130884914 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 130884995 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130886849 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130888916 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 130889471 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130890018 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 130892147 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130892927 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130893018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130894424 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130895304 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130898280 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130898681 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130899267 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130899424 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 X 130899642 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 X 130900103 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 X 130904364 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130904678 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130906563 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130907908 T C N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 X 130908144 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 130908220 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 X 130908496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130909194 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 130909396 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 X 130909414 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 X 130909469 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 X 130909568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130909628 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 X 130909967 C G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 X 130910083 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 X 130910633 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.1875 0.125 0.6875 8 24 3 2 11 X 130910762 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 130910808 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 130910843 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 130910948 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 130912354 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130913329 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 X 130913574 T A N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 X 130913862 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 130914012 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 130914191 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 130914927 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 X 130915536 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 130915952 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 X 130916000 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 X 130916001 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 X 130916229 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 X 130916293 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 X 130916308 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 X 130916793 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130916847 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 X 130916882 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130917141 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130917150 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 X 130917157 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 130917278 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130917337 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130917794 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 130917930 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 X 130917963 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 130917982 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 130918007 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 130918018 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 130918026 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 130918124 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 130918211 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130918432 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 130918970 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 X 130919162 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130919508 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 130919831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130921448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130926919 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130929715 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 X 130929758 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 130931846 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130935805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130937762 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130940590 C T N Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.5 0 0.5 6 6 3 0 3 X 130940599 T C N Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.5 0 0.5 6 6 3 0 3 X 130942509 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130944241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130945643 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 130945644 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 130946720 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130948602 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130949841 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130952001 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130952028 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130952185 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130952517 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 5 13 2 1 6 X 130953106 G T Y N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.166666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 9 15 2 5 5 X 130953356 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 130953537 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 130953559 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130953562 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130953614 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 130954860 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 X 130954861 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 130954929 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 X 130955731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130955866 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 X 130955956 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 X 130955973 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130956079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130957994 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 X 130958012 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130958145 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130959139 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130959301 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130959699 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 X 130959974 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130959985 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130960223 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130960380 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130962781 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 0.105263157894737 0.421052631578947 20 18 9 2 8 X 130962809 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 0.105263157894737 0.421052631578947 20 18 9 2 8 X 130962814 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.5 0.1 0.4 22 18 10 2 8 X 130962833 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 0.105263157894737 0.421052631578947 20 18 9 2 8 X 130962834 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 0.105263157894737 0.421052631578947 20 18 9 2 8 X 130963686 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 130964353 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 X 130965040 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130965317 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130965631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130966210 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130966823 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130967915 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130968008 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 130969826 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130970260 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 X 130970444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130970486 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130972116 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130972797 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 X 130972822 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130973513 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.368421052631579 0.105263157894737 0.526315789473684 16 22 7 2 10 X 130973523 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130973525 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130973880 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130973889 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130974263 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 X 130974828 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 X 130974926 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 X 130976626 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 X 130978492 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130979248 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130979359 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130981671 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 X 130982226 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130982544 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 X 130984540 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 X 130985047 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130985078 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130985608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130986568 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 X 130986704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130986923 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 X 130987789 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130987948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130988549 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 X 130989055 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 130989474 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 X 130989577 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 130991788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 130992051 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 130999358 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 131004858 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131004966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131009211 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 131009566 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 131011620 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131011846 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 131012264 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131014810 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131016786 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131016916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131018015 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131019182 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 131020496 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 131020762 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 131021490 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 131021986 T A N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 X 131022886 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 14 10 6 2 4 X 131023011 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 8 10 3 2 4 X 131023235 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131023280 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 X 131025156 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 131025577 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 X 131026814 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131027025 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131035952 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131037474 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 131038257 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 X 131038262 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 X 131038470 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 X 131038471 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 X 131039004 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 X 131039026 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131039116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131039124 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 X 131039186 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131039993 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 131040659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131041381 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 131041660 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131042011 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131042405 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 X 131042429 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 X 131042980 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 X 131042987 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131043486 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131043582 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131043842 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131046435 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131049002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131049109 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131049275 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 X 131049328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131049616 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 131050315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131050346 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131050587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131057203 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 131058521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131060228 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 X 131060357 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 X 131063743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131063798 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131063908 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131064030 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131064382 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 131064689 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131066085 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131066804 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131067834 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131068544 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131068545 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131069250 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131070434 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131070660 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131074128 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131078296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131079092 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131079397 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 131079517 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 X 131079556 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131079598 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 131079793 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131079813 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 X 131079948 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 X 131079979 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 X 131079980 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 X 131080514 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 X 131080942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131081159 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 131081170 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 131085066 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 X 131085593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131086150 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131086324 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 131086433 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131086974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131087225 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 131087973 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 131088496 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131088808 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131090009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131091284 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 X 131091315 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131092574 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131092788 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 X 131093085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131094311 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131095110 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131095947 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 131096830 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 131097806 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131098474 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131099172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131099374 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131100430 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131100861 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131101380 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131102545 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 131103215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131103967 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 131104215 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 131104254 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 131104265 C G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 131104330 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 131105038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131105186 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131105939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131110994 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131114308 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131116176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131120107 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131122297 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 131122692 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 131123811 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 131128537 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131129547 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131129735 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131131992 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131132038 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131136879 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 131146302 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 131147382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131147508 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131149456 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131157650 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131158990 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131159958 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 131160559 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 131160573 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131161568 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131161727 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131161815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131162319 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131162911 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131163208 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131168378 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131168553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131168755 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131168974 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131170408 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131170655 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131171217 G T Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 X 131171611 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 X 131172289 A C Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 X 131172393 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131172486 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 X 131173151 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131173288 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131175107 T G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 X 131175259 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 131175557 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 X 131176053 T C Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 X 131176242 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 X 131176243 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 X 131176263 G A Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 X 131177247 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 X 131180083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131183464 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 X 131186907 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131187074 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131187324 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131187598 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 131191903 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131192734 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 131196388 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131197161 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 X 131199028 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 131200931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131201017 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131202102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131202720 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131204171 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 131205344 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131206610 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 131206810 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131207993 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131208565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131209537 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 131211315 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 131211699 T C Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 X 131213729 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 131216082 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 131217162 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131217292 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 131219510 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131219588 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131220541 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 X 131221293 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 131223038 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131224165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131225939 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131228812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131229154 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131231412 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 X 131232121 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131232347 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 X 131232385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131232492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131232565 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131232570 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131232578 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131232659 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131232688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131233239 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131233428 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131233560 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131233586 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 131233786 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 131233953 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131234100 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131234301 C T N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 X 131234306 C T N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 X 131234401 A T N N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 X 131237058 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 131237463 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131237467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131237829 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131238706 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131239084 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 X 131239149 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 X 131239193 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 X 131239195 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 X 131239445 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 X 131240175 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131240273 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131240315 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131240342 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131240394 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131240569 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131242122 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131242531 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 X 131242536 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 X 131242770 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 131242977 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 131243931 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131246801 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131247710 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 131250741 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 131252905 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131254035 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131254146 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 131254406 A T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 X 131256827 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 X 131258883 C G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 131259174 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 131260409 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131260877 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131261578 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131263217 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131263640 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 131265003 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131265029 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 X 131266177 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 131271246 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131272762 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131273112 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131274868 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131276869 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131279450 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 131286478 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131292822 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131296854 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 131298500 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131300220 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131304670 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 131307004 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 131307486 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131310391 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131312883 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131318363 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131320390 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 131320599 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131323766 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 131326313 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 131326371 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131331136 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131331153 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131331222 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131331410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131331560 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131332119 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 131332518 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131332583 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131333154 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 131333260 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 131335699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131335870 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131336461 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131341502 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131344332 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131345048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131345120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131348881 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131352774 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 131353088 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131358428 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 131361269 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131362445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131363041 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131366125 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131375392 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131382193 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131382616 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131388723 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131390533 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131392474 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131392649 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131392972 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131393544 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131394568 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 131394848 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131395567 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131396408 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131397776 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131398474 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131399133 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 131400555 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131400576 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131400773 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 131410647 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131411400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131413344 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131414900 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 131415088 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131420104 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131426695 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 131437458 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131459606 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131462798 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131463832 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131464489 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131464908 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131468644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131470146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131470555 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131470590 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131471268 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 131471401 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131472443 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131476711 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131476759 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131477956 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131478510 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131479183 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131482649 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131483450 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131483758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131484587 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131485582 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131485830 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131486918 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131487349 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131488056 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131488431 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 131489134 G T Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 131489146 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 131489924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131490102 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131491221 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131491273 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131494371 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131495307 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131498485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131498723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131498930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131503166 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 131504215 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131504953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131505162 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 131506555 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131507927 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131508148 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131510512 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131514334 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131515266 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 131516906 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131517635 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 131518810 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131521272 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131525022 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131529233 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 131535860 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131553442 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131553595 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131553704 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131556034 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131557046 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 131557070 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131558743 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131559704 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131560410 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 131560979 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131565737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131566666 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131568806 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131573462 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131574613 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131591156 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131591233 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131598069 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131599148 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131602732 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131602753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131602783 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131602865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131603001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131603073 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131603313 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131603361 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131603380 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 131603382 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131603412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131603432 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131604289 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 131605614 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 131605734 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 131606433 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131606582 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 131607373 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131607781 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131608452 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 131609091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131609229 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131610490 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131610954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131611549 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131612179 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131615001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131619290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131623816 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131627068 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131631871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131631947 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131632793 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 131635005 T G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 131636214 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131637048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131637751 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131643895 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 131729121 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131731006 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 131732483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131733537 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131733548 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131734176 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131734928 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131735003 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131735936 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131736046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131736572 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131737029 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131737404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131737751 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131737966 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 131738087 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 131739310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131739943 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131740428 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131742529 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131742685 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131742803 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131744906 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 131745873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131747331 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131747629 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131747694 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131750684 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131750816 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 131751146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131751191 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131751507 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131751637 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131751683 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 131753020 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131753309 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131753948 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131754806 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 131755040 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131757894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131759189 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131759583 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131759595 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131761090 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131761106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131761361 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131761374 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131761403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131765368 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131766482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131766534 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131766547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131767439 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131767826 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 131768413 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131769295 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131770901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131771131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131771403 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131772617 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131773283 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131776858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131777828 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131779038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131783691 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 131784374 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131786602 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131787282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131790070 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131791277 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131791999 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131793291 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131794231 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 131795558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131795996 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 131796100 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131797685 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131798931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131799490 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131801639 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131802469 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 131805670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131806518 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131810865 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131811931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131811932 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131811939 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131813130 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131815476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131820230 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131820512 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131822981 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131823857 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131825030 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 131825060 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 131825099 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131826071 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131828478 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131828964 C A N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 X 131828965 C G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 X 131828980 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 X 131829175 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131829383 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131831342 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 131831343 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 131831443 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 131853719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131854373 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 131857109 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131857287 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131857924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131859088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131859270 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131859449 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131865694 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 131866243 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131866382 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131867136 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 131869237 T G Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 131869239 C A Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 131871185 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131872315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131880575 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 131881080 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131882466 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 131882894 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 131883526 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 131883547 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 131885734 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 131889047 A G N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 131954765 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132101157 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132102070 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132103198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132103973 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 132108039 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132109958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132124052 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132124312 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132145456 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132158698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132201249 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132203903 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132217055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132244634 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132258713 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132260475 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 132263712 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132269811 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 132269813 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132269814 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132273160 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132283358 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 132285953 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132286210 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132287409 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132289647 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 132295226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132302102 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 132302435 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132302632 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 132305941 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132309386 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132312119 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132319504 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132319683 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132321298 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132330049 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132333832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132339903 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132343957 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132344329 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 132345632 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132361455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132378061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132397672 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132416458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132417663 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132421843 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132421981 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 132422201 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132422244 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132422397 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132422482 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132424758 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132426166 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132437124 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 132437131 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 132438452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132439590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132440432 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 132441261 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132442489 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132445244 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132447245 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132448134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132450188 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132450384 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 132451467 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132453277 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132453713 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 132454627 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132458431 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 132459474 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132463871 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132470936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132472611 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132472809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132473581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132474884 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132475080 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132479886 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132486926 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132487553 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132487688 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132487975 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132488966 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 132489058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132489764 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 132489774 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 132490189 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132490325 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132490499 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132490736 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 132491254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132491792 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132492167 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 132493516 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132493598 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132493707 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132493892 G T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 132494052 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132494204 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132494362 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132495026 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132496492 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132496938 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132499542 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 132500716 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132501575 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 132502048 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132502642 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 132502786 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 132502837 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 132502906 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 132502933 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132503092 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 132503190 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132503389 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132503397 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132503407 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132503453 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132503454 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132503461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132503554 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132503672 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132503684 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132504083 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132504155 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132504416 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132504589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132504653 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132504688 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132504840 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132504912 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132505294 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 132505295 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132505450 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132505486 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132505549 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 132505772 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132506613 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132506631 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 132506770 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 132507110 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132507136 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132507310 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 132507768 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132507775 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132509040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132510581 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 132510954 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132511039 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 132511417 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132511982 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132515509 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 132518326 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 132520371 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132522420 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132522574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132523847 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132524098 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132526053 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132526605 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 132529057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132529733 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132529951 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132530025 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132530393 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132531181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132531760 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132531952 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132533837 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132533876 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132534058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132534322 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 132535050 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132536006 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 132536131 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132536169 A G Y Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 X 132536938 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 132537569 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132537573 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132537981 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132538009 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132538307 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132538313 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132538340 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132538347 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132538770 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 132539035 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132539699 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 132539972 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132540756 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132541060 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132541406 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132543927 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 132544500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132544840 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132545157 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132545366 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132546082 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132550934 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132551264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132551851 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132552003 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132552302 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 132553698 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132554339 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 132555532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132555684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132555988 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132558357 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132559188 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132559703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132563311 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132563326 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132566759 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 132566881 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 132569063 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 X 132569683 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132570141 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132570847 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 132573372 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132576081 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132576703 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132578716 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132578924 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132579348 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132579665 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132580005 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132580183 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132580380 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132580401 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132580521 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132580539 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132580557 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132580566 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132580568 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132581053 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132581167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132581307 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132581386 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132581582 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132581619 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 132581723 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132581835 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132581846 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132581884 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132581893 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132581986 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132582232 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132582375 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132582381 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132582472 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132582508 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 132583075 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 132583137 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132583211 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132583821 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132584061 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 132584197 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 132584415 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 132584578 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132585113 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132585456 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132585972 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132586177 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132586473 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132586548 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132586865 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132586929 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132589838 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 132591687 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132591777 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132594486 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 132594663 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132596182 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 132597115 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132597254 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 132597257 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 132597696 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132599908 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132600095 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 132600610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132600711 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132600752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132601058 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 132603365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132603400 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132603648 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132603761 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132603763 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132603892 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 132604120 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 132604148 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 132604524 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 132605049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132605979 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132606403 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132608220 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132609125 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132609517 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132609661 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132609703 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132610851 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132613272 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 132616781 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132621311 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132621606 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132623163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132623187 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 132625517 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 132625567 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132625818 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132625948 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 132626322 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132626771 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 132628738 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132628893 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 132628894 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 132629396 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132632193 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132634281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132637621 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132637891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132638438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132639253 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132639584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132640819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132641691 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132647637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132649033 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132653932 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 132663053 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132665040 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 132666934 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132667219 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 132668461 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132669738 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132669776 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132669836 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 132670047 C A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 132670286 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 132670312 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 132670392 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132670423 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132670425 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132670610 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132670952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132671082 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132671710 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 132671743 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132671873 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 132672110 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132672291 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 132672343 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 132672549 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 132672758 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132672824 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132672889 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132672914 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132673049 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132673097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132673274 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132673304 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 132673307 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 132674235 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132675181 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132675567 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132675653 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132675659 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132679909 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132682434 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 132682435 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 132684723 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 132684957 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132687957 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132688753 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132689994 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132690000 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132690003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132690012 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132697651 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 132699751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132700513 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 132701338 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132701346 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132702573 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132705684 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 132708789 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 132709328 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 132709676 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 132709744 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 X 132710197 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 X 132710942 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132714278 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132714868 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132714978 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 132716009 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132722387 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132726900 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132728538 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132728902 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132730349 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132730402 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132733894 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132735412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132739192 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132740807 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132740943 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132745248 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132746308 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132747517 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132748256 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132748260 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132748314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132749238 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132751142 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132752170 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 X 132752326 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132752780 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 132755574 A T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 132759691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132764020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132765606 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132766401 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132766819 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132770491 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132770978 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132772987 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132773790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132774084 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132774698 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132775992 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 132777371 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132777932 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132779002 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132779403 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 132781677 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 132786696 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 X 132787575 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132788369 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132788748 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132790619 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 132791935 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132792941 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132798487 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 132798488 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 132798869 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 132800363 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132801123 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 X 132801500 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 132801717 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132802203 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132802593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132804507 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132808845 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 132811005 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132811249 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132811656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132812411 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132815490 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132815791 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132816887 T C N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 X 132819757 C A Y N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 132821460 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132822172 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 132823227 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 132824801 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132826179 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132826757 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 132827079 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132827101 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 132827506 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132829538 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132831747 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132832095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132833933 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132835487 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132836780 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132839744 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132840558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132841159 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132842205 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132842255 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 132842607 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132843950 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132844468 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132845683 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132846598 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132847611 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132848404 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132851352 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132851689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132851748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132852919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132853207 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132853705 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132854881 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132856283 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132856833 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 132858782 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132862715 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 132862932 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132863043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132863082 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132863553 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132865356 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132865443 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132865624 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132865685 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132865966 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132869208 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 132869851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132871123 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132872107 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132872610 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132874701 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132875733 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132882280 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 132882282 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 132882903 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132884746 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132885306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132887086 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 132887207 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 132887354 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132887522 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132887992 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 132889056 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 132889321 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 132890011 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 132891506 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 132893279 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 132894879 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132895262 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132895601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132897582 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 132898690 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 132900920 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 132900921 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132901099 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132901426 T C Y Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 X 132902264 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132904040 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132904060 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132904276 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132904789 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132905024 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132905602 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132921792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132924254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132927588 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132944210 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132950361 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132951624 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132952034 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132952185 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 132952494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 132953327 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132953339 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 132961780 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 132981869 G C N N 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 2 4 1 0 2 X 132981873 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 132982289 T G N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 132982320 A C N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 132984636 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 132985256 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 132985266 G A N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 132989499 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 132991445 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 132991890 A G N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 133001260 A C N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 133002985 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133004497 T A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 133004638 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 133004806 T C N Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 X 133011582 A C N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 133019534 T G N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 133019944 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 133021278 T G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 133021378 C T N Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.5 0 0.5 4 4 2 0 2 X 133021396 C A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 133022906 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 133022962 T C N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 133029951 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 133030506 C T N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 133030839 T A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 133039798 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133040002 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133040838 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 133042228 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 133043183 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133046025 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133046076 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133048272 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 X 133049897 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133050108 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133050642 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 133053595 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 133053872 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133056160 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133056460 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 133056583 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 133056588 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 X 133056593 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 133056602 C G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 X 133056609 T A N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 X 133056611 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 X 133056649 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 133059187 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133064378 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133066264 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133067045 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133068199 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133068490 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133074885 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133075066 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133078137 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 133078377 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133090391 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133094186 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 133094370 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 133102064 G C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 133106106 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 133107499 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133111967 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 133113289 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133114103 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133117940 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 133118681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133119167 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133120600 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 133121130 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 133121654 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133121667 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133121672 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133121688 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133121932 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133124840 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133129394 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 133129669 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133129860 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133130424 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133131438 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133131778 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133132269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133133032 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133133285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133133321 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 133133708 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133133996 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133134293 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133134510 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133134825 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133135029 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133135083 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133136550 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 133138069 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 133138234 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 133141174 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 133141845 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133143801 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 133144118 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 133144351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133146506 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133153744 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 133154826 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133154831 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133155369 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 133155775 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133155797 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133156498 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 133156743 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133157244 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 133158761 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133159244 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 133159496 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133160108 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133161347 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 133161714 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133161904 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133162183 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133162293 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133162706 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 133163064 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 133163787 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133164634 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 133164753 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133164928 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133165022 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133165168 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133165527 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133165537 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133165637 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133165647 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133165826 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133165845 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133166128 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133166194 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133166230 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133166267 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133166276 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133166289 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 133166395 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133169116 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 133169139 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 133169158 T G N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 X 133169332 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 133169407 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 133169416 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 133170133 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 133172258 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 X 133173463 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 133174252 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 133175745 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 133175809 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133178286 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133178692 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133180432 T A N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 133180736 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133182457 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 133190361 G C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 133190902 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133191103 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133193776 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 133194786 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 133194857 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133196428 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 133197256 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 133198297 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133198421 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133198478 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 133198638 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133202780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133204060 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133204683 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133205656 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 133206334 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133208491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133210981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133211344 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133211802 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133212421 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133213038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133215042 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133215204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133215469 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133216485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133216713 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 133217797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133219368 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133222618 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133223091 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133223838 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133224313 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 133225850 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133230943 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133230973 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133234585 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 133234629 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133235796 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133236435 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 133238938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133239740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133239999 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133240083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133240127 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133240253 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133242131 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 133244758 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133244813 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133246836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133247944 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133248414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133250061 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133250827 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133251062 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133251486 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133251507 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133252671 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133252672 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133252986 G T Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 133253405 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133253946 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 133253982 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 133257370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133257469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133259130 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133259325 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133265279 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 133265403 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 133269328 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 133270909 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133272652 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133273488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133276079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133277993 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133278383 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133281168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133281950 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133283115 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133285224 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133285234 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133285721 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133286274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133289114 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133289490 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 133289967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133290479 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133292996 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133294582 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133295109 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133296638 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133302265 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 133305374 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133305607 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133306641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133313758 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133315388 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133315493 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 133316226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133316478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133318085 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133319996 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133320303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133326163 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133327894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133330414 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133335904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133338502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133339180 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133339663 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133340507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133340508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133341034 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133343068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133343354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133343415 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133343522 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133344334 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 133344446 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133344848 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 133344891 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 133344898 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 133344933 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 133344940 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 133345015 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 133345035 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 133345229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133351910 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133353179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133353666 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 133354603 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133357391 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133357481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133357639 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133358207 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133358820 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133362203 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133362505 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133363195 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133364081 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 133364817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133365446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133367080 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133367635 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133367707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133369770 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133371945 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 133374382 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133375331 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133377823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133378001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133382069 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133383677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133385919 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133386338 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 133388042 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133388102 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133389624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133390272 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 133396301 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133400311 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133401920 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133404608 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133405453 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 133406264 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133410858 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133411138 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133412625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133413304 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133413332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133416196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133416308 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133419368 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133424350 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 133427928 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133428030 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133431264 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133435123 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 133435752 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 133443388 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133455972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133456031 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133456052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133457245 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133457352 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 133457949 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 133457978 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 133458060 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 133461151 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 133461461 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 133461713 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133467760 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133467821 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133469662 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 133469785 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133469899 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 133469924 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 133469948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133470325 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133471232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133472551 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133473479 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133474410 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 133477387 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133481693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133485164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133485850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133487570 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133489676 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133493972 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133494660 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133498692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133498748 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133500302 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133501733 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133510221 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133510932 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133513331 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 X 133514326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133514510 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133516026 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133518298 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133519245 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133519942 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133521279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133523440 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 133524801 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133524890 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133525362 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133525539 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133527851 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133528002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133528853 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 133528895 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133529793 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133530976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133531631 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133533261 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 133534183 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 133534257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133534942 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 133535818 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 133535885 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133536396 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133537569 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 133537603 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 133537928 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133539859 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133540045 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 133541779 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133542820 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133542981 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133543112 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 X 133543949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133544474 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133544644 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133544706 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 X 133544950 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 X 133545023 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 X 133545129 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 X 133545140 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 X 133545165 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 X 133545190 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 X 133545217 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 X 133545239 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133545412 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133546296 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 133546903 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133547191 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 X 133547667 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133547849 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 X 133548159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133548271 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 133548909 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 133548920 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 133549537 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 133549850 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 133550356 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 133550819 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133552558 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 133558217 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133558937 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133559872 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133566079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133568507 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 133568917 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 X 133569317 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 X 133570104 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 133580820 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 X 133582623 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133584920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133588014 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133588743 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133591527 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133593174 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 133594774 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 X 133594822 T G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 X 133595425 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133595846 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 X 133595859 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 X 133595862 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 X 133595867 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 X 133595897 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 133598365 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 133598763 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133598893 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 133598981 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 133599072 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 133599079 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 133599114 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 133599333 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 133599630 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133599805 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133600121 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 133600126 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133600151 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133600152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133600167 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133600371 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 133600437 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133600589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133600613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133600953 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133600967 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 133601022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133601210 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133601227 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133601352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133601549 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133601921 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133603538 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 X 133604294 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133606239 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133606858 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133607045 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133607068 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 X 133607077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133607190 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133607244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133607251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133607317 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 133607319 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 133607339 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 X 133607423 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 X 133608216 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133609284 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 133611955 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133612648 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133613083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133613366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133614347 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133614971 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 X 133616310 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 133617426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133620947 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133621134 G A N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 X 133624896 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 X 133624984 C T N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 X 133626143 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133626381 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 X 133628504 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133628534 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 133630681 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133631362 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 133632392 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133633624 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 133633854 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 133636920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133637961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133638536 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133638716 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133647504 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 133647541 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 133647649 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 133647803 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 133651191 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 133651783 T A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 X 133652499 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 X 133652566 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133654679 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 133654856 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 133656216 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 133656600 C G Y N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 X 133657992 A C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 133658019 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 133658866 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 133662468 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133663411 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 133666834 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 133669155 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 133670888 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 133671107 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133672948 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 X 133674885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133675274 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 133675373 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133677973 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133678354 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 133678414 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 133678449 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 133678598 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133681172 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 133681748 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133682175 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133682484 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 133683193 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133683274 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133683562 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 133684130 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133684469 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133684471 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133684673 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 133685093 G A N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 X 133685135 T C N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.153846153846154 21 5 10 1 2 X 133685154 G C N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 X 133685410 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 133685411 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 133685759 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133686078 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133686294 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133687002 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 133687291 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133690073 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133690895 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133691027 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 133691805 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 133691887 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133692077 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133692661 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133692666 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133692955 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 133696138 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133696463 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 133702400 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 133702648 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 133703439 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 133704805 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133705223 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 133707449 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 133707544 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 133707712 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 133708469 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 133708696 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133708834 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 133713637 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 133713869 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 133714792 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 133714813 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 X 133716121 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133716476 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133716739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133717833 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133717834 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 133718190 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 X 133728466 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 133728489 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 133728553 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 133728689 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 133728700 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.555555555555556 0.111111111111111 0.333333333333333 22 14 10 2 6 X 133728726 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 X 133728744 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 133730837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133736468 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133736580 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133736619 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 133737746 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 133737783 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.578947368421053 0.105263157894737 0.315789473684211 24 14 11 2 6 X 133738213 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 133738825 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133740775 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 133741273 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 X 133742248 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 133742266 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 133742392 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 133742668 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 133742801 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 133742910 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 133742915 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 133742916 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 133743335 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 133743450 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.4375 0.125 0.4375 16 16 7 2 7 X 133743759 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 133744359 A C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.352941176470588 0.117647058823529 0.529411764705882 14 20 6 2 9 X 133745292 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 X 133747740 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133748145 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 133748369 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133751056 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 133751698 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133753597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133754460 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133755923 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133756122 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 X 133757143 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 133758823 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 133761975 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 X 133762617 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 133767303 G A N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 X 133769519 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 133773052 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133777665 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 133777869 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 133779945 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 133781124 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 133782875 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 133786835 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 133787691 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 133791288 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133794175 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 133800141 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133800837 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133800979 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 133801215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133801590 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 X 133802762 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 133805060 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 133808538 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133808906 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 X 133809499 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133809659 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 X 133810267 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133810544 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 133810547 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133810747 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 X 133811529 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133811640 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 133811833 T A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 X 133812077 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 X 133812563 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 X 133812710 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 133812730 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 X 133813435 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 133813457 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 X 133813529 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 X 133813555 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 133813711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133813879 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 X 133813929 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 133814246 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 X 133814368 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 133814516 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 133814742 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 X 133814818 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 133815128 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 133815291 A T Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 X 133816007 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133816211 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 133816271 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 133816411 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 133816662 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 133816665 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 133816687 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 133816719 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 133817018 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 133817408 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 X 133817709 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 X 133818876 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 X 133819650 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133819670 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 133819780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133819836 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 X 133820821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133820911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133820967 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 133821013 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 X 133822014 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 133823152 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 X 133824862 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133825059 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133838189 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133838261 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 133838836 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 133839836 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 133842061 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133843231 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 133843844 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133844263 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 X 133844289 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133844300 C A Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 X 133844308 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133844544 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133844565 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 X 133844720 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 X 133844840 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 X 133844843 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 X 133845155 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 X 133845872 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 X 133845996 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 X 133846047 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 X 133846198 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 X 133846349 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 X 133846511 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 X 133846601 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 X 133846945 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 133846997 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 X 133847144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133847426 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 X 133848322 C G Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 X 133848473 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133848513 T C Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 X 133848772 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 X 133848917 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 X 133849031 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 X 133849164 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 X 133849202 G A Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 X 133849342 A C Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 X 133849391 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 X 133849775 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133849776 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133849959 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 X 133850137 A C Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 X 133850139 A T Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 X 133850359 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 X 133851509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133852448 A G Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 X 133852497 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 133852867 A G Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 X 133852889 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133854361 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 X 133854885 T C Y Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 X 133854971 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 X 133855488 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133855654 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 X 133855922 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 133856488 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133856544 C T Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 X 133856843 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133857017 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 X 133857082 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 X 133857174 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 X 133858777 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 X 133858863 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 X 133858906 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133859685 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 X 133859960 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 133859975 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 X 133860026 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 X 133860078 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 X 133860202 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 X 133860294 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 X 133861019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133861142 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 X 133861450 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 X 133861509 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 X 133862112 T G N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 X 133862529 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 133862681 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 X 133862907 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 133863273 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 X 133863340 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 X 133863632 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 X 133864135 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 X 133864155 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 X 133864174 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 X 133864469 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 X 133864476 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 133864547 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 X 133865041 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 X 133865299 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 X 133865378 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 X 133865485 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 X 133865526 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 X 133866076 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133866284 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 X 133867646 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133867799 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 X 133867937 C G N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.3125 0.1875 0.5 13 19 5 3 8 X 133868144 G C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 X 133868844 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 133868931 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 X 133868985 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 133869057 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133869161 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133869267 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 X 133869477 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 133870089 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 133870167 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 133870276 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133870620 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 X 133871195 A C Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 133872157 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133872248 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133872297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133872333 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 133872554 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 133872633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133872663 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 X 133872760 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 133872765 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 133872775 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 133872832 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133872838 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 133872954 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 133873032 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 X 133873085 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 133873166 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 133873177 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 133873270 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 133873783 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 X 133873966 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 133874355 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 X 133874626 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 133874658 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 X 133874872 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133874906 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 X 133875309 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 X 133876314 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 X 133876378 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 133876490 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 133876619 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 133876687 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 133876789 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 133876815 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 133876817 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 133876838 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 X 133877035 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 X 133877482 C T N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 X 133877532 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 X 133877711 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 133877747 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 133878330 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 X 133878341 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 133878421 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 X 133878446 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 X 133878759 G C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 X 133878807 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 X 133878849 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 133878975 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 133879072 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 133879110 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 X 133879122 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 X 133879214 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 133879298 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 X 133879470 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 X 133879553 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 X 133879729 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 X 133879739 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 133879780 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 133880008 G A Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.214285714285714 21 7 10 1 3 X 133880152 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 133880434 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 X 133880503 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 X 133880633 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 133880675 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 X 133880815 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 X 133880819 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 133881068 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 133881212 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 X 133881727 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 X 133881878 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 X 133881880 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 X 133881932 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 133882999 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 X 133883754 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 133883755 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 133885380 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 133885419 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 X 133885515 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 133885516 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 133885555 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 X 133885976 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 X 133886219 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 133887312 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 X 133887322 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 133887323 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 133890122 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 X 133890282 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 X 133890391 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 X 133890434 C G Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 X 133890457 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 X 133890573 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 X 133890595 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 X 133890624 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 X 133890641 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 X 133890680 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 133890742 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 X 133890756 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 X 133890788 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 X 133890794 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 X 133890820 T A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 X 133890958 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 X 133891061 T C Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 X 133891128 A T Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 X 133891437 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 X 133891445 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 X 133891462 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 X 133891586 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 X 133891775 G C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 X 133892020 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 X 133892328 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 X 133892359 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 X 133892405 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 X 133892470 C G Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 X 133892477 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 133892687 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 133892825 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 X 133892995 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 X 133894348 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 133894787 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 133894795 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 X 133894796 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 133894891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133895147 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 133896054 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133896949 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 133897263 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 X 133897555 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 X 133897626 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 X 133897947 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 X 133898296 C G N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 X 133899263 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 X 133899286 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 X 133899534 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 X 133899621 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 133899692 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 X 133900070 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133900573 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133901145 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 X 133901209 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 X 133901275 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133901500 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133901612 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 133903457 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133904182 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 X 133904211 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 133904466 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 X 133904529 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133904787 A C Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 133905984 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 133906169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133906607 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133906746 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 X 133906978 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133907085 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 133907285 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 133907339 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 X 133907781 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133907848 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 133908910 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 133908950 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 X 133909033 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 X 133909171 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 X 133909210 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 133909511 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 133909539 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 X 133909543 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 X 133909785 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 X 133909890 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 X 133910134 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 X 133911860 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 X 133911959 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 133911988 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 133911990 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 133912283 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 133912684 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 X 133912784 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 133913219 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 X 133913353 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 X 133913387 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 X 133913444 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 X 133913607 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133914418 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 133914841 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 133914971 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 133915790 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 133915936 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 133917924 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 133924423 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133924770 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 133925213 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133925551 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133925714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133926386 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 133926401 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133927363 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133929974 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133930366 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 133930581 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 133931224 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133933750 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 133933897 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133941228 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 X 133942258 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 133942365 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 133942863 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 133942864 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 133943020 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133943554 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 133945189 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133946285 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133946483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133955583 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133955677 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 133956840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133958247 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133958979 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133959458 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 X 133959877 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 X 133960541 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133960712 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 133960819 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 133968828 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133969787 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 133970116 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 133970720 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133970866 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 X 133970953 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 X 133971058 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 X 133971548 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 X 133972378 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 X 133972500 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 X 133972503 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 X 133974372 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 133974554 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 133974618 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 X 133974755 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 X 133974912 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 133975007 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 X 133975295 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 X 133975498 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 X 133975655 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 133975832 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 133975866 T G N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 X 133976011 T G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 X 133977024 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 X 133978038 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133978192 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 133979288 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 X 133979507 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133979634 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 X 133980315 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 133981072 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 133981478 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 X 133981893 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 133981950 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 133982357 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133982469 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 X 133982557 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 133982604 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 133982690 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 133982871 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 133983694 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 133984577 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133985292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133985458 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133985533 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 133985666 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 133986775 A C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 133987181 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 X 133987194 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 133988854 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133989983 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 133990614 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 133992188 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133992812 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133995126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 133995415 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 133996318 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133996363 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 133998376 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 133998502 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134001688 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134005396 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 134006220 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 134007172 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 X 134007296 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134009865 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 X 134010099 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 134010162 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134011879 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134015937 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 134018166 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134018277 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134018759 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134019417 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 134019472 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134020975 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 134021308 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 134022153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134022165 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 134022317 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 134022496 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134025987 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 134025988 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 134026580 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134026683 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 X 134026711 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 X 134027444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134027642 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134030204 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134030960 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134031044 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 134031801 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134032242 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134033763 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134034506 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 134034985 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 134035172 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134043696 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134043831 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134043979 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134045527 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 134046042 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 X 134047898 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 X 134050503 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 X 134051362 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 134052179 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134052908 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 134053339 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 134054114 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134055379 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 134055595 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 134056595 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134059278 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 134059493 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 134060147 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134061155 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 134061580 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134061764 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134061852 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 X 134062443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134062821 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134062823 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 134063194 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134063211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134064878 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134065923 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 134066015 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134066018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134067004 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134071518 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 134073564 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134074928 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134075805 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134076965 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 134077507 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134078268 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134079076 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134083759 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134084658 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134085568 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 134087852 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134088296 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 X 134088729 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134088872 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 X 134088929 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 X 134089356 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 X 134089413 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134089477 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134089666 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 134089677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134089827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134089883 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 134090203 G A Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 X 134090214 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 X 134090702 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 X 134091118 A C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 X 134091162 G C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 X 134091217 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 134091236 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 134091545 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 134091563 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 134091652 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 X 134092509 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134092679 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134092759 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 X 134092897 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 134093190 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 134094280 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134095331 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 134096990 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134098086 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 134100009 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134101931 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 134102138 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 134103487 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134105963 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134106325 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 X 134106384 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 X 134106394 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 X 134106544 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 134107112 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134107628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134108793 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134108848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134110201 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134110578 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134111333 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134111378 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 134111675 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134111772 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134112659 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 134112856 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 134114470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134114689 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134114743 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 134115376 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 134115967 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134117601 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134118326 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 134118549 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 134118647 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134118702 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 134118720 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134119132 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134120324 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 134120500 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 134121480 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134122047 A T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 X 134123328 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134124023 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134125822 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 134126075 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 134127074 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134127142 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 134127447 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134128410 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 X 134129490 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134129873 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134130367 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 134130404 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 134130808 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134130948 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 134131389 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 134131404 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134131624 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134131636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134132108 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 134132323 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134132376 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 134132394 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 134132413 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134132469 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 X 134132828 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134132862 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 X 134134941 T C N Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 X 134136296 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 X 134137762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134138199 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134139289 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134139510 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134139594 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134139753 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134140130 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 134141066 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 134141094 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 134141375 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134141481 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 X 134141689 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 134141776 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 134142277 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 X 134142693 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134142752 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 134143057 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 X 134143116 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 X 134143276 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134143418 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 134143852 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 134146517 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 134146616 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 X 134149374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134151047 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134151978 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134153323 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 134153411 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134155106 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134157524 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134158329 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 134161682 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 134162372 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134162494 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134162805 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 134162893 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134163143 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134163754 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134163932 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 134165246 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 134166367 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 134167078 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 134167079 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 134167455 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134169751 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134170904 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 134170905 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134171242 A G Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 X 134171463 T G Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 134172951 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134178145 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134178515 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134181079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134181627 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134182406 C T N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 X 134183087 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 134183758 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 X 134187622 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 134189709 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134190015 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 X 134190392 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 134192996 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134193375 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 134194935 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134195292 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 X 134195861 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134196350 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134196730 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 X 134196782 T A N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 X 134196802 A T N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 X 134196976 C G N N 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 2 4 1 0 2 X 134197218 A G N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 X 134197328 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 X 134197384 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 X 134197392 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 X 134197396 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 X 134197524 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 X 134197621 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 134197644 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 X 134197703 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134197730 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 X 134197807 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 134197974 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 134197985 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 X 134198004 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 X 134198155 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 X 134198330 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 X 134198397 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 X 134198822 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 X 134198934 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 X 134199012 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 X 134199020 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 X 134199028 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 X 134199512 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 134199777 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134199898 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 134200108 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 134200723 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 134201330 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 134201376 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 134201885 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 134201995 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134203640 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134205171 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 134205204 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 134205332 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 134205757 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134205785 T G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 X 134206716 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 134208191 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134208259 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 134208697 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 X 134209538 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 X 134209818 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134211447 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134212265 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134212641 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 134213325 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134213572 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134214792 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 134215862 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 134216536 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134219124 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134219878 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134220110 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 134222680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134223023 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134231269 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134232523 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 134232543 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134232786 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 134234783 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134235206 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134235250 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134235810 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 134235993 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134236954 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134239120 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134239298 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134240936 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134242452 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134245163 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 134247778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134251582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134255170 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134259572 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 134260103 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134263310 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134263507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134267508 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134267981 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134268307 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134268560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134269144 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134269476 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 134273076 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134273337 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134275383 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134275385 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134275392 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134276137 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134277862 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134278366 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 134278846 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 134280739 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134284696 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134286017 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134287681 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134288815 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134294130 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134299019 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134302373 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134303062 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134304708 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134305289 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134306602 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 134309106 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134309352 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134311264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134311283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134311720 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134311814 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134311925 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134314541 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134314950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134316058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134317618 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 134317939 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 134320548 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134322660 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134323743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134324614 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134325216 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134330417 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134330644 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134331029 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134331372 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134331440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134332344 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134334447 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134335543 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 134335738 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134336256 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134336479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134336803 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134337228 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134337365 C A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 134338288 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134342683 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134342692 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134343511 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134343709 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134345322 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134345527 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134346443 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134350313 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134352096 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134356061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134357200 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134359292 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134359888 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134360773 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134360917 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134362333 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134363975 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134367751 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 134367761 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 134367954 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134368330 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134369858 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134372257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134373312 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134380343 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 134382375 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134382534 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134384938 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134386394 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134386524 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134386554 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134387107 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134387795 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134388964 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 134390166 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134391203 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134393342 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134393873 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 134394075 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134395487 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134397826 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134402928 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 X 134421863 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134432636 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 134443014 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134455415 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134487645 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 134527813 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134531072 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134535305 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134552743 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134552839 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134556776 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 134558072 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134584882 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134585212 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134586696 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134591956 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134593495 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 134594900 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134594995 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134595204 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134595516 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134595714 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134597495 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134600587 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134600631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134601293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134602479 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134604750 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134606548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134609622 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 134610723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134610881 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134611344 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 134615552 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134615658 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134616092 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134617966 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 134619695 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134622151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134622383 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 134623688 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134626539 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 134626618 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 134626837 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134628106 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134630762 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134630936 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 134631374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134635551 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134635918 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134639689 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134642698 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134646598 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134648358 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 134648360 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 X 134648371 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 134651548 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 134651645 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 134653033 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 134656314 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 134656396 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 134659251 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134659710 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134668064 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134670539 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134672050 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 134672843 C A Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 X 134673887 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 134674560 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134675192 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134677997 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 134680659 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134681967 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134682019 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134683540 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134683759 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134683879 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134684592 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134684612 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134686528 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134690156 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134690910 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134690916 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134691298 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134691547 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134693073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134694948 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134695308 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134695463 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 134697560 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134699432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134699742 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134700608 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134701089 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134702231 C A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 134703338 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134703757 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134704360 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134704692 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134704999 T A N N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 X 134705037 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 134706432 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134706526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134706948 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134707219 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134708303 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 134710286 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134711405 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 X 134711802 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134711872 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 134712599 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134717401 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134718472 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134719925 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134721436 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 134722290 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134722616 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134722704 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134724267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134725327 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 X 134726373 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134734019 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 134734318 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134737094 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134739026 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134739360 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134741392 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134742355 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134743943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134744192 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134747921 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 134748087 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134749090 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134750971 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 134751208 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134752184 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134752768 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134752841 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 134752861 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134756546 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134764361 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134764624 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134765804 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 X 134767525 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134774084 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134774712 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 134774991 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 134775047 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 134776493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134776644 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134777744 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 X 134778205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134778334 T A Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 X 134778451 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134779185 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 134779188 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 134779235 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134779361 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 X 134781121 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 134781256 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134781353 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 134781354 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 134781391 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 134784704 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 134787648 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134788801 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134789295 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 134790467 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134790508 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134793074 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 134794775 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134795299 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134796182 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134797249 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134797386 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134798345 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134800131 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134800170 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134800746 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134802747 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134806464 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 134808051 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 X 134808077 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 134808784 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 134809358 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 134809359 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 134809886 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134810299 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134810383 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134810821 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134813310 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134813344 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 134813366 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134813757 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134814022 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 134814294 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 134814397 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 134814439 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134816918 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 134816926 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 134820426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134822756 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134824226 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134824266 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134825417 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134826722 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134827095 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134827217 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 134828153 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 134830286 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134830599 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134830919 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 134832023 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 134840521 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134840735 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134840852 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134842594 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134844011 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134844678 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134845283 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134845731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134847389 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134847576 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134850044 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134850047 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134850918 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134851326 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134851577 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134851990 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134852150 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134852476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134852822 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134852896 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134852946 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 134859618 A C Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 134859700 T A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 134859753 G T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 134860538 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134861990 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 X 134861999 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134862116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134862119 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134864241 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 134868735 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134869368 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134869752 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134872283 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134872359 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134873354 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 134873448 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134873744 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 134875884 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134876513 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134877349 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134880693 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134881515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134892588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134893320 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 134894403 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134897867 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134898185 T G Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 X 134898884 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134900458 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134901420 A T N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 X 134901421 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 X 134901426 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 X 134901498 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 X 134901977 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 X 134902077 G C N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 X 134902362 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 X 134902569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134902582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134903472 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 X 134904800 T A N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 X 134905553 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 X 134905941 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 X 134906167 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134906444 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 X 134906501 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 X 134906791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134907916 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 134908009 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 X 134908588 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 X 134908967 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 X 134909392 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 X 134909743 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134909945 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 X 134910120 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 134910284 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 X 134910403 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 X 134911028 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134911097 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 X 134911618 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 X 134911852 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 134912039 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134912871 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134913800 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 X 134914046 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 X 134914371 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 X 134915684 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 X 134915955 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 X 134916104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134916312 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 X 134916804 G A Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 X 134917138 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134917204 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134917727 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134918758 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134919073 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134919074 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134919261 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134920319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134921632 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 134921845 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 134924934 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134925203 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 134925866 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134926379 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 134926411 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134926939 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134929467 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 134932321 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134932366 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134932422 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134932516 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134932553 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134934768 G C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 134938203 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134938637 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134938850 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134939235 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134939292 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 134939543 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134940432 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134942656 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134942690 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134943054 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 134943605 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 134944622 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134945993 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134946381 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134946708 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134947057 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134948726 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 X 134949006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134950447 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 134952580 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134952663 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134955833 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134957756 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 134959423 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 134959610 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134960800 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134960936 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134964647 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134966344 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134966451 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134967228 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134972160 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134973650 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 134975500 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 134975549 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134975686 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134975891 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134975994 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134976376 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134976583 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134977740 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134979560 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134983918 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134984415 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134986201 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134986264 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134986840 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 134986843 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 134987375 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134987654 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134990464 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 134991320 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134992261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 134994906 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 134997691 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 134998866 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 134999367 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 134999825 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 135002790 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135004209 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 135006155 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135007280 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 135008431 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135010104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135010480 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 135012377 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135013038 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135016455 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135016529 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 135016993 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 135018636 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135019029 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135019525 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135019734 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135019735 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135020883 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135026459 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135027929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135029826 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135031015 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135033744 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135036334 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135052984 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135053564 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135056422 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135060393 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135060824 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 135061231 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 135061759 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135062462 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135064806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135068928 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 135070443 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135070485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135071433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135074535 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135074609 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135076565 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135076743 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135078232 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135078632 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 135078633 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135079123 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135079340 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 135080266 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 135081363 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135081419 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135081424 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135081454 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135083696 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135084812 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135088053 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135088334 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135089020 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135090327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135090936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135092808 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135092859 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135095011 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135096179 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135097485 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135102551 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 135103576 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135105223 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135105707 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135114760 T A N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 135115975 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135116266 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 135117266 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 135118801 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 135126976 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135130469 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135131396 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 135131623 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135136957 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135138167 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135141212 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135141780 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135143911 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135149989 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135152111 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135152879 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135162464 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135164470 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 135168889 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135169796 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135171576 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135175194 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135175955 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135176052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135179442 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 135182940 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135184345 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 135186173 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135192343 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135192496 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135194550 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135197269 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135213513 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135218157 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 135219266 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135223254 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135225432 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 135228752 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135230229 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135231414 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 135231423 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 135233228 G T Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 135234191 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 135234371 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135235476 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 135235911 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135237524 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135238142 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135238541 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135238868 A C N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 135238965 C G N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 135239189 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135242996 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 135243299 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135244295 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135244862 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135249231 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135253009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135255443 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135255557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135256957 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135258348 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135260407 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135260450 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 135261169 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135261710 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135262658 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135263550 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135266319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135275675 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135276000 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135276849 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 135276850 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 135279675 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135280315 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135280813 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135283901 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 135290216 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135290254 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135290266 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 135290361 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135291555 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135291557 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135293046 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135294212 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135297200 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 135297256 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 135297545 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135299250 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135300063 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135303747 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135306726 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135308415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135308440 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135308734 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 135309281 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135309743 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135311458 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135311817 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135312328 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 135312801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135313129 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135313499 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135315590 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135316183 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135316195 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135316590 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135317529 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135321193 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 135322102 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135324782 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135327256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135327646 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135327961 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 135329976 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135331972 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 135332737 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135333497 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 135340788 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135341045 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135345437 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135345939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135346788 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135349024 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135349061 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 135349553 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135349580 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135351843 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135353716 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135354591 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135355827 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 135360215 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 135361860 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135363569 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135364122 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135366015 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135367311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135367893 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135369014 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135369267 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135369845 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135370235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135370308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135371013 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135372433 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135373779 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135374232 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135374309 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135374785 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135377769 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135379033 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135379136 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 135379558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135383303 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 135384096 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135386687 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135389844 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 135392611 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135392820 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135393074 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135394110 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135394741 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135394765 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135397376 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135400950 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135401542 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135403924 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 135404904 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 135405753 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135406107 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135406415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135406957 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135409308 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135409309 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135409524 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135410503 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135410782 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135410796 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135411238 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135411239 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135413183 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135413274 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135414176 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135414213 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135416649 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135419829 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135420390 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135421852 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135424032 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135425339 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135425423 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135425628 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135428307 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135429316 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135429576 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 135430571 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135431431 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135432443 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 135432487 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 135432831 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135433133 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135433289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135433510 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135433687 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 135433724 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 135433893 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135433956 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 135434345 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135434462 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135436234 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 135437305 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 135441019 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135442764 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135445439 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135449436 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135450085 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135450128 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135452160 C T N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 135453388 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 135453625 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135453746 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135454450 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 135457740 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135458328 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135458415 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135474723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135480183 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135496186 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135498312 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135499584 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135500462 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135508517 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135509418 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135509453 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135511202 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 135511218 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135511219 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135512636 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 135512697 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 135514329 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135520364 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 135520564 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 135522083 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135523789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135524508 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135527892 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 135528610 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135529528 C T N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 135529713 G T N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 X 135533836 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135535389 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135536424 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135536840 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135537516 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 135539469 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 135540682 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 135541018 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135542591 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 135543393 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135544379 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135546610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135547718 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 135548158 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135549661 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 135549683 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 135549901 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 135551212 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135552253 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 135554774 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135554894 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135555642 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135559021 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 135559751 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135559897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135559918 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 135560397 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 135561858 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 135562236 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135562239 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 135562293 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135562315 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135563258 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 135563354 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 135563403 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 135563410 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135563498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135563543 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 135563936 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135564009 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135564017 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135564070 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135564102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135564157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135564176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135564184 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135564487 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 135564562 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135564732 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 135564780 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 135565119 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 135565293 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135565322 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135565412 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 135565586 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 135565613 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 135565999 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135566027 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135566309 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135566323 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 135566671 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135567147 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 135567260 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 135567271 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135567320 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135567351 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135567498 C G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 X 135567699 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135567713 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135568563 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135568693 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135568698 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135569147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135569157 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135569351 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135570347 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135570390 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135570475 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135570791 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135570973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135570995 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135571413 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135571473 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135571479 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135571751 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135571935 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 135571953 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135572256 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135572580 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135573070 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135573814 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 135573818 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 135575318 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135575523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135576114 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135576162 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 135576658 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135576801 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135577607 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 135578235 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135578261 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 135578308 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 135579139 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135579878 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135579965 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 135580869 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135581038 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135581135 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135581552 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 135581866 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135582852 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 135583939 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135587107 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 135587923 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135589568 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 135590246 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135590455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135590476 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135593993 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135594066 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135594186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135596358 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 135596359 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 135596516 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135599302 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135599898 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 135599986 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135600717 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135601451 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135601490 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135601695 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135602099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135602534 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135602592 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 135602594 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 135602648 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 135602781 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 135603633 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 X 135603771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135604197 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135605864 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 135607516 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135608346 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 135612007 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135612079 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135617374 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135618228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135619216 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135619225 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135619279 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135619660 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135620656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135620757 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135621279 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135627833 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135628029 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135628874 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135628931 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135629608 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135629610 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135630430 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 135631735 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135631817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135631957 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 135632017 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135632267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135632570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135632696 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135632797 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135632798 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135632880 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 135633058 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135633311 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135637322 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135637381 G C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135638843 A G Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 135639670 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 135640819 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 135640825 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 135640892 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 135641444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135641764 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135641811 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 135641936 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 135641941 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 135642331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135642852 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135644317 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135644576 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 135644679 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 135644852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135644874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135644887 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135645129 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135645563 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135645752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135645945 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135646021 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135646645 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135646718 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135647284 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135647874 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135650994 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135656026 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135657316 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135658037 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135663651 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135663816 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135664078 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135665407 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135675032 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135676668 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135678601 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135680027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135682696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135683144 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 135684142 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135688134 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 135690257 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 135692541 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135694929 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 135696785 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 135698014 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135699007 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135699861 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135701581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135703053 G T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 135706368 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135712387 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135713173 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135713600 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135713791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135714728 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135715189 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135715397 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135715960 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135716521 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 135718193 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135720592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135722539 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135724462 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135728975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135734367 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135736237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135740604 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 135741726 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 135753050 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135753108 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135753380 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135754466 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135755662 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135758838 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135762657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135763347 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135765222 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135765749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135768213 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135768435 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135775275 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135775857 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135778426 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135778925 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135779882 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135779995 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135780215 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 X 135780374 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 135780826 A T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 X 135780961 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135780965 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135780972 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135780986 C A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 X 135781102 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135781199 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135781226 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135781247 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135782737 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135787434 A C N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 X 135787501 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135790221 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135792952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135793279 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135794239 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135795735 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 135800554 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 135800634 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135801300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135801642 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135802433 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135804777 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135805138 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135808932 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135810634 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135812307 G C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 135812406 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 135812446 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 135812828 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 135814268 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135814826 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135814827 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135817620 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135817746 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135818854 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135820033 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135820437 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 135821315 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 X 135821858 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135823084 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 135824907 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135841221 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135843957 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135852322 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 135853701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135862526 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 X 135881259 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135881697 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135884967 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135885708 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135889103 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135889266 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135890092 G C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 X 135890308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135891086 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135896964 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 135897015 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 135897573 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 X 135898008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135899654 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135899666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135899691 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135900764 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135900910 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 X 135901007 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 X 135901024 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135901040 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135901429 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 X 135903111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135903528 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135904637 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135906991 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 X 135944951 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135949637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135950734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135950942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135962139 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 135965321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135966205 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135967794 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135968529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135969195 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 135969288 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 X 135969290 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 X 135969810 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 135970452 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 135973756 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135978514 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135978786 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 135979672 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 135981867 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135988111 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 135998825 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136003468 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 136006978 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136009144 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136011387 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136011450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136012752 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136013485 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136014792 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 136015196 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136017504 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 136019419 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136020100 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136021464 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136022674 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136023484 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136024339 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136024785 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 136027054 G A N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 136027423 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136034196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136037976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136040722 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 136041179 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136041198 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136041729 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136042013 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136043783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136044341 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 136045491 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136045586 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 136047575 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136055804 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 136056574 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136061105 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136062028 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136062050 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136062052 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136062431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136063079 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 136063263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136063291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136065282 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136067930 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 136068005 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 136068684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136071150 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 136071527 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136071540 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136072343 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136073560 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136074006 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 136075605 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136077689 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 X 136078290 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136079236 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136079776 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136081941 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136083638 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136083771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136091389 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136091607 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136093472 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136095115 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136095427 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136095816 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 X 136097516 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136098253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136098805 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 X 136098940 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 X 136099078 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 X 136099202 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136099622 A T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 X 136099744 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136100315 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 X 136102052 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136102053 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136102132 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136102173 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136102228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136108044 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 136108566 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136108932 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 136110891 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136117776 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 136121289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136123533 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136123625 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 136123900 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136125532 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136129376 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136129696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136131493 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136131611 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136131793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136133534 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136134138 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136134566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136135131 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136135281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136136328 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 136138131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136138906 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 136142739 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136143052 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136143703 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136144029 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136145052 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136145191 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136146194 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 136146806 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 136150435 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136150745 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136151757 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136152027 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136154323 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 136154945 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136155388 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 136156734 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 136158587 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136159166 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136159583 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136164241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136164464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136164806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136165145 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136165708 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136167598 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136168450 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136168716 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136170439 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136173588 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136174510 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136176002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136177006 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 136177160 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136177507 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 136177616 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136177646 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136178067 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 X 136178298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136178561 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 X 136178756 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 136178783 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 136178885 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 136179238 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 136179942 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 136180401 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 136180884 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136180932 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 X 136181110 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 X 136181118 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 X 136181192 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 136181227 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 X 136181278 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 136181293 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136181556 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136181564 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136182168 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 136182444 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 X 136182479 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 X 136182488 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136182729 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136182793 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 X 136182821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136183011 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 X 136183139 A G N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 X 136183239 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 136183257 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 X 136183340 C G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 X 136183647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136184160 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136184387 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 136184847 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136185025 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 136185038 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 136185059 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 136185194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136185238 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136185417 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136185440 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136185441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136185464 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136185560 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136186261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136186926 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136187228 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 136188496 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 136189056 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136190294 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 136190634 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136191548 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136192017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136192124 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136192498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136192797 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136193181 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136193568 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136193599 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 X 136194394 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136194511 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136195499 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136195911 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 136196294 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 136196520 A G N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 X 136197161 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136197326 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136197687 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136198091 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 136201114 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 X 136201179 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 X 136203357 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 136203479 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 136203702 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136204118 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 X 136204211 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 X 136204465 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 X 136205066 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 X 136205167 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 X 136205690 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 X 136206669 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136209659 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136210358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136211736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136215840 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 X 136216633 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136218109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136218917 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136220723 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136222149 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136222709 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 136224504 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136225039 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136229853 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136229859 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136232400 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136235323 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136235336 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136235396 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 136235733 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 X 136235785 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136235823 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 X 136235853 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 X 136236070 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 X 136236190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136236357 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 X 136236533 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 136236548 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 136237614 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 136242392 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136242856 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 136242857 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 136242964 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 136243428 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 X 136243654 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136245500 A G N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 X 136245759 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 136246598 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 136247701 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 136247710 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 136247764 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 X 136248335 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 X 136248373 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136249030 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 136249375 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 136249429 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136252525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136255514 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136256200 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 136257857 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136260756 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136262117 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136263329 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 136263344 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 136263484 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 136263667 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 X 136263793 C A N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 X 136263804 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 X 136263958 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136263988 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 136264014 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 136264017 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 136264032 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 136264051 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 136264076 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 136264100 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 136264178 T G N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 136264189 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 136264314 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 136264320 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 136264588 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 136264703 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136264752 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 136265173 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136265904 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136267910 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 136269211 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136272361 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 136274750 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 136276937 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136280566 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 136281167 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 136282874 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136282882 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136286852 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136288516 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 136288989 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 136289205 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 136289248 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136289508 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136289602 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136291226 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 136291316 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136291475 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 136291530 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 136291545 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136291591 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 136291767 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136295145 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136296827 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 136298706 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 136304240 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 136305237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136306474 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136307231 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136309013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136312281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136313374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136313746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136314531 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136314625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136314812 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 X 136315979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136317434 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136317636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136318699 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136319607 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136321246 T A N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 X 136323611 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136324323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136325390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136326594 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 X 136327408 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136333396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136338490 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136340938 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136345220 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136348270 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136371117 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136371711 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136371915 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136371974 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136372029 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136373402 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136373514 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136375249 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136375859 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136375979 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136376771 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136379326 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136383686 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136384857 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136386958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136387901 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 136395875 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136397192 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136397328 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136402601 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136402787 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136403212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136403829 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136404088 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 136404472 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136407504 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136407768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136407902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136408322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136409384 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 136409779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136410041 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136410423 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136410801 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136410893 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136411290 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136412687 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136412855 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136413445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136413467 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136413818 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136413845 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136413949 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136414004 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136414010 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136414116 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136415206 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136415717 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136415928 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136416087 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136418412 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136418420 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136420456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136420562 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136421186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136423349 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136423413 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136423568 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136423806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136423881 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136424306 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136424406 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136425781 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136425856 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136429493 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136430551 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136431368 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136431892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136433211 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136433826 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136434853 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136436122 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 136437225 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 136437398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136437632 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136437886 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 136437888 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136437890 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 X 136438399 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136439164 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136439250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136439368 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136439373 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136439378 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136439396 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136439425 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136439498 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 136439545 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136439557 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 136439582 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 136439601 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 136439647 C A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 136439851 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136439901 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136439931 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136439945 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 136440082 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136440153 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136440212 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136440265 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136440318 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136440434 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136440438 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136440617 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 136440650 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 136440655 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 136440685 G A N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 X 136440880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136441943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136441948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136442077 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136442096 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136442274 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136443642 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136444967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136445535 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136445552 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136446333 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136446792 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136447612 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 136448075 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 136450718 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136451995 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136452199 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136452428 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136453762 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136457614 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136457954 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136460845 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136461519 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136461691 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136461728 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 136461776 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 136461804 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136461981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136463910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136466575 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136468613 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136472597 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136473614 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136476006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136478676 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136482880 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136483008 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136483186 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136483187 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136488656 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136489241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136492678 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136493867 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 136497644 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 136498345 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 136502669 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136503279 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136503732 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136504701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136507098 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136507682 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 X 136507972 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 136508465 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136508579 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 X 136508598 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 X 136508771 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 X 136508786 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 X 136508803 G T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 X 136508882 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 X 136508922 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 X 136509021 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 X 136509042 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 X 136509057 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 X 136509093 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 X 136509560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136509642 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136510139 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136510753 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 136510758 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136510842 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136510884 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136510905 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136510909 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136510956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136511079 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 X 136511395 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136511469 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136511588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136511739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136511826 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 136511850 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136511902 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136511921 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136512765 A C Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 X 136512770 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 X 136512811 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136513257 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 X 136513458 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136513723 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 X 136514142 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 X 136514584 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 X 136514852 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136515253 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136515397 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136518152 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136518464 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 136518852 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136518863 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136520328 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136521326 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 136523579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136524128 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136525128 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136528233 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136529003 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 136529601 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136530299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136530325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136530993 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136532559 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136534489 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136539095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136540571 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 136541529 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136541762 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 136545141 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136548761 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136549532 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136550098 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 136551148 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136552536 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 136554388 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 136554510 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136555372 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136556102 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136556149 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136557100 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136557460 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136557940 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136558115 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136558328 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136561962 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136565033 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136565822 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136566291 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136566316 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136566662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136569899 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136571540 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136572691 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136573045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136575508 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136576362 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136577790 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 136580674 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136581885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136582773 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136583819 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136584192 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136592534 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136595751 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 136595788 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 136610883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136614159 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136614701 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136626751 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136628973 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136632638 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 136641048 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 136643631 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 136643737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136645878 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 X 136649049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136649882 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 136653737 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 136654089 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136654781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136655610 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136657650 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136660512 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136660578 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136663684 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136665505 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136669273 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136671740 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136688046 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 136691173 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136711748 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 136714688 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136714791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136719764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136720128 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136720428 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 X 136720504 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 X 136720505 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136720556 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 136720567 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 X 136720608 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136720651 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 136720679 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136720686 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136720726 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136720817 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136720951 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 X 136720982 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136721018 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136721145 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136721648 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 136721744 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136721941 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136722091 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 136722123 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136722190 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136737759 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 136737807 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 136737847 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136737863 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 136738593 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136738746 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136738798 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136739107 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136739706 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136740229 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136744251 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 X 136749503 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 136751189 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136751541 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 136751799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136752497 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136754993 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 136759378 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 136763670 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 136771523 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136774602 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 136776732 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136779789 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136781568 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136782785 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136783910 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136784322 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 136784979 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136785083 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136785707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136786624 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136792256 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 136797661 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 X 136798462 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 136801221 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136801854 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136802677 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136802988 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136803325 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136803340 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136804557 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136806063 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136813674 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 136813729 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 136814227 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 136815326 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136816743 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136816918 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136817150 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136817265 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136824202 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136824277 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 136827104 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136828793 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136828895 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136829700 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136830094 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136831949 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136833143 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136834926 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 X 136854699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136856286 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136856704 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136856918 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 X 136858614 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136860357 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136860410 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136862849 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136862850 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136863741 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136863742 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136871241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136873060 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136874358 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 136876947 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136879239 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136879305 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136879617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136880006 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136884672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136887530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136890012 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136893325 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136896531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136898696 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136901474 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136906684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136908845 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136917776 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136921197 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136923823 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136924042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136926258 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136926484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136938182 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136939543 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136953213 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136953824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136954098 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136954171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136954536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136954719 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136954765 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136954787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136955056 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136955972 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136956192 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136956912 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136956951 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136957044 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136957045 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136957088 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136960336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136961343 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136962877 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136963795 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 136963875 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136964943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136967022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136970267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136970490 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136971408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136975069 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136977508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136978286 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136985815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136993050 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136993511 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 136993675 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 136994079 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 136996194 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 136996257 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 136996410 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 136996431 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 136996756 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 136997291 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 136998319 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 136999431 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137001442 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 137003074 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137003772 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137005273 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137006328 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137006368 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 137006429 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 137008832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137009979 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137010561 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137011042 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 137011314 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137012225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137012532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137012595 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137018263 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137019137 G A N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 137019361 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137020281 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 X 137020365 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 X 137022033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137022332 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 137022335 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 137022672 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137022702 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137022995 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137023525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137023659 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 137024091 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137024902 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 137025604 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137026168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137026270 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137030623 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137031203 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 137032698 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137033807 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137033812 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137034134 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 137034167 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137036236 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 137036383 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 137037301 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137041803 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 137043457 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 137044212 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 X 137044580 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 X 137045819 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137046105 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137046449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137050835 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137053470 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137080117 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137080171 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137082953 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137083572 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137093610 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137093931 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137096052 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137096460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137096600 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137097491 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137098870 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137100426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137103820 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137105705 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 137108495 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137110944 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137114831 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137118653 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137120239 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137120625 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 137123397 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137123419 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137124554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137134551 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 137138082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137142290 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137142652 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137142918 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 137143069 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137143255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137143470 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137143684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137144089 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 137146451 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137150489 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137154009 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137159219 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137173194 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 X 137182055 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137185578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137185711 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137187302 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 137187528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137190884 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137192115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137192176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137194186 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137194610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137198169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137200070 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137202058 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137203287 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 137205980 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137208161 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 137211848 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137212187 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137213848 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 137213991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137214802 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137217744 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 137222272 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137224876 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137226835 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137231086 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137231620 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137236289 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137236955 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137238477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137239127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137239218 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137239402 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 X 137239423 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 X 137239508 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 X 137240181 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137240454 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 137240553 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 X 137240826 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 X 137240869 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 X 137241287 C T N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 X 137241298 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 X 137241386 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 X 137241809 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137242246 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 X 137242378 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 X 137242379 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 X 137242455 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137242458 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 X 137242535 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137242918 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 X 137243154 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 X 137243178 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 X 137243349 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 X 137243359 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 X 137243405 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 X 137243669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137243944 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 X 137244042 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 X 137244625 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 X 137245220 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 137245372 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 137245822 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 137245980 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 X 137245986 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 X 137246139 A G N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 X 137246185 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 137246301 T C N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 X 137246410 T A N N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 X 137246615 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137247800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137247811 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 X 137247814 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137247846 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 137248589 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137248663 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 X 137249383 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137249569 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 X 137249625 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 137249780 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 137249832 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 137250008 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 X 137250169 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137250493 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137250533 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137250634 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137250996 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 137251050 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137251150 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 137251644 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137252031 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 X 137252152 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 137252232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137252525 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137252688 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 X 137252721 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 X 137252805 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 X 137252820 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 X 137252906 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 137253226 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 137253307 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 137253926 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137254174 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137258718 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137258889 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137260602 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137261131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137265639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137267989 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137269820 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137274947 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137288444 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137288529 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 137290350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137291387 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137294637 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137294643 G A Y Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 X 137298576 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137299215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137301744 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 X 137303297 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 137303579 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 137304619 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137305980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137309460 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137309718 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137313854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137314612 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137315238 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137317389 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137317408 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137318358 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137321442 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 137324488 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137327092 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137327117 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137327679 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137327691 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137327692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137327710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137328109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137328524 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137328944 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 137328946 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 137329603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137329753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137332036 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 X 137333486 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137333717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137333939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137333973 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137336029 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137336423 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137336441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137340790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137341897 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137341912 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137342344 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137345184 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137348986 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137349242 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 137352794 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137360560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137362651 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 137370440 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137372310 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137372573 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 137372778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137373402 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137373474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137373682 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137377201 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 X 137377473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137377600 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137377612 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137377735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137377781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137377786 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137377929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137377948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137377994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137378033 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137378044 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137378318 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 137379854 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 137382698 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137382798 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 137383702 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137384441 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 137387542 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137394275 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 X 137395998 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 137397065 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 137397156 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137397772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137397820 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 X 137398195 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137398489 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 X 137399297 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 X 137399341 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 137400378 G T N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 X 137400650 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 X 137401372 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 X 137401499 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 X 137402350 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137402772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137402808 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137402857 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137403457 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 X 137406499 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 X 137406992 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 137407024 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 X 137407029 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 X 137407722 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 X 137408564 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137408696 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137408739 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137408838 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137408995 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137409261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137409306 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 X 137409418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137409616 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137409625 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137409754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137409890 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 X 137410038 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 X 137411272 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137411300 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137411332 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 137411346 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 137411805 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137413553 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137413784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137414063 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137414899 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137414950 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137414997 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 137415001 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 137415336 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137415693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137416003 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137416583 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 137416979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137417472 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137417950 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137418328 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137418495 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137418507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137418535 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137418729 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137418819 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137418870 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137418974 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137420238 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137421900 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137422118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137422710 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 137422803 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137422859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137423793 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137425276 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137425387 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 X 137425404 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 X 137425418 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 X 137425502 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137425653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137427822 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137432848 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137433178 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137439737 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137443898 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137444954 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 137446584 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137448614 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 X 137448717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137449488 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137452805 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137453068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137453299 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137461742 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137466186 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137467293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137472717 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137475470 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 X 137475487 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 137475557 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 137476204 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137479893 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137480631 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137481562 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137482124 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 137482187 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 137482221 G C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 137485831 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137487209 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137488454 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137494025 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137495426 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137498524 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137500771 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 137502321 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 137502748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137503930 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137506018 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137506188 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 137507262 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137508423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137510993 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 137512421 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137513752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137514152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137514571 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 137517061 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137518420 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137519607 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 137519750 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137520350 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137520640 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 137520711 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137520918 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 137521166 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 X 137521324 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137521493 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137521501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137521686 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137521764 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137521774 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137521999 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137522030 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137522032 C G Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 X 137522166 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 X 137522225 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 X 137522276 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137522288 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137522433 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137522442 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137522586 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 137522685 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137522739 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137522792 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137522862 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137522887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137523347 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137523671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137523691 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137523928 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 137524047 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137524058 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137524123 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137524260 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137524264 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137524452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137525829 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137525880 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137592010 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 X 137594045 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 137594273 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 137595044 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137595223 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137596605 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 137597350 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 137597464 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137599251 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137599268 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137599281 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137599289 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137599347 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137599352 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137599668 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137599734 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137599950 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137600714 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137600879 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137600881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137600947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137601151 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 137601435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137602440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137604205 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137605196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137605336 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137605959 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 137606591 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 137606999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137608238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137608581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137608739 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137608751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137608901 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137608992 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 X 137609678 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 137609758 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137610206 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137613501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137613574 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137615245 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137616242 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137616461 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137618384 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137621287 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137622138 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137622676 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137627009 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137627328 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137629134 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137630164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137631328 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137631963 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137633860 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137634260 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137634316 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137635198 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137637339 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137638429 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137639095 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 137646001 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137647423 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137647957 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 137648128 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137648298 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 137650794 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137651709 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137651755 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137651922 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137653200 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137653512 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137653917 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137655582 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137656588 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137656638 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137657419 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137657657 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137657668 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137657706 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137657845 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137658311 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137658419 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137658461 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137658475 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137658478 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137658628 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137658675 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137659132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137659293 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137659581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137661068 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137661496 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137662642 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137663041 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137663393 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137664470 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137664522 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137664722 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137667199 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137672295 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137675361 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137675581 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137679585 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137684977 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 137684998 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137690591 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 137690939 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137691084 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137691722 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137692249 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137692385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137694488 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137695985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137698515 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137700754 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137701478 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 137702192 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137702242 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 137702780 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137702832 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137703238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137704271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137705167 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 137705355 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 137705743 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137707059 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137707678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137707692 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137707808 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137708699 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137709480 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137709539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137710079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137715180 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137716042 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137723017 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137723459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137725301 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 137731185 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 137733722 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137734005 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 137734053 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 X 137738714 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137738726 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137741032 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 137741996 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 137742923 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137745170 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 137745996 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137746776 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137750882 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137752254 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137755782 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137756106 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137756402 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137756403 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137756435 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137758269 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137758505 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137759321 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137760152 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137760153 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 137760632 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137761161 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137761618 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137761964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137763865 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 137764213 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137764254 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 137764279 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 137764998 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 137765040 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 137765053 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 137765798 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137765830 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137766801 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137768954 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137769601 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137769602 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137773140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137774338 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137774487 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 137774539 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137774546 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137774577 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137774628 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137774929 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137775128 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 137775149 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 137775359 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137775476 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137775925 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137776305 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137776525 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 137776999 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137777532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137777547 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137777648 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137777741 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137777934 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137778073 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137778510 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 137778710 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 137779151 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137779197 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137779504 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 137779594 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137780393 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137781543 G A Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 137781990 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137782587 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137785208 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137786474 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 137788105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137788179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137788771 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137789543 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 137789785 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137790082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137790083 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137790088 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137790389 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137790399 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137790625 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137790644 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137790724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137790834 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137790849 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137790927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137790995 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137791098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137791416 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137791479 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137791949 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137792356 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 137792686 G A Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 137792789 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137793198 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137794776 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137795699 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137795756 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137796326 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 137799011 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 137799455 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 137800340 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137801424 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137801584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137801597 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137801689 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 137801833 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137802768 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137803183 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137803314 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137803428 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 137804642 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137806121 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 137806379 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 137807416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137808916 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137809927 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137810431 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137811373 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137812168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137812649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137813225 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137813264 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137813364 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137813417 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137813514 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137813624 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137813728 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137813830 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 137813914 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 137815212 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137815492 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137815921 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 137816744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137819980 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 137822612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137824948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137825326 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137825768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137830457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137832418 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137833903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137834014 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 137837226 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137838323 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137840672 T G Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 137843545 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 137847859 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137847913 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137848407 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137850503 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137851767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137851931 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137853106 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137855925 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137856321 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 137861751 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137862111 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137862193 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 137863122 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137863507 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 137863523 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137863545 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137863620 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137863640 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137863851 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137863951 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137864069 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137864149 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137864166 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 137864181 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137864248 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 137864259 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 137864457 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137864483 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137865207 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137865555 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 137866099 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137866127 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137866406 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 137866435 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 137866729 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137866770 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137867345 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137867770 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137867796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137870417 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 137870421 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 137870523 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137870586 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 137871044 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137872253 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137872338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137873036 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 137873276 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 137873296 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 137873627 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137874468 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137875510 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 137876489 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137878351 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 137879124 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 137881428 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 137882961 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137883204 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137885190 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 137886507 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137887153 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137890065 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137890311 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 137890589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137897950 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 137898114 C T Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 137898419 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137898751 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137900080 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137900086 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137901496 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137903474 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137904214 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 137904371 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137904595 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137905651 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137905801 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137906604 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137906958 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137907043 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 137907162 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 137907318 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137907383 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137907954 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137908605 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 137911193 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137912311 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137913836 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137914840 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137915809 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 137919050 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137920858 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 137920862 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 137920876 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 137921102 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 137925351 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137926012 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137926062 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137926168 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137926288 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137926329 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 137926507 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137926559 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137926581 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137926640 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137927194 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137927327 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137927522 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137927700 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137927758 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137927780 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137927922 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 137927970 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137929138 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137931089 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 137931631 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137936110 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 137937659 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137938895 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137942314 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 137946953 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 137951819 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137958963 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137959897 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 137965749 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137967348 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137970765 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 137971033 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 137974548 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 137976222 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 137977222 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 137977466 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137979246 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 137987113 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 137988246 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138004832 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138005357 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138006353 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138006790 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 138009058 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 138009862 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138009982 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138010030 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138010044 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138010087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138010103 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138010690 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 138010885 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 138011742 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138012137 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138013306 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138013813 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138018153 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138020282 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138021766 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138022473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138023927 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138027765 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 138031517 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138035880 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138035926 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138036856 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138037620 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138037632 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138038937 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138038977 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138039177 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138039971 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138043373 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138044918 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138045480 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 138048003 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138048748 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138050058 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138050200 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138050601 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138055845 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 138058364 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138059113 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 138067324 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138071472 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138071626 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138075278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138076931 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 138077470 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 138077734 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138078550 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 138080973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138083243 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 138084399 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138086414 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138088140 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138092621 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138098936 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138100016 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 138102414 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 138108993 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 X 138113018 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 138113799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138114765 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 138115870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138116711 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138117791 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 138118053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138118642 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138119572 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 138120539 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138121470 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138121721 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138122033 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138122190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138123028 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138123361 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 138124086 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 138124312 C G N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 138124321 C T N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 138125695 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138126419 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138127323 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 138128401 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138128803 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138130927 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 138131019 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 138132154 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138132400 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138133704 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 138134247 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 138135405 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138135530 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138137095 T A N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 138141620 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138142398 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138142633 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138146144 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138147163 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138147860 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138155393 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138155726 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138156258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138157791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138160202 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138160999 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138161593 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138167778 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 138168617 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 138168621 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 138173223 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138182901 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 138182974 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 138183534 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138186544 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138192630 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138193812 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138199545 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138200084 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138201591 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138201911 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138203099 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138203246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138203547 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138203578 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138203628 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 138203752 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 138203769 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 138203771 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 138203796 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138203818 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138203823 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138203835 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138203838 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138203869 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138203951 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 138203962 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138204003 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138204011 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138204111 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138204116 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138204133 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 138205848 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 138205866 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138205937 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 138206377 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138206401 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138206653 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138206676 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138207247 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138207744 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138208041 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138208117 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138208476 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138208525 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 138209462 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138209469 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138209504 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138209517 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138210251 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138211135 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 138212096 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138212176 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138212383 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 138213210 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138213222 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138213366 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138214157 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 138214363 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 138214845 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 138215935 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138216048 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138216841 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138217143 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 138217368 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 138217630 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138218585 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138218881 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138220002 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138221797 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138222233 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138223258 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138223990 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138224667 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138224931 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138227333 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138231358 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138232899 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138233723 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138234102 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138234560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138236028 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138237512 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138238401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138238465 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138245414 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138248853 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138251092 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138251857 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138253626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138254153 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138255224 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138261879 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138263404 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138263985 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138273448 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 138277176 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138277630 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 138279037 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 138282060 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138283986 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138288007 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138292327 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 138293265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138293403 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138295431 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138298815 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 138301777 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138304388 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138304911 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138304969 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 138305012 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138306429 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138306768 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138307058 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138307643 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138308054 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138308292 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 138312425 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138312586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138315580 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138315800 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138316585 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138317426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138317469 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138318147 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 138319255 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138320144 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138320189 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 138320297 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 138321259 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138321373 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 138321682 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138322566 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138324570 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 138324765 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138324891 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 138334262 G C N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 138339432 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 138339469 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 138340603 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138341971 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 138342446 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138342466 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138343413 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138343861 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138344556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138345754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138345902 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138346005 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138346121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138346990 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138347602 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138347603 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138348711 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138349160 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138350146 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138352389 C A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 138352844 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138352845 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138353745 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138355052 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138356290 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 138356693 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138359036 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138359367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138359371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138359497 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138359653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138360912 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 138361128 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138361165 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138361405 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 138362682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138362834 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 138363370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138364159 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138366542 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 138374231 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138376053 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138376077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138376839 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138382386 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138383177 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 138386326 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138395765 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138398234 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 X 138398895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138399536 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138401418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138402854 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 138405389 G A N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 138405725 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138406109 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138410133 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 138410264 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138410691 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138412784 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138413186 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138414915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138415330 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138415848 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138416213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138416969 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 138418042 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138418710 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 138421014 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138421565 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138421829 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 138421839 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 138425542 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138427799 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138428251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138429036 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138429113 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138429653 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138430667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138432028 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138432416 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 138433011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138433924 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138434153 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138434875 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138434987 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138437004 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 138438345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138438699 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 138439711 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 138440144 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138440445 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138446214 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 138446255 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138446355 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 X 138446448 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138447684 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138449575 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138449966 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138451424 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138453798 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138455858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138456148 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138457292 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138457711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138457902 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138458066 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138459144 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138459176 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138459938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138461783 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138462874 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 138463351 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138463741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138465298 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138466220 C A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 138466456 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138467015 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138467564 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138468987 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138469862 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138472434 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 138472877 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 138475086 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138477720 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138478866 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138479015 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138479102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138479368 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138479500 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138480076 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 138482903 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138485908 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 138487347 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138492439 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138496456 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 138496493 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 138496494 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 138500295 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138500627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138502416 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138502795 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138503900 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138504615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138505615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138508083 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138508993 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138509966 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138513286 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 138514655 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138516171 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138517039 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138517134 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138517259 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138520551 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138520802 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138523014 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138523243 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138523779 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138526065 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138526340 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138529290 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138529838 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138529853 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138530036 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138533300 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138535197 G T Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 X 138537120 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138537121 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138538400 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 X 138540141 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138540820 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138541946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138543847 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138545138 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138545296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138545896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138551613 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138552685 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138552693 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138554190 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138554390 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138555520 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138555837 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138558708 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 138561416 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138563005 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138563271 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138564194 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138564740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138564757 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138568735 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138569617 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138569949 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 138570533 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138570841 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138570957 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138571429 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138572047 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 138572594 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138572881 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138588473 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 138590105 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 138591653 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138593069 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138595458 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138598046 G C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 138598403 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138599453 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138604327 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138604902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138607033 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138608662 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138608705 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138609806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138610630 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138611126 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138611155 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138611395 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138612108 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138612508 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138612744 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138613924 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138613976 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138613986 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138614309 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138614365 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138614443 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 138615008 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138615083 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138615135 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138615303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138615351 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138615638 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138615866 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138616736 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138617534 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138617714 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 138618130 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138619950 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138619998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138620352 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138621590 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138626521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138629250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138634135 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138634903 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138635160 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138636719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138637411 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138642974 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 138643373 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138644411 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138647100 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138649359 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 138649848 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138651540 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138652155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138653998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138654373 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138656139 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138656359 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138656599 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138660233 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 138662217 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 138662863 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 138664684 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 138667801 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138669987 C G Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 138673012 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138673060 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138673732 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 138674630 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138675402 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138675617 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138676219 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138676828 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138678364 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138679472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138680805 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138682206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138682233 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 X 138682339 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 138685850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138686062 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138690153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138693211 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138699147 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 X 138700740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138701943 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 138702481 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 138702704 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 X 138703162 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138703238 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138703698 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 138704854 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138705142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138705311 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138705714 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138708320 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138711050 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138711315 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 138712806 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 138716659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138716889 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138716942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138720939 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138721191 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 138721900 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138725891 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138726690 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138727648 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138728980 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138729109 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138729457 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138734225 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 138734505 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138735251 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138735315 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138736218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138737759 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138737892 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138738311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138738633 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 X 138738634 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 X 138738848 T G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 X 138738849 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 X 138739062 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138739100 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138739294 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138739426 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138739898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138742959 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138744735 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138746179 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138747031 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 X 138748409 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138749346 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138754720 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138757576 G C Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 138757592 C A Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 138759698 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138759730 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138763643 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138764565 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138765496 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138767229 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138767956 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138768921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138769562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138769733 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 138770109 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138771634 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138773700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138775112 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 138775459 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138776144 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138776624 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138778033 A C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 X 138778064 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 X 138778070 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 X 138778093 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 X 138778113 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 X 138778403 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138779129 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 X 138779155 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 X 138779156 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138779161 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 X 138779186 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 X 138779206 A G N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 X 138779299 A T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 X 138779386 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 X 138779405 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 X 138779429 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 X 138779439 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 X 138779447 G C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 X 138779648 T C N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 X 138779802 G A N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 X 138779822 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 X 138779926 T C N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 X 138779956 G A N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 X 138780333 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 138781865 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 X 138781882 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 138781907 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 138781912 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 138783446 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138783485 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138785094 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138785148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138786839 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138787173 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138787393 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 X 138787404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138787673 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 X 138787731 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138788489 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138788638 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138788763 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 X 138789014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138789127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138789490 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138789797 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138789889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138790184 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138790365 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 X 138790374 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 X 138790382 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 X 138790447 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 X 138790675 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 X 138790729 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138790963 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 X 138790991 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 X 138791116 G C N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 X 138794422 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138796851 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 138797126 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138797305 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138797795 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138798672 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138801133 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138801547 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138804746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138807358 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138809598 G T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 138810011 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138810301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138812836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138816909 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138816978 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 X 138817010 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 X 138817074 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 X 138817097 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 X 138817274 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 X 138817286 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 X 138817372 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 X 138818125 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138824652 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 138824869 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138825878 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138826355 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 138826392 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138827339 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138827812 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138831074 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138832396 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138833271 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138834165 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138836418 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138837725 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138838306 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138843112 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138843159 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138844313 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138844671 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138844709 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138845894 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138845949 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138846176 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138846259 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138846378 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 138846542 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138847257 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 138847267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138847270 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138848065 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138848372 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138848450 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138849494 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138850133 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138850223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138851877 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138852369 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 138853168 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138853214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138853437 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138853688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138854578 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 138859739 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138866162 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 138866490 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 138866828 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138867145 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138867146 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138868015 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138868163 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 138868541 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138868688 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138869794 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138870225 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138871608 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138871856 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138872201 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138874147 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138878156 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138879398 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138879804 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138882231 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138882602 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138883001 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138883022 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 X 138883096 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138883236 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 X 138883237 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 X 138883244 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138883246 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138883400 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 X 138883419 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 X 138883457 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 X 138883496 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 X 138883529 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138883551 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138883572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138883688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138884038 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138884078 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138884277 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138884746 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 138884865 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 138884885 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 138886069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138886162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138893112 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138894696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138895962 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138900018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138900034 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138901325 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138903092 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138903761 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138905003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138909984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138911435 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138912231 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138913123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138913245 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138914379 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138914718 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 138915957 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138918471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138919415 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138919421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138919436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138919459 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138919712 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138920178 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138920894 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138920982 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138921030 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138921963 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 138923774 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138923795 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138923874 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138923916 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138923999 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138924046 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 X 138924435 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 X 138924485 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138924487 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 X 138924497 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 X 138924850 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138924961 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138925061 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138925066 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138925067 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138925143 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138925906 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 X 138925924 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138926033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138926484 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138926923 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 138926998 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 138927071 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138927099 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138927128 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 138927205 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 X 138927219 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 X 138927441 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138928572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138928745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138928853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138929052 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138929799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138930025 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138930636 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138932522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138934180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138934395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138936778 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138938009 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138938376 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138938412 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138943017 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 138943366 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 138944100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138944314 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138944829 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138944992 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138945155 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138946257 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138947729 T A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 X 138947735 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 138947863 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 138947939 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138947962 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 138948702 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 X 138949071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138949459 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138949616 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138949687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138949713 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138950037 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 X 138950119 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138952518 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138952779 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138952809 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138952845 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138953291 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138955244 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 X 138956282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138956369 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138959710 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 138959954 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138959957 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138960349 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138960507 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 X 138961052 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138962137 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138962202 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138962530 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138963125 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 X 138963179 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138963398 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138963725 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138963873 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138964203 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138964474 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 X 138964537 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 X 138964571 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 X 138964814 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 X 138965066 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 X 138965362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138965408 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 X 138966536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138966624 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138968024 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138968791 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 138969150 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138970137 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 X 138972260 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138972458 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138972660 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 138973792 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138973899 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 X 138974781 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138975092 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138975950 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 138978038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138978246 T A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 138978902 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138979390 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138980298 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138980387 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138981748 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138983662 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 X 138984188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138984665 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 138985636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138986501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138986870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138986923 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 X 138987252 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 X 138987740 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 X 138988855 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 X 138989019 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 138989502 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 138991591 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 X 138992497 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138992775 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138992801 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138994202 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 138994518 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138995582 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138996871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138996898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138997067 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138997700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 138997881 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 138997955 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 X 138999257 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139000716 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139002586 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139006936 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139007537 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139007805 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139009388 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 139013148 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 X 139013748 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 X 139014863 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 X 139015199 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139015986 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 X 139016285 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 X 139019442 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139021314 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 X 139021508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139022248 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139024036 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 139024783 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139025319 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139025485 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 139027915 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139028644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139028842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139029455 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 139030298 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139030547 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139031216 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139033177 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 X 139033205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139033748 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139035392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139035761 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 X 139036586 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 139036647 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 139037013 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139037929 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 139038139 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 X 139038284 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139038328 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 X 139039280 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139041198 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139041199 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139041200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139041202 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 139042506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139042643 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139044749 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139045433 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 139048931 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139049135 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139050005 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139050914 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139054401 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139055022 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139055988 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139057572 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 139058803 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 139063124 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139063176 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 139063419 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139063422 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139063439 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139063622 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139064727 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 139064777 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 139064817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139067975 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 X 139068198 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139068604 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139068985 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 139069057 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 X 139069114 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 X 139069289 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 X 139069642 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 139069682 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139071177 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139074934 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 139074959 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139076688 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 139079313 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139080062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139081165 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 139082079 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 X 139082101 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139082373 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 139084104 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 139084342 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 X 139084416 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139084595 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139086443 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139088088 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139088139 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139088655 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 X 139088770 T C Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 X 139089041 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 139089306 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139090098 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139091749 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139093866 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 139094984 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 139099483 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139100253 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139100743 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139100936 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 139101822 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139101824 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 139102336 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139103386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139104969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139104988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139107052 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139109166 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139112172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139112735 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 139114109 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 139115038 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 139115198 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 139118131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139119176 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 139119934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139120771 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139122299 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139122842 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139123863 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139125071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139126148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139126165 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139127321 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139128445 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139130425 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139131843 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139134789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139137051 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139139911 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 139140647 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 139150073 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139150170 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139150251 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139150520 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139151328 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139152172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139153428 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139157633 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139163698 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139165680 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 139165919 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139165924 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139166362 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139166919 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139169845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139171347 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 139174250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139174496 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139177095 A T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 X 139179233 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139179631 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139180336 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139180704 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 139180893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139184372 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139185797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139185955 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139185971 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139187565 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139188051 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139191793 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139191832 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139191971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139194980 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139197553 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139197660 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139203178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139205075 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139205645 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 X 139207717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139213221 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139213237 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139213681 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 139215245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139217268 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139219578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139222832 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139223726 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139224868 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 139225828 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139225830 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139226225 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139226316 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139227993 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139228030 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139234207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139234258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139236819 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139236873 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 139237607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139240488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139242663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139243139 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139244328 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139245126 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139254492 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139255425 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139255598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139255804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139256561 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 139256990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139257676 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139257770 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139257986 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139258330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139259185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139259591 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139260019 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139260484 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139261019 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139261393 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139261465 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139261965 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139262464 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139262567 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139262948 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139264691 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139264775 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139265514 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139265553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139265557 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 139266299 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139266672 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 139269827 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 139270167 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 X 139270368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139271007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139271506 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139272381 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 X 139272645 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139272697 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139274167 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139274742 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139277798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139280320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139283321 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139284554 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139287500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139289284 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139290888 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139291418 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139292981 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139294746 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139294753 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139297117 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139311890 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139312061 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139312391 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139313296 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139313507 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139313718 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139313767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139313885 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139316380 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 139316392 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 139316401 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 139316591 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139316757 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139318832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139318890 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139318920 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139319265 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139321465 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139322999 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139324061 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139326868 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139328048 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 X 139329686 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139329747 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 X 139331757 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 X 139332511 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139335220 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139336810 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139336870 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139337452 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139337951 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139342950 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 139343544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139345700 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139347937 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139352959 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 139353600 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139354838 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139357606 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139359655 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139363182 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139363838 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139364840 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139369216 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 139372203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139374264 C T N Y 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 X 139374395 A T N N 0.5 ALT 0.95 0.95 0.5 0.5 0 1 0 1 1 0 1 0 X 139374425 T G N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 139374432 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 139374470 A C Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 139374926 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 139376550 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 139377514 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 139378866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139379806 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139380988 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 139384576 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139384956 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139385389 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139390216 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 139391546 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 139391612 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139392212 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139394406 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139402091 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139402470 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 139402811 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139405182 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139407966 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139408717 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 139416680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139418576 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139418933 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139423782 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139424983 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139425011 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139425208 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139425546 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139427312 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139430812 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139431274 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139431387 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139432088 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 139432308 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139432918 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 139433171 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 139435247 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139438039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139438673 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 139438692 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 139443066 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139443311 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139446583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139446996 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139447177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139447743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139448240 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139448362 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139451359 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139452135 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 139452604 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139456387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139457605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139467013 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139467488 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139468868 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 139469367 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139469452 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 139469573 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139471234 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 139476061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139476639 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139479515 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139480099 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139481579 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139482517 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 X 139482849 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139484131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139485100 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139486022 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139489070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139489231 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139490466 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139492921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139496288 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 X 139496291 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139496306 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 X 139496343 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139496622 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139497017 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 139497274 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139497596 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139498168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139502054 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 X 139502719 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139503435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139504255 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139505417 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139506916 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139507044 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139511410 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139512368 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139512882 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139512964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139513039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139513090 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139514586 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139514723 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139517297 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139518821 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139527813 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 139532282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139532680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139532819 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139533024 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139533459 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139533958 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139538360 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139542186 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139542392 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139545312 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139546542 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139547331 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139547766 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139547900 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 139547974 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 139550031 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139550443 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139551194 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139551662 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139551974 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139553543 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139553708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139554571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139556799 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139558214 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139558221 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139558314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139558384 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139559075 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 139559528 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139559574 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139560943 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139561826 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139566516 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 139570131 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139572117 A T Y N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 X 139578558 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 139581399 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139581421 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 139586245 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139586390 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139586446 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139586506 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139586964 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139587504 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 139588071 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 139588420 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139588602 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139589117 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 139589153 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 139589321 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 139594120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139594553 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139594704 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139595128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139597256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139597302 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139599859 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139602006 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 139617304 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 139617924 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139620919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139625353 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 139626909 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 139629862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139630045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139631493 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 139631757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139632829 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 139637908 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139639205 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 139641356 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139643084 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139644879 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 139645938 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139648902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139649157 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139649353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139649659 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139650968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139651319 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139655355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139655385 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139656313 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139657542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139658504 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139661210 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139661789 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 139662114 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139663634 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139663835 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 139671176 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 139671177 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 139671870 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 139672102 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 139674261 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139676578 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139677762 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139677898 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139678238 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139678297 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 139678862 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139680415 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139680865 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139682867 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139683470 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 139683783 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139686114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139686562 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139687501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139688866 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139697771 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139698022 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 139698169 T A N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 X 139700840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139704914 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 139706484 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 139707448 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139708105 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139708742 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139709191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139710017 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139711097 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139711675 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139714263 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139714306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139715996 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 139722170 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139728261 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139729944 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139731147 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139732280 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 139733353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139735010 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139737699 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139738020 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139738339 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 139738341 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139738349 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139738454 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139739109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139740825 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139741056 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 139744873 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 139746297 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 139746727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139747595 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139748041 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139751295 G A N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 139755654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139755983 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139755988 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139755998 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 139756807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139758301 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139758408 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139759252 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 139761224 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139761226 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139764684 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139766529 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139768256 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139769285 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139770483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139770879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139772778 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139773177 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139773287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139773651 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139773770 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139780182 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139781237 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139782919 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139783641 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139783784 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 139784774 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139785380 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139785887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139787189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139788696 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139788732 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139789034 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 139789530 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 139790384 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 139790386 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 139798166 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 139798489 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 139799493 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139799827 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139799929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139800392 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139802022 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139803771 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 139804524 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139810619 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139812709 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 139814409 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 139816324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139816356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139816445 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139816918 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139822697 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 139823911 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139824673 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139825136 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139827519 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139831980 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139832990 C A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 X 139832991 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 139833381 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 139833870 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139837743 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139838856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139839322 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139839327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139839346 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139839748 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 139839968 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 139840497 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139840721 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139841215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139841423 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139841626 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 139841828 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139841872 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 139843642 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139844006 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139844665 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 139844746 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139845514 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139845693 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 139845728 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 139847808 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139848696 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139849039 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139849366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139849409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139849543 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139849866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139850171 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 139852792 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139853109 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 139854338 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139854546 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 139854716 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139855529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139858009 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 139858010 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 139858556 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139859004 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139861380 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 139861448 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 139869793 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139869971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139874578 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 X 139875036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139875409 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139877713 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139877759 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 139878798 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139879581 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 X 139880603 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139881139 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 X 139881679 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 X 139882321 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139882351 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139882419 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139883234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139886114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139892883 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 139898461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139899328 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139903204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139903273 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139903290 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139911770 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139912255 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139913136 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 139913387 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139915151 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139923409 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139923438 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139924563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139924991 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139925327 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139926036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139926075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139926914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139929744 T G N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 X 139932467 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 X 139932691 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139939150 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 139940259 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139944096 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139949085 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 139950301 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 139951192 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139951433 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139952168 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139953457 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 X 139953880 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 X 139954253 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 X 139954867 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 X 139957203 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139959106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139960496 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 139963210 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139964639 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139965207 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139968243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139970556 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139973587 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139974139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139977017 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139979233 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139979456 C T Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 139979764 G T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 139979838 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 139980075 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139980914 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139981019 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139981191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139981223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139981460 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139981544 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139981673 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139983543 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 139985824 G A N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 X 139986461 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139986643 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139988377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139988645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139988656 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139989006 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139989159 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139989161 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139990585 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 139990994 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139992820 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139994562 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139996704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 139997658 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 139999321 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 139999757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140000821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140001418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140002105 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140002589 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140003133 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140005569 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140006730 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140009055 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140009291 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140009552 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 140010521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140012112 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 140012123 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 140014370 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140014448 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140015588 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140017531 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140019129 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 140019467 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 140026478 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 140034114 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140039389 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140042195 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140043284 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140043416 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140044290 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140044839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140045959 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 140047309 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 140048269 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140048360 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140053148 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140060384 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140060867 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140061668 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140061695 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140061796 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 140061843 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 140061870 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140063292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140064082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140065606 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140066959 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140068508 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140069031 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140069773 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 140071940 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140072232 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140073198 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140073772 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140074023 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140074362 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140075633 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140076205 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140076755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140077416 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 140078672 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140079142 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140079983 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140083616 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140084376 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140086760 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 140088301 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140089843 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140091496 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140091604 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 X 140092412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140092792 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 X 140092817 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 X 140093814 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140094186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140095364 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140096940 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 140099904 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140099945 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140101918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140101975 C G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 X 140102446 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140103004 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140103305 G T Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 140103426 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140103860 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 140104183 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 140104901 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 140105271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140106424 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140106812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140106975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140107154 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140107244 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140107353 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140107827 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140107948 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 140107953 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140108340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140109895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140110994 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140111793 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140112275 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140118593 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140120701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140121543 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 140122040 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 140122080 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140122384 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140122771 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140122854 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140123079 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140123396 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140123913 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140124993 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140125333 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140125500 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 X 140125680 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140125727 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140125734 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140126111 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 140127685 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140128243 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140128664 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140128684 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 140128700 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 140129389 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 140129720 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140130202 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 140132384 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140132646 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140132686 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140138893 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140139556 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140139568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140139776 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 140140563 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140141925 G C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 140142366 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 140144480 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140144695 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 140144806 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 140145061 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140149637 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140150092 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140150096 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140150348 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140150561 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140150829 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 140151510 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140151606 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140151930 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140153406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140158071 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140158650 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140165152 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 140166838 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140167707 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 140168154 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 140172192 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140174203 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140174471 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140175060 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140176855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140177199 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140177942 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140181955 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 140182233 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140182991 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140184643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140191341 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 140193831 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140195446 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 140197597 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140200723 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140206601 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140207703 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140208196 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 140209566 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 140209951 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140210039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140210086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140210376 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140211056 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140211489 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140221128 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140222087 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 140222699 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 140226814 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140229256 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140229868 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140233098 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140234312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140236837 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140237429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140239599 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 140240742 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140248236 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140248413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140248856 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140249021 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140253281 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 140254026 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140254304 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140255598 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140256478 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140257530 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140258610 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140259380 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140261346 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140264746 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140268980 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140270182 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 140270606 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140271860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140277276 T C N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 140277371 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 140278070 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 140278259 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140279639 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140280252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140281998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140282218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140285733 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140285946 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140288059 A T Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 140290141 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140294895 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 140298535 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140298816 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140301155 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140301412 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 140302789 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 140304255 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140305841 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140307449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140309095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140309160 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140309390 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140312404 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140312965 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140313071 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140314366 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140314503 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140314508 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140315104 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140315119 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140315326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140315594 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140316317 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140316421 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140317670 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 140317718 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140318209 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140318309 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140318433 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140321398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140321549 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140323234 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140323246 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140323721 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140324819 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 140326121 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140329638 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140330387 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140330393 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140330443 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140330488 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140333086 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140333817 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140333908 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140334692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140335216 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140337416 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140337858 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140339563 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 140339946 T C N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 140340213 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140340298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140343007 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140343586 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140344874 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140345197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140345764 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140346968 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140350435 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140350956 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140351588 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 140351741 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140352131 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140352136 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140352200 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140352338 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 140353384 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 140353652 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140353693 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140354089 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 140354374 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 140354551 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 140354899 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140354949 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140355221 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140355245 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140355259 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140355263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140355338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140355362 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140359524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140359932 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140359947 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140362167 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140362243 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140363240 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 140365572 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140367350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140369761 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140370214 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140370832 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140370910 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140373213 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 140373421 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140373528 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140373802 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140373947 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140374870 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140376610 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140376960 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140378941 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140379514 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140379536 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140379757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140379989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140381179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140382267 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140383642 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 140384883 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140386166 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140386583 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140387049 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140387184 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140388642 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140389425 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140389778 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140390140 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140390144 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140390595 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 140399243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140399562 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140400413 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 140400562 T G N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 140401927 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140401983 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140401990 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140402794 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140402962 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140403573 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140403678 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140403887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140404177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140404714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140404815 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140405447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140405768 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140414963 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 140415598 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140416202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140416215 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140416352 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140416443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140416447 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140416549 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140416625 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140416629 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140416956 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140417077 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140420525 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140420762 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140421028 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140421035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140421328 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140423527 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140426297 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140426399 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140426402 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140426465 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140428100 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140430059 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140431448 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 140431744 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 140432634 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 140432979 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 X 140439235 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140439532 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 140439794 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140439812 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140441093 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140441237 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140441684 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140441829 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140442789 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140443184 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140443978 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140446997 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140446998 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140455828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140466615 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140466772 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140467262 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140468665 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140469795 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140470821 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140472514 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140473213 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 140474522 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 X 140474824 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140475016 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140475437 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140475841 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140475912 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 140475919 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140476428 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 140477679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140477939 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 X 140479399 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140483165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140483748 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140484481 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140485182 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140488378 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 140490600 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140491665 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140493539 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140495726 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140504125 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140505510 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140506589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140509011 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140509188 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140511650 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140514901 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 140516348 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140517544 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140517586 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140523137 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140532819 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140535861 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 140536544 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140536729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140536731 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140537218 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 X 140537272 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140537917 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140538839 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140540154 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 140540647 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140543558 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140543592 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140544921 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 140545996 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140546258 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140546494 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140548356 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140548811 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140549307 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140549312 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140549639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140549733 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140549838 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140558606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140559253 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140560381 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140560838 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140561345 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140563846 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140564031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140564110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140564606 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140566702 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140569967 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140569979 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140572106 T A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 140572358 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140573124 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140573474 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140573979 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140574097 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140575548 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 140575807 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 140581840 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140583830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140587694 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140590264 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 140590774 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140591187 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 X 140592137 G T N N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 X 140592417 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 X 140592652 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140592840 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140592909 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 X 140593812 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 X 140594012 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140594059 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 X 140594162 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140594480 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140595038 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 X 140595165 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 X 140595172 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 X 140595473 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 X 140595490 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140596948 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 X 140599540 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140599756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140601215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140601862 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140603608 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140604861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140606458 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140608514 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140613601 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140614306 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140615853 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140616910 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140618528 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140618806 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 140620237 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140620399 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140627262 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140629409 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140630710 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140631430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140634834 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140638881 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140643079 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 140646983 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140647662 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140648561 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140652287 T A N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 140652530 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 140654563 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140655999 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140656081 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.526315789473684 0.105263157894737 0.368421052631579 22 16 10 2 7 X 140664408 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140667189 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140668933 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140669435 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 140670914 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140671302 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 X 140671785 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 X 140672132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140672460 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140674160 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 140676518 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 140680897 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140682769 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140683673 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140686756 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 X 140686943 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 X 140687477 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140687972 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 140688569 C T N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 X 140688882 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 X 140689246 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140689256 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140689380 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140690120 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 X 140690416 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140690615 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140691056 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 X 140691169 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.315789473684211 0.105263157894737 0.578947368421053 14 24 6 2 11 X 140692217 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 X 140694229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140697444 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140699071 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140700412 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140702716 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140702726 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140705697 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140705850 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140706420 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140706588 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140706739 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140706746 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 X 140706859 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 X 140707007 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140714104 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140714108 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140714132 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 X 140714350 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 X 140714468 C A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 X 140714736 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 140715087 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140715142 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140715559 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 140715589 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 140715590 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 140715635 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140715721 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 140716289 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 140716421 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 X 140716482 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 140717334 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140717479 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 X 140717742 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140717939 A T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 X 140718070 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140718125 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140718165 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140718391 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 X 140718790 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140719054 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 X 140720229 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140720644 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140723247 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 140728565 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 140733944 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 140733959 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 140734026 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 140735059 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140735161 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140736549 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 X 140737102 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140738603 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140740385 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140740462 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 X 140740553 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140740563 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140740743 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 140740780 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140740803 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140740814 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140740856 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140740878 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 140740890 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140740907 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140741090 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 X 140741118 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 X 140741218 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 X 140742163 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.25 0.333333333333333 0.416666666666667 10 14 3 4 5 X 140742291 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 140742336 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 140742495 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 140742705 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 X 140742821 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140742848 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 X 140742928 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140743201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140743639 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140743788 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140743858 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 140743916 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140744597 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 140744625 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140744783 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 140744827 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 140745118 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 140745253 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140745278 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140745294 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140745316 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140745448 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140745454 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140745463 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140746628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140746747 C T Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 X 140748074 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 140748633 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140748784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140749309 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140749335 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140749371 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140749754 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 X 140750226 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140750273 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140750601 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140750667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140750741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140750832 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140750956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140751050 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140752398 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140753126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140759379 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140759736 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140760466 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140760773 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140765227 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140768030 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140770386 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140771297 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 140771428 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140771436 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140775119 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140775905 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140776379 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140778707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140786477 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 140789030 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140792147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140792203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140792236 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140793829 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 140799073 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 140799187 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140800607 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140803032 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140804366 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140808579 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 140809979 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140810630 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140812414 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140813758 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 140815716 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140818248 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140818459 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 X 140823811 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 X 140824074 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140824861 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140825069 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140825188 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 X 140825944 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140826015 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 X 140826267 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140827158 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 X 140833330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140838284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140838286 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140838379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140842026 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140842694 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140843919 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140844427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140847733 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140852730 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140857493 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 140857985 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140858083 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140859022 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140862170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140864331 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140869089 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140872850 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140875212 C T Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 140876094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140878207 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140880274 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140880291 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140881091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140883139 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140885079 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140885758 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140885983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140886257 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140887500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140888324 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140891128 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140891989 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140892049 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140892840 C G N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 140894211 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140899199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140899886 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140900716 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140905495 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140909023 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 140912831 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 140914893 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 140915204 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 140922760 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140923821 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140924096 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140924244 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140926282 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140929033 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140930371 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140931031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140931080 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140934884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140935203 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140939802 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140940420 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140943680 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140947908 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140948826 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140949190 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140949836 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140953032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140953392 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140953905 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140956689 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140961930 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140962855 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 140967475 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140968413 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140968680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140972380 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 140972806 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140976454 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140992027 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140992245 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140992581 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 140992764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 140993837 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 140994677 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 140995899 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 140996589 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 140996789 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 141004922 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 141009768 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 141010579 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 141012021 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141014257 T A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 141016226 T A Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 141019865 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141022427 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141030517 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 141032447 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141033935 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141036153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141037274 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141037851 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141038010 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141038714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141039006 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141039716 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141040692 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141040799 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141041014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141041757 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 X 141041949 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141041979 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141041982 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141042275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141042400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141042515 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141043440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141043693 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 X 141043882 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141045425 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 141045505 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 141045533 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 141045571 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 141045587 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 141045704 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 141045722 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 141055250 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141055670 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141056704 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 141058010 T G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 141060341 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141060538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141061140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141061318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141061986 T A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 141062290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141069196 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 141070728 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141071943 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141074669 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141074772 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141075241 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141077549 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141080276 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 141080381 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141083217 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 141083882 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 X 141083933 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 141084061 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 X 141085621 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141085702 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141086156 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141087477 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 X 141087583 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141089210 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141089794 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 141090165 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141090256 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141093333 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141093718 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141094154 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141094355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141094651 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141094729 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141094952 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141095096 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 X 141095217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141095223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141097054 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141097329 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141097809 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141101609 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 141101624 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 141101893 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141101941 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141102245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141102312 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141102557 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141102748 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141102947 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141103126 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 141103314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141103477 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141103811 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141104180 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141104339 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141104395 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141104946 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141105427 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141111466 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 X 141111733 G C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 141113063 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141113180 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 141114065 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141114861 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 141116206 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141116593 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141117010 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141118590 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141124755 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141125016 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141127501 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141132771 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141138418 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141140366 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141141037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141142744 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141143580 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141145269 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141147370 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 141147694 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141147826 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141148362 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141149547 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141149753 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141151096 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141151521 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 141152296 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141157035 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 X 141160211 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 141160875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141161855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141165414 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141166464 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141166648 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141167807 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141168522 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 141169201 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141169235 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141169275 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141169321 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141169390 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141169565 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141169626 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141169629 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141169725 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 141169931 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141169932 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141169964 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141170073 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141170238 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141170342 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 141170420 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141170444 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141170489 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141170600 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141170703 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141170880 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141170962 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 141170969 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 141171071 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141171188 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141171191 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141171229 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141171286 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141171299 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141171365 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141171558 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 X 141171575 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141171622 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141171631 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141171638 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141171870 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 141172383 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 X 141172847 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141173479 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141174599 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141174811 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 141174876 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141175807 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141176454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141177340 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141178794 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141180162 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141180269 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141180367 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141180881 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 141181903 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141182308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141183185 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141183188 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141184968 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141185933 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141186800 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141186853 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141188112 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141188129 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141188875 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141189089 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141189298 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 X 141190122 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141191215 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141192615 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 141193949 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141194590 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141195152 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141195156 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 141195713 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141195738 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141195935 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141195945 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141195976 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141198832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141199006 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141199284 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141199629 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 141200227 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141203700 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141204039 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141204178 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141204504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141204846 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141208348 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141208785 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141210388 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141212147 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141212715 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141213064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141213432 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141213768 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141215672 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 141215727 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 141216223 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141216686 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141223986 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141224000 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141224043 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141226010 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141226049 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141227595 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141228170 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141228886 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141229261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141229931 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141230203 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 141230222 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 141230377 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 141230580 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 141230581 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 141233613 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141234298 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141235152 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141235756 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 X 141236169 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141236190 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141237024 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141238221 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141238774 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141239064 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141239282 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141242016 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141243049 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141243051 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141243611 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141245870 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141247961 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141248216 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141248373 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141250098 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141250533 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141252877 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141253608 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141253802 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141254062 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141254115 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141254248 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 141254262 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 141254537 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141254755 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141254831 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141254871 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141254882 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141254902 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141254915 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141255067 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141255141 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141255142 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141255225 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141255280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141262491 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 141262534 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 141262590 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 141262721 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141263073 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141263280 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141263338 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141263353 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141263448 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141263461 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141264416 G A Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 141264712 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 141264741 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141265203 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141265592 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141265702 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141265888 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141266090 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141266093 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141266274 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141266295 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141266303 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141266304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141266915 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141266976 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141267091 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141267150 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141267162 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141267583 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141268151 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141268764 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141268849 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141269316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141269416 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141269717 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141270601 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 141270889 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141277858 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141278093 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 141278159 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141280831 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141282276 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141282904 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141284730 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141286664 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141286966 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141287164 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141287351 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141287779 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141287847 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141288133 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 141288186 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 X 141288263 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141288593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141288932 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141289063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141289165 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141289194 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141289469 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 X 141289595 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 X 141289619 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141289898 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 141289933 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 X 141290014 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 141290623 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 141290624 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 141290643 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 141290928 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141290929 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141291311 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 141291368 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141291471 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141291631 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141291694 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141293149 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 X 141293387 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141293629 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 141293690 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 141293959 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 141293984 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141294081 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141294137 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 141294222 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141294798 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 141295058 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141295105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141295359 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141295420 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 141295666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141295699 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141295938 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141296423 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141298290 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141299538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141310088 A C Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 141310788 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141313602 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 X 141313768 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141315227 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 141319387 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141319460 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141321525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141322524 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141322826 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141327318 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141329320 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141331012 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 X 141331366 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141332164 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141332902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141333925 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141334003 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141334214 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141337003 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141337255 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141337598 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141339458 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 141339564 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141340898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141347958 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 141348208 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 141348740 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141349859 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141350785 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 141352033 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141352828 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141353200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141353373 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141353534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141353939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141353967 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141357156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141357769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141358082 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141358431 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141359140 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141359189 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 141359192 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 141359655 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141360624 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141364938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141365352 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141365800 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141365975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141366443 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 141366515 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 X 141370611 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141370866 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141371006 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141371624 G T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 141372034 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141374550 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141375158 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141376477 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 141376762 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141377072 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141377475 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141381737 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141384652 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141386510 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141386791 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141387131 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141387973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141392709 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141393292 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141394929 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141394972 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141395811 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141397237 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141397447 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141397925 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141398013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141398969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141400433 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 141404206 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141404278 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141404535 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141405224 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141406387 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141407456 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141408086 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141411347 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 141412689 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141413359 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141413723 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141415322 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 141418346 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141418620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141420318 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 141420802 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 X 141421509 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 X 141422260 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141423120 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141424196 G A N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 141425866 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141426224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141427961 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141428416 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141428506 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141428551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141429102 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 141429858 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 141430063 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141430772 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141431123 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141433427 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141433662 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141434016 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141434940 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141435682 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141436235 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 141436386 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141436568 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 141437052 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 141437587 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141437604 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 141437783 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141439490 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 141439849 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141439996 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141443353 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141443381 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 141443387 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141443684 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141443701 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141443717 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141443812 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141444020 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141444074 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 141444141 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141444173 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141444186 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141444237 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 141444394 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 141444410 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 141444763 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141445313 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141445462 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141445738 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141446058 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141446092 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141446205 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141446246 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141446248 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141446459 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 141446470 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 141446489 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 141446516 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 141446638 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141446659 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141446755 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141446807 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141446867 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141446886 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141446971 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141447098 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141447111 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 141447113 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141447285 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141447395 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141447667 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 141447677 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 141448031 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141448142 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141448189 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141448407 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 141448578 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141448686 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141448855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141449552 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141450808 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141450896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141450897 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141452225 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141453172 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141461826 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141463709 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 141465561 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141466367 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141467694 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141469489 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141469671 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 141470604 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141470790 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141471682 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 X 141471786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141472615 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141473571 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 X 141473676 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141474990 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141475101 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141475304 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 X 141476496 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 141476542 G T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 141486892 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 141492042 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141492684 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141492821 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141493787 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141498917 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 X 141500170 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 141500437 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141501048 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141501867 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141503928 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 141504883 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141505214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141505426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141505579 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141506890 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141507761 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141509371 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141513079 T A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 141513380 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 X 141513508 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141513539 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 X 141515008 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141516240 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141518801 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141519403 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141519428 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 X 141523394 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 141525056 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141526289 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141528912 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141530698 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 141532330 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141533166 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 141533873 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141538170 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141544316 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141545366 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 141545758 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141546995 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141547078 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141551317 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141552275 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141555889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141556289 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141558005 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141558194 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141558367 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 141558876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141559566 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141561856 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141562579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141565228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141567382 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 141571099 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141576882 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141578479 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141579354 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141582555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141583692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141586275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141587250 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141589303 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141589523 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141590009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141590135 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141590321 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141592262 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141593072 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141593209 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141593211 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141593318 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141597164 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141598228 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141599329 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 141600047 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141600099 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141601776 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141603664 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 141604585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141604695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141605597 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141607210 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141607503 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141608349 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141608587 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141609208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141609584 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141612504 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141614648 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141615491 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 141615646 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141616205 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141616791 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141617138 A T N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 X 141617887 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141617901 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 X 141618009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141618334 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 141618344 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 141618459 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 141618476 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 141618580 G C N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 X 141618598 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 X 141618748 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 X 141618842 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 X 141618958 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141619340 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 X 141619514 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141620206 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141620369 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141622191 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141622239 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141622987 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141624136 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 141629117 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 141630223 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141631026 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141631076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141632978 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 141634640 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141634889 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141636476 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141636847 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141641429 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 141641672 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 141645431 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 X 141646603 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141647063 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141647690 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141648997 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 141649192 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141649416 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141649562 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141650473 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141650601 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 141652950 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141658718 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 141658796 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141659471 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 X 141661293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141664719 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141677098 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141679349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141679450 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141679808 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141680008 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141681081 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141681687 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141687920 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141690022 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 X 141690823 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141690827 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141691513 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141696269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141696560 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141699114 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141699257 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141701521 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141704088 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141704181 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141704476 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141705114 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141706333 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141706602 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141707306 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141707822 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141708118 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141709768 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141711168 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141712555 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141713390 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141723502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141724182 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141725737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141725916 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141726255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141727450 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 141728545 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141732479 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141732587 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141734513 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 X 141734535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141736020 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141736145 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141737518 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141739032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141739278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141739739 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141739830 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141740048 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 141740303 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141740311 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141742632 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141743393 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141744546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141744554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141744754 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141746233 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 X 141749036 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141756495 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141756496 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 141758290 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141758319 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141759015 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141759087 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141759625 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141759702 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141760500 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141760622 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141760877 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141762161 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141765193 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 X 141766033 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 141768738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141770322 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141771150 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141771201 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141776304 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 X 141776785 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 X 141776920 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141777582 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141778028 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141778080 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 X 141778146 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 X 141779127 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 X 141779182 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 X 141779477 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 X 141779499 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 X 141779571 A G N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 X 141779909 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 X 141781531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141781560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141781977 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141784640 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141784661 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 X 141784710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141784866 T C Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 X 141785461 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141785689 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 X 141786178 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141786270 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141786792 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 X 141791236 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141791652 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 141791941 T G Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 X 141792095 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141792674 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 141792858 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 X 141792860 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 X 141792953 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 X 141793009 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141793126 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 X 141793221 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141793471 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 X 141793539 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 X 141794498 C G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 X 141794579 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 X 141794824 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 141795520 C G N N 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.545454545454545 0.272727272727273 0.181818181818182 15 7 6 3 2 X 141795637 T G N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 141795670 G C N N 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 13 7 6 1 3 X 141795947 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 X 141796201 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 X 141796287 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 X 141796573 G T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 X 141797195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141797835 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141798145 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 X 141798451 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 X 141798452 A T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 X 141798573 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141798753 G T N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 X 141798794 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 X 141799004 G C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 X 141799167 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 X 141799271 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 X 141799657 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 X 141799902 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 X 141799957 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 X 141799960 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 X 141799964 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 X 141800115 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 X 141800710 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141800824 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141801259 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 141801579 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141803090 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 141803136 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 141803314 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141803378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141803533 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 141803991 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141804252 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141804876 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141805061 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 X 141805096 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141805209 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141805291 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 X 141806169 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141806185 C T Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 X 141806389 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 X 141806414 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 X 141806634 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 X 141806657 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 X 141806666 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 X 141806853 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141807487 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 141807733 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141809910 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141812203 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141812226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141812886 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 141815263 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141815714 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141816009 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141816615 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141817408 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141818264 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 141824868 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141824944 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141828107 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 141831157 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141833007 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141834520 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141834537 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141838424 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141868736 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141869481 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141869561 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141870025 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141870747 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141874405 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141876735 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141876835 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141877138 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141877889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141883617 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141889715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141892969 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141893787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141895587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141896333 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141897421 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141899830 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141900552 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141901419 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 141904625 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 141905363 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141906274 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141906515 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141908276 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141909490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141909945 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141910118 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141910911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141911271 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141911290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141914650 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141915577 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 X 141915955 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 X 141916943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141917224 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 X 141918051 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141918590 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141919474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141919740 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141920363 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141921254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141921469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141922000 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 X 141923660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141924152 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141925668 T A N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 X 141927379 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 X 141927401 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141927559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141927670 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141927882 G C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 X 141927980 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 X 141928504 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141928800 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141928812 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141929199 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 X 141929402 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141930649 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141930776 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 X 141931560 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141931732 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 X 141931986 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141932363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141935787 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141937172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141937712 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 141938027 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141942281 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141945763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141948267 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 X 141951588 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141951991 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141952386 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 141952403 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141954265 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141955514 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141956188 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141957921 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 X 141961926 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141963401 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141964335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141967122 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141967233 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141967267 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 X 141967324 C A N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.2 0.133333333333333 0.666666666666667 8 22 3 2 10 X 141967544 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141968360 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141968940 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141968983 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141970907 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141972748 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141973510 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141973514 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141976060 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141978087 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 141980869 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 141981221 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 X 141983195 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 141983224 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141983241 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141983285 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141983308 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141983326 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141983334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141983429 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141983578 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141983601 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141983608 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141983643 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141983773 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141983775 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141983875 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141983885 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141983890 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141983950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141984075 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141984095 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141984165 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141984400 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 141984479 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141984660 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141984695 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141984731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141984782 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141984792 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141984867 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141985118 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 141985999 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141987726 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141991643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141993283 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141993474 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141994764 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 141995310 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 141995367 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141997804 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 141998084 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 141998085 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 141998754 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142000872 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142001593 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 142002704 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142003956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142003957 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142003971 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142004444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142007480 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142007606 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142008267 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142012559 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142015997 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142016694 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142016723 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142018254 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142018281 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142023238 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142023473 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142023503 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142023847 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142023907 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142024104 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142025401 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142025998 T C N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 142026571 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 142031084 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142031940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142032872 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142033342 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142034283 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142034648 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142034775 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142035170 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142035194 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142035461 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 X 142035570 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142035606 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 X 142035957 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 X 142036717 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142036910 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142037225 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142037265 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 X 142038203 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142038644 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142040203 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 142040555 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 142041747 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142043990 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142046415 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142049769 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142050380 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 X 142050387 G A N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 X 142050490 A G N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 X 142050589 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 142050623 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 X 142050834 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142050929 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 142050982 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142051086 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142051221 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142051236 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142051265 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142051304 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142051450 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142051520 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142051720 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142052135 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142053075 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142054500 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142055071 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142064574 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 142065323 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142069238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142069935 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142070001 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142070435 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142070734 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 X 142073435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142073699 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142074412 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 142074742 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 142075165 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 142076099 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 142077638 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142079899 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142080515 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142081349 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142082029 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142093557 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 142094232 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142095414 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142103841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142103852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142104103 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142104553 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142105844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142105918 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142106412 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142106444 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 X 142106657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142109164 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142109757 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142111870 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142115021 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142116443 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142117326 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142117888 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142118674 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142119126 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142119715 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142122808 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142122953 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142123008 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142123091 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142123795 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142126032 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142126161 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142126402 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142127558 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142128767 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 X 142129213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142129659 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 142130420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142131530 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142131903 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142132230 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142132528 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142133452 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142134311 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142135708 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142137916 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142137921 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142137984 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142138802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142140360 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142140546 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142140559 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142141314 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142141390 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142141414 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142141609 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142141828 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142144108 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142152825 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142153073 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142153158 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142153332 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142153425 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142153550 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 X 142153685 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 X 142154109 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 X 142154258 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 X 142154361 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 X 142154483 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142154765 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 X 142154959 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142155478 G T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 X 142155625 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 142155649 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 142155657 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 X 142155727 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 X 142155732 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 X 142155734 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 X 142155737 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 142155810 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 X 142155815 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 X 142155817 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 X 142155891 A C N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 X 142155927 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 X 142156059 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 X 142156195 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 X 142156224 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 X 142156409 C A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 X 142156410 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142156455 C T N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 X 142156474 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 X 142156520 T G N N 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 6 12 2 2 5 X 142156552 G A N Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 6 10 2 2 4 X 142156632 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 X 142156652 T C N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 X 142156688 G T N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 X 142156732 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 X 142156790 G T N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 X 142156801 C A N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 X 142156804 T A N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 X 142156851 G T N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 X 142156880 C T N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 X 142156917 T G N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 X 142156964 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 X 142157663 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 142157876 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 X 142157982 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 X 142158049 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 X 142158101 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 X 142158228 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 X 142158515 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 142158793 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 X 142159174 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142160277 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 142160998 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142162077 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 142162237 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142162896 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 X 142166857 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142175382 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 142175497 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142177954 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142178107 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142179501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142192040 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142195287 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142203808 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 142206905 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142210246 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 X 142213958 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142214201 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142214447 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142214721 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142221503 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142221734 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142223723 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142224884 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142225121 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142225622 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142225704 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 142226426 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142229381 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142230502 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 142230776 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142233394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142238370 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142238671 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 X 142238710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142238789 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142239464 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142239484 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142240246 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142240703 A G N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.142857142857143 23 5 11 1 2 X 142241254 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 X 142241302 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 X 142241445 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 142241537 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 X 142242078 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142242727 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 X 142242761 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142243458 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142243516 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 X 142243559 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 X 142244175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142244849 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142245085 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142246705 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142248598 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 142250490 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 X 142250928 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142251689 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 142251732 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 142254082 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142254669 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142255297 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142255304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142255416 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142255678 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142255730 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142256243 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142256331 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142256399 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142256743 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142256760 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142256790 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142257006 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142257148 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142257573 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142258235 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142258625 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142258680 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142259142 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142259563 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142259577 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142259705 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142259856 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 142259866 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 142260478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142260485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142260574 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142262016 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142262213 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142262359 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142262539 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142264357 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142264461 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142264940 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142265562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142266453 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142267679 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142267951 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142268208 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142269013 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 142270464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142270780 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 142270784 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 142271663 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 142272228 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142273601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142274440 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142276638 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142277398 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142279027 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 142279060 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 142279432 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 142280070 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142281370 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142282308 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 142283288 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142289114 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142295024 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142295226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142295623 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142295658 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142295728 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142295868 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142295959 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142296320 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 142296325 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 142296333 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 142296345 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 142296351 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 142296406 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 142296456 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142296482 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142296653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142296715 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 X 142296797 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142296978 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142297085 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 X 142297436 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 X 142297505 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142297634 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 X 142297697 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142297817 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 142298751 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142298851 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142298876 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142298990 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 X 142298996 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142299042 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142301479 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 X 142302054 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142302255 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142306232 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142312735 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142314533 C A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 X 142315067 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142316025 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142319148 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142321395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142322037 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142322366 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 X 142322379 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 X 142322906 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 142324091 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142324889 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142324999 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142325614 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142328961 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 142329599 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142330810 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142331143 A C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 X 142331414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142331816 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142334022 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142334499 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 142334698 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 142336097 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 142336229 A T N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 142344184 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142345109 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142345197 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142345912 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142346392 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142346393 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142347285 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142347610 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 142347615 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142347978 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142348010 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142348570 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142349600 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142349767 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142349870 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142350006 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142351083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142354368 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142354478 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142356262 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 142372383 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142372391 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142373108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142374286 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142375551 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142376910 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142378834 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142379918 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142380640 C A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142380884 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 142381376 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142384060 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142384640 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 142384778 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142384833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142386042 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142389746 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 142390136 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142391514 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 142397040 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142399018 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142400089 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142401833 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 X 142407991 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 142408110 A T Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 142410379 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142411042 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142411198 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142412570 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142413464 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142414563 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142416978 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142417037 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142417753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142421631 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142423108 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142423233 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142424613 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142426421 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142426992 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142427243 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 142427315 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142429196 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142429380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142430127 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142430605 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142431133 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142434879 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142435584 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142436767 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142437220 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142438224 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142438707 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142438724 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142439513 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 142441105 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142442695 A G N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 X 142445612 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142445656 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142447130 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142447202 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142448620 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142449617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142452836 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142453421 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 142455151 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 142455553 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142455707 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142455858 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 142457589 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142457830 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142457861 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142457968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142458874 T G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 142459028 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 142461075 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142461594 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142461769 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142461793 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142462230 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142462565 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142463118 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142463515 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142467401 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142476194 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142476666 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 X 142477005 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142477034 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142477250 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142478084 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142478239 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 142478339 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142479117 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142479118 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142479349 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 X 142479548 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142479705 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142479834 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142480008 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142480201 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142481371 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142481449 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142481598 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 142482059 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142482060 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142482108 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142482185 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142482363 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142482524 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142482856 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142483250 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142483763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142483869 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142484063 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142484127 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142484351 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142484381 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142484525 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142484530 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142484537 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142484549 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 142484832 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142484858 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142484979 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142484990 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142485238 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142485273 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 142486050 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 X 142486121 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 X 142486180 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 X 142486628 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 142486694 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 142486986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142487604 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 142489155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142490740 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142492427 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142492531 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142494957 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142498054 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142499531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142499538 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 X 142499549 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 X 142499620 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 X 142499650 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 X 142499652 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 X 142499776 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142499789 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142499813 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142499943 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142500340 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 142500768 C A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 X 142500770 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 X 142500780 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 X 142500791 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 X 142500919 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142501052 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 142501835 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 142503958 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 X 142504150 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142506614 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142506636 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142506640 C T Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 X 142506786 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142506988 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 X 142507012 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 X 142507340 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142507727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142508879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142509309 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 X 142509336 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 X 142509344 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 X 142510430 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 X 142510548 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 X 142510994 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142511043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142511062 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142513858 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142514454 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 142515386 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 142521233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142522053 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142522954 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142523187 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142523615 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 142524139 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142532244 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 142532539 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142533672 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 142534241 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142536438 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142538873 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142539104 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142539332 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142539627 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 142540200 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142542551 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142546820 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142546879 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142547403 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142547516 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142547856 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142547925 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142548112 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142548596 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142549173 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 X 142549217 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142550020 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142550670 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142552792 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142552864 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142557915 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142561073 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 142562461 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142563185 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142563252 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142565549 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 X 142565654 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142566609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142566904 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142567229 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 X 142571060 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 142571854 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142573226 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142574488 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142576658 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142576953 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142577067 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142578611 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142579083 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142579123 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142579284 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142579323 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142579674 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142580051 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142580566 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142580711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142580857 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142580986 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 142581693 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142581838 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 142582027 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142582441 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142582506 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142582568 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142582916 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142585361 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142585626 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142585627 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142585629 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 142586020 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142586393 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142586634 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 142586826 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142587514 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 142588355 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142589439 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142589632 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142589856 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142590215 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142590954 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142590985 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142591208 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142598141 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142598154 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142598356 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142598401 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142598405 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142598445 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142598700 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142598702 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142598710 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142598768 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142598927 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142598944 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142599218 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142599904 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142600493 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 142600546 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 142600840 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142601641 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 142602895 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142603039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142603146 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142603281 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142603386 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142603774 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142603810 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142608518 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142608779 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 142612148 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142612359 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142613077 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142613085 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142615650 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142615817 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142616325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142616588 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142617440 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142617603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142617686 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142617808 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142617884 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142618041 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142618081 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142618190 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142618231 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142619013 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142619236 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142620143 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142621687 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142621691 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142622472 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142622604 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142623120 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142623143 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142623515 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142623752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142626881 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142628423 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142629806 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142630337 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 X 142630836 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142631220 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142631286 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142632495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142633272 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142633599 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142636391 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142637559 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 X 142638151 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142640575 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142640580 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142641246 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142641271 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142641513 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142641790 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142642360 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142643087 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142643749 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142643969 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142644101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142644227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142645261 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142647100 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142647117 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142650910 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142651179 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142652486 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142652776 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142655318 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142655343 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142656434 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142656975 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142657452 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 142657645 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142657968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142661300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142667950 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 X 142669565 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142683615 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142683857 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142683858 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142685823 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142688280 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142690532 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142690600 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142690620 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142692366 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142693824 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142694143 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142695518 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142695809 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 142696445 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142696873 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 142698469 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142700865 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142701633 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142704013 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142706099 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142706753 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142707112 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142707220 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 142708281 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 X 142708726 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 142709334 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 142709585 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142710505 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142711134 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 142711296 A T N N 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 X 142711938 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142716270 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142717201 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142717493 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142717972 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142718795 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142719822 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142719850 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142719899 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142720152 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142720954 A T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 X 142721679 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142724434 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 142726422 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 142726844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142727387 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142728445 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142728521 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142730139 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142731407 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142733858 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142734906 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 142736600 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142737263 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142738289 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142741444 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 X 142742209 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142742474 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142750634 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142750748 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 142751369 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142752569 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142753536 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142754842 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142757790 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142758446 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142760788 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142762407 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142764066 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142764278 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142764917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142765139 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142765917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142766263 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142766531 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142768672 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 142768710 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142769370 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142771393 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142772249 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142775192 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142775544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142776262 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142776535 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142778227 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 142780450 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142780898 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142782911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142783164 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142783165 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142783338 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 142783533 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 142783648 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142783937 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142784900 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 142785225 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142785545 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142786455 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142786994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142787080 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142794690 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142794809 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142794846 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142798288 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142798940 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142801149 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142802501 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142802718 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 142803015 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 142804734 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 X 142806679 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142807656 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142809817 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142811036 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142811228 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142811279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142811687 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142813788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142813883 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142815278 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142816314 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142817011 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142818663 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142820930 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142821538 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 142822879 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142825343 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142825454 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142826242 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 X 142826795 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142826937 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 X 142830751 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142831214 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 142834601 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142835989 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 142836123 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 142838224 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142838816 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142838917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142839758 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142841255 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142845600 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142845729 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142846270 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142846889 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142847786 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142848124 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142848420 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142850147 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 X 142850215 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142851133 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 142852984 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142856151 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142857038 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142857344 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142857693 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142859296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142859661 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142859978 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142862732 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142862906 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 142863469 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142863976 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142865060 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142865695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142868112 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 142870027 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142870097 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142871225 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142872836 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142873391 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142877699 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142878328 G T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 142879131 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142880886 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142882227 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142883081 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142883280 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 142883363 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142885756 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142885968 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142887230 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142887357 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 142887423 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142888522 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142891700 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142893848 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142902528 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142903623 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142903636 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142903949 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142905578 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142908464 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142908702 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142908995 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142909616 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142909668 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142910935 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142912789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142914372 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142914886 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 142916006 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 142918033 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142920986 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142924498 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142925414 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142925433 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142925844 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142926191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142928577 G T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 142929079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142929580 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142931047 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142931626 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 142939117 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142939130 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142942383 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142942632 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142945080 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142945086 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142946334 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 142946611 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 142946627 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142949773 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142950752 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142952979 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142953335 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142953744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142954107 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142954798 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 142954919 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142955636 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142956386 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142957498 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142957947 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142958074 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142960250 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 142962543 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142963360 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 142965745 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 142967330 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142967717 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142968947 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142968948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142969135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142969203 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142969710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142970563 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142971010 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142971157 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142972097 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142972547 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142973235 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142973733 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142973862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142974202 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142974940 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142975549 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 142975685 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142976708 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142976730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142979796 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142980489 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 142981877 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142981950 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142982609 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142982977 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142983195 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142984987 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142985269 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142986653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142988437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142989417 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142989671 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142989954 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142990136 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142992255 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142992447 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 142992713 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142992860 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142993649 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 142994278 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 142995303 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142995325 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142995543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142995690 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142996205 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 142997001 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142997101 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 142998368 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142998749 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142998903 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 142998965 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142999162 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 142999247 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 142999265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143001045 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 143001135 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143002102 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143006109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143006544 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143007488 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143007583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143012092 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 143012107 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 143012554 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143013696 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143014620 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143016315 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143024493 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 143025986 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 143025988 G T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 143028274 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143028842 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 143032112 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143034103 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143034326 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143034327 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143036847 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143037506 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143042901 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143043491 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143043799 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143043802 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143044253 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143046268 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143046764 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143047434 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 143047457 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143047890 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 143048024 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 143048847 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143049023 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143049484 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143051237 G A N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 143051825 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143052057 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 143052183 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 143052821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143052881 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143054005 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143060219 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 143060547 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143063519 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143063646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143069359 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143071078 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143071788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143073870 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143075500 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143077190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143078466 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143079689 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143082159 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143083348 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 143083382 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 143083865 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143084233 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143084574 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143084766 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143084865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143085107 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143086021 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143086891 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143087992 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143088789 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143088790 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143089164 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 143089450 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143089561 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143090436 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 143094498 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143094613 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143094665 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143096235 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143098098 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143098099 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143099503 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143100395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143102471 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143104653 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143106903 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143109270 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143114193 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143114650 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 143114810 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 143115557 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143117230 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143117392 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143120819 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143120921 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143121691 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143122624 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143124730 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143125726 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143126917 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143127266 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143128684 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143129717 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143136475 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143136597 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 143137101 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143138994 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143139857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143142182 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143143768 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143144458 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 143145193 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143153090 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143155898 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 143156769 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143158233 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 143163084 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143163932 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143166618 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143168281 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143168615 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143168934 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143171678 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143171878 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 143173307 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143174222 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 143174914 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143174959 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143180492 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143180589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143182815 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 143183388 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143186394 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143186916 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143190355 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143190635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143199621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143200027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143200397 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143202014 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 143204471 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143204485 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143205774 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143210409 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143210595 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143212338 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143212965 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143213968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143214131 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 143214198 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 143214281 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 143214313 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143214547 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143214943 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143214944 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143214982 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 143215219 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 143215259 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 143216665 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 143216866 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 143216914 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143217214 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143217619 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143217993 A C Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 143218245 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143218279 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143218438 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143218779 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143218781 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143218995 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143219304 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 143219330 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 143219620 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143219668 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143219744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143219812 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 143220656 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 143221436 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143221742 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143221905 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143222336 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143222578 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143222584 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143223087 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 143223525 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 143223574 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143223699 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143224182 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143224370 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 143224383 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 143224391 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 143224531 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 143224557 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143224844 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143224967 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143224994 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 143225013 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 143225018 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 143225555 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143225729 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143225886 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143226172 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 143226326 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143227104 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143227309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143227396 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143227519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143227528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143227770 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143227972 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 143228095 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143228107 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 143228135 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 143228143 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 143228230 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 143228719 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143228919 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 143229098 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 143229360 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143229606 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143229892 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143229901 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143230255 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143230267 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143230361 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143230645 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 143230807 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 143231440 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 143232306 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 143232308 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 143232354 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 143232576 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143232688 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143232959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143233094 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143233477 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143233773 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143234042 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143234043 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143234168 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143234906 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143235030 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143235178 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 143235182 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 143235539 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 143235744 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 143236014 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 143236099 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143236507 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143236691 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143236938 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143236957 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143237388 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143237794 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 143237956 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 143238241 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143238258 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 143238441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143238750 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143238844 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143238882 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143239422 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143239510 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143239747 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143239818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143239820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143239958 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143240036 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143240063 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143241407 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143241844 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143241975 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143242179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143242248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143242280 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143242504 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143242743 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143242839 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143243039 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143243214 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143243650 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143243665 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 143243811 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143243989 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143244108 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143244223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143244337 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143244372 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143244472 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143244672 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143244838 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143244841 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143244902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143245151 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143245194 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143245363 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143245444 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143245498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143245599 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143245826 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143245887 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143246059 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 143246501 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143246659 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143246681 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143246753 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 143246887 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 143247464 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143247674 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143247692 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143248007 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143248008 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143248470 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143248919 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143249254 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143249456 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143249716 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 143250146 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143251018 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143253734 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143253782 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 143255298 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143255575 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143256094 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143256308 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143256443 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 143256505 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143256747 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 143257804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143257852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143258649 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143258684 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143259318 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 143259454 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 143259461 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 143260038 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143260133 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143260239 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143260329 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143260373 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143260374 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143260521 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143260676 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143260728 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143260774 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143260813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143260886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143261046 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143261176 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143261197 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143261283 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143261347 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143261664 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 143261926 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143261992 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143262026 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143262562 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143262575 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 143263020 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143263291 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143263870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143263896 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143267107 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143267164 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143268337 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143269763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143270738 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 143270798 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143271289 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 143271879 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143273710 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143275182 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143275184 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143277517 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 143277609 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143277867 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143278712 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143279076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143279122 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143279655 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 143279806 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143280114 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143280172 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143281260 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143281285 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 143281559 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143282569 A C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 143282615 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143282701 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 143286439 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 143286896 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143287074 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143287397 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143291487 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 143291864 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 143291888 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 143292084 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143292133 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143292498 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143292502 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143293495 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143296324 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 143297065 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143299991 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143301400 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 143302051 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 143303714 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143305354 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 143305782 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 143306107 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143316614 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143317201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143322028 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143323275 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143326206 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143326880 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143329607 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143329635 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143346916 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 143347614 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 143348210 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143351222 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 143351761 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143352435 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 143355185 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143355540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143356603 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143357214 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143357334 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143357837 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143358793 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143360957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143363490 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143366976 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 143370553 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143372810 C A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 143373181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143375380 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143375613 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143378821 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143379764 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 143379986 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 143381501 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143384257 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143384770 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143384820 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143386798 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 143387488 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143390633 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143395641 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143402752 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143403046 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143403904 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 143403906 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 143404144 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 143404428 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 143404906 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 143404998 A T N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 143405445 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143406974 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143408049 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143413766 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143416282 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143416639 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 143417530 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143417721 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 143419238 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 143421827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143422324 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143425046 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143428809 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143432088 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143432111 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143435544 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143435768 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143436161 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 143436547 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 143436648 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 143437770 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143437786 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143439228 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 143440355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143440807 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143441023 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143441372 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143445372 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 143445608 T G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 X 143445609 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 143445870 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143446194 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143446429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143446737 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143446785 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143448144 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143448278 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143448737 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 143449793 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143450014 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143452449 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143452620 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143458554 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 143458749 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 143459320 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143459346 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143459424 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143460584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143461488 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143465649 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 143466978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143468596 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 143470098 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143471643 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143473646 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143473814 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 143474107 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143475047 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 143475134 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143476773 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143476944 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 143478310 G A N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 143481697 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 143484920 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 143485123 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143485334 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 143486248 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143486643 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143487052 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143487427 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143488364 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143488415 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143489365 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143489385 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143489563 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143489571 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143489592 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143489613 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143489657 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143489739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143490218 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143491232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143491337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143491606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143491778 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 143492415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143492535 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143492588 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143492828 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143494182 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143502275 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143503702 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143505601 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143506330 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 143508255 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143508646 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 143509302 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143509585 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143512135 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143512213 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143514182 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 143514831 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143515544 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143515700 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143516738 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 143516817 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 143517961 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143517972 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143518102 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143518433 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143518754 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143520652 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143520987 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143522543 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143522932 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143524230 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143526497 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143526498 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 143527000 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 143527429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143527515 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143527693 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143528054 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143529767 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 143530262 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143530656 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143531094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143531420 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 143531707 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 143531777 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143531789 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143531851 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143531873 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143531897 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143531965 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143532091 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143532132 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143532173 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143532210 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143532235 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143532287 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143532408 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143532593 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 143532617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143532691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143532833 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143533150 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143533197 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143533423 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143533525 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143533698 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143533769 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143533794 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143533863 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143534005 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143534029 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143534134 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143534220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143534456 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143534562 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143534583 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143534584 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143534630 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143535170 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143535204 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143535346 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143536282 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143536810 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 143537953 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 143538224 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143539983 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 143540576 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143541374 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 143541887 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 143543752 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 143544300 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143550951 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 143551009 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 143551127 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143552875 G A N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 X 143553173 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143553324 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143553650 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 143553743 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143554145 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 143554397 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 143554674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143554681 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143554722 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143554797 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143554975 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 143554976 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143554990 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143555169 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143555235 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143555429 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143555507 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143555511 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143555513 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143555564 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143555569 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143555575 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143555578 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143555792 T G Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 143555793 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 143555955 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143556154 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143556457 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 143556506 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 143556519 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 143556750 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 143556952 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 143557172 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 143557217 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 143558218 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143558334 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143558553 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143558559 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143558611 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143558763 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143559291 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143559479 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 143559581 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 143559641 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 143559793 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 143560409 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143560850 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143560931 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 143560949 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143561004 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 143561010 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 143561015 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 143561162 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 143562057 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 143562087 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 143562181 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 143562325 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143562403 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 143562427 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 143562452 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 143562578 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 143562607 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 143562805 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 143562969 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 143562991 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 143563149 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143563237 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143563239 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143563265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143564225 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143564655 A C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 143564795 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 143566247 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143567593 T A N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 X 143571651 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 143571894 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 143572151 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143572317 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 143572320 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 143572697 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 143572726 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 143572924 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 143577402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143577982 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143578333 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 143578589 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143582037 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 143582534 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 143591708 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143595267 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 143596598 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 143597136 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 143597615 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 143598224 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143598256 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143598289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143598514 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 143598582 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 143599148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143599241 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 143599244 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143599543 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143599607 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143599650 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143599732 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143599897 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143600771 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 143601826 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 143605143 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143606509 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 143606772 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143609574 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 143610875 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143611570 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143612050 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 143612057 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 143612565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143613521 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 143614823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143617683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143618051 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143618909 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143620199 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 143621466 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 X 143622970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143623246 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143623353 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143623639 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143623912 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 143626173 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 143626303 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143630839 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143630847 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 143631016 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143631390 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143631574 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143631728 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143631972 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143632477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143633159 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143633529 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 143635969 A T Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 143636169 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 143636769 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143637689 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143637690 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 143638285 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143639195 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 143639258 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143639259 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143647544 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 143647843 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143648341 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143648626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143649630 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143649970 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 143650417 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143650597 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143650873 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 143650978 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 143653415 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143653542 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143654207 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143656003 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 143656666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143658543 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 143660304 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 143661217 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 143661313 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143663231 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143664527 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143664944 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 143665090 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143665656 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143666552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143666613 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143667162 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143668042 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143668907 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143671107 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143671946 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143671986 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 143677505 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 143680746 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143681617 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 X 143683577 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 143685441 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143685635 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 143685730 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143688486 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 143688535 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 143688856 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 143688864 T A N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 X 143690819 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 143691028 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143691688 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143693115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143693777 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143693994 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143695127 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143695128 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143696117 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143697576 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 143697838 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 143698736 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 143699521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143701906 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 143703513 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 143704838 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 143706881 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143707374 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 143708201 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 143709581 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 143714448 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 143716374 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 143730565 C A N N 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 X 143734758 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 143734950 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 143735254 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 143743452 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 143745669 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143746996 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143747161 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143747162 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143748058 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 143748189 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 143748625 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 143749380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143749497 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143749966 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143749967 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143750020 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143750780 T A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 143750873 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143750950 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143750973 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143751251 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143752034 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143752035 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143753629 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143753645 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143753945 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 143753986 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 143754046 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143754297 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143754566 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 143755004 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 143755117 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143755140 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143755189 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 X 143755201 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 X 143755701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143755762 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 X 143755767 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 143755873 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 143755887 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143755919 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 143755934 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143756087 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143756179 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143756223 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143756609 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143756724 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143756738 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143756741 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143757039 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143757073 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143757672 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143757739 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 143757825 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 143757884 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143757943 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 143757948 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 143759115 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143759321 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 143759784 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 143763513 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143767459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143767889 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 143768032 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 143769142 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143769872 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 143773400 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143773661 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143773986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143774346 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 143775689 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143775943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143777031 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 143777082 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143777427 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143777623 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143780838 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 143782906 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 143783398 C G N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 X 143783794 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143783973 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143784423 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 143786051 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 143786957 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143787146 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143791287 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143791562 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143794727 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143795171 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 143795403 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 143797114 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 143797732 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 143797755 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 X 143797756 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 143799296 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143799744 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 143799847 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143800669 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143801129 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143802411 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 143804610 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 143804858 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143806596 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143808184 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 143808640 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143810115 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 143814000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143816433 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 143818404 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 143819961 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 143823319 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 143827700 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143832698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143833537 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143834831 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 143836248 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143837791 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143837930 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143843067 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143844739 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143848851 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143855358 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 143855429 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143856149 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 143857481 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 143857866 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143858579 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 143858829 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143858869 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 143860928 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143861064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143861229 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 143862654 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 143863054 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143867292 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143867570 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143867910 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143884100 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143884894 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143889488 T G N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 143890680 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143891415 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143893992 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143899307 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 143900194 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 143900965 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143901714 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143902422 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 143902694 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143903416 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143903432 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143906273 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143907036 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 143908048 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143912945 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 143913170 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143913540 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143915119 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143919419 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143925390 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143926949 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 143928722 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143931059 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143932914 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143934535 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143935081 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143940253 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 143941315 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143941649 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143943779 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143946801 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143949857 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 143950770 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 143952715 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 143952769 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143962507 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143964322 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 143965202 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143969449 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143971376 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143971445 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143972177 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 143975313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143977787 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143978565 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143978682 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 143979723 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143979846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 143980949 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 143987254 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143989966 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 143990819 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 143995035 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 144001602 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 144001800 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 144002056 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 144003156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 144003988 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 144008221 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 144008286 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 144009274 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 144009570 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 144010578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 144013474 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 144013854 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 144013858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 144013956 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 144013966 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 144014475 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 144018474 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 144019627 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 144021592 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 144021905 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 144023436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 144023517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 144023594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 144023687 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 144024010 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 144026329 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 144027616 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 144029911 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 144030756 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 144031899 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 144032155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 144032514 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 144034099 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 144036367 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 144041725 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 144042495 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 144043558 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 144044106 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 144045034 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 144045762 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 144046406 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 144050087 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 144053781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 144056296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 144057398 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 144057591 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 144061654 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 144066355 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 144066357 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 144067735 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 144068117 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 144070432 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 144070941 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 144071450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 144074174 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 144076850 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 144090422 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 144090519 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 144090545 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 144091868 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 144092319 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 144093000 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 144099432 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 144099570 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 144101265 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 144101527 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 144107026 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 144111253 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 144111336 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 144112440 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 144113854 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 144114398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 144114475 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 144115181 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 144119789 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 144121704 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 144125346 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 144125513 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 144126394 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 144127754 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 144128096 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 144130011 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 144130065 A T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 144130366 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 144131599 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 144131990 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 144132535 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 144132749 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 144134307 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 144134308 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 144138143 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 144138979 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 144139307 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 144141687 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 144144812 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 144147677 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 144150320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 144152874 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 144155449 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 144164041 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 144164821 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 144167746 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 144168934 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 144169725 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 144169921 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 144170617 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 144175959 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 144177112 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 144178214 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 144179659 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 144179664 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 144179725 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 144180381 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 144180930 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 144183687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 144186580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 144189341 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 144192253 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 144192523 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 144193421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 144193422 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 144195134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 144196272 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 144198896 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 144199307 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 144199671 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 144200210 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 144203163 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 144203299 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 144203345 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 144204646 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 144204712 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 144204997 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 144205032 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 144222483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146550986 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146551074 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146565500 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146567223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146572271 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146575796 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146576044 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146577463 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146577940 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146579165 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146579167 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146579189 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146580578 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146582526 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146583700 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 146585582 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146587534 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146588208 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146589879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146589981 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146596478 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146596694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146599674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146601052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146601828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146605806 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 146607158 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146614676 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146615434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146616743 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146627940 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 146636694 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146641331 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146643436 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146644007 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 146644111 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146644546 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146647900 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146648670 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 146649462 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 146649723 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 146651122 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 146660548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146673482 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146678185 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146680362 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146687562 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 146690566 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 146691154 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 146693546 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146693835 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146698867 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 146699000 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146702897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146707082 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146711792 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 146712808 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 146717412 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146720750 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146723589 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146726335 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146726336 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146726522 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146726525 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146726914 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146727331 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146729817 T A Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 146735320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146735921 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146736002 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 146736283 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146737921 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146738460 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146741148 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146742599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146742672 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146748154 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146749225 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 146750532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146751060 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146752020 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146755206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146755488 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146756004 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 146756232 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146766237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146766374 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146767162 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146767321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146767980 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146775035 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146775974 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 146776683 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 146777425 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146777554 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 X 146778573 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 146780090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146785091 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146786764 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 146786931 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 146787663 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146792377 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146792700 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146794943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146798718 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 146801248 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 146801484 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146801988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146803253 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146803553 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146804219 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146804746 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146805348 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 146806995 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 146815086 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 146818020 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146818402 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 146823965 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 146824366 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146828746 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 146828859 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146832378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146832899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146834116 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 146834145 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 146842022 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 146847088 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146851818 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146852351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146853055 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146860700 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146862451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146862963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146868518 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146876368 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 146879456 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 146881258 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146886713 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146889412 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 146892345 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146897305 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146897332 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 146899581 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146940571 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 146941963 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 146941969 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 146942253 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 146942825 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 146943682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146944328 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146944759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146947452 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 146950811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146950925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146951714 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 146976950 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 146978692 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146981445 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146981702 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146981919 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 146982182 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146982474 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 146984759 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 146987885 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146988034 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146989073 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 146989180 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146990516 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146990618 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146994895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 146996306 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 146998817 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 146998832 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 146999841 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147001245 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147001584 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147001989 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147002334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147002376 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147002775 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147003404 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147003588 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147004723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147006187 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147006268 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 X 147006565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147006747 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 147007581 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 147007582 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 147007651 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147008246 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147008278 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147008368 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 147008369 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147008371 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147009053 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147010069 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147010155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147010578 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 147013562 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 147014113 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 147041613 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147044993 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147078129 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147078493 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147087190 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147087573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147089105 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147089309 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147089586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147090238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147092151 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147093042 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147093157 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147095625 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 147095720 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147096795 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147097580 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147102043 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147102092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147119156 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147122667 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147123152 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147142788 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 147148007 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147155958 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147158185 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 147158605 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 147161612 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147185096 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147187337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147188392 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147190208 T G Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 147196183 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 147196798 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147198320 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147198624 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147198899 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147200053 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147200205 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147200623 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147200654 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147200669 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147200697 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147200935 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147200961 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147201083 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147201100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147201241 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147201258 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147201325 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147201383 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147201504 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147201523 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147201851 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147202485 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 147202561 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147204763 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 147204764 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147204769 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147204829 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147204850 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147204851 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147204856 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147204973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147204981 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147205031 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147205187 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147205213 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147205216 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147205220 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147205256 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147205311 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147205347 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147205438 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147205554 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 147206711 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147208310 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147214278 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 147215719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147231491 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147233178 G A N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 147239114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147250759 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147259345 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 147260549 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147261720 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 147263299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147268691 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147270591 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147275536 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147275773 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147281042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147281251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147284544 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147289902 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147293284 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147293327 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147293392 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147293515 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147294842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147295217 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147304826 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147307688 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147307861 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147313165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147318558 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147323180 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147325042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147325368 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147325584 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147325718 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 147326487 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147328114 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147329874 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147332787 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147333392 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147335951 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147335996 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147337029 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147337040 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147337104 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147343810 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147344316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147348267 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147350001 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 147351470 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147353180 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 147354931 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 147358771 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147358796 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147359200 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147360929 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147362384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147363181 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 X 147363263 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147364153 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147364523 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147366650 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147366807 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147368426 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 147368428 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 147369200 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 147369736 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147372584 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147373193 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147373987 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147374188 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147374310 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147380169 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147384668 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147385123 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147394198 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147397384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147398123 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147400099 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 147400741 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 147400770 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147405281 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147408435 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 147410361 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 147410646 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 147411744 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147413572 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147415717 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147418692 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147426258 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147426322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147427339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147428700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147431186 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147434570 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147436238 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147436646 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147437606 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147440801 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147441076 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147441579 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 147442086 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147442250 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147442605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147442642 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147443079 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147443236 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147446311 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147446323 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147446341 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147446933 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147447087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147454946 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 147457353 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 147457923 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 147462156 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 147463355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147463375 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147463445 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147465223 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147467845 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147468669 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 147468684 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147473783 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147475578 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147478933 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147479745 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147484181 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147484193 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147488023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147488096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147489055 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147490594 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147492129 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147492629 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147496448 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147503702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147507186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147509664 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147510760 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147511096 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147514249 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147514869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147517909 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 147525676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147526704 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147532766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147533100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147540552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147544082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147555664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147556467 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 147558190 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147560030 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147561156 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147561741 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147562292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147564723 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147567180 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147569286 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147572783 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147572935 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147577810 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 147578172 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147578999 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147581600 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147584203 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 147589085 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147589411 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147595933 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 147595951 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 147599567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147607741 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147608286 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147616458 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147618410 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147619996 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147620183 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147620706 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147620809 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147621123 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 147621154 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 147621169 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 147622181 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147622455 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147623326 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147623504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147624051 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147624631 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147624875 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147624918 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147625047 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147625051 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147625067 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147625781 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 147626474 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 147629087 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 147629818 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 X 147631156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147631820 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 X 147631911 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 X 147631964 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 X 147632139 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 X 147632140 A T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 X 147632434 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 147633625 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147634739 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 147635038 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 X 147635707 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 X 147635942 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 X 147636445 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 X 147636928 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147637283 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 X 147637955 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147639148 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 147639987 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147640355 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 X 147640356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147641026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147641588 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 147641746 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 147642034 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147644081 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147646719 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 147646801 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 147648039 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 147648355 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147649148 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147653737 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147654150 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 147655379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147655506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147655557 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147657348 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147657402 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147657548 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 147660676 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147660678 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147660747 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 147662204 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 X 147662348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147662654 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147664079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147665181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147666128 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 X 147666916 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 X 147667129 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147668830 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 147669411 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 X 147669434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147670397 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 147670402 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 147670406 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 147671822 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147672156 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147672342 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147680117 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 147680557 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147681198 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147687322 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 X 147687385 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 X 147690193 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147690296 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147690748 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147691781 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 147692652 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147694222 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 147695008 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147697062 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 147698625 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147701491 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 147701624 A G N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 X 147707198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147707747 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 147708290 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147709106 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 147711835 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 147712680 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 147715899 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147716838 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 147717504 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147718174 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147718590 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147720243 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147721964 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 147721965 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 147722592 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147724769 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 147724837 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147724906 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147725045 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147725497 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147726482 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 X 147726633 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 147727153 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 147728055 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147732327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147732858 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147733084 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 147733115 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 147733116 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 147733299 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147735039 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147735345 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 147735455 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 147735889 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147736325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147737114 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 147738684 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147741584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147745239 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147746935 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147752283 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147755520 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147755688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147756896 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147757658 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147759553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147760120 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 147760247 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147762562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147763015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147763018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147764563 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 X 147765781 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147768016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147768392 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147768602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147769122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147770830 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 147771724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147771728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147771868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147772101 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147773004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147773174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147773226 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 X 147776770 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147781356 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147783229 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147785219 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 147787062 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147788109 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 147788622 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147789189 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 147789955 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147796091 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 X 147797281 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147797313 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 X 147799344 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147803434 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147805808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147807551 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147812047 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147817127 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 147817211 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147817460 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147819086 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 147819915 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 147833204 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147837036 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147838259 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 X 147838683 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 147839564 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 X 147841906 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 X 147841917 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 X 147844259 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147844808 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147845789 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147849891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147850002 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147851432 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 X 147851629 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147853911 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147854149 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 X 147855083 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147855464 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147856181 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 147857308 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147859616 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147861039 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147863121 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147864153 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147866881 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147867073 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 147867803 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147867806 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 147868856 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 147872501 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147874868 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 147875256 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 X 147877637 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147879100 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147879165 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147879496 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147879512 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 X 147879755 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147879821 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 X 147879845 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 X 147881851 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 X 147882169 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 X 147884225 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147884366 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147884435 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147884693 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 X 147886322 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 147886855 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 147886861 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 147887259 C T N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 X 147888424 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 X 147888607 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 X 147888949 G T N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 X 147888964 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 147889190 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 X 147889506 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 X 147889521 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 X 147889526 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 X 147890254 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 147890981 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147891013 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147892038 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147892237 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147892599 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147892746 C T N Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 X 147892832 C G N N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 X 147893450 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 X 147893490 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 X 147893871 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 X 147894224 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147898291 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 147900768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147901806 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147902861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147904667 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147909284 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 X 147910376 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 147912081 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147916326 T C Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 147917603 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147917667 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147921521 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 X 147922481 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 147924741 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 147924742 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 147924748 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 147924760 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 147926041 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147926505 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 147926762 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 147928028 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 147928084 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 147929619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147930371 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 X 147930663 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 X 147930795 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 X 147931500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147933012 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 147934533 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147942845 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147943241 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 147948134 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147948476 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147949767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147953778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147953826 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147953897 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147954140 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147955426 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 147955900 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 147969226 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 147972221 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147973244 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 147980796 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 147997898 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 148001428 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 148009504 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148010957 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 148019844 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148019873 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148021251 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 148022913 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148022961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148022962 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148027205 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148035473 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 148035924 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148040045 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148043641 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148046578 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 148047408 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148047967 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148048901 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148049377 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148050764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148051424 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 148051427 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 148056647 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148062867 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148068995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148073048 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148074391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148075188 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 148078384 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148080650 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148084679 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148085764 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 148086825 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 148092472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148092692 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148095762 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148102834 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 148102958 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148105054 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 148105122 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 148105768 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148106544 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148107409 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148120502 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 148121751 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148123909 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 148124190 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148126455 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 148131578 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148134402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148138576 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148138988 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148141028 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148141866 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148142062 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148142235 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 148147938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148147942 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148149044 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 148149898 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148151037 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148154585 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148156772 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148163423 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148163462 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148164825 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148165163 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148165879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148169527 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148170833 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148172517 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 148174080 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148176671 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 148186394 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148189488 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148192260 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148195675 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148196505 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 148203780 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 148207195 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148207455 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 148208882 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148209283 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148215139 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148218460 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148219194 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 148219512 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 148221126 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148221849 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148227036 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148228447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148228806 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148230474 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148232691 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148234214 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148241588 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 148242089 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 148246407 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 148248045 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148252983 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 148254336 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 148257464 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148257873 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148261881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148264397 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148267900 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 148274064 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148276375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148276425 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148278079 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 148280750 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 148282737 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148286872 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148292482 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 148292712 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 148295129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148295879 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148297794 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 148298465 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148303547 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148309162 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148311744 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 148314182 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148315780 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148316107 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148316344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148320988 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148324856 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 148329678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148330603 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148331407 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148331910 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148332421 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148332904 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148337645 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148349173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148352286 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 148355070 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148355198 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148364530 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148368491 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 X 148374496 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148375648 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 148377687 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148381939 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148382610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148392901 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148395323 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148396840 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148399110 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148399150 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148400619 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 148400990 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148407695 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148408037 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 148408073 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 148408343 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148414986 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148415082 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 148415092 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148415450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148416224 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 148416564 G C N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 X 148416990 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 148417385 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148419377 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148419404 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148419418 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148419650 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148419703 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148419775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148419806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148419966 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 X 148419967 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 148419972 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 X 148420200 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 X 148420826 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148420855 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148420951 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148421309 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148421668 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148421680 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148421732 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148422249 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 X 148422527 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 X 148422659 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148422862 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148425350 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 148425792 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148426538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148427235 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 148430416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148431609 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148440255 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148443673 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148444877 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148446417 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 148472980 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 148488849 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148507229 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148518575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148519632 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148522846 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148525529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148527480 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148528425 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148529590 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 148529789 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148530271 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148530463 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 X 148531216 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148532819 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148533380 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148535267 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 148541614 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 148542758 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 148543415 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148543459 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148544322 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 148547543 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148548130 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148549010 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148549490 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148551603 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148553348 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 148554059 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 148554976 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148555890 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 X 148557077 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 148557413 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 X 148557713 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 X 148558532 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148560126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148560484 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148562412 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148562676 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 X 148564985 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148569885 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148570779 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 148571917 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 X 148573890 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 148574006 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 X 148574105 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 148574219 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 148574507 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 X 148575662 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 148575720 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 148581572 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148587067 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 X 148589393 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148604303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148606306 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148608032 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148608622 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148613823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148618232 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 148619655 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148619762 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148619864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148622088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148632579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148637613 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148643019 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 148644710 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148645560 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148645563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148646279 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148646497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148647711 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148648060 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148648203 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148650011 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148651576 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 148652691 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148652837 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148652848 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148653404 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148653549 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148658694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148662541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148663610 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 X 148664083 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 148664879 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148665594 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148667548 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148671093 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148671166 A T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 X 148671170 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 X 148671571 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 148673471 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148675298 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148676330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148676381 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148676519 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148677708 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148682843 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 148683791 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148684660 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 148688359 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148693445 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148693808 A C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 148693835 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 148694277 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148694455 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148694763 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 148695428 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 X 148695886 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 148696398 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148698010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148698312 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148698767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148699582 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148699654 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 148699715 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 X 148699893 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 X 148699987 G T N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 X 148702687 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148703182 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148706552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148707047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148708043 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 148708741 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 148713700 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 148717679 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 148723188 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148724718 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148729715 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148734877 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 X 148740057 T G N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 X 148741509 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148742493 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148743887 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148746907 T A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 148748027 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148748247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148748325 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148749020 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 148749177 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 X 148750102 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148753475 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 148755825 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148756866 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148760585 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148761595 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148762020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148762808 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 X 148764247 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148764711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148764774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148774310 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148791875 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148795910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148802031 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148804140 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148805965 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148809499 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148809908 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148818299 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148826330 C T N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 148827197 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148834637 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 148882414 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 148882456 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148882465 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148888170 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 148892994 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 148894647 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148895048 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 148896057 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148898924 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148909010 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 148915025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148918699 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148931414 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148949424 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 X 148953986 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148954696 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148956686 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 X 148956973 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148957181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148957546 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148965928 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 148967565 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 148967856 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 148968157 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 148968206 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 148968839 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 148970245 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148971922 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148971989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148973566 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 X 148973801 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 X 148974529 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 X 148975204 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148976070 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 X 148976074 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 X 148976091 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148976171 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 X 148976510 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 X 148977878 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 X 148978272 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 X 148978323 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 X 148978353 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 148978598 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 X 148978763 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148978802 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 X 148979136 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 X 148979152 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 X 148979180 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 X 148979203 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 X 148979244 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 X 148980200 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148980274 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 X 148980595 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148980886 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148981671 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 148984649 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 148990149 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149015455 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149016540 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149017817 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149029431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149039182 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149045100 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149046436 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149049734 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 149050028 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149051180 G T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 X 149053767 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149054435 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149055178 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149056585 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149057985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149062343 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 X 149063089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149067614 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149068659 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149069147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149072380 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149072453 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149072467 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149074833 A T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 149075389 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149076457 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 149076513 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 149077536 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149080838 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149098017 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149099579 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 X 149105322 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149105937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149107252 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 149107718 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149108893 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 149109032 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 149110279 T G N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 X 149118038 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149118248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149118317 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149118797 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149118823 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149119030 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149119588 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 149119901 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149120890 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149120895 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 X 149120902 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149120914 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 149124514 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149126823 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149128398 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149132458 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149132643 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 X 149132674 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 X 149132680 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 X 149132705 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149132945 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 X 149133111 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149133316 C A N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 X 149133369 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 X 149133415 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 X 149133509 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 X 149133849 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 X 149133858 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149133866 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 X 149133921 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 X 149134063 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 X 149141986 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 149142176 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149142975 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149143512 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 X 149143812 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149143920 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149144104 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149146089 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149146329 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149148935 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149151479 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149152184 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 149152647 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149154089 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149154263 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149154356 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149155015 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149155401 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149156443 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 149156551 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 149157088 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 149157420 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 149159144 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149159357 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149159627 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149159652 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149161287 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 X 149164080 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 X 149164145 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149165704 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149166034 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149166691 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149167150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149167189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149167465 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149167509 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149167603 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 X 149168161 T C Y Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 X 149171030 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 X 149171466 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149172036 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 X 149172098 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.2 0 0.8 6 24 3 0 12 X 149172535 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149172781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149172986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149173160 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149174567 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149174745 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149175044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149176021 G T Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 X 149177586 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 X 149177638 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149177833 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 X 149177877 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149178031 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149178099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149178420 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 149178421 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149179208 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149179330 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 X 149179591 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 149179601 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 149180312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149180454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149180923 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 X 149181363 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 149181513 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149181944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149181960 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149182204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149182535 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 X 149182551 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149182614 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 X 149182730 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149183973 A T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.0588235294117647 0.764705882352941 0.176470588235294 15 19 1 13 3 X 149184829 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 149187077 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149187446 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 X 149187792 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 X 149187860 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149187867 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149188757 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 X 149191707 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 149193095 G T Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 X 149193170 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149193486 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149198026 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149200196 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149205069 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 X 149206418 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 X 149210013 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149212376 T C N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 X 149213956 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149214297 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149215647 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 X 149216270 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149217667 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149218866 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149218955 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149219420 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149219505 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149223430 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149230018 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149230057 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149232215 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149232516 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149233843 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 149236176 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149237410 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 149239235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149241862 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149242742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149247868 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149248862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149249099 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149249831 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149250044 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149250098 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149251291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149251536 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149252531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149255275 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 149255286 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 149255361 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 149255685 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149257484 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149258338 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 149259658 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 149261495 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149262024 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149262886 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149263115 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149263893 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149265224 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149269792 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149270078 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 149270875 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 X 149272408 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149272563 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149272832 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149272922 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149278102 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149278693 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 149278707 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149279286 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149279377 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149279475 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149281042 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149281076 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149281300 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 149281362 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149281431 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149282983 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149284177 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149284417 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149288621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149288668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149288917 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149289567 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149290444 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149290761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149291466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149292036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149293819 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149294066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149294152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149294197 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149294331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149294346 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149294398 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149294534 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149294536 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149294836 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149295014 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149295130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149300406 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149300755 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149301267 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149301435 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149302000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149302118 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149302253 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149302362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149302897 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 X 149304275 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149304396 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 X 149304718 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149307055 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 149307835 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 149307861 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149307869 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149308374 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149311033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149315433 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149319827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149320616 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149320756 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 149321061 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149321452 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149328730 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 X 149336991 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149337534 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 149342119 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149343197 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149345198 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149346075 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149347606 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149349672 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149350376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149351334 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149351874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149352426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149352440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149353060 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149358729 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149359349 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149359771 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149360895 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 149360953 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149366564 G T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 149367136 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149368958 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149371060 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 149371440 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149372321 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 149378090 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149383074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149383411 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149385461 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 149385500 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 149387204 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149387780 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 149388994 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 149389507 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 149390046 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 149391547 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149392185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149393868 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149395331 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149402804 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149403342 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149403367 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149403562 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 149403572 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149403596 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149403604 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149403639 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149403779 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149403780 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149404320 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 149404966 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149405029 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149405402 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 149405565 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149409341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149409895 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149410144 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149410411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149410599 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149411865 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149412142 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149413324 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149413800 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149413836 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 149415828 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149416985 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149417281 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 149418084 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149418552 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149420504 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149420956 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149426399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149428778 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149433997 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149434824 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149435160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149435955 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149440437 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149446531 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149447056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149448188 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149477485 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149477724 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149479395 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149480285 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149482786 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149486800 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149487439 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 149489746 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149490015 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 149490214 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 149490472 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149492028 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149492881 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 149494004 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149494225 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 149495290 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149496618 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 149499391 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 149500022 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149501750 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149502115 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149502523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149502873 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 149502936 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 149503086 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 149503332 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149503339 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149504159 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149504828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149505128 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 X 149505137 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 X 149505173 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 149505466 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149505490 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149505622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149506687 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 149506829 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 149507090 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 149507173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149507207 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 149507839 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149507876 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149508168 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149508986 G T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 149509392 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149514458 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149514463 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149514801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149516114 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149516387 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149516428 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149516531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149516573 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149516598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149517134 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 149517495 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 149518303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149518890 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149519022 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149519156 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149519486 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149519672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149520010 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149520017 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149520600 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 149520917 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149521406 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 149521701 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149522637 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149522640 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149522988 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149523077 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149523251 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149523493 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149523495 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149523884 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149524151 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149524581 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149524660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149524664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149524671 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149524982 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149524991 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149525290 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149526551 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149526553 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149528593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149534709 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149535393 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149536366 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149537502 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149539601 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149539721 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149540465 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 149540487 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 149541575 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149541637 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 149542618 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149546848 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 149546855 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 149547268 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149548240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149548441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149548527 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149548907 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 149549511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149549534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149551606 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 149553612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149553690 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149554990 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149556290 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149559597 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149560892 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149564487 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149566622 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149568290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149568344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149570688 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 149575884 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 X 149576000 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149576530 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 149576604 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149576606 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 149576643 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 X 149576674 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149576754 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149576756 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149577077 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 149577661 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 149577970 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 X 149577988 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 X 149578007 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149578396 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149583217 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149585124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149588733 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149589713 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149590613 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149592146 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149595052 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149596568 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149598130 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149598284 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149598315 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149598319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149598730 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 149599820 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 149600401 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149601741 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149602375 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149603672 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149604290 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149604454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149605026 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149605720 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149605864 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149606535 G A N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 149607039 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149607040 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149609192 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149610760 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149612567 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149613367 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149613379 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149613627 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149613950 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149614041 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149614296 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 X 149614372 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149614754 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149615544 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149615966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149616131 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 149616175 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149616587 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149616970 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149617023 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149619050 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149619759 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149620212 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149620755 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 X 149620756 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 X 149620783 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149620901 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 149623958 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149625326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149626773 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149626982 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149627050 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149627088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149627211 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149634555 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149635601 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149636267 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149637996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149638798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149642650 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 149651657 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149654637 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149654765 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149655073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149655126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149655201 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149655606 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149656082 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 X 149656085 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149656087 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149656117 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149656157 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149656188 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149656560 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149656582 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149656857 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149656998 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149659681 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 149661492 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149663168 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149663707 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149664909 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 X 149664959 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149665291 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 149665348 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 149665378 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149665414 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149665487 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149665506 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149665527 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149666179 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149667791 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149668000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149670862 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 149672605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149675144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149677027 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 149677338 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 149678435 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149679751 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149680460 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149680760 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149681469 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 149682939 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 149684744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149685018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149686454 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149687461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149687670 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149689379 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149689968 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149690054 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149692014 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149692787 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149693013 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 149696168 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149696939 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 149698400 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149698711 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149699216 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149701253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149701347 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149702727 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149704204 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149704844 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149704907 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149706185 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149706336 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 149710860 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149714428 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149715572 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 149717816 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149721487 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149721758 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149721867 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149723337 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149726093 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149726971 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149729712 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149730396 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149733474 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149736331 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149736543 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149737233 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 149737325 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 149738482 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149739031 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 149740580 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149741627 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149745882 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149747131 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149747489 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149749592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149749726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149752963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149754745 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149754815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149755495 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 149756914 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149757093 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149757577 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149757877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149760694 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149761076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149766337 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149768513 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 149773952 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149776478 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149777873 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149779194 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 149781581 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149784704 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149785289 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149785316 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149785494 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149786178 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149786182 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149786938 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149787092 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149787921 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 149791542 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149792653 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149792766 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149792767 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149793448 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149798174 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149798799 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149798801 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149800463 A C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 X 149800966 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 X 149800978 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149800988 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 149801012 C A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 149814352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149817504 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 149817637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149817793 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 X 149818313 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149820999 T C N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 149821644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149821697 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149821843 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149822231 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149822765 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149824408 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149828253 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149828661 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149834587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149836418 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149836555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149837293 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149838683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149838838 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149842488 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149843672 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149848213 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149849841 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149850590 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149856528 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149857288 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149857431 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149858103 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 149860556 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149860582 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149862047 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 149865368 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149869864 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149873182 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149873898 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149878632 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149879602 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 149881457 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149882727 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149882984 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149883277 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149887576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149893960 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149895451 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149896764 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 149899966 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149900031 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 149906386 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149909535 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 149912668 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149914888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149915220 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149915383 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149915565 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149916197 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149916642 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149917058 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 149921752 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149924364 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149926232 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 149929498 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149929692 C A N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 X 149931214 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 149933968 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149934721 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149936121 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149936656 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149937141 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 149937263 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 149939224 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 X 149939799 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149941067 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149941195 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149942656 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149948002 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149948235 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 149954887 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149954902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149962264 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 149963614 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149963706 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149965288 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 X 149965457 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 X 149965563 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149965737 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 X 149966023 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 X 149966089 T G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 X 149966193 A C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 X 149966280 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 X 149966821 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 X 149966918 T A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 X 149967242 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 X 149967290 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 X 149967431 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 X 149967835 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 X 149967930 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 X 149967975 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 X 149968178 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 X 149968220 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 X 149968229 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 X 149968646 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 X 149968767 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 X 149968820 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 X 149968829 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 X 149968900 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 X 149968940 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 X 149969296 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 X 149969332 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 X 149969575 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 X 149969732 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 X 149969753 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 X 149969794 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 149969851 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 X 149969921 T G N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.142857142857143 23 5 11 1 2 X 149969934 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 149970354 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 149971247 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 149971990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149972449 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 X 149973441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149973496 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149973520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149973764 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149973874 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149974286 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149974337 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 149974403 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 149974406 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 149974620 A T N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 X 149975007 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149975070 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 149975171 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 149975184 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 149975240 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 149975246 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149975250 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 149975259 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 149975355 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149975422 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 149975549 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149975677 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 149975784 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 149976082 G T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 X 149976289 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 X 149976378 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 X 149976412 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 X 149976507 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 X 149976564 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 149976600 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 149976601 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 149976657 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 X 149976749 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 X 149977318 A C N N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 X 149978220 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 149978833 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149979249 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149981122 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 149981186 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 149983105 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 X 149983822 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 X 149984700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149986231 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 149987247 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 X 149988061 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 X 149992297 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149992746 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149993194 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 149995569 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 149996748 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150005020 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150008775 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 150009020 G T Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 150009620 T G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 150009625 A C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 150010838 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150011388 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 150012068 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150014282 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 150014574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150015016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150015017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150015570 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 150016006 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 150018035 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 150020852 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 150021006 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150021494 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 150023171 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 150024370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150032125 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150033459 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 150034513 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150034698 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150035350 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 150035558 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 150035981 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150036250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150037410 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 150037681 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150037833 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150040037 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 150041844 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150042306 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150042627 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 150043560 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 150043789 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150043900 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150044142 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150044170 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150044211 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 X 150044238 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150044243 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150044294 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 X 150044435 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150044579 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150044660 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150044854 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 150044856 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 150044962 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150044996 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150045006 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150045047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150045059 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 X 150045095 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150045181 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 X 150045474 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150045578 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 X 150045849 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 150045876 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150045899 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150045974 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 150046132 C T N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0 0.6875 0.3125 11 21 0 11 5 X 150046186 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150046189 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 150046202 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 150046229 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 150046234 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 150047170 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 X 150047304 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 150047619 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150047887 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 X 150047927 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 X 150048109 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 150050246 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150055832 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 X 150056178 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 X 150056241 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 X 150057130 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150057576 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150058409 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150059013 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 X 150061426 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150061766 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150066096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150066450 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150066946 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 150067135 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 150067493 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 150068392 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 150069173 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150069256 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150069747 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 150070313 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 X 150070314 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 150070751 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 150071061 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150072571 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 150074571 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 150075889 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150076057 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150079519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150079652 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150079654 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150079960 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150081055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150081739 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150084429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150086805 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150087769 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150089846 T G N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 X 150089890 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 150091897 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150093188 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150093347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150097593 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 150100551 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150102560 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150104023 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 150113065 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150113537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150115848 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 150115976 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150120360 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150121198 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 150122206 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150122273 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150127961 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 X 150128033 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 150129261 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150129801 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150132114 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150132479 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150135059 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 150137381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150141676 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150141851 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150143369 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150144246 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150144355 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150144757 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150145132 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150146933 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150148022 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150148654 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150149482 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150149565 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150150872 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150152890 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150153444 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 150154962 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150156095 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 150156601 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150157265 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 150157543 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 150158584 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 150168175 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150168679 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 150169963 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150171255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150171648 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150173032 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 150173251 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 150173570 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150173621 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150173651 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150175337 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150176663 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150176775 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150178295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150179670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150180556 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 150182408 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150183018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150183074 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150183343 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150183446 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150185400 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150185738 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150185907 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150194081 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 150194954 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150194992 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150195096 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150196625 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 150197599 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150206200 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 150206991 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 150210459 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150210711 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150211266 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150211997 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150213508 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150213593 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150213734 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150216586 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150216908 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150220766 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150223008 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150223075 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150223886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150223894 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150224335 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150224368 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150225208 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 150226237 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150226259 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150226878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150227052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150227266 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150227383 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150227712 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150228478 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 150228573 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 150228900 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150229667 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150229860 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150230563 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150230724 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 150230916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150231630 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 150232569 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 150236976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150237420 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 150238136 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150238366 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 X 150239447 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150239448 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150239590 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150241674 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 X 150243468 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 X 150245910 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150246552 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150248189 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 150248215 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 150248220 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150248337 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150248528 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150248913 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150249530 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150249861 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150250416 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 X 150254380 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 150254749 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150255335 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150256068 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 150263825 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150266679 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150269097 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 150271444 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150272310 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 150272778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150272802 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150273399 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 150273639 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150273677 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 X 150273777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150274192 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150274680 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150275406 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150275568 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150275693 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 150276032 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 150276046 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 150276281 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 X 150276618 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150276780 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150277079 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150277548 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150277726 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 150277850 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 150277968 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 150278220 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150278571 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150279024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150279571 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 X 150279751 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 150280214 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150280665 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150282516 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150283492 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150283522 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150283524 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150284496 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 150284736 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 150285268 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150285756 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150285857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150286856 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150287192 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150288825 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 150289380 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 150289493 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 150289516 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 150289604 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 150290030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150290484 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150290758 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150291034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150291115 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150291287 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150291578 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150292380 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 150292558 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150298576 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150300585 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150300844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150301213 G C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 X 150302936 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150305491 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150308278 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150309439 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150314540 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150317668 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150319345 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150319499 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150322972 G A Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 X 150323597 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150328773 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150330396 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 150330873 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 150332531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150333748 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 150335601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150336188 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 150337064 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150337390 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150339099 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150341416 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 150343949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150344051 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150346970 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 150349850 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150352808 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150355984 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150356247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150356428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150356999 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150363892 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150366372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150368093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150368178 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150368344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150369797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150371445 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150371547 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150373695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150374539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150380414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150381537 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150381947 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150382573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150382946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150383055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150391458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150391676 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150394942 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150400692 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150407679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150413822 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150415175 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150416751 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150422895 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150426959 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 150427245 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 150428467 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150504924 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150510521 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150511682 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150513928 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150514008 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 150516264 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 150518105 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150518123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150519955 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150520783 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150521389 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 150532570 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150533420 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150567415 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 150567833 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 150568566 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150569206 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150569327 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150570634 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150574377 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150574686 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 150575536 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150576040 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150577548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150577761 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150580006 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150582125 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 150583110 C G Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 150583710 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150583722 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150584141 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 150585922 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150588219 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 150588901 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 150589587 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150590040 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150590100 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150590769 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150591706 G A Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 150592699 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150600799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150603934 T G Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 150614984 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 150615964 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 150617974 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 150623586 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 150633802 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 150634056 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 150634197 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 150635233 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 150643496 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 150646987 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 150654488 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 150655104 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 150655335 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 150658082 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 150664783 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 150668200 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 150670955 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 150671621 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 150674076 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 150683528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150685247 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150687285 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 150687850 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150689802 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150690458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150697398 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150698492 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150699552 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 150699677 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150702797 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150705990 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150706968 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150707042 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150709837 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 X 150711237 T C Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 150712690 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 150712965 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 150715473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150723604 A C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 150727894 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150729337 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150731026 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 150733524 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150741689 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 150753968 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150758837 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150759057 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 150763870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150764620 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150765553 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150769791 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150769843 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150772462 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 X 150772551 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150773748 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150780240 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150784548 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150787698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150794849 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150797736 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150813282 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150822447 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 150824553 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150825016 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150827016 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 150831713 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150849059 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150849616 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150849660 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150850364 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150850874 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150850890 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150872040 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 150872559 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150874119 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150876437 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 150879604 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150881050 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150887918 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150888182 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150889199 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150889896 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 150891339 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150891585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150896508 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 150897305 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150898168 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150902263 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 X 150910876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150912904 G T Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 X 150915646 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150919618 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150923342 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150923617 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150926130 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150927553 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150928939 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150941837 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 150942327 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150953752 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 150955234 G A N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 150964360 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150967866 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150967872 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150975120 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150975663 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 150976804 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 150991248 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 150998467 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 X 150998566 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151003738 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151004360 G T Y N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 X 151006682 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 151007285 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151011121 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 151013210 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151018503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151020378 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 151020822 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151023672 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151028618 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151035087 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151036545 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 151040163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151042514 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 151050850 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 151051896 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151054052 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 151058275 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151069068 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151069625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151072337 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151079233 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151081041 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151082019 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151083481 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 151086299 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151092297 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 X 151101736 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151104689 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151107645 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151111177 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151118122 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151123319 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151126201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151127706 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151130777 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151136263 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 151160155 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151161594 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 151170572 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151177530 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151192111 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151215677 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151222154 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 151224988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151226365 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151228056 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 X 151245356 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 151251215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151251962 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151271603 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 151273866 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151281125 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151282336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151283002 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151285118 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151286012 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151296108 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151312296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151317811 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151332698 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151337715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151338576 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 151341800 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 151343237 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151351994 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151353863 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151356673 T G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 151357296 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 151358282 A T N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 X 151358687 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151363997 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 151377551 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151399346 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151406380 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151430565 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 151500287 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151529390 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151529813 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151533150 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 151535324 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151538718 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151539105 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151541609 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151542831 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151548786 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 151552865 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 151554918 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151555139 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 151559581 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.875 0 0.125 28 4 14 0 2 X 151562194 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151562561 A C Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 X 151563418 T C N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0 0.5 0.5 6 18 0 6 6 X 151563835 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151565264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151566532 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151568329 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151568678 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 151569840 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151570885 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151572292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151574470 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151574612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151577153 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 151577526 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151579195 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 151580785 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151582661 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 151582749 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 151582912 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 151584314 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151585532 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151585622 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151585640 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151586069 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151587736 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151590612 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151590633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151591141 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 151592398 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 151592561 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151593711 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151596268 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 151596901 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 151597760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151598351 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151599153 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 151600230 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151600403 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151601047 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151603200 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 151604397 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151607889 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151608436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151608443 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151608455 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151608847 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 151609041 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 151609231 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151609564 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 X 151609724 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151610910 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151611362 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 151614708 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 151615704 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151615954 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151619170 T G Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 X 151620398 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 151623142 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151623727 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151625786 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151626127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151627208 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 151627321 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151629575 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 151632734 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151634412 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151638911 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151639428 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151639667 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151639728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151642125 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151643920 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 X 151645109 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 X 151652375 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151663595 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151664180 T C Y Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 X 151664340 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 X 151667942 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151668231 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 X 151669129 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 151670257 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 151676117 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151676766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151677155 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151678943 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151682852 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151684147 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151685295 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151685525 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151686637 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151692064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151692161 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151695929 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 151700021 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151701355 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151701834 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 151701941 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 X 151702047 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 X 151702280 G C N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 X 151702505 A G N Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.571428571428571 0.142857142857143 0.285714285714286 9 5 4 1 2 X 151702888 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151703401 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 X 151703456 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 151703719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151703720 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151704140 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 151704141 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 X 151704156 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 X 151704167 A C N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 X 151704356 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151704479 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151704709 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 X 151704868 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 X 151706669 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151707030 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 151707288 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 X 151707691 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151707917 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151708160 A C N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 X 151708327 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 X 151708446 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 X 151708970 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 151708997 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 X 151709061 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 X 151709638 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 X 151709746 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151710011 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 X 151710252 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 151710608 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 X 151711176 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151711575 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 X 151711620 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 X 151711650 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 X 151711652 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 X 151711675 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 X 151711706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151711967 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151712232 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 X 151712248 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 X 151712693 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151712699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151712901 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 X 151713007 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151713452 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 151714413 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 X 151722510 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151722810 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151723272 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151723632 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151729700 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151732595 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151732787 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151734907 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 151737052 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 151739777 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151740749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151748571 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 151749976 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151753694 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 151753902 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 151756378 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 151758384 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 151759945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151760286 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151760830 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 151762972 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151766739 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 151767063 T C Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 X 151767210 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151770071 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 151772000 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151777614 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151777946 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151778201 A C N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 X 151778854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151779273 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 X 151779303 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 X 151779902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151779952 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151780092 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151780405 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151780435 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 151780454 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151780557 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 151780604 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 151780605 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 X 151780612 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 151780661 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 151780662 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 X 151780678 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 151780679 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 151780797 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151780886 T C Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 X 151781037 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151781279 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151781412 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 X 151781543 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151781835 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151782089 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151782196 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151782390 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151782626 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 X 151782814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151783119 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151783709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151784248 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 151787530 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151788552 A C N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 X 151791100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151791610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151791992 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 151793178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151795630 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 151796069 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 151796714 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 151797887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151801143 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 151802069 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151802725 C T Y Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 X 151804153 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151809564 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151812083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151813898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151814035 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 X 151826735 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 151829613 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151831908 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151832312 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151832738 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151832780 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 X 151834373 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151834416 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151834425 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151835347 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 151835851 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151839272 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151839810 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151840392 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151840647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151841251 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 151842076 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 151844614 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 X 151845848 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 151849582 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151850368 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151850545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151850934 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151852002 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151854494 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 X 151855380 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151855999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151858180 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151858623 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151863006 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151867290 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151867845 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151869652 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151870787 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 151870789 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 151872780 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151872938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151873117 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151873240 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 151874967 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 151878095 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 151881922 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151889903 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151901892 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151906319 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 151910362 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151914477 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151922715 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 151925263 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151927680 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151928996 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 151930767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151938058 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 151940558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151941787 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151945867 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151947350 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151948072 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151951660 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151960842 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151961269 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151962094 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 X 151962290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151965333 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151965409 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 151966889 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151968808 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 151969374 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 151970200 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 151972469 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151973666 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151974622 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151974678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151975035 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151975923 A C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 X 151978017 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151985739 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 151985963 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151987133 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 151988481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151989493 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 151990524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151991815 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 151992577 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151995015 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 151995354 C T N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 X 151995393 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 151996232 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 151996674 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 151999971 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152000892 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152001051 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152001188 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 152002501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152005905 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 152006173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152006837 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 152010609 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152013905 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152013934 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152014351 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 152019803 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 152020270 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 152020966 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152022621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152023168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152028737 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 152029173 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 152029189 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 152029318 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 X 152029661 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 152029721 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152030214 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152030594 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152030723 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152030729 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152030832 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152030936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152031045 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152031142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152031460 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152031527 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152031532 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152031754 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152031781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152032076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152032476 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152032635 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152032722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152033396 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152033723 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 X 152033771 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152034458 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152035612 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 152036382 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 152036667 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 X 152037015 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 152037617 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152038352 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 152038640 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 152038670 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 X 152038820 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152040337 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152040345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152042956 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 152044843 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 152044932 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152052014 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 152052236 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 152052261 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152053138 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 152078258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152081193 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152081248 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152083943 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 152085258 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152086165 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 X 152087058 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152087306 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152087466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152089184 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 152091077 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 152094051 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152094052 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152097055 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152098145 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 152102032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152105135 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 152105167 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 152109545 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152115536 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152115620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152125658 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 152128300 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152129491 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152130043 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152130651 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 152131293 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152131298 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152132077 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152132909 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152144561 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 152147126 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152149161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152149736 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152150850 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152153797 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152158693 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 152159480 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 152171144 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 152175816 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152175912 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 152177521 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152178771 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 152181698 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 152199015 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 152202911 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 152211438 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 152221669 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 152225487 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 152235466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152251255 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152262669 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 152264297 C T Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 152275930 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152276946 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 152277239 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 152281288 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152291806 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152298208 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152307219 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152316899 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 152335584 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 152343358 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152362644 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 152372176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152375684 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 152382103 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 152382710 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 152399355 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 152403655 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 152403876 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152403935 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152417497 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152424582 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 152436001 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152447813 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152452828 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 152455733 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152471230 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152477735 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 X 152491642 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 152496837 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152518955 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 152523890 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 152528890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152533601 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 152541337 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 152544725 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 152551052 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152556367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152558597 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 152579059 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 152612263 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 152631920 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152637972 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 152663072 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 152666713 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 152673723 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 152684100 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152685836 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152686918 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152690385 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 152703288 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 152703338 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 152704380 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152704381 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152707131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152708449 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152709199 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 152709380 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 152712518 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 152714405 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 152714593 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 152715057 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 152716405 G A N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 152717483 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 152718159 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 152718512 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152719122 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152723088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152724024 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 152729203 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152730209 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 152734468 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152736070 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 152743375 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 152747769 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152747939 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 X 152748898 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 152749139 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 152751547 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 X 152758867 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 X 152758881 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152759209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152760147 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 152761396 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152763616 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 152763757 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 152764361 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152764471 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152764952 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152766015 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 152770635 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152777623 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 152786895 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 152793476 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152796089 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152799599 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 152801216 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152801774 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152822151 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 152826241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152831607 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 152831609 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 152843426 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 152853423 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152865818 G C Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 X 152868098 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152871854 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 152885787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152891133 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152896582 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152896707 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 152899960 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152903434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152906520 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 152908075 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152910708 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 152924473 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152937136 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152942563 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 152947691 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 152948608 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 152952557 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 152955639 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 152959455 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 152961288 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 152964756 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 152965206 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 152965689 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152965717 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 152966363 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 152966395 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152968981 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 152970038 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 152970361 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 152970846 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 152973165 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 152973292 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 152974508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152975196 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 152975431 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 152976426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152976940 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 152979093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152979380 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152979821 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 152981250 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152982891 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 152984863 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 152985072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152985133 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 152985175 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152987215 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 152987310 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 152987320 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152988019 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 152988324 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152988502 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152992056 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 152992373 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152992665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 152993058 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 152995529 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 152998176 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 152998228 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 152999338 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153001223 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153001552 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153003575 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153003702 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153003769 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153004494 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153007116 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153008870 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 153011349 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153011510 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153012260 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 153026720 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 153028934 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153029673 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153029875 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153034448 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153037165 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153039011 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153039031 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153039426 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153039737 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153040040 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153044856 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 153045121 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 153045438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153047631 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153049680 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153050564 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153051342 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153052268 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153053881 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153060545 G A Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 153062255 T C N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 153070644 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153071299 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153071529 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153072217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153072285 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153072486 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 X 153075630 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153077195 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153077477 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153078069 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153078719 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153079885 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153081362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153082530 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153083529 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153084318 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153085274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153087014 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153087116 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153089442 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 153089655 C G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 153097446 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153097536 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153097978 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153099982 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153102043 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 153102795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153106546 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 153109816 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 153109817 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153110258 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153112398 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 153114540 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153115184 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 153115208 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153115458 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153116088 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 X 153116842 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153118166 T G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 153118865 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153119077 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153120514 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153121078 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153121249 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 X 153123030 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 153124501 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153125076 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153126691 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153128719 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153131135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153132372 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153133030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153133184 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153135969 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153138852 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 153139665 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153139984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153141037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153141800 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153142955 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153144829 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153145611 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 153146365 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153146594 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153149507 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153149529 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153150168 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153150272 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153151187 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153151512 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153151687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153151783 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153153598 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153154462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153155028 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 153156402 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153157363 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153157859 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153157942 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153159336 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153159795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153160900 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 153161235 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153169615 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153172302 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 153173599 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153175298 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 153175416 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 153175912 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153176563 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153177793 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153177975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153177993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153179535 A C Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 153181950 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153182983 C G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153183255 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 153183909 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153184401 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153185102 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153185197 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153186579 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153188289 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153189692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153190339 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153192502 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 153192940 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153192947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153192958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153193517 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 153197684 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153197816 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153200125 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153206705 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153207068 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153207885 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153208723 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153209038 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 153209047 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153209504 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153209838 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153210482 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153211037 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153211337 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153212916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153214372 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153216190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153217452 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153217945 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 153217972 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153217978 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153219737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153220867 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153220902 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153223278 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 153224307 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153227844 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153235058 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153239151 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153240888 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153247022 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153247026 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153251929 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153252439 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153254551 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 153258176 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153258791 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 153258996 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153259907 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 153260110 G C Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 153260238 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153260470 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153260484 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153260599 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153260921 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153263271 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153264458 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 153266192 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153266254 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153267654 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153267795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153269488 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 153270923 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153271260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153273748 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153273826 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153275528 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153275889 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153275897 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153276345 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 153276749 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153278071 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153278431 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153280500 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 153281072 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 153281713 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153284092 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 153284109 A T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 X 153284867 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 153286681 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153288501 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153291677 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153292905 C T N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 X 153294432 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153296488 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153296865 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153298540 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 153299725 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153300094 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153300115 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153300645 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153300675 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 153301191 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153301379 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153309501 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 153309619 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153311809 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 153312505 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153312541 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 153314270 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153315466 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153316006 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153317141 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 153317997 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153322522 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153323305 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153324198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153324910 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153325200 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153325265 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153325351 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153325436 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153325498 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153325614 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153326088 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153326183 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153326307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153326480 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153327029 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153327218 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 153327944 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153328181 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153328389 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153328582 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153328674 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153329080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153329390 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153330025 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 153330091 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 153330363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153331022 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153331096 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153331114 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153333026 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153333453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153333683 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153335109 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153336243 A G N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 X 153337952 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153339387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153340537 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153341713 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153344081 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153346064 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153353373 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153354820 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 153357578 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153358190 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 153360888 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153392637 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153393813 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153397284 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153402455 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 153403025 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153406813 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153408549 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153413813 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 153416430 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153420224 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153424587 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153427575 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153429574 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153430529 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153430586 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153440565 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 153440618 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153440979 G A N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 X 153442408 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153442816 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153444423 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153446682 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153446846 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153448336 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153449387 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153450858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153452600 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153454170 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153461520 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 153471730 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153474609 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 153478472 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153489042 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 153492285 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153495376 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153497283 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153502928 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153503179 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153505002 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153506702 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 153507819 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153509007 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153509726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153510504 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153514476 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153517315 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153518834 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153522179 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153522448 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153522912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153523053 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153524386 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 153527093 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153527303 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 153528915 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 153530436 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153530651 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153532837 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 153534141 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153540988 T A N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 153542057 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 153542997 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153543803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153545125 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153547541 T C Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 153549460 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153553008 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153553558 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153555448 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153556443 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153557408 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153557748 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153557749 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153560863 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 153560910 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 153562601 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153563000 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153563514 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153570389 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153570928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153571110 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153571244 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153571458 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153571592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153571594 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 153571762 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153572222 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153572223 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153572488 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153572510 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153572769 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153572881 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153573155 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153573218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153573388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153574074 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153574079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153574197 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153574671 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153574806 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153574878 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153575662 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153575853 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 153575918 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 153577195 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153577539 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153577541 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153577557 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153578098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153581667 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 153582383 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153582665 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153582789 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153582874 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153584332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153585399 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153593310 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153595755 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153600253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153600729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153601343 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153615849 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153617314 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153617988 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153619140 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 153621914 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153622905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153622959 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153624654 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153625452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153625499 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153625545 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153625646 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 153627605 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 153628510 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153628562 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 153628962 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153629350 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 153632568 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 X 153633485 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 153633517 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 X 153633543 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153634987 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153635419 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153635594 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 153635714 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153636101 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153636969 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 153638252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153638417 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153638418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153638509 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153638620 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153639007 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153639646 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153640276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153640507 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153641036 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153641098 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153641245 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 153641551 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 153642577 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153644366 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153645921 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 153649725 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153650752 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153652057 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153652571 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153653732 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153653762 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153654052 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153654169 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 153654326 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153654539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153654693 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153654785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153656174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153659029 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153659158 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 153659648 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 153660262 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153660306 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 153660541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153660606 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153660671 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153660862 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153661046 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 153661406 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 153661440 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 X 153661507 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153661651 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153661682 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 X 153661887 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153662268 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153662315 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153663654 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153664807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153664818 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153665067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153665158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153665169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153665826 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 153665918 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153666112 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 153666131 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153666265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153666404 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 X 153666444 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153667394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153669438 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153669489 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153669648 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153670177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153670582 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 153670952 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 X 153671164 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 153672117 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153672965 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153673881 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153674057 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153674178 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 153674331 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 153674779 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153674787 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153677543 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153679287 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153679345 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153679899 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153680383 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153680461 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153681736 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153682916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153686490 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 153687223 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153688867 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153690038 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 153694271 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153695716 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 X 153699077 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 153701497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153703346 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153704603 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153706912 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153708013 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153709727 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153712515 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153715437 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153718972 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153719300 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 153719395 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153719458 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 X 153719848 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153720035 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 153720045 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 153720546 C T N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 X 153720574 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153720635 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 X 153720698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153720869 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 X 153727823 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 153727861 C A Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 X 153728281 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 153728367 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153728485 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 153728830 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 X 153729099 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 X 153729194 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 X 153729421 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153729656 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 X 153730095 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 153730284 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 153730292 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153730992 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153731235 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153732779 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 X 153732786 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 X 153733517 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153733740 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 X 153734198 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153734518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153734675 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153735083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153735723 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153737808 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 X 153738692 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153739671 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 153739743 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 153740174 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153740390 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153741551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153742083 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153744530 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153745424 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153746237 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153748006 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153748743 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153750836 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153751030 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 153752055 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 153752187 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153752520 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153752687 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153752688 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153752751 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153752752 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153752973 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153753166 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153753240 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153753411 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153753706 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153753995 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153754517 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153754777 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153755069 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153755813 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153756795 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153756807 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153756943 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153761001 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153761190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153762387 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153766214 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 X 153766256 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153766492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153766842 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153767121 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153767680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153767975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153768212 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153769086 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153770087 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153770088 A T N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 X 153770766 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153771020 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 X 153771167 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 X 153771984 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 X 153772470 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153772621 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153773013 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 X 153773306 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.277777777777778 0.111111111111111 0.611111111111111 12 24 5 2 11 X 153773334 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153773386 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153773438 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153773499 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 153773656 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 153773683 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153773802 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153773940 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153773995 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 X 153774032 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153774055 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153774237 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153774244 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153774348 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153774351 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153774440 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153774540 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153774560 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153774576 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153774595 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153774605 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153774607 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153774901 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153774956 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153775554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153775783 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153775835 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 X 153776244 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153778402 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153779691 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153783008 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153783205 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153784101 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153785405 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 X 153786037 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 X 153786622 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153788160 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153788630 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153789274 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153789336 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153789637 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153789810 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153790487 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153790748 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153790859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153791337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153791364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153791511 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153791716 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153792065 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 153792403 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 X 153792798 T C N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 X 153792949 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 X 153793014 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153793068 C A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 X 153793198 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 X 153793233 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 X 153793797 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 X 153793926 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153800771 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153810193 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 X 153813019 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153813546 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 153814139 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153815141 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153815274 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153815358 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153815443 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153815894 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153816260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153816725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153816824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153817599 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153817722 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153817979 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153819095 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153824013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153824367 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153824502 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153824690 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153826955 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153827318 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 153828575 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153829030 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153829199 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153829537 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 153829878 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153831889 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153834098 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 X 153834396 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153834890 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153835560 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 153838277 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153838357 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153838710 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153839598 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153840347 A T N N 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 X 153840749 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153843669 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153844879 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153850718 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153852375 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 153853169 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153856069 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153856103 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153856318 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153859339 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153859558 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153859628 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 X 153860699 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153861999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153865217 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153867683 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 X 153869234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153870851 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153874087 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153876385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153877255 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153877598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153879270 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153879360 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153880032 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 153880341 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153880497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153880664 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153886066 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153886109 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153886140 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153886864 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153887147 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153887682 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 153887784 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 153888681 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153888729 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153888757 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153888951 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153889015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153889475 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153890547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153890989 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 153893243 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153899497 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 X 153902072 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153912776 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153914927 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153915575 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153917763 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153921320 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153923595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153924067 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153931110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153931836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153938172 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153939805 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 153939936 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153943010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153943846 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153945160 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153946412 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153946727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153946819 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153950150 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153950230 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153950550 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 153951476 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 153951887 A T N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.214285714285714 0.142857142857143 0.642857142857143 8 20 3 2 9 X 153952068 T A Y N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 X 153955254 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153955464 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153957925 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153957964 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153958348 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 153958579 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 153958747 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 153960042 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153960766 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153961351 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 153963678 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 153965663 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153965827 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153970225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153971488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153973191 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 153973521 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 153978880 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 153981765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153983787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153984198 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153993055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 153994479 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 153997680 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 153997745 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154000861 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154003792 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154008241 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 154008331 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154009111 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 154013405 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 154015889 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154016631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154017345 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 154021799 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154022280 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 154026936 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 154028390 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154034634 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154034952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154038387 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154038388 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154038910 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 154039422 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154039446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154040697 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154040731 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154040873 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154041305 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154041815 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154042194 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154043738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154046766 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154047301 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154048179 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154049073 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 154050057 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154050653 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154050658 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154052055 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154055433 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154055915 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154055986 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154056777 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154056957 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154056958 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154065876 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154068045 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154068112 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154070691 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154072744 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154074462 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154076250 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154076367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154076912 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154077445 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154080575 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154082783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154083268 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154083779 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154083978 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154084766 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154085732 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154085768 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154086085 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154087850 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154093387 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154100591 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154101025 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 154101180 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 154101373 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154104077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154104430 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154106921 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154111483 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154111504 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154111579 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154114072 G T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 154115982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154116189 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154116321 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 154118996 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154119587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154119707 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154125334 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154126378 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154127684 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154134028 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154136094 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154136470 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154136523 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154139713 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154139835 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154142394 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154144777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154148549 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 154152107 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154152699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154153227 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154154274 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 154154603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154154877 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 X 154155490 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154156263 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 X 154159124 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 154166869 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154167385 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 154168383 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154171467 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154174364 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154175131 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154175320 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 154179101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154179193 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154179232 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154179699 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 X 154179875 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 X 154179890 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154181942 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 154181987 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154182195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154182376 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154182723 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 154182761 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 154182939 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 154182997 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 154183055 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 154183120 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 154183145 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 X 154183245 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154183284 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154183409 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154183422 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154183425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154183432 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154183441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154183451 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154183460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154183516 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154183740 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154183981 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154184061 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154184211 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 154184443 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 154184548 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154184966 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 X 154185526 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154185594 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154185665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154185672 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154186871 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154188626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154190325 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154190333 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154193421 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154194079 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154194385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154194397 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154195390 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154195690 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154196136 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154196955 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154197170 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154197252 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154197896 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154197930 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154198631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154199096 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154199280 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154199404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154199594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154199647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154199764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154199831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154200344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154200784 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154208506 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154208748 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154209796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154211450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154211996 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154212622 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154213237 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154217165 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154217191 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154218056 G C N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 154218238 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154218339 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154218355 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154218585 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154218678 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154218689 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154218896 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154219161 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154219311 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154219331 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154219413 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154224158 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154224187 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154224428 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154224745 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154224778 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154225078 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154225080 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154225254 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154226287 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154226309 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154226322 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154226551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154226636 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154226853 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154226950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154226951 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154227076 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154227276 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154227947 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154227954 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154228171 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 154228819 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154228911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154228969 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154229160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154229790 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154229818 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154230196 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154230462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154230557 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154230842 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154231032 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154231033 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154232136 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 154238527 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154239770 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154248655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154248940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154252928 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154253296 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154255743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154257113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154260321 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154261342 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154263145 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154263238 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154263262 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154265752 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154271880 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154271881 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154273611 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154273727 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154275417 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154277554 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 154279109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154281637 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 154282919 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154285220 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154286239 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154286529 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154287172 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154288142 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154288331 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154289442 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154289695 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154293170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154294382 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154294391 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154294433 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154294457 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154294781 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154295691 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154296059 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154296467 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154296808 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154297067 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 154297072 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 154297140 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 154297172 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 154297595 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154297883 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154298116 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154298124 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154298780 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 154298801 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 154298961 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 154299133 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 154299212 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 154300606 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 154301288 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 154301915 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 154301993 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 154301995 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 154303266 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154304623 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 154307397 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154308222 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 154308279 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154308628 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 154308683 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154309109 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 154309317 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 154309418 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154309834 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154310629 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154310832 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154311212 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 154312141 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154312457 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 154316422 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154321612 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 154321619 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 154325495 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154327544 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154327545 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154328474 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154329250 T C N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 X 154329873 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154332723 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154336838 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 154339255 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 154339359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154352362 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 154352749 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154354303 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154354344 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154355405 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154358072 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154358460 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154360584 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154360946 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154361664 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 154364115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154369182 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154369563 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154373548 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 154373952 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154376425 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 154383304 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154390177 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154401371 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 154405486 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154405552 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154406133 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154406302 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154407030 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154408378 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154411743 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154414805 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 154414929 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154416974 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154422525 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 154424233 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 154426178 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154426420 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154427757 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 154430934 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154432757 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154435637 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154438221 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154440496 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154443378 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 154445100 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154446041 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 154446369 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154450017 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 154450229 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154450732 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 154450739 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 154451917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154452308 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154452525 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154452917 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 154454742 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154455324 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154455483 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154456058 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154456146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154459516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154460085 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154460123 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154460359 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154462419 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154462462 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 154462525 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154467475 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154469099 G C Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 X 154470070 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 154470349 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 154472003 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 154475784 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154478249 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154478723 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154483856 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154483956 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 X 154487419 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154488668 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154492964 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154493968 G T Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 X 154495602 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154502583 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154503387 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154508928 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154513259 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154513604 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154513907 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154517336 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154519548 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 154520522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154520908 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154521362 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 154522090 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154522258 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154527350 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154527571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154528362 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154528394 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154528430 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154530970 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154533601 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154533671 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154535904 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154537126 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154540163 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154540742 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154540785 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154541760 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154541884 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154542182 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154543735 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154545099 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154546875 T C Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 X 154547226 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154547500 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154549689 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154557538 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154561305 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154561407 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154561573 G C Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 154561969 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 154563029 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 154563971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154564369 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154566393 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154567437 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154567771 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154568427 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154568624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154569066 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 154569489 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 154572507 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154574492 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154575516 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 154575664 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154575983 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154576085 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154576598 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 154588251 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154588671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154588851 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154589050 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154589643 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154590210 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 154593982 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154596147 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154604027 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154604861 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154606055 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154606328 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154608613 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154608762 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154609809 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154612444 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154612450 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154612454 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154613240 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154613788 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154615040 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154616227 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154616671 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154617576 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154617843 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154617950 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 X 154618046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154618200 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154619555 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 X 154619767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154620604 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154620943 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 154621576 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 X 154621852 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 154622290 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 154622515 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 154622734 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154622853 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 154627573 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154627692 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 X 154628282 T A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 154629232 T G N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 154630600 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154631789 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154632945 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154632990 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 154637005 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154637013 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154637296 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154639677 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 154641854 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 154643773 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154645919 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154646122 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154646984 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154647145 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154648239 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154648430 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154648931 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154651692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154653565 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154656783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154657329 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 154657952 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 X 154657972 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154658305 A G Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 X 154658801 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 154658880 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 154658907 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154659332 G T Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 154659448 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 154661301 T A Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 154661558 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154661726 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154661911 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 X 154662944 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 154663047 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 X 154663088 T A Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 X 154663234 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154663719 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 X 154663721 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 X 154663748 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154663801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154663889 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 X 154664000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154664009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154664055 T C Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 X 154664090 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 X 154664272 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 X 154664305 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 X 154665742 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 154665874 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 154666469 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 X 154666670 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 X 154667360 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 X 154667491 T C Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 X 154669555 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154669716 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154670016 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 X 154670242 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 X 154670822 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154671152 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154672863 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 154673396 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 154673994 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154676127 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154681651 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154681760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154683892 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 154686733 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154686819 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154686889 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154688474 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 154692760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154694131 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 154694237 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 154694250 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 154696485 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154696827 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154697459 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154697575 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154698208 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154698214 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154698252 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154700206 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154700254 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154701513 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154702316 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154702733 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 X 154702757 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154703383 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 X 154703729 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154704332 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 154704336 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 X 154704667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154704930 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154704963 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 X 154705098 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154705623 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154705796 G T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 X 154706409 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 X 154706422 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 X 154706507 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 154706816 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 X 154707930 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 X 154708103 C T N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 X 154708238 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 X 154708882 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154709977 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 154717965 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154721514 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154722835 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154727069 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154729207 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154729951 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154730225 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154732720 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154733074 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154733649 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154733689 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154734069 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154735839 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 154737437 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154737628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154738050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154738449 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154738976 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154739032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154739938 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 154740141 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 154741829 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 154742176 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154744073 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 154744393 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 154745147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154748425 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154756275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154756530 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154756613 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154757338 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154757691 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154757940 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154758222 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154758345 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154758653 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154758886 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154760761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154766070 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154766169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154766995 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154767566 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154767902 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154768171 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154768346 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154768757 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 154773434 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154773463 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154773587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154773593 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 154776665 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154777227 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 154778079 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 154779639 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 154782994 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 154782996 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 154783017 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154783020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154783903 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.277777777777778 0.0555555555555556 0.666666666666667 11 25 5 1 12 X 154784017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154784228 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 154785148 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154785989 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154787581 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154790820 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154796485 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154796528 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154803025 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154803633 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 154810549 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154810550 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154814696 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154817202 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 154820989 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154822708 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.25 0.05 0.7 11 29 5 1 14 X 154825236 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154825315 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154826192 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154826206 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 154826302 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154828384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154828906 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154828957 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154829095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154829096 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154829109 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154833060 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154833399 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154833400 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154834285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154835558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154835780 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154836073 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154837050 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154837447 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154838574 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154838947 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154839100 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154841382 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154841546 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 154841575 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 154841997 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154842235 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154842304 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154842797 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154845453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154846608 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154848616 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154848777 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154849799 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154849850 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154851788 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 154852541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154853784 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 154855201 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154860496 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 154862705 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154863126 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154863369 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154863765 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 154865094 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154866773 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154868041 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 154868685 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154869165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154869450 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154870362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154870651 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154870706 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154871401 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154871442 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154872173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154872590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154876406 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154879933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154880017 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154881170 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154881209 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.25 0.05 0.7 11 29 5 1 14 X 154881217 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.25 0.05 0.7 11 29 5 1 14 X 154885352 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154886976 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 154887453 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 154888939 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154889252 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154889729 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154890101 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154891524 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154893113 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154894610 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154894707 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 154894807 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154894880 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 154895201 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154895441 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 154899956 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154911196 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154916233 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154918677 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 154921275 A T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 154922845 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154924112 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154924622 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 154924878 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154925787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154925795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154926066 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154928157 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154931635 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154935001 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 154936424 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 154936845 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 X 154938298 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154938671 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154940256 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154941554 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154943611 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 154944674 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154945304 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 154947442 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154948621 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 154950090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154950637 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154951293 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154951712 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154952711 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154953423 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154954037 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154954204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154954253 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154954545 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154954752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154954943 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 154957879 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154960194 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154960309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154961193 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154961858 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 154961878 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 154963472 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 X 154963982 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154964991 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154965069 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154965332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154965342 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154966473 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 154967384 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154969028 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154969206 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 154970218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154970727 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 154970850 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 154971482 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 154972733 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154979641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154980138 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154983558 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 154983901 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154985210 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154986819 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 154992976 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 154994378 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 154995633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 154996504 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 154998066 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 154999552 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155000703 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155001226 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155012519 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155014449 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 155015004 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155019275 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155020623 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 155020775 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 155021777 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 155024126 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155025010 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155025132 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 155025282 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 155027038 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155028178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155029620 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 155031792 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155033331 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155033993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155034724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155036279 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 155036280 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155036778 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155036779 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155037465 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155037481 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155037731 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155046723 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 155047068 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155049409 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155049853 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155050225 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155052072 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 155053739 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155053811 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155054644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155055681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155056058 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155060074 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 155061554 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155063323 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155063495 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155064239 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155064662 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 155065332 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155065490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155065995 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155066208 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155066708 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155068558 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.222222222222222 0.0555555555555556 0.722222222222222 9 27 4 1 13 X 155071757 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155072211 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155073720 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 155076191 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 155076611 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155078246 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155080622 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155084911 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155085155 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155085251 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155088317 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 155089437 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155089509 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155091835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155093323 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155095592 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155095703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155097541 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155098106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155098206 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155098352 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155098900 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 155099235 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155099618 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155100055 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155101162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155102135 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155102963 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155104351 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155106276 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155106277 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155108288 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155108818 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155109766 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 155110202 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155122637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155130968 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155136476 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155137181 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 155137438 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155138962 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155140304 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155142298 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155142548 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155144236 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 X 155144981 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155145160 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155145230 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155145238 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155145303 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155145491 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155145568 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155145715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155145913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155145922 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155146046 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155146183 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155146208 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155146352 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155146430 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155146434 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155146562 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155146577 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155146723 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 155147387 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155147553 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155147627 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 155151076 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 155154539 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 X 155158058 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155159030 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155161722 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 155162454 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155162619 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155166598 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 155167722 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155168153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155168605 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155169044 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155169343 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155170027 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 155170858 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 155171095 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155175789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155175949 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155176134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155177533 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155178212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155183496 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155184245 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155185616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155187037 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155187887 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155187977 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155188466 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155190724 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155190996 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 155191191 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155191950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155194148 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 155196269 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155196992 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155198663 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155205050 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155205356 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155206269 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155208655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155216740 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155219391 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155220993 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 155222470 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 155225832 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155226449 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155227618 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155229448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155230864 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155231056 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155232845 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155234087 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155235195 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155238919 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155239584 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 155240909 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155241766 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155241775 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155241818 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155243007 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155247037 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155247806 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155249583 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155250338 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155251632 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155252626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155252835 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155254818 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155256804 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155257516 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155257740 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155258238 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155261129 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 X 155261971 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 X 155262709 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 X 155265353 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155265971 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.210526315789474 0 0.789473684210526 8 30 4 0 15 X 155266240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155267139 A G N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.166666666666667 0.0833333333333333 0.75 5 19 2 1 9 X 155267774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155267795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155267929 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155269131 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 X 155269198 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155269383 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155270333 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155271073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155271733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155273387 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155276018 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155276290 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155277739 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155278266 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155285350 T G N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 X 155285521 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155286847 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 155292365 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 155292367 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 155292368 C T Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 X 155293088 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155294135 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 X 155294308 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 X 155294323 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 X 155294338 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155294461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155295708 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.222222222222222 27 9 13 1 4 X 155296479 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.176470588235294 27 7 13 1 3 X 155296666 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155296889 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.222222222222222 27 9 13 1 4 X 155297028 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155297102 C T N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.266666666666667 21 9 10 1 4 X 155297288 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155302241 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155302430 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 X 155302453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155303866 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155304701 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155305353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155317520 G C N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 155317852 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155318620 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 X 155318642 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155319137 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155319171 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155319189 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.210526315789474 0.0526315789473684 0.736842105263158 9 29 4 1 14 X 155320511 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 X 155320671 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 X 155321439 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.222222222222222 0.0555555555555556 0.722222222222222 9 27 4 1 13 X 155323996 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155324097 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155324222 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155325032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155325086 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155325240 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155325404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155325432 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155325567 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155325597 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155325715 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155325763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155326232 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 155326465 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 155326822 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155326919 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155327248 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 155328328 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155328418 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155328931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155329014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155329604 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 155329628 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 155329728 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 155329731 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 155329854 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 155329944 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 155330538 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 155330722 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 155330724 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 155330775 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155331107 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155331317 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 155331352 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155331378 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155331576 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155331670 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155332041 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155332114 G A Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 155332237 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155332266 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 155332561 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155333173 G T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 155333576 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155333783 C T Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 155333792 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155333871 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155333934 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155333962 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155334233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155334963 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155336001 T A Y N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 155346791 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 155346866 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155347210 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155347459 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155347515 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155347682 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155347731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155348045 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155348068 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155348100 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155348308 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 155348405 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155348433 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155348489 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155348495 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155348982 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155349083 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155349317 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155349430 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155349575 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155354095 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155354281 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155354964 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 155355758 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155356649 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155358879 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 155361789 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155361795 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 155362117 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155362352 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155362731 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155366655 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155371539 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155373939 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155374158 G A Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 155375078 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155376310 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155376595 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155377510 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155378506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155379600 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155380777 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155380818 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155384076 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155384428 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155384887 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155386374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155386555 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155387313 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155393614 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155394145 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155395658 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 X 155398227 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 155399955 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 155402809 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155405968 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 155409104 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155409424 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155409589 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155413010 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155414239 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155415705 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 155416645 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155416676 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155419687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155419792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155420772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155420794 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155420838 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155422008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155422663 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155425016 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155427936 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155431777 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155439865 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155439966 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155440087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155440120 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155440384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155442844 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155445050 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155445689 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 155446005 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 155446537 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155447480 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 155448232 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155456173 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155456364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155459528 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155463260 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155467967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155469387 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155470751 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 155473249 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155473386 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155476415 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155476596 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155476666 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155476784 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155477489 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155478053 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155478794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155479017 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155479291 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155480082 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155480292 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155481337 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155483458 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 155483734 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 X 155483781 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155485528 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155485610 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155485613 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155486633 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155486758 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155486974 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155488251 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155488790 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155492665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155493016 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155493034 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 155493035 C A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 155493036 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 155493437 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155493504 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155493709 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155493733 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155494834 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155495571 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155495963 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155496405 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155496420 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155496752 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155496838 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155496975 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155497525 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155498242 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155499066 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155499729 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155501243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155503316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155504718 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155507552 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155509349 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155510071 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 155510210 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155512159 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155512603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155519500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155519721 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155520532 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155520599 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155520824 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155527247 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155528480 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155531330 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 X 155532392 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155532482 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155532641 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 155534527 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155534882 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155541757 C A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 155542403 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155543347 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155544328 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155545017 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155546631 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155546826 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155547632 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155548179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155548239 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155548394 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155548573 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155549004 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155549096 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 X 155549237 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155549548 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 155552114 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 155552268 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155554916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155556542 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 155556800 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155557066 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155557113 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155557276 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155562955 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155563185 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155564227 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155564911 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 155565129 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 155565781 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155565783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155565919 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155566620 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155577924 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155580712 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155581044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155582199 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155582208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155584012 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155584956 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155585434 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155585892 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155586486 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155587251 G A Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 155594230 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155596134 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 155596564 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155598642 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 X 155600660 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155606204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155606286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155606818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155609229 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155613665 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155613689 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 X 155615763 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155618840 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155622090 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155622233 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155623295 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155623814 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155624016 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155625164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155626206 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155627292 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155627467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155627818 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155628523 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155628759 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155628911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155629455 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155630887 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155632288 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 155634160 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155634814 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155635527 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 X 155636321 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155636745 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155637070 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155638468 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 155639081 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155643304 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155644393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155646870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155647095 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155647588 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155648684 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155649033 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155650389 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155651461 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155654486 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155654780 G T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 X 155655406 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155658131 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 155660055 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155660086 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155661602 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155661723 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155663306 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155663307 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 155663521 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155665532 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155666087 A G Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 X 155666385 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155667130 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 X 155667217 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 155667347 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 155667556 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 155667670 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 X 155667912 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 155667994 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 X 155668045 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 X 155668229 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 155679542 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155681331 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155682751 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 155689965 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155690840 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155692569 C T Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 X 155693126 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155693241 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155695403 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155698358 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155701098 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155701450 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155701885 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155710706 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155712098 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155712595 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 155713222 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 155716975 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155718533 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155720324 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155724565 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 155724756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155724886 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155725126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155726987 C G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 155730709 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155735851 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155735862 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155735869 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155736021 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155736241 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155739742 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 155741752 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 155742312 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 155742954 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155743032 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 155744619 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155748161 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155754697 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 X 155758050 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155758525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155759114 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155759326 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155761603 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155762121 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155762466 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 155765085 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155767526 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 155768254 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155768451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155769151 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 155775028 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 155781417 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155782439 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155784611 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155785166 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155785735 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155788512 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155789419 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 155796243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155799842 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155801180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155802226 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155803427 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 155806350 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155806384 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155809085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155812287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155815305 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155816598 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155816909 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155816925 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 X 155817750 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155820938 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 X 155821012 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155821403 G A N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 X 155823276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155824047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155824553 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155824973 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155825040 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155825806 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155828235 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155828254 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155830272 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155832811 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155833490 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155833660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155835591 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 155835604 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 155836013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155843019 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155845047 G T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 X 155846268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155847951 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 155848206 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 X 155848291 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 X 155849978 G A N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0 0.5 0.5 4 12 0 4 4 X 155852998 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155854277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155856258 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155856903 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 155857801 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 X 155860272 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155862019 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155863463 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155865244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155865337 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155865851 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155867053 T A Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 155868542 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155870547 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 X 155870949 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 155871790 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155874509 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 155875844 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155877178 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155877244 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 X 155877262 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 155881429 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155883107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155883211 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155883358 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 X 155883706 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 X 155883751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155884391 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155884672 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 155884799 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 155885220 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 X 155885951 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 X 155886046 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 X 155886057 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 155886441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155886974 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155887090 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155887575 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155887597 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155888251 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155888290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155888387 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 155888415 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 X 155888424 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 X 155888976 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155889331 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155892510 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155894135 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155894779 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155896124 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 X 155896856 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155897457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155898256 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155899790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155900436 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155901579 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 155902286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155902294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155902422 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155902426 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155904445 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155905755 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155908916 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155908988 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155910611 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 X 155912355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155912415 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155912724 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155914028 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 155914488 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155916710 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155917015 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155918968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155919055 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155919649 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155920315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155920746 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155921307 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155923786 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155924994 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155926030 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 155926639 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155926809 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155927595 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 155928442 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155929945 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155931889 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 X 155933037 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155933756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155934194 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 X 155934248 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 155934298 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155936617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155936642 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155937446 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155939221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155939239 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155939550 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155939907 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 155941174 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155941590 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155942211 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155943251 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155945254 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 155945330 A T Y N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 X 155945347 C T Y Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 X 155945397 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155945918 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 X 155946111 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 X 155946567 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155948384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155950010 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155956534 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155957456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155961223 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155962986 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155963623 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155964981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155965876 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 X 155966065 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 155966963 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 155967083 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 155967708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155969779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155971642 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155972117 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 155972409 T A N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 X 155972561 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155974335 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155975341 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155980938 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155982606 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155983503 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155983629 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 155983729 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155984322 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155984454 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 155984578 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 155984620 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155984667 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 155984767 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 155984917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155984944 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155985529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155985614 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155985635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155985703 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 155986094 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155986279 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155987789 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155988163 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 155988164 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 155988219 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 X 155988276 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 155988345 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155990601 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155991685 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 155992578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155993625 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 X 155994817 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155995641 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 155996028 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155997038 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 155997732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 155998408 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156000903 T C N Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 X 156001066 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 156003275 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156004142 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156005068 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156012109 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156015192 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156020381 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156020809 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 X 156022532 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156023004 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156026557 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156027445 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 156027725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156032873 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156032954 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156033196 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 156033684 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156033827 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156034868 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156035140 A C N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 X 156035323 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156035334 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 X 156035382 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 X 156035871 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 156036004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156036312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156036370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156036535 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156036568 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156036803 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 156037304 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156037544 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 X 156037676 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 X 156038718 G C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 X 156039015 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156039053 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156039140 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156039166 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 X 156039185 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 X 156039342 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156039430 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 X 156039811 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 X 156040155 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 X 156040225 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156040242 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156040271 C A Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 X 156040786 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 X 156040903 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156041994 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156042269 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 X 156042560 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156042659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156043988 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156044747 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156045739 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156046452 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156046671 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156047028 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156047221 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156047222 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 X 156047337 T G N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 X 156047717 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 X 156047850 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156047949 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 X 156048006 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156048039 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156048109 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 X 156048130 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156048298 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 X 156051747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156053580 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156056872 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 156058851 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156060784 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156062236 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156066986 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156066987 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156068051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156069235 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 X 156070055 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156071307 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156073554 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156075014 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156075283 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156075747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156076811 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156077594 T C Y Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 X 156077599 G A Y Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0 0.6 0.4 6 14 0 6 4 X 156078927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156080672 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156081234 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156081374 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156082947 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156084487 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156084749 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156084912 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156085766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156086433 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156086455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156087286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156087455 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156089618 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156089770 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156090650 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 156090712 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156091060 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156092909 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156093427 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156094388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156096003 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156096145 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156096146 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156098080 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 X 156098133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156098372 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156098509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156100318 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156110322 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 X 156111220 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156111989 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156115373 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156116290 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156116854 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156117372 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 X 156117678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156118003 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156118022 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156118037 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156119939 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156120854 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156122313 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156123094 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156123419 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156123420 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156125441 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156125963 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 156127999 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156128190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156128451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156129286 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156130862 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156131201 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156132284 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156132724 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156132870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156134562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156135906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156136659 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156137131 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156137655 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156144615 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156148998 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156153309 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156153430 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156154448 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156154634 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156156255 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 156157379 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156157647 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156158884 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156161930 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 156169514 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156171044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156175613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156176402 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156177179 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 156178412 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156179033 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156179160 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156179933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156183337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156185006 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156185009 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156185029 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156185827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156186240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156189042 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156189054 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156189838 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156190425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156191811 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156193705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156194049 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156194054 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156194404 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156196449 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156196593 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156196740 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156200300 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156200494 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156200838 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156203899 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156204403 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156204436 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156204495 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156204549 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156204906 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156205275 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156205358 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156205399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156206601 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156208833 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156212105 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156212273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156216044 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156216243 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156220166 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156221544 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156222456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156224151 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156229425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156229452 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156229798 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156229878 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156230342 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156230736 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156231027 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 156231172 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156231242 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156231672 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156232225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156232488 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156232705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156232883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156233195 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156233269 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156234003 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 156234343 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 156235605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156237206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156238581 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156241366 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156244693 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156245223 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156246932 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156247252 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 156250711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156251097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156252867 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156253001 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156253463 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156256825 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156257036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156257810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156259278 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156260927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156261218 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156262176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156262768 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156265576 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156270393 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156271872 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 156272078 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 156272322 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156272713 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156273155 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156273226 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156273315 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156273604 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156274267 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156274534 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156274603 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156274613 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156274647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156274688 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156274693 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156274973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156275218 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156275233 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156275280 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156275302 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156275349 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156280853 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 156281325 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 156281550 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156284814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156285364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156285477 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156286028 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156286775 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156286861 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156286863 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156286941 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156287001 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 156287004 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156287005 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156288489 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 156288885 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156289336 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156294708 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156294798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156295551 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156297301 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 156297328 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 156297703 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156297755 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156298003 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 156298402 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156299771 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156299802 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156299830 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156299926 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156299992 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156300223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156303584 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156306364 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 156306879 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 156308135 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156309374 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156311809 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156311854 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 X 156312685 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 X 156313649 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156317228 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156318417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156318709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156319672 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156323901 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156325298 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156328106 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156328903 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156329482 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156329762 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156329975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156330188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156332776 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 X 156336142 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 X 156336153 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 X 156336389 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 156336392 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 156336571 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 X 156336586 T A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 X 156336607 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 X 156336630 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 X 156337044 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156337216 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156337380 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156337427 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156337750 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156338482 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156340923 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156344387 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 X 156344490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156344993 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 156345431 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156346889 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156348804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156354307 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156355405 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156357236 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156357242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156357799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156358528 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156362205 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156362525 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 X 156363487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156363850 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156363894 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156364382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156364935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156365061 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156368276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156369955 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156371087 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156372906 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156373131 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 X 156373289 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156373872 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156375753 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 156376565 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156377191 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 X 156377195 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 X 156377327 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 X 156377369 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156377577 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156378033 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156379896 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156380785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156381476 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156382366 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 156385920 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156387805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156390492 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156392213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156392570 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156392776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156392784 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156393217 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156396245 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156396278 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156396919 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156397620 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 156398051 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156399007 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156399334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156399383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156400450 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 X 156402338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156403307 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156407504 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156407995 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 156408650 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156414867 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156417733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156418099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156418637 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156419414 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156419795 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156420262 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156421735 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156422184 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156423124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156424686 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156427950 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156428002 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156428323 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156428524 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156429213 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156429948 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156430111 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156430278 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156431129 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156431172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156433009 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156434123 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156435576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156435870 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156436327 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156436365 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156436366 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156436827 G A Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 156436964 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 156436981 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 156437497 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156437617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156437618 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156438567 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156439635 G A N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 156439724 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 156441256 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 156441479 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156441788 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 156442448 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 156442581 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 156443386 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156443391 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156443494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156444091 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 156446151 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 156448584 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156449369 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 156450870 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156451072 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156454441 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156454790 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156454834 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156454846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156454861 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156455939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156458819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156459491 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156460707 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156461913 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156462617 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156464128 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 156464511 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 156464959 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156465566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156465858 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156466087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156466713 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156466872 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156468982 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156469967 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156474052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156474673 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156475620 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156477816 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156478822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156479641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156482538 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 156484578 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156484977 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156484978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156485183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156486076 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 156486095 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 156486321 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156487223 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156487355 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156487806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156489703 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156490005 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 156491883 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156492470 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156492591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156492792 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 156494526 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156498706 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156499181 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156499620 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156499641 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156499677 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156500729 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156500763 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156501358 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156501377 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156501668 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156502719 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156503093 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156503156 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156503236 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 156503272 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 156504700 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156504718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156505645 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156505749 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156506433 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156506546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156507488 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156507491 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156507820 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156508001 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156510638 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156510740 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156511546 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156514215 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156514928 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156516654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156516704 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156517083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156522268 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156522271 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 156523966 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156526086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156526215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156529401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156530594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156532145 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156532300 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156533710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156535720 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156536545 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156539029 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156540769 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156545813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156547398 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156547919 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156551383 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156552626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156553376 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156554390 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156556090 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156560109 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156560996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156562383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156562668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156563069 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 156563193 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 156563898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156564373 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156564827 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156565391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156566118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156566531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156566758 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156566967 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156572217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156573619 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156576459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156577209 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156577866 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156578551 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 156582709 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156584551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156587680 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156588095 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156589767 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156589781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156590577 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156590606 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156591873 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 156592345 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156593048 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156593182 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156595366 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156597321 A G Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 156598290 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156598919 C G N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 156599538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156599578 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156599818 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156599878 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156599882 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156599932 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156600817 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156600947 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156601306 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156601380 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156601382 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156601393 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156601406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156602906 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156603569 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 156605249 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156605284 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156607007 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156607084 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156607624 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156609800 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156611998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156612982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156613751 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156614041 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156614173 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156614311 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 156614317 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 156614382 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156614460 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 156614471 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156614480 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156614742 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156614848 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156615219 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156616951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156618151 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156618657 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156620981 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156621272 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156621782 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156622098 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156622146 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156622873 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 156623318 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 156623319 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 156623770 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156624647 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 156625737 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156625739 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156627366 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156629991 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156630133 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156630962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156631045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156631133 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156631380 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156631565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156631851 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 156632109 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156632378 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156632419 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156632472 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156632730 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156632741 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156632747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156632770 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156633350 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156633467 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 156634158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156634321 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156635818 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156635872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156638985 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156639314 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156639328 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 X 156641035 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156641997 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 156642467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156644291 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156644359 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156645436 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156647075 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156647313 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156647518 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156648829 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156648839 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156649078 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 X 156649371 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156649651 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 X 156649654 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 X 156649793 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 X 156649977 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 X 156650134 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156650214 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 X 156650248 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 X 156650400 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 X 156650592 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156650634 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156650709 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 156650763 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 X 156650978 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 156650984 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 156651011 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 156651087 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156651097 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156651128 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156651178 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156651196 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156651200 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156651296 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156651327 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156651370 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156651421 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156651454 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156651484 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156651513 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156651531 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156651662 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 156651785 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 156651828 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156652073 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156652125 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156654801 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 156654804 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 156654881 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 156654895 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 156654954 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 156654971 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 156654999 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 156655033 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156655466 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156655855 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156656689 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 156656909 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 156657517 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 156657745 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156657775 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156658774 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156660212 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156660213 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156660234 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156660235 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 156660468 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156660508 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156661118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156661140 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156661216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156661270 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156661446 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156661819 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156661853 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 X 156662111 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 156662650 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156664350 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156666916 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156668798 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156668882 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156669274 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156669856 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156670807 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156671418 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156671937 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156672206 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156672957 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156674009 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156677176 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156677236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156677238 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156677249 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156677270 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156677278 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156677360 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156677516 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156677610 C G Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 156677703 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 156677712 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 156677864 G A Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 156678173 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 156678437 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 156678504 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 156678570 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 156678721 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156678927 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156678961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156679180 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156679236 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156679297 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156679352 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156679722 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 X 156679875 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156679931 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156679948 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156680011 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156680036 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156680053 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156680087 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156680148 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156680194 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156680330 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156680354 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 X 156680387 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156680420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156680438 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156680560 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156680635 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156681266 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156681586 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156681626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156681640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156681796 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156682100 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156682126 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156682155 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156682336 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156682406 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156682503 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156682757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156682808 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156682949 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156683022 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156683075 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 156683115 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156683657 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 X 156683685 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156683801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156683867 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156683885 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 156684153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156684248 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156684324 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156684345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156684361 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 156684444 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156684511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156684610 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 X 156684847 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156684860 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 156685018 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156685544 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 156685561 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156685596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156686034 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 156686315 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156686326 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156686532 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 156686626 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 X 156686840 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156687266 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156687393 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156688191 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156690150 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 156690922 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156692677 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 156696218 A C Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 156699809 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156701111 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 156701121 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156701404 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156702232 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156703667 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156704731 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156709822 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156711961 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156713601 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 156715494 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156716032 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156721578 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 X 156721637 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156721714 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156723448 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156723505 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156731591 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 X 156732234 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156732870 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 156732927 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 156733324 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 X 156733447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156734322 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 156734500 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 156734946 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156735131 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156736679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156737194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156738270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156742562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156743438 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156746506 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156746616 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 156749870 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156751422 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156752300 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156754794 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156757565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156758104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156758371 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 X 156759990 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156763368 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 X 156767516 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156775571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156776605 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156777819 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156780052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156781203 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 156785453 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156786055 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156786060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156788909 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156790458 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156790732 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156790879 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156800668 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 156806007 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 156806328 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156806638 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156807153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156807656 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156807760 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156808444 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156808611 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 X 156808798 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 X 156809307 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 156809919 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 156810213 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 156811441 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 156811446 A G N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 X 156814891 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156816123 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156816587 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156816737 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156817053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156817554 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 X 156818405 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156818861 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156826403 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156827357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156829715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156831561 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156832874 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 156833587 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156834242 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156834474 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156837846 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156843221 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156843793 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 156845250 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156845749 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156846389 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156846589 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156847225 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156848201 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 156849357 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 156849439 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 156850474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156852271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156853890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156854255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156854727 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156855180 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156855276 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156855405 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156855664 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156855779 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156856327 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 156856609 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156858486 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156859021 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156859107 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156860151 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156864931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156865157 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156865384 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156867163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156869546 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156869789 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156869801 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156870116 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156870294 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156870306 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156872697 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156873803 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156884045 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156884150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156888395 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 156889700 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156889976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156894330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156896365 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 156898851 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156900461 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 156901797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156902586 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156902621 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156902874 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156908662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156913968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156918688 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 156920918 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156921245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156923088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156925830 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156928403 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156928497 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156930316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156932169 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156932581 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156933472 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156935161 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156935400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156936460 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156936886 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156939246 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156941624 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156943128 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156944221 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156944234 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 156947536 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 156948070 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156948397 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 156949669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156949944 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156951796 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 156954072 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156962312 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156962320 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156962525 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 156962990 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156964343 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156970856 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156984032 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 156987435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156991987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 156997976 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157000080 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157001288 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157001910 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157004321 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157005359 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 157005990 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 157010007 G A Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 X 157012374 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157014989 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157015300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157015706 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157016393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157016885 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157018398 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157021722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157022937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157023856 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157026351 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157027756 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157028742 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157029642 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157035076 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157036661 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157037701 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157038602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157038794 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157039367 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157041726 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157043519 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157045569 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157048175 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 157049595 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 157051951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157052128 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157052367 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157053372 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157053386 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157054806 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157055005 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157055030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157056182 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157056595 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157058854 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157058874 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157058877 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157059568 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157060387 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157060492 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157060570 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157060664 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157060711 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157060761 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157061714 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157062135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157062744 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157062872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157064735 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157064874 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157064875 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157068276 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157068355 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157069394 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157069440 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157069499 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157070002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157070315 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157072709 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157074716 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157075311 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157075418 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157078794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157079290 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157080685 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 157081397 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157081427 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157081480 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157081481 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157084938 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157086048 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157086111 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157086961 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157087248 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157087355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157087414 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157087459 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 X 157087473 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 X 157087576 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157087598 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157087663 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157087914 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157088089 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157088232 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157089126 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157090133 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157090173 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157090522 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157090825 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157097632 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 157098316 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 157098322 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 157098559 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 157098626 C A N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 157099097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157099275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157099730 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 157099843 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157099849 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 157100559 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157101243 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157101762 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157101960 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157103131 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157103184 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157103318 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157103411 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157103652 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157103902 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157104042 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157104452 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157104580 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157105248 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157105779 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 157105923 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 157105930 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157105952 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157106019 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 157106646 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157106975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157107655 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157107704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157107821 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157107838 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157107875 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157107984 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157108034 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157108197 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157108257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157108481 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157108483 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157109005 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157109204 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157109239 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157109260 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157109277 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157113500 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157115248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157116848 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157117837 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157118928 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157119218 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157120324 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157120739 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157120831 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157121289 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157121424 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 157121525 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 157121545 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157121727 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 157121993 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 157122262 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157122361 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157122362 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157122438 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157122444 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 157122477 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 157122818 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157123715 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 157123830 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 157123895 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 157124003 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 157124212 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157124330 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157124478 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157124970 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157125288 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157126267 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157127651 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157127793 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157127959 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157128003 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157128106 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157128374 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157128587 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157128782 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157128879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157129185 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157129865 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157130534 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157132899 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157134675 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157136676 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157137997 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157138064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157140133 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157140716 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157142778 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157143276 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157143813 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157144496 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157145937 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157151265 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 157153605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157153609 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157157087 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157158501 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157159043 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157159756 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157160891 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157164956 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157167634 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157167684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157170824 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157170889 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157172037 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157175076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157176094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157179045 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 157182001 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157182246 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157182496 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 157183587 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157183731 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157183842 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157185472 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 157185490 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157186156 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157186238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157186537 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157187546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157187998 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 157188625 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157188803 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157190072 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157190960 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157197573 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157207268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157212446 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157215256 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157218237 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 157221565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157223145 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157225320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157226305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157227756 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157228458 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 157229569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157230972 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157231089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157236599 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157238532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157240785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157270156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157277667 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157285926 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157293143 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157318320 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157330949 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 157336051 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157336457 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157336536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157341087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157344972 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157346023 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157348860 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157349460 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157349959 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157350969 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157351832 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157352214 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157352561 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157355330 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 157355331 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 157355620 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 157355797 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 157359659 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157361680 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157364900 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157365823 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157365894 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157368092 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157369078 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157369118 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157369993 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157374450 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157376119 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157378543 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157381967 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157383044 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157383312 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157388659 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157391428 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157391968 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157392031 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157392062 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157394542 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157394693 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157394955 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157402647 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157404035 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 157406813 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 157407174 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157408140 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157409903 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 157411092 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 157413311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157413477 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157413845 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157417044 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 X 157419014 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157422626 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157425647 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157428194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157429185 G A N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 X 157431051 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157432056 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157432557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157433130 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 157433500 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157434831 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157435305 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 X 157437826 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157440540 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157443826 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157446793 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157448591 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157449754 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 157451327 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157451955 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157458183 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 157458348 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157458490 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157459211 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157460207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157463521 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157464218 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157464516 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 157464932 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157465002 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157466297 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 157466720 T C Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 X 157467704 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157468567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157474661 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157474734 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157475011 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157475480 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 157476864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157478242 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 157481027 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157482036 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157483967 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157487790 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157489696 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 157490880 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157502291 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 157502768 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 X 157503326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157503609 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157504850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157505436 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157510369 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157510748 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157511025 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157512427 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157513375 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157514740 G A Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 157514751 A T Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 157515491 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157517949 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157518077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157519688 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157519689 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157521216 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157521645 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157524176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157524359 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157527119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157529299 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157531354 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157532266 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157533264 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157533885 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157534561 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 X 157536188 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157537985 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 157541367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157547574 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157548734 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 157551079 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157552373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157552625 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157553217 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157554222 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 157556198 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157557073 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157557134 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157558269 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157558580 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157561249 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157563182 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157564047 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157564619 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157566725 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157568448 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157569848 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157570231 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 157570592 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 157571362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157576280 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157578134 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157579605 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157585651 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157589467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157590140 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 157590430 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157593553 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157594671 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157595483 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157595850 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157598842 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157603274 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 157605222 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 157607476 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157610306 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 157611498 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 157613062 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157613771 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157614105 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157615289 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157615522 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157623832 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157624340 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157624777 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 157624778 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 157629144 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157629752 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157629849 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157630152 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157631913 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157633160 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 157633804 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157635646 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157636448 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157639409 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 157639615 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 157640524 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157641176 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157641702 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157643507 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157643800 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157645011 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 157645512 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157649177 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157652318 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157652844 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157654762 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 157654792 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 157656512 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157670476 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157671050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157671361 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 157677520 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157677604 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157679422 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157682362 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157682978 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157682993 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157682999 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157684244 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157685593 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157685946 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157687072 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157696944 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157699194 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157707574 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157708770 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157709089 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157709353 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157709966 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157710120 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157710648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157712251 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157713004 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157714119 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 157714833 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157715734 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157719271 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157719712 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157723415 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157727484 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157728436 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157735881 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157737561 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157742709 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 157742712 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 157758294 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 157758411 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157759143 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157760747 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157761312 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 157766327 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157767481 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157769488 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 157772240 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157775304 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157777332 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157777829 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157778034 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157779255 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157779454 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157779475 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157779526 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157779868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157781522 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157783498 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 157789365 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157790448 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157791004 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157795453 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 157795684 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157796389 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157797287 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 157797971 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157799943 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157802321 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157805312 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157806693 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157806949 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157807110 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157807284 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 X 157807342 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157807757 C G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 X 157809054 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157810318 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157810357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157811140 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157811212 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157811243 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157811523 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157818584 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157823563 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157824508 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157824992 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157825622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157825645 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157825781 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157825841 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157826042 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157826135 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 X 157826401 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157826449 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157828004 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 157838905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157839985 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157839991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157848267 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157848593 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157852355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157853824 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157854161 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157857408 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157860005 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 157861739 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157862161 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157863472 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157865903 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157865978 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157866306 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157868090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157868902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157869362 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157870004 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157870081 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 X 157870336 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157870341 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157870595 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157870600 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157870675 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157870824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157870837 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157871029 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 157871107 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157871117 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 X 157871404 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157871648 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 X 157871874 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 157872046 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157873206 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157873296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157873612 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157874201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157876255 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157876491 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 X 157878123 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 157878510 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157878550 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157879068 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157879227 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157879540 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157879876 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157879877 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157879913 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157880117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157880517 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157880565 C G N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 X 157880704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157881034 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157882880 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 157885870 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 157885887 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157885995 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157886580 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 157886610 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 157886799 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157886969 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 157887096 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157887133 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157887142 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157887159 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157887161 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157887203 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157887514 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157887612 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157887919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157888623 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157888750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157888884 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157888885 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 157888896 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157889315 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157889457 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157889745 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 X 157891547 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157892929 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157893959 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157894012 C G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 X 157894389 G A N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 157894900 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 157894973 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157895058 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157895333 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157895410 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157895778 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157895781 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157895782 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157896108 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 X 157898783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157898853 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157898856 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157900192 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 157901417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157903099 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157903613 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 157904100 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157904976 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157905131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157905792 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 X 157907604 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157907882 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157908446 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157909366 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 X 157909778 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 157910885 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 157912729 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157919845 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157923846 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157927341 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157927457 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 157927614 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157927904 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157927917 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157928971 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 157929138 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 157929722 G C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 X 157931696 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 157932319 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157932682 C T N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 157932879 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 157933813 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157935086 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157936404 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157938222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157940398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157943562 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157946387 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157948797 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157951269 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157951598 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157951819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157952581 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157953258 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157954082 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157956111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157957554 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157962656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157967952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157969944 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157969965 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157970571 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157972260 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157972267 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 157972711 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157974540 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 157976897 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157985688 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 157986043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157989601 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 157990091 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 157997095 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 X 157997304 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 157997790 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158000981 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158001302 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 X 158001428 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158001571 A G N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 X 158001975 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 158002094 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158002098 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158002230 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158002407 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 X 158002528 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 X 158002833 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158008682 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 158009537 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 X 158011515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158012492 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 X 158018002 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158023924 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 158029772 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 158030310 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158032296 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 158032700 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158036955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158037434 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158037593 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158040346 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158041816 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 158043055 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158045337 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158045836 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158046539 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158048975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158049246 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158060378 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 158060506 G T Y N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 X 158060574 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158067073 T A Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 X 158067509 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 X 158068033 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 158068228 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158069462 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158074248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158074342 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158076442 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158076711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158078649 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 158082495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158086838 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158089539 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158090951 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158098456 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158098533 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158098538 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158098700 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 X 158100189 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158101225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158103306 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158103614 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158105175 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158105198 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158106427 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 158113401 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 158113696 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 158114055 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158115298 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158117161 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 158120181 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 158120883 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 X 158122816 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 X 158123865 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 X 158123999 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158125575 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 X 158125652 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158125783 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 X 158125882 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158126223 C A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 X 158126781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158127053 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158127457 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158127504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158127933 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158133335 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158133818 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158133926 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158134435 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 158136537 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158136790 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158139386 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158139414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158139442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158140610 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158140945 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158142421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158142487 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158143739 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158156193 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158157492 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158159998 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158160264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158161316 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158161810 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158166286 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158173196 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158175082 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158177176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158177520 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158178086 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158179102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158179242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158181227 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158182856 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158186222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158186630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158186643 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158187333 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 158193777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158194546 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158194875 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158195037 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158195118 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158196352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158196498 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158197178 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 158197722 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158199904 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158202480 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158206199 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158207589 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158207958 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 158209500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158209501 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158210025 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158210259 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158210825 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158210944 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158211051 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158211172 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158215805 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158217183 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158217890 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 158220893 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158221803 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 158222238 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158222641 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158223716 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158224801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158226134 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158228291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158229335 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158230269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158230280 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158230597 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158231757 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158233380 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158234668 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158234670 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158240065 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158240635 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158242657 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 158244066 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158244423 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158244676 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158244761 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158245090 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158247400 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158247447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158248311 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158250864 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 158251239 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158253365 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 158254254 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158254370 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158258507 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158259951 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 158262575 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 158265367 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 158266375 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158266766 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158267526 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158267553 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158268353 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 158271611 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158273740 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 158274467 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 158276052 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158280537 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158283246 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158286216 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158288162 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158294592 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158299305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158303191 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 X 158304922 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158307540 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158310585 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158310644 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 X 158312146 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158312266 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158313176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158313500 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158314250 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158314340 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158314747 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158320319 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158320326 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158322029 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158323509 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158323610 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 158327018 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 158330855 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158331447 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158332350 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158337873 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 158339545 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158340309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158342592 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 158342747 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158347751 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158349954 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158350146 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158350182 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158352351 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 158355816 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158356049 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158357773 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 158358741 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 158360340 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158360492 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158360825 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158361413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158361836 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158365700 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 158367608 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158368292 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158368547 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158369820 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 X 158369973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158370765 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158370894 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158370929 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158371132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158371525 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 158371543 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 158379486 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 158380047 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158381088 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158381536 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158382589 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158383128 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158383508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158385052 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 158385743 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158387225 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158388426 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158388434 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158393578 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158395983 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158397230 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158397576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158397926 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 X 158398393 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 X 158398456 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158398704 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 158398752 C G N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 X 158398979 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 X 158400514 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158401980 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158402116 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158402145 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158404371 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 X 158404564 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158404953 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158405456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158405766 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 X 158405793 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 X 158405986 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158407171 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158407344 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 X 158407814 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 X 158407883 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 X 158407961 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 158407967 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 X 158408490 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 X 158408699 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 X 158408835 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 158409901 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158410850 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158411727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158412467 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 158412575 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158412692 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158413257 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 158414181 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158414344 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 158414739 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158415141 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158415143 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158418408 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 158420776 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 158421451 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158421619 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 158422393 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158423466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158423897 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158424796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158424868 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 158424942 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 158425031 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 158425115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158425808 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158430564 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158430628 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 158432283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158432527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158432845 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158432916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158433226 A T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 X 158436402 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158438376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158439567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158440492 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158440495 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158441567 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158442142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158443276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158444205 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158444334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158446888 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158447371 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158447416 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158448066 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158449329 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158449356 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158449745 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158450520 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158451765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158451954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158453491 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158454211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158454263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158457230 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158458916 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158459025 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158459579 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158460573 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158462764 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158463242 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158466859 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158469090 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158469807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158470505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158471012 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 158471019 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 158472618 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158472710 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158475145 C G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 X 158475663 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 158477662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158478273 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158480836 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158482679 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158491135 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 158491768 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158491907 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158493217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158494378 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158494459 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 158495151 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158496348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158496986 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158501053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158503858 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 158506037 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158511712 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158513402 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158514895 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 158517957 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158518118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158519801 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158523543 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158524280 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158526437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158527505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158529025 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158531126 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158531524 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158531860 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158532969 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158533392 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158534342 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158536330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158536433 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158538429 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158539336 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158540142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158543058 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158544910 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158545377 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 158545434 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158548334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158548544 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158549459 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158556814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158557237 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158569028 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158570003 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158570711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158574338 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158574496 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158574957 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158575446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158579969 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158579974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158581700 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158587201 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158587387 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158588146 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 158588247 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158588318 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158588334 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 158588405 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158589297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158589320 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158589664 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158589712 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158589817 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158598761 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 158599678 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158600544 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 158601972 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158602472 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158602738 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 158603593 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158604938 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158607175 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 158607879 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 158607903 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158607949 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158608427 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158609708 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158610728 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158610961 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158612808 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158629835 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158632751 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158634762 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 158636393 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158636865 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158637221 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 158638043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158638371 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158643129 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158645843 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158646408 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158647527 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 158649770 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 158649907 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158650173 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158651309 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158652503 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158652610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158653051 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158654312 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158654655 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 158658112 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 158659265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158663440 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158668516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158672785 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158673731 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158676556 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158680173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158680476 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158681771 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158685929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158688273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158691628 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158697858 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158698930 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158704576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158707725 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 158708761 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158710334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158710915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158711250 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158711643 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158712898 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158714226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158714355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158714984 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158715052 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158717031 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158717438 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 158717910 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158721481 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158722755 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 158727601 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158729720 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158730313 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158731769 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158734309 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158736936 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158738283 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 158740882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158741516 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158742397 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158743076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158743912 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158744277 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158751251 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158753887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158754892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158755564 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158756186 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 158757006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158763289 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 158763379 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 158770551 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 158770691 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 158771449 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 158773684 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 158775660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158780414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158786960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158787564 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158787987 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158788560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158788791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158790971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158791828 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 158793642 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 158795349 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158797087 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158798059 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158801034 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158801426 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158801822 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158802779 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158803651 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158804472 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 158806666 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 158807074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158809871 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158810674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158813649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158814605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158824525 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158825159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158826097 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158827905 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158829905 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 158834923 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158835573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158835583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158835943 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158836038 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158836486 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158836941 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158837571 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158842327 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158842572 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158845569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158850186 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158850728 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158850867 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158851849 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158852526 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158853221 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158853372 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158854122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158856449 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158862888 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 158864679 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 158866746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158867361 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 158867476 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 158871011 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158871738 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 158872725 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158873941 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158876619 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158877116 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158877798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158878349 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158878352 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158878898 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158879477 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158880882 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 X 158883051 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158884551 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158885264 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158885342 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158885396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158886216 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158891041 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158895372 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158900103 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158900418 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158901316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158902596 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158903056 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158903613 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158904971 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158905625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158908296 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 X 158908535 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158908628 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158908807 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158909156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158910538 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158911750 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 158911844 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158913178 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158920542 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158920657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158924823 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158924890 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158928765 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158929547 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158931932 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158931957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158933297 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158935433 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 X 158935988 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158938165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158938661 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 X 158940076 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158941601 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158942053 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158942944 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 158943382 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 X 158945230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158945986 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158946394 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158946726 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 X 158946764 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158946837 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 X 158947126 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 X 158947700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158947736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158949093 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158949095 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 158949894 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158950332 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158951208 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158952679 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158953729 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158954874 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158956082 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158956443 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158957799 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158961025 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 158963168 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 158963187 G A Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 X 158965721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158970983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158971153 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158980424 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158982344 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158983016 T A Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 X 158984017 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158984290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158985269 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 158986181 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 158987099 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 158987501 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 X 158987666 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 158991883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158992027 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158992928 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158995823 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 158997248 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 158998369 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 158999292 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 158999533 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 159000318 T C N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 X 159001988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159002699 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 X 159004029 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159004088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159004146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159005645 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159006294 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159007349 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159007694 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159007865 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159008028 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159009673 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159010035 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159011492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159011574 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159011642 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159011885 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 X 159012147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159012252 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159012299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159013460 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159013860 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159014898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159015223 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159015748 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 159015963 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 159016740 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159016761 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159017869 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 X 159017878 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 X 159018213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159018690 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159018691 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159019122 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 X 159019389 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 159019627 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 159019924 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 X 159021022 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 X 159021440 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159021560 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 X 159021582 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159021899 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159024964 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159025773 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159026783 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 X 159026813 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 159026979 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 159027318 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159028699 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 X 159029735 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159029773 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159029808 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159029810 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159029885 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159029916 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159029953 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159029958 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159030269 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159030877 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159030883 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159030972 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 X 159033756 T C Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 X 159033770 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 159033772 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159033910 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 159033948 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159034361 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159034412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159034437 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159034442 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159034554 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159034609 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159034947 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 159036461 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159036638 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159036764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159036871 T A Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 X 159036908 C T N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 X 159038985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159039624 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 159039701 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159040586 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 159042969 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 X 159044499 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 159045401 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 X 159046203 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159046521 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159047394 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159047929 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 159048001 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159048040 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159048056 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159048085 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159048200 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 159048286 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 159048468 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159048656 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 159048713 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 159049055 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 159049296 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159049412 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159049662 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159050015 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 159051025 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159051098 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159051104 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159051387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159051394 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 159051395 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159051487 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159051706 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 159051790 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159051868 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 159052016 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159052034 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159052363 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 159053515 A G Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 X 159053531 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159053571 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159053802 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 159054486 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 X 159054704 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 159055592 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159056578 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159057374 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159057517 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159057649 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 X 159057902 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 159057909 G A Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 X 159058710 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 159059509 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159059582 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159059821 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159059911 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159060207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159060298 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159060626 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159061280 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159061444 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159062701 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159064590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159064614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159064791 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159064858 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159065001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159065002 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159065064 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159065382 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 X 159065435 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159066290 T C N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 X 159066350 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 159066938 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159066976 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159066990 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159067036 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159067300 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159067348 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 X 159067584 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 X 159067620 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 X 159067665 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159067711 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159068104 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 X 159068188 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159068308 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 X 159068626 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159068944 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159068956 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159070570 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 159071193 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 159071894 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159072231 G C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 X 159072455 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159072737 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 159073577 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 159074009 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159074447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159074851 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 159076787 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 159076805 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 159087670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159089601 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 159090651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159090812 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159096726 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159100099 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 159103071 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159103304 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 X 159103317 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 X 159103322 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 X 159103359 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 X 159105174 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 159105713 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 159105885 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159117128 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159117377 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159119495 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159120032 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159120359 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 159124947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159125608 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159128050 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159129881 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159135741 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159141349 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159141543 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159143429 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159147132 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159147442 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 X 159147978 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159148398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159148427 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159148622 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159153274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159154031 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 X 159154327 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 159154948 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 159154972 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 159156856 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159157167 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159160670 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159165354 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 159167793 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 159172401 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159176893 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 159177298 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159177918 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159178597 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159179071 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159179546 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159182603 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 159182607 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 X 159186529 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159187663 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 159189026 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159191064 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159191231 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159192958 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 159194066 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159194303 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159196825 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 159207186 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 159208715 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159211105 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159211533 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159213297 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159220820 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159222479 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159223253 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159223398 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159224886 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159226329 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159230639 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159249067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159252248 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159254945 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 159270685 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159270703 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159272430 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159274400 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 X 159274999 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159275267 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 159275327 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 X 159276245 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 X 159276339 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159277277 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159278202 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159280318 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159280837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159283231 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159283244 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159283255 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159283262 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 159283264 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 159283431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159283994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159284129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159285591 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 159285759 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 159287251 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159288525 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159298261 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159308525 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159309772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159313636 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 159313657 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 159314980 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159315208 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 159315209 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 159316032 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159316364 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159316373 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159316375 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159316496 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159316749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159316842 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159319313 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159321334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159321400 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159321401 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159326294 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 159327009 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 159327024 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159327095 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 159327117 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 159327421 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159327512 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 159327582 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159328007 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 159329165 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159329814 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 159332136 C A N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 X 159333757 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159334125 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159334418 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159336917 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 159337081 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 159338347 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159338810 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 159338813 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 159340504 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159340629 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159340755 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159341686 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159341943 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159342563 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159345077 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159345078 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159345628 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159346334 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159346492 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159346869 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 159347495 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 159350316 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159351651 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159352814 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 159353999 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 159354645 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159355142 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 159355224 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 159356380 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159358407 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159358733 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 159359207 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159359591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159361623 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159363871 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159364005 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159365629 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 159370289 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159372935 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 159373071 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159374294 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159378473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159378813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159378935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159379822 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159380360 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 159380364 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 159380429 A T N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 X 159380751 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 159381049 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159381484 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159381584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159382235 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159382240 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159382310 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159383517 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159384752 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159385078 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159385079 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159385105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159385156 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159385207 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159385281 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159385289 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 159385428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159385443 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159385607 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159386917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159387043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159387114 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159387512 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 159387660 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159388286 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159388408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159388880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159389014 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159389022 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159389691 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159390066 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159390271 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159390499 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159390518 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159390539 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159390670 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 159390886 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159393123 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159393429 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 159393782 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159394851 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159395357 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159395578 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159395648 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159395844 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159398796 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159399074 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159399219 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 159399920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159399922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159399985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159400286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159400297 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159402919 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 159403473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159404082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159404199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159404228 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159404360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159404631 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159404817 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159405180 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159405680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159406027 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159406871 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 159407641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159408113 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159408206 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159408228 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159408411 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159408427 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 159408429 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 159408455 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 159408464 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159410628 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159410962 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 X 159411196 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 159411201 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 159411206 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 159411280 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159411286 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159411293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159411403 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159412105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159412353 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159412362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159412650 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159413268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159414176 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159415523 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159415548 T A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 X 159415639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159424620 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159425827 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159425841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159427668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159428520 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 159428613 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159428781 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159428825 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159430342 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159430385 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159430410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159430493 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159430757 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159432100 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159432540 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159432884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159433012 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159433054 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159433128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159433400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159433542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159433938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159434042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159436091 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159436553 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159436572 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159438251 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159438806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159439418 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159439603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159439745 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159440146 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 159440179 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159440220 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159440335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159440341 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159440395 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159440482 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159440824 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159440884 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159441040 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159441364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159441374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159441461 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159441662 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159441904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159441991 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159442591 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 159442599 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159442622 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159442877 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159442883 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159442994 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159443108 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159443265 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159443461 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159443652 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159443708 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159443715 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159443725 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159443756 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159443875 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159443924 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159445676 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159446824 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159447365 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159447931 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 159450210 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 159451098 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159451885 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 159451947 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159453096 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159454075 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159455086 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159455131 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159455405 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159455694 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159455857 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159456471 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 159456863 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 159456874 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 159456886 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 159457009 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 159457045 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 159457055 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159459913 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159460263 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159460705 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159460747 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159460854 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 159465662 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159465683 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159466046 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 159467242 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 159467372 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159468076 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159469523 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159470604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159471729 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159472403 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159472576 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159472607 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159472608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159472610 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 159472653 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159472654 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159472766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159474950 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159475226 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159475592 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 159475761 T C N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 159476907 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159477409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159478413 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 159478420 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 159478448 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 159478454 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 159478455 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 159478552 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 159478595 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 159478901 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 159478969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159479182 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 159479186 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 159479351 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 159479369 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 159479404 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 159479458 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159479490 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 159479528 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 159479576 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159479700 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 159479812 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 159479853 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 159480156 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159481269 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159483327 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159483407 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159483436 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159484732 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159492097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159494427 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159497829 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159502675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159503236 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159509318 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 159512415 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159512768 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159516548 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159517390 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159521466 G T Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 159521897 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159522130 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159522766 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 159526064 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159527511 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159529388 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 159530668 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 159531046 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159532343 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159534408 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159534582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159534584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159534700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159534747 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159535125 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159535833 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159535909 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159536020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159536475 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159536642 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159536682 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159537371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159539103 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159539359 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159541227 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159541250 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159541289 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 159541290 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 159542086 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159542295 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159543482 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159543621 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159544869 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159549207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159550633 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159558542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159559529 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 159562060 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159565002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159565717 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 159567095 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159567791 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 159567926 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159570103 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159570117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159570457 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159571221 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159575621 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 159576802 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 159581521 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 159581883 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 159581895 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 159581908 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 159581916 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 159581985 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159582211 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159583499 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159583848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159584145 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 159584851 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159585331 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159585361 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159588351 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159592328 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 159592369 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 159592642 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159593119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159593556 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159593558 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159593674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159594431 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159594589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159595699 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159596271 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159596635 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159596788 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159597048 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159597078 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159597295 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159600481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159601368 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159602074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159602970 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159603184 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159603479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159604160 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159604185 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159609762 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159612573 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159614160 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159618634 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159619249 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159620119 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159621380 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159622751 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 159624220 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159624269 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159626082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159628934 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159630387 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159633709 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159634416 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 159635083 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159636167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159643542 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159647593 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159649332 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159652124 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159653403 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159656648 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159663617 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 159664346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159667388 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159668050 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 159668339 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159669217 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159673316 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159674463 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 159675860 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 159682566 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159682870 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159684239 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159687786 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159688169 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159691942 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 159692728 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159694005 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159696011 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159698036 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 159701115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159705254 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159705344 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 159706064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159706569 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 159713998 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159715198 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159715882 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 159716044 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159716113 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159716121 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159716139 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159722038 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 159725490 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 159738829 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159741104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159742599 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 159744451 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159748989 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159749122 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159749309 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 159749863 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159750311 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159751272 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159753025 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159756986 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159757598 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159758459 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159759841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159760234 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159766924 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159767306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159772359 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159782550 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159783393 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 159788723 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159791730 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159800106 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159800571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159801245 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159801676 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159801911 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 159802505 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159802716 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159806202 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159806945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159807051 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159807316 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159809052 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159809885 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159809956 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 159816419 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159818133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159820758 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159825474 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 159826816 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159828470 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159829263 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159831420 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159832377 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159832612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159835191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159835414 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 159836243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159839920 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 159842152 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159848397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159852713 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159856705 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 X 159856714 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 159856965 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159858224 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159860368 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159860705 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159860915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159863267 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159866016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159873584 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159876347 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159876761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159888683 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159896769 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 159911465 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 159916994 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 159940206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159947715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159949099 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159949410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159950661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159952853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 159958010 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 159959339 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160055203 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 160055990 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160085926 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160087684 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160094287 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160094997 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160131249 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160165891 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 160183755 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160193132 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160196092 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160222390 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160324106 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160324940 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160327428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160328182 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160328200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160330264 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160333302 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160333676 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160336296 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160337610 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160346963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160353820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160353976 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160355035 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160359453 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 160364560 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 160367644 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160374604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160379939 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160380146 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 160387766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160399423 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160399426 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.611111111111111 0.111111111111111 0.277777777777778 24 12 11 2 5 X 160399495 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 160400412 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160400679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160400732 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160400925 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 160400962 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 X 160400965 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160401368 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.578947368421053 0.105263157894737 0.315789473684211 24 14 11 2 6 X 160401561 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160402029 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 0.117647058823529 0.352941176470588 20 14 9 2 6 X 160402499 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 26 14 12 2 6 X 160402616 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160402633 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 26 14 12 2 6 X 160402675 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160402808 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 26 14 12 2 6 X 160402860 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.578947368421053 0.105263157894737 0.315789473684211 24 14 11 2 6 X 160403075 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 X 160403221 G A N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 160403874 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 160405423 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160406174 G C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 160408457 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160410181 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160411401 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160413251 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.3 0.1 0.6 14 26 6 2 12 X 160413442 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160414115 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160423524 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160425749 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 160426127 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.35 0.05 0.6 15 25 7 1 12 X 160426194 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.6 0.05 0.35 25 15 12 1 7 X 160428102 G A N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.5625 0.0625 0.375 19 13 9 1 6 X 160428252 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.333333333333333 23 13 11 1 6 X 160428396 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.578947368421053 0.0526315789473684 0.368421052631579 23 15 11 1 7 X 160430824 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 160431295 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160432998 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160433946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160434558 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160435580 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160439678 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.388888888888889 0.0555555555555556 0.555555555555556 15 21 7 1 10 X 160440459 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 160450758 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 160452871 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160453560 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.65 0.05 0.3 27 13 13 1 6 X 160454366 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160455473 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160456449 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160456838 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160457032 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160461280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160461326 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.263157894736842 27 11 13 1 5 X 160461558 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160462154 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160462178 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160462363 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160462367 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160462555 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160462760 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 160462852 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160463327 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160463369 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160463792 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160465228 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160465334 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160465502 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 160465713 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160466372 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160466485 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 160466745 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160467935 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160467972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160468175 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160468325 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160468708 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160469281 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160469668 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160469977 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160470119 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160470309 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160471335 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160471370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160472271 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160472887 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160472912 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.266666666666667 0.0666666666666667 0.666666666666667 9 21 4 1 10 X 160473227 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160473317 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160473918 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.315789473684211 25 13 12 1 6 X 160474421 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 X 160474422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160474975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160475137 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160475174 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160477876 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160478455 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 160478766 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 160480221 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160480789 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 160482492 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 160484344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160485659 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160485815 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160485934 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160486158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160493802 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160495424 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160496560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160496630 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160499338 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160501080 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160502786 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160504816 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160505047 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160506224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160506563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160510167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160511971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160514128 C A Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 X 160514808 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 160517925 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160522099 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160522449 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160527234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160530518 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 X 160530530 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160530911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160531322 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 X 160531346 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160531380 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160531429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160531658 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 X 160531674 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 X 160531697 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 X 160532087 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 X 160532628 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160534111 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 X 160534118 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 X 160534223 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 X 160534616 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160535757 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160536196 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 X 160536240 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 X 160536818 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 X 160537158 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160539942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160540701 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160543933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160544254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160545287 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160545389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160545678 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160545815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160546973 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160550780 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160550895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160551608 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160551756 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160551935 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 X 160552080 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160553412 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 160556033 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160556614 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160558119 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 X 160562015 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160562046 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 160562092 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 160562563 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160563352 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160565705 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 160573181 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160573592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160574331 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160575719 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160576967 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 160577767 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160578155 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160579499 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160579594 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 160579673 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 160580983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160581114 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160581258 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160581489 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 160584531 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 160588293 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160590971 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160592715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160593293 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160593581 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 160596414 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160599472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160600798 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160605536 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 160607985 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 160614839 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160619542 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160623589 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 160629238 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160629513 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 160630087 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160630709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160632493 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 160632958 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160633352 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160633646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160633846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160635002 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160635971 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160639493 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 160639647 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 160639949 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 160644610 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160644696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160645503 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160650795 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 160651331 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 160657161 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160658257 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160658779 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160659370 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160659914 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 160660148 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 160660198 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160662813 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160663007 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160663269 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160665504 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160665601 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160668551 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160669069 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160669455 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160669489 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160669943 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160670159 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160670203 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160670219 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160670271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160670552 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160670667 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160670679 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160670693 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160670695 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160670782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160670868 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160671080 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160671148 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160671199 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160671284 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160671459 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160671974 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 160672581 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160672634 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160673074 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160673164 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160673424 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160673719 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 160673728 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 160673793 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160673871 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 160673949 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160674324 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 160674491 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160674572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160674609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160674614 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 160674615 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160674704 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 160674767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160674858 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 160674942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160674952 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160674970 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160675052 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160675210 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160675231 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160675279 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160675439 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160675452 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160675493 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 160675753 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 160675824 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 160675991 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160676130 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 160676254 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 160676272 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160676303 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 160676394 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 160676487 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160676605 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160676610 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160676670 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 160676695 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 160676904 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 160676909 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160676955 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 160677170 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 160677269 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 160677661 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 160677738 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 X 160677741 A G N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 X 160677750 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 X 160677904 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 160677989 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 X 160678002 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 X 160678063 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 160678154 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 160678175 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160681416 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160682093 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160682157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160682508 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 160682811 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 160682939 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160683732 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 160683937 G C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 160683951 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 160684366 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 160684765 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160685146 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160686604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160686617 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160687666 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 160690934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160691661 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160692225 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160693848 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160698551 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160700140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160700951 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160701759 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160702495 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160703394 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160704422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160705858 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160706471 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160706972 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 X 160707018 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160707036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160707142 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160707286 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160707588 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 X 160707808 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160707829 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160707839 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160708228 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 X 160708590 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160708679 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 X 160708805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160708992 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160709146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160709397 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160709520 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160709698 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160710242 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160711632 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160716085 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 160716867 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 160717855 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160721033 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160721280 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160721290 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160721757 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160722434 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 160723252 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160724556 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 X 160724782 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160735602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160739353 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160740132 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160740468 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160742021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160744036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160744703 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160744985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160745493 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 160748341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160751537 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160753043 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160758154 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160759082 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160760181 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 160761247 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 160765524 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 160769265 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160776522 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160778114 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 X 160778447 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 X 160778527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160778655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160778932 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160778996 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 X 160779003 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 X 160779016 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 X 160779100 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 X 160779133 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160781819 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160786278 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160798106 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 160798709 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160800909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160802884 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160803202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160803442 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160803885 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160807113 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160808769 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160808927 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160810547 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 160813030 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160815718 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160816273 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160817165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160818618 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160819671 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 160821117 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160823093 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160823798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160824524 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160824714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160827096 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160830180 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160830715 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160831904 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160833053 T G N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 X 160834990 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160835001 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160837664 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160838253 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160838543 A C Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 X 160838584 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160838686 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 X 160843115 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 160844242 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 160844243 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 160846152 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160846874 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 160849027 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160850109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160852621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160853747 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 160853748 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 160854067 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160854955 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160855300 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160855892 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 X 160856067 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160856144 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 X 160857646 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 160857675 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 X 160858039 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160858632 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160862882 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160863806 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160866700 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 160868673 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160868866 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 X 160873635 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160873840 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160873868 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160874003 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160874005 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160874412 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160874413 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 160874570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160877199 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160887223 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160888242 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160889680 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160894473 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160894895 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160899679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160900130 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160901132 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160905541 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 160910414 A T N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 X 160910528 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 160916575 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 160916872 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 160917102 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 160919130 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 160921540 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160925546 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160927775 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160933075 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160933234 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160933341 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160933523 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 160933563 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160936629 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 160937496 A G N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 X 160939526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160942215 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160943454 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160944633 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 160946199 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 160947651 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 160947652 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 X 160948948 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160952095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160957428 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160957792 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 X 160959735 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160966585 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160969445 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160969696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160972218 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160973713 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 X 160973723 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 X 160975203 C T Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 X 160976928 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160982591 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160983831 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 X 160984297 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 160984513 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160987331 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160988228 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160988584 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160988776 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160991597 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160992267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160992861 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 160994337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 160995415 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161007621 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161007676 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161008192 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161008709 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161011619 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161015390 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 161021660 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161022276 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161022693 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161023720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161023790 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161024268 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161024348 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161025491 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161025559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161030222 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161031276 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 161032384 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161035958 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161039802 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161043981 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161047563 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161048925 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161049022 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161050193 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 161052143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161060840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161066710 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161068813 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161077741 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161079567 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161079817 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161080859 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161081098 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161082616 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161082698 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161085659 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161086183 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161086340 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161087761 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161087939 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161088745 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161089660 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161090637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161090832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161091227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161091310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161091656 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 161094376 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161098575 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161099213 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161099682 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 161099738 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 161099978 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 161102190 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 161102518 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161102600 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161104370 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161105040 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161105389 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161109308 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161110361 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161111499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161112208 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161112596 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161113685 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 X 161115518 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 161115660 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161120135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161120226 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161121051 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161123974 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161124876 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161125779 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161125980 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161127138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161128205 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 161129253 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 161130529 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161131289 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161131989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161132335 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161133483 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161134234 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161134661 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161137237 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161138557 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161139834 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161141957 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161142928 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161143355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161151909 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 161151998 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161153221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161154864 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161155418 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 161156878 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161162131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161162576 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161163093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161163260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161163847 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161164553 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161165330 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161165477 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161165793 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161167504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161167824 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161168419 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 161168696 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 161169495 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161169575 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 161169700 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161170011 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161170079 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161170364 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161170827 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161171088 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 161171235 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 161171532 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161171863 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161172809 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161172904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161173212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161173501 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 161174354 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161174515 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161174761 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161175053 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161176379 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 161176607 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161176736 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 X 161176802 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161177408 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161177745 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 X 161177979 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 X 161178610 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 X 161178822 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 X 161179149 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 X 161179829 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161179967 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 X 161180722 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161184781 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161185715 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161186987 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161199019 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161205786 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161207889 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161208575 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161209008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161209995 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161214726 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161216630 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 161216868 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161219077 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161219139 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161220274 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161222615 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161222670 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161222907 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161223105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161225834 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161226576 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161232672 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161234369 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161237166 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161238861 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161242440 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161242704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161242720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161243053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161243249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161243409 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 161243488 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161243496 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161243563 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161243889 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161245352 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161246934 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161247261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161247270 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161248215 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161248220 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161249211 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161249832 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161250096 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161251945 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161252375 G C N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 161255412 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161256338 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161256524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161258207 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161261211 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161261284 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161264889 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161266786 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161267085 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 161267639 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161267895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161268123 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161268385 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 161273262 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161273288 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161273489 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161273632 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161273736 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 161273898 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161274383 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161274576 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161278536 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161279476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161280420 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 X 161281200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161282079 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161282865 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161284565 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161285076 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161285281 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 161285385 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 X 161285403 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 161286393 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161288608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161293270 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161293346 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161293563 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161293929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161294773 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161297998 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161299267 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161301443 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 161308715 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161310717 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161310954 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161311400 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161311995 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161312444 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161312757 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161313802 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 X 161314390 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161315279 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 161315509 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161317408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161317602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161320269 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161323290 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161324179 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 161325372 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161326434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161334535 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 161335202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161337451 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161338890 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 X 161339646 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161340844 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161341137 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161341160 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161341227 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161341389 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161344197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161346841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161353237 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161357784 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161358732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161362335 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161362412 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161363574 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161363968 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161364254 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161364499 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161367432 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161370022 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161373011 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161381777 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 161383176 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161383675 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161384919 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161387071 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161389433 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 161389580 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161391083 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 X 161391133 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 X 161391134 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161395920 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161396781 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 161399214 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161399729 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161399843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161400462 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161401154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161401586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161402383 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 161403717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161404299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161405765 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161406430 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161409274 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161409282 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161411965 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161412563 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161413226 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161418431 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161418895 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161419726 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161421151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161429603 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 161429604 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 161429629 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161435601 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161437042 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161438411 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 161441394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161443036 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161443464 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161443631 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161444717 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161445569 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161446908 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161447603 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161449503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161449789 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 X 161449795 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 X 161449902 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161449919 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161449984 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 161450213 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161450236 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161450517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161450605 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161450621 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 161450622 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161450687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161450724 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161450808 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 161451131 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 161451407 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161451460 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 161451463 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 161451589 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 161451614 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161451636 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161451645 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161451771 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161451937 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161452261 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161452267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161452298 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161452305 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 161452391 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161452393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161452448 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161452479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161452514 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161452652 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161452751 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161452946 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 161452988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161453027 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161453057 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161453231 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 161453232 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 161453341 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161453436 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161453455 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161453483 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161453533 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161453600 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161453624 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161453652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161453711 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161453815 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161453835 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161453926 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161454189 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161454235 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161454884 A G N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 X 161454885 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 161455054 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161455120 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161455135 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161455190 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161455318 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 161455393 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 161455438 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 161455888 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 161455914 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 161455959 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 161456013 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 161456099 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161456119 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161456122 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161456237 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161456266 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161456272 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161456356 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161456358 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161456384 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161456512 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161456513 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161456627 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161457139 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161457387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161457520 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161457627 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161457696 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161458325 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161458334 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161458649 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161459054 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161459161 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 161459392 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161459639 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 X 161459879 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161460128 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161460194 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 X 161461028 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161462972 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161463510 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 161463845 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161464282 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 161464289 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 161464891 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 161466100 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161468537 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161471229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161471881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161473316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161475142 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161476084 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161476437 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 X 161476939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161477598 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161479024 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161479090 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161481003 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161481724 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161482337 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161482577 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161483526 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161484363 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161485184 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 161485919 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161485959 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161488215 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161488450 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161488922 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161490117 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 X 161490404 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161490592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161491216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161491276 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161492455 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 161493412 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161494845 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161500276 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161500618 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161505841 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 161508613 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161510130 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161510495 C G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 X 161512634 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161514143 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161517521 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161518884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161519436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161520724 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161534674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161534818 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161535979 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161536176 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161536316 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161537177 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161538331 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161541084 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161541326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161541327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161542294 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 X 161543189 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161543368 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161547541 C T N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 X 161548252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161548910 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161551163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161551440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161553776 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161556389 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161560292 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161560667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161562564 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161570946 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161572636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161573285 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 161574426 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161574620 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161577039 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161577140 G C Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 161579518 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161580376 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161581096 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161581288 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 161581457 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 161581839 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 161582747 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161583362 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161584876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161585963 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161586204 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161587294 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161587473 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161588217 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161588648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161588992 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 X 161589028 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 X 161589245 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 161591374 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161591657 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161592982 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161593219 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 161594268 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161595272 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161595548 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161595738 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161596617 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 161596921 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161597005 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161598056 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 161599242 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161600445 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161604759 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161608158 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161613958 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161621786 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161623029 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161623048 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161628543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161630367 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161635665 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161636577 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161637228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161639145 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 161640488 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 161641716 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161641968 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161648337 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161648636 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161650665 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161652499 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 161652593 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 161654208 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161654457 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161661764 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161669646 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161669767 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161671121 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 161674083 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161674320 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 161675747 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161676761 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 X 161677725 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161679464 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161679800 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161680013 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161682706 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161683666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161685707 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161686749 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161687605 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 161688515 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161690095 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161690584 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161690879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161690993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161692089 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161693689 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161694015 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 161694790 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161695919 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 161696995 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 161698961 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161700533 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 161700786 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161701976 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161702142 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161702150 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161702734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161702778 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161703891 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161705814 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 161706873 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 161709160 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161709740 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161709870 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161712029 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 161714317 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 161715990 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161717519 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161720396 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 161721200 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 161721518 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161727227 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161728810 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161729296 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161729297 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 161729656 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161743705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161746622 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161747313 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161748887 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161750458 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 161750644 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161752338 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161752717 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161753051 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161756082 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161757328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161757439 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161758031 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161758977 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161759211 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 161775393 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161776234 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161778462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161782943 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 161784077 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161797445 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161797875 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 161798280 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161799984 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 161803280 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161804813 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161805317 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161805641 T A N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 X 161812314 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161812650 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161814069 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 161814447 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 161815372 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161817249 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161821819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161822545 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161823688 G A N Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 X 161824718 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161825725 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161826272 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161826833 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161828352 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161829775 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161830959 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161831009 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161834321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161836179 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161837824 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161840774 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 161842486 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161842893 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161843419 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161845914 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 161855430 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161857745 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161858982 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161859441 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161861562 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161861674 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 161861853 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161862036 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161862952 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161864062 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161867232 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161868101 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161870416 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161871097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161874243 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161878647 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161879324 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161879567 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 161879784 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 161882791 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161886291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161887423 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161887455 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161887947 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161888083 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 161891329 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161892814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161893127 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 161896921 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161897278 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161899130 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161901205 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161902334 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161920877 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161921568 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161925677 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 161925697 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161926231 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161932127 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 161932660 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161932853 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 161934710 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161935612 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 161939311 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161943846 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161944001 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161945879 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161947109 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161954040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161954092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161956248 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 161957272 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 161966138 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 161968056 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 161975828 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 161976814 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 161978147 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 161982694 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 161982716 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 161982717 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 161986347 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161986640 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 161992907 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162001033 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162002621 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162002626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162008647 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 162013071 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162016467 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 162017963 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162019578 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 162020620 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162022847 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162023124 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 162029324 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162029337 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162030154 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162033282 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162033754 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 162036982 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162039369 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162040488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162042081 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 162042485 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 162049511 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162053571 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162060472 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162064430 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162065384 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162079059 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 162088519 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162090833 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162093800 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 162097405 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162097675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162098784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162101681 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162101794 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162112126 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162114015 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162114643 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162122061 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162125463 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 162128228 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162128492 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162128531 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 162129476 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162132887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162136075 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 162138545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162147061 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162148599 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 162154772 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162162713 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162166808 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162166982 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 162167142 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162167289 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162167385 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162180441 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162180547 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162181595 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 162183147 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162184275 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162185103 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 162187274 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 162192961 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 162203404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162203819 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162204934 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 162205549 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 162210022 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 162213803 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 162216763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162217560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162217770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162221944 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162223213 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 162244574 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162261865 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 162304152 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162314021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162318165 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162320795 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162321579 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162323636 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162325961 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162336659 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162336662 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162336675 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162337210 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162346831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162347724 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162350350 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162355656 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 162357078 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162358140 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162364630 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162366740 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 162368691 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 162370054 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 162371392 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162373664 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162389423 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162412768 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162414324 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162419142 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162420072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162420165 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162420373 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162421971 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162422715 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162422769 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162422881 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162423532 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162429664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162430660 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162431501 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162434174 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 162436185 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162442887 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 162443775 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162444187 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 162446132 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162446814 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162449886 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 162451248 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162451281 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162451289 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162451922 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162452261 G C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 162456149 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162458983 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162463134 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 162466325 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 162469463 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162470611 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162471459 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162472744 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162472774 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162473155 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162476077 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162476311 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162477768 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162478820 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162480019 T G N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 162480932 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 162482769 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162483276 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162485469 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162485742 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162486156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162486197 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162486500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162488639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162488990 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162491182 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 162491426 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 162492594 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162493395 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162494620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162495221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162495372 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162496229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162497663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162499666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162508525 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 162509731 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162510722 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162512423 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 162512481 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 162513098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162513726 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162517834 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 162518183 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 162520448 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162525398 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 162525680 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162526341 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 162527349 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162528313 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 162528336 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162535742 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 162541733 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162541913 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162542184 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 162544486 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162544921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162547605 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162551182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162551204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162551909 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 X 162551940 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 162552128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162553091 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162554155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162554541 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162557092 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162557259 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162558627 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162559099 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 162562881 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162569144 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162577566 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162585975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162586441 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162587057 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162587801 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162587815 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162588435 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162590627 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162592411 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162592440 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162594835 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162595233 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162596327 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162596493 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 162600958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162602475 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162605796 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162608438 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162608617 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162610060 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162610120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162610218 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162612367 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162616210 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162617412 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162621086 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162624420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162626065 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162626345 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162626553 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162634487 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162636120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162636811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162637795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162641530 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162649502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162650165 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162650370 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162653017 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162653659 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162654160 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 162654448 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162654585 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162655735 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162656077 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162656299 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162656605 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162656721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162657056 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162657491 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 162657702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162658655 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 162658672 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162658927 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162658931 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162659168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162659709 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162660134 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 162660490 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162663004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162669720 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162672374 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162672788 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 162673539 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162674573 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162675730 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162676774 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 162677300 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162680344 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162684049 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162684210 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162684503 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162684572 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 162684624 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162684671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162684684 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162684685 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 162684981 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162685158 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162685253 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162685989 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162689186 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 162689324 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162689403 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162693504 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162695645 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162696621 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162698525 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 162698765 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162699071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162699388 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 162702155 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162705105 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 162706790 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162708194 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162710312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162710646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162718265 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162723640 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162726347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162727306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162727505 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162727678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162729914 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162737608 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162738722 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162739323 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162741912 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162742761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162743949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162745083 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162751652 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162751937 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162751981 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162752038 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 162752750 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162752802 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162753058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162753251 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162753292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162754033 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162754060 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162754418 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162755037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162755168 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162755342 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162755881 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162756893 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162757569 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 162757593 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162758624 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162758673 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162759374 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162759403 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162759562 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162759829 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162760300 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 162760536 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162760583 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162760763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162761611 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162761806 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162761939 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 162762382 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162764451 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162765290 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162766147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162768877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162770708 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162772164 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162772256 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162774088 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162774699 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162776084 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 162776677 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162777353 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162777676 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162783851 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162784371 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 162786247 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162786455 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162788621 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162788645 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162792612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162796067 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162796497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162796552 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162796763 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162798684 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162798771 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162799123 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162799142 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162801140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162801153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162801225 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162801724 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162801965 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162802771 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 162803065 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162803069 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162803085 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162803156 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 162803253 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 162803264 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 162803398 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162803417 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162805855 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162806428 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162806680 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162811147 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 162814497 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162814538 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162815816 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162817191 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162817804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162819995 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 162825240 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162826445 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162829224 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162829619 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162830923 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162832960 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162833336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162833903 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162835181 C G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 162835211 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 162835577 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162835580 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 162835813 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162836624 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162836771 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162839471 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162840078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162840285 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162841133 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162842199 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 162843344 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162845055 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 162846958 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162848907 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 162849907 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162850086 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162852102 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162852138 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 162852792 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 162854150 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162860748 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 162862534 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162863460 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162864744 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162865750 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162867332 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162867341 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162867449 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162868380 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 162869336 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 162870547 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162874681 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162874945 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162878695 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162878841 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162878932 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 162879507 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162879862 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162880051 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162880338 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 162882194 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 162882771 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162882884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162883159 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162883641 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 162883934 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162885013 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 162885105 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 162886025 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162886625 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162886740 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 162886841 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162886984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162888019 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162889457 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162892930 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162893764 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162898043 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162898557 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162900189 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 162900765 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162904309 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162904418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162905213 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162906194 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162906473 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162907595 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 162908539 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 162908543 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162911970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162912716 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162914356 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162914531 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 162914819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162915602 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162915694 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 162915991 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162917409 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162917600 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162918791 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162919149 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 162919947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162920407 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162923927 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162926060 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 162926179 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162926180 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162926929 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162927717 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162928189 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162930115 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162930117 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162930338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162931484 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162931954 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162932188 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 162932228 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 X 162932768 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162933427 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162933500 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162933947 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162933953 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162934988 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162935845 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162938133 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162939843 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 162940232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162942220 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162943054 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162943654 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162946277 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 X 162946715 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162947604 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162947636 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162948092 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162948767 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162949118 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162949363 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 X 162949737 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 X 162949817 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162949959 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162950176 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162950235 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162950535 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162950653 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 X 162950904 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 X 162951151 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 X 162951398 T C N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 X 162951430 A G N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.357142857142857 0.142857142857143 0.5 12 16 5 2 7 X 162951636 G C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 X 162951649 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 X 162951883 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162952207 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162952450 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162952459 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162952482 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162952547 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162952927 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 162952979 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162953151 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 X 162953174 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 X 162953182 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162953426 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162953743 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162953777 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162953778 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162954579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162954638 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162954868 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162954869 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162954921 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162954975 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162955053 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162955136 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162955149 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162955172 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162955211 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162955558 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162955766 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162955919 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 X 162955929 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162956079 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 X 162956354 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162956511 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162956834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162956989 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162957016 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162957077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162957183 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 X 162957306 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 X 162957351 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 X 162959876 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162960354 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 X 162960400 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 X 162960828 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 X 162960988 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 X 162961097 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 X 162961476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162961691 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 X 162961778 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162962023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162962054 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162964093 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162964212 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162964365 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162964631 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162964725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162964876 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162964884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162965078 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162965741 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 X 162966356 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162966921 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162966959 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 X 162968175 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 162968260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162968436 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162968438 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162968551 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162968771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162969318 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162969830 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162971678 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 X 162971723 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162971728 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162971783 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 X 162971799 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 X 162971858 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162971887 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 X 162974260 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162974568 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162976910 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162976911 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162979797 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162979878 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162980963 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 162981071 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162981075 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162982044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162983687 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 162984152 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162985442 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162986173 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162986237 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162986390 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162986455 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162986503 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162986516 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 162986517 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162986569 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 162986739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162986912 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162987122 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162987123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162987832 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 162987937 G A N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 X 162988111 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 162988253 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162988304 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162988568 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162988576 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162992752 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162994624 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 162995075 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162996899 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162997026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 162997612 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 162997829 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162999710 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 162999815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163000112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163001941 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163002023 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 163005923 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163006242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163006511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163007240 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163007421 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163007490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163007771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163007772 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163008159 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163008200 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 163008207 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 163008409 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 163010408 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 163010910 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163011074 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163011416 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163012048 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163014586 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163019603 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163022838 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163023698 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 163026968 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163027520 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163027751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163027879 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163028929 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163028983 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163029551 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163029566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163032203 T A N N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 X 163032581 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163032904 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163033850 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 163034242 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163035004 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163035682 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163037985 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163039081 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163039834 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 163040810 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163041058 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 163041067 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 163041071 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 163041130 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 163042719 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163043184 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163044882 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163046015 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163051889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163054595 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163056169 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163057687 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163061854 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163063970 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163064031 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 163066503 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163067081 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163067455 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163067684 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163070367 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163070853 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 163071497 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163073041 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 163073127 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163074004 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163074044 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163074692 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 163075156 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 163075411 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163075671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163083500 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163083861 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163084620 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163084683 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 163086117 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 163089782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163096539 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163097525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163097702 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163099259 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163101127 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163101582 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163102580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163103708 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163104211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163105407 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 163109968 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163112877 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163112957 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 163115488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163117385 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163117424 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163119057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163119199 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163122375 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163124411 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163124563 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 163125393 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163126590 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163126981 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163127396 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163129683 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163134580 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163135061 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163136631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163137614 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163137842 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163141236 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163141993 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163142243 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 163144562 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163145391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163145896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163146740 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163147770 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 163148364 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163149509 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163151286 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 163152918 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 163153007 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163153330 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 163154374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163154648 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163155178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163156236 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163157017 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 163158075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163159260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163162985 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163163326 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 163165988 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163167029 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163167079 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163167608 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163167800 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163167854 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163167872 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163168078 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163168540 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163168672 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163168700 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163169073 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 163169221 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163169698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163170016 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 163170058 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 163170149 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 163170668 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163170811 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163171003 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163171174 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163171346 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163171537 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163171577 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163171632 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163172280 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163172299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163172467 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163172476 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163172571 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163172610 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163172635 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163173089 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163180002 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163180174 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 163180822 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163181047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163181153 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163181171 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163181689 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163181807 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163182146 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 163183393 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163183394 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163183436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163183593 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163184164 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163184205 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 163184230 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 163184813 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163184814 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163185065 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163185104 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163185378 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163185433 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163185738 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 163186065 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163186399 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163186820 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163186868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163186869 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163187189 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163187248 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163188213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163188395 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163188801 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163189179 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163190320 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163190478 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163190666 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 163191451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163191997 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 163192064 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 163192862 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163193481 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163193825 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163194185 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163194457 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163194466 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163194486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163194974 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163195069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163195152 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 163195280 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 163196182 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163196515 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163196546 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163196806 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163197362 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163197378 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163197433 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163197560 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163197978 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 163198423 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163198720 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 163199734 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163206957 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 163209485 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163211543 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163215029 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163216387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163222026 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163222176 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163223326 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163224029 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163224321 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163224587 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163226348 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163229319 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163230415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163230960 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163235598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163235725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163235751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163235808 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 163236029 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163236033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163236204 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163236535 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163236552 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 163236553 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 163236555 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 163236627 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163236636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163236815 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 163237940 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 163238231 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 163238793 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 163239275 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163239462 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 163239470 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 163239668 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 163239860 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 163242482 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163244139 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 163244558 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163244844 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 163244864 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 X 163245110 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163245362 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 163246397 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 X 163246969 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163247103 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 163247639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163247771 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163247921 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 163247949 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163248164 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163248362 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163248402 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163248426 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163249055 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163249482 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163251380 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163253461 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 163253489 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 163253491 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163253550 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163253576 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 163253843 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163253978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163254096 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 163254204 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163254302 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 163254567 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 163254602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163254749 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163254812 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 163254905 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 163254918 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 163255510 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 163255569 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 163255789 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 X 163255795 T A N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 X 163255856 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163255969 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 163255989 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 163255996 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 X 163256154 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 163256411 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 163257772 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163257954 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163259024 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163259090 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 X 163259157 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 163259540 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163259988 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 163260208 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 163260248 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 163260833 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163261328 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 163261379 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 163261390 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 163261452 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163261501 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 163261875 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 163261955 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 163262262 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 163268698 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 X 163268806 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 163269557 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 163269560 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 163270333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163270382 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163270540 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163270837 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 163270888 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 163270972 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163270999 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163271247 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163271915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163272102 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163272142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163272147 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163272560 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163272742 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163274492 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163275924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163275959 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163278131 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163278185 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163278296 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 163280362 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163281102 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 163281356 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 163282127 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 163282262 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 163282804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163284800 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163285782 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163286172 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 163294683 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163295800 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163298165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163298560 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163299138 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163300940 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163305222 A G N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0 0.583333333333333 0.416666666666667 7 17 0 7 5 X 163305960 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163309607 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 163312382 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163319302 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163320755 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163326273 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 163327700 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163331616 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163331648 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163333046 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163334367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163337765 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163338232 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163338381 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163340420 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163340601 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163341471 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 163341687 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163341723 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 163341862 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163341866 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163346959 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 163349143 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163349362 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163350447 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 163351403 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163352429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163353164 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163354109 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163356351 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163356434 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163358505 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163358898 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163359110 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163361031 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163362156 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 163362587 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163363881 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163365961 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163368636 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 163371216 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163371265 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163373622 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163373900 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163374107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163374553 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163375575 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163378320 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163379745 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 163379819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163382636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163384569 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163385252 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163387231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163387533 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163388150 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163388409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163392435 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163396301 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163398835 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163399099 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 163400035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163400641 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 163400979 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163402205 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 163406434 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 163410339 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163410474 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163412045 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163413836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163413947 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163414390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163415456 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163418197 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163418755 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 163418932 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 163421545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163430693 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 X 163431150 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163431315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163431332 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163431346 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163431372 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163431454 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163431640 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163431855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163431912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163434086 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163434978 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 163437414 C A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 163437797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163442144 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163444160 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163444693 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163444720 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163446852 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163447509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163449390 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 163449823 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163449940 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 X 163450685 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 X 163451684 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 163452772 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163454734 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163456395 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 163456743 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163457121 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163457749 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163458904 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163460340 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163460804 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163461393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163461778 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 X 163461789 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163462324 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163462540 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163462545 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163462911 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163463221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163464101 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163464366 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163467514 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163468124 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163471883 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163475174 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163478532 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163478752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163479565 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163479691 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 163479716 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 163479759 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 163480355 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 163480449 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163480490 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163480538 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163480565 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163480619 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 163480629 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 163480684 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 163480721 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163480904 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163480929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163481149 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163481462 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163482882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163484471 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163485217 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163485243 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163485356 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163485730 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163486179 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163487516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163488183 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163488235 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163488264 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163489302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163489561 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163489702 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163489724 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163490378 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163491035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163491042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163491100 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163491218 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163491280 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163491287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163491291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163491297 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163491303 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163491597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163491805 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163491829 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163491841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163491960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163491972 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163492095 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163492553 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 163492777 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 163494169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163494479 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163495393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163495434 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163496138 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 163497132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163497682 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163497998 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163498427 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163499064 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163499338 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 163500111 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163500568 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163502743 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163503313 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163503372 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163504206 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163504669 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163504961 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163505886 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163505922 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163506127 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163506682 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163506826 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163507177 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163509272 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163510890 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163512201 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163515554 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163515616 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163515828 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163515896 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163515944 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163516139 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163516473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163516526 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 163516527 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163516529 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163516578 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163517543 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163517677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163519038 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163519597 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163519772 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 163520226 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163520281 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 163520292 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163521407 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 163521784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163522494 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163523355 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163523427 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163523734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163527398 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163528276 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163530492 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 163533363 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163534885 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163536000 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163538030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163538269 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163538606 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163541822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163543269 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163543354 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163543394 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163543799 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163544357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163547333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163548985 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163550588 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163551618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163552336 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163553237 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163553500 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163555384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163556112 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163557630 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163558640 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163558703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163560712 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 163560896 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163563350 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 163563455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163563636 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163565866 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163566025 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163566414 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163569299 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163573426 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163576877 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163577408 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163577894 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163579415 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 163580059 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163580385 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 163581083 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163581835 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163585385 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 X 163585466 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163585814 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163586969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163587516 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163588512 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163588743 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163589133 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163590269 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163590812 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163591949 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163596673 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163596927 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163597878 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 X 163598043 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163598956 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163600405 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 163601043 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163601347 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163601629 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163601930 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 163610227 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163610423 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163613114 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163613197 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 163613779 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163614402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163614550 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163614687 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 163615104 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163615301 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163615680 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163616239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163616323 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163618076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163620244 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163620640 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163620929 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163623204 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163623811 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163624017 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163624523 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163627620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163628516 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163629588 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163630343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163631114 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 163632311 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163633834 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163634379 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163636606 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163636682 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 163636860 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163637027 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163637270 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163637446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163638203 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163641941 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163642377 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163642640 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163642884 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163643703 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 163646442 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163647159 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163647243 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163647767 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163647943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163648476 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163648549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163649147 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 163649276 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 163650767 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163650984 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163658223 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163658317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163659804 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163659906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163660512 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163660733 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163662996 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163664399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163664583 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163665196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163668448 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163668675 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163671600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163671691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163672983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163674302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163677112 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163677176 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 163680109 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 163680134 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163683101 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 163683834 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163690698 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163691391 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163694725 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163695025 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163695477 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 163696351 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163697520 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163697777 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163698476 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163703596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163703888 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163705637 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163705912 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163706119 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163706423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163706616 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163706758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163707376 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163709090 G A N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 X 163709997 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 163710510 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163710514 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163710779 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163710950 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163715142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163715382 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163718336 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 163721521 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163721582 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163723094 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163723129 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163724777 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163727972 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163728240 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163728704 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163729092 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 163729805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163731044 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163733974 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163735063 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163735065 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 163740532 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163750977 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163751675 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163754699 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163758040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163762523 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163767616 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 163768359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163770549 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163771497 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163771749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163774305 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 163787158 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 163788839 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163789691 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 163789839 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163790956 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163791214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163792010 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 163796487 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 163797575 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163798704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163799316 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163802690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163804211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163805112 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163805127 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163807721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163814396 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163819947 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163820164 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163820188 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163820189 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163824051 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163825547 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163828664 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163829466 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163829536 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163829610 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163829770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163832501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163832533 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163832565 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163832667 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163832674 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163832742 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163832828 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163833033 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163833373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163833412 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163833695 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 163835033 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 163838502 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163838867 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163841036 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163842369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163842405 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163844483 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163846217 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 163846693 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163850327 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163854500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163856709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163856971 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163857722 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163858749 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 163859813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163859877 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163864130 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163864278 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163866007 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 163866139 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 163866391 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163866858 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163868907 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 163869014 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 163870069 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163870802 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163872039 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 163874719 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163881577 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 163881580 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 163882241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163883663 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163885278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163886168 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163886741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163887177 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 163887217 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 163887810 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 163889369 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 163891869 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163892469 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 163892612 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163892967 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163893362 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 163895100 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163896946 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163898604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163899719 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163900796 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163902961 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163903849 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 163903859 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 163903874 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 163903930 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163903954 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163904575 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163904585 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163904621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163904999 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163905201 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163905371 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163905626 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163905904 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 163906674 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 163906676 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163906809 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163908424 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163920025 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 163920925 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163927664 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163929516 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163933336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163934519 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163937045 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163937229 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163939591 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 163940185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163940822 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163941443 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 163944376 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163944869 G C N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 X 163945640 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163945685 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163946316 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 X 163946337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163946643 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 163948055 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163949320 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163950413 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163950875 C A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0 0.882352941176471 0.117647058823529 15 19 0 15 2 X 163951656 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163952274 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163953733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163954090 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163954653 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163954655 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 X 163954968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163956444 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 163961786 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163962755 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 X 163962925 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163963610 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 X 163964337 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 X 163970727 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 163971131 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163971850 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163972425 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163972642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163972808 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 163974435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163974457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163976659 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163976843 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163980178 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163982016 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 163983265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163983818 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 163985822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163986050 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 163986188 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163994103 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163995545 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 163997319 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163997689 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 163998951 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 164001527 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164003125 G A N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 164003956 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 164003977 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164004771 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164005123 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 164005408 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164006543 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 164007370 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 164007543 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164007677 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164008399 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164011554 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164011960 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164014210 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164015079 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 164015998 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 164016087 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 164016649 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 164017962 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164019358 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164029289 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164063178 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164066703 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 164067516 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164076416 C G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 X 164077985 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 164080274 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164080774 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164082095 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164082345 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164084347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164085657 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 164086957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164088372 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 X 164088664 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164089653 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164090173 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164091033 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164094884 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164095261 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164095725 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164095901 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164097312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164097345 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164098094 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164098238 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164099311 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164099941 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164100208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164100460 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164101110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164101372 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 164101383 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164102961 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164103066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164103104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164103659 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 164105228 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164105232 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164105533 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 X 164105757 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164106425 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 164106921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164107004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164109838 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164112008 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164112522 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164113817 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164115303 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164116911 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164118935 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164124231 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164124949 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164125149 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164126090 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164126682 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 164127240 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164127401 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164129240 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164131780 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164133431 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164133921 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 164134696 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 164135042 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 164135108 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 164136964 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164138446 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164138648 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 X 164139968 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164140550 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164140574 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164140626 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164141050 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164141457 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164142894 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164143251 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164143260 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164144355 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164145039 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164145350 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164147238 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 X 164147517 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164147714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164148024 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164148310 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164148318 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164148603 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 164148709 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164149138 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164150073 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 164150127 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164152355 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164153480 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 164153858 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164155351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164157169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164157255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164159294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164162611 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164162675 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164167666 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164167968 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164169505 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164169659 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 164171199 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164171460 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164173099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164174408 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164175517 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164175829 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 164180735 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 164183175 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164183188 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164183376 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164183600 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164185294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164185343 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164189953 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164190026 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164193162 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164196775 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164203108 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164203959 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164207323 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164210534 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 164210978 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164211253 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 164211505 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 164212598 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164214121 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164214413 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164214422 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164214425 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164214457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164215014 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164215551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164223248 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164223811 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164223988 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 164227471 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164227956 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164231997 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164232069 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164232457 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164232976 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164234778 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164235218 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 164236357 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 164236711 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164238539 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 164239322 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 X 164242184 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164243373 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164245192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164248517 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164251866 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164254643 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164255367 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 164256207 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 164258517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164258653 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164260555 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164261267 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164262767 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 X 164263915 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164265555 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164266269 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164269212 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164270105 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 164272240 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164273008 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164273058 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164273737 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 X 164273813 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164276931 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164277376 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 X 164277522 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164278587 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164279247 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 164279535 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164283656 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164289077 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164290157 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164291088 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 164291577 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164291901 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164291955 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 164292747 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164294282 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164296077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164296659 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164296786 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164296818 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164297803 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 164299574 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164303562 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 164304450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164307006 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164307144 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164307389 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164309235 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164309989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164310202 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 164310433 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 164310630 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 164311371 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 X 164311421 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 X 164311423 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 164311550 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 X 164311584 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 X 164312065 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 X 164312283 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 X 164312366 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 X 164312591 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 X 164312636 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 X 164312819 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 X 164312864 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 X 164312891 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 164314162 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164314251 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164314575 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 164315429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164315488 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164315549 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164315555 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164317229 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164318998 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 164318999 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 164319060 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164324383 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 164324672 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 164324909 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 164324980 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 164325763 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 164325870 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 X 164327323 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 164328457 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 164331241 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 164335886 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164336601 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164336664 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 164337575 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 164338377 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 164338528 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 164338829 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164339009 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 164339055 A T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 164339995 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164340725 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164341025 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 164341036 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 164344301 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 164345536 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 164346354 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 164346615 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 164347235 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 164347256 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 164349075 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164349354 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 164349373 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 164350446 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164350451 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164354098 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164355212 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 X 164355618 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 164357441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164359720 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 164362874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164362948 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164363076 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164363213 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 164364180 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164365170 T G Y N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 4 20 2 0 10 X 164365572 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 164368024 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 164369508 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 164369533 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.473684210526316 0.0526315789473684 0.473684210526316 19 19 9 1 9 X 164369824 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 164370476 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164370668 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 X 164370688 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 164370730 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164371029 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.45 0.1 0.45 20 20 9 2 9 X 164371232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164371345 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 164371568 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 164371605 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 164371641 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 164371670 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 164371835 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 164371992 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164372032 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 164372233 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 X 164372346 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 164372639 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 164374032 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164374403 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 164376914 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 164377050 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 164377100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164377873 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164378681 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 X 164379872 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 164380369 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 164380581 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164380735 G A Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.444444444444444 0.111111111111111 0.444444444444444 18 18 8 2 8 X 164381876 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164382826 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164383188 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164383319 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164383551 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 164383724 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 164383776 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 164386114 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 164386427 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 164387963 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 164390541 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 164390556 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.388888888888889 0.166666666666667 0.444444444444444 17 19 7 3 8 X 164391114 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 164391385 G A N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.533333333333333 0.133333333333333 0.333333333333333 18 12 8 2 5 X 164392734 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164392977 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 164393604 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164395156 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 164397633 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 164397794 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 164398355 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 164398972 C A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 164399153 A G N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.538461538461538 0.0769230769230769 0.384615384615385 15 11 7 1 5 X 164399557 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 164399754 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 X 164400109 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 164400706 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 164402102 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 X 164404481 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.3125 0.1875 0.5 13 19 5 3 8 X 164405956 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164406029 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164407456 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164410422 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 164411598 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164411918 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164412414 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 X 164412584 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164413119 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164416543 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164416963 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 164418255 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164418744 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 X 164419254 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 164420299 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 164420300 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 164420419 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 164420664 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164421315 A T N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.4 0.0666666666666667 0.533333333333333 13 17 6 1 8 X 164422233 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 164430253 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164430614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164430987 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164431975 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164432011 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164432263 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164432264 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164432453 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164432618 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164432748 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 X 164432813 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164433134 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164433309 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164433390 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164433405 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164434208 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164435086 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164435409 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164435426 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164435737 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164436794 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 164436901 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 164437421 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 164437886 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 164438003 T G N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 X 164443081 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164444890 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164446201 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164446810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164447171 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164448159 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164448160 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164449450 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164450012 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164452762 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 X 164453730 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 X 164453743 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164454073 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164454597 G A N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 X 164455428 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164455527 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164456035 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164456113 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 X 164456140 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164456209 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 X 164456388 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164456621 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 X 164456857 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164457122 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 164457394 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164457431 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 X 164457452 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 X 164457500 G A Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 X 164457613 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 X 164457792 T C N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 X 164457859 T C Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 X 164457911 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164457916 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164458086 C T Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 X 164458215 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 X 164458378 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164459129 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164459408 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 X 164460496 C T N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 X 164461762 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164462022 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164462674 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164463721 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164465363 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 164465411 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164465602 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164465656 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164465756 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 X 164467121 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 X 164469980 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164470365 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164470888 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164472357 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 164472517 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164472574 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164472787 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 164472822 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164472895 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164478113 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 164478367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164478522 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164481915 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164482095 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 X 164482427 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164482954 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 164483463 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164484896 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 164489141 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164489869 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164490798 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 164491098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164492130 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164493082 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 164493967 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 164494447 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164495305 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164496499 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164498038 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164500292 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164500418 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 164500517 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 164501049 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164501867 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164502257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164503224 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164504443 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164506092 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164507586 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164510696 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 164512352 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164513019 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164513223 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 164514160 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164514617 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164515045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164515424 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 X 164515431 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 164515433 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 164517667 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164520399 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 164520680 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164524543 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164528472 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 X 164528534 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 X 164528599 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164528651 G T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 X 164530215 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164531327 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164532006 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164532536 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164534228 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 164534677 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164541026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164543434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164543761 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164545399 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164549356 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164549638 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164550332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164550362 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164550667 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164550708 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164550716 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 164550718 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164553679 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164555017 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164560022 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164561741 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164562726 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164562926 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164562979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164563659 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164564606 G A Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 X 164565116 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164566017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164566357 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164566466 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164566701 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164566730 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164567745 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 164571377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164573943 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164574937 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164576387 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164576700 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164578351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164579590 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 164580094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164580411 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164580776 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164580971 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164582050 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164583056 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164584285 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 164584316 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164584957 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 164585128 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 164585138 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164586448 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164587664 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 164587719 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164587793 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 164588418 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 164590269 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164590647 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164590652 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164590730 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164590863 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164591098 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164591589 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164591610 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 164592809 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 164593613 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164593925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164594143 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 X 164594144 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 X 164594150 G C Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 164594201 A G Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 164594495 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 164594606 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 164594660 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 164595367 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 164595405 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 164596000 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 164596120 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164596223 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164596274 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 164596301 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164596399 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 164597331 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 X 164597463 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 164597608 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 164597676 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164598006 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 164598048 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164598056 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 164598133 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164598197 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 164598269 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 164598455 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164601350 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164601650 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 164601732 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164601794 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164602082 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164602087 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164602150 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164602576 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164603753 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164603934 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164604127 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164604649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164604926 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164605012 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164605763 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164605844 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 X 164606232 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164606789 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164606830 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164606872 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164607122 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164607838 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 X 164608167 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 164608392 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164608425 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164608815 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164609827 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 164611417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164611947 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164619719 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 164620801 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164621998 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164622340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164622673 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164623503 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164624541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164624709 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164625886 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 164626952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164628117 C A Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 X 164629436 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164630115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164630664 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164632928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164639277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164644683 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164645484 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164645935 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164646100 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 X 164646194 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164647917 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164648998 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164649372 A C Y N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 X 164649385 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 164649700 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164650067 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164653124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164659641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164661253 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164661478 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164664298 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 164665165 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164666102 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164666276 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164667131 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164667279 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164667294 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164667491 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164667627 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 164668761 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 164668776 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164669624 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164669655 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164670466 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164672965 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164673971 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 164674517 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164674791 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164676184 T G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 164679588 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164679814 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164679857 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 164680938 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164681198 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 X 164681413 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164683506 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 X 164683947 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 164683963 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164683987 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 X 164684049 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164684050 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 X 164684897 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164686108 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164687994 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164688778 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 164688890 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164689123 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164689531 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164689775 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164689977 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164690066 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164690095 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164690178 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164690697 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 X 164691302 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164691304 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164691935 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164691948 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164692337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164693651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164693994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164694037 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 X 164694985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164695431 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164696432 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164696625 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164697161 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164697700 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 164698933 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 164698968 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 164699582 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164703348 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164704641 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164704843 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 164705105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164707645 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164707740 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164707965 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164707989 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164709087 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164711104 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164711948 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 X 164713722 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 X 164714135 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164715346 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 X 164717029 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164718205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164718497 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164718836 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164720124 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164720772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164721248 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164722321 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164725646 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164727119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164728048 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164729331 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164729525 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164731369 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 164731441 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164733534 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164734004 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164734733 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164735430 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164735630 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164738009 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164740301 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164741050 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164741263 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164742824 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164743850 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164744991 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164745145 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164746052 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 164746953 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164747170 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 X 164747675 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164747914 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164748083 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 X 164748115 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 164748284 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 X 164748339 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 X 164748470 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 X 164748553 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 X 164748738 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164749327 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 X 164749650 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164749714 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164750056 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 X 164750076 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 X 164750111 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 X 164750517 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 X 164750674 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164751392 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164752395 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164752752 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 X 164753309 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164754430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164754905 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164755161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164758817 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164759188 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 X 164760030 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164761516 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164763865 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164766272 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 164766608 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164767222 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164768061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164768586 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164772789 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 164774152 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164777545 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 164779386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164783339 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164784372 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164784793 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164787617 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 X 164787704 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164789873 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 X 164790066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164792011 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164792564 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 X 164793078 G C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 X 164794118 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164794301 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 X 164794674 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 164795217 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164796699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164797399 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164797809 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 164798407 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164798410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164798449 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 X 164798674 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164798676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164801129 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164801261 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164801608 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164802132 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164802218 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 164802770 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164804037 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 164804358 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164804371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164804940 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 X 164805231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164807278 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 164807571 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164809366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164811763 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164811813 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164811870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164813601 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164817168 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 164817694 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164818481 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 X 164823018 A T Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 164823021 G T Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 164824341 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 164828165 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164829237 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 164832160 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164839623 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164840688 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164842734 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 164842879 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 164855867 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164858450 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164859285 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164860636 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164860770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164860955 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 X 164860991 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 164861143 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 X 164861274 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 X 164861630 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 X 164863093 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164863637 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164863743 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 X 164865952 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164866715 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164868490 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164868639 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164868944 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164868985 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164869687 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164869748 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 164871381 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164871650 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164874490 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164874559 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164874696 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164878609 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 X 164878662 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164883525 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164886138 A G N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 X 164890933 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 164890934 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 164890940 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 164890954 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 164890979 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164890988 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 164891004 G C Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 164892233 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 164893150 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 164893582 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164895356 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164896840 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 164898128 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164898988 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164902326 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 164902499 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164902842 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164904791 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164906761 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 164909920 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164911497 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 164911934 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164912355 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164912359 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164912656 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 164914130 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164915283 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164915697 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164916588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164917265 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164917918 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164919308 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 X 164920082 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164921391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164924071 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164926595 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164927879 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164928392 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164932268 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164932464 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164942357 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164943750 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164946277 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164947005 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164950235 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 X 164950654 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 X 164950660 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 X 164950661 G C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 X 164950704 A C N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 X 164951009 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164951371 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164951592 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 164951889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164953839 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164954161 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 164955015 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164955750 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 X 164955968 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 X 164956018 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164956217 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 X 164956622 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 X 164957059 T G N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 164958680 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164958764 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 X 164958973 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 X 164958988 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 X 164959061 G A N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 X 164959123 T A N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 X 164959129 C T N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 X 164959132 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 164959546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164960001 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 X 164960366 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164960669 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164960712 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 164960891 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164960910 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164960942 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164960950 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164961009 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164961248 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 164961295 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 164961305 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164961601 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164961657 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 X 164961837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164962036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164962327 T A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 X 164962370 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164962471 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164962749 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164962903 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164963167 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164963176 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164963336 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164963765 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 X 164967326 G T Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 164967707 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 164967908 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 164968136 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 164971075 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164973281 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164973960 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 X 164974073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164974091 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 X 164974387 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 X 164974647 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 X 164974709 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 X 164974710 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 X 164974714 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 X 164974719 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 X 164974759 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 X 164974760 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 X 164974950 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 X 164974984 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 X 164975036 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 X 164975071 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 X 164975182 T G N N 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.363636363636364 0.272727272727273 0.363636363636364 11 11 4 3 4 X 164975773 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 X 164975866 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 X 164975914 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 X 164976045 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 X 164976060 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 164976331 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 X 164976617 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 X 164976788 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164983978 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164984375 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164986662 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 X 164987392 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164989451 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164989757 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 164989955 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164990518 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 164990806 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 164992387 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164992662 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 164993178 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 164994540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 164995547 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 164996173 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 164996324 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 164997118 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 164999713 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165000329 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165002737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165003676 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165003805 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 165006433 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165009502 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165010319 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165012155 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165012518 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165013040 C T Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 X 165013903 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165014201 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165014717 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165015014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165015590 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165015812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165015973 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165016968 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165018395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165019975 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165021790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165022186 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165022233 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 165024919 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165024993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165025562 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165026211 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165026637 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 X 165027424 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165030668 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165030699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165031892 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 165032847 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165034096 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165034666 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165034828 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165035014 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165035029 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165035389 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165035476 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165035573 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 165035765 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 165035796 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 165035821 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165036011 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165036251 G A N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 X 165036458 C T N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 X 165036571 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 X 165036577 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 X 165036583 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 X 165036822 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165036893 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 X 165036894 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 X 165036918 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 X 165036929 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 X 165036950 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 X 165037011 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 X 165037102 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 165037182 T C N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 X 165037213 T C N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 X 165037220 C T N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 X 165037230 T C N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 X 165037232 G T N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 X 165037263 T C N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 X 165037320 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 X 165041041 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 165044000 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165046542 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165047434 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165049621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165049638 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165049924 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165050692 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165051293 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 165052120 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 165052270 A G N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 X 165052326 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 165052523 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165052582 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165053372 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 165055403 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 165057394 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165060146 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165060915 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165061391 G A Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 X 165062443 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165062530 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165062995 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165063593 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165064720 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 X 165067544 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 165069706 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165072035 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 165072529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165072849 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165072883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165074585 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165075104 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165075805 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165076123 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165076810 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165078476 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165078634 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165082366 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 165084399 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165084645 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165086181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165089531 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 165089793 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165091178 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165093400 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165094082 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165094707 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 165095003 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165097023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165097956 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165101588 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165102793 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165103018 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165105218 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165105551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165107071 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165113374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165115064 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165115312 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165115466 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165116654 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165122724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165122847 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165131039 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 165131755 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 165131789 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 165132004 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165132110 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 165132130 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 X 165132149 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 X 165132150 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 X 165132321 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 X 165132544 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165134841 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 165136473 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165137357 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165138504 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165139543 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165140446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165140555 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165142250 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165144529 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165145265 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 165145692 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165146026 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 165146121 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 165146173 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165147994 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 X 165148026 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 165148265 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 165148687 A C Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 165149632 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165150114 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165151051 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 165151062 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 165151685 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165151729 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165151789 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165151991 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 165152285 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165152667 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 165152967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165153805 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165154434 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165154496 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165154638 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165155245 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165155352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165155410 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 165155885 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165156114 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165156527 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 165156661 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165156932 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 165156967 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 165157065 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165158438 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165158568 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 165158672 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 165158813 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 165159787 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165160238 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 165160528 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 165160845 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 165160945 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 X 165160952 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 165161199 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 165161456 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 X 165161602 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165161912 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 X 165161919 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 X 165161922 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 165161927 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 165162276 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 165162427 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165162774 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 165162781 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 165162814 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 165163360 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 165163446 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 165163474 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 165163532 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 165163533 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 165163780 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 165163815 C A Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 165164498 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165164983 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165165393 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 165165522 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 165166172 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 165166204 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 165167356 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 165168056 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165169730 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165170341 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165171620 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165173312 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165173480 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165173631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165173918 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 165174079 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 165174332 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 165174473 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 165174734 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165174866 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165175535 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165175844 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165177357 A C Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 165177395 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 165177747 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165177832 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 165177964 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 165178003 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165178385 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 165178751 T C Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 X 165180666 T A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 165183981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165184097 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 165184129 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165184252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165184945 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165184972 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165185276 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 165185429 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165185628 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165186015 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165186116 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165186589 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 165187522 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 165187589 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165190206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165190688 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165191456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165192392 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 X 165192514 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 X 165192583 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 X 165192644 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 X 165192845 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 X 165192855 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 X 165192881 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 X 165192893 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 X 165193024 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165193029 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 X 165193030 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 X 165193115 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 X 165193125 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 X 165193126 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165193140 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 X 165193159 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 165193275 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165193305 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 X 165193337 G T N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 X 165193555 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 X 165193777 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 165194364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165194631 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165196737 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165197898 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165198865 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165199241 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165201023 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165202659 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165204471 G A Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 X 165205806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165206208 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165206575 A G N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 X 165206580 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 165206675 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 165206725 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 X 165206726 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 X 165206730 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 165206811 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165207035 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165207072 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165207970 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165208008 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165209091 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165211667 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165212249 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165213264 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165214503 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 165215391 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 165215582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165216365 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165218354 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165218874 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 165223719 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165224705 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165225858 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165226967 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165228629 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 165228885 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 165229064 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 165231216 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165231832 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 165235889 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 165236248 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165237041 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165238885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165246297 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 165247429 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165247605 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165252121 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 165281829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165291008 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165305326 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 165317455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165317555 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165317778 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165318169 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 165318963 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 165319052 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165319082 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165319670 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 165320466 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 165321603 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165321933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165324949 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165327306 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165336276 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165339827 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165339945 T C N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 X 165348520 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165348521 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165350128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165353103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165354716 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165354892 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 165355147 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165357177 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165359615 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165371002 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165372722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165377109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165377729 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165383260 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165386572 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 165387388 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165387692 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 X 165388539 T C Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 X 165388606 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 165389822 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 165389882 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 165389901 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 165389949 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 165392404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165394430 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165394663 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165396043 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165396200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165398256 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165398993 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 165401592 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165405142 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 165405150 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 165405496 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165405960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165407700 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 X 165407958 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165409536 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165410125 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 165411496 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165413710 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165414469 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165419580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165422571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165424223 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 165425398 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 165426231 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165427336 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165427386 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165429959 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 165431535 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165433877 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165434227 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165435864 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165436742 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165436743 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165439090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165444873 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165446678 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165448252 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165448279 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 165450879 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 165451276 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165453845 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165454187 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165454389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165454754 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 165456618 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 X 165457896 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165457897 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165458775 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165459116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165459154 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 165459210 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165459995 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165461331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165461660 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165462018 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165462413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165463582 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165464278 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165465400 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 165468036 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 165473202 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165473577 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165474034 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 X 165474747 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165475908 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165476298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165476825 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165477908 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165478329 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165482458 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 165485429 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165487024 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 165488378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165504429 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165508858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165514778 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165515166 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165517423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165544935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165565830 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 165567389 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165577286 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165577515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165582128 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165582675 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165584658 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165586092 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165594896 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 165613651 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 165616929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165621010 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 165621016 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 165623490 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165623492 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 X 165624637 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165626382 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 165626539 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 X 165626812 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165627445 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165627743 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 165631937 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 165634073 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165638220 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165638313 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165640292 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 165642972 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165643379 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165647390 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165649933 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165650179 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165650745 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165662744 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165673523 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 165674747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165679913 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 165682154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165691219 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 165703090 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165720814 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165722897 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165730076 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 X 165730680 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165731093 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165731596 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 165731873 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 165731999 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 165732620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165737509 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165743870 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165743939 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165744120 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 165745212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165747137 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165753465 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165756962 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165759475 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165760311 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165761128 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165761135 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165761773 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165764019 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165765709 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165766002 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 165766024 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 165766040 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 165766067 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 165767545 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165768068 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165772143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165773109 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165774871 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165775138 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165776830 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165784695 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 X 165790188 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165791096 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165796206 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165800716 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 165822704 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165822705 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165830377 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 165840649 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165840724 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165841247 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165841413 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165843192 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165844504 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 165844893 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165847368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165849106 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 165856736 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165856830 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165858159 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165858241 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165859105 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165859812 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 165862575 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 165866455 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165866683 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 165867671 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165871179 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 165871841 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165873472 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165876634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165882636 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165882688 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165885838 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165889622 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165902595 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 165905004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165905839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165911785 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165919346 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 165919652 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 X 165920160 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 X 165923393 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 X 165930566 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 165934221 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 165934400 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165934588 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165938346 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 165940527 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 165940695 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165942367 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165942914 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 165943014 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 165943637 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 165943721 A T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 X 165945410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165946274 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 X 165946453 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165946491 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165948614 C A N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 6 18 2 2 8 X 165948736 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 X 165948827 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 165948946 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 165949205 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 X 165950999 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165951131 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 165951324 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 X 165952605 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165952635 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 X 165953735 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 165954080 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165954291 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165954732 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 165955179 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165955237 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165955359 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165955507 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 165955545 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 165956513 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165956577 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165957362 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165957376 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165957895 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165958035 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165958247 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 165958474 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 165958493 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 165958514 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 X 165958597 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165960189 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165964267 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 165968038 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165968087 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 165968095 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 165968104 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 165970581 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 165971184 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165971553 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 165972122 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165974661 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 165978386 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165979266 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 165979974 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165981644 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165981792 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165985422 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 165985811 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165987371 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165987414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165988061 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 165990164 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 165990996 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166001617 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166013714 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166032331 C G Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 X 166039438 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 166043092 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166056604 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166059989 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166060873 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166065704 A G Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 X 166067798 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166068539 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 X 166068573 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166068633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166069165 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166069202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166069669 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 166069738 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166070233 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166070950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166071045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166071116 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166071701 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166071852 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166073580 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166073765 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 X 166074394 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 166075248 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166076174 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166078445 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166079966 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 166080113 A C Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 X 166080788 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 166080983 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166081068 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 X 166081090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166081428 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 X 166081650 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166081657 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 X 166081788 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 X 166082041 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166082195 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 X 166082710 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166082787 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166083873 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 X 166083956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166084276 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 X 166084526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166084733 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 X 166084819 C A Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 X 166084844 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 166085247 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166085949 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166085972 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 166086550 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 166086612 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 166086752 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 166087205 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 X 166087458 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 166087916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166088016 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166088396 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 X 166088505 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 X 166088884 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 X 166089391 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 X 166089393 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 X 166089394 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 X 166089521 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 X 166091416 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 X 166092377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166092441 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166094739 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 X 166094874 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166095615 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166095873 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 166096381 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166096774 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166096907 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 166097173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166097468 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166098055 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166102703 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166102832 C T Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 166106937 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166112942 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166114400 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166116646 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166120285 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 X 166120595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166122276 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166126500 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166130186 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166131316 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 166132042 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 166134247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166137131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166137858 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 166138019 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166138759 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166139507 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166140302 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166141040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166141305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166145789 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 X 166145822 T G N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 X 166147316 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166147924 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166149162 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 166149243 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 166149410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166149630 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 166149916 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166151680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166152262 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166153235 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166153270 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166153291 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166153921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166154353 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 166154802 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 166155072 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166155187 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 166155223 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 166156052 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166156476 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166159366 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166163358 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 166163956 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166164404 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 166173637 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166174482 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 166177359 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 166185285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166185486 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166187636 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166189153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166195202 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166197219 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 166197990 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166197995 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166198104 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166203115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166203801 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 166207580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166208508 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 X 166210020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166213883 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 166214637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166215777 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166216446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166216660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166217758 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 X 166218990 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166219073 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166219418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166219890 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166221645 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 166222574 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 166225860 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 166228737 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 X 166229411 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 166229947 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 X 166232676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166232985 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166233561 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166234489 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166237492 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166238460 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166238938 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 166239801 G C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 X 166240641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166242029 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 166242202 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 166243041 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 166243399 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 166245606 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 X 166245876 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166246198 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166248599 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 X 166250300 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 X 166250727 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 166252056 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 X 166254909 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 166256859 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166256863 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 166258201 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 166258453 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166258800 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 X 166259980 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 166260055 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166260678 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166263502 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166265236 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 166265463 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 166269147 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 X 166269266 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 X 166271537 G T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 X 166271647 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 X 166278072 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166279897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166280200 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 166281631 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 166282468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166283575 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166285220 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 166285221 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 166285492 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 166289262 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 166289729 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 X 166291191 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 166295127 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166295329 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 X 166295350 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 X 166295937 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166296197 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166300260 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 X 166302215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166302857 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 166304269 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 166308703 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166310238 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166311058 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 X 166316293 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 X 166317956 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166318537 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166318858 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 X 166319008 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166322132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166322698 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166322904 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166326383 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166326661 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 X 166327302 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 X 166327306 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 X 166328536 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166329152 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166329236 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166330631 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166332200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166333158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166333741 A C N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 X 166333751 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 X 166334230 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 X 166335565 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 166336389 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 166336722 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 X 166340825 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166345820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 X 166347315 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 X 166355629 G C N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 166356497 G C N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 166363839 G A Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 166369687 G C N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 166382737 T C N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 166388147 T C N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 X 166396088 C T N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1