chr bp logP sigma2 nalleles allele count estimate
1 2961959 4.450679e+00 3 1.443583e+01 0 AAA 2 1.050397e+01 1 AAA 443 5.953996e-02 2 0 28 -1.692291e+00
1 2962485 4.450679e+00 3 1.443583e+01 0 T 2 1.050397e+01 1 T 443 5.953996e-02 2 C 28 -1.692291e+00
1 14584076 4.938294e+00 4 1.430932e+01 0 A 2 1.353980e+01 1 A 15 3.367913e-01 2 T 355 -1.294543e-01 3 W 101 1.368791e-01
1 14584082 5.486689e+00 3 1.429004e+01 0 G 2 1.353980e+01 1 G 435 -3.554983e-02 2 R 36 -3.226509e-01
1 14584083 5.259954e+00 4 1.426260e+01 0 T 2 1.353980e+01 1 T 354 -8.318527e-02 2 C 12 -1.451409e+00 3 Y 105 1.884275e-01
1 14584117 5.090291e+00 4 1.428721e+01 0 G 2 1.353980e+01 1 G 316 -1.479079e-01 2 C 66 -1.754910e-01 3 S 89 3.510303e-01
1 14584131 4.910630e+00 4 1.431335e+01 0 AGGTCGTG 2 1.353980e+01 1 AGGTCGTG 390 -4.633430e-02 2 AGGCCGTG 61 -2.646264e-01 3 0 20 3.566488e-01
1 14584145 5.486689e+00 3 1.429004e+01 0 G 2 1.353980e+01 1 G 435 -3.554983e-02 2 A 36 -3.226509e-01
1 14584147 5.499482e+00 3 1.428824e+01 0 TC 2 1.353980e+01 1 TC 451 -7.585939e-02 2 0 20 3.566488e-01
1 14584166 5.586471e+00 3 1.427607e+01 0 A 2 1.353980e+01 1 A 442 -9.349433e-02 2 G 29 4.912030e-01
1 14584171 5.451177e+00 3 1.429501e+01 0 T 2 1.353980e+01 1 T 446 -5.056689e-02 2 Y 25 -1.810710e-01
1 14584172 5.451177e+00 3 1.429501e+01 0 G 2 1.353980e+01 1 G 446 -5.056689e-02 2 R 25 -1.810710e-01
1 14584196 5.720014e+00 3 1.425740e+01 0 T 2 1.353980e+01 1 T 451 -9.874990e-02 2 C 20 8.728299e-01
1 14597359 4.030058e+00 2 1.456684e+01 1 C 459 -1.207967e-01 2 A 14 3.960405e+00
1 14605007 4.030058e+00 2 1.456684e+01 1 A 459 -1.207967e-01 2 T 14 3.960405e+00
1 14688335 5.219926e+00 2 1.440636e+01 1 G 458 -1.445753e-01 2 R 15 4.414367e+00
1 14689278 4.442900e+00 3 1.443693e+01 1 T 433 -1.424682e-01 2 TT 25 -1.810710e-01 3 Y 15 4.414367e+00
1 14689294 5.219926e+00 2 1.440636e+01 1 A 458 -1.445753e-01 2 M 15 4.414367e+00
1 14689412 5.219926e+00 2 1.440636e+01 1 T 458 -1.445753e-01 2 C 15 4.414367e+00
1 14691141 4.442900e+00 3 1.443693e+01 1 TAAAAACATTAAC 433 -1.424682e-01 2 0 25 -1.810710e-01 3 TAAAAACATTTAC 15 4.414367e+00
1 14694670 5.219926e+00 2 1.440636e+01 1 T 458 -1.445753e-01 2 G 15 4.414367e+00
1 14695309 5.219926e+00 2 1.440636e+01 1 C 458 -1.445753e-01 2 Y 15 4.414367e+00
1 14695317 5.219926e+00 2 1.440636e+01 1 G 458 -1.445753e-01 2 S 15 4.414367e+00
1 14695924 5.219926e+00 2 1.440636e+01 1 C 458 -1.445753e-01 2 G 15 4.414367e+00
1 14697081 5.219926e+00 2 1.440636e+01 1 G 458 -1.445753e-01 2 0 15 4.414367e+00
1 14709946 5.219926e+00 2 1.440636e+01 1 T 458 -1.445753e-01 2 0 15 4.414367e+00
1 14711334 5.219926e+00 2 1.440636e+01 1 T 458 -1.445753e-01 2 0 15 4.414367e+00
1 14886744 4.385460e+00 4 1.439022e+01 0 C 2 4.086778e+00 1 C 374 -1.772444e-01 2 S 82 -9.877617e-02 3 G 15 4.414367e+00
1 14887396 4.984770e+00 3 1.436049e+01 0 T 2 4.086778e+00 1 T 456 -1.631339e-01 2 C 15 4.414367e+00
1 14888158 4.448113e+00 3 1.443620e+01 0 C 3 2.109988e-01 1 C 455 -1.469198e-01 2 Y 15 4.414367e+00
1 14888161 4.448113e+00 3 1.443620e+01 0 G 3 2.109988e-01 1 G 455 -1.469198e-01 2 R 15 4.414367e+00
1 14888177 4.448113e+00 3 1.443620e+01 0 G 3 2.109988e-01 1 G 455 -1.469198e-01 2 T 15 4.414367e+00
1 14888232 4.448113e+00 3 1.443620e+01 0 C 3 2.109988e-01 1 C 455 -1.469198e-01 2 T 15 4.414367e+00
1 14915806 5.768632e+00 4 1.418919e+01 0 0 1 1.023810e+01 1 0 437 -2.148975e-01 2 CAAGCTTAGTCTCCTCGTACAACTTTCACCCCACAA 20 8.728299e-01 3 CAAG 15 4.414367e+00
1 14915808 6.080414e+00 3 1.420715e+01 0 0 1 1.023810e+01 1 0 457 -1.672945e-01 2 TAGTCTCCTCA 15 4.414367e+00
1 14922334 4.083969e+00 3 1.448780e+01 1 T 232 7.076603e-02 2 G 224 -3.627878e-01 3 K 17 3.814515e+00
1 14922491 5.219926e+00 2 1.440636e+01 1 A 458 -1.445753e-01 2 G 15 4.414367e+00
1 14922507 5.219926e+00 2 1.440636e+01 1 T 458 -1.445753e-01 2 C 15 4.414367e+00
1 14922591 4.603011e+00 3 1.441430e+01 1 C 400 -8.644941e-02 2 A 58 -5.454438e-01 3 0 15 4.414367e+00
1 14927414 4.369742e+00 2 1.452107e+01 1 A 457 -1.354442e-01 2 R 16 3.868625e+00
1 15055372 4.369742e+00 2 1.452107e+01 1 0 457 -1.354442e-01 2 AGTGTTTCCGTTAGCGTTTGCAGTTGT 16 3.868625e+00
1 15055374 4.369742e+00 2 1.452107e+01 1 0 457 -1.354442e-01 2 ATAGCAAGAATGATGCATCATGGACGTGGTTC 16 3.868625e+00
1 15059023 4.369742e+00 2 1.452107e+01 1 T 457 -1.354442e-01 2 A 16 3.868625e+00
1 15059461 4.369742e+00 2 1.452107e+01 1 0 457 -1.354442e-01 2 TATACAA 16 3.868625e+00
1 15067299 4.369742e+00 2 1.452107e+01 1 0 457 -1.354442e-01 2 GGG 16 3.868625e+00
1 15069006 4.369742e+00 2 1.452107e+01 1 0 457 -1.354442e-01 2 A 16 3.868625e+00
1 15069212 4.369742e+00 2 1.452107e+01 1 0 457 -1.354442e-01 2 GAA 16 3.868625e+00
1 15069216 4.369742e+00 2 1.452107e+01 1 0 457 -1.354442e-01 2 TGTGGTCCAGTTCCG 16 3.868625e+00
1 15069626 4.369742e+00 2 1.452107e+01 1 C 457 -1.354442e-01 2 T 16 3.868625e+00
1 15070418 4.369742e+00 2 1.452107e+01 1 G 457 -1.354442e-01 2 0 16 3.868625e+00
1 15077453 4.103318e+00 3 1.448505e+01 0 T 1 -7.420907e+00 1 T 455 -1.174689e-01 2 A 17 3.580543e+00
1 15137150 4.026670e+00 2 1.456730e+01 1 T 456 -1.334852e-01 2 C 17 3.580543e+00
1 15142882 4.375563e+00 3 1.444646e+01 0 C 1 1.334971e-01 1 C 454 -1.583408e-01 2 S 18 3.986290e+00
1 15146696 4.375563e+00 3 1.444646e+01 0 C 1 1.334971e-01 1 C 454 -1.583408e-01 2 A 18 3.986290e+00
1 15163149 4.687477e+00 2 1.447821e+01 1 G 454 -1.539962e-01 2 R 19 3.679700e+00
1 15163177 4.687477e+00 2 1.447821e+01 1 A 454 -1.539962e-01 2 R 19 3.679700e+00
1 15163374 4.687477e+00 2 1.447821e+01 1 C 454 -1.539962e-01 2 Y 19 3.679700e+00
1 15163744 4.919630e+00 2 1.444688e+01 1 G 453 -1.624665e-01 2 K 20 3.679865e+00
1 15163769 4.919630e+00 2 1.444688e+01 1 C 453 -1.624665e-01 2 Y 20 3.679865e+00
1 15163785 4.159001e+00 3 1.447715e+01 1 G 316 -1.479079e-01 2 A 137 -1.960468e-01 3 R 20 3.679865e+00
1 15163985 4.155706e+00 3 1.447762e+01 1 C 259 -1.641804e-01 2 T 194 -1.601783e-01 3 Y 20 3.679865e+00
1 15163999 4.919630e+00 2 1.444688e+01 1 G 453 -1.624665e-01 2 K 20 3.679865e+00
1 15164151 4.919630e+00 2 1.444688e+01 1 T 453 -1.624665e-01 2 Y 20 3.679865e+00
1 15164164 4.168515e+00 3 1.447580e+01 1 G 437 -1.541500e-01 2 A 16 -3.896096e-01 3 R 20 3.679865e+00
1 15164379 4.919630e+00 2 1.444688e+01 1 G 453 -1.624665e-01 2 S 20 3.679865e+00
1 15164466 4.919630e+00 2 1.444688e+01 1 T 453 -1.624665e-01 2 Y 20 3.679865e+00
1 15164768 4.919630e+00 2 1.444688e+01 1 T 453 -1.624665e-01 2 W 20 3.679865e+00
1 15164800 4.919630e+00 2 1.444688e+01 1 G 453 -1.624665e-01 2 R 20 3.679865e+00
1 15165628 4.163213e+00 3 1.447655e+01 1 C 388 -1.760950e-01 2 T 65 -8.111437e-02 3 Y 20 3.679865e+00
1 15165715 4.168515e+00 3 1.447580e+01 1 G 437 -1.541500e-01 2 A 16 -3.896096e-01 3 R 20 3.679865e+00
1 15165736 4.168515e+00 3 1.447580e+01 1 T 437 -1.541500e-01 2 A 16 -3.896096e-01 3 W 20 3.679865e+00
1 15165755 4.919630e+00 2 1.444688e+01 1 G 453 -1.624665e-01 2 R 20 3.679865e+00
1 15166276 4.919630e+00 2 1.444688e+01 1 A 453 -1.624665e-01 2 W 20 3.679865e+00
1 15178246 4.919630e+00 2 1.444688e+01 1 AACCCTAAACTCTT 453 -1.624665e-01 2 0 20 3.679865e+00
1 15187297 4.188780e+00 3 1.447293e+01 1 C 59 -3.428197e-01 2 A 394 -1.354592e-01 3 M 20 3.679865e+00
1 15187387 4.185859e+00 3 1.447334e+01 1 T 25 -4.382055e-01 2 A 428 -1.463602e-01 3 W 20 3.679865e+00
1 15187391 4.167730e+00 3 1.447591e+01 1 G 422 -1.510528e-01 2 R 20 3.679865e+00 3 A 31 -3.178400e-01
1 15187537 4.195774e+00 3 1.447193e+01 1 C 20 -5.198652e-01 2 T 433 -1.459584e-01 3 Y 20 3.679865e+00
1 15189866 4.155817e+00 3 1.447760e+01 1 AAAA 428 -1.613797e-01 2 AAA 25 -1.810710e-01 3 0 20 3.679865e+00
1 15190457 4.919630e+00 2 1.444688e+01 1 A 453 -1.624665e-01 2 0 20 3.679865e+00
1 15192976 4.919630e+00 2 1.444688e+01 1 0 453 -1.624665e-01 2 AGTGTT 20 3.679865e+00
1 15193272 4.159942e+00 3 1.447702e+01 0 A 1 -6.949731e-01 1 A 452 -1.612884e-01 2 G 20 3.679865e+00
1 15194610 4.159942e+00 3 1.447702e+01 0 0 1 -6.949731e-01 1 0 452 -1.612884e-01 2 CGGG 20 3.679865e+00
1 15195848 4.159942e+00 3 1.447702e+01 0 0 1 -6.949731e-01 1 0 452 -1.612884e-01 2 ATAACCCCCGAACCA 20 3.679865e+00
1 15195854 4.159942e+00 3 1.447702e+01 0 0 1 -6.949731e-01 1 0 452 -1.612884e-01 2 CT 20 3.679865e+00
1 15196719 4.159942e+00 3 1.447702e+01 0 0 1 -6.949731e-01 1 0 452 -1.612884e-01 2 CGCG 20 3.679865e+00
1 15197054 4.159942e+00 3 1.447702e+01 0 ATACATAAAGCATCTAGTCATATTTGGCT 1 -6.949731e-01 1 ATACATAAAGCATCTAGTCATATTTGGCT 452 -1.612884e-01 2 0 20 3.679865e+00
1 15197882 4.159942e+00 3 1.447702e+01 0 AAACCCT 1 -6.949731e-01 1 AAACCCT 452 -1.612884e-01 2 0 20 3.679865e+00
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