magic	chr	start	end	left.haplotype	right.haplotype	left.length	right.length	cluster	left.genotypes	right.genotypes	total.genotypes	confirm
MAGIC.175	1	16742266	16742517	wil-2	ws-0	752143	282575	TRUE	1	1	2	TRUE
MAGIC.175	2	618345	620470	edi-0	ct-1	115695	7783	TRUE	4	1	5	TRUE
MAGIC.175	2	1023537	1023566	edi-0	can-0	397135	399	TRUE	5	32	37	TRUE
MAGIC.175	2	1640353	1640433	edi-0	bur-0	616318	1440	TRUE	6	1	8	TRUE
MAGIC.175	3	11956787	11956866	sf-2	col-0	149213	78	TRUE	4	21	26	FALSE
MAGIC.175	3	11956936	11956967	col-0	sf-2	78	738881	TRUE	20	4	25	FALSE
MAGIC.175	3	23019105	23019133	wu-0	can-0	424224	561	TRUE	1	50	52	FALSE
MAGIC.175	4	1771938	1772648	edi-0	hi-0	17552	13904	TRUE	4	8	12	TRUE
MAGIC.175	4	10908069	10908075	wu-0	bur-0	66237	164	TRUE	5	34	40	TRUE
MAGIC.175	4	10908235	10908277	bur-0	wu-0	164	7676585	TRUE	34	2	37	TRUE
MAGIC.175	5	16228539	16228550	rsch-4	can-0	637154	252	TRUE	9	22	34	TRUE
MAGIC.175	5	16228762	16228823	can-0	rsch-4	252	3842879	TRUE	22	6	34	TRUE
MAGIC.433	1	15081313	15081317	ct-1	wu-0	72504	340583	TRUE	0	2	7	FALSE
MAGIC.433	1	15988898	15989058	mt-0	bur-0	109072	17295	TRUE	1	2	5	TRUE
MAGIC.433	1	22252745	22252850	ler-0	can-0	392454	371892	TRUE	0	1	2	FALSE
MAGIC.433	1	26196564	26196581	sf-2	ler-0	310621	177981	TRUE	1	2	7	FALSE
MAGIC.433	2	4467909	4467960	sf-2	kn-0	30533	339848	TRUE	0	4	5	FALSE
MAGIC.433	2	8513545	8513567	kn-0	bur-0	780411	178	TRUE	18	62	85	FALSE
MAGIC.433	2	8513745	8513754	bur-0	wil-2	178	48223	TRUE	62	14	78	TRUE
MAGIC.433	3	13153159	13153197	oy-0	can-0	2081	6470	TRUE	6	5	12	FALSE
MAGIC.433	4	4449362	4449380	tsu-0	oy-0	44476	36132	TRUE	7	0	11	FALSE
MAGIC.433	4	8110663	8110686	ct-1	wu-0	57993	176070	TRUE	5	2	7	TRUE
MAGIC.433	4	11384331	11384370	can-0	ler-0	3055	217630	TRUE	0	20	42	FALSE
MAGIC.433	4	11602000	11602078	ler-0	can-0	217630	11138	TRUE	3	20	25	FALSE
MAGIC.433	5	15279318	15280855	sf-2	mt-0	184588	74329	TRUE	1	1	6	FALSE
MAGIC.105	1	16485246	16485261	can-0	bur-0	670291	78	TRUE	7	14	28	FALSE
MAGIC.105	1	16485339	16485351	bur-0	can-0	78	2564042	TRUE	14	16	31	TRUE
MAGIC.105	2	2242341	2243858	wil-2	ler-0	746217	379651	TRUE	1	2	3	TRUE
MAGIC.105	2	2638291	2638334	can-0	wil-2	16283	58260	TRUE	4	13	21	FALSE
MAGIC.105	2	3218569	3218700	wil-2	tsu-0	93793	282667	TRUE	4	1	5	TRUE
MAGIC.105	2	8513545	8513567	ler-0	bur-0	1925162	116	TRUE	13	50	66	TRUE
MAGIC.105	2	8513683	8513691	bur-0	wil-2	116	48286	TRUE	50	6	70	TRUE
MAGIC.105	3	1801712	1804152	ler-0	wil-2	3094	28411	TRUE	1	1	2	TRUE
MAGIC.105	3	9894582	9894925	kn-0	tsu-0	268977	581787	TRUE	1	1	2	TRUE
MAGIC.105	4	528685	528892	rsch-4	po-0	157649	186200	TRUE	1	5	6	TRUE
MAGIC.105	4	2576672	2576758	po-0	can-0	87122	2922	TRUE	11	3	15	TRUE
MAGIC.105	4	2579586	2579629	can-0	kn-0	2922	4787	TRUE	3	3	6	TRUE
MAGIC.105	4	2584051	2584441	kn-0	tsu-0	4787	6019	TRUE	1	2	3	TRUE
MAGIC.105	4	2590253	2590563	tsu-0	zu-0	6019	189637	TRUE	1	5	6	TRUE
MAGIC.105	4	2780200	2780227	zu-0	po-0	189637	36065	TRUE	1	8	11	TRUE
MAGIC.105	4	5185501	5185840	bur-0	po-0	2824	12789	TRUE	3	1	4	TRUE
MAGIC.105	4	6580387	6580416	po-0	bur-0	159884	25551	TRUE	3	5	8	TRUE
MAGIC.105	4	6890095	6890486	po-0	can-0	27750	17216	TRUE	1	9	11	TRUE
MAGIC.105	4	7199563	7199568	ws-0	po-0	6389	93910	TRUE	6	7	22	FALSE
MAGIC.105	4	7353295	7353435	zu-0	hi-0	59760	57100	TRUE	1	1	4	FALSE
MAGIC.105	4	7410423	7410500	hi-0	po-0	57100	52515	TRUE	2	2	5	TRUE
MAGIC.105	4	7604294	7606913	tsu-0	po-0	140977	17036	TRUE	2	1	3	TRUE
MAGIC.105	4	7627778	7628126	ct-1	po-0	6588	20614	TRUE	2	3	5	FALSE
MAGIC.105	4	7648740	7649199	po-0	edi-0	20614	117333	TRUE	4	1	6	TRUE
MAGIC.105	4	8401141	8401190	ler-0	po-0	3484	26577	TRUE	12	2	14	TRUE
MAGIC.105	4	8540020	8540037	wu-0	edi-0	28469	54402	TRUE	3	1	5	TRUE
MAGIC.105	4	8827992	8827998	po-0	sf-2	31494	3734	TRUE	1	7	9	FALSE
MAGIC.105	4	8924879	8926238	po-0	zu-0	94434	23701	TRUE	1	1	3	TRUE
MAGIC.105	4	8970747	8972920	ct-1	po-0	22855	43209	TRUE	2	2	4	TRUE
MAGIC.105	4	9029498	9030223	ler-0	po-0	14015	5685	TRUE	1	2	3	TRUE
MAGIC.105	4	9318243	9318789	po-0	bur-0	124098	16959	TRUE	2	0	13	FALSE
MAGIC.105	4	9429237	9429250	po-0	kn-0	94020	7619	TRUE	3	4	10	FALSE
MAGIC.105	4	9444526	9444577	no-0	wil-2	7659	1202	TRUE	1	7	8	TRUE
MAGIC.105	4	9445779	9446101	wil-2	po-0	1202	23319	TRUE	12	4	20	FALSE
MAGIC.105	4	9468942	9469162	po-0	sf-2	23319	6280	TRUE	6	3	10	FALSE
MAGIC.105	4	9475442	9475539	sf-2	po-0	6280	4034	TRUE	1	1	2	TRUE
MAGIC.105	4	9479486	9479583	po-0	bur-0	4034	9934	TRUE	2	1	4	TRUE
MAGIC.105	4	10227638	10227676	sf-2	zu-0	66333	46538	TRUE	1	1	2	TRUE
MAGIC.105	4	10390671	10391947	po-0	wil-2	88658	544	TRUE	11	25	40	TRUE
MAGIC.105	4	10392491	10392516	wil-2	po-0	544	6285	TRUE	25	14	43	FALSE
MAGIC.105	4	10398801	10398900	po-0	bur-0	6285	54730	TRUE	3	3	6	TRUE
MAGIC.105	4	10474588	10475811	po-0	ler-0	20933	50344	TRUE	3	6	9	TRUE
MAGIC.105	4	10562715	10562842	rsch-4	po-0	37715	17533	TRUE	6	7	17	FALSE
MAGIC.105	4	10734669	10735095	po-0	bur-0	34686	14112	TRUE	3	1	5	TRUE
MAGIC.105	4	10814158	10814425	po-0	ler-0	38957	4574	TRUE	5	1	9	FALSE
MAGIC.105	4	10887982	10888068	wil-2	po-0	35166	10501	TRUE	2	1	5	TRUE
MAGIC.105	4	11309959	11309962	wu-0	rsch-4	84449	131260	TRUE	97	0	99	TRUE
MAGIC.105	4	13258073	13258276	can-0	po-0	187412	261761	TRUE	1	1	3	FALSE
MAGIC.105	4	16625460	16625928	tsu-0	can-0	88453	19877	TRUE	2	1	3	TRUE
MAGIC.105	4	16645770	16645889	can-0	ws-0	19877	28244	TRUE	1	3	4	TRUE
MAGIC.105	4	16696549	16696935	no-0	tsu-0	22449	37576	TRUE	2	1	3	TRUE
MAGIC.105	4	17155009	17155473	mt-0	edi-0	48954	12670	TRUE	2	1	3	TRUE
MAGIC.105	4	17184537	17184769	col-0	kn-0	16637	99802	TRUE	2	5	9	FALSE
MAGIC.105	4	17284571	17284609	kn-0	can-0	99802	484	TRUE	3	23	31	TRUE
MAGIC.105	4	17285093	17285105	can-0	col-0	484	2674	TRUE	24	15	44	TRUE
MAGIC.105	4	17287503	17287830	col-0	po-0	2674	13371	TRUE	5	1	6	TRUE
MAGIC.105	4	17337671	17337696	ct-1	po-0	36356	69855	TRUE	1	2	4	TRUE
MAGIC.105	4	17415060	17415082	ws-0	can-0	7323	22772	TRUE	4	0	6	FALSE
MAGIC.105	4	17437846	17437857	can-0	hi-0	22772	6491	TRUE	1	1	2	TRUE
MAGIC.105	4	17510520	17510555	bur-0	can-0	9632	3957	TRUE	2	2	4	TRUE
MAGIC.105	4	17516934	17517121	rsch-4	can-0	2384	6719	TRUE	6	1	9	TRUE
MAGIC.105	4	17560430	17560615	rsch-4	no-0	36672	107159	TRUE	4	8	12	TRUE
MAGIC.105	4	17718852	17719077	edi-0	oy-0	51031	46917	TRUE	4	1	5	TRUE
MAGIC.105	4	17775027	17775260	edi-0	oy-0	8532	1694	TRUE	2	4	7	TRUE
MAGIC.105	4	17776954	17777137	oy-0	ct-1	1694	6593	TRUE	3	2	6	TRUE
MAGIC.105	4	17809876	17809985	ct-1	tsu-0	15956	506749	TRUE	1	4	5	TRUE
MAGIC.287	1	12659791	12659858	zu-0	ws-0	4173796	390	TRUE	3	83	87	FALSE
MAGIC.287	1	12660075	12660199	ws-0	zu-0	390	779744	TRUE	83	1	85	FALSE
MAGIC.287	1	13439943	13439958	zu-0	oy-0	779744	19199	TRUE	0	1	3	TRUE
MAGIC.287	3	11956787	11956866	ct-1	col-0	1475368	78	TRUE	4	21	26	FALSE
MAGIC.287	3	11956936	11956948	col-0	ct-1	78	814791	TRUE	20	4	25	FALSE
MAGIC.287	3	19404954	19405256	po-0	can-0	145100	8984	TRUE	8	8	16	TRUE
MAGIC.287	3	21435482	21435731	po-0	hi-0	132540	21335	TRUE	3	3	7	TRUE
MAGIC.287	3	22108176	22108241	po-0	bur-0	58769	32732	TRUE	10	2	12	TRUE
MAGIC.287	3	22494608	22494627	col-0	ct-1	28164	45266	TRUE	1	2	3	TRUE
MAGIC.287	4	4316342	4316418	wil-2	mt-0	22549	9664	TRUE	0	1	5	FALSE
MAGIC.287	4	8108997	8109297	mt-0	ct-1	164195	1609	TRUE	1	4	5	TRUE
MAGIC.149	1	11133893	11133919	no-0	kn-0	804092	167425	TRUE	0	2	3	FALSE
MAGIC.149	1	12673470	12673549	kn-0	no-0	8797	77222	TRUE	3	1	5	FALSE
MAGIC.149	2	7681325	7681393	hi-0	oy-0	102075	217802	TRUE	1	0	3	FALSE
MAGIC.149	3	16620673	16621088	ct-1	hi-0	27834	5355	TRUE	0	0	7	FALSE
MAGIC.446	2	5909760	5910025	po-0	kn-0	137631	6514	TRUE	8	5	13	TRUE
MAGIC.446	2	6244979	6245650	po-0	wu-0	39476	17200	TRUE	1	2	3	TRUE
MAGIC.446	3	6119115	6119116	po-0	ler-0	425201	3087	TRUE	1	0	2	TRUE
MAGIC.446	3	6652377	6652560	tsu-0	col-0	34356	44890	TRUE	1	2	3	TRUE
MAGIC.446	4	1245093	1245370	col-0	ct-1	207721	145794	TRUE	2	2	5	TRUE
MAGIC.446	4	2576672	2576758	po-0	can-0	87122	2907	TRUE	11	3	15	TRUE
MAGIC.446	4	2579586	2579629	can-0	bur-0	2907	5907	TRUE	2	1	3	TRUE
MAGIC.446	4	2590253	2590563	tsu-0	zu-0	4826	189637	TRUE	0	5	7	FALSE
MAGIC.446	4	2780200	2780227	zu-0	po-0	189637	36065	TRUE	0	8	9	TRUE
MAGIC.446	4	4712351	4712649	rsch-4	wu-0	68949	9861	TRUE	1	2	4	FALSE
MAGIC.446	4	4741819	4741920	can-0	bur-0	2734	31834	TRUE	4	1	7	TRUE
MAGIC.446	4	5185501	5185682	can-0	po-0	2302	12947	TRUE	3	1	4	TRUE
MAGIC.446	4	5198629	5198712	po-0	can-0	12947	12718	TRUE	1	9	12	FALSE
MAGIC.446	4	5211102	5211361	can-0	po-0	12718	198400	TRUE	1	3	5	FALSE
MAGIC.446	5	14486011	14486019	hi-0	wu-0	382412	423622	TRUE	2	0	4	TRUE
MAGIC.446	5	17196171	17196279	bur-0	po-0	2020	159649	TRUE	0	1	3	TRUE
MAGIC.446	5	17367896	17367996	tsu-0	po-0	11918	4803	TRUE	1	2	3	TRUE
MAGIC.446	5	17392218	17392698	po-0	bur-0	12540	64227	TRUE	1	0	3	TRUE
MAGIC.446	5	17928109	17928167	po-0	tsu-0	94027	10337	TRUE	1	1	2	TRUE
MAGIC.446	5	17938504	17939062	tsu-0	ct-1	10337	7035	TRUE	2	11	14	TRUE
MAGIC.446	5	17945492	17945567	ct-1	po-0	7035	18854	TRUE	1	1	4	FALSE
MAGIC.446	5	18179716	18181109	po-0	no-0	4739	6991	TRUE	1	2	3	TRUE
MAGIC.446	5	18224360	18225494	tsu-0	po-0	19502	8393	TRUE	3	4	11	TRUE
MAGIC.446	5	18232626	18232890	po-0	rsch-4	8393	39591	TRUE	1	15	16	TRUE
MAGIC.446	5	18496238	18496336	mt-0	po-0	9911	25223	TRUE	6	2	8	TRUE
MAGIC.446	5	18600509	18601808	zu-0	kn-0	2330	23459	TRUE	1	1	2	TRUE
MAGIC.446	5	18767254	18767346	po-0	bur-0	136024	10245	TRUE	1	1	2	TRUE
MAGIC.446	5	19304459	19304889	tsu-0	rsch-4	427003	223217	TRUE	3	2	5	TRUE
MAGIC.329	3	11956570	11956866	ws-0	tsu-0	102046	607	TRUE	3	20	23	TRUE
MAGIC.338	1	12847129	12847183	ler-0	can-0	521	155400	TRUE	7	3	11	FALSE
MAGIC.338	1	16485019	16485028	can-0	bur-0	13908	311	TRUE	3	13	20	TRUE
MAGIC.338	1	16485339	16485354	bur-0	can-0	311	28303	TRUE	13	14	32	FALSE
MAGIC.338	1	22752954	22752988	edi-0	can-0	2153819	164	TRUE	9	29	40	TRUE
MAGIC.338	1	22753079	22753208	can-0	edi-0	164	902170	TRUE	30	10	42	TRUE
MAGIC.338	1	24175133	24175755	no-0	mt-0	519555	2085	TRUE	2	31	33	TRUE
MAGIC.338	1	24177167	24177236	mt-0	no-0	2085	6247808	TRUE	64	1	65	TRUE
MAGIC.338	2	5909760	5910025	po-0	kn-0	137631	13830	TRUE	8	5	13	TRUE
MAGIC.338	2	5929114	5929209	bur-0	mt-0	5564	5255	TRUE	1	4	6	TRUE
MAGIC.338	2	5934464	5934506	mt-0	ler-0	5255	271625	TRUE	2	1	3	TRUE
MAGIC.338	2	6244979	6245650	po-0	wu-0	39476	10027	TRUE	1	2	3	TRUE
MAGIC.338	2	6710746	6711706	edi-0	po-0	13846	85789	TRUE	3	1	4	TRUE
MAGIC.338	2	8025103	8025285	po-0	tsu-0	704311	5446	TRUE	1	4	5	TRUE
MAGIC.338	3	114112	114841	oy-0	po-0	114683	854098	TRUE	1	3	4	TRUE
MAGIC.338	3	16650699	16650930	no-0	kn-0	307549	388892	TRUE	7	9	16	TRUE
MAGIC.338	4	4598438	4598475	wu-0	ler-0	46770	43789	TRUE	2	1	4	FALSE
MAGIC.338	4	4695032	4695206	po-0	rsch-4	10486	4779	TRUE	2	0	3	TRUE
MAGIC.338	4	10908069	10908075	wu-0	bur-0	135331	164	TRUE	5	35	42	TRUE
MAGIC.338	4	10908235	10908277	bur-0	wu-0	164	2711987	TRUE	36	1	38	FALSE
MAGIC.338	5	10189734	10191362	oy-0	no-0	124980	3573	TRUE	2	7	10	TRUE
MAGIC.338	5	14067733	14068151	ler-0	zu-0	56709	11089	TRUE	2	3	5	TRUE
MAGIC.338	5	14563079	14563341	ler-0	zu-0	2453	4508	TRUE	1	10	11	TRUE
MAGIC.338	5	14772676	14772703	po-0	tsu-0	120991	5259	TRUE	1	4	5	TRUE
MAGIC.338	5	14777962	14777979	tsu-0	po-0	5259	119060	TRUE	12	2	15	TRUE
MAGIC.338	5	14897033	14897714	po-0	kn-0	119060	12376	TRUE	4	3	7	TRUE
MAGIC.338	5	15098294	15098500	bur-0	wu-0	23918	7175	TRUE	5	3	12	FALSE
MAGIC.426	1	15058297	15058579	oy-0	zu-0	1456498	23083	TRUE	1	1	4	TRUE
MAGIC.426	1	24177167	24177236	mt-0	rsch-4	1475	847402	TRUE	35	1	36	TRUE
MAGIC.426	2	2924839	2924934	oy-0	can-0	972477	788	TRUE	8	82	95	FALSE
MAGIC.426	2	2925433	2925696	can-0	oy-0	788	168128	TRUE	84	9	102	TRUE
MAGIC.426	3	9607006	9607068	sf-2	wil-2	8015	574477	TRUE	4	1	9	FALSE
MAGIC.426	3	11817450	11817620	wil-2	tsu-0	25065	3881	TRUE	1	1	4	FALSE
MAGIC.426	4	10907896	10908075	edi-0	bur-0	949100	304	TRUE	9	35	47	FALSE
MAGIC.426	4	10908235	10908277	bur-0	edi-0	304	127489	TRUE	37	2	40	FALSE